结核杆菌检测基因芯片的制备研究

目的　建立结核杆菌检测基因芯片的制备技术。方法　制备和标记靶基因 ,用点样仪将靶基因点于玻片介质上 ,并经点样后处理制成基因芯片 ,用扫描仪测定处理前后芯片上荧光强度的变化 ,计算 DNA固定率 ,同时测定和比较两种不同玻片、不同点样液和三种不同点样后处理方法的 DNA固定率。结果　制备结核杆菌检测基因芯片 ,用醛基修饰玻片作为介质 ,用 DMSO溶液作为点样液 ,点样后芯片处理以水合 1小时再干燥 30分钟为佳。结论　本研究所建立的结核杆菌检测基因芯片制备技术具有较高的效率和可靠的实用性能     

基因芯片的制备研究

目的：建立基因芯片的制备技术。方法：基因样本准备,将带荧光标记的ＰＣＲ产物用点样仪点于玻片介质上,并经过点样后处理制备成基因芯片,用扫描仪测定前后芯片上荧光强度的变化,计算ＤＮＡ固定率,分别设计了５种玻片３种固定条件和６种点样后处理方法的固定率测定。结果：对芯片制备的各种条件和方法优化实验表明,ｃＤＮＡ的氨基修复,点样后的ＵＶ交联和芯片室温干燥处理能有效提高ＤＮＡ的固定率。结论：本研究建立的基因芯     

红白血病K562细胞基因表达谱芯片制作研究

以人红白血病K562细胞为材料，应用限制性显示PCR（RD-PCR）技术分离到K562细胞在诱导分化药物羟基脲诱导分化前后不同时期的cDNA片段3256条，并用DNA芯片仪制作了K562细胞基因表达谱芯片。对芯片制作中不同点样液及处理条件对玻片上DNA固定效率的影响，样品DNA最优浓度等进行了初步研究，结果认为用DMSO作点样液、样品DNA浓度为0.3μg/μL、点样后经紫外交联（150mJ）、80℃干烤2h,DNA探针在玻片上的固定效率可达95%。用此法制作的K562基因表达谱芯片得到较好的杂交效果。     

病毒性肝炎基因芯片检测肝炎肝硬化患者肝组织中HBV DNA的研究

目的:研究病毒性肝炎基因芯片的制备及其检测HBV DNA的准确性.方法:将PCR扩增的HBV DNA探针用点样仪点于玻片介质上,并经过点样处理后制备成基因芯片;收集肝炎后肝硬化肝组织标本99份,分别用基因芯片、原位分子杂交法、免疫组织化学法检测HBV DNA和HBcAg,比较各种方法的优缺点.结果: 53例HBcAg、HBV DNA阳性组织中基因芯片检测阳性40例; HBcAg阳性22例中基因芯片检测阳性6例; 32例HBcAg HBV DNA阴性组织中基因芯片检测均阴性.结论:肝炎基因诊断芯片可以检测肝组织中HBV DNA,准确率可达75%,假阳性率低.     

基因芯片技术及其应用

基因芯片的产生仅10年左右的时间,但在制备方法及应用方面都得到了极快的发展。本对基因芯片的产生及发展、主要制备原理以及应用作了概括的介绍。目前,基因芯片最常用的介质是表面修饰了特殊基团的玻片,使DNA分子通过共价键同玻片相连。通常被固定的元素是DNA片段或寡核苷酸。最常用的制备技术是直接点样法,即以针点或喷点的方式制备微矩阵基因芯片;此外,还有原位合成法及电定位法等制备芯片。基因芯片的应用概括起来有两大用处;检测基因的量及检测基因的结构（质）,前主要用于大规模检测基因表达的改变情况;后主要指DNA的序列分析,包括测序及再测序、SNP分析、突变检测等,因此在后基因组研究、分子诊断及分子检测方面具有广阔的应用前景。     

基因芯片检测肝炎肝硬化患者肝组织中HBVDNA

目的 :研究病毒性肝炎基因芯片的制备 ,用肝炎基因诊断芯片 ,免疫组织化学法和原位分子杂交法 ,检测 99例乙型肝炎后肝硬化肝组织中 HBV DNA,比较各种方法优缺点。方法 :将 PCR扩增的 HBVDNA探针用点样仪点于玻片介质上 ,并经过点样处理后制备成基因芯片 ;收集肝炎后肝硬化肝组织标本 99份 ,分别用基因芯片、原位分子杂交法、免疫组织化学法检测 HBVDNA和 HBc Ag。结果 :5 3例 HBc Ag、HBVDNA阳性组织中基因芯片检测阳性 40例 ;HBc Ag阳性 2 2例中基因芯片检测阳性 6例 ;32例 HBc Ag HBVDNA阴性组织中基因芯片检测均阴性。结论 :肝炎基因诊断芯片可以检测肝组织中 HBVDNA,准确率可达 75 % ,假阳性率低。     

基因芯片检测肝炎肝硬化患者肝组织中HBVDNA

目的研究病毒性肝炎基因芯片的制备，用肝炎基因诊断芯片，免疫组织化学法和原位分子杂交法，检测99例乙型肝炎后肝硬化肝组织，比较各种方法的优缺点。方法将PCR扩增的HBVDNA探针用点样仪点于玻片介质上，并经过点样处理后制备成基因芯片；收集肝炎后肝硬化肝组织标本99份，分别用基因芯片、原位分子杂交法、免疫组织化学法检测HBVDNA和HBcAg。结果53例HBcAg、HBVDNA阳性组织中基因芯片检测阳性40例：22例HBcAg阳性组织中基因芯片检测阳性6例；32例HBcAg、HBVDNA阴性组织中基因芯片检测均阴性。结论肝炎基因诊断芯片可以检测肝组织中HBVDNA，准确率可达75％，假阳性率低。     

人胎盘基因表达谱芯片的初步研究

目的：制备人胎盘基因表达谱芯片，并用于基因差异表达分析。方法：用基因芯片点样仪将胎盘基因文库探讨打印在氨基包被的玻片上制备表达谱芯片。分别提取对照组与三氧化二砷处理的K562细胞总RNA，纯化mRNA后反转录成cDNA，再以限制性显示技术进行荧光标记，将两组荧光标记的样品混合后与芯片进行杂交，杂交后清洗芯片，干燥后对芯片进行扫描，分析杂交结果。结果：建立了较可靠的制备与检测基因表达谱芯片的方法，并筛选出45个差异表达基因片段，结论：制备的人胎盘基因表达谱芯片可有效地应用于基因的差异表达分析。     

基因芯片技术检测丁型肝炎病毒的研究

目的 制备检测丁型肝炎病毒(HDV)基因芯片。方法 针对HDV基因保守区域设计多对PCR引物。用芯片点样仪将PCR产物点到玻片上制成基因芯片。样品标记采用限制性显示技术，样品标记后进行杂交。结果 运用PCR技术得到多个HDV特异性基因片段，序列分析表明，所扩增的片段均属于HDV特异基因。杂交结果显示，样品和HDV诊断基因芯片杂交的敏感性和特异性均佳。结论 用基因芯片检测HDV具有敏感、高效、检测结果可靠的优点，有着较大的应用前景。     

人胎盘基因表达谱芯片的初步研究

目的 制备人胎盘基因表达谱芯片,前用于基因差异表达分析。方法用基因芯片点样仪将胎盘基因文库探针打印在氨基包被的玻片上制备表达谱芯片。分别提取对照组三氧化二砷处理的K562细胞总RNA,纯化mRNA后反转录成cDNA。再以限制性显示技术进行荧光标记,将两组荧光标记的样品混合后与芯片进行杂交。杂交后清洗芯片,干燥后对芯片进行扫描,分析杂交结果。结果 建立了较可靠的制备与检测基基表达芯片的方法,并筛选出45个差异表达基因片段。结论 制备的人胎盘基因表达谱芯片可有效地应用于基因的差异表达分析。     

基因芯片法对丙型肝炎病毒RNA的基因型分析

目的：制备丙型肝炎病毒(HCV)基因的分型诊断芯片，检测其对丙型肝炎患者血清HCVRNA基因分型诊断的价值。方法：根据HCV 5′端非编码区末端(5′UTR)和C区设计引物和特异性探针，将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后，配制成50μmol／ml的点样液，用点样仪点到特殊处理的玻片介质上，制成HCV基因分型诊断芯片。收集HCVRNA阳性的丙型肝炎患者血清30份作为实验组，健康人血清30份作为对照组。用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCVRNA定量检测，实验组血清HCVRNA含量均大于5()()copies／ml，对照组血清HCVRNA均为阴性。两组血清进行HCVRNA分离纯化、逆转录反应、巢式PCR扩增后，分别用基因芯片与核酸序列测定法进行双盲HCV基因分型检测。结果：实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性；基因分型1b型23例，3a型2例，3b型1例，2a型1例，2b型1例，混合型1b 2a1例，1b 3b型1例；核酸序列测定分型1b型25例，3a型2例，3b型1例，2a型1例，2b型1例；两种方法检测的基因分型符合率为93．3％。对照组血清基因芯片检测均阴性。结论：制备的HVC基因诊断芯片可以用于检测血清HCVRNA，并进行基因诊断分型，准确率较高。     

肝炎基因诊断芯片对丙型肝炎病毒基因分型检测的初步研究

目的 研究丙型肝炎病毒（HCV）基因分型诊断芯片的制备和其对丙型肝炎患者血清HCVRNA基因分型诊断的准确性。方法 根据丙型肝炎病毒5′端非编码区末端（5UTR）和C区设计引物和特异性探针,将设计的20条特异性寡核苷酸探针用核苷酸合成仪合成后,配制成浓度为50μmol/ml的点样液,用点样仪点到特殊处理的玻片介质上,制成丙型肝炎病毒基因分型诊断芯片,收集HCVRNA阳性的丙型肝炎患者血清60份作为实验组,健康人血清60份作为对照组,用荧光定量PCR仪对两组血清进行HCVRNA定量检测,实验组血清HCVRNA含量均大于500拷贝/ml,对照组血清HCVRNA含量均小地500拷贝/ml,两组血清进行HCVRNA分离纯化,逆转录反应,巢式PCR扩增后,分别用基因芯片,HCVRNA核酸序列测定法（美国Li-Cor核酸序列测定仪）进行双盲丙型肝炎基因分型检测。结果 实验组血清基因诊断芯片检测均为阳性;基因分型;1b型46例,3a型3例。3b型3例,2a型2例,2b型2例,混合型1b 2a2例。1b 3b型2例;核酸序列测定分型1b型50例,3a型3例,3b型3例,2a型2例,2b型2例;基因诊断芯片检测和核酸序列测定检测的基因分型结果符合率为93.3%。对照组血清基因芯片检测匀阴性。结论 肝炎病毒基因诊断芯片可以用于检测血清HCVRNA,并进行基因诊断分型,准确率较率。     

基因芯片技术检测丁型肝炎病毒的研究

目的制备检测丁型肝炎病毒(HDV) 基因芯片。方法针对HDV基因保守区域设计多对PCR引物。用芯片点样仪将PCR产物点到玻片上制成基因芯片。样品标记采用限制性显示技术,样品标记后进行杂交。结果运用PCR技术得到多个HDV特异性基因片段,序列分析表明,所扩增的片段均属于HDV特异基因。杂交结果显示,样品和HDV诊断基因芯片杂交的敏感性和特异性均佳。结论用基因芯片检测HDV具有敏感、高效、检测结果可靠的优点,有着较大的应用前景。     

利用基因芯片检测性传播疾病

目的 探讨基因芯片在性传播疾病检测中的应用。方法 针对中国主要流行的7种性传播疾病病原体,选择高度保守的特异基因片段为芯片探针．将其PCR扩增产物用MicroGrid Ⅱ型全自动点样仪点样于包埋有醛基的载玻片上,制备成性病检测基因芯片。对7种临床病原DNA样本及阴性样本进行扩增、标记,与芯片杂交后,用激光共聚焦荧光扫描仪检测并分析结果。结果 该芯片可以从病原体感染样本DNA中检测到阳性参照序列以及与病原体相对应的特异基因片段。结论 性病检测基因芯片能对性传播疾病病原体做出快速、准确的检测。     

基因芯片技术在中医药研究中的应用

基因芯片(gene chip),又称DNA芯片、DNA微阵列(DNA microarray).DNA芯片是将大量的DNA片段按预先设计的排列方式固定在载体表面,如硅片、玻片,并以此为探针,在一定的条件下与样品中待测的靶基因片段杂交,通过检测杂交后的信号实现对靶基因信息的快速检测.基因芯片可以分为很多种类,常见并广泛应用的有cDNA微点阵和寡核苷酸原位合成.基因芯片能对微量样品中的核酸序列进行检测和分析,其高通量、快速、并行化采集生物信息的特点更是优于其他传统的技术方法.基因芯片技术以一种系统、整体的方法进行研究,打破了"一种疾病、一种基因"的陈日模式,整体宏观上研究生物体基因的表达及功能.目前,基因芯片技术在中医学中的应用主要有:证、经络、藏象、针灸,以及中药的研制开发.     

基因芯片及其医学应用研究进展

基因芯片(Genechip)，又称DNA芯片、DNA微阵列(DNA microarray)，是将大量的DNA片段按预先设计的排列方式固化在载体表面如硅片、玻片，并以此为探针，在一定的条件下，与样品中待测的靶基因片段杂交，通过检测杂交后的信号，实现对靶基因信息的快速检测。基因芯片可以分为很多种类，常见并广泛应用的有cDNA微点阵和寡核苷酸原位合成。基因芯片能对微量样品中的核酸序列进行检测和分析，其高通量、快速、并行化采集生物信息的特点更是优于其他传统的技术方法。     

基因芯片技术在肿瘤研

基因芯片又称DNA芯片、DNA阵列、DNA微集阵列等 ,是生物芯片技术的一种 ,具有快速、高效、高通量、高度并行性及高度敏感性、自动化程度高等特点。基因芯片是近年来新兴的一项生物技术 ,前景十分乐观。1　基因芯片简介基因芯片一般分为 2类 :片上原位合成寡核苷酸点阵芯片ONA和微量点样技术制作cDNA点阵芯片CDA ,其区别在于制作方法上的不同。基因芯片技术主要包括 4个步骤 :芯片制备、样品制备、杂交反应、信号检测和结果分析。其制备方法分为 2类 :“原位合成”和“直接点样”。前者是指直接在芯片上用 4种核苷酸合成核酸及其他生…     

HIV基因芯片的初步研究

目的：建立HIV基因检测芯片的分析技术，方法：分离HIV 1U26942基因限制性显示片段作探针，应用PixSys 5500点样仪将探针打印在氨基包被的玻片上制作基因芯片，然后与随机引物荧光标记的HIV样品进行杂交，以分析限制性显示基因片段的杂交动力学，经杂交后清洗和干燥，扫描芯片进行检测。结果：对基因检测芯片的制作与检测的实验条件进行了初步研究并筛选了12个限制性显示基因探针。结论：建立的检测芯片的实验方法可行且较特异。     

戊型肝炎病毒诊断基因芯片制备的初步研究

目的制备戊型肝炎病毒诊断基因芯片并进行杂交验证。方法利用Oligo6.0软件针对戊型肝炎病毒诊断基因保守区域设计多对寡核苷酸探针,用芯片点样仪将其按照阵列设计打印在玻片上制备成基因芯片。样品标记采用限制性显示技术,样品标记后进行杂交,进而在芯片扫描仪中对得到的探针数据进行分析并实验验证。结果芯片杂交后得到的探针荧光强度好,信噪比高,符合临床样品的基因亚型,RT-PCR验证后得到的电泳结果与芯片实验一致。结论实验设计并制备的寡核苷酸戊型肝炎病毒诊断芯片能用于戊肝的检测,为这项疾病的实验室诊断提供了一种快速平行的检测方法。     

HIV基因芯片的初步研究

目的建立HIV基因检测芯片的分析技术。方法分离HIV1U26942基因限制性显示片段作探针,应用PixSys 5500点样仪将探针打印在氨基包被的玻片上制作基因芯片。然后与随机引物荧光标记的HIV样品进行杂交,以分析限制性显示基因片段的杂交动力学。经杂交后清洗和干燥,扫描芯片进行检测。结果对基因检测芯片的制作与检测的实验条件进行了初步研究并筛选了12个限制性显示基因探针。结论建立的检测芯片的实验方法可行且较特异。