蛋白组学在肝纤维化及中医证候研究中的运用

蛋白质组学(prpteomics)概念最早是由Marc Wilkins在1995年提出的,名称来自蛋白质(protein)与基因组学(genomics)两个词的组合,是指一种基因组所表达的全套蛋白质,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质.蛋白质组学是继基因组学后提出的一门新兴学科,它以组织或细胞的全部蛋白质为研究对象,以研究蛋白质表达的整体水平为特点,为生命科学的研究提供了新的视角.所谓蛋白质组,是指"一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质",它具有整体性、动态性和系统性的特点[1].     

本草基因组学

中医药学对世界医药学发展作出了巨大贡献,随着现代科学技术的发展,特别是人类基因组计划的提出和完成,对人类疾病的认识和治疗开启了全新篇章。在此背景下,笔者将组学技术引入中药学研究,提出本草基因组学(Herbgenomics)学科概念,即利用组学技术研究中药基原物种的生物遗传信息及其调控网络,阐明中药防治人类疾病分子机制的学科,从基因组水平研究中药及其对人体作用的前沿科学。主要内容涉及结构基因组、功能基因组、蛋白质组、转录组、代谢组、表观基因组、宏基因组、药用模式生物、基因组辅助分子育种、DNA鉴定、中药合成生物学、中药基因组学、生物信息学及数据库等理论与实验技术。本草基因组学为中药药性研究提供理论基础,为中草药次生代谢产物的生物合成和代谢工程提供技术支撑,为中药配伍研究提供科学依据,指导药物开发及合理用药,为实现个体化精准医疗提供重要信息和技术保障,为中药道地品种改良和基因资源保护奠定基础,推动中药农业的科学发展,对培养多学科人才充实到传统药物研究具有引领作用。本草基因组学正促进前沿生命科学技术应用到中药领域,对中药现代化进程具有重大战略性科学意义。     

基因芯片技术在中药基因组学研究中的应用

该文基于现代基因组学特别是功能基因组学及一些生物技术手段的研究进展及发展趋势,从一个新的视角提出了开展“中药基因组学(TCM Genommics)”研究的策略。认为当前中药的现代化研究应集中体现于中药基因组学,并将以基因芯片等为核心的基因技术引入中药基因组学和现代中药研究。将中药的作用机理或功能利用能代表其功能的一组基因表达的影响来诠释。     

从现代生物学的发展谈中医药从整体上调控基因功能的优势

以DNA双螺旋结构为基础的分子生物学在20世纪取得了巨大成就.在人类基因组计划初步完成后,分子生物学面临着挑战,经历从局部观走向整体观、从线性思维走向复杂性思维的改变.所以逐渐发展了研究复杂生命现象的生命科学,即后基因组时代,如功能基因组学、蛋白质组学等,其中最为突出的就是系统生物学.基因组学与传统中医药学在研究生命科学的思维方法逐步趋于统一、相互渗透,说明在探讨复杂性生命现象时中西医两种医学结合的必然性和重要性;而且更重要的是中医药在整体治疗、调节功能基因和功能网络方面具有优势,在后基因组时代可发挥更重要的作用.     

从现代生物学的发展谈中医药从整体上调控基因功能的优势

以DNA双螺旋结构为基础的分子生物学在20世纪取得了巨大成就。在人类基因组计划初步完成后，分子生物学面临着挑战．经历从局部观走向整体观、从线性思维走向复杂性思维的改变。所以逐渐发展了研究复杂生命现象的生命科学，即后基因组时代，如功能基因组学、蛋白质组学等，其中最为突出的就是系统生物学。基因组学与传统中医药学在研究生命科学的思维方法逐步趋于统一、相互渗透，说明在探讨复杂性生命现象时中西医两种医学结合的必然性和重要性；而且更重要的是中医药在整体治疗、调节功能基因和功能网络方面具有优势，在后基因组时代可发挥更重要的作用。     

蛋白质组学技术在高血压领域的应用

高血压病是临床常见病之一,随着人类基因组计划的完成,心血管研究趋向于绘制一幅分子生物学＂疾病基因图谱＂。蛋白质组学的应用,将基因分析和病理分析串联起来,现就蛋白质组学在高血压领域的应用总结如下。1蛋白质组以及蛋白质组学的概念蛋白质组的概念由澳大利亚Wilkins和Willians于1994年提出,指的是由一个基因组所表达的全部蛋白质。蛋白质广泛参与细胞的功能及调节,蛋白质组决定细胞乃至组织和器官的表型。不论是处于正常状态还是急慢性疾病状态下。     

蛋白质组学研究与中医药学的原创性发展

基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性 ,与生命现象的复杂性和多变性存在着巨大反差 ,使得人们对于生命活动的直接执行者———蛋白质的重要性有了更深刻的理解。因此 ,对蛋白质的数量、结构、性质、相互关系和生物学功能进行全面和深入的研究 ,成为生命科学研究的迫切需要和重要任务。“蛋白质组”的概念提出后几年 ,已成为现今世界范围内生物学领域研究的热点[1～ 6 ] 。“蛋白质组” ,特别是“功能蛋白质组”的理论与技术特点 ,及其整体、动态性的核心思想 ,和中医药学“整体观、辨证观”、“药证”、“方证”等理论体系有着类似之处…     

蛋白质组学与中医方证研究思考

随着人类基因组计划的完成,人类对生命本质与疾病的研究进入了一个新的领域--功能基因组学与蛋白质组学研究,其中蛋白质组学已成为与功能基因组学密不可分,极具广泛应用价值的核心学科.近年来,全世界范围内都在竞相抢占蛋白质组学研究这一战略"制高点",促进了自然科学的渗透和整合,出现了新的学科发展格局.中医药面临着前所未有的机遇抉择,若能抓住机遇,吸取现代科技精华,以可能的相关技术为平台,发挥中医药的优势与特色,解决中医药发展中的重大关键问题,如中医方证调节和干预作用机理的研究,必将拓展中医药的发展空间.     

组学技术应用于药源性肝损伤的研究述评

目的：对基因组学、蛋白质组学及代谢组学在药源性肝损伤中的应用进行综述,为药源性肝损伤的研究提供思路。方法：对近10 a来国内外用基因组学、蛋白质组学及代谢组学研究药源性肝损伤的临床和实验文献进行分析、研究。结果：基因组学为药源性肝损伤的研究提供了更加灵敏和全面的机制研究方法;蛋白质组学通过比较特定细胞、组织或器官在药物作用前后的蛋白质表达谱的变化,为阐明药源性肝损伤的作用机制提供新的线索;代谢组学可以较全面地反应生物体的生理及代谢状态,有效地评估药物的肝脏毒性作用。结论：基因组学、蛋白质组学及代谢组学为阐明药源性肝损伤的分子机制、分子生物标志物和危险度评价等方面提供了可靠的依据。     

试论“中药基因组学”与“中药化学组学”

中药对众多疾病的独特疗效已为人们广泛认可 ,但是由于历史的局限 ,其理论基础很难得到现代社会特别是国际社会公认 ,因此中药现代化势在必行。如何应用现代科学技术 ,给传统中药理论以现代科学理论解释是中药现代化的关键。本文基于现代基因组学特别是功能基因组学、现代分析化学及一些生物高技术手段的研究进展及发展趋势 ,从一个新的视角提出了开展“中药基因组学 (TCMGenomics)”和“中药化学组学 (TCMChemics)”研究的策略。这一研究体系的核心是将中药的作用机理或功能用能代表其功能的一组基因表达的影响来诠释 ;将中药作用的物质基础用能代表其功能的一组化学成分来诠释。本文试图从上述观点出发探讨建立现代中药理论体系和现代中药学的可能性。