致突变物与遗传疾病

人类基因组（指染色体上蕴藏的全部基因）的遗传信息影响着人类的生殖、发育、衰老和疾病，尤其是生殖细胞的基因、染色体突变带来的遗传疾病，是遗传和环境因素共同作用的结果，具有家族性和遗传性特征，在现代人类疾病谱中占有重要的地位。     

DNA损伤修复基因与遗传易感性

美国国家环境卫生科学研究所在人类基因组计划 (ＨＧＰ)顺利进展后 ,于 1997年底启动了“环境反应基因及其对人类健康的影响”的研究项目 ,即环境基因组计划 (ＥＧＰ) ,旨在阐明基因和环境对疾病的影响和它们之间的相互作用。该计划列举了11大类共 76种再测序的环境应答基因 ,ＤＮＡ修复基因被列为第一位 ,其中 2 1种ＤＮＡ修复酶基因被列为重点研究对象。人类基因组与其他物种的基因组的功能一样均是编码信息从而保护遗传信息的完整性[1] 。ＤＮＡ修复酶始终监视染色体并校正癌基因和有细胞毒性的化学物所致的核苷酸残基的破坏 ,若没有ＤＮ…     

组胺脱羧酶基因多态性与糖尿病和冠心病关系

人类基因组是一个高度变异的体系，其计划的进展和实旌标志着基因组多态性研究及其应用进入一个新的阶段。组胺脱羧酶是催化组氨酸脱羧生成组胺的关键酶，定位在第15号染色体的长臂2区1带至2区2带（15q21-q22），其DNA完整序列是由单拷贝基因编码，编码区由12个外显子构成。它能增加毛细血管的通透性，刺激胃蛋白酶及胃酸的分泌，其催化产物组胺与过敏反应及支气管哮喘有关。     

英科学家发现裂腭基因

据海外媒体报道,英国伦敦帝国学院的研究人员发现裂腭基因,这一发现将有助于改善对这种先天性疾病的诊断、治疗及发现先天性与偶发性裂腭之间的关系。研究人员利用人类基因组的资料,在X染色体上找到了这种TBS22基因。     

基因多态性与肥胖发生的关系

肥胖是一种发生于多基因、多因素基础上的常见代谢失调症。人类肥胖相关基因有300多个,除Y以外的所有染色体均分布有肥胖相关基因,但与人类肥胖密切相关的基因多分布在2、5、10、11和20号染色体上。我们对其中主要基因的研究现状作一综述。     

汉族人白癜风易感基因被“捕获”

安徽医科大学皮肤病研究所与襄樊铁路中心医院白癜风诊疗中心、国家人类基因组南方研究中心的科研人员，经过3年艰苦努力，成功地将中国汉族人白癜风易感基因定位于4号染色体长臂的4q13-q21位点上，这是世界上第一次确定汉族人白癜风易感基因位点。     

看眼脸,知不孕

<正>年轻妇女的不孕症状可能与染色体基因缺陷有关,此基因缺陷还会造成眼睑异常。这个遗传学最新研究成果是由意大利、法国、比利时和美国等多国医师组成的研究小组发布     

基因保存技术研究进展

生命的奥秘存在于DNA分子的4种单核苷酸的排列顺序中。人类基因组计划的研究结果告诉我们：人类基因组由30亿个单核苷酸组成，存在于23对（46条）染色体中。人类许多疾病的产生，不仅受到内部基因的控制，还受到外部环境条件的制约。不同基因型的个体在不同的环境条件下可以产生不同的表现型，即使同一基因型的个体，在不同环境条件下，也可以产生不同的表现型。也就是说，疾病是基因与环境共同作用的结果。随着基因检测和基因治疗的迅速发展，儿童基因保存的概念应运而生。利用保存的婴儿基因，通过对发病后的基因位点与婴儿原始状态下的位点进行比较分析，能正确地判断发生疾病的根源，即能精确地确定与该疾病密切相关的基因突变，为基因治疗提供最直接的参考。     

SOX3基因的功能及其突变

正Sinclair等人在1990年首次发现了性别决定基因SRY(Sex Determining Region Y gene),它在人类性别决定上起着关键作用。该基因位于Y染色体短臂拟常染色质区,其开放阅读框包含1个外显子,可编码204个氨基酸的蛋白质。在此之后许多学者以人SRY基因片段为探针对其他物种的基因组文库及cDNA     

霍乱弧菌2个染色体的DNA序列

John F.Heideberg等以全基因组随机测序法测定了革兰氏阴性的 γ-蛋白细菌埃尔托霍乱弧菌 N16 96 1的基因序列 ,其完整基因组序列有 40 33 46 0个碱基对。该基因组包括 2个大小不同的环状染色体 (大染色体和小染色体 ) ,分别有 296 1146和 10 72 314个碱基对 ,这些碱基对共同编码 3 885个开放读框 (见表 1)。大多数细胞功能所必需的 (如 DNA复制、转录、翻译和细胞壁生物合成 )和致病性(如毒素、表面抗原和粘附素 )基因位于大染色体上。但小染色体包含的假定基因(5 9%)比大染色体 (4 2 %)多 ,同时也含有更多的起源基因 ,这与 γ-蛋白细菌…     

基于癌症基因组图谱的体细胞拷贝数变异与基因分布相关性分析

目的 探索拷贝数变异(CNA)区域中的非中性选择,分析肿瘤基因组中CNA与基因密度之间的关系。方法 从ArrayMap公共数据库中收集注释过的肿瘤基因组数据,对来自16 264个癌症样本,代表62个肿瘤类型的体细胞CNA进行分析,使用Spearman相关系数评估小片段拷贝数丢失和染色体断点与基因富集区的相关性。结果 从基因数量和编码序列占比方面来看,在基因密集的区域中,小片段的CNA显著富集,Spearman相关系数R=0.342,P<0.001。与CNA相关的DNA断裂位点也与富含基因的区域呈正相关,平均Spearman相关系数R=0.460,P<0.001。相反,染色体臂级CNA的频率与各个染色体臂上的总基因数呈负相关,Spearman相关系数R=-0.449,P=0.004,并且在各种肿瘤类型的数据中均观察到类似的结果。结论 通过大数据得到的肿瘤基因组图谱揭示了小片段CNA与基因密度之间存在正相关,而染色体臂级的CNA与其基因数则呈现负相关性。这些结果体现了CNA在肿瘤基因组进化过程中的非中性选择。     

2型糖尿病易感基因被找到

由中国医科院基础医学研究所方福德教授领衔,北京协和医院和国家人类基因组南北方研究中心共同参与的“中国人群2型糖尿病易感基因定位及血糖调节相关基因的研究”,通过对60个2型糖尿病家系、四百多名成员进行除性染色体之外的基因组扫描分析,在1号染色体上精确定位了5个易感基因位点,并从其中的2个位点上筛查出PRKCZ基因和UTS2基因,初步被认定为可能是2型糖尿病的候选易感基因。该成果不久前获得中     

基因治疗问题、发展与思考

科技的发展受社会的影响,科技的发展无疑推动着社会的前进,但社会的需要是科技诞生的最根本、最持久的原动力。恩格斯曾说过:“社会一旦有技术上的需要,这种需要就会比十所大学更能把科学推向前进。”社会需求不仅历史地推动了科技时代的变迁,还造就了某一具体学科或技术的出现。自从人类基因组草图的绘制完成后,基因治疗已成为世界上最活跃的研究领域,1990年Anderson等[1]首次成功地进行基因治疗的临床试验以来,迄今已完成了500多例基因治疗临床试验,但其结果尚不尽人意。如今脍炙人口的基因治疗正面临着“警惕科学发明双刃性”的考验。1基因治疗进展现代生物技术与人最直接相关的领域就是人类基因组计划。1990年,美国正式启动为期15年的“人类基因组计划”,投资30亿美元其目标就是测定人类30亿个碱基对的全部DNA序列,进而破译人类3~10万个基因的遗传信息。人类基因组的图谱是人类的真谛,所有疾病的发生都与基因有着直接或间接的关系,即人类所有的疾病都可归结为基因病。基因图谱破译后,某些观点声称,医生看病只要查看基因信息即可,而治疗就是基因的更换,即所谓的基因治疗。基因治疗药物将对医药工业产生深远的影响,它将重新界定药物使用。最初...     

论遗传病致病基因克隆的策略和路线

本世纪九十年代以来,科学家对致病基因的克隆及其功能的研究已进入鼎盛时期,由美国国立卫生研究院和能源部出资进行的,开始于1990年10月1日,预计耗资30亿美元,历时15年完成的人类基因组项目,至1993年底取得的里程碑似的重大成就有两个方面,1、科学家们已初步完成了第一张人体单组染色体即1—22号染色体加X、Y染色体的略图;2、1993年科学家克隆了9种遗传病的基因,从而使1986年以来克     

霍乱弧菌O1血清群El Tor产毒株重组特征分析

目的分析霍乱弧菌O1血清群El Tor产毒株基因组的重组特征。方法在美国国立生物技术信息中心数据库中,选取分离时间从1937—2015年的292株霍乱弧菌O1血清群El Tor菌株完成图序列或草图序列,以菌株N16961的基因组序列为参照,使用snippy软件获得菌株的全基因组比对信息,利用ClonalFrameML软件对数据进行重组分析,比较大小染色体间重组数目及重组区域总长度的差异,以及不同分离地区菌株的基因组重组片段数目和总长度的差异。使用KOBAS分析工具对重组热点基因进行基因本体富集分析。结果292株霍乱弧菌菌株中,发生基因重组163株(55.8%);其中,归一化处理的小染色体重组片段数目M(P25,P75)为4.7×10^-(69.3×10^-7,2.0×10^-5),大于大染色体[2.4×10^-(63.4×10^-7,5.7×10^-6)](P<0.001);小染色体重组区域占小染色体长度的比例M(P25,P75)7.1%×10^-(53.7%×10^-6,4.8%×10^-4),大于大染色体[2.2%×10^-(52.4%×10^-6,8.4%×10^-5)](P<0.001)。分离自非洲、亚洲、欧洲、北美洲和南美洲的菌株重组片段数目M(P25,P75)分别为23(1.0,33.0)、1.0(0.0,34.0)、6.0(2.0,13.0)、0.0(0.0,1.0)和29.5(6.8,56.8)(P<0.001);分离自各大洲的菌株重组区域总长度M(P25,P75)分别为233.0(4.0,461.0)、11.0(0.0,695.5)、56.0(4.0,111.0)、0.0(0.0,9.0)和347.5(132.8,1323.5)bp(P<0.001)。富集分析结果显示,62个重组热点编码基因的功能主要集中在趋化、趋性、对外界刺激的反应、受体活性和分子转导活性。结论霍乱弧菌El Tor大小染色体的重组片段数目及区域长度存在差别,不同大洲菌株重组片段数目及重组区域总长度不同。     

砷化物对人类金属硫蛋白-3cDNA基因表达的影响

目的 探讨砷化物对人类正常肝细胞金属硫蛋白(Metallothionein,MD-3cDNA基因表达的影响。方法 利用SMART方法克隆cDNA基因,生物信息学分析克隆基因的同源性、染色体定位、基因结构和对该基因编码蛋白质进行分析并对该蛋白质进行跨膜信息分析,基因芯片方法检测染砷L-02细胞MT-3基因的表达。结果 成功克隆MT-3cDNA基因,经生物信息学分析可知,该基因定位在人16号染色体16q13区段,跨膜信息分析发现MT-3基因编码蛋白质可以穿出生物膜,基因芯片结果证实染砷的人正常肝L-02细胞在染砷早期MT-3基因表达增高。结论 该研究发现人类MT-3基因是砷化物作用的一个相关基因,早期参与了砷代谢解毒。     

应用不同技术检测白血病患者融合基因的比较

<正>慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)是一种起源于造血干细胞的恶性血液病,是迄今发现的第一种与染色体异常直接相关的人类恶性肿瘤。CML患者具有特征性的Ph染色体,该染色体是9号和22号染色体相互易位形成的,其形成的BCR-ABL融合基因编码产生的Bcr-Abl融合蛋白与正常abl蛋白相比,具有较强的酪氨酸激酶活性,从而促进细胞分裂、降低细胞对凋亡信号的反应、延长细胞存活,导致白血病的发生[1,2]。     

云南省四株霍乱弧菌全基因组测序分析

目的选取云南省具有代表性的霍乱弧菌四株,进行了全基因组测序分析,为云南省霍乱弧菌的基因组学研究提供资料。方法根据对云南省历年霍乱菌株资料的分析,结合菌株特征和脉冲场凝胶电泳带型特点等,选取了四株代表性霍乱弧菌,采用WGS Illumina Hi Seq2500进行paired-end测序。对测序结果进行拼接、组装以及注释等。结果基因预测和功能注释结果显示,所有四株霍乱弧菌(YN2011004、YN98296、YN97083和YN89004)均显示携带有2个染色体,同时YN2011004,YN98296和YN89004各自携带有一个质粒。YN2011004的1号染色体具有2 727个基因,2号染色体具有958个基因;YN98296 1号染色体具有2 825个基因,2号染色体具有969个基因;YN97083 1号染色体具有1 948个基因,2号染色体具有955个基因;YN89004 1号染色体具有2 653个基因,2号染色体具有907个基因。所有预测的基因功能主要涉及细菌生理代谢、信号储存和处理以及信号转导等各个方面。结论云南省的四株代表性霍乱菌株均具有两个染色体,其中三个菌株还各自含有1个质粒。     

079 基因多态性在环境卫生学中的应用

随着第一张人类基因组序列图的绘制成功,人们对基因研究的兴趣更加浓厚,而且越来越认同基因是健康的影响因素之一.在大量的研究中人们发现了基因多态性现象,即处于相同环境中的人群,其发病的危险性在不同个体间可以存在很大差异,这种差异是由遗传因素决定的.同时,基因研究方法已逐渐融入到公共卫生研究中,主要表现在遗传学研究方法的运用和分子流行病学.本文就外源性化合物生物转化酶及其多态性,基因-环境相互作用研究实例,以及基因多态性在环境卫生学研究中的价值作一简要编译.     

解读诺贝尔医学奖成果RNA干扰机制和医学应用

年轻的获奖者2006年10月2日,现年47岁的Andrew Z.Fire和45岁的Craig C.Mello由于在RNAi(RNAinterference,RNAi)及基因沉默现象研究领域的杰出贡献而今年诺贝尔医学奖获得者,且获奖日期距其研究发表仅8年时间,获奖速度之快亦令人叹为观止。颁奖委员会评价:“他们发现了控制基因信息流通的基本机制,解释了困惑这一研究者们许久的难题。”RNAi的殊荣2001年,随着人类基因组测序的完成,针对其它多种生物的基因组测序计划也相继开展起来。在未来的一段时间内,科学界将不会出现比人类基因组测序更瞩目的技术。有人将人类基因组测序称为“21…