心血管系统蛋白质组的研究进展

继基因组之后蛋白质组研究已成为当前生物医学研究的热点，检查蛋白质组的变化可深入理解基因组分析不能明确的细胞和分子机制，蛋白质组技术的发展促进了心血管疾病在分子机制上更全面的研究。本文概述了蛋白质组技术及其在心血管系统的研究进展。     

蛋白质组学在脑缺血预适应研究中的应用

蛋白质组是由一个细胞、一个组织或一个机体的基因组所表达的全部相应蛋白质.蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象,从蛋白质整体水平认识生命活动规律的科学,也是定量检测细胞或组织的一个或多个蛋白群或蛋白质组的科学方法.脑缺血预适应是近几十年来神经科学领域的研究热点之一,其神经保护机制与缺血后蛋白表达水平改变有关,因此,蛋白质组学在其机制研究中显得越来越重要.文章主要介绍蛋白质组学的主要技术及其在脑缺血预适应研究中的应用.     

利用大数据研发肝脏疾病的诊断标志物和治疗药物

正2003年,人类基因组计划的完成开启了基因组时代。自此以后,持续的技术进步实现了快速经济地分析大样本患者人群的DNA、RNA、蛋白质及其他生物分子。这些技术产生的数据快速积累使得基于不同人群和环境的多重组学研究的结合成为可能,通过对积累数据的再分析已开始获得重要临床发现。除了基因组和转录组数据集,蛋白质组、代谢组、激酶组、甲基化乙酰化组、脂质组,微生物组、表型组、环境暴露组、元基     

基因芯片研究艾灸大鼠命门穴延缓衰老的抗氧化机制

目的 探讨艾灸大鼠命门穴延缓衰老的分子机制.方法 老年大鼠分为老年组和灸疗组,另设年轻组,用Illumina大鼠全基因组芯片研究其分子机制.结果 老年组与年轻组中涉及氧和活性氧中间产物参与新陈代谢的过程的9条基因下调,经过灸命门穴位治疗后,有8条基因在灸疗组与年轻组中正常表达.结论 抗氧化可能是灸命门穴延缓老年大鼠衰老的机制之一.     

免疫蛋白质组学技术在血吸虫病研究中的应用

蛋白质组学技术与现代免疫学相结合形成了一门新兴交叉学科——免疫蛋白质组学(immunoproteomics).日本血吸虫和曼氏血吸虫的基因组、转录组研究积累了大量生物信息资料,使血吸虫免疫蛋白质组研究成为可能.该文对近几年来免疫蛋白组学技术在血吸虫病研究中的应用进行综述.     

血吸虫体被被膜蛋白质组研究进展

血吸虫成虫最外层的体被被膜由两层双分子层组成,可能涉及血吸虫营养、免疫逃避与免疫调节、排泄、渗透压调节和信号转导等重要功能,因而血吸虫体被被膜蛋白成为当今研究的热点.随着蛋白质组学研究技术的发展和应用以及血吸虫基因组计划的实施,血吸虫体被被膜蛋白质组研究取得了重要的进展.该文就近年来血吸虫被膜蛋白研究进展作一综述.     

肿瘤线粒体蛋白质组学研究进展

在癌症的发生发展过程中,涉及很多蛋白质的表达和表达水平的变化以及蛋白质生物活性的变化.利用蛋白质组学技术来分析肿瘤,并建立各种肿瘤的蛋白质组的数据库和分析软件,以及在肿瘤中的应用的分支学科,称为"肿瘤蛋白质组学".它将为获得诊断、预测肿瘤的分子标志、治疗、药物筛选和分析肿瘤的发生发展机制提供重要的科学依据.肿瘤是多因素多步骤发展的产物,至今已有多项研究结果表明,线粒体蛋白质组的改变与多种肿瘤有明确的相关性.深入研究肿瘤线粒体蛋白质组与肿瘤的关系,对阐明细胞的癌变机制以及肿瘤的早期诊断及治疗具有重要的意义.     

酵母双杂交系统在痘病毒与宿主相互作用中的研究进展

痘病毒全基因组序列分析为痘病毒的研究提供了丰富的信息。近年来,一些痘病毒编码的蛋白之间,以及病毒蛋白与宿主蛋白之间的相互作用的研究证明其在痘病毒复制、感染、致病及传播过程中起关键作用,因此受到了广泛的关注。酵母双杂交系统是研究蛋白质之间相互作用的重要工具,该技术可以发现新蛋白之间的相互作用,确定蛋白相互作用的区域,从而为研究各蛋白质的生物学功能以及蛋白质之间相互作用的分子机制奠定基础。本文综述了酵母双杂交系统在痘病毒蛋白之间及病毒-宿主相互作用的研究现状及优缺点。     

生物信息学在寄生虫学中的应用

生物信息学是建立在牛物学和信息科学基础上的一门新兴学科,基因组信息学、蛋白质的结构模拟以及药物设计是牛物信息学的三个组成部分.随着基冈绀学的发展,寄生虫病的研究进入分子水半,彤成r分子寄生虫学这一门新兴学科.随着寄生虫的基因和蛋白质数据的激增,生物信息学在寄生虫学研究中的重要性越来越突出了.     

蛋白质组技术在大肠癌研究中的应用进展

除二维凝胶电泳和质谱分析外 ,最近激光捕获显微切割技术电泳、靶蛋白芯片等新技术被应用于大肠癌蛋白质组的研究。继初期建立蛋白质组数据库后 ,大肠癌蛋白质组研究更加深入 :在大肠粘膜恶性转化的分子机制研究中 ,发现在转化过程中和转化后有多种多肽或蛋白质的变化 ,不同的基因如 p5 3基因和APC基因突变引起不同的细胞内变化 ;在放化疗机制方面的研究初步表明肿瘤化放疗后的改变涉及凋亡、信号传导等多种机制 ;在标志物的的研究方面发现了 3个较特异的标志物———S10 0A8、S10 0A9、S10 0A11。     

蛋白质组技术在大肠癌研究中的应用进展

除二维凝胶电泳和质谱分析外，最近激光捕获显微切割技术电泳、靶蛋白芯片等新技术被应用于大肠癌蛋白质组的研究。继初期建立蛋白质组数据库后，大肠癌蛋白质组研究更加深入：在大肠粘膜恶性转化的分子机制研究中，发现在转化过程中和转化后有多种多肽或蛋白质的变化，不同的基因如p53基因和APC基因突变引起不同的细胞内变化；在放化疗机制方面的研究初步表明肿瘤化放疗后的改变涉及凋亡、信号传导等多种机制；在标志物的的研究方面发现了3个较特异的标志物——S100A8、S100A9、S100A11。     

HSD17B10、ALDH9A1、ALDH2、PRDX4在脑膜瘤蛋白质组学中的上调表达

目的探讨人脑膜瘤的发病机制。方法以人脑膜瘤组织和配对瘤旁正常蛛网膜组织为研究材料,采用蛋白质组学技术筛选脑膜瘤相关蛋白质。应用GO进行数据分析。结果鉴定出4个具有氧化还原酶活性的上调表达蛋白。结论该研究揭示了脑膜瘤蛋白质组中的4个具有氧化还原酶活性的上调表达蛋白,为进一步研究脑膜瘤的发生和发展分子机制提供了初步数据。     

蛋白质组学技术与针灸防治胃溃疡效应

蛋白质组学是一门在蛋白质水平认识生命机制的学科.近年来,应用蛋白质组学技术开展针灸防治胃溃疡效应的研究日益受到重视.本文综述了目前针灸防治胃溃疡的蛋白质组学研究的相关进展,并就研究中存在的相关问题进行分析,认为利用蛋白质组技术研究针灸机制和调节效应是未来针灸研究的重要突破口和发展方向.     

应用比较基因组杂交技术研究淋巴瘤细胞遗传学异常与临床的关系

淋巴瘤是起源于淋巴组织的常见恶性肿瘤，在我国淋巴瘤发病率约为2／10万。淋巴瘤是一组异质性肿瘤性疾病，生物学行为极其复杂。虽然国内外对淋巴瘤的分子细胞遗传学进行了很多研究，但对淋巴瘤的发病机制和复杂的生物学行为尚难以阐明。我们采用比较基因组杂交技术（CGH）从全基因组水平对淋巴瘤遗传学异常进行检测，探讨淋巴瘤的分子细胞遗传学异常及其发生发展以及疗效等临床特征的关系。     

CCl4大鼠肝纤维化形成与消减过程中肝组织蛋白质组的动态变化及扶正化瘀方的干预作用

目的:通过大鼠纤维化肝组织高亲水性蛋白质分子差异展示及扶正化瘀方干预作用,寻找与扶正化瘀方治疗肝纤维化相关的蛋白质分子.方法:通过皮下注射大鼠CCl4,分别持续4、8、12周,对大鼠肝纤维化过程进行动态观察,并在不同时期进行扶正化瘀方干预,治疗从第12周始至16周止.采用蛋白质分步抽提方法,提取肝组织蛋白质,分别进行二维聚丙烯酰胺凝胶电泳(2-DE)分离、凝胶银染,显示各组蛋白质分子的差异表达的蛋白质分子.结果:在各组银染凝胶图谱上,可辨识的蛋白质斑点达1 000～1 400个左右,蛋白质表达中除有肝组织看家蛋白质,模型组也有特异蛋白质表达,且在不同时期蛋白质分子表达也有差异,特异表达蛋白质分子为100至300多个不等,在不同阶段表达是不相同的,经质谱鉴定确定了有几类功能不同的蛋白质分子.结论:扶正化瘀方抗肝纤维化作用机制是多方面的,其干预作用与多种蛋白质分子相关.     

布氏菌分子生物学研究现况(续前)

5 布氏菌蛋白质组 所谓蛋白质组（proteome）是指在一个特定的时间和确定的环境条件下，一种生物表达一套完整蛋白、结构、功能及它们之间的联系等。蛋白质组的研究又是后基因组（或称基因组后）工作。一种生物的基因组工作完成后，必须考虑这些基因组功能及其所表达产物蛋白质组的情况。     

大黄抑制鼠疫耶尔森菌的基因芯片检测

目的 研究基因组芯片检测大黄抑制鼠疫耶尔森菌分子机制的方法 .方法 使用的鼠疫耶尔森菌全基因组芯片包含4005条鼠疫耶尔森菌基囚.应用液体稀释法测定大黄对鼠疫耶尔森菌的最小抑菌浓度(MIC),基因芯片表达谱实验中,大黄作用鼠疫耶尔森菌的浓度为10×MIC,作用时间为30 min,提取并纯化鼠疫耶尔森菌总RNA,反转录合成cDNA,用Cy3,Cy5染料标记后,与鼠疫耶尔森菌全基因组芯片杂交,通过芯片扫描仪获得表达谱分析结果 .应用实时定量PCR技术对芯片结果 进行验证.结果 大黄对鼠疫耶尔森菌的MIC为0.02500 kg/L.获得了大黄作用鼠疫耶尔森菌的基因芯片表达谱.大黄作用鼠疫菌的明显差异表达基凶共有498个,上渊基闪358个,下凋基因140个.结论 应用鼠疫耶尔森菌全基因组DNA芯片可以进行大黄抑制鼠疫耶尔森菌的分子作用机制研究.     

蛋白质组学技术在呼吸病学研究中的应用

随着人类基因组草图的绘制完成，预示着后基因组时代的到来。蛋白组学渐成为医学研究的热点。澳大利亚学者Wilkins等在1994年首度提出了蛋白质组(proteomics)的概念，指一个基因、一个细胞或组织所表达的全部蛋白质成分，从不同时间和空间上探索蛋白质的作用模式、功能机制、调节控制及蛋白质组间相互作用。人类基因组测序结果表明仅需30000～35000个活性基因便可维持人类正常的生理功能，但从基因表达的mRNA到最终的蛋白质，受蛋白质翻译的调控、糖基化、磷酸化等诸多因素的影响，使得最终产生的蛋白质数目远超过活性基因的数目，因此采用蛋白组学的方法研究比较蛋白质的结构和功能意义深远。     

蛋白质组学与中医药研究

蛋白质组学研究突破了基因的局限性,能够揭示生命和疾病的最终机制.就蛋白质组学的研究技术及其促进中医药发展的可行性进行介绍,并回顾了近年来应用蛋白质组技术对中医药所作的研究.     

弥漫性间质性肺疾病蛋白组学研究

蛋白质组学是指对蛋白质组整体水平进行研究.与传统研究单一蛋白质变化的方法 发相比,能获得整体蛋白质水平表达差异.弥漫性间质性肺疾病发病机制复杂,涉及广泛的细胞因子网络,以往大量研究集中于单个细胞因子水平,蛋白质组学技术以其高新系统量及整体水平比较差异优势成为新的研究方向.本文就蛋白质组学技术在肺间质疾病的研究应用进行综述.