人类白细胞抗原新等位基因B*55:35的鉴定及家系调查

目的 鉴定人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)基因B位点的1个新等位基因并调查其遗传情况.方法 应用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reactionsequence specific oligonucleotide probe,PCR-SSOP) HLA分型技术发现1个疑似的新HLA等位基因,通过DNA测序鉴定其序列,并与同源性最高的HLA基因进行核苷酸序列比对,对携带者家系进行调查.结果应用PCR-SSOP进行HLA基因分型时,该样本HLA-B位点反应格局异常.DNA序列分析证实其为1个新HLA-B等位基因.与同源性最高的等位基因B*55:02比较,在第2外显子区域中有7个碱基发生改变,导致6个密码子发生了变化,造成2个氨基酸改变,即第69位的氨基酸由谷氨酸(Glu)变为甲硫氨酸(Met)、第70位的氨基酸由谷氨酸(Glu)变为丙氨酸(Ala).结论 发现并鉴定了HLA-B位点的1个新等位基因,GenBank注册号为FJ898284,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B* 55:35.     

西藏珞巴族HLA-A,-B基因多态性研究

目的调查西藏地区珞巴族群体HLA—A，—B基因的多态性。方法用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针反向斑点杂交技术，对西藏林芝地区3代内无血缘关系的92个珞巴族健康个体进行了HLA—A，—B位点的基因分型。结果在HLA—A位点共检出10种等位基因，在HLA—B位点检出19种等位基因；在HLA—A位点高频等位基因是HLA—A*11、-A*02、-A*24，它们的频率分别为36．40％、25．50％、23．90％，这3种等位基因共占珞巴族可检出等位基因的85．80％。在HLA—B位点高频基因为HLA—B*40(频率为27．20％)、-B*15(11．40％)和-B*38(10．90％)，它们占等位基因的49．5％。结论珞巴族与其他各华人群体间都存在较大的差异，显示其HLA等位基因频率分布的民族独特性；但其HLA—A、—B等位基因多态性与藏族的很接近，这与民族学、历史学和社会学研究结果相一致。     

云南彝族2型糖尿病与HLA-DQA1等位基因多态性的关联研究

目的探讨云南彝族2型糖尿病与HLA—DQA1等位基因多态性的关联性。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物技术，对58例云南楚雄地区彝族2型糖尿病患者和同地区82名彝族正常对照者进行基因分型，做2型糖尿病与HLA—DQA1等位基因多态性的关联分析。结果云南彝族2型糖尿病组与彝族对照组比较，HLA-DQA1＊0301等位基因频率明显高于对照组（P=0．002，RR=3．097）；HLA—DQA1＊0601等位基因频率明显低于对照组（P=0．025，RR=0．429），差异有统计学意义。结论HLA—DQA1＊0301是云南彝族2型糖尿病的易感基因；HLA—OQAI＊0601是云南彝族2型糖尿病的保护基因。     

HLA-B40组等位基因多态性和血清学分型不明确标本分析

目的：利用DNA分型技术调查上海汉族人群HLA－B40组等位基因多态性并比较配型标本中HLA－B40抗原血清学和DNA分型的结果：方法：采用反向PCR－SSOP技术进行DNA分型，可检出HLA－B＊4001－4011等11个等位基因，结果：所有标本DNA分型均获成功，无假阳性和假阴性结果出现，质控DNA分型结果与UCLA结果相符，上海地区汉族人群共检出B＊4001－4003，4005－4007，4011等等位基因，未检出B＊4004，4008－4010等等位基因，296名无关个体中HLA－B40＊组等位基因频率为0．1402，血清学方法检测HLA－B40组抗原错误率为12．82％（10／78），结论：该技术用于HLA－B40分型分辨率高，分型结果较血清学方法更加精确，可确保HLA分型的准确。     

DNA测序鉴定新等位基因HLA-DRB1*1609

目的 鉴定HLA新等位基因DRB1＊1609。方法 应用分子克隆和DNA测序的技术测定HLA新等位基因的核苷酸序列，进行HLA等位基因序列比对分析和新等位基因的血清学分型及家系分析。结果 新等位基因DRB1第二外显子（exon2，Ex2）序列与所有已知的HLA等位基因序列均不相同，与同源性最高的HLA-DRB1＊160101相比，第127位碱基由A→T，引起相应编码第47位氨基酸由酪氨酸Tyr（Y）→苯丙氨酸Phe（F）。血清学分型表明抗原特异性为DR16。家系分析提示该志愿者DRB1＊1609等位基因遗传自母亲。结论 DNA测序表明被测标本含有HLA-DRB1新等位基因，被WHOHLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1＊1609。     

HLA新等位基因HLA-DRB1*0453的认定

目的鉴定一个HLA-DRB1＊04的新等位基因。方法从外周血中提取基因组DNA．应用PCR-SSO技术进行中低分辨率的HLA基因分型，PCR产物直接测序技术检测基因序列，通过软件和数据库中的同源等位基因进行序列比对，对先证者进行家系分析。结果样本HLA-DRB1位点的第2外显子序列与所有已知HLA-DRB1等位基因序列不同，该基因序列与同源性最高的等位基因DRB1＊0447相比有3个碱基替代，在外显子2区域中的286位碱基发生了C→A替代，导致相应的67密码子由亮氨酸（L）→异亮氨酸（I），344和345位碱基发生了GT→TG替代，并导致相应的86密码子由甘氨酸（G）→缬氨酸（V）。家系分析结果显示，先证者的新等位基因HLA-DRB1＊0453遗传自父亲。结论该等位基因是HLA-DRB1＊04新的等位基因，被WHO HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1＊0453。     

湖南汉族人群HLA-DP、-DQ位点等位基因多态性与鼻咽癌的相关性

目的 探讨湖南汉族人群HLA—DP、HLA—DQ位点等位基因多态性与鼻咽癌遗传易感性之间的关系。方法 应用聚合酶链反应—特异性寡核苷酸探针基因分型技术对87例湖南汉族鼻咽癌患者与91名健康对照作HLA—DPAl、—DPBl、—DQAl及—DQBl的基因分型，采用x^2检验比较两组各位点等位基因频率，单倍型频率分布的差异。结果 发现鼻咽癌组DPAl*0201、DPBl*1901、DQAl*0201较对照组明显降低，DPBl*0402、DQAl*0101较对照组明显升高；单倍型DPAl*0201—DPBl*1401及DQAl*0201—DQBl*0201较对照明显降低；但P值经Bonferroni校正后，差异均无显著性(Pc＞0．05)。结论 湖南汉族人群HLA—DP和—DQ位点与鼻咽癌无明显相关，与以往用受累同胞对方法在鼻咽癌家系中未能证实鼻咽癌易感基因与HLA—DP和—DQ位点连锁的结果一致。     

沈阳地区汉族人群HLA-DRB1的PCR-SBT分型研究

HLA(humanleukocyteantigen ,HLA)位于人类第 6号染色体短臂 6p2 1.3区域 ,具有高度的遗传多态性 ,作为个体组织细胞的遗传标志物 ,在抗原识别、递呈、免疫应答与调控等方面起着非常重要的作用。其中HLA DR抗原是异基因移植免疫反应中最重要的抗原之一 ,决定其特异性的主要编码基因DRB1座位具有高度多态性 ,DRB1基因分型对器官移植的供体选择、法医学个体认定、HLA与疾病相关性及人类学等研究均具有重要意义。我们用聚合酶链反应 直接测序方法 (PCR SBT)对沈阳地区汉族健康个体进行了DRB1高分辨率的等位基因分析。沈阳地区汉族…     

新等位基因HLA-A*240212的认定

目的发现和认定1个HLA新等位基因。方法应用PCR-SSO基因分型技术筛选可能的HLA新等位基因，PCR产物测序，确认与最同源HLA等位基因序列的差异。结果发现一个样品的HLA-A位点结果异常。其序列与已知所有HLA—A等位基因序列不一致，与同源性最高等位基因A＊24020101的差异只是在第2外显子区域中的230位碱基发生了C→T碱基的替换，但并未改变第77密码子编码的氨基酸。结论该等位基因为HLA-A位点的1个新等位基因，已被WHOHLA因子命名委员会于2006年8月23日正式命名为HLA-A＊240212。     

云南昆明彝族和汉族儿童HLA-DQB1等位基因的多态性研究

研究不同人群HLA的多态性，对于探讨相关疾病的致病机制及器官移植配型都有着重要的理论和应用意义。本文采用了聚合酶链反应．序列特异性引物(polymerase chain reaction—sequence specific primers，PCR—SSP)技术对云南昆明地区70名彝族和72名汉族健康儿童进行了HLA—DQB1基因分型，旨在探讨昆明彝族和汉族人群HLA—Ⅱ类基因频率分布特征，从而提供一些遗传学方面的数据。     

新等位基因HLA-B*070503的认定

中华骨髓库辽宁分库组织配型实验室常规HLA基因分型工作中发现一个新的HLA-B等位基因，被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B＊070503（HWS10003243-DQ162803）。     

广东汉族人群HLA-B基因多态性研究

目的调查广东汉族人群HLA-B位点基因多态性，比较不同人群HLA—B等位基因频率分布特征。方法应用测序技术测定562名广东汉族人HLA-B位点第2、3、4外显子序列，比对数据库得到分型结果，计算HLA-B等位基因频率并与不同人群进行比较。结果共检测到59种HLA-B等位基因，其中6种等位基因频率≥5％，分别是HLA-B＊4601（14．5％），HLA-B＊400101（14．4％），HLA—B＊1502（11．5％），HLA—B＊1301（8．6％），HLA-B＊5801（8．1％）和HLA-B＊380201（6．4％）。这6种等位基因的等位基因频率合计为63．5％。同时，检测到30种等位基因频率〈0．5％的HLA-B等位基因，这30种等位基因的等位基因频率合计为4．9％。广东汉族人群HLA-B等位基因频率总体分布与中国香港华人、新加坡华人比较差异无统计学意义（P〉0．05），但与日本人比较差异有统计学意义。结论分析了HLA-B基因在广东汉族人群中的分布特征，提供了较完整的HLA-B等位基因频率分布资料，为遗传学及疾病相关性等研究提供了重要的参考数据。     

新等位基因HLA-A*01:130的序列分析及HLA分子三维结构模拟

目的:确认HLA新等位基因HLA-A*01:130并分析其有异常反应格局的核苷酸序列。方法:应用DNA测序分型技术(PCR-SBT)进行HLA分型,对可疑新等位基因采用单链测序基因分型技术直接测定基因序列,分析其与同源性最高的HLA等位基因序列的差异。最后,经Swiss-Model对HLA分子进行三维结构模拟。结果:新基因与所有已知的HLA-A等位基因序列均不相同,与HLA-A*01:66基因序列相比在第3外显子368位碱基由A→G,导致第99位密码子改变,酪氨酸→半胱氨酸。替代氨基酸位于抗原肽结合区β片层上。结论:发现一个新的HLA-A等位基因,现已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-A*01:130。     

脐血HLA-A位点PCR-SBT分型的研究

目的建立HLA—A位点等位基因的PCR-SBT高分辨分型方法，探讨DNA测序技术在脐血库样本HLA分型中的应用价值。方法利用PCR产物直接测序，对广州脐血库保存的547份脐血样本进行HLA—A位点2、3、4外显子的序列分析，由分型结果得出基因频率，与中华（上海）骨髓库北方人群、上海地区人群及德国白种人进行比较。结果采用PCR-SBT分型方法并结合分析软件确定了全部样本的HLA—A基因型，广州地区人群HLA-A等位基因以A＊110101（30．8％）最为常见，其后依次是A＊24020101／02L（16．18％）、A＊0207（11．88％）、A＊3303（9．42％）。A＊110101在广州汉族人群中出现的频率明显高于中华（上海）骨髓库北方人群，而A＊010101、A＊3001明显低于后者；在HLA-A2亚型人群中，A＊020101在广州、上海两地汉族人群中的频率明显低于德国白种人，而广州汉族人群中A＊020101与A＊0206均明显低于上海汉族人，但A＊0203明显高于后者。结论基于核酸序列测定的HLA分型技术能够直接、准确、快速地进行高分辨分型，将有助提高无亲缘关系供者脐血移植的临床效果。改进实验条件、升级分型软件，可以降低试剂成本和节约时间。     

新的HLA-DRB1等位基因DRB1*1212的核苷酸序列分析

目的验证一个新的HLA等位基因HLA—DRB1＊1212的序列。方法采用盐析法抽提样本基因组DNA，利用HLA—DRB1组特异性引物PCR扩增先证者HLA—DRB1等位基因的第2外显子，PCR产物经割胶回收后进行测序分析，通过聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针方法验证测序发现突变点。结果先证者有两个HLA—DRB1等位基因，其中一个为HLA—DRB1＊090102，另一个HLA—DRB1等位基因，经BLAST验证为新的等位基因，新的等位基因序列已递交GenBank（AY899825）。与最接近的DRB1＊120101等位基因序列相比，新的等位基因仅在第2外显子上有1个核苷酸不同，即第199位A→C，导致第67位氨基酸Ile—Leu。结论该等化基因为新的HLA—DRB1等位基因，被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-DRB1＊1212。     

新等位基因HLA-B*9526的确认和序列分析

目的 鉴定中国人群中人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因HLA-B*9526,并进行核苷酸序列分析.方法 使用序列特异性寡核苷酸PCR技术进行HLA基因分型,发现1个反应格局异常的等位基因,应用分子克隆和DNA双向测序技术测定新等位基因的核苷酸序列,并与已知等位基因进行序列比对分析.结果 检出反应格局异常的DNA样本,经过克隆测序得到两个等位基因,分型结果一个为B*5403,另一个的核苷酸序列与已知的HLA等位基因均不同,该基因序列与同源性最高的HLA-B*1507基因序列相比在第3外显子区域中425位碱基发生A→G突变,导致142位编码氨基酸由酪氨酸变成半胱氨酸.结论 一个新的HLA-B等位基因被确认,并被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*9526.     

中国北京人群HLA-DRB1基因多态性的研究

目的 调查北京人群人类白细胞抗原(human leukocyte antigen，HLA)—DRBI基因多态性，获得完整准确的遗传学数据。方法 应用聚合酶链反应—序列特异性引物方法对2810名北京出生的汉族人进行HLA—DRBI基因型检测，并对随机抽取的217名个体进行DRBI高分辨分型。结果 检出DRBI基因型(低分辨率)14个，DRBI等位基因亚型(高分辨率)39个，其中DRBI*09012、*1501、*07011、*08032等位基因频率较高。结论 从基因水平分析了HLA—DRB1基因的群体分布特征，提供了一套比较完整准确的DRBI基因频率，为人类学及疾病相关性等研究提供了重要的参考数据。     

中国南方妇女子宫内膜异位症与HLA-DRB1相关性的研究

目的：探讨子宫内膜异位症与HLA－DRB1等位基因相关性。方法：用聚合酶链反应－序列特异性引物（PCR－SSP）技术对51例经腹腔镜或外科手术证实的子宫内膜异位症患者和44名健康育龄妇女,进行HLA-DRB1等位基因的基因分型。结果：两组人群HLA－DRB1等位基因频率的差异无显著性。结论：子宫内膜异位症与HLA－DRB1等位基因可能无相关性。     

新等位基因人类白细胞抗原B*4609的发现和确认

目的 鉴定一个人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因HLA-B*4609.方法 使用序列特异性寡核苷酸PCR技术进行HLA基因分型,发现反应格局异常的可疑新等位基因,应用分子克隆和DNA双向测序技术测定新等位基因的核苷酸序列,并与已知等位基因进行序列比对分析.结果 检出1个样本HLA-B位点反应格局异常,DNA测序分型结果一个为B*151101,另一个的核苷酸序列与已知的HLA等位基因均不同,该基因序列与同源性最高的HLA-B*460101基因序列相比,在第3外显子区域中527位碱基发生A→T突变,导致176位编码氨基酸由谷氨酸(GAG)变成缬氨酸(GTG).结论 样本中含有HLA-B新等位基因序列.该序列申报后,被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*4609.     

HLAⅠ、Ⅱ类抗原的组织配型基因芯片的建立及应用

目的应用基因芯片技术进行北方汉族人群HLAⅠ、Ⅱ类抗原中分辨度分型研究,建立稳定的HLA检测芯片。方法采用寡核苷酸芯片分型方法,选择了中国人群基因频率较高的等位基因,同时考虑遗传的连锁不平衡,根据HLA-A、HLA-B、HLA-DR、HLA-DQB、HLA-DQA不同基因亚型的独特序列,完成了探针的设计与筛选,共设计了213条探针(HLA-A 56条,HLA-B 66条,HLA-DQA 22条,HLA-DQB 38条,HLA-DR 31条)制成基因分型芯片。采用带荧光标记的引物,用合适的PCR方法扩增HLAⅠ、Ⅱ类抗原上的多态性区域,产物与芯片上探针杂交。杂交结果经荧光扫描并用特定软件分析判断,以此确定样品基因型。结果所有样本的HLAⅠ、Ⅱ类抗原基因分型均获成功。此中分辨度探针可分出598个Ⅰ类抗原等位基因,511个Ⅰ类抗原等位基因,可检出Ⅰ类抗原特异性57个,Ⅱ类抗原特异性30个。结论基因芯片用于HLAⅠ、Ⅱ类抗原分型可行。其分辨率高、特异性强,可用于HLA基因分型、骨髓移植、器官移植的HLA配型、与HLA有密切关系的遗传性疾病的人群筛查。