多基因甲基化检测对结直肠癌早期诊断的意义

目的 通过对结直肠癌（CRC）组织中多基因甲基化水平的检测,探讨多基因甲基化对CRC早期诊断的意义.方法 选取25例CRC患者胃镜采集标本组织,通过甲基化特异性PCR（MSP）检测CRC和炎性组织中甲基化水平,分析其与CRC患者临床各指标的关系.结果 在CRC患者中,APC、P16、MLH1、DCC甲基化率分别为52.0%（13/25）、32.0%（8/25）、44.0%（11/25）、60.0%（15/25）.炎性组织中仅有1例DCC甲基化异常表达,甲基化率为10.0%（1/10）,甲基化阳性率显著高于炎性组织（P＜0.05）,4种基因甲基化联合检测诊断CRC的阳性率为92.0%（23/25）,高于单个基因检测的甲基化阳性率,差异有统计学意义（P＜0.01）.结论 APC、P16、MLH1、DCC基因在CRC患者中甲基化水平异常表达,联合检测APC、P16、MLH1、DCC可能作为CRC早期诊断的标志物.     

人POT1基因实时荧光PCR相对定量法的建立

目的：建立SYBR Green Ⅰ实时荧光PCR定量检测人POT1基因的方法。方法：依据人POT1基因及参照基因TBP基因序列设计引物,以人类乳腺癌细胞系MCF-7总RNA逆转录合成的cDNA为模版,以TBP基因为参照基因,应用SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测POT1基因的表达。结果：POT1和TBP基因熔解曲线为单峰,无杂峰及二聚体。POT1基因及参照基因TBP基因扩增效率相同（直线斜率0．0171〈0．1）。POT1基因批内变异与批间变异分别为1.3％和2.1％;TBP基因批内变异与批间变异分别为1．2％和2．6％。结论：建立了SYBR Green Ⅰ实时定量检测人类POT1基因的方法,该方法简单快速,经济,灵敏度高,特异性和重复性好,可用于人类POT1基因的定量分析。     

遗传性非息肉病性结直肠癌错配修复基因MLH1启动子甲基化研究

目的了解中国人遗传性非息肉病性结直肠癌中MLH1基因启动子区CpG岛的过度甲基化现象。方法在错配修复基因微小突变检测和大片段缺失检测等实验的基础上,对47例DNA标本进行硫化处理,然后采用甲基化特异性PCR（MSP）方法检测标本中MLH1基因启动子的甲基化情况。结果47例标本中发现6例存在MLH1基因启动子过度甲基化,检出率为12.8%,其中4例表现为完全甲基化,2例表现为部分甲基化。结论MLH1基因启动子过度甲基化现象在遗传性非息肉病性结直肠癌中发生率较高,是HNPCC发病的相关因素之一。过度甲基化现象的研究有助于致癌机制的进一步探讨和揭示。     

实时荧光定量RT-PCR检测结直肠癌中ERCC1 mRNA的表达及其临床意义

目的传统的影像学检查及肿瘤标志物检测对结直肠癌微转移的诊断价值有限。本研究旨在探讨ERCC1 mRNA在结直肠癌患者外周血中的表达情况及其临床意义。方法用实时定量荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法,对53例结直肠癌患者和21名健康人的外周血标本进行ERCC1 mRNA检测,分析其表达与肿瘤临床病理特征的关系并应用接受者操作特征曲线(ROC曲线)分析ERCC1 mRNA检测对结直肠癌的诊断价值。结果结直肠癌组外周血ERCC1 mRNA表达水平显著高于正常对照组(P<0.05),其表达与肿瘤淋巴结转移、血行转移和TNM分期相关(P<0.05)。ERCC1 mRNA诊断结直肠癌的ROC曲线下面积0.89,诊断界值为Ct≤32。结论实时定量荧光RT-PCR检测ERCC1 mRNA可以更好地评估结直肠癌血道微转移,有利于判断预后。     

应用实时荧光定量PCR检测结直肠癌与癌旁组织中miRNA-221的差异表达状况

目的分析结直肠癌与毗邻癌旁组织中miRNA-221差异表达状况。方法常规抽提30例结直肠癌及对照癌旁组织中总RNA,应用实时荧光定量PCR方法检测标本中miRNA-221的表达状况。结果与癌旁组织相比,结直肠癌组织中miRNA-221表达明显上调（P〈0．01）。结论实时荧光定量PCR是一种较精确的miRNA定量检测方法;miRNA-221可能通过转录后基因沉默机制促进结直肠癌的发生发展。     

人KIM-1基因实时荧光定量PCR标准质粒的构建

目的制备用于人KIM-1基因mRNA实时荧光定量PCR检测的标准品质粒。方法通过PCR扩增出目的片断,纯化PCR产物与p MD18-T载体连接,转化宿主菌E.coli DH5α,获得阳性克隆;通过PCR扩增鉴定和测序分析,确认重组质粒完整正确。提取重组质粒测定DNA浓度后,10倍倍比稀释,建立KIM-1质粒标准品。结果 KIM-1基因目的片段成功重组至p MD18-T载体上,扩增目的片段长度为131 bp,测序结果证实所构建的质粒序列与NCBI基因库KIM-1序列性一致。结论成功构建KIM-1基因实时荧光定量PCR标准品质粒。     

EYA4基因在结直肠癌中的甲基化状态及其意义

背景：EYA4（eyes absent4）是一种非巯基蛋白酪氨酸磷酸酶,参与器官发育、细胞凋亡调控、先天性免疫、DNA损伤修复、血管生成等过程。目的：研究EYA4基因在结直肠癌中的甲基化状态及其意义。方法：选取2006年6月～2007年1月上海交通大学医学院附属仁济医院31例结直肠癌患者,采集其癌组织和相应癌旁非癌组织。以5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-Aza—dC）处理人结肠癌细胞株HT29、HCT116、SW480、SW1116。应用MSP技术检测结直肠癌组织、癌旁非癌组织、HT29、HCT116、SW480、SW1116细胞中EYA4基因启动子的甲基化状态。分析结直肠癌患者临床病理特征与EYA4基因甲基化关系。采用RT—PCR和蛋白质印迹法分别检测结肠癌细胞株中EYA4基因和蛋白的表达水平。结果：结直肠癌组织EYA4基因启动子甲基化率显著高于癌旁组织（77．4％对6．5％,P〈0．01）。EYA4基因和蛋白在启动子甲基化的HT29、HCT116、SW480细胞中不表达,在启动子非甲基化的SW1116细胞中显著表达。以5-Aza—dC处理后EYA4基因和蛋白在LIT29和SW480细胞中表达上调。结论：EYA4基因是结直肠癌发生的甲基化相关基因,有望成为结直肠癌的诊断标记物。     

实时荧光定量PCR技术检测食管鳞癌c-myc mRNA的表达

目的 探讨c-myc mRNA表达与食管鳞癌发病的关系.方法 采用实时荧光定量PCR法检测24例食管鳞癌患者食管鳞癌组织和正常食管鳞状上皮组织、癌旁食管鳞状上皮组织中c-myc mRNA的表达.结果 食管鳞癌组织与癌旁食管鳞状上皮组织c-myc基因的表达量相近,二者均明显高于正常食管鳞状上皮组织(P<0.05).结论 c-myc基因在食管鳞状上皮癌变过程的早期阶段起重要作用.     

实时荧光定量PCR检测人类EZH2基因方法的建立

目的:建立SYBR Green Ⅰ实时荧光PCR定量检测人类EZH2基因的方法.方法:将EZH2 RT-PCR扩增片段克隆入载体pGEM-T后,经测序鉴定正确后,进行纯化和定量及系列稀释,应用SYBR Green Ⅰ实时荧光定量PCR检测EZH2,建立标准曲线,熔解曲线分析产物的特异性.结果:该法检测的最低拷贝数为10,线性范围为101～108拷贝,相关系数r为-1.00,104copies/μl标本的批内变异系数(CV)和日间CV分别为1.0%和2.7%.熔解曲线分析显示单一的峰,熔解温度(Tm)为(83.42±0.13)℃.结论:实时荧光定量PCR方法检测EZH2基因,具有高敏感性、高特异性和高精确性等优点,可作为进一步研究EZH2的方法.     

特异性PCR法检测胰腺癌p16基因甲基化改变

目的探讨胰腺癌 p16基因启动子区5'CpG岛甲基化改变的特点及其与临床病理特征的关系.方法应用甲基化特异性PCR法进行甲基化检测.结果 14/36例胰腺癌标本的p16基因启动子区5'CpG岛检测到甲基化,甲基化频率为38.9%,5例癌旁组织、1例正常胰腺组织、7例慢性胰腺炎及2例胰腺粘液性囊腺瘤未发现相应区域的甲基化.结论 p16基因启动子区5'CpG岛甲基化是胰腺癌p16基因失活的机制之一,是胰腺癌细胞区别与正常细胞的分子事件.检测p16基因甲基化可能有助于胰腺癌的诊断及鉴别诊断.     

hMLH1基因高甲基化在胃癌发生、发展中的作用

基因启动子区CpG岛甲基化使许多基因失活，从而导致恶性肿瘤的发生和发展。目的：检测hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化水平，探讨其胃癌发生、发展中的作用。方法：以甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测41例胃癌、40例癌前病变和38例对照组织中hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化状态，并分析其与胃癌患者临床病理特征的关系。结果：胃癌组织中hMLHl基因启动子区CpG岛甲基化阳性率为34．1％，显著高于癌前病变组的5．0％和对照组的0％（P〈0．05）。hMLHl基因甲基化阳性率与胃癌患者的年龄和肿瘤浸润深度有关（阳性率分别为46．4％对7．7％和55．0％对14.3％，P〈0．05），与性别、肿瘤分化程度和淋巴结转移无关（阳性率分别为34．8％对33．3％、28．0％对43．8％和38．1％对30．0％）。结论：胃癌组织中存在hMLHl基因启动子区CpG岛高甲基化，可能与胃癌的发生、发展有关．且可能在老年胃癌患者的肿瘤发生过程中起重要作用。     

结直肠癌患者外周血人端粒酶逆转录酶mRNA和MUC1mRNA的检测及其临床意义

背景：传统影像学检查和血清肿瘤标记物检测对结直肠癌微转移的诊断价值有限。目的：检测结直肠癌患者外周血人端粒酶逆转录酶（hTERT）mRNA和MUC1mRNA表达，探讨两者对结直肠癌微转移的诊断价值。方法：收集53例结直肠癌患者和21名健康人的外周血标本，以实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测hTERTmRNA和MUC1mRNA表达．分析两者表达与肿瘤临床病理特征的关系。应用接受者操作特征曲线（ROC曲线）分析hTERTmRNA、MUC1mRNA和两者联合检测对结直肠癌的诊断价值。结果：结直肠癌组外周血hTERTmRNA和MUC1mRNA表达率和表达水平显著高于正常对照组（P〈0．05），两者表达与肿瘤淋巴结转移、血行转移和TNM分期相关（P〈0．05）。hTERTmRNA、MUC1mRNA和两者联合检测诊断结直肠癌的ROC曲线下面积分别为0．806、0．778和0．861．诊断界值为Ct〈32。结论：外周血hTERTmRNA和MUC1mRNA可作为诊断结直肠癌微转移的标记物，以实时荧光定量RT-PCR联合检测两项指标优于单项检测。     

错配修复基因MLH1激活p53和线粒体凋亡通路参与雌激素诱导的结肠癌细胞凋亡

临床和流行病学研究显示雌激素替代治疗可降低绝经后妇女的结直肠癌发生风险。前期研究发现雌激素能上调结肠癌细胞的错配修复(MMR)基因MLH1表达,在MLH1基因缺失的结肠癌细胞中再表达MLH1能明显增强雌激素诱导的细胞凋亡。目的:探讨MLH1参与雌激素诱导结肠癌细胞凋亡所涉及的信号通路以及p53及其相关基因在此凋亡通路中的作用。方法:以含人野生型MLH1(hMLH1)全长cDNA的质粒转染MLH1基因缺失的人结肠癌细胞株HCT116。以转染空质粒的HCT1 16细胞作为对照,在有或无雌激素作用的条件下,采用电泳法检测凋亡DNA Ladder,蛋白质印迹法检测p53等凋亡相关蛋白表达。结果:转染hMLH1后,10~(-8)mol/L雌二醇(E_2)能明显诱导HCT116细胞凋亡。转染hMLH1并经E_2处理的HCT116细胞(D组)与经E_2处理但未转染hMLH1的HCT116细胞(B组)相比,其caspase-3、caspase-9、p53、Bax、胞质细胞色素C蛋白表达均显著增强,D组上述蛋白表达亦均高于转染hMLH1但未经E_2处理的HCT116细胞(C组)。结论:MMR基因MLH1主要通过激活p53和线粒体凋亡通路参与雌激素诱导的人结肠癌细胞株HCT116凋亡。     

胃癌患者血清RASSF1A基因启动子区甲基化检测

Ras相关结构域家族1A（RASSF1A）基因是近年发现的新型抑癌基因，其启动子区甲基化可能与胃肠道肿瘤的发生、发展密切相关。目的：检测胃癌患者血清RASSF1A基因启动子区甲基化情况，探讨其在胃癌早期诊断和预后评估中的可能作用。方法：以甲基化特异性聚合酶链反应（MSP）检测47例胃腺癌患者、30例胃良性病变患者和30名健康对照者的血清RASSF1A基因启动子区甲基化情况，其中16例胃腺癌患者同时留取手术切除癌组织、癌旁组织标本以及术前、术后血标本行对照研究。结果：胃腺癌患者血清RASSF1A基因启动子区甲基化率为34．0％（16／47），显著高于胃良性病变患者（3.3％，1／30）和健康对照者（0％）（P〈0．01）。16例胃腺癌组织中5例（31．2％）检测到RASSF1A基因启动子区甲基化，其中4例（80．0％）术前、术后血清标本均检测到RASSF1A基因启动子区甲基化。血清RASSF1A基因启动子区甲基化与胃癌患者性别、年龄、肿瘤分化程度、有无转移以及血清癌胚抗原（CEA）水平均无相关性。结论：血清RASSF1A基因启动子区甲基化检测可望为胃癌的早期诊断和预后判断提供依据。     

人胰腺癌细胞株MUC2基因启动子区甲基化状态检测和分析

近年表观遗传学修饰方式之-的DNA甲基化成为肿瘤研究的热点。目前已发现胰腺癌中存在MUC2表达异常。目的：探讨人胰腺癌细胞株MUC2表达与其基因启动子区甲基化的关系，以了解胰腺癌的发生机制。方法：以人胰腺癌细胞株AsPC-1、BxPC-3、CFPAC-1、PANC-1、SW1990和PaTu8988s为研究对象，以逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）和免疫细胞化学方法检测去甲基化制剂DNA甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷（5-Aza-CdR）处理前后各胰腺癌细胞株MUC2 mRNA／蛋白表达的变化，以甲基化特异性PCR（MSP）结合测序检测MUC2基因启动子区CpG岛甲基化状态。结果：5-Aza-CdR处理前．胰腺癌细胞株AsPC．1、CFPAC-1和SW1990无MUC2mRNA／蛋白表达或低表达：经5-Aza-CdR处理后，MUC2mRNA／蛋白重新表达。MSP结合测序显示上述胰腺癌细胞株MUC2基因启动子区CpG岛存在高甲基化。结论：人胰腺癌细胞株MUC2表达抑制与其基因启动子区CpG岛高甲基化相关。MUC2基因启动子区CpG岛高甲基化可能在胰腺癌的发生、发展中起-定作用。     

hMLH1．93G／A基因多态性与结直肠癌的相关性研究

hMLHl是DNA错配修复（MMR）系统的重要成员,在DNA复制过程中识别和修复错配碱基,其基因多态性对散发性结直肠癌（CRC）的诊断有重要价值。目的：探讨hMLHl启动子区-93G／A基因多态性与CRC的关系。方法：连续收集2008年1月-2010年10月的CRC患者312例,纳入同期正常对照300例。抽提所有人选者外周血白细胞DNA．以TaqManMGB探针荧光定量PCR检测hMLHl启动子区-93吲A基因多态性。结果：CRC组患者hMLHl-93G／A各基因型频率与正常对照组相比．差异无统计学意义（P=0．219）。对CRC组行分层分析示DukesCA期患者的A等位基因和AA基因型频率明显高于MB期患者（60．5％对48．1％,P=0．004;39．8％对23-3％,P=0．015）,淋巴结转移者的A等位基因和AA基因型频率亦明显高于无淋巴结转移者（60．5％对49．1％,P=0．010;39．5％对25．O％,P=0．031）。结论：hMLHl启动子区-93G／A基因多态性与CRC的发生无关,但A等位基因和AA基因型可能与CRC的进展有关。     

粪便中p53与APC突变检测在大肠癌诊断中的意义

目的探讨在大肠癌患者粪便中检测p53、APC基因突变的可行性及其应用前景和意义。方法从36例大肠癌患者、10例大肠腺瘤患者以及30例正常对照者的粪便中分别提取DNA,应用PCR-SSCP法检测粪便中p53、APC基因突变情况。结果36例大肠癌患者粪便中p53及/或APC基因突变检出率为77.78%(19/36),二者突变率分别为52.78%(19/36)和36.11%(13/36);10例大肠腺瘤中p53基因突变检出率为0%,APC为20%;30例正常对照粪便中p53、APC基因突变检出率均为0%。p53的突变随大肠癌分化程度的降低而增高(P<0.05);APC基因突变与大肠癌组织学类型无关(P>0.05)。结论联合检测粪便中p53与APC突变在大肠癌诊断和筛查中有潜在的应用价值。     

结直肠锯齿状癌变途径的分子基础

锯齿状癌变途径是近年提出的概念．用来解释一部分缺乏染色体不稳定性结直肠癌的发生，包括部分增生性息肉、无蒂锯齿状息肉、锯齿状腺瘤和混合性息肉。早期发生BRAF突变、DNA高甲基化以及微卫星不稳定是大部分这类息肉的分子特征．经典的Wnt信号通路在这条途径中可能不起主要作用。     

Low Allele Frequency of MLH1 D132H in American Colorectal and Endometrial Cancer Patients

PURPOSE Hereditary nonpolyposis colon cancer is caused by mutations in DNA mismatch repair genes, predominantly MLH1 and MSH2. Classic MLH1 mutations cause an approximately 20-fold increase in colorectal cancer susceptibility. Recently, we identified a hypomorphic allele, MLH1 D132H , which impairs, but does not completely eliminate the function of MLH1 in tumor suppression. MLH1 D132H confers an approximately fivefold increase in colorectal cancer susceptibility and was first described in a cohort of Israeli colorectal cancer patients, with an estimated allele frequency of 1.3 percent. Because MLH1 D132H has only recently been described, the ethnic distribution of this risk allele is not well understood. This study was undertaken to determine both the frequencies of this risk allele in ethnic groups outside of Israel and whether families harboring this mutation have susceptibility to extracolonic cancers in the hereditary nonpolyposis colon cancer spectrum.METHODS We genotyped two independent cohorts: 629 population-based colorectal cancer patients ascertained from clinics in Orange, Imperial, and San Diego Counties, and 515 endometrial cancer patients ascertained from gynecologic oncology clinics in the Midwestern United States.RESULTS MLH1 D132H was not detected in either study cohort, which together totaled more than 1,100 American colorectal cancer and endometrial cancer patients.CONCLUSIONS The MLH1 D132H risk variant has significantly lower allele frequency in American compared with Israeli cancer patients and, alone, is unlikely to explain significant amounts of American sporadic colorectal cancer or uterine cancer susceptibility. Genetic testing for the MLH1 D132H allele exclusively is therefore unlikely to be cost effective for genetic risk assessment in American population-based and clinic-based colorectal cancer and endometrial cancer patients.Supported by grants from the American Cancer Society, Atlanta, Georgia (RSG-02-153-01), and NCI, Bethesda, Maryland (CA81488, CA098626, CA71754, and CA115231).     

Microsatellite instability and MLH1 promoter hypermethylation in colorectal cancer

Colorectal cancer (CRC) is caused by a series of genetic or epigenetic changes, and in the last decade there has been an increased awareness that there are multiple forms of colorectal cancer that develop through different pathways. Microsatellite instability is involved in the genesis of about 15% of sporadic colorectal cancers and most of hereditary nonpolyposis cancers. Tumors with a high frequency of microsatellite instability tend to be diploid, to possess a mucinous histology, and to have a surrounding lymphoid reaction. They are more prevalent in the proximal colon and have a fast pass from polyp to cancer. Nevertheless, they are associated with longer survival than stage-matched tumors with microsatellite stability. Resistance of colorectal cancers with a high frequency of microsatellite instability to 5-fluorouracil-based chemotherapy is well established. Silencing the MLH1 gene expression by its promoter methylation stops the formation of MLH1 protein, and prevents the normal activation of the DNA repair gene. This is an important cause for genomic instability and cell proliferation to the point of colorectal cancer formation. Better knowledge of this process will have a huge impact on colorectal cancer management, prevention, treatment and prognosis.