基于TCGA 数据对60 岁以上不同分层急性髓系白血病患者相关lncRNA 的基因信息学分析

目的　通过对肿瘤基因组图谱（the concet genome atlas,TCGA）的相关数据进行分析,以得到长链非编码 RNA （long non-coding RNA,lncRNA）及其下游靶分子,对60 岁以上急性髓系白血病 （acute myeloid leukemia, AML）人群预后影响的相关信息。方法　将TCGA 数据库中60 岁以上AML 患者样本,根据美国国立综合癌症网络 （NCCN）指南分为高危AML 和低中危AML 两组。通过R 软件中的“edgeR”筛选得出差异表达的lncRNA / miRNA / mRNA。再利用R 软件中的“survival”包对在高危AML 与低中危AML 中存在差异表达的lncRNA 进行生存分析,并 构建相互竞争的内源性RNA（ceRNA）网络。结果　根据TCGA 数据库中的 lncRNA / miRNA / mRNA 表达数据, 综合 分析得出10 个经典lncRNA（AC009154.1, AC011124.1, AC093627.2, AC144450.1, AL035691.1, AL355974.2, AL441943.2, LINC00703, LINC01612 和AC103702.2）与60 岁以上AML 患者预后具有显著的相关性,并得到了与这些lncRNA 相关 的ceRNA 网络。此外,还进行了两者之间存在差异表达的mRNAs 基因本体论（gene ontology,GO）和京都基因与基 因组百科全书（KEGG）通路分析。结论　可以通过干预这些lncRNA 的表达,影响高龄AML 患者预后,从而延缓或 控制高龄AML 患者病情的发展。     

基于TCGA 数据库构建三阴性乳腺癌预后相关的ceRNA 调控网络及分析

目的 通过分析癌症基因组图谱（the cancer genome atlas,TCGA）数据库构建三阴性乳腺癌(triple negativebreast cancer,TNBC）预后相关的竞争性内源性核糖核酸（competitive endogenous RNA, ceRNA）调控网络。方法 从TCGA 数据库中下载TNBC lncRNA 表达RNAseq 数据,对TNBC 患者的 mRNA,miRNA 和lncRNA 进行差异表达分析,并进一步行生存分析,得到与乳腺癌有明显差异表达同时也对生存有相关性的mRNA,miRNA 和lncRNA。同时构建 lncRNA- miRNA - mRNA 相关 ceRNA 调控网,再对生存相关 lncRNA 所相关的 mRNA 进一步功能富集和注释,并构建蛋白质互作网络最终用关键基因通过人类蛋白质图谱（the human protein atlas,HPA）数据库进行验证。结果 在TCGA 中共找到TNBC 差异表达mRNA 2 331 个、差异miRNA 100 个和差异lncRNA 1 269 个。ceRNA 调控网中的 mRNA 在细胞黏附、唾液分泌和血小板活化、用于IgA 产生的肠道免疫网络、补体和凝血级联反应等信号通路中明显富集。生存分析中,1 个差异mRNA(NMUR1）,1 个差异表达miRNA(hsa-miR-6832-3p),2 个差异表达的lncRNA（AC104809,LINC01297）的表达量均与TNBC 患者的预后相关,差异具有统计学意义（P ＜ 0.05）。最后利用HPA数据库对NMUR1 蛋白水平和生存分析验证,NMUR1 的高表达患者的总生存期显著高于NMUR1 低表达组,差异有统计学意义（P ＜ 0.05）。结论 成功构建了促进TNBC 发生发展的 lncRNA-miRNA-mRNA 调控网络,筛选得到生存相关的差异mRNA,miRNA 和lncRNA 为TNBC 发病机制的研究和诊疗生物标志物的探索提供参考依据。     

Circ＿0032821/miR-936/CEP55调控轴在胃癌组织中的表达及与临床特征之间的关系

目的 通过生物信息学技术构建胃癌相关circRNA的内源竞争性RNA(ceRNA)调控网络并探讨其临床意义。方法 挖掘基因表达图谱(GEO)数据库中差异表达的环状RNA(circRNA)、微小RNA(miRNA)、信使RNA(mRNA),Cytoscpe软件构建circRNA、miRNA、mRNA之间的ceRNA调控网络,并对差异表达的mRNA进行基因本体论和京都基因与基因组百科全书数据库通路富集分析,最后利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库的343个胃癌组织标本和30个正常组织标本的临床资料对ceRNA网络中的mRNA进行生存分析和表达验证,筛选其中重要的circRNA-miRNA-mRNA调控网络。在胃癌组织中对ceRNA的表达进行初步验证,并分析其与临床特征之间的关系。结果 构建的circRNA-miRNA-mRNA调控网络中包含6个circRNA、4个miRNA和21个mRNA。根据TCGA数据库中胃癌患者临床资料分析和表达验证,ceRNA网络中CEP55和CCDC80与患者生存预后相关,CEP55在胃癌肿瘤标本中的表达显著高于正常组织标本中的表达,差异有统计学意义(P<...     

类风湿关节炎患者滑膜组织lncRNA表达及基于CeRNA网络的生物信息学分析

目的:通过生物信息学分析来识别类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)滑膜组织病变进展相关的差异表达基因。方法:通过NCBI GEO数据库获取GSE55235和GSE55457的基因表达谱。采用Perl语言对下载的数据进行样本数据合并及基因重注释;采用R语言进行批次矫正及差异分析,根据差异长链非编码RNA(lncRNA)和mRNA构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络及进行GO富集分析和KEGG通路分析;使用cytoHubba插件筛选Hub基因,分析与差异LncRNA的相关性。结果:分析显示与正常滑膜组织对比,RA患者滑膜组织143个mRNA、3个lncRNA存在明显差异表达。根据差异基因构建lncRNA-miRNA-mRNA互作网络,网络由2个LncRNA节点,16个miRNA节点、17个mRNA节点以及44个边组成。GO功能富集分析主要集中在细胞死亡的正调控、成纤维细胞增殖的调节、免疫应答调节细胞表面受体信号通路等功能。KEGG通路分析显示35条通路被富集,其中涉及IL-17代谢通路、MAPK信号通路、WNT信号通路、TNF信号通路等。其中Hub基因MYC,CDKN1A,JUN,FOS与LncRNA MEG3在RA滑膜组织中均呈低表达,且lncRNA MEG3与MYC,CDKN1A,JUN,FOS表达具有相关性。结论:通过生物信息学网络分析,lncRNA MEG3可能作为ceRNA在RA的疾病发展中发挥着重要作用,为RA提供一些新的候选诊断生物标志物或潜在的治疗靶点。     

基于全转录组测序分析多形性胶质母细胞瘤增殖及侵袭的相关机制

目的 通过对多形性胶质母细胞瘤(GBM)组织及癌旁组织的转录组测序及生物信息数据进行分析,挖掘导致GBM发生的关键基因并明确其功能,深入探讨GBM细胞增殖、侵袭及迁移的分子调控机制。方法 收集4例GBM患者的癌组织及癌旁组织进行全转录组测序分析,筛选差异表达的mRNA、微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA),并对其进行生物信息学分析[基因本体(GO)富集分析、京都基因与基因组数据库(KEGG)通路分析和转录本富集分析等]。构建mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA的关联网络,寻找与脑胶质瘤发生、迁移和侵袭密切相关的目标分子。结果 筛选出3 088个癌组织与癌旁组织差异表达的mRNA,其中表达上调1 375个、表达下调1 713个;差异表达的lncRNA 106个,其中表达上调52个、表达下调54个;差异表达的circRNA 82个,其中表达上调32个、表达下调50个;差异表达的miRNA 15个,其中表达上调8个、表达下调7个。差异表达的mRNA转录本富集共得到显著性通路19条,涉及Shh(Sonic hedgehog)信号...     

基于ceRNA网络筛选卵巢癌铂类药物的耐药基因及临床验证

目的 探讨竞争性内源RNA(ceRNA)网络筛选卵巢癌铂类药物的耐药基因并进行临床验证。方法 通过PubMed数据库检索卵巢癌长链非编码RNA(lncRNA),构建卵巢癌铂类耐药内源竞争RNA(ceRNA)调控网络。收集2018年4月至2020年4月在西北妇女儿童医院治疗的64例铂类药物耐药卵巢癌患者为耐药组,另纳入同期64例铂类药物敏感卵巢癌患者为对照组。采用荧光定量PCR法检测患者癌组织中lncRNA表达水平,分析lncRNA对卵巢癌铂类药物耐药和患者预后的判断价值。结果 亚细胞定位分析显示共有6个lncRNA位于细胞质,其中HOX转录反义RNA(HOTAIR)和Y框蛋白2(SOX2)为关键ceRNA。lncRNA HOTAIR与miRNA(miR-519d、miR-148b-3p)及mRNA(XIAP、OCT4)构成ceRNA调控网络,lncRNA SOX2与miRNA(miR-302、miR-429、miR-140-3p)及mRNA(EGFR、ABHD2)构成ceRNA。耐药组癌组织lncRNA HOTAIR和lncRNA SOX2水平分别为2.72±0.58和1.45±0.3...     

脓毒症患者外周血中lncRNA和miRNA表达谱及功能分析

目的本研究利用二代测序(next-generation sequencing, NGS)技术, 对脓毒症患者外周血液进行测序分析, 探讨非编码小RNA(microRNA, miRNA)和长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA)的差异表达及其功能网络。方法本研究采集2021年6月至9月在盐城市第一人民医院招募的重症医学科7例泌尿系统感染的脓毒症患者和3例健康职工志愿者的全血进行NGS分析, 筛选差异表达的mRNA、lncRNA和miRNA, 并对差异表达进行生物信息学分析(差异倍数FC>2, P<0.01)。本研究筛选并下载GEO数据库中4个脓毒症患者基因组数据集, 筛选共同差异表达基因, 对筛选基因进行京都基因组百科全书分析。使用Cytoscape 3.7.0进行构建miRNA-mRNA和IncRNA-miRNA-mRNA网络。结果差异表达mRNAs主要富集于炎症反应相关通路。131个差异基因显著富集在PD-1/PD-L1信号通路, 发现调控PD-1/PD-L1信号通路的TLR2、LAT和CD247等靶基因, 以及参与调控的miRNA(hsa...     

基于外泌体中基因序列构建miRNA-mRNA预测复治肺结核特异的关键基因

目的 基于外泌体所建数据库构建复治肺结核(RTB)特异miRNA-mRNA的调控网络,为RTB在发病机制研究上提供理论支撑。方法 利用初治肺结核(ATB)和RTB患者和健康对照者外周血进行外泌体数据库的建立,并筛选RTB特异的差异表达miRNA和差异表达mRNA,通过miRNet数据库预测差异表达miRNA在RTB特异性下游靶基因并进行富集分析。使用可视化软件Cytoscape绘制miRNA-mRNA调控网络图。结果 ATB中有92个独立差异表达miRNA,RTB中有11个独立差异表达miRNA。ATB中有201个独立差异表达mRNA,RTB中有308个独立差异表达mRNA。对RTB特异性差异表达mRNA与RTB特异性差异表达miRNA预测的靶基因进行综合分析后取交集,共有8个靶向目标基因。PPI网络拓扑分析得出前20个关键基因,包括高表达RTB特异性差异表达基因miRNA的靶基因：PABPC1、EEF1A1、VCP、HNRNPA1;低表达RTB特异性差异表达基因miRNA的靶基因：DDX17、MAPK14、FLNA、TPT1、POLR2E。结论 PABPC1、EEF1A1、VCP、H...     

基于GEO 数据库筛选慢性胰腺炎恶变过程中关键miRNA 和ceRNA 网络构建

目的 筛选慢性胰腺炎（chronic pancreatitis, CP）进展到胰腺癌（pancreatic cancer, PC）过程中发挥潜在作用的 miRNA及其调控网络。方法 从 GEO数据库中下载芯片数据 GSE24279和 GSE25820,筛选出在 CP和 PC中差异表达的 miRNA（differential expression miRNA,DEM）。预测 DEM的靶基因和长链非编码 RNA（long non-coding RNA）,随后进行靶基因富集分析,构建蛋白互作网络（protein-protein interaction, PPI）并筛选出枢纽基因和具有特殊生物学功能的模块,通过综合分析 DEM,枢纽基因和 LncRNA的表达和预后,基于竞争性内源 RNA（competing endogenous RNAs, ceRNA）的理论,构建 miRNA的调控网络。结果 筛选出 16个 DEM,其靶基因参与共生过程,细胞器组织的正调控,细胞质的核周区域和双链 RNA结合。从 PPI网络中,筛选出 17个枢纽基因和 3个模块。综合分析后,将 hsa-miR-221-3p,hsa-miR-222-3p,hsa-miR-210-3p及 RNPS1,MGRN1作为 CP进展为 PC中关键节点。 41个 LncRNA结合关键 DEM,其中 MIAT,DANT2,TTN-AS1,PAXIP1-AS2和 LINC00473具有预后价值。综合以上结果,构建出包含 3个 DEM,2个基因和 5个 LncRNA的 ceRNA调控网络。结论 研究采用的整合分析方法有助于揭示 CP恶变的机制,构建的 LncRNA-miRNA-基因调控网络,为预测和治疗由 CP进展为 PC的患者提供了新的生物学靶点。     

基于TCGA数据库筛选微小RNA（miRNA）用于原发性乳腺癌早期诊断的生物信息学分析

目的　基于肿瘤基因图谱（the cancer genome atlas,TCGA）数据库筛选微小RNA（miRNA）用于原发性乳腺癌的早期诊断。方法　从TCGA上下载原发性乳腺癌miRNA表达数据,将癌症组与正常组比较获得差异表达miRNA。用miRwalk2.0软件分析差异miRNA的靶基因。在c-Bioportal数据库中筛选出原发性乳腺癌突变发生率大于5%的突变基因。分析差异miRNA作用的靶基因与乳腺癌高频突变基因之间的关系,得到备选miRNA,将备选miRNA与乳腺癌前20 名差异表达的miRNA求交集,得到目标miRNA,将目标miRNA做受试者工作曲线（ROC曲线）分析。结果　TCGA数据包含原发性乳腺癌组织1 075例,正常对照乳腺组织95例,共有1 870条miRNA的表达数据。共得到差异表达显著miRNA 129个（P＜0.05）,其中乳腺癌组织中表达升高至3倍以上的miRNA 90个,下调至1/3的miRNA 39个,预测到相对应18 413个靶基因,筛选出原发性乳腺癌突变基因12个。18 413个靶基因中包含12个高频基因,此12个基因是差异miRNA的靶基因同时也是高频基因,故将此12个基因对应的63个miRNA作为备选miRNA。将备选miRNA与乳腺癌前20 名差异表达的miRNA求交集得到目标miRNA 6个:hsa-mir-4732,hsa-miR-486,hsa-miR-592,hsa-miR-449b,hsa-miR-187和hsa-miR-196a,将这 6个miRNA构建ROC曲线（P＜0.05）,预测其作为肿瘤标志物的诊断能力。结论　基于TCGA数据库的生物信息学方法可简便而可靠地筛选目标miRNA进行后续研究,有较高的参考价值。     

基于生物信息学分析的卵巢癌微小RNA调控网络的初步构建

目的在生物信息学分析基础上初步构建卵巢癌微小RNA(miRNA)及长链非编码RNA(lncRNA)调控网络,探讨miRNA在卵巢癌细胞中的分子调控机制。方法通过miRwalk 2.0及HMDD v2.0精准查询与卵巢癌相关且功能明确的miRNA,根据miRwalk 2.0软件出现频次进行筛选,明确其对应靶基因表达情况。在lncRNA疾病数据库中查询与卵巢癌相关的lncRNA,运用starBase v2.0对所得到的miRNA和lncRNA进行综合分析,筛选出与上述miRNA相互作用的且与卵巢癌相关的lncRNA。通过Cytoscape软件绘制miRNA在卵巢癌中的分子调控网络。结果 hsa-let-7a、hsa-mir-21、hsa-miR-16、hsa-mir-17、hsa-mir-19b、hsa-mir-29a、hsa-mir-92a是介导卵巢癌调控的高频miRNA,成功获取了有关miRNA在卵巢癌中的分子调控网络;初步明确了高频miRNA。lncRNA与miRNA匹配分析发现,lncRNA X(染色体)失活特异性转录物(XIST)作为核心调控因子与高频miRNA相互作用介导卵巢癌基因调控。结论利用生物信息学分析技术成功描绘了一张与卵巢癌相关的miRNA分子调控网络,miRwalk、HMDD、starBase等数据库可有效地用于miRNA与疾病关系的研究。     

miRNA及lncRNA在胃癌中作用机制的研究进展

胃癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,严重威胁着人们的健康,探明胃癌的机制对改善预后十分重要。在胃癌发生发展过程中许多基因的表达及活性发生了改变,其中非编码RNA[包括微小RNA(miRNA)及长链非编码RNA(lncRNA)]在胃癌中发挥了重要作用。miRNA通过参与肿瘤细胞的生长、迁移、侵袭以及凋亡等过程从而调控胃癌进程,血中循环miRNA对胃癌的诊断和治疗具有重要提示作用。lncRNA能够同时在转录和转录后水平参与调控胃癌进程,它不仅能够通过诱导染色质修饰或调控信使RNA(mRNA)稳定性的方式参与胃癌进程,还可作为竞争性内源RNA(ceRNA)与靶基因竞争结合miRNA,进而参与调控胃癌进程。因此,了解miRNA及lncRNA在胃癌中的具体作用机制,有利于我们对胃癌的机制进行深入的理解,同时也可以为胃癌的诊治提供新思路。     

ceRNA与肿瘤

长链非编码RNA(LncRNA)、微小RNA(miRNA)、mRNA及假基因是竞争性内源RNA(ceRNA)理论的重要组成部分。LncRNA和miRNA都属于非编码RNA的范畴,不具备蛋白编码能力,不能翻译为蛋白质。LncRNA是一类转录本长度>200个核苷酸的RNA分子,可在表观遗传、转录或转录后调控等多种方式在生物体内发挥重要作用。MicroRNA长约22个核苷酸,可与靶mRNA 3UTR区互补结合,抑制靶mRNA的翻译或降解mRNA。mRNA具有蛋白编码能力,且大多数mRNA中分布大量的microRNA反应元件(MRE)。假基因拥有与编码基因高度同源的基因序列,与亲代编码基因相同或相似的MREs,但失去了编码蛋白质的能力。LncRNA,mRNA,假基因及miRNA可通过MREs进行相互作用,各类型RNA之间通过竞争MREs构成一个庞大的ceRNA调控网络,在肿瘤的发生发展中发挥重要作用。     

基于TCGA数据库筛选与胃癌预后相关的差异基因

目的 通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃腺癌转录组数据进行分析,找出预后相关的差异表达基因。方法 从TCGA数据库中下载胃腺癌的转录组数据,利用R语言edgeR包筛选出差异基因后,对差异基因进行生存分析。结果 共得到175个差异表达miRNA及201个差异表达mRNA/lncRNA,进一部进行生存分析,以P 0. 05作为统计筛选标准,得到15个miRNA和9个mRNA、8个lncRNA与胃癌的生存时间相关。结论 通过对TCGA数据库中胃腺癌的表达数据进行分析研究,选出与该病预后密切相关的基因,为该病的早期诊断和靶向治疗提供分子层面的参考信息。     

长链非编码竞争性内源RNA在胃癌中的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200个核苷酸并且能够在转录及转录后水平调节蛋白编码基因表达的非编码RNA,参与大量病理、生理过程。长链非编码RNA含有microRNA(miRNA)反应元件,可以和miRNA相互结合,影响目的基因的表达,此类lncRNA称为竞争性内源RNA(ceRNA),这种ceRNA参与胃癌的致病过程,为胃癌的致病机制提供了新的思路,通过阻断lncRNA与其相应位点的结合,也为胃癌的治疗提供新的靶点。     

急性B淋巴细胞白血病的差异microRNA综合调控网络的生物信息学分析北大核心CSCD

目的通过生物信息分析途径,从系统水平揭示参与急性B淋巴细胞白血病（B—ALL）发病的分子机制,为研究提供新的思路。方法从公共数据库GEO中下载B—ALL的microRNA（miRNA）芯片数据,利用QlucoreOmicsExplorer3．0软件筛选差异表达miRNA,再分析得到差异miRNA与靶基因、长链非编码RNA和转录因子各自的调控数据,然后构建以差异miRNA为中心的综合调控网络。另外,功能富集分析有功能的靶基因。结果共筛选出15个差异miRNA,其中7个miRNA表达上调,8个miRNA表达下调。通过差异miRNA为中心的综合调控网络可知,hsa—miR．126和hsa—miR-486—3p调控大量的靶基因,其中hsa．miR-126的靶基因包括MYC基因。hsa—miR．29a、hsa．miR-130a和hsa—miR-181c调控大量的长链非编码RNA,包括XIST。hsa．miR-181a．2、hsa—miR．18ib-2和hsa．miR-663调控大量的转录因子,包括CDX2、YYl等。hsa—miR．126靶基因的通路分析显示富集到Wnt通路。结论通过生物信息学方法分析得出,hsa—miR-29a、hsa．miR-126和hsa—miR-181家族是B．ALL的核心差异miRNA,及其转录因子CDX2、长链非编码RNAXIST和靶基因MYC基因在B．ALL的发生发展中起重要作用,可能为潜在的治疗靶点。     

基于微小核糖核酸-信使核糖核酸调控网络的骨关节炎病变的相关分子机制研究

目的基于miRNA-mRNA调控网络进行生物信息学分析, 探讨骨关节炎病变的相关分子机制。方法从GEO数据库下载人血清样本miRNA表达数据集, 通过R语言limma包获取差异表达miRNA,采用miRwalk 2.0版数据库预测其对应靶基因(mRNA), 并构建miRNA-mRNA调控网络。对靶基因进行功能GO分析和KEGG信号通路分析, 构建靶基因所编码的蛋白质相互作用网络(PPI), 从中筛选出骨关节炎病变的核心基因。结果共筛选出7个差异表达的miRNA(表达均为下调)和900个mRNA, 这些基因主要涉及蛋白结合、DNA结合、转录等生理过程, 参与Cell cycle、p53、Neurotrophin、PI3K-Akt等信号通路。蛋白相互作用分析表明MAPK1、TP53、MAPK14、CCND1、EP300、POLR2E、POLR2F、ABL1、RAC1、SKIV2L2为该调控网络的核心靶基因。结论 OA的发生和发展涉及多个的miRNA、靶基因和作用途径, 而通过构建骨关节炎相关miRNA-mRNA调控网络, 可为找出骨关节炎病的分子机制和今后临床上诊疗提供新的思路。     

基于基因芯片的肾母细胞瘤生物信息学分析

目的:整合并利用生物信息学分析肾母细胞瘤基因表达谱芯片,挖掘肾母细胞瘤发生的关键基因。方法:利用GEO2R在线分析工具对GEO数据库肾母细胞瘤基因芯片数据GSE2712进行差异表达基因筛选,使用R软件对差异表达基因进行火山图绘制,进一步结合DAVID和STRING在线生物信息学工具对差异表达基因进行调控网络分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,使用Cytoscape软件进行Hu b基因筛选。结果:共筛选出肾母细胞瘤差异表达基因955个,其中表达上调基因157个,表达下调基因798个。对差异表达基因进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,利用在线生物信息学工具构建PPI网络,使用Cytoscape软件获取PPI网络中前10位Hub基因,分别是FN1,ALB,VEGFA,KDR,IGF1,PECAM1,FLT1,TEK,FGF1和ANGPT1。结论:应用生物信息学能有效分析基因芯片数据,获取肾母细胞瘤发生的关键基因,为肾母细胞瘤的治疗提供新的思路。     

基于ceRNA调节网络结直肠癌预后关键基因的筛选与分析

目的 本研究利用癌症基因组图谱（TCGA）数据库分别构建结肠癌和直肠癌的lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络,寻找网络中与患者总体生存率相关的基因,为结直肠癌提供新型预后分子标志物。方法 在TCGA数据库分别下载结肠癌和直肠癌的原始转录组测序数据和临床数据,利用R 4.0.4软件的edgeR程序包进行差异基因的分析。根据差异基因靶向调控关系,构建lncRNA-miRNA-mRNA调节网络。利用Cytoscape 3.7.1软件绘制网络调节图。结合患者的临床资料,利用Survival程序包寻找调控网络中与患者总体生存率相关的基因。结果 在结肠癌的ceRNA网络中,共涉及29个miRNA、128个lncRNA和53个mRNA,有9个lncRNA(AC002511.1、AL590483.1、AP004609.1、GAS6-AS1、HOTAIR、ITCH-IT1、KCNQ1OT1、LINC00491、PVT1),4个mRNA(FJX1、SERPINE1、TPM2、ULBP2),4个miRNA(miR-145、miR-193b、miR-216a、miR-375)与患者预后相关（...     

MicroRNAs与冠心病发生发展关系的研究进展

microRNA（miRNA）是一类长约21-25个核苷酸的小分子非编码RNA,是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶加工后生成双链RNA,双链miRNA被引导进入沉默复合体中,一条成熟单链miRNA保留其中,另一条被降解。miRNA分子在3’端非编码区域（3’UTR）与靶基因mRNA分子互补配对后,可以降低mRNA分子的稳定性并使mRNA发生翻译抑制从而影响靶基因的表达调控。miRNA具有集体功能的特点,单一miRNA难以替代。