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相似文献
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1.
本文报告了中国广西狂犬病毒野毒株(CGX89-1株)糖蛋白基因cDNA的核苷酸序列及其推导的氨基酸序列。CGX89-1株的糖蛋白基因从起始密码ATG到终止密码TAA共有1575个核苷酸残基,可编码形成524个氨基酸残基的多肽链,经修饰后形成具有505个氨基酸残基构成的狂犬病毒糖蛋白。CGX89-1株的糖蛋白基因和核苷酸组成分别为:A占27.11%,T占26.29%,C占21.97%和G占24.63%。核苷酸序列和巴斯德株(PV株),国际标准攻击毒株(CVS株),中国狂犬病毒疫苗株(3aG株)相比,同源性分别为84.1%,83.1%和84.5%。其推导的氨基酸序列和PV株、CVS株和3aG株相比其同源性分别为92.4%,89.7%和89.5%。CGX89-1株也具有3个N-糖基化位点,分别位于第37位、157位和319位的氨基酸残基上。糖蛋白的膜外区部分重要抗原位点和PV株、CVS株及3aG株具有较高的一致性。  相似文献   

2.
我国登革2型病毒43株非结构蛋白NS1基因的特征   总被引:1,自引:0,他引:1  
对我国1987年从广西分离的登革2型病毒43株非结构蛋白NS1基因的核苷酸序列进行了分析,结果表明登革2型病毒43株非结构蛋白NS1基因含有1056核苷酸编码352个氨基酸,并就其核苷酸序列及其相应的氨基酸序列与我国1985年海南流行高峰期分离的D2-04株、国际参考株新几内亚C株(NGC)、牙买加株(JAM)、候选疫苗株(S1)和马来西亚流行株M1(登革出血热)、M2(登革休克综合征)、M3(登革热)进行比较,发现核苷酸序列的同源性分别为92.2%,93.7%,93.3%,90.7%,89.9%,89.5%,89.3%,氨基酸的类似性分别为89.8%,92.6%,93.3%,91.2%,90.6%,90.1%,89;9%,推断的氨基酸序列含有两个糖基化位点,分别位于氨基酸残基的130和207位,一个可能的蛋白裂解位点350~352和10个保守的半胱氨酸残基。  相似文献   

3.
丙型肝炎病毒E2/NS1区基因cDNA的克隆及序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
从北京地区1份丙型肝炎病毒(HCV)感染者血清中提取RNA,经逆转录和套式聚合酶链反应扩增HCVE2/NS1区基因约930bp,将其插入至pGEM-T质粒载体中,利用双脱氧链末端终止法测出该基因5’端431bp的核苷酸序列,将此序列与其它9个HCV分离株的相应序列进行比较分析,结果表明,此序列与HCVⅡ型序列同源性较高,核苷酸水平同源性在80%以上。由其编码的HCV外膜蛋白N端存在两个高变部位(HVR),在HVR内、外具有几个保守氨基酸残基和氨基酸区域,它们与外膜蛋白空间构型的维持有关。  相似文献   

4.
本文报道1987年从广西病人血清中分离的登革2型(D2)病毒D2-43株和1985年从海南病人血清中分离的D2-04株乳鼠致病性的差异与基因变化的关系。结果表明D2-43株对乳鼠致病,D2-04株不致病。D2-43株和D2-04株C到NS1基因的读码框架基本相同,均由3381核苷酸组成,编码氨基酸总数1127。包含三个结构蛋白C.PrM(M)、E和一个非结构蛋白NS1。该两株病毒核苷酸序列同源性为93.8%,氨基酸序列的类似性为91.3%。C和E基因同源性为95.0%~95.8%,NS1基因为92.2%,M基因为86.7%,两株之间核苷酸序列的主要差异是在M基因。两株病毒的C-NS1基因与国际参考毒株比较,43株与JAM株类侧性最高,其次是NGC株,与S1株类似性最小。而04株只有C、E和NS1与JAM株最高,PrM(M)都与NGC株最高。43株与04株的M基因相比较,04株的PrM(M)基因的同源性低于43株,说明两株与国际参考毒株比较,主要差异也在M基因,乳鼠致病性差异可能与M基因变化有关。  相似文献   

5.
汉滩病毒Z10株G1糖蛋白编码区克隆及序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 汉滩病毒浙10(Z10)株G1糖蛋白编码区的克隆、核苷酸序列分析,提供我国应用最为广泛的肾综合征出血热(HFRS)疫苗株序列资料。方法 反转录PCR法扩增G1基因片段,克隆入pGEM-T载体,双脱氧链终止法测定核苷酸序列。结果 测定1449个核苷酸,可编码483个氨基酸。与I型76/118、Lee、Hojo株比较核苷酸同源性分别为87%、86%、86%,与Ⅱ型R22株同源性为67%。比较氨基  相似文献   

6.
采用反转录-PCR方法,分节段扩增汉坦病毒A9株M基因片段cDNA,并克隆入pGEMT载体中,用双脱氧末端终止法直接测定序列。结果表明,A9株M片段cDNA由3618个碱基组成,编码1135个氨基酸,  核苷酸序列及由其推导的氨基酸序列同76/118株的同源性分别为94.33%和97.80%,说明汉坦病毒A9株与76/118株在糖蛋白的结构上高度保守。同76/118株比较,在3'末端非编码区变异极大,变异率为20%,且多了2个核苷酸。A9株M基因片段核苷酸序列的获得,为利用该cDNA进行基因工程疫苗的研制创造了条件。  相似文献   

7.
广州地区散发性戊型肝炎病毒基因片段序列分析   总被引:7,自引:0,他引:7  
目的对广州地区散发性戊型肝炎病毒(HEV)作基因片段序列分析。方法用逆转录套式聚合酶链反应(RT-nestedPCR)检测了8例广州地区散发性戊肝患者粪便和血清中的HEVRNA,其中3例粪便阳性。对阳性PCR产物进行基因克隆、核酸序列分析。结果广州地区G1、G2、G3株与缅甸株(B)、巴基斯坦株(P)、墨西哥株(M)、中国新疆株(Ch1.1)和广州血清株(G-9)的核苷酸和氨基酸的同源性均值分别为80.67%和88.60%(B)、81.25%和89.20%(P)、77.45%和84.81%(M)、81.25%和89.20%(C)、97.85%和96.20%(G)。结论广州HEV株有一定程度的变异。  相似文献   

8.
报告了2型登革病毒04株结构蛋白C,PrM(M)、E和非结构蛋白NS1基因的核苷酸及氨基酸序列,并与国际参考株新几内亚C株、牙买加株和候选疫苗S1株进行了比较。结果表明,从壳体蛋白C到主要非结构蛋白NS1,这一开放读码框架核苷酸总数为3381,编码1127个氨基酸;在E蛋白区有3个保守的氨基酸序列,分别位于E区的98-111、371-378、416-422;有2个潜在的糖基化位点,分别位于E区的Asn-67和Asn-153位;有12个保守的半胱氨酸残基。非结构蛋白NS1有两个糖基化位点,位于NS1区的130和207位,有10个保守的半胱氨酸残基。在结构蛋白C、PrM(M)、E和非结构蛋白NS1中,E蛋白表现最为保守,其次是C蛋白。D2-04株病毒在核苷酸水平与氨基酸水平上与其他2型病毒株比较,我国04株较类似于牙买加株,其次是NGC株,与S1株类似性最小。说明我国病毒株与牙买加株相关性较大,与S1株相关性较小。  相似文献   

9.
本文报告了我国登革Ⅱ型病毒3个分离 株(04、05和43株)包膜蛋白基因的核苷酸序列及推断的氨基酸序列。并通过美国MACAW微机程序对3株之间的核甘酸与氨基酸序列进行了比较分析,并分别与其它Ⅱ型毒株进行比较,发现04、05和43株核苷酸序列同源性为95.76%~95.96%,它们之间无明显差别。氨基酸类似性为92.12%~94.30%,氨基酸类似性略低于核苷酸序列同源性。通过变化的核苷酸在三联密码  相似文献   

10.
使用PCR对21份采集于1995年中的云南陇川县HIV-1阳性静脉吸毒者外周血单个核细胞(PBMCs)样品进行扩增,从17份样品中获得了HIV-1膜蛋白(env)基因的核酸片段,并对其C2-V3及邻区450个核苷酸序列进行了测定和分析。研究结果表明,17份陇川样品中存在B和C两种亚型的HIV-1毒株序列,各亚型内的基因离散率分别为4.7%和3.3%。与A~E参考亚型及部分B和C亚型代表株序列相比较,属陇川B亚型的14个毒株与包括泰国、缅甸及云南瑞丽在内的B亚型毒株序列十分接近,基因离散率在3.9%~4.5%的范围内;属陇川C亚型的3个毒株则与代表印度毒株的C亚型共享序列及瑞丽C亚型毒株序列十分相似,其基因离散率均为2.5%。以上数据提示,HIV-1在陇川的流行时间不长,且B和C亚型毒株的传入时间相差1年左右。对B亚型毒株V3环序列的分析还发现,位于V3环顶端的四肽序列中GPGQ占64.3%,GPGR则仅占28.6%,且编码其精氨酸(R)的密码子均为CGA而不是AGA。此结果与作者根据早期瑞丽HIV-1毒株序列研究结果得出的推测相吻合。  相似文献   

11.
人巨细胞病毒单克隆抗体识别的抗原表位的筛选   总被引:5,自引:1,他引:4  
目的找出人巨细胞病毒(HCMV)单克隆抗体识别的抗原表位以进行HCMV多肽疫苗的研制。方法通过链亲和素-生物素的作用将HCMV单抗固定在酶联板上,加入噬菌体随机六肽文库,经过三轮捕捉、洗脱、扩大培养的筛选过程,并逐轮增加冲洗强度,与HCMVMcAb具有亲合力的噬菌体得到了富集;从最后得到的三级库中,随机挑选16个单克隆,测定其所携带的外源DNA的序列,找出一致序列并进行同源性查询。结果16个克隆中有15个序列相同,5'-AGTGCTGGTTGGGCTTCT-3',对应的氨基酸序列为Ser-Ala-Gly-Trp-Ala-Ser,此序列同源性查询结果显示与HCMV病毒膜糖蛋白UL01有78.8%的同源性,其中有4个氨基酸残基(AGWA)是完全相符的。结论所筛选到的六肽序列可能为HCMV抗原表位,从而说明用噬菌体肽库技术寻找抗原表位的可行性  相似文献   

12.
应用分子克隆技术,构建了含全长人B7-1cDNA(867bp)的逆转录病毒表达载体pLNC-hB7-1。以pCDM8-hB7-1为模板,5'引物为:ACCCTAAGCT,TCTGAATTCATGGGCCACAC,内含HindⅢ切点及起始密码ATG,3’引物为:CTTCTGCGTTAACTG-TTATACAGGGCGTAC,内含HpaI切点和终止密码TAA,经PCR扩增及电泳回收后得到纯化PCR产物,用内切每HindⅢ和Hpal消化后,定向插入经同样内切酶消化的pLNCX载体,获得含人B7-1cD…  相似文献   

13.
报告了中国狂犬病固定毒aG株核衣壳蛋白(N蛋白),核蛋白壳磷酸蛋白(NS蛋白,又称M1蛋白)和基质蛋白(M蛋白,又称M2蛋白)蛋白基因的核苷酸序列和氨基酸推导序列。各基因编码区的全长分别是:N基因1352,NS基因894和M基因609个核苷酸。aG和CVS株的N,NS和M基因的核苷酸序列都具有高的同源性,分别为91.95%,90.27%和90.80%。  相似文献   

14.
报告了中国狂犬病固定毒aG株核衣壳蛋白(N蛋白),核蛋白壳磷酸蛋白(NS蛋白,又称M1蛋白)和基质蛋白(M蛋白,又称M2蛋白)蛋白基因的核苷酸序列和氨基酸推导序列。各基因编码区的全长分别是:N基因1352,NS基因894和M基因609个核苷酸。aG和CVS株的N,NS的M基因的核苷酸序列都具有高的同源性,别为91.95%,90.27%和90.80%。  相似文献   

15.
根据杜氏利什曼原虫(L.donovani)与婴儿利什曼原虫(L.infantum)基因组核苷酸序列之间具有高度的同源性的特点,设计合成了酸性核糖体蛋白-1(ARP-1)基因序列特异性的引物,应用多聚酶链反应(PCR)技术,以杜氏利什曼原虫的基因组DNA为模板,扩增获得了杜氏利什曼原虫的ARP-1基因克隆。序列分析表明,杜氏利什曼原虫与婴儿型利什曼原虫ARP-1基因的核苷酸序列之间的同源性为93%,编码的氨基酸残基序列的同源性为98.0%。  相似文献   

16.
获得抗体的可变区基因是由鼠源性McAb制备重组抗体的前提,本实验合成与轻链可变区(VL)FR1和FR4互补的通用引物,由分泌抗人C1-INHMcAb的杂交瘤F7细胞株提取总RNA,经RT-PCR扩增出F7VL的cDNA片段,并将其克隆入pUC18/19测序载体,从两端进行双脱氧核苷酸随机终止法的DNA序列测定。结果显示:VLcDNA是由303个碱基组成,编码101个氨基酸残基。由国际联机检索进行EMBL和Kabat基因库扫描发现:F7VL仅与Ig同源,符合小鼠Ig的VL基因特征,同源性为60%~80%。根据Kabat分类方法,F7VL基因推导的氨基酸序列应归属于小鼠Ig的VL基因IV亚组,是由Vk-Jk1重排产生。CDR3含有9个氨基酸残基,其中含3个不相同氨基酸残基,VL大多数的氨基酸变化集中在FR1和CDR1区,F7VL符合IgVL氨基酸残基变化的基本特征。Cys23和Cys88残基位于F7VLCDR1和CDR3的起始点,与二硫键形成有关。成功获得F7VL基因为进一步构建和表达单链Fv(scFv)抗体打下了良好的基础。  相似文献   

17.
目的 构建表达狂犬病毒糖蛋白基因(GP)的重组人腺病毒。方法 克隆狂犬病毒疫苗株GP基因并测序,将其插入E3区缺失的Ad5载体,置于E3区早期启动子的控制下,通过同源重组,蚀斑纯化,筛选表达GP的重组人腺病毒。用ELISA法检测表达的糖蛋白,快速荧光灶抑制试验(RFFIT)法测定此重组病毒免疫小鼠后产生的中和抗体。结果 获得的3aG株基因的开放读码框为1575个核苷酸,编码524个氨基酸;经同源重  相似文献   

18.
将人单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)的cDNA插入融合蛋白表达载体pGEX-4T-1中,构建成质粒pGEX/MCP转化大肠杆菌JM109,经IPTG诱导后合成GST-MCP-1融合蛋白。用12%SCS-PAGE检测在30kD左右有新生蛋白条带出现,表达量约占菌体总蛋白的31.7%,趋化实验证明,该产物具备明确的单核细胞趋化活性。  相似文献   

19.
酪氨酸激酶受体基因(receptortyrosinekinasegene,RET基因)被定位于染色体10q11.2上,其突变可导致3种多发性内分泌瘤综合征和先天性巨结肠的发生。为了探讨RET基因突变在先天性巨结肠发病中的作用,采用多聚酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)及单链DNA构象多态性分析(single-strandedDNAconformationalpolymorphism,SSCP)的方法,对34例散发先天性巨结肠基因组DNA进行RET基因第6外显子突变筛查,并对电泳条带变异的PCR产物进行了直接核苷酸序列分析。发现1例为GACTCAGAC→GAATCAAAC碱基突变,导致两个氨基酸发生改变。表明RET基因突变与先天性巨结肠发病有关。  相似文献   

20.
将人单核细胞趋化蛋白-1(MCP-1)的cDNA插入融合蛋白表达载体pGEX-4T-1中,构建成质粒pGEX/MCP转化大肠杆菌JM109,经IPTG诱导后合成GST-MCP-1融合蛋白。用12%SDS-PAGE检测在30kD左右有新生蛋白条带出现,表达量约占菌体总蛋白的31.7%。趋化实验证明,该产物具备明确的单核细胞趋化活性。  相似文献   

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