结肠癌肝转移与肺转移关键基因集筛选及功能分析

目的 挖掘结肠癌转移的关键基因及其临床意义。方法 基于TCGA和GEO(GSE41258)中的结肠癌数据集,利用WGCNA包和Limma包分析结肠癌转移相关的基因集,并分析基因集对预后及肿瘤临床分其的影响。随后利用Metascape构建每一个关键基因的蛋白互作网络,并利用DAVID根据蛋白互作网络进行功能富集分析。最后,利用TIDE数据库,从免疫角度分析关键基因对细胞毒性T细胞的免疫浸润以及免疫应答的影响。结果 本研究筛选出了CNN1、CXCL10、CXCL11、MGP、SPINK4和PBK 6个关键基因,不仅影响患者预后,同时与结肠癌的肿瘤分期呈现线性关系。通过KEGG与GO富集发现结肠癌肝转移关键基因网络调控细胞因子功能、中心粒细胞驱化以及单核细胞驱化等免疫过程,而在结肠癌肺转移关键基因网络调控RAS信号通路,这些结果揭示了结肠癌不同转移途径的机制差异。其中,CNN1、MGP抑制细胞毒性T细胞的免疫应答,PBK促进细胞毒性T细胞的免疫应答。结论 CNN1、CXCL10、CXCL11、MGP、SPINK4和PBK 6个基因可以作为结肠癌转移的筛查分子标志物,并在结肠癌的免疫治疗中发挥作用,为潜在的结肠癌的治疗靶标。     

应用微阵列芯片分析结肠癌组织中miRNA差异性表达

目的 分析结肠癌与正常结肠黏膜的微小RNA(miRNA)表达谱差异.方法 收集结肠癌组织和癌旁正常结肠黏膜共12对,抽提、纯化RNA,加入荧光标记后与miRNA寡核甘酸基因芯片(Affymetrix公司)杂交,应用SAM软件进行数据分析,对有显著差异的miRNA进行实时荧光定量PCR验证,采用靶基因分析软件分析miRNA功能.结果 has-miR-182、has-miR-17、has-miR-106a、has-miR-93、has-miR-200c、has-miR-92a、has-let-7a、has-miR-20a等8个miRNA在肿瘤组织中显著上调[中位假基因验出率(FDR)＜5%],has-miR-195、has-miR-143、has-miR-145等3个miRNA显著下调(FDR＜5%).结论 结肠癌与正常结肠黏膜之间存在明显的miRNA差异表达,这些miRNA的差异性表达可能与结肠癌的发病、侵袭、转移相关.     

结肠癌转移相关基因-1在胃肠肿瘤中的作用

胃肠肿瘤对人类的健康构成了巨大威胁。目前,其预后判断和治疗方案的选择主要依据其临床病理学分期。随着对肿瘤认识的不断深入,分子标志物已成为判断患者预后的热点研究领域之一。结肠癌转移相关基因-1(metas-tasis-associated in colon cancer-1,MACC1)是近年发现与胃肠肿瘤的预后相关的重要基因,并可能作为在早期阶段预测胃肠肿瘤是否发生远处转移的一个独立的指标。本文综述了MACC1与胃肠道肿瘤转移、生存期的关系及调控机制等方面研究进展。     

结肠癌转移相关基因1在妇科恶性肿瘤中的研究进展

结肠癌转移相关基因1(MACC1)被证实与多种恶性肿瘤的发生、发展和转移等多种生物学行为关系密切.本文就MACC1在妇科恶性肿瘤发生、发展中的作用,对肿瘤生物学行为的影响及其在化疗效果和预后评估等方面应用的研究进展作一综述.     

结肠癌根治术转移复发的相关因素分析

目的 探讨结肠癌根治术转移复发的相关因素.方法 回顾2003年1月～2009年12月外科收治的310例结直肠癌患者,行根治切除术临床资料进行总结.结果 本组310例结肠癌患者术后有72例发生转移复发（23.2）.结论 结肠癌根治术转移复发与肿瘤淋巴结转移、大体分型、分化程度、浸润深度、辅助化疗等相关因素有关.     

小鼠结肠癌高转移模型体内筛选和建立

目的采用体内筛选的方法建立小鼠结肠癌高转移模型,为系统研究结肠癌转移机制和临床结肠癌治疗提供动物模型。方法先将C26小鼠结肠癌移植于T、B、NK免疫细胞缺陷的NOD-SCID小鼠皮下,并在首代筛选过程中切除皮下瘤,延长小鼠寿命以获得明显转移灶,然后通过皮下移植→肺转移→皮下移植→肺转移的体内循环筛选方法建立高转移模型。以建立成功的高转移模型为瘤源,在BALB/c小鼠体内以相同的方法继续筛选,同时进行肿瘤的生长和转移情况观察、病理组织学、超微结构、细胞增殖周期和异倍体的观察。结果NOD-SCID小鼠筛选5代后肺转移达100%。但筛选后的肿瘤组织皮下移植到BALB/c小鼠体内时,肿瘤的转移程度有所下降,又经BALB/c小鼠体内4代筛选,肿瘤的移植成瘤率、肺转移率均为100%。病理组织学、超微结构观察、细胞增殖周期和异倍体等结果表明与原结肠癌生物学特性相似。结论作者建立的肺转移率100%、转移特性稳定、直观性好、操作简便的小鼠结肠癌高移植模型,为探讨结肠癌转移的生物学机制和抗转移治疗提供了理想的动物模型。     

大黄素抑制结肠癌转移的研究

目的 研究大黄素对结肠癌细胞转移的抑制作用及其作用分子机制.方法 通过MTT法确定大黄素有效作用浓度,采用细胞划痕实验、Transwell和基质胶实验检测大黄素对结肠癌细胞迁移、侵袭能力的影响.通过免疫印迹试验(Western blot)检测EMT事件标志性蛋白的变化及上游信号通路的标志性蛋白.结果 MTT表明,大黄素对结肠癌细胞SW480有明显的抑制作用;细胞划痕、Transwell和基质胶实验表明,大黄素具有抑制结肠癌迁移和侵袭的能力;Western blot结果表明,大黄素激活N-cadherin,抑制E-cadherin、Vimmentin、β-catenin的表达,同时抑制恶性基因VEGF、MMP-2、MMP-9的表达,抑制Akt/mTOR、STAT3的磷酸化.结论 大黄素通过抑制STAT3、PI3K-AKT信号通路进而抑制结肠癌转移,为其在临床上作为治疗结肠癌的辅助药物或直接作用药物提供理论依据.     

应用cDNA微阵列技术研究胶质母细胞瘤凋亡相关基因的表达

目的研究胶质母细胞瘤凋亡相关基因的表达。以探讨凋亡相关基因的异常表达在肿瘤的发生、发展过程中的作用。方法采用cDNA微阵列技术,研究胶质母细胞瘤与正常脑组织之间凋亡相关基因表达的差异。采用看家基因对杂交信号进行校正。差异大于1.5倍的基因视为差异有显著性意义,并从中选择6个基因采用RT-PCR进行验证。结果共有28个基因的表达存在差异,其中有17个基因在胶质母细胞瘤表达升高,11个表达下降。RT-PCR结果与基因芯片结果一致。结论众多凋亡相关基因参与了胶质母细胞瘤的发生和发展,其中部分基因如CRAF1、hHR23B等是新发现的与胶质母细胞瘤有关的基因。     

结肠癌术后早期肝转移的相关基因分析

目的 探讨大肠癌早期肝转移的相关基因,为大肠癌肝转移的早期诊断提供理论依据.方法 应用RT2 ProfilerTM PCR Array Human Tumor Metastasis(PAHS-028A)芯片,对原发灶和肝转移灶组织进行差异基因筛选.结果 我们发现以下基因在大肠癌原发灶中表达明显高于肝转移结节:ACTB、APC、CTNNA1、NRdA3、MMP10、CTSL1、RB1、HPSE、ETV4、GNRH1、CDKN2A、KISS1R、IL8RB、ITGA7、ITGB3、DENR、RPSA,CXCR4、MYCL1、NME2、PNN、SMAD2,4、MMPIJ、SRC、RORB、SS7712、SYK、TCF20、MMP3、TIMP2,3,4、TIPM1;以下基因肝转移灶表达明显高于原发灶:MMP9、FN1、CST7、CCL7、MGAT5.结论 筛查大肠癌早期肝转移相关基因可以为合成大肠癌早期肝转移基因芯片提供依据.     

结肠癌相关基因研究进展

结肠癌是常见的恶性肿瘤,在我国其发病率有上升趋势。近年来,从分子水平上研究结肠癌的发生、发展及预后,寻找更有效的治疗方法,已经成为热点。目前研究结果显示,与结肠癌发生、发展相关的基因有许多。现从癌基因、抑癌基因、与血管生成有关的基因、其他基因等几个方面对其研究进展予以综述,为更好地研究结肠癌提供一定的理论依据。     

基因芯片技术筛选结直肠癌腹膜转移相关基因

目的筛选和鉴定结直肠癌腹膜种植转移相关基因。方法收集手术切除3例伴有腹膜种植转移的结直肠腺癌病人原发病灶和正常黏膜的新鲜组织标本,提取总RNA,经逆转录合成cDNA后经体外扩增合成aRNA,Cy3荧光分子标记后和人类全基因组表达谱芯片杂交,采用经验贝叶斯方法(P≤0.05)筛选出差异表达基因,并用RT-PCR实验对部分差异表达基因进行验证。结果满足(P≤0.05)的基因共有105个。其中和正常组织相比,在肿瘤组织表达上调的基因有42个,表达下调的基因有63个。通过生物信息学分析,在表达上调基因中选择3条(S100P;PRDX1;SLPI)基因进RT-PCR行验证,结果与芯片结果完全相符。结论基因芯片技术通过筛选结直肠癌腹膜转移过程中发挥关键作用的基因,为寻找结直肠癌腹膜转移的分子标志物提供依据和参考。     

转移负相关新基因C14orf106的生物信息学分析

目的研究肿瘤原发灶和转移灶的基因表达差异,并采用生物信息学方法对1条卵巢癌肝转移灶低表达基因C14orf106进行初步分析。方法分别制备卵巢癌原发灶和肝转移灶组织标本mRNA,线性扩增后与人类寡核苷酸芯片杂交,通过信号扫描、处理后获得两者的表达差异基因。并用生物信息学方法对1条无功能研究的新基因C14orf106进行初步分析,预测了它的基因结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、蛋白质功能域等信息。并对多物种中的相似性蛋白进行了系统进化分析。结果人类寡核苷酸芯片发现了共272条差异表达基因。对转移负相关新基因C14orf106的上述性质进行了有效的预测,基本明确了该基因编码蛋白为一核蛋白,可能参与了肿瘤转移抑制基因的转录活化及促进表达。结论生物芯片技术是一种研究肿瘤转移基因表达差异的有效的高通量研究方法。通过生物信息学分析,表明新基因C14orf106是一个有肿瘤转移研究价值的新靶点。     

转移负相关新基因C140rf106的生物信息学分析

目的研究肿瘤原发灶和转移灶的基因表达差异，并采用生物信息学方法对1条卵巢癌肝转移灶低表达基因C140rf106进行初步分析。方法分别制备卵巢癌原发灶和肝转移灶组织标本mRNA，线性扩增后与人类寡核苷酸芯片杂交，通过信号扫描、处理后获得两者的表达差异基因。并用生物信息学方法对1条无功能研究的新基因C140rf106进行初步分析，预测了它的基因结构、染色体定位、编码蛋白质的理化性质、亚细胞定位、蛋白质功能域等信息。并对多物种中的相似性蛋白进行了系统进化分析。结果人类寡核苷酸芯片发现了共272条差异表达基因。对转移负相关新基因C140rf106的上述性质进行了有效的预测，基本明确了该基因编码蛋白为一核蛋白，可能参与了肿瘤转移抑制基因的转录活化及促进表达。结论生物芯片技术是一种研究肿瘤转移基因表达差异的有效的高通量研究方法。通过生物信息学分析，表明新基因C140rf106是一个有肿瘤转移研究价值的新靶点。     

MiR-148a-3p通过靶向SRPK2抑制结肠癌细胞转移

目的:MicroRNA (miRNA/miR)参与结肠癌各种生物学过程。目前,miR-148a-3p在结肠癌中的作用还不完全清楚。本研究旨在探讨miR-148a-3p对结肠癌细胞转移及侵袭能力的影响及机制。方法:实时定量PCR （qRT-PCR）检测结肠癌细胞系中miR-148a-3p及SRPK2 mRNA的表达,Western blot检测SRPK2 蛋白的表达。使用miR-148a-3p mimic, miR-148a-3p inhibitor调节HCT-116及SW480细胞中miR-148a-3p的水平。通过划痕及transwell实验检测miR-148a-3p对结肠癌细胞迁移及侵袭能力的影响。生物信息学分析预测miR-148a-3p的靶点,荧光素酶报告实验验证。Western blot及qRT-PCR检测miR-148a-3p对结肠癌细胞上皮-间质转化及SRPK2表达的影响。结果:与正常结直肠粘膜细胞FHC相比,结肠癌细胞系中miR-148a-3p水平降低（P<0.05）。结肠癌细胞中miR-148a-3p过表达可以明显抑制结肠癌细胞转移及侵袭能力（P<0.05）。相反的,敲低miR-148a-3p结肠癌细胞转移及侵袭能力增强（P<0.05）。荧光素酶报告系统结果提示SRPK2是miR-148a-3p的直接作用靶点。过表达miR-148a-3p可以抑制SRPK2在结肠癌中的表达（P<0.05）,但是敲低miR-148a-3p时SRPK2表达明显增高（P<0.05）。结论:MiR-148a-3p可能通过靶向SRPK2抑制结肠癌细胞的转移及侵袭能力。MiR-148a-3p可能成为诊断和治疗结肠癌的靶点之一。     

裸鼠结肠癌肝转移模型中多韦替尼抗肿瘤作用的研究

目的：建立稳定的裸鼠结肠癌肝转移模型,观察多韦替尼（ TKI-258）药物的肿瘤抑制作用。方法将人结肠癌细胞株LoVo接种于裸鼠脾脏建立异位肝转移模型,随机分为TKI-258研究组和对照组。研究组TKI-258灌胃,对照组同一时间段用生理盐水。采用形态学和病理学方法比较TKI-258研究组与对照组间肝转移癌形成情况,并对TKI-258研究组肝转移的预防与治疗进行评价和鉴定。结果裸鼠结肠癌异位肝转移模型的成瘤率为100％。 TKI-258研究组与对照组相比抑制肝转移癌的形成,肝转移评分也明显下降,差异有显著性意义（ P＜0．05）。 TKI-258研究组的肝转移癌明显缩小,浸润深度变浅,部分有治愈瘢痕,两组差异在形态学上有显著性意义（P＜0．05）。 TKI-258研究组的肿瘤中央细胞坏死及细胞凋亡成片,只存留边缘部分肿瘤细胞,细胞分布不规则,两组在显微镜下观察差异有显著性意义（P＜0．05）。结论异位肝转移模型适合对肝转移率和取材要求较高的实验研究。 TKI-258对裸鼠肝转移癌的预防和治疗有一定的疗效,能有效抑制转移癌的形成,但有必要进行临床试验来证实其量化效果。     

不同转移潜能结肠癌细胞比较性实验研究

目的:评估影响结肠癌进展的主要因素,为临床有效防治提供实验依据。方法:对两种具有不同转移潜能的人结肠癌细胞株LS174T及HCT8,作生长能力、侵袭力、癌细胞表面HLA及共刺激分子表达、诱导血管内皮细胞迁移能力、血管内皮生长因子表达等指标的检测。结果:两种癌细胞株主要在诱导血管内皮迁移能力上存在不同,LS174T及HCT8诱导的内皮细胞迁移数目分别为154.6±37.9个及113.0±72.7个,差异有统计学意义(t=2.137,P<0.05)。结论:高转移的结肠癌细胞在促使肿瘤血管生成能力上存在优势。     

华蟾素抑制结肠癌细胞增殖转移的实验研究

目的:观察华蟾素对结肠癌细胞HCT116细胞增殖、迁移的影响,探讨其可能的作用机制。方法:常规体外培养结肠癌细胞HCT116细胞系,采用CCK-8法检测不同浓度华蟾素作用不同时间对HCT116细胞增殖的抑制作用,细胞划痕实验和Transwell小室法检测华蟾素对细胞迁移能力的影响,蛋白质印迹法(Western blot)检测细胞基质金属蛋白酶(MMP)-9、MMP-2、钙黏蛋白(E-Cadherin)的表达水平。结果:CCK-8法检测结果表明,华蟾素对HCT116细胞的生长有明显抑制作用,其抑制作用随药物浓度和作用时间的增加而增强(P0.05);细胞划痕实验和Transwell小室法结果显示,随华蟾素药物浓度的增加,HCT116细胞迁移能力下降(P0.05);Western blot结果表明,华蟾素能够明显抑制HCT116细胞MMP-9的蛋白表达并上调E-Cadherin的蛋白表达(P0.01),但对MMP-2蛋白的表达无显著影响(P0.05)。结论:华蟾素能够抑制人结肠癌细胞的增殖和转移,其机制可能与其抑制MMP-9和上调E-Cadherin的蛋白表达有关。     

结肠癌淋巴结转移43例的CT评价

目的了解结肠癌淋巴结转移的CT诊断价值和评价标准的确切性。方法对比分析43例结肠癌淋巴结转移患者的术前CT与术后病理诊断结果。结果43例患者共113个淋巴结转移中,CT诊断正确48个(45.3%),误诊58个,漏诊65个。结论CT对结肠癌淋巴结转移的诊断价值有限。     

血管内皮生长因子-C表达与结肠癌淋巴转移的关系

[目的]探讨结肠癌组织中血管内皮生长因子-C（VEGF—C）表达与淋巴转移、临床病理参数之间的关系。[方法]将64例结肠癌患者按有无淋巴结转移、性别、年龄、肿瘤大小及TNM分期进行分组,采用免疫组化PV-9000二步法检测其结肠癌组织中VEGF—C表达情况,应用X^2检验、直线相关分析进行统计学处理。[结果]结肠癌组织中VEGF—C阳性率为57．8％;在淋巴结转移阳性组VEGF—C表达（80％）明显高于淋巴结转移阴性组（38．2％）（P〈0、01）。VEGF—C表达与患者性别、年龄、肿瘤大小均无显著相关（r=0．008、0．025、0．013,P〉0．05）,而与TNM分期显著相关（r=0．447,P〈0．01）,其中随着TNM分期的增高,VEGF—C阳性表达亦显著增高。[结论]结肠癌可表达VEGF—C,并影响结肠癌的淋巴转移。VEGF—C高表达而淋巴结转移阴性的病人有很强的淋巴结转移倾向,甚至可能已发生淋巴结微转移。     

Microarray expression analysis of epithelial ovarian cancer with distinct differentiation

To identify gene expression profiling in epithelial ovarian cancer and to explore its correlation with histopathology characterization and prognosis. Gene expression profiles were generated from 10 hu- man ovarian frozen tissue specimens using Agilent Human 1A microarrays. Strikingly, clear differences of gene expression patterns were observed in ovarian cancer as compared to normal tissues. Unique gene pro- files were observed in moderately and poorly differentiated epithelial ovarian cancer. It is concluded that different histopathology characterization likely exists extensive molecular heterogeneity.