2型糖尿病基因多态性的病例对照研究

[目的]研究2型糖尿病与脂联素基因SNP+45、SNP+276的相互关系。[方法]采用单因素非条件Logistic回归分析,对上海市浦东新区常住居民中新发糖尿病患者(糖尿病组)及社区正常人群(对照组)各590人进行病例-对照研究。[结果]糖尿病组与对照组比较,脂联素基因SNP+45的3种基因型和等位基因分布的差异无统计学意义(χ2=1.44,P>0.05;χ2=1.35,P>0.05)。脂联素基因SNP+276的3种基因型和等位基因分布的差异有统计学意义(χ2=8.45,P<0.05;χ2=8.99,P<0.05),糖尿病患者T/T基因型多于对照组人群。单因素分析显示,脂联素基因SNP+276与糖尿病的关系有统计学意义。[结论]脂联素基因SNP+276与浦东新区汉族人群2型糖尿病的发病相关,脂联素基因的变异可能在2型糖尿病发病过程中起重要作用。     

强直性脊柱炎易感性与IL-1F10基因多态性关系

目的 探讨强直性脊柱炎易感性与白细胞介素-1F10(IL-1F10)基因中rs6743376和rs6761276位点基因多态性的关系.方法 收集2007-2008年安徽医科大学附属第一医院门诊确诊的强直性脊柱炎患者161例和同期正常健康献血人群对照178人,采用基于高温连接酶的连接酶检测反应(LDR)方法检测其IL-1F10 rs6743376和rs6761276位点的单核苷酸多态性,分析比较其等位基因频率及基因型频率在2组中的分布.结果 病例组和对照组的rs6743376位点A等位基因频率分别为74.2%,71.6%;C等位基因频率分别为25.8%,28.4%;2组的rs6761276位点C等位基因频率分别为21.1%,18.0%;T等位基因频率分别为78.9%,82.0%;2个位点等位基因在2组人群中的分布差异均无统计学意义(均P>0.05);基因型频率在2组间的分布差异也无统计学意义.结论 安徽籍汉族人群强直性脊柱炎易感性与IL-1F10基因rs6743376和rs6761276位点单核苷酸多态性无关.     

FADS1、FADS2基因多态性与中国汉族孤独症谱系障碍的关联研究

目的 分析参与多不饱和脂肪酸代谢的FADS1和FADS2基因单核苷酸多态性(SNPs)与中国汉族孤独症谱系障碍(ASD)患儿的相关性。方法 采用病例对照的研究方法,收集病例和对照各243例,采集外周血并提取DNA。利用人类基因库数据和Haploview 4.2软件筛选FADS1和FADS2基因的标签SNPs,采用Sequenom Mass ARRAY系统对SNPs进行基因分型,采用Logistic回归分析标签SNPs与ASD发病风险之间的关联。结果 病例组和对照组儿童FADS2基因的rs526126等位基因频率和基因型频率差异有统计学意义[G等位基因OR=0.54(0.41～0.72),G/G基因型OR=0.05(0.02～0.19),P均<0.001]。结论 FADS2基因可能与中国汉族儿童ASD发病风险存在关联性。     

HindⅢ、S447X基因多态性与哈萨克族MS关系

目的 探讨脂蛋白脂酶(LPL)基因HindⅢ、S447X多态性与代谢综合征(MS)及其组分的关系。方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态法检测哈萨克族200例MS患者和201名非MS居民的脂蛋白脂酶HindⅢ、S447X基因型。结果 MS组H+H-/H-H-基因型、H-等位基因、SX/XX基因型、X等位基因频率分别为33.5%,22.0%,10.5%,5.5%明显低于对照组的45.8%,28.6%,22.9%,12.44%(P均<0.05);MS各组分在HindⅢ和S447X不同基因型间差异有统计学意义(P均<0.05);随着MS组分异常的增多,H+H+、SS基因型的携带率有不断增加的趋势。结论 LPL基因HindⅢ、S447X多态性与哈萨克族MS的发病风险相关,其中H+H-/H-H-基因型、H-等位基因、SX/XX基因型、X等位基因可能是MS的保护因素。     

肿瘤坏死因子β NcoI位点多态性与胃癌易感性

目的 探讨江苏省南京市汉族人群肿瘤坏死因子β(TNF-β)等位基因多态性与癌易感性的关系,并分析与环境危险因素的交互作用.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对294例胃癌患者及对照进行(TNF-β)基因的单核苷酸多态性(SNP)检测,分析TNF-β基因多态性与胃癌易感性的关系.结合环境危险因素分析,了解TNF-β基因多态性与环境危险因素在胃癌发生中的交互作用.结果 TNF-βG/A杂合子是胃癌的危险因素,其在病例组与对照组中的频率分别为50.0%与44.2%,OR=1.6615,95%CI=1.0777～2.5617,P=0.0210),TNF-βA/A出现的频率在胃癌组与对照组比较差异无统计学意义(P>0.05),未发现与环境因素存在交互作用.结论 TNF-βG/A杂合子与胃癌的易感性有关.     

survivin基因易感性及其单倍型与原发性肝细胞癌关系

目的 探讨汉族人群中存活素(survivin)基因rs8073069及rs1042489位点与原发性肝细胞癌(HCC)的相关性,为采取干预措施提供参考依据。方法采用病例对照研究方法对在江苏省海门市10个社区收集的176例汉族HCC病例和随机匹配的196名健康汉族人群进行一般情况问卷调查以及survivin基因rs8073069和rs1042489位点基因分型。结果 rs8073069位点CC、CG、GG基因型和C、G 2个等位基因在HCC病例组的频率分别为8.52%、35.22%、56.25%2、6.14%7、3.86%,在对照组的频率分别为6.12%3、9.80%、54.08%、26.02%7、3.98%,不同遗传模式下rs8073069位点基因型和等位基因分布在HCC病例组与对照组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);rs1042489位点CC、CT、TT基因型和C、T 2个等位基因在HCC病例组的频率分别为17.61%、55.68%、26.70%、45.45%、54.55%,在对照组的频率频率为13.78%、52.04%、34.18%、39.80%、60.20%,不同遗传模式下rs1042489位点基因型及等位基因在HCC病例组与对照组间分布差异均无统计学意义(P>0.05);多因素Logistic回归分析结果表明,在相加遗传模式下,HBsAg+和有乙肝史是HCC的危险因素r,s8073069G-rs1042489T单倍型是HCC的保护因素;不同遗传模式下环境因素与单倍型交互作用分析结果表明,显性、隐性和相加遗传模式均未发现单倍型与环境因素的交互作用(P>0.05)。结论 汉族人群survivin基因rs8073069和rs10424892位点多态性与HCC的易感性无关;rs8073069G-rs1042489T单倍型是HCC的保护单倍型。     

P2X7R基因rs1621388多态性与痛风易感性的关联研究

目的 分析嘌呤受体P2X配体门控离子通道7（purinergic receptor P2X ligand-gated ion channel 7,P2X7R）基因多态性与痛风易感性的关联。方法 通过对P2X7R基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）位点的连锁分析,确定具有代表性的rs1621388为研究位点。提取114例痛风患者（实验组）及93例高尿酸血症患者（对照组）外周血单个核细胞DNA,采用TaqMan探针法进行rs1621388基因分型,分析不同等位基因或基因型与痛风易感性的关系。结果 rs1621388基因型AA、AG和GG在痛风组中频率分别为10.5%、49.1%和40.4%,高尿酸血症组中分别为3.2%、28.0%和68.8%,两组基因型分布差异具有统计学意义（χ²=17.369,P<0.001）。等位基因A和G在痛风组中频率分别为35.1%和64.9%,高尿酸血症组分别为17.2%和82.8%;等位基因A是痛风的易感基因（OR=2.601,95%CI：1.629~4.154,P<0.001）。显性模型（AA+AG vs GG）基因型频率分布在痛风和高尿酸血症组间的差异具有统计学意义（OR=3.262,95%CI：1.833~5.807,P<0.001）。结论 P2X7R基因单核苷酸位点rs1621388多态性与痛风易感性存在关联。     

TPH2基因多态性与单相抑郁及自杀行为关系

目的 探讨色氨酸羟化酶2(TPH2)基因rs4570625位点单核苷酸多态性与单相抑郁症及自杀行为的关系。方法 提取中国北方地区300例单相抑郁患者(病例组)和300名健康对照者(对照组)基因组DNA,采用聚合酶链反应技术(PCR)扩增包含TPH2基因rs4570625位点的基因组DNA片段,将PCR产物直接测序检测病例组及对照组的基因型,应用SPSS 11.0软件进行统计分析。结果 病例组与对照组SNPs基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05);单相抑郁症组与健康对照组TPH2 rs4570625基因型及等位基因频率比较,差异无统计学意义。病例组有自杀行为组携带的基因型T/T、G/G、T/G频率分别为31.3% (30/96)、18.8% (18/96)、46.9% (45/96),无自杀行为组分别为23.0% (47/204)、27.5% (56/204)、42.6% (87/204),2组比较差异无统计学意义;有自杀行为组TPH2基因rs4570625位点等位基因T、G频率分别为56.5% (105/186)、43.5% (81/186),无自杀行为组分别为47.6% (181/380)、52.4% (199/380),2组比较差异有统计学意义(χ²=3.886,P=0.049)。结论 TPH2基因rs4570625单核苷酸多态性与单相抑郁症无明显关联,与抑郁症自杀行为易感性有关。     

脂联素基因多态性与缺血性脑卒中关系

目的 探讨脂联素基因(apml gene)多态性与缺血性脑卒中的关系。方法 采用病例对照组研究方法,利用荧光定量PCR的Taqman控针技术检测357例缺血性脑卒中新发病例及345例健康对照的脂联素基因(rs2241766、rs266729)多态性,用Logistic回归分析计算各基因型与缺血性脑卒中的相关性。结果 rs2241766等位基因T→G突变增加了缺血性脑卒中发病无关(OR=1.55,P=0.005);rs266729多态性与总人群缺血性脑卒中发病无关(OR=1.13,P=0.57),但GG纯合突变增加了女性缺血性脑卒的发病风险(OR=3.25,P=0.04)。结论 rs2241766基因多态性与我国东北汉族人群缺血性脑卒中的发病相关;rs266729等位基因GG纯合突变可能是我国东北汉族女性缺血性脑卒中的危险因素。     

单胺氧化酶A基因与暴力攻击行为关系

目的 探讨单胺氧化酶A(MAOA)基因与暴力攻击行为的关联性.方法 采用聚合酶链式反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法,检测91名某监狱暴力犯罪服刑人员(攻击组)和101名正常对照者(对照组)MAOA基因家族中rs6323位点的基因型,并常规电泳检测基因型.应用SPSS 13.0软件分析攻击组和对照组的等位基因和基因型分布规律.结果 在MAOA基因rs6323位点攻击组、对照组GG基因型频率分别为50.5%,58.4%,TT基因型频率分别为49.5%,41.6%;攻击组、对照组G等位基因频率分别为50.5%,58.4%,T等位基因频率分别为49.5%,41.6%;基因型与等位基因在攻击组和对照组的频数分布差异均无统计学意义(P>0.05).结论 MAOA基因rs6323位点基因多态性与暴力攻击行为可能无关联,但不排除MAOA基因其他SNPs与暴力攻击行为相关联.     

脂联素基因多态性与新疆地区汉族2型糖尿病的相关性研究

目的研究脂联素(APN)基因45T/G单核苷酸多态性(SNPs)与新疆地区汉族人2型糖尿病(T2DM)的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性技术(PCR-RFLP),比较新疆地区汉族人正常糖耐量组(NGT)和T2DM组APNSNP45基因型与等位基因分布频率差异;比较相同人群不同基因型和不同人群相同基因型T2DM相关体测与生化指标的差异。结果 T2DM组APNSNP45TG+GG基因型及G等位基因分布频率均高于NGT组(P﹤0.005);NGT组TG+GG基因型者血清甘油三酯(TG)、总胆固醇(CH)和低密度脂蛋白(LDL)水平显著高于TT基因型者(P﹤0.005),相同基因型人群之间,T2DM组收缩压(SBP),体重指数(BMI),腰臀比(WHR),空腹血糖(FBG),胰岛素抵抗指数(LOG(HOMA-IR)),TG,CH及LDL均高于NGT组(P﹤0.05);胰岛β细胞功能指数(LOG(HOMA-β))和高密度脂蛋白(HDL)水平均低于NGT组(P﹤0.005)。结论 APNSNP45T/G多态位点与新疆地区汉族T2DM相关,携G等位基因者发生T2DM的可能性增加,且G等位基因与汉族血脂代谢异常及胰岛素抵抗有关。     

脂联素基因多态性与中国大城市汉族老年人代谢综合征相关性研究

目的探讨脂联素基因rs2241766(T45G)和rs15011299(G276T)多态性位点(SNP)与中国大城市汉族老年人代谢综合征(MS)的相关性。方法根据国际糖尿病联盟(IDF)的MS定义,从2002年营养与健康状况调查对象中选取大城市60岁以上汉族老年人,分为MS组和正常对照组,共907人。检测这些研究对象血浆脂联素和胰岛素浓度,提取全血基因组DNA,采用Taqman方法检测所有研究对象脂联素基因rs2241766(T45G)和rs15011299(G276T)位点的基因型。并分析各SNP位点基因型与MS的相关性。结果 rs15011299的三种基因型在MS组和正常对照组间的总体分布差异有显著性,MS组T等位基因频率显著高于正常对照组。在rs15011299位点,GG、GT、TT三组基因型的研究对象的BMI、脂联素浓度差异有显著性,GG+GT型研究对象的BMI、腰围、血浆胰岛素浓度显著低于TT型研究对象,而血浆脂联素浓度显著高于TT型研究对象;在rs2241766位点,TT、TG、GG三组基因型的研究对象间BMI及舒张压差异有显著性,TT型研究对象BMI、腰围及舒张压显著高于TG+GG型研究对象。logistic回归分析显示rs15011299TT型研究对象与GG型研究对象相比发生MS的风险高,其校正的OR值为3.19(1.31,7.78)。结论脂联素基因rs15011299位点的变异可能与MS相关,G→T突变可能增加MS的发生,使腰围、BMI增加,并降低血浆脂联素水平。     

Association of the adiponectin gene (ADIPOQ) +45 T > G polymorphism with the metabolic syndrome among Han Chinese in Sichuan province of China

The metabolic syndrome is a cluster of abnormalities characterized by obesity, impaired glucose metabolism, hypertension or elevated blood pressure, and dyslipidemia. The aim of this study was to investigate the association of the adiponectin gene (ADIPOQ) +45 T > G polymorphism with the metabolic syndrome among Han Chinese in Sichuan province of China. A case-control design was used including 116 patients with the metabolic syndrome and 108 unrelated controls, matched on age and gender. The ADIPOQ +45G allele (TG+GG) had a significant association with risk of the metabolic syndrome (odds ratio=1.88, 95% confidence interval: 1.03-3.44, p=0.039) adjusted for education, physical activity, family history of related diseases, smoking and drinking, compared with subjects with TT genotype. The association between the ADIPOQ +45 T>G polymorphism and the metabolic syndrome was independent of multiple confounders.     

The -11377C > G adiponectin gene polymorphism alters the adiponectin concentration and the susceptibility to type 2 diabetes in Thais

The aims of this study were first to detect the levels of adiponectin, insulin, albumin, glucose, alanine aminotransferase (ALT), lipids, homeostasis model assessment for insulin resistance (HOMA-IR), and anthropometric variables in type 2 diabetes mellitus (T2DM) as well as healthy control groups, and to determine whether two adiponectin gene polymorphisms, at the position -11377C > G as well as +45T > G, are associated with serum levels of adiponectin and other variables; then to search for the association between these two single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the adiponectin gene and T2DM. We investigated 93 T2DM patients and 90 healthy volunteers. Compared with the healthy control group, the T2DM group had significantly lower adiponectin levels. Waist circumference, total cholesterol, ALT, glucose, insulin, and HOMA-IR scores were significantly higher in the T2DM group than in the control group. The polymorphism of the adiponectin gene at position -11377C > G among type 2 diabetes subjects showed that the adiponectin concentration was significantly lower in CG/GG genotypes (6.2 μg/mL) than the CC genotype (7.8 μg/mL), whereas SNP +45T > G was not associated with adiponectin levels. Adiponectin gene polymorphisms at position -11377C > G and +45T > G were significantly more frequent in type 2 diabetes patients than in the control group (p = 0.022; p = 0.045, respectively). However, multivariate logistic regression analysis showed that the strong impact on T2DM was found for -11377C > G gene polymorphism (p = 0.023) and waist circumference (p < 0.001). Therefore, the single nucleotide polymorphism of -11377C > G in adiponectin promoter region has impact on the lower adiponectin concentrations, and may influence susceptibility to T2DM in Thais.     

Association of the 276G->T polymorphism of the adiponectin gene with cardiovascular disease risk factors in nondiabetic Koreans

BACKGROUND: The adiponectin gene is known to modulate adiponectin concentrations and diabetes mellitus development. OBJECTIVE: We assessed whether adiponectin gene variants contribute to circulating adiponectin, insulin resistance (IR), or cardiovascular disease risk factors. DESIGN: Nondiabetic subjects [n = 902; x +/- SE age: 42.5 +/- 0.53 y; body mass index (BMI; in kg/m2): 24.7 +/- 0.11] were genotyped for 2 single-nucleotide polymorphisms (SNPs), 45T-->G and 276G-->T. RESULTS: After adjustment for age, sex, and BMI, subjects with the G allele for the SNP 276 had significantly higher concentrations of triacylglycerol and small dense LDL (sdLDL) and smaller LDL particle size than did T/T subjects. G/G subjects at SNP 276 had significantly lower plasma adiponectin and higher homeostasis model assessment (HOMA) of IR and urinary prostaglandin F2alpha than did T/T subjects. In the SNP 45-276 haplotype test, we also observed that subjects with the X/X haplotype had significantly higher plasma adiponectin after adjustment than did TG/TG or TG/X haplotype subjects. In the highest BMI group (BMI > or = 26), T/T subjects had lower HOMA-IR (P = 0.011) and higher plasma adiponectin (P = 0.026) at SNP 276 than did G/G or G/T subjects. These patterns were also seen for adiponectin in haplotype groups. However, no significant genotype effect for SNP 45T-->G was observed. CONCLUSIONS: The 276G-->T polymorphism of the adiponectin gene modulates circulating adiponectin and IR, particularly in obese states. G allele carriers also have higher oxidative stress, higher sdLDL concentrations, and smaller LDL particle size. Therefore, the presence of the G allele in the adiponectin gene at SNP 276 could be a significant contributor to higher cardiovascular disease risk in Koreans, independent of common environmental factors.     

抵抗素基因多态性与2型糖尿病关联性分析

目的探讨广东省汉族人群中抵抗素基因(RETN)的单核苷酸多态性(SNP)与2型糖尿病的关联。方法采用以医院为基础病例对照研究方法对2010年11月-2012年7月在广东省8家医院内分泌科就诊的595例2型糖尿病患者和同期在此8家医院健康体检的725名体检人群进行问卷调查, 并采用SNPscan^TM多重SNP分型试剂盒对筛选的2个tagSNP(rs7408174、rs3219175)进行基因分型;应用χ²检验、logistic回归模型等方法分析SNP位点与2型糖尿病的关联性。结果rs7408174的TT、CT、CC基因型频数在病例组为329例(55.3%)、230例(38.7%)、36例(6.1%), 在对照组为366人(50.8%)、308人(42.8%)、46人(6.4%);rs3219175位点的GG、GA、AA基因型频数在病例组为377例(63.4%)、200例(33.6%)、18例(3.0%), 在对照组中为442人(61.0%)、253人(34.9%)、30人(4.1%);调整性别、体质指数和甘油三酯等因素后, rs7408174、rs3219175在等位基因关联分析和基因型关联分析中差异均无统计学意义(P>0.05)。结论广东省汉族人群rs7408174和rs3219175与2型糖尿病无关联。     

新疆维、汉两民族非综合征性唇腭裂IRF6基因多态性分析

目的:探讨非综合征性唇腭裂(NSCL/P)干扰素调节因子6(IRF6)rs2013162位点单核苷酸多态性(SNP)在新疆维、汉两民族内和民族间基因型和等位基因型的频率差异。方法:抽取100例NSCL/P患者作为NSCL/P组(维吾尔族50例、汉族50例),对照组100例(维吾尔族50例、汉族50例),运用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RELF)技术来分析IRF6基因的多态性,病例-对照研究分析两组基因型和等位基因型频率及两民族内和民族间频率的差异。结果:rs2013162位点GG基因型和等位基因G和T频率在NSCL/P组和对照组中分布差异有统计学意义(P<0.05),维、汉两民族内rs2013162位点维吾尔族中GG和TT基因型及等位基因G和T分布差异有统计学意义(P<0.05),维、汉两民族间rs2013162位点NSCL/P组中维吾尔族GG和TT基因型和等位基因G的频率均高于汉族,两民族间基因型和等位基因型分布差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:新疆维、汉族NSCL/P与rs2013162位点GG基因型及等位基因G存在相关性。     

内皮型一氧化氮合酶基因多态性与2型糖尿病并发冠心病的相关性研究

目的探讨汉族人内皮固有型一氧化氮合酶(ecNOS)基因外显子7单核苷酸多态性(G894T)和内含子4可变数目串联重复序列插入/缺失多态性(4b/a)与2型糖尿病(T2DM)并发冠心病的关联性。方法提取80例T2DM患者、92例T2DM并发冠心病患者及119例健康人的基因组DNA,用聚合酶链反应—限制片段长度多态性法测定G894T多态性,用聚合酶链反应-可变数目串联重复序列法测定4b/a多态性。结果3组间G894T多态性基因型(χ2=11.112,P=0.004)和等位基因(χ2=12.262,P=0.002)频率分布存在统计学差异;3组间4b/a多态性基因分布无差别;携带T等位基因的T2DM患者较之GG基因型者发生冠心病的危险性升高(OR=3.293,P=0.005)。结论ecNOS基因894位点T等位基因是T2DM并发冠心病的独立危险因素。4b/a多态性与T2DM或T2DM并发冠心病无关。     

钙蛋白酶10基因多态性与2型糖尿病遗传性

目的探讨昆明高原地区钙蛋白酶10基因（Calpain 10基因）单核苷酸多态性-SNP43与2型糖尿病遗传易感性的关系。方法采用1：1病例对照研究方法,在昆明市城市社区选取131名2型糖尿病患者和131名正常对照者。应用聚合酶链式反应双引物等位基因特异性扩增法（PCR-ASA）检测Calpain 10基因UCSNP43位点G／A等位基因的多态性。结果（1）UCSNP43的G等位基因频率及GG基因频率在2型糖尿病患者中均较对照组显著升高,分别为93．13％和86．26％（P=0．0097）,86．26％和73．28％（P=0．0089）。（2）SNP43位点的G／G基因型与2型糖尿病相关,经Logistic回归分析,OR值在2型糖尿病患者为2．24,P=0．006。结论calpain 10基因的SNP43位点与昆明人2型糖尿病的遗传易感性有关。