病原宏基因组测序对肺部感染病原体检测价值以及影响因素分析

目的 探讨mNGS对肺部感染病原体检测价值以及影响因素分析.方法 收集2021年1月-2021年6月本院住院并送检mNGS的肺部感染者19例,记录患者临床资料、mNGS结果以及传统病原学检测结果.结果 mNGS检测阳性率为73.68％,显著高于传统培养(47.37％,P<0.05);mNGS检测出2种及2种以上的病原体...     

宏基因组二代测序技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的应用价值研究

目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)技术在儿童重症肺炎病原学诊断中的应用价值。方法 回顾性分析71例重症肺炎患儿的临床资料,均进行m NGS检测及传统病原学检测(TPD)。比较m NGS与TPD病原体及细菌检测结果 ,并分析m NGS细菌检测阳性的影响因素及TPD细菌检测阳性的影响因素。结果 71例患儿经m NGS病原体检测阳性66例,阳性率为93.0%;TPD病原体检测阳性51例,阳性率为71.8%。两者病原体检测结果一致性较差(Kappa=0.234), mNGS病原体检测阳性率显著高于TPD,差异具有统计学意义(P=0.001<0.05)。TPD细菌检测阳性率为38.0%(27/71),培养时间为(79.2±15.7)h;mNGS细菌检测阳性率为67.6%(48/71),检出时间为(54.0±16.9)h。两者细菌检测阳性率一致性较差(Kappa=0.299), mNGS细菌检测阳性率显著高于TPD,检出时间显著短于TPD,差异均有统计学意义(P<0.05)。71例患儿经mNGS细菌检测阳性48例(67.6%)作为mNGS阳性组,阴性23例(32.4%)作为mNGS...     

肺泡灌洗液宏基因组二代测序对肝衰竭合并重症肺炎的临床价值

目的 探讨宏基因组二代测序(mNGS)对肝衰竭合并重症肺炎(SP)的临床价值。方法 回顾性收集36例肝衰竭合并SP患者,其中mNGS组20例,作肺泡灌洗液(BALF)mNGS检测以及常规微生物的检测;对照组16例仅作常规微生物的检测。对两组患者基线资料,临床表现,常规培养、mNGS检测结果,肺炎的严重程度评分(CURB 65评分)、急性生理学与慢性健康状况评分(APACHEⅡ评分),以及抗生素治疗方案、疾病转归等资料进行分析。结果 两组年龄、性别、CURB 65评分、APACHEⅡ评分的差异均无统计学意义。mNGS组机械通气时间(9.92±2.45)d,小于对照组的(14.16±2.85)d(P=0.000)。mNGS组17例病原体检测阳性(85%),对照组8例阳性(50%)。肝衰竭合并SP患者最为常见的感染类型是混合性的感染(15例,60%);其次为单纯的细菌感染为6例(24%),而混合性感染中又以细菌混合真菌最为多见,占32%。mNGS组9例mNGS和常规的微生物检测均为阳性,均阴性的2例,两种检测方法的符合率为55.0%。mNGS检测的阳性率(85%)高于常规的微生物检测(50%...     

按蚊伊丽莎白菌肺部重症感染1例

按蚊伊丽莎白菌是一种相对较新发现的细菌,其致病机制尚不清楚。微生物宏基因组二代测序(mNGS)具有高通量、快速、精准等优势,已广泛应用于临床微生物病原体检测和鉴定,弥补了传统病原学检测方法的不足。本文报道1例脑出血患者肺部感染按蚊伊丽莎白菌的治疗及预后,探讨mNGS对于致病机制复杂、耐药性广泛的罕见按蚊伊丽莎白菌感染的诊断价值。     

宏基因组学第二代测序技术对比传统微生物培养在慢性子宫内膜炎病原学诊断中的优势

目的 通过对比宏基因组学第二代测序技术（mNGS）与传统微生物培养在慢性子宫内膜炎病原学检测结果的差异,了解mNGS在慢性子宫内膜炎病原学诊断中的优势。方法 选取2017年1月至2021年12月我院生殖中心慢性子宫内膜炎的不孕症患者共计500例,同时取子宫内膜标本送检,每份标本均分为2份,1份行传统微生物培养法检测病原体,另1份行m NGS法检测病原体,统计治疗前两种方法检测出的病原体数量与种类、微生物检出阳性率以及两种检测方法的一致性,并于治疗后对两种方法的复检阳性率进行比较。结果 传统微生物培养法的检出阳性率为20.80%;mNGS法的检出阳性率为79.40%,有显著性差异（P <0.05）。通过传统微生物培养法共检出104例,致病菌包括：肺炎克雷伯杆菌、大肠埃希菌、链球菌、粪肠球菌等。通过m GNS法共检出397例,除上述致病菌外,还检测出了细菌（阴道加德纳菌、金黄色葡萄球菌）、病毒（巨细胞病毒、乳头状瘤病毒）、支原体（解脲脲原体）。在500例子宫内膜标本中,两组检测结果完全不一致的有105例（21.00%）,检测结果不完全一致的有241例（48.20%）,检测结果完全一致...     

宏基因组二代测序诊断鹦鹉热衣原体肺炎4例

目的 分析4例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床特征及诊治思路,探讨宏基因组二代测序(mNGS)在鹦鹉热衣原体肺炎诊断中的应用价值。方法 回顾性分析4例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料。入院后进行实验室、影像学及支气管镜检查,并进行肺泡灌洗液mNGS检测。观察治疗后临床结局。结果 患者发病前均有明确的鸟类或禽类接触史,以发热、咳嗽为首要临床表现,可见头晕、呼吸困难及肌肉酸痛等表现。4例患者白细胞计数未见明显升高,淋巴细胞计数、血钠下降,CRP、降钙素原、铁蛋白、纤维蛋白原和D-二聚体明显升高,AST及乳酸脱氢酶升高。胸部CT显示肺间质性病变3例,双侧胸腔积液2例。肺泡灌洗液mNGS检测显示,4例患者均查出鹦鹉热衣原体序列,及时调整为以多西环素为基础的治疗方案,其中1例患者合并真菌感染,联合使用氟康唑抗真菌治疗,均好转出院。结论 鹦鹉热衣原体肺炎起病急,多见发热、咳嗽,禽类和鸟类接触史为重要诊断线索,临床症状及实验室、影像学检查缺乏特异性。肺泡灌洗液mNGS检测能够快速明确诊断,减少漏诊、误诊。以多西环素为基础的治疗效果明显,患者如合并其他病菌感染,需要联合用药治疗。     

应用PCR方法检测重症合并感染病人血中细菌16SrRNA基因的临床价值

目的探讨病人血中细菌16SrRNA基因对临床诊断重症合并感染的意义。方法40例APACHEⅡ评分≥12分重症合并感染的病人，抽取其外周血，应用PCR技术检测细菌16SrRNA基因同时做血细菌培养。对PCR和血培养检测的结果进行比较。30例正常对照组检测其血中细菌16SrRNA基因。结果40例重症合并感染的病人中有13人用PCR法检出细菌16SrRNA的基因，阳性率为32．5％。血细菌培养阳性的6人，阳性率仅为15％。血细菌培养阳性者其PCR结果全部为阳性。结论用PCR方法检测重症合并感染病人血中细菌16SrRNA基因具有灵敏、快速、不受使用抗生素的影响，与临床诊断吻合度高等优点，弥补与丰富了微生物学的检测方法，为准确认识和救治重症合并感染提供科学依据。     

血清PCT联合CRP对重症感染患者的检测价值

目的探讨血清PCT联合CRP对重症感染患者的检测价值。方法选取2012年1月~2016年12月于我院ICU入住的感染患者68例,按感染严重程度分为重症感染组37例,局部感染组31例。选取同期入住ICU未合并感染的患者60例为对照组。入住ICU时,抽取外周静脉血20m L,采用双抗夹心免疫化学发光法检测降钙素原(PCT),免疫散射速率比浊法检测C反应(CRP)。PCT≥0.5ng/L定义为阳性,CRP≥10mg/L定义为阳性。结果重症感染组和局部感染组血清PCT和CRP水平均显著高于对照组(P<0.05);且重症感染组血清PCT和CRP水平均显著高于局部感染组(P<0.05)。重症感染组和局部感染组PCT和CRP阳性率均显著高于对照组(P<0.05);重症感染组PCT阳性率显著高于局部感染组(P<0.05);重症感染组和局部感染组CRP阳性率均为100.00%,差异无统计学意义(P>0.05)。PCT敏感性为81.96%,特异性75.16%;CRP敏感性为60.54%,特异性49.25%;联合应用PCT和CRP检测,敏感性为87.25%,特异性81.56%。结论血清PCT联合CRP检测,有助于重症感染的早期诊断和鉴别,效果优于单一PCT或CRP检测,值得临床推广应用。     

慢性肾脏病应用糖皮质激素后重症肺部感染8例临床分析

目的探讨8例慢性肾脏病长期应用糖皮质激素致重症肺部感染的诊断和治疗。方法8例重症肺部感染患者，给予抗细菌、抗病毒和抗真菌治疗。结果7例重症肺部感染治愈，1例死亡。结论应早期行病原学检查，不能明确病原体可早期行经验性治疗，预后较好，死亡率低。     

基于高通量基因测序诊治肺萜烯诺卡菌病5例并文献复习

目的：分析肺萜烯诺卡菌病患者的临床表现、影像和实验室检查特征以及临床治疗方案,提高对该病的临床认识。方法：收集2020年6月—2021年12月经宏基因组二代测序(mNGS)诊断的5例肺萜烯诺卡菌病患者相关信息,对其临床特征、实验室检查、影像、微生物学特征以及治疗方案进行回顾性分析。结果：5例患者中,多数为老年人,临床表现以高热、咳嗽、咳痰为主;实验室检查多表现为白细胞计数异常、中性粒细胞百分比升高、低蛋白血症;影像学特征以双侧病变多见,空洞、结节以及斑片影是最常见的影像学特征。经mNGS诊断后使用利奈唑胺、复方磺胺甲恶唑(TMP-SMZ)、亚胺培南西司他汀联合治疗方案,疗程6～12个月,复查胸部CT病灶明显吸收。结论：肺萜烯诺卡菌病的临床表现为化脓性炎症,通常表现为高热合并肺部空洞及实变影,mNGS有助于明确病原学诊断,利奈唑胺、TMP-SMZ、亚胺培南西司他汀可作为治疗方案的核心用药。     

血清降钙素原水平对重症加强护理病房重症合并感染患者的意义分析

目的观察血清降钙素原(PCT)对重症加强护理病房(ICU)重症合并感染患者的临床意义。方法选取2017年3～9月在我院ICU住院病情较重患者140例,所有患者分成A、B两组,A组合并感染的患者70例,B组无感染的患者70例,观察A、B两组患者C反应蛋白(CRP)、PCT水平对重症感染的诊断价值。将A组患者随机分成两组,观察组35例患者根据PCT水平进行抗生素治疗,对照组35例患者按照临床指南进行抗生素治疗,观察两组患者经抗感染治疗后CRP水平及抗生素使用时间。结果 (1) A、B组患者CRP进行比较差异有统计学意义(P 0.05),A组CRP诊断重症感染的阳性率达95.714%。A、B组患者PCT进行比较差异有统计学意义(P 0.05),B组PCT诊断重症感染的阳性率达97.143%。A组患者的CRP及PCT进行比较差异无统计学意义(P 0.05)。(2)观察组治疗前后及对照组治疗前后CRP比较有差异,治疗后CRP均降低(P 0.05);观察组和对照组治疗前CRP比较差异无统计学意义(P 0.05),治疗后比较有差异,观察组CRP更低(P 0.05);观察组及对照组抗生素使用时间比较有差异,观察组抗生素使用时间更短(P 0.05)。结论 PCT对ICU重症感染的诊断具有参考价值,PCT水平可以用于指导重症感染患者抗生素用量的调整,缩短抗生素使用时间。     

宏基因组二代测序技术在社区获得性肺炎中的临床应用体会

目的：探讨宏基因组二代测序技术(mNGS)在社区获得性肺炎中的临床应用价值。方法：回顾性分析2020年12月—2021年12月因社区获得性肺炎在太原市中心医院呼吸与危重症医学科住院的26例患者的临床资料,对传统病原学检测方法与宏基因组二代测序检测方法进行对比研究,比较两者结果的一致性。结果：研究共收集26份标本,传统微生物培养法共检出13份阳性,mNGS共检出23份阳性,mNGS灵敏度(88.5%)高于微生物培养灵敏度(50.0%),差异有统计学意义(P=0.007)。在致病菌检出方面,mNGS共检出细菌20种,真菌7种,病毒9种以及寄生虫1种;微生物培养共检出细菌5种,真菌5种。结论：与传统的微生物培养法相比,mNGS法检测敏感性更高,对病原体的检出能力更强,在呼吸系统感染性疾病的诊治中将发挥重要作用。     

mNGS辅助诊断肺惠普尔病1例并文献复习

惠普尔病(WD)是由惠普尔养障体(TW)感染引起的一种罕见慢性多系统感染性疾病,发病率较低,好发于卫生状况较差的人群,临床症状不典型,易漏诊、误诊。近年来,随着分子医学检测技术的发展和宏基因组二代测序(mNGS)辅助诊断技术的应用,WD误诊率下降。该文报道了1例肺WD患者,经mNGS在肺泡灌洗液中检测出TW诊断为肺WD。提示临床医师对不明原因感染应尽早行mNGS以明确诊断。     

某院鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床特征与治疗结果分析

目的：分析鹦鹉热衣原体肺炎（Chlamydia psittaci pneumoniae,CPP）患者的临床表现、实验室指标和治疗结局,为提高对该病的认知和诊治能力参考。方法：采用宏基因组二代测序技术（metagenomics next-generation sequencing,mNGS）,分析医院2020年5月—2022年3月收治的6例CPP患者的临床表现、实验室检查与胸部CT结果、诊治过程、治疗用药和预后情况。结果：纳入的6例CPP患者的临床表现以咳嗽为主,其余伴随症状有头晕、胸闷气促、气喘和头痛等,其中4例有明确的禽类接触史;6例CPP患者实验室检查发现中性粒细胞百分比、C反应蛋白、降钙素原、肝酶均有不同程度的升高,其中4例患者有低钠血症、5例患者有低钾血症、2例患者有白细胞总数升高;胸部CT表现为某一肺叶实变;呼吸道肺泡灌洗液标本经mNGS检测出鹦鹉热衣原体核酸序列,并结合其临床表现与禽类接触史被确诊为CPP;及时启动抗感染治疗后均好转、出院。结论：CPP患者临床表现具有一定的特异性、诊断困难,经mNGS检测及时明确病原学诊断,并分别采用多西环素、阿奇霉素和左氧氟沙星等药物治疗...     

病毒感染与支气管肺炎的关系

应用已知抗体检测104例支气管肺炎（瑞型）患儿鼻咽分泌物脱落细胞内的病毒抗原。检测到的病毒包括呼吸道合胞病毒、流感病毒A型和B型。阳性病例可为单一病毒感染或几种病毒合并感染，病毒感染阳性率为60．6％，感染阳性率以呼吸道合胞病毒最高。病毒感染后发生的气道高反应与其感染及临床症状的严重程度、持续时间呈平行关系。病毒早期快速诊断可为支气管肺炎的治疗提供可靠的病原学依据。     

临床药师基于宏基因组测序技术协助临床对重症感染性疾病患者的临床治疗分析

目的:分析临床药师基于宏基因组测序技术协助临床对重症感染性疾病患者临床用药治疗的指导作用.方法:选取医院3例重症感染性疾病(颅内脓肿2例、肾移植术后重症肺炎1例)患者病历资料,在常规病原学培养检测报告受限的情况下,临床药师参与会诊后建议采用宏基因组测序技术(metagenomic next-generation sequencing,mNGS)明确其感染病原菌种,分析其抗感染治疗的药学监护过程.结果:宏基因组测序与应用明确了2例脑脓肿患者术中脓液标本、1例肾移植术后重症肺炎肺泡灌洗液标本中感染致病菌,临床药师结合临床特点及药学知识,提出个体化的药学建议,3例感染患者均得到有效救治.结论:宏基因组测序技术的应用对复杂感染性疾病提供新的技术支持,给临床药师会诊提供更多证据.     

CT影像诊断重症肝病患者肺部感染的应用

目的:探讨CT影像诊断重症肝病患者肺部感染的应用价值。方法:选取2015年9月~2017年9月期间苏州大学附属第一医院收治的80例重症肝病患者,根据是否发生肺部感染分为感染组(n=40)和未感染组(n=40)。对两组患者进行多层螺旋CT检测,比较两组患者的CT表现。结果:感染组患者肺实变影、结节影和胸膜增厚阳性率高于未感染组,差异有统计学意义(P0.05);两组患者的磨玻璃影阳性率比较无统计学意义(P0.05)。结论:重症肝病患者发生肺部感染后,其CT影像也呈现明显变化,CT影像可作为诊断重症肝病患者肺部感染的辅助检测。     

病毒感染与支气管肺炎的体系

应用已知抗体检测１０４例支气管肺炎（喘型）患儿鼻咽分泌物脱落细胞内的病毒抗原。检测到的病毒包括呼吸道合胞病毒、流感病毒Ａ型和Ｂ型。阳性病例可为单一病毒感染或几种病毒合并感染，病毒感染阳性率为６０．６％，感染阳性率以呼吸道合胞病毒最高。病毒感染后发生的气道高反应与其感染及临床症状的严重程度、持续时间呈平行关系。病毒早期快速诊断可为支气管肺炎的治疗提供可靠的病原学依据。     

54例重症肺部感染的病原学分析

目的分析重症肺部感染病原体的构成,为重症肺部感染患者的早期适当经验性抗生素治疗提供重要临床依据。方法对54例重症肺部感染患者痰标本接种于血琼脂培养基培养,进行病原学检测分析。结果 54例重症肺部感染患者病原体检测,革兰阴性杆菌20例占37.0%,革兰阳性球菌24例占44.4%,肺炎支原体10例占18.5%;其中,革兰阳性球菌最常见者为金黄色葡萄球菌,12例占革兰阳性球菌的50%。结论病原学检测的重要意义之一在于可能改变经验性的治疗方案,并进而改善患者的预后。     

抗生素治疗1例恙虫病合并肺部感染的病例分析

目的：分析恙虫病合并肺部感染患者的临床特征,指导临床及时予以抗生素治疗。方法：通过分析我院收治的1例恙虫病合并肺部感染患者的临床资料和诊疗过程,对恙虫病的流行病学特征和抗生素治疗效果进行分析。结果：在常规对症治疗的基础上给予多西环素治疗后患者病理征转阴,病情明显好转。结论：由于恙虫病合并肺部感染的临床症状表现不具特异性,存在较高的误诊率,临床上应当充分结合患者接触史、症状表现、实验室指标以及影像学征象,并及时进行mNGS检测,以便及时予以多西环素抗感染染治疗。