长链非编码RNA RAB11B-AS1在膀胱癌组织中的表达及与预后的关系

 目的 探讨长链非编码RNA RAB11B-AS1（lncRNA RAB11B-AS1）在膀胱癌组织中的表达及其与临床病理参数和预后的关系。方法 收集2012年10月—2014年2月于云南省第二人民医院泌尿外科手术切除的83例膀胱癌组织及相应癌旁正常组织。采用qRT-PCR检测lncRNA RAB11B-AS1的表达并分析其与患者临床病理特征的关系,采用Cox回归分析lncRNA RAB11B-AS1表达水平与膀胱癌患者预后的关系。结果 lncRNA RAB11B-AS1在膀胱癌组织中的表达水平低于癌旁正常组织（1.17±0.32 vs 2.09±0.74,t=10.396,P<0.001）;膀胱癌癌组织中lncRNA RAB11B-AS1的表达水平与患者TNM分期、组织学分级和淋巴结是否转移有关（P<0.05）。lncRNA RAB11B-AS1高表达患者5年总生存率高于低表达患者（62.22% vs 26.32%,χ²=13.420,P<0.001）;多因素Cox回归分析显示,lncRNA RAB11B-AS1低表达是影响膀胱癌患者预后的独立危险因素（HR=1.126,95%CI：1.058~1.200,P<0.001）。结论 lncRNA RAB11B-AS1在膀胱癌组织中低表达,且低表达患者预后较差。     

YEATS2在肝细胞癌中的表达及临床意义

目的 探讨YEATS2在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）中的表达及其与预后的关系。方法 收集我院2010年1月至2014年1月112例手术切除的HCC癌组织和癌旁组织石蜡标本，采用Real-time PCR检测HCC癌组织及癌旁组织中YEATS2 mRNA的表达，Western blot和免疫组化染色检测YEATS2蛋白水平，免疫荧光染色检测YEATS2在HCC癌组织中的表达定位，并分析YEATS2与HCC患者临床病理特征和预后的关系，同时采用TCGA数据库数据验证。结果 Real-time PCR结果显示，YEATS2 mRNA在HCC癌组织中的表达较癌旁组织上调（P<0.001）；Western blot检测结果显示，YEATS2在约66.67%（12/18）的HCC癌组织表达升高；免疫组化染色分析发现，约71.43%（80/112）的HCC患者中YEATS2表达上调，其表达与TNM分期明显相关（P<0.001）；YEATS2主要在HCC癌组织细胞核中表达；多因素分析结果显示YEATS2高表达是患者不良预后的独立危险因素（HR=2.204，95%CI：1.388~3.500，P=0.001）。TCGA中HCC队列分析也表明YEATS2高表达的患者OS更差（HR=1.751，95%CI:1.107~2.770，P=0.017）。 结论 YEATS2在HCC组织中高表达，且与患者不良预后相关。     

基于数据挖掘分析GOLM1基因在前列腺癌中的表达及其临床意义

目的 探讨GOLM1基因在前列腺癌中的表达及临床意义。方法 利用Oncomine数据库分析GOLM1基因在前列腺癌与其癌旁正常组织组织中的表达情况，从TCGA数据库中下载相关的RNA-Seq数据和临床资料，分析GOLM1基因表达与患者临床病理学特征及预后的关系。结果 Oncomine及TCGA数据库分析结果显示，GOLM1基因在前列腺癌组织中的表达显著高于癌旁正常组织（P<0.001）。相关分析结果显示，TCGA数据库中547例前列腺癌患者GOLM1 mRNA表达水平与其年龄、临床T分期、病理学T分期及Gleason评分的相关性不大；低表达GOLM1基因的患者总生存期显著较高表达者长（HR=4.50，95%CI：3.77~5.37，P=0.038）；ROC曲线分析显示最佳截断点为8.889，灵敏度为80.5%，特异度为80.8%，ROC曲线下面积为0.862（95%CI：0.813~0.912）。结论 GOLM1基因在前列腺癌组织中高表达，且与患者不良预后相关，可作为前列腺癌较好的诊断标志物。     

人mcl1不同亚型在结肠癌组织中表达变化的临床意义

目的 探讨人mcl1基因不同亚型在结肠癌组织中差异表达的临床意义。方法 采用RT-PCR和Western blot分别检测正常结肠组织、结肠腺瘤、结肠腺癌组织以及相应的癌旁组织各20例中mcl1基因三种mRNA剪接异构体和三种蛋白亚型的表达水平,进而分析这些亚型表达差异与肿瘤临床病理特征之间的相关性。结果 mcl1基因亚型1在结肠肿瘤组织及相应旁组织中的mRNA和蛋白质水平表达均高于正常组（P=0.009, P=0.022）,且腺癌组中的mRNA和蛋白质水平表达亦高于腺瘤组（P=0.004, P=0.034）。亚型2在结肠肿瘤组织及对应旁组织中的mRNA和蛋白质水平表达均高于正常组（P=0.002, P=0.011）,且腺癌组中的mRNA和蛋白质水平表达亦高于腺瘤组（P<0.001, P=0.007）。亚型3在结肠肿瘤组织及对应旁组织中的mRNA和蛋白质水平表达均高于正常组（P=0.027, P=0.045）,但肿瘤组与相应旁组织之间以及腺癌组与腺瘤组之间的比较差异均无统计学意义。结论 研究表明mcl1亚型1和亚型2对结肠癌肿瘤恶性程度呈正相关,可以作为临床评估结肠癌恶性程度有效的诊断指标之一。而亚型3可以作为肿瘤早期诊断的标志物,但其表达水平与恶性程度无明显相关性。     

Clp蛋白酶复合体亚基ClpX在肝细胞癌中的表达及意义

目的 探讨Clp蛋白酶复合体的ATP依赖性亚基（ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit，ClpX）在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC） 组织中的表达及临床意义。方法 收集2013年1月至2014年12月于空军军医大学西京医院肝胆外科行根治性肝切除术的166例HCC患者癌组织及癌旁正常组织。采用免疫组化法检测HCC癌组织及相应癌旁正常组织中ClpX的表达，并分析ClpX蛋白表达与HCC患者临床病理特征及预后关系。在HCC癌细胞株SNU739中分别干涉或过表达ClpX后，采用MTS法检测细胞增殖能力。结果 ClpX在HCC癌组织中的表达水平低于癌旁正常组织（P＜0.001），ClpX高表达的HCC患者总生存期优于低表达患者（P=0.009）。ClpX表达水平与TNM分期相关（P=0.008），ClpX低表达是影响HCC患者总生存期的独立危险因素（P=0.046）。干涉ClpX表达后，SNU739细胞增殖能力较对照组增强（P＜0.001）；而过表达ClpX后，细胞增殖能力降低（P＜0.001）。结论 ClpX在HCC癌组织中呈低表达，且低表达患者预后更差；下调ClpX可促进细胞增殖，ClpX可作为HCC患者潜在的预后标志物。     

共刺激因子B7-H1蛋白在胆囊癌中的表达及与预后的关系

目的 观察B7-H1蛋白在胆囊癌中的表达;探讨其在胆囊癌的发生发展中的作用及其与预后的关系。方法 用免疫组织化学SP法检测B7-H1蛋白在60例胆囊癌组织中的表达;另取癌旁非肿瘤组织20例及胆囊腺瘤性息肉20例作为对照组。结果 胆囊癌组中B7-H1蛋白的表达明显高于癌旁非肿瘤组织组（P=0.003）和胆囊腺瘤性息肉组（P=0.035）;B7-H1蛋白在Nevin（Ⅳ+Ⅴ）期、TNM（Ⅲ+Ⅳ）期、有淋巴结转移组中的表达明显高于Nevin（Ⅰ+Ⅱ+Ⅲ）期（P=0.041）、TNM（Ⅰ+Ⅱ）期（P=0.049）、无淋巴结转移组（P=0.000）;与性别、年龄及肿瘤分化程度无关（P>0.05） 。B7-H1蛋白阳性表达组的三年生存期明显短于阴性表达者（P=0.029）。结论 B7-H1蛋白在胆囊癌中高表达导致预后不良,提示B7-H1蛋白在胆囊癌的发生发展和浸润转移中起作用。     

线粒体钙离子摄入蛋白1在肾透明细胞癌组织中的表达及其临床意义

目的 探讨线粒体钙离子摄入蛋白1（mitochondrial calcium uptake 1,MICU1）在肾透明细胞癌（renal clear cell carcinoma,RCCC）组织中的表达及其临床意义。方法 以2016年1月—2018年12月于延安大学附属医院行根治性肾切除术的30例RCCC患者为研究对象。采用免疫组织化学法检测RCCC组织及癌旁正常组织中MICU1蛋白的表达。采用瞬时转染法分别将MICU1干涉片段和MICU1过表达质粒转染到CAKI-1细胞中（siMICU1组和MICU1组）,分别设置相应的阴性对照（siCtrl组和EV组）。采用Western blot检测蛋白表达,MTS实验和EdU实验检测细胞的增殖能力。收集TCGA数据库中517例RCCC组织转录组数据,分析MICU1 mRNA表达与RCCC患者临床病理特征及预后的关系。结果 MICU1蛋白在RCCC组织中表达水平低于癌旁正常组织（P<0.001）。成功构建过表达MICU1细胞和干涉MICU1细胞,MTS实验和EdU实验显示,MICU1组的细胞增殖能力低于EV组（P<0.05）,siMICU1组的细胞增殖能力高于siCtrl组（P<0.05）。TCGA数据库分析结果显示,MICU1表达与性别、TNM分期有关（P<0.05）;MICU1低表达患者生存率低于高表达患者（χ²=19.290,P＜0.001）;多因素Cox回归显示,MICU1低表达是影响RCCC患者总生存期的独立危险因素（HR=1.641, 95%CI：1.191~2.261,P=0.002）。结论　MICU1在RCCC组织中呈低表达,且可促进RCCC细胞增殖。     

PES1对肝细胞癌预后和肝癌BEL-7402细胞生长的影响

目的 探讨pescadillo核糖体生物发生因子1（pescadillo ribosomal biogenesis factor 1，PES1）在肝细胞癌（hepatocellular carcinoma，HCC）组织中的表达及其对肝癌BEL-7402细胞生长的影响。方法 采用免疫组化法检测HCC癌组织和癌旁正常组织中PES1的表达。肝癌BEL-7402细胞转染PES1小干扰片段后，采用Western blot检测PES1、CDK4、CDC25A蛋白表达，MTS法检测细胞生长情况，流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡。结果 95例HCC癌组织中，PES1表达阳性率高于癌旁正常组织（90.5% vs 72.6%，χ²=10.122，P=0.001）；癌组织中PES1染色评分高于癌旁正常组织的［（6.30±3.56） 分 vs （2.10±1.64） 分，t=10.423，P<0.001］。PES1表达与HCC患者的肿瘤大小、门脉癌栓和TNM分期有关（均P<0.05）；PES1高表达患者总生存期较PES1低表达患者短（P<0.05）。转染PES1小干扰RNA组的细胞与对照组相比，细胞生长受抑制（P<0.01），G1期细胞比例增加，S期细胞比例减少（均P<0.01），CDK4、CDC25A蛋白表达下调，但细胞凋亡未见明显变化。结论 HCC组织中PES1表达上调，且与患者预后相关。PES1可通过上调CDK4、CDC25A蛋白表达，加快细胞G1/S期的转换，促进肝癌细胞生长。     

lncRNA lnc01317和lnc00886在胃癌患者组织和血液中的表达及其生物信息学分析

目的:探索长链非编码RNA(lncRNA) lnc01317和lnc00886在胃癌患者组织和血液中的表达及其生物信息学分析。方法:通过TCGA数据库筛选在胃癌中差异表达的lncRNA，进一步使用定量反转录聚合酶链反应（qRT-PCR）在新鲜胃癌组织中验证TCGA数据库筛选的lncRNA。最后挑选在胃癌组织验证中差异显著的lncRNA在胃癌患者和健康人血液中验证lncRNA的表达，ROC曲线分析其诊断的可能性。结果:在TCGA数据库中筛选及9对胃癌及癌旁组织验证发现lnc01317和lnc00886在胃癌组织中显著低表达；qRT-PCR表明lnc01317和lnc00886在胃癌患者血液中低表达，ROC曲线下面积（AUC）分别为0.823和0.743。结论:lnc01317和lnc00886可能作为新型的生物标志物，并为胃癌靶向治疗提供有价值的信息。     

长链非编码RNA HOXA-AS3在结肠癌组织中的表达及与临床预后的关系

目的:观察长链非编码RNA HOXA-AS3（lncRNA HOXA-AS3）在结肠癌组织中的表达并探究其与临床预后的关系。方法:选取2012年01月至2014年02月本院外科行手术治疗的94例结肠癌患者癌变及癌旁结肠组织冻存标本,采用实时定量PCR（RT-qPCR）法检测癌组织和癌旁组织中lncRNA HOXA-AS3的表达水平,采用单因素方差分析其与结肠癌患者临床病理参数的关系;采用Kaplan-Meier生存曲线分析lncRNA HOXA-AS3表达水平与结肠癌患者5年生存率的关系;采用COX多因素回归分析影响结肠癌患者不良预后的危险因素。结果:与癌旁组织比较,结肠癌组织中lncRNA HOXA-AS3表达水平明显升高（P＜0.05）;lncRNA HOXA-AS3在结肠癌组织中的表达水平与患者年龄、性别、病理类型无关（P＞0.05）,与TNM分期、肿瘤直径、分化程度、淋巴结转移有关（P＜0.05）。lncRNA HOXA-AS3高表达组结肠癌患者5年生存率（60.98%）明显低于低表达组（94.34%）（χ2=16.41,P＜0.05）。COX回归分析结果显示,lncRNA HOXA-AS3高表达、TNM分期和淋巴结转移是影响结肠癌患者预后的独立危险因素（P均＜0.05）。结论:lncRNA HOXA-AS3在结肠癌组织中高表达,且与患者TNM分期、肿瘤直径、分化程度、淋巴结转移及5年生存率有关,其表达变化可能与结肠癌的发生、发展进程有关,有潜力成为结肠癌预后评估的新型生物指标及潜在治疗靶标。     

FAM83A and FAM83A-AS1 both play oncogenic roles in lung adenocarcinoma

Lung adenocarcinoma (LUAD) is the most common subtype of lung cancer. Nevertheless, the detailed molecular mechanisms of the progression of LUAD remain largely unknown. The present bioinformatics analysis reported that FAM83A and FAM83A-AS1 were upregulated in LUAD tissues and associated with prognosis in patients with LUAD. The purpose of the current study was to investigate the role of FAM83A and its antisense long non-coding (lnc)RNA FAM83A-AS1 in LUAD. Gene Expression Profiling Interactive Analysis was used to screen for potential oncogenes in LUAD and to analyze the clinical significance of FAM83A and FAM83A-AS1. Small interfering RNAs were constructed and transfected into LUAD cells to knock down the expression of FAM83A and FAM83A-AS1. EdU, Cell Counting Kit-8, Transwell and Matrigel assays were performed to detect the proliferation, migration and invasion of LUAD cells. The interaction between FAM83A-AS1, microRNA (miR)-495-3p and FAM83A was explored using a luciferase reporter assay. FAM83A and FAM83A-AS1 were both overexpressed in LUAD tissues compared with adjacent normal tissues. High expression of FAM83A and FAM83A-AS1 predicted worse survival and more advanced clinical stage. Knockdown of FAM83A or FAM83A-AS1 could inhibit the proliferation, migration and invasion of LUAD cells. Moreover, lncRNA FAM83A-AS1 regulated the expression of FAM83A by functioning as competing endogenous RNA for miR-495-3p. These results implicated that FAM83A and FAM83A-AS1 both played oncogenic roles in LUAD and FAM83A-AS1 could regulate the expression of FAM83A by sponging miR-495-3p. The study revealed a novel regulatory mechanism of tumor development in LUAD and FAM83A and FAM83A-AS1 may be novel biomarkers and therapeutic targets for LUAD.     

lncRNAAK093987在结肠癌组织中的表达及其临床意义

目的:探讨长链非编码核糖核酸AK093987(lncRNA AK093987)在结肠癌组织中的表达及其临床意义.方法:收集2011年1月至2015年12月四川内江市第一人民医院收治的65例结肠癌患者的肿瘤组织及癌旁组织和15例先天性巨结肠和各种原因结肠破裂穿孔、肠扭转、嵌顿疝患者的正常结肠组织.通过Real-time PCR法检测lncRNA AK093987在65例结肠癌组织、癌旁正常组织及结肠癌细胞中的表达,CCK8法检测转染siRNAAK093987下调lncRNA AK093987表达的结肠癌LoVo细胞的增殖.采用Chi-Square检验和Kaplan-Meier法分别分析lncRNA AK093987表达与临床病理参数、生存时间和预后的关系.Cox回归分析影响结肠癌患者DFS和OS的因素.结果:lncRNA AK093987在结肠癌组织中的表达明显高于癌旁组织和正常结肠组织(7.125±1.398 vs 1.058±0.070、1.092±0.049,均P＜0.01).下调lncRNAAK093987表达的结肠癌LoVo细胞增殖显著降低(P＜0.05).lncRNAAK093987的表达与疾病分期、淋巴结转移、远处转移、肿瘤分化、血清CEA水平和生存状态明显相关(均P＜0.05);而与患者的性别、年龄及肿瘤部位无显著相关(均P＞0.05);高表达lncRNA AK093987患者的中位DFS和OS均较低表达者明显缩短[DFS:(13.00±1.49) vs (27.01±1.87)个月;OS:(27.00±3.32) vs (43.72±3.08)个月,均P＜0.01];lncRNAAK093987的表达、远处转移及临床分期是结肠癌独立的预后因素(P＜0.05).此外,下调lncRNAAK093987的表达能够明显抑制肿瘤细胞的增殖.结论:ln-cRNAAK093987参与结肠癌的发生发展,lncRNAAK093987的表达与疾病分期、淋巴结转移、远处转移、肿瘤分化、血清CEA水平和患者生存状态有关,可作为潜在的结肠癌诊断和预后评估的分子标志物.     

长链非编码RNA EPB41L4A-AS2对乳腺癌的预后研究

目的 通过检测乳腺癌组织中EPB41L4A-AS2的表达,评价其临床病理特征与乳腺癌患者预后之间的关系。方法利用癌症基因组Meta分析、TCGA和GEO数据集,评价EPB41L4A-AS2的表达量与乳腺癌的临床组织特征之间的关系。利用Western blot实验,在乳腺癌细胞水平验证EPB41L4A-AS2与凋亡通路的关联性。结果 在Meta分析、TCGA和基因表达库(GEO)数据集的结果中发现,乳腺癌组织中EPB41L4A-AS2低表达,并且与不良的临床病理特征呈正相关。而在乳腺癌细胞系中的实验验证了EPB41L4A-AS2与细胞经典凋亡通路相关联。在GEO中进行Meta分析的预后研究中,发现EPB41L4A-AS2的高表达与良好的疾病预后有关。结论 EPB41L4A-AS2抑制了肿瘤的形成,对乳腺癌的临床预后分析有较高价值。     

lncRNACRNDE 在非小细胞肺癌组织中的表达及其临床意义

目的:探讨结直肠差异表达长链非编码RNA CRNDE (colorectal neoplasia differentially expressed)在非小细胞肺癌(NSCLC)组织标本中的表达及其临床意义.方法:收集2011年1月至2015年12月成都军区总医院行根治性或姑息性切除术的NSCLC患者137例,以相应癌旁组织和29例肺外伤非肺癌患者的正常肺组织作为对照,通过实时荧光定量PCR法检测lncRNACRNDE在癌组织及癌旁组织标本中的表达,分析其表达与患者临床病理特征及预后的关系.结果:lncRNA CRNDE在肺癌癌组织中的平均表达水平为5.283±0.245,与非肿瘤组织(1.098±0.082)比较,差异有统计学意义(t=14.59,P＜0.01).lncRNA CRNDE 在肺癌组织标本中的表达较癌旁组织明显增高.lncRNA CRNDE的表达与患者的年龄、性别、吸烟史、肿瘤大小、淋巴结转移及肿瘤分化无关(均P＞0.05);与疾病分期、远处转移、病理类型及生存状态明显相关(均P＜0.05).lncRNA CRNDE高表达水平与NSCLC中的病理类型相关(P＜0.05),在腺癌组的表达水平明显高于鳞癌及其他类型组的表达水平;此外,高表达lncRNACRNDE的患者的PFS为(20.00±1.72)个月,较低表达者(34.07±1.97)缩短,差异有统计学意义(x2=15.940,P＜0.01);低表达lncRNA CRNDE的患者的OS为(47.50±2.31)个月,较高表达者(32.15±2.19)明显延长,差异有统计学意义(x2=12.40,P＜0.01).Cox多因素回归模型分析显示,lncRNA CRNDE的表达、远处转移及临床分期是NSCLC独立的预后因素(P＜0.05).结论:lncRNA CRNDE参与调节NSCLC的发生发展,可作为潜在的NSCLC诊断和预后评估的生物标志物.     

Long noncoding RNA TFAP2A-AS1 exerts promotive effects in non-small cell lung cancer progression via controlling the microRNA-548a-3p/CDK4 axis as a competitive endogenous RNA

In this study, we mainly focus on probing expression profile and detailed functions of long non-coding RNA TFAP2A antisense RNA 1 (TFAP2A-AS1) in non-small cell lung cancer (NSCLC). Moreover, the mechanisms played by TFAP2A-AS1 were unraveled comprehensively. Herein, a notable overexpressed TFAP2A-AS1 in NSCLC was observed by TCGA and our own cohort. An increased TFAP2A-AS1 level displayed a negative correlation with the overall survival of patients with NSCLC. Loss-of-function approaches illustrated that the absence of TFAP2A-AS1 weakened NSCLC cell proliferation, colony formation, migration and invasion in vitro. Also, interference of TFAP2A-AS1 caused in vivo tumor growth suppression. Mechanistically, TFAP2A-AS1 could negative regulate microRNA-584-3p (miR-584-3p) as a competitive endogenous RNA. Furthermore, cyclin-dependent kinase 4 (CDK4), a direct target of miR-584-3p, was positively controlled by TFAP2A-AS1 in a miR-5184-3p-dependent manner. Rescue function experiments corroborated that the anticancer activities of TFAP2A-AS1 deficient on the oncogenicity of NSCLC cells were reversed by downregulating miR-584-3p or overexpressing CDK4. To sum up, TFAP2A-AS1 exhibits cancerpromoting roles in NSCLC through the adjustment of miR-584-3p/CDK4 axis.     

lncRNA BLACAT1靶向LEMD1促进结直肠癌细胞的增殖和转移

目的 研究长链非编码RNA(lncRNA)BLACAT1在结直肠癌细胞发生发展过程的作用机制。方法 starBase分析TCGA数据库中lncRNA BLACAT1分别在结直肠癌组织和癌旁组织中的表达水平,采用qPCR分别检测10例结直肠癌患者癌组织和癌旁组织中lncRNA BLACAT1的表达水平;检测结直肠癌细胞系SW620、SW480、HT-29、LoVo、HCT116和正常结直肠上皮细胞FHC中lncRNA BLACAT1的mRNA表达水平,筛选lncRNA BLACAT1高表达细胞系;敲低lncRNA BLACAT1验证对高表达细胞系增殖、迁移和侵袭的影响;starBase在线预测与lncRNA BLACAT1靶向作用的基因,qPCR和Western blot实验验证结果;starBase分析lncRNA BLACAT1与作用基因相关性,双荧光素酶报告基因实验验证lncRNA BLACAT1的靶基因;检测lncRNA BLACAT1作用靶基因对结直肠癌细胞的增殖、迁移和侵袭的影响。结果 TCGA数据库分析和结直肠癌患者检测结果均表明癌组织中lncRNA BLACAT1表达明显高于癌旁组织(P＜0.001);结直肠癌细胞系SW620中lncRNA BLACAT1的mRNA表达水平最高(P＜0.001);敲低lncRNA BLACAT1能够抑制SW620细胞的增殖(P＜0.001)、迁移(P＜0.001)和侵袭能力(P＜0.001);qPCR和Western blot实验及数据库分析结果表明lncRNA BLACAT1与LEMD1的表达存在正相关关系(r=0.778,P＜0.001),双荧光素酶报告基因实验证明LEMD1是lncRNA BLACAT1的靶基因;lncRNA BLACAT1上调LEMD1的表达,促进SW620细胞的增殖(P＜0.001)、迁移(P＜0.001)和侵袭(P＜0.001)。结论 lncRNA BLACAT1靶向LEMD1促进结直肠癌细胞SW620的增殖和转移。