北京市2006年HIV一1流行毒株的gag和env基因序列测定及亚型分析

目的监测2006年北京市北京户籍HIV感染者中HIV-1型流行病毒株的亚型分布特点和变化规律。方法采集北京市2006年新确认北京户籍HIV-1感染者的抗凝全血样品32份,分离血浆,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应方法扩增病毒gag和env基因,并进行序列测定和亚型分析。结果系统进化分析表明北京户籍HIV-1感染者样品分别属于5个亚型,分别为B亚型9份,泰国B亚型2份、C亚型2份,流行重组型CRF07 BC亚型5份,流行重组型CRF01．AE亚型4份。结论北京市居民中已存在多种HIV-1亚型和流行重组型,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略。     

艾滋病病毒1型CRF01_AE毒株的过去、现在和将来

CRF01_AE是我国目前流行的主要HIV-1毒株,具有独特的流行病学特征。本文从该毒株的发现起源与命名、在国内外的流行过程、参与形成的重组毒株以及致病性等方面进行介绍,并讨论了与流行病学特征密切相关的社会和生物学因素。     

HIV-1重组毒株gag区快速基因分型方法

目的建立一种简便、快速基因分型方法,对广西人类免疫缺陷病毒（HIV-1）重组毒株gag基因区进行亚型鉴定。方法从HIV阳性样本中提取核酸,使用HIV-1 M组通用引物对gag区进行第1轮扩增,第2轮使用分别检测C亚型和CRF01-AE重组型的二套特异性引物放入同一反应管中进行扩增,根据不同亚型扩增的目的带位置不同判断亚型。另外设计了一套引物,专门用于检测B’/C重组毒株。扩增出的所有样本均进行基因测序和系统树分析以验证结果。结果54份样本中,经基因测序和系统树分析证实CRF08-BC样本4份（7.41%）,CRF01-AE样本46份（85.18%）,4份（7.41）无法确定亚型。经亚型特异性引物PCR法检测出4份（100%）B’/C重组毒株,45份（97.83%）CRF01-AE重组毒株,灵敏度为98%,特异性为100%。2种方法检测结果经差异性检验显示,P〉0.05,差异无统计学意义,结果一致性高达98.15%。与基因分析结果吻合。重复实验显示,B’/C的平均重复性为100%（20/20）,CRF01-AE为98.3%（59/60）。结论该方法具有简便、快速,高度灵敏度和特异性的特点,可直接对广西HIV-1重组毒株CRFO 1-AE gag基因区进行分型。     

广西HIV-1重组流行株env基因V3-V4区序列变异分析

[Objective] To study the genetic variations of V3-V4 and flanking regions of the env gene from the circulating recombinant form （CRF） of human immunodefieiency virus type 1 （HIV-1） in Guangxi. [Methods] 24 samples were collected from the prevailing area of HIV-1 in Guangxi. Fragments of the HIV-1 env gene were amplified by nest-PCR from proviral-DNA templates of HIV-1 infected individuals. The PCR products were then directly sequenced by using ABI 310 DNA SEQUENCER. The sequencesof V3-V4 region and flanking region of the env gene from CRF were carried out amino acid mutations by CLUSTAL. MEGA and dnatools software. [ Results] Of the 24 samples, 21 samples （ 87.5% ） were infected with CRF01-AE. 3 （12.5%） were infected with CRF08-BC. Phylogenetic tree analysis showed that 21 CRF01-AE strains clustered with 97CNGX2F andTHCM240, while 2 CRF08-BC strains were closely related to CRF08-BC.98CN006 and CRF08-BC. 97CNGX6f, and 1 CRF08-BC clustered with C.95IN21068. Nueleotied sequence analysis showed that DNA distances in V3-V4 regions of the env gene of 24 samples were closely related to the normal strains in Guangxi, and majority of amino acid substitution occurred in C3 and V4 regions rather than V3 region. [Conclusions] Majority of genetric variation in V3-V4 regions of the env gene from recombinant form of CRF01-AE occur in the C3 and V4 regions rather than V3 region.     

深圳艾滋病病毒1型传播途径及优势流行株分析

目的 分析广东省深圳市艾滋病病毒1型( HIV-1)优势株的亚型特征和传播规律,为正确掌握HIV-1的流行趋势提供帮助.方法 对429例HIV-1阳性的感染者进行流行病学调查和外周血采集,逆转录-聚合酶链反应( RT-PCR)巢式扩增包膜蛋白(env),测序后确定亚型,建立进化树,计算基因离散率.结果 深圳市HIV-1亚型包括01 -AE 、07- BC 、08-BC 、02 -AG 4种重组亚型和B、C2种亚型;其中01 -AE、07-BC和B亚型为主要流行株,分别占51.8％ (207/400) 、28.8％ (115/400)和12.3％ (49/400);08-BC 、C亚型和02-AG在人群中流行较少,分别占3.5％( 14/400)、3.5％ (14/400)和0.3％( 1/400);传播途径以性传播和静脉吸毒传播为主,占感染总数的96.6％( 200/207),其他传播途径仅占3.4％(7/207);异性传播毒株的组内基因离散率最大,为14.3％;同性传播病毒株与异性传播病毒株之间的基因离散率最大,为15.8％;在进化树上,各种传播途径的毒株形成了相对独立的簇,但是存在交叉.结论 01 -AE是深圳地区HIV-1的优势流行株,性传播是主要的传播途径.     

河南省人免疫缺陷病毒1型流行现状研究

目的 了解河南省人免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株的亚型状况及序列变异、流行特征,分析其传播来源和传播规律.方法 对2006-2007年在河南省采集的1287例HIV-1感染者抽取静脉血,用巢式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸的env基因和gag基因进行扩增,并测定和分析核苷酸序列.结果 1287份样本中存在B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型,其在所有分析样本中的比例分别为95.882%(1234/1287)、0.466%(6/1287)、2.875%(37/1287)、0.777%(10/1287).与国内及国际的参考毒株RL42、C.95in21068、07-BC.CN.97.C54A、01AE.TH.90.CM240间的离散率分别为(9.327±0.245)%、(5.214±0.183)%、(6.278±0.194)%、(5.332±0.1 58)%.结论 目前河南省艾滋病感染者中有B'、C亚型及BC、AE两个重组亚型.泰国B'亚型依然占主导地位.B'亚型以既往有偿献血人员为主,BC亚型以性传播为主,AE亚型以性传播及既往献血途径为主,C亚型以性传播为主.     

汉族人群RANTES基因多态性与艾滋病病毒-1感染关系的初步研究

目的 分析RANTES启动子和内含子等位基因在中国汉族健康人群和艾滋病病毒—1(HIV—1)感染者人群的分布特点。方法 用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性(PCR—RFLP)法和13NA测序法对中国汉族HIV—1感染者以及健康人群的538份血液样品的RANTES启动子—403、—28和300份样品的内含子In1．1等位基因进行检测。结果 汉族的健康人群—403、—28等位基因具有6个基因表型，AC／AC、AC／AG、AC／GC、AG／GC、GC／GC、AG／AG，比例分别是12．4％、3．5％、29．2％、10．9％、42．1％、1．5％。从单倍型看，以GC最高为62．7％，AC为28．7％，AG为8．6％。与AC／AC比较，AC／AG、AC／GC、AG／GC、GC／GC的OR值显示有轻度的保护作用。汉族HIV—1感染者和汉族健康人群间RANTES等位基因频率无统计学差异；RANTES内含子In1．1等位基因T／T、C／T和C／C分别为71．0％、19．9％和9．1％；其中：RANTES In1．1T为81％，RANTES In1．1C为19％。男性感染者和健康人等位基因分布差异有显著性，RANTES In1．1C比例与健康人比显著增高，显示RANTES In1．1C是HIV—1感染的危险因素；但是女性人群比较差异不显著。三个单核苷酸多态性(SNP)位点之间存在严重的连锁不均衡。结论 本项研究证实了在中国汉族人群中存在：RANTES启动子—403、—28和内含子In1．1突变。内含子In1．1C与增加HIV易感性有关。与基因表型AG／AC比较，AC／AG、AC／GC、AG／GC、GC／GC的OR值显示都有不同程度的保护作用。     

福州MSM人群中HIV-1病毒株基因进化分析

目的 分析福州地区男同性恋患者中HIV-1病毒CRF_07BC亚型的分子特征和全基因结构.方法 采用分层随机抽样法取2011年1月—2016年12月95份福州地区经免疫印迹法确诊的同性恋人群中新近感染的血清标本,用RT-PCR法对env基因进行扩增,通过MEGA软件对env基因序列进化分析,结果表明46份env基因阳性...     

广西HIV-1 CRF01-AE env和gag区快速基因分型方法的建立

[目的]建立一种快速简便的基因分型方法,对广西HIV-1 CRF01-AE毒株env和gag基因区进行亚型鉴定。[方法]从HIV阳性样品中提取核酸,使用HIV-1M组通用引物对env和gag基因区进行第一轮扩增,第二轮则使用CRF01-AE亚型的特异性引物进行扩增,根据扩增的目的带位置来判断亚型。将通用引物扩增出的所有样本进行基因测序以验证结果。[结果]43份CRF01-AE样本中,经env基因区亚型特异性引物PCR法检测得出39份(90.70%),灵敏度为90.70%,而gag基因区亚型特异性引物PCR法检测得出42份(97.34%),灵敏度为97.34%。将基因测序法和亚型特异性引物PCR法的检测结果进行比较,经差异性检验显示两种方法检测结果在两基因区中差异均无统计学意义,env基因区两方法检测结果结果一致者占90.70%。而gag基因区则高达97.34%。重复实验显示env基因区平均重复性为93.80%(61/65),gag基因区为98.30%(59/60)。[结论]该方法是一种简便、快速、低成本,具有高度灵敏性和特异性的HIV-1 CRF01-AE env和gag基因区分型法,能够直接对广西HIV-1 CRF01-AE重组毒株进行鉴定。     

江苏省艾滋病病毒流行毒株的基因序列测定和亚型分析

目的 :了解江苏省不同人群中HIV各亚型毒株的流行情况和传播规律。方法 :收集感染者及病人的流行病学资料 ;无菌采集HIV感染者或AIDS病人抗凝全血标本 5ml,提取前病毒DNA ,用套式聚合酶链反应扩增膜蛋白基因的C2 -V3区 ,进行序列测定 ,鉴定病毒亚型。用威斯康星GCG软件进行共享序列、基因离散率的计算和毒株的聚类分析。结果 :截止 2 0 0 1年 6月底 ,江苏省已发现HIV - 1中的A、B、B′、C、D、E 6种亚型 ,B′亚型 (占 4 1.6 7% )和C亚型 (占 2 5 % )为主要流行株 ;静脉吸毒感染人群中10 0 %为C亚型 ,采供血和受血感染人群中 87.5 %为B′亚型 ,在性途径传播人群中所有 6种亚型均有 ,且分布较为均一。结论 :多种亚型的并存说明江苏存在着适宜艾滋病流行的各种危险因素 ,提示今后在药物治疗、疫苗研制以及其它防制工作上将面临着更大的困难。因此在今后相当长的一段时间内 ,对高危人群进行行为干预将是江苏省艾滋病防制工作的重中之重。     

中国CRF01_AE亚型人类免疫缺陷病毒毒株的分子流行病学研究

目的　通过对两次全国范围人类免疫缺陷病毒 (HIV)毒株分子流行病学研究 (NationalMolecularEpidemicStudy ,NMES)中发现的CRF0 1_AE重组HIV 1毒株的分析 ,研究该重组型毒株在我国的流行特点和基因变异特征。方法　从HIV感染者血液中提取前病毒DNA ,使用套式聚合酶链反应 (nested PCR)扩增HIV 1的env基因C2～V4区 ,PCR产物直接测序并使用GCG软件包进行序列分析。结果　到 2 0 0 2年底 ,从全国 31个省市自治区采集的标本中发现CRF0 1_AE重组型样本 16 9份 ,分布在 17个省。虽然CRF0 1_AE重组型仍然以性传播人群为主 [NMES1为 6 2 2 % (2 3/ 37) ,NMES2为5 5 3% (73/ 132 ) ],但吸毒人群中感染该重组型的比例明显增加 ,由NMES1的 2 7% (10 / 37)增加到NMES2的 4 1 6 % (5 7/ 137)。系统树分析可明显看到NMES2吸毒人群流行毒株远离NMES2中性传播人群和NMES1吸毒人群流行毒株。NMES2吸毒人群流行毒株的V3区氨基酸较保守 ,但C3区第 6、8、9、10、12、15、16位氨基酸呈现出规律性变化。结论　CRF0 1_AE亚型已从东南沿海和西南边境扩散至内陆 ,吸毒人群中该亚型比例不断上升。NMES2吸毒人群和NMES1吸毒人群中流行的CRF0 1_AE重组毒株序列明显不同 ,显示其可能有新的来源 ,并呈现扩大流行的态势。     

北京地区流行的HIV-1 CRF01_AE株基因特征研究

目的 分析北京地区HIV-1 CRF01 AE株在的基因特征.方法 采集北京地区2006-2008年新确证HIV感染者的抗凝全血标本,分离血浆和提取病毒RNA,用反转录/巢式聚合酶链式反应扩增病毒gag基因,对获得的105条CRF01_AE株序列进行系统进化分析,并通过计算组间距离和Entropy核苷酸多态性差异方法分析病毒株的遗传特征.结果 在CRF01 AE株序列系统进化树中存在4个主要的亚簇,Homo-Max亚簇包含67例样本,同参考株CM240组间基因 离散率为5.4%,组内离散率为2.8%;Hetero亚簇包含6例样本,组间基因离散率为4.8%,组内离散率为4.2%.Mix亚簇包含8例样本,组间基因离散率为4.2%,组内离散率为5.2%.Homo-Min亚簇包含18例样本,组间基因离散率为4.4%,组内离散率为2.8%.Homo-Max、Hetero和Homo-Min亚簇无其他国家的序列,Mix亚簇与越南和泰国CRF01 AE株关系密切;核苷酸多态性分析结果显示,以Mix亚簇为参照,Homo-Max、Homo-Min和Hetero亚簇分别有37、29和11个位点的核苷酸组成,差异有统计学意义.结论 北京地区流行的CRF01_AE病毒株中首次观察到4个独立的亚簇;Homo-Max亚簇株为最主要的CRF01_AE株;Mix亚簇株与来自于泰国和越南的CRF01 AE株有较高同源性.     

异源双链泳动分析法在人类免疫缺陷病毒1基因亚型分析中的应用

目的 运用异源双链泳动分析法（HMA）进行人类免疫缺陷病毒1（human immunodeficiency virus-1,HIV-1)基因亚型分析。了解福建省HIV-1亚型的流行情况。方法 收集细胞培养中HIV-1感染的外周血单个核细胞（PBMC），聚合酶链反应（PCR）扩增HIV-1膜蛋白基因（env)区的核酸片段，与标准亚型的对照质粒的PCR产物进行杂交，形成异源双链二聚体，根据其在聚丙烯酰胺凝胶电泳中的泳动率确定其亚型，并进一步对标本进行序列测定和系统树分析，结果 15份标本中，80.00%为E亚型，6.67%为B亚型，2份不能确定其亚型，比较异源双链泳动法和序列测定法的结果，显示两种分析方法对HIV-1病毒基因分型有较高的一致性，其亚型一致率为86.67%。结论 福建省流行的HIV-1毒株以E亚型为主，亚型分析5法具有快速，简便，经济和高特异性的特点，可用作对HIV流行毒株进行长期监测的重要手段。     

广东省人免疫缺陷病毒1亚型基因序列特征分析

目的研究广东省人免疫缺陷病毒1（HIV-1）亚型的基因序列特征。方法2002年采集100份HIV-1感染者的外周静脉抗凝血,分离单核细胞（PBMC）,提取前病毒DNA,通过聚合酶链反应（PCR）扩增,获得包膜蛋白（ENV）区基因的核酸片段,并对其C2～V3及邻区核苷酸序列进行测定和分析。所得序列用GCG软件包进行系统进化树和氨基酸变异分析。结果经过离散率计算和系统进化树分析后证实,其PCR扩增阳性的75份样品中,44份（58．7％）为重组毒株CRF01-AE（circulating recombinant form 01-AE）,27份（36％）为CRF—BC,4份为泰国B’亚型（5．3％）。结论广东省HIV-1以CRF01-AE和CRF—BC为主,也存在泰国B’亚型。目前我省境内有多种亚型存在,流行趋势日益严峻。加强艾滋病患者的治疗,以及控制和预防艾滋病的传播是今后面临的重要任务。     

江苏省艾滋病病毒感染的分子流行病学研究

目的 了解江苏省不同人群中艾滋病病毒(HIV)各亚型毒株的流行情况和传播规律。方法 收集HIV感染者及患者的流行病学资料；无菌采集HIV感染者或艾滋病(AIDS)患者抗凝全血标本5ml，提取前病毒DNA，用巢式聚合酶链反应(nested—PCR)扩增膜蛋白基因的C2～V3区，进行序列测定，鉴定病毒亚型。用威斯康星GCG软件进行共享序列、基因离散率的计算和毒株的聚类分析。结果 截止2001年底，江苏省已发现HIV-1中的A、B、C、D、E五种亚型和一个B亚型变种(B^ )流行，C(占40．48％)和B^ (38．10％)亚型为主要流行株；静脉吸毒感染人群中86．67％为C亚型，采供血和受血感染人群中91．67％为B^ 亚型，在性途径传播人群中所有六种亚型均有，且分布较为均一。结论有偿献血人群中B^ 亚型毒株由邻省传人，吸毒人群中C亚型毒株的传人主要与新疆籍流动人口的介入有关；多种亚型的并存说明江苏省存在着适宜AIDS流行的各种危险因素；提示今后在药物治疗、疫苗研制以及其他防制工作上将面临更大的困难。     

河北省2007年HIV-1流行毒株基因序列测定及亚型分析

HIV具有基因易变性特点,为探讨河北省HIV-1感染人群传播特点,监测不同人群中亚型毒株的分布和基因变异规律,开展了此项研究.     

浙江省HIV-1 CRF01_AE流行株的分子特征分析

目的 分析艾滋病病毒1型(HIV-1)CRF01_AE重组毒株在浙江省的分子流行特征.方法 提取234例HIV-1感染者基因组DNA用巢式聚合酶链反应(nPCR)方法扩增gag部分基因片段,测定序列以后分析核苷酸和氨基酸序列.结果 在扩增阳性并成功测序的192个序列中HIV-1CRF01 AE有81个,占42%,是浙江省HIV主要的流行毒株之一.系统进化树中存在3个bootstrap值＞60的分支簇,其中MIX组包括47个序列,内部基因离散率为2.4%±0.7%,与参考株CM240的基因离散率为3.4%±0.5%;SEX组包括7个样本,组内基因离散率为3.0%±1.2%,与参考株的基因离散率为3.9%±1.0%;MSM组包括12个样本,组内基因离散率为2.8%±1.1%,与参考株的基因离散率为4.9%±0.6%,三者差别有统计学意义.特征性氨基酸分析表明MIX组、SEX组、MSN组共享序列与国际参考株共享序列之间分别存在2个、4个和8个位点的差异.结论 浙江省内HIV-1 CRF01 AE流行株中主要存在三个进化簇,其中两个簇与广西来源株密切相关.CRF01_AE毒株在浙江省内主要以异性性途径和注射吸毒形式传播.     

乙型肝炎病毒基因重组疫苗阻断母婴传播的进一步观察

“七五”和“八五”计划期间 ,我国对第一代乙型肝炎 (乙肝 )疫苗 (血源疫苗 )的新生儿免疫效果进行了近期和远期效果考核 ,均证明效果良好。“九五”期间又对第二代乙肝疫苗(基因工程疫苗 )效果进行考核 ,以最后取代血源疫苗。本文报道对我国研制的在哺乳动物细胞中高效表达的基因工程疫苗 (ＣＨＯ疫苗 )阻断母婴传播的初步结果。1.材料与方法 :(1)疫苗及乙肝免疫球蛋白 :ＣＨＯ疫苗 ,10 μｇ/ｍｌ,卫生部长春生物制品研究所生产 ,批号 96 12 0 5 7。乙肝免疫球蛋白 ,10 0ＩＵ/支 ,卫生部成都生物制品研究所生产 ,有效期内使用。 (2 )对象…     

美国的艾滋病发病率监测

HIV发病率对于艾滋病的预防和控制至关重要.美国公共卫生领域的专家们研发了一种用于检测HIV新近感染者血清阳转的血清学检测规程(serologic testing algorithm for recent HIV seroconversion,STARHS)[1],能够在群体水平上监测HIV发病率;基于此项技术,依托于较为完善的HIV/AIDS病例报告系统,美国于2005年开始在全国建立的HIV发病率监测系统逐渐趋于完善[2,3].本文对这种新型发病率监测体系的建立、发展及其运行状况综述如下.