CCR2、 CCL5、 CCR5和CCL1基因多态性与中国汉族儿童结核病易感性的关联研究

目的 探讨CCR2、CCL5、CCR5和CCL1的基因多态性与中国汉族儿童结核病易感性的关系.方法 收集353例汉族儿童结核病患者,以同期查体的400名儿童作为对照,采用病例对照研究,应用高通量MassARRAY技术对于CCR2、CCL5、CCR5和CCL1基因的SNP位点进行基因分型研究.结果 CCR2、CCL5、CCR5和CCL1基因SNP位点的等位基因、基因型以及单体型在结核病组和对照组的分布差异均无统计学意义（P＞0.05）.结论 CCR2、CCL5、CCR5和CCL1的基因多态性与中国汉族儿童结核病易感不存在相关性.     

解整合素-金属蛋白酶33基因T1位点多态性与毛细支气管炎的相关性研究

目的 探讨在广州地区汉族儿童中解整合素-金属蛋白酶33(ADAM33)基因中的T1位点不同基因型及等位基因的分布频率与毛细支气管炎的相关性.方法 采用聚合酶链反应结合限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,检测60例毛细支气管炎儿童(试验组)及60例对照儿童(对照组)T1位点单核甘酸多态性.结果 在广州地区儿童中可检测到Tl位点的3种基因型(TT CT和CC),试验组3种基因型的分布频率分别为78.3％、16.7％和5％,对照组分别为88.3％、10％和1.7％,两组分布频率差异无统计学意义(-2.36,P＞0.05);试验组的T等位基因和C等位基因频率分别为86.7％和13.3％,对照组分别为93.3％和6.7％,两组分布差异也无统计学意义(x2=2.27,P＞0.05).结论 在广州地区汉族儿童中,ADAM33基因Tl位点基因多态性与毛细支气管炎发病无关.     

OX40基因rs2298212位点与汉族人群冠状动脉粥样硬化疾病的关联研究

目的 探讨OX40基因(TNFRSF4)rs2298212G/A位点与山东汉族人群冠状动脉粥样硬化疾病的相关性.方法 在山东大学齐鲁医院心内科和健康体检中心分别收集到冠状动脉粥样硬化疾病患者536例和正常对照544名,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法 对OX40基因rs2298212G/A多态性位点进行基因分型,并对数据进行统计分析.结果 基因型与等位基因频率分布在病例组与对照组之间差异均无统计学意义(P＞0.05).在回归校正了年龄、性别、体重指数、收缩压、舒张压、血糖、总胆固醇及甘油三酯等因素的影响后,基因型频率分布差异仍无统计学意义(P＞0.05).在对冠状动脉受累支数进行的分层分析发现,受累1支与受累3支之间,基因型与等位基因频率分布差异均有统计学意义(P＜0.05).结论 OX40基因rs2298212G/A多态位点同山东汉族人群冠状动脉粥样硬化疾病之间无关联性存在,但该位点可能与冠状动脉粥样硬化的严重程度相关.     

BARD1单核苷酸多态性与汉族儿童神经母细胞瘤相关性的研究

目的 探讨BARD1单核苷酸多态性与汉族儿童神经母细胞瘤的相关性.方法 采用病例对照研究,收集242例汉族神经母细胞瘤患儿及301例汉族健康儿童的外周血,通过PCR方法扩增目的DNA,应用Sequenom massarray对所扩增的DNA进行基因分型.以x2检验及logistics分析比较不同组基因型与神经母细胞瘤的关系.结果 BARD1的21个标签SNPs位点均符合Hardy-Weinberg平衡,BARD1的21个SNPs等位基因频率在患者组与对照组之间差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 未发现BARD1单核苷酸多态性与汉族儿童神经母细胞瘤有相关性.     

HLA-DQB1基因多态性与中国汉族人群系统性红斑狼疮的相关性

目的 探讨HLA-DQB1基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与汉族人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erthematosus,SLE)遗传易感性的相关性.方法 通过聚合酶链式反应-连接酶检测反应(polymerase chain reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)技术对908例SLE患者和961例健康对照rs3129716(HLA-DQB1)位点进行基因分型,同时结合临床表现分型,分析该位点与疾病及临床表型的相关性.分型结果用PLINK1.07软件进行统计分析.结果 rs3129716(HLA-DQB1)位点等位基因频率和基因型频率在SLE疾病组和对照组的分布差异无统计学意义(P＞0.05).三种遗传模型下的分析显示,两组间差异无统计学意义(P＞0.05).将SLE患者按血清学指标及临床表现分型,未发现相关性.结论 rs3129716(HLA-DQB1)与中国汉族人群SLE患者遗传易感性不相关.     

维生素D受体基因ApaⅠ和TaqⅠ位点多态性与帕金森病的相关性研究

目的 探讨维生素D受体(vitamin D receptor,VDR)基因ApaⅠ和Taq Ⅰ位点多态性与帕金森病(Parkinson's disease,PD)遗传易感性的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术和基因测序方法,检测285例中国北方汉族散发PD患者与285名正常对照VDR基因ApaⅠ和TaqⅠ位点多态性,并比较两组基因型和等位基因频率的差异.结果 ApaⅠ和Taq Ⅰ位点基因型和等位基因频率在PD组和对照组之间差异均无统计学意义(P＞0.05).将样本按性别及发病年龄分组后比较,ApaⅠ位点各亚组间基因型频率和等位基因频率差异亦无统计学意义(P＞0.05),而TaqⅠ位点的基因型分布在男性PD组(168例)与男性对照组(1 60名)之间差异有统计学意义(x2=4.187,P=0.032,OR=2.149,95％CI:1.011～4.567),男性PD组T等位基因频率较男性对照组显著增高(x2=3.867,P=0.036,OR=2.064,95％CI:0.989～4.307).结论 VDR基因ApaⅠ位点多态性与PD风险间无相关性,但TaqⅠ可能是男性PD的风险因素.     

GPER1基因多态性与自然流产的相关性研究

目的探讨GPER1基因rs10269151位点SNP多态性与流产之间的相关性。方法采用SNa Pshot法对117例自然流产汉族女性和107例对照组女性GPER1基因rs10269151位点进行的基因分型,采用SHEsis进行遗传分析,探讨其基因型和等位基因的频率分布差异。结果 rs10269151位点病例组基因型频率AA 85%、AG 6.84%、GG 92.31%,病例组AA 0.85%、AG6.84%、GG 92.31%,p Value0.05;病例组等位基因频率A 4.27%、G95.73%,对照组3.27%,96.73%,p Value0.05。结论GPER1基因rs10269151位点与自然流产之间缺乏关联性。     

KIM-1基因多态性与中国山东汉族人群糖尿病肾病的相关性研究

目的探讨肾脏损伤因子(KIM-1)基因2个SNP位点与中国山东汉族人群糖尿病肾病(DKD)的相关性,为糖尿病肾病的早期预防提供理论依据。方法收集2型糖尿病肾病(DKD)患者274例,健康对照(NC)个体248例。提取以上样品的全血基因组DNA,用聚合酶链式反应—限制性酶切片段长度(PCR-RFLP)多态性技术进行检测,对KIM-1基因启动子区的-416G>C和-1454G>A两个SNP位点的基因型频率、等位基因频率进行比较和分析。结果健康对照组与DKD组的-416G>C基因频率和基因型频率分布的差异有统计学意义(P=0.004,P=0.001)。健康对照组与DKD组的-1454G>A基因频率和基因型频率没有统计学差异。结论 -416G>C位点的多态性与中国汉族人群DKD的发生有关,GG基因型可能增加DKD的发病风险。     

固醇调节元件结合蛋白1c基因多态性rs2297508、rs11868035与甘肃汉族、东乡族人群2型糖尿病的相关性

目的 探讨固醇调节元件结合蛋白1c(sterol regulatory element binding protein-lc,SREBP-lc)基因多态性rs2297508、rs11868035在甘肃汉族、东乡族人群中的分布及其与2型糖尿病(type 2diabetes mellitus,T2DM)的相关性.方法 选择汉族2型糖尿病患者342例以及正常对照343人,东乡族2型糖尿病患者218例以及正常对照238人,采用聚合酶链反应-变性高效液相色谱法检测SREBP-1c基因型,采用氧化酶法或放免法测定血糖、胰岛素及血脂水平.采用卡方检验进行统计学分析.结果 SREBP-lc基因多态位点rs2297508、rs11868035在汉族和东乡族正常对照者中的基因型和等位基因频率分布差异无统计学意义(P＞0.05).上述位点在汉族、东乡族人群2型糖尿病患者C等位基因和CC基因型频率均明显高于对照组,差异均有统计学意义(P＜0.01).在汉族对照组中,rs2297508的C等位基因携带者的低密度脂蛋白胆固醇水平明显高于GG者,其差异有统计学意义(P＜o.05).在东乡族对照组中,CC基因型的低密度脂蛋白胆固醇水平明显高于GG者,其差异有统计学意义(P＜0.05).结论 SREBP-lc基因多态性rs2297508、rs11868035在甘肃汉族和东乡族人群中均与2型糖尿病发病存在关联.C等位基因可能是罹患2型糖尿病的危险因素之一.上述多态性在汉族和东乡族人群中的分布并无差异.SREBP-le基因多态性rs2297508可能与低密度脂蛋白胆固醇升高有关.     

DRD1基因4个多态性位点与注意缺陷多动障碍的关联分析

目的:探讨ADHD与DRD1基因4个多态性(G-48A,G-1251C,T-800C和T1403C)单个位点的关系.方法:对138名ADHD患者和119名正常对照进行以下遗传学分析:应用PCR-限制性内切酶分析技术分析4个SNP位点,检测各位点基因型和等位基因频率,经χ~2检验比较两组间各位点基因型及等位基因频率的差异.结果:①ADHD组中DRD1基因G-48A多态性-48C/-48G基因型频率明显低于对照组,差异有统计学意义(χ~2=4.318,P=0.045).②ADHD组和对照组在DRD1基因的其他3个多态性位点(G-1251C、T-800C和T1403C)等位基因和基因型频率分布均无统计学差异(P>0.05)).结论:①DRD1基因G-48A多态性与ADHD可能存在关联.-48G/-48G基因型可能是ADHD的保护因素.②DRD1基因的其他三个SNP(G-1251C,T800C和T1403C)与ADHD可能均无关联.     

ABCC2 Haplotype is Associated With Antituberculosis Drug-Induced Maculopapular Eruption

Genetic variants in ATP-binding cassette (ABC) transporter genes are associated with increased susceptibility to adverse drug reactions. We hypothesized that genetic variant ABC transporters (ABCB1 and ABCC2) may be candidate markers for predicting maculopapular eruption (MPE) induced by antituberculosis therapy. We compared the genotype distributions of single nucleotide polymorphisms and haplotypes in the ABCB1 and ABCC2 genes between 62 antituberculosis drug (ATD)-induced MPE cases and 159 ATD-tolerant controls using multivariate logistic regression analysis. There was no significant association between genetic polymorphisms in ABCB1 and ATD-induced MPE (P>0.05). Among seven selected SNPs of ABCC2, IVS3-49C>T in intron and I1324I were associated with ATD-induced MPE (P=0.029 and 0.036, respectively). In an analysis of the ABCC2 haplotypes (ht; -1549G>A_-24C>T_IVS3-49C>T_V417I), ht1[G-C-C-G] was significantly associated with ATD-induced MPE (P=0.032, OR=0.35, 95% CI: 0.16-0.95). No significant association between the other haplotypes and ATD-induced MPE was observed. An ABCC2 haplotype is associated with the presence of ATD-induced MPE in patients with tuberculosis and may be a genetic risk factor for the development of MPE induced by ATD.     

家族性热性惊厥与CAPS基因的相关分析

目的研究CAPS(calcyphsine)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点与家族性热性惊厥(febrile seizures,FS)的关系.方法通过NCBI的dbSNP数据库选择CAPS基因的2个单核苷酸多态性位点,应用聚合酶链式反应-限制性内切酶长度多态性技术,检测54例家族性热性惊厥患儿和90名健康对照者的CAPS基因2个SNPs位点的基因型,用SPSS软件判定个单核苷酸多态性基因型频率分布是否符合Hardy-Weinberg平衡,SNPs基因型频率和基因频率在正常人和患儿中的分布比较用R×C和2×2表x2检验并经连续性校正.结果位点rs7249419的基因型频率符合Hardy-Weinberg平衡,但是它的最小等位基因频率不足1%,其基因型频率和等位基因频率在正常人和患儿间的分布无显著性差异(P＞0.05).位点rs11437855只有1种基因型,均为无插入的纯合子.结论CAPS基因SNP rs7249419、rs11437855可能与家族性热性惊厥无关.     

单胺氧化酶A基因多态性与精神分裂症的关联研究

目的探讨河南地区汉族人群单胺氧化酶A（monoamine oxidase A，MAOA）基因多态性与精神分裂症的关系。方法参照CCMD-3诊断标准，选取212例精神分裂症患者与168名正常对照，应用聚合酶链反应及限制性片段长度多态性技术检测MAOA基因多态性，采用病例一对照的关联分析方法对精神分裂症患者及正常对照的基因型和等位基因频率进行分析。结果（1）MAOA基因的基因型在患者组和对照组中均符合Hardy-Weinberg平衡定律（X^2=0．618，dr：2，P〉0、05；X^2=3．173，df=2，P〉0．05）。（2）MAOA基因的基因型和等位基因频率在患者组与对照组间的分布差异无统计学意义（P〉0．05）。（3）按性别分组，男性患者组中CT基因型分布频率显著高于男性对照组（X^2=7．654，P=0．022）。（4）MAOA基因的基因型和等位基因频率在家族史阴、阳性间的分布差异无统计学意义（P〉0．05）。结论没有发现MAOA基因多态性与汉族精神分裂症的发病有关联，但对性别发病有影响，基因型CT可能是男性精神分裂症发病的易感因素。     

RTKN2、LDLR、APOB和APOC1基因多态性与类风湿性关节炎的相关性

目的：建立RTKN2基因rs3125734 C＞T、LDLR基因rs688 C＞T、APOB基因rs693 C＞T和APOC1基因rs4420638 A＞G四个SNP位点的PCR-HRM分子诊断方法,并研究其与兰州地区汉族人群类风湿关节炎易感的相关性。方法：通过设计引物和PCR-HRM检测体系优化,建立四个SNP位点的基因分型方法。检测588例RA患者和200例健康对照者标本,通过病例对照研究分析其RA易感性。结果：经测序验证所建PCR-HRM检测方法的正确性。结果显示,rs3125734和rs688位点的基因型和等位基因频率在RA组和对照组间存在统计学差异（P分别为0.046和0.016、0.014和0.02）,rs3125734杂合突变型CT在RA组与对照组间差异有统计学意义（χ2=4.013,P=0.045,OR=1.613,95% CI:1.010-2.576）,rs688纯合突变型TT在两组间有显著差异（χ2=6.853,P=0.009,OR=0.273,95% CI:0.103-0.721）。rs693和rs4420638位点基因型和等位基因频率在RA组和对照组间差异无统计学意义（P＞0.05）。经RF和anti-CCP将RA组分层后,rs4420638位点基因型和等位基因频率在RF(-)RA组与对照组间有统计学差异（χ2=4.710,P=0.030;χ2=4.110,P=0.043）,其杂合突变型AG在两组间存在显著差异（χ2=4.046,P=0.044,OR=1.799,95%CI：1.015-3.186）;rs693在各组间无显著差异（P＞0.05）。构建rs688和rs4420638单倍型,单倍型CA和TA在RA组和对照组间有显著差异(P=0.020,OR=1.408,95%CI：1.054-1.881;P=5.73×10-5,OR=0.443,95%CI：0.295-0.664)。 结论：建立的rs3125734、rs688、rs693和rs4420638位点PCR-HRM分子诊断方法可用于常规化检测。rs3125734、rs688和rs4420638位点是兰州地区汉族人群的RA易感基因,rs3125734位点CT基因型和rs4420638位点AG基因型是RA发病的危险因素,而rs688位点TT基因型是RA的保护性因素。rs688和rs4420638的单倍型CA可显著增加RA的发病风险,TA可降低RA的发病风险。     

HLA-DPB1及PRTN3基因和ANCA相关性小血管炎的相关性分析

背景 ANCA相关性小血管炎（ANCA-associated vasculitides,AAV）包括肉芽肿性多血管炎（granulomatosis withpolyangiitis,GPA）、显微镜下多血管炎（microscopic polyangitis,MPA）和嗜酸细胞性肉芽肿性多血管炎（eosinophilicgranulomatosis with polyangitis,EGPA）.前期的AAV易感基因研究主要着眼于白种人,鉴于人群异质性及种族差异的存在,故而本研究着眼于探究HLA-DPB1、PRTN3及CD226基因与中国北方汉族人群AAV的相关性.方法 使用Sequenom MassArray质谱阵列技术（Sequenom iPLEX assay,San Diego,CA）对待检者进行基因分型.本研究共纳入了196例AAV患者（GPA 100例,MPA 76例,EGPA 20例）和485名健康对照者.结果 GPA组与健康对照组比较,Rs3117242（HLA-DPB1）的T等位基因频率显著上升（68.0％ vs.50.4％）,差异有统计意义（OR=2.09,95％ CI：1.51～2.88,Pc ＜0.001）,但MPA组、EGPA组与健康对照组比较,差异均无统计学意义（Pc =0.09,Pc =0.94）.针对Rs3117242（HLA-DPB1）位点的基因型频率进行分析,其结果与等位基因频率分析结果类似.与健康对照组比较,无论是AAV组或GPA组或PA组或EGPA组,其他基因的SNP位点的等位基因频率或是基因型频率分布的差异均无统计学意义（Pc＞0.05）.结论 Rs3117242（HLA-DPB1）是中国北方汉族人群GPA的易感位点.这一研究为深入探讨GPA的发病机制提供了新的线索.     

SLC22A12基因第8外显子和第8内含子多态与中国汉族人原发性高尿酸血症关联研究

目的 研究原发性高尿酸血症患者SLC22AI2基因第8内含子和第8外显子单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点与原发性高尿酸血症遗传易感性的关系.方法 选择山东沿海地区原发性高尿酸血症患者215例,正常对照人群323名.提取基因组DNA,PCR扩增SLC22A12基因第8内含子和第8外显子,对PCR扩增产物进行测序.结果 序列分析发现:(1)SLC22AI2基因第8外显子存在T1309C单核苷酸多态,第8内含子存在-103A＞G单核苷酸多态,这2个多态位点完全连锁.(2)高尿酸血症组-103A＞G G等位基因频率和T1309C C等位基因频率明显高于正常对照组(均为51.9%vs.42.4%,P＜0.01);(3)高尿酸血症组GG+GA基因型频率和CC+CT基因型频率显著高于正常对照组(均为80.0%vs.69.0%,P＜0.01).(4)-103 A＞G和T1309C基因多态中,含有等位基因G的基因型GG+GA及含有等位基因C的基因型CC+CT均使高尿酸血症的发病危险性上升了1.79倍(OR=1.79,95%CI:1.19～2.70).结论 SLC22A12基因第8外显子T130gC及第8内含子-103A＞G SNP与原发性高尿酸血症密切相关.     

TGF-β1和ADAM33基因交互作用与儿童哮喘易感性及严重程度相关性

目的:探讨转化生长因子β1(TGF-β1)和解整合素金属蛋白酶33(ADAM33)基因单核苷酸多态性与儿童哮喘易感性及严重程度相关性。方法:采用以医院为基础的病例对照研究(110例哮喘患儿和144例对照)方法,三个多态性位点(V4、T2、T869C)用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(PCR-RFLP)技术进行基因分型,应用MDR软件分析基因各位点之间交互作用。结果:TGF-β1基因的T869C位点基因型及等位基因频率分布在哮喘组和对照组比较差异均无统计学意义(P>0.05)。哮喘组ADAM33基因V4位点C和T2位点A等位基因频率显著高于对照组(P<0.01),而V4位点的CC基因型及T2位点的GA基因型分布在轻中度哮喘组与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05),T2位点的AA基因型分布在重度哮喘与对照组比较无显著性差异(P>0.05)。MDR交互作用分析显示,ADAM33基因V4和T2位点构成的2个位点最佳模型;ADAM33基因位点V4、T2和TGF-β1位点T869C构成的3个位点最佳模型两组比较均有统计学差异(P<0.05)。结论:ADAM33基因V4和T2位点与儿童哮喘发生及其严重程度相关,同时TGF-β1基因T869C位点与ADAM33基因V4和T2位点均具有明显交互作用     

Polymorphisms in the matrix metalloproteinase-2 and tissue inhibitor of metalloproteinase-2 and the risk of human adenomyosis

The matrix metalloproteinases (MMPs) and tissue inhibitor of metalloproteinases (TIMPs) may contribute to the development of adenomyosis. The aim of the present study was to investigate whether three single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the promoter regions of MMP-2 (-1306C/T and -735C/T) and TIMP-2 (-418G/C) genes were related to the risk of adenomyosis development. Genotypes were determined by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay in 180 adenomyosis patients and 324 frequency-matched control women in a Chinese population. There were significant differences in allele frequencies and genotype distributions of the MMP-2 -1306C/T polymorphism between patients and control women (P = 0.01 and 0.04, respectively). The frequency of C allele in patients (92.2%) was significantly higher than in the controls (87.0%) (P = 0.01). Compared with the C/T+T/T genotypes, the C/C genotype could significantly increase the risk of adenomyosis development, with an odds ratio of 1.83 (95% CI = 1.13-2.96). However, no statistically significant difference was found in allele frequencies and genotype distributions of MMP-2 -735C/T and TIMP-2 -418G/C SNPs between the two groups (all P values > 0.05). Two polymorphisms of MMP-2 displayed linkage disequilibrium (D' = 0.74). The haplotype analysis suggested no significant association of four haplotypes with the risk of adenomyosis development. Our results indicated an association of MMP-2 -1306C/T polymorphism with the risk of adenomyosis, suggesting a potential role in adenomyosis development in North Chinese women.     

MMP-2和TIMP-2基因多态性与子宫内膜异位症和子宫腺肌病发病风险的关联研究

目的 探讨基质金属蛋白酶-2(matrix metalloproteinase-2,MMP-2)和金属蛋白酶组织抑制剂-2(tissue inhibitor of metalloproteinase-2,TIMP-2)基因启动子区单核苷酸多态性与子宫内膜异位症和子宫腺肌病发病风险的关系.方法 采用PCR-限制性片段长度多态方法检测298例子宫内膜异位症患者(内异症组)、180例子宫腺肌病患者(腺肌病组)和324名对照妇女(对照组)MMP-2和TIMP-2基因型频率的分布.结果 MMP-2-1306C/T多态的基因型和等位基因频率分布在子宫内膜异位症组与对照组间差异无统计学意义(P＞0.05);但在腺肌病组和对照组间MMP-2-1306C/T多态的基因型和等位基因频率分布均有明显的差异(P＜0.05);与CT+TT基因型相比,CC基因型明显增加腺肌病的发病风险,OR值为1.83(95%CI:1.13～2.96).MMP-2-735C/T多态的基因型和等位基因频率分布在3组间均未发现明显差异(P＞0.05);统计学分析显示MMP-2基因的2个多态性位点间存在着连锁不平衡(D'=0.74),但4种单倍型频率在3组之间分布差异无统计学意义(P＞0.05).TIMP-2-418G/C多态的等位基因频率分布在3组间差异无统计学意义(P＞0.05),但CC基因型频率在子宫内膜异位症组患者中为0.7%,与对照组(3.7%)比较,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 MMP-2-1306C/T多态C等位基因的存在可明显增加腺肌病的发病风险,但与子宫内膜异位症的发病风险无关;MMP-2-735C/T和77MP-2-418G/C多态与子宫内膜异位症和腺肌病的发病风险无明显关联.