广州市一起由新型冠状病毒Delta变异株引起的家庭聚集性疫情流行病学调查

目的  分析广州市一起由Delta变异株(B.1.617.2)引起的COVID-19家庭聚集性疫情的流行病学特征,为相关疫情防控提供参考。方法  从中国疾病预防控制中心传染病报告管理信息系统和流行病学调查资料获取病例信息,采用描述性流行病学方法对该起疫情的调查和特征进行分析描述。结果  该起家庭聚集性疫情涉及6名确诊病例,其中男、女各3人,中位年龄为24.50岁,均无新型冠状病毒(简称新冠)疫苗接种史。病例1~4与确诊病例在某餐厅有同时段用餐史,在暴露后4~7 d陆续发病;家庭成员病例5、6则分别在病例1~4发病后2~5 d发病。除病例1、2是由社区集中核酸检测发现,其余4人均是作为病例1、2的密切接触者在集中隔离观察中检测发现。6名病例活动轨迹累计涉及24个重点场所,共甄别密切接触者427人,除病例3~6外无续发感染。结论  结合疫苗接种和非药物类控制措施,重点关注和控制家庭聚集性发病,仍是阻断COVID-19疫情社区传播的重要策略。     

2021年宁波市一起新型冠状病毒Delta变异株本土聚集性疫情流行特征分析

目的 分析宁波市一起新型冠状（新冠）病毒Delta变异株本土聚集性疫情流行特征,为完善新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情防控政策提供参考依据。方法 通过制定病例定义,开展病例搜索,对发现的病例开展现场流行病学调查,采集相关标本开展病原学检测,运用描述流行病学方法进行分析。结果 本起疫情累计报告74例确诊病例,病例以轻型为主,占87.84%（65/74）,无重型和危重型。流行曲线呈人传人传播模式,据流行病学调查显示,本起疫情至少传播6代。病例年龄范围为2~80岁,其中≥60岁占27.03%（20/74）。职业分布中以工人占55.41%（41/74）和家务/待业占27.03%（20/74）为主,疫情局限,未发生病例外溢。病例间流行病学关联明确,传播链清晰。基因测序结果证实为新冠病毒Delta变异株,与浙江省外输入关联疫情高度同源。结论 本起疫情为一起浙江省外输入COVID-19确诊病例引起的本土聚集性疫情,通过生活、工作接触导致社区传播扩散。     

新型冠状病毒Delta变异株引起的家庭二代续发率及影响因素研究

目的分析新型冠状病毒Delta变异株引起的家庭二代续发率(HSAR)及影响因素。方法 2021年7月南京市报告一起Delta变异株引起的聚集性疫情, 累计报告现住址为南京市的病例235例, 分布于171个家庭, 筛选出存在家庭密接接触者(家庭密接)的家庭及家庭密接作为研究对象, 收集家庭首发病例和家庭密接相关信息, 采用多因素logistic回归模型分析家庭HSAR及影响因素。结果 103个家庭共报告家庭密接234名、家庭续发病例64例, HSAR为27.4%(95%CI:22.0%～33.4%), 家庭规模2～3、4～5、6～9人的家庭分别占64.1%(66个)、26.2%(27个)、9.7%(10个);共报告家庭聚集性疫情35起, 占34.0%(35/103)。103例家庭首发病例中, 男性占27.2%(28例), 年龄M(Q1, Q3)为49(9, 56)岁;234名家庭密接中, 男性占59.0%(138例);年龄M(Q1, Q3)为42(20, 55)岁;暴露时间M(Q1, Q3)为3(1, 3)d。多因素logistic回归模型分析结果显示, 家庭首发病例为机场工作人员(OR...     

新型冠状病毒Delta变异株引起的宁波市镇海区本土疫情传播链分析

目的调查新型冠状病毒(新冠病毒)Delta变异株引起的宁波市镇海区本土聚集性疫情, 分析其传播链, 为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控提供参考依据。方法资料来源于现场调查收集2021年12月6-18日宁波市镇海区新冠病毒感染者个案信息。采用现场流行病学调查方法, 描述COVID-19病例流行病学特征和传播链。结果首例病例为途经中风险地区, 直接或间接接触阳性感染者而感染新冠病毒, 后继出现家庭内聚集性疫情, 并通过工作、生活、艾灸养生活动等密切接触而传播。疫情共持续14 d, 共报告确诊病例74例, 潜伏期M(Q1, Q3)为4.0(3.0, 5.8)d。所有病例均在一条传播链上, 传播6代以上, 代间距M(Q1, Q3)为3.5(2.0, 5.3)d。基因测序结果为Delta变异株(AY.4进化分支), 流行病学调查和基因测序结果均显示宁波市镇海区本土疫情与上海市疫情为同一起关联疫情。结论本起疫情传播链清晰, Delta变异株(AY.4进化分支)具有明显的家庭、封闭场馆、集中居住地聚集性, 要加强重点区域、重点人群健康管理, 提高核酸检测频次。     

新型冠状病毒Delta变异株引起的广州市荔湾区本土疫情流行特征分析

目的 分析新型冠状病毒（新冠病毒）B.1.617.2（Delta）变异株引起的广州市荔湾区本土疫情流行特征,为Delta变异株疫情防控工作提供参考依据。方法 资料来源于中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统和广州市荔湾区CDC,收集2021年5月21日至6月18日广州市荔湾区新冠病毒感染者（确诊病例和无症状感染者）相关信息。采用频数（构成比）、直方图、百分比堆积面积图等对本次Delta变异株疫情的流行病学特征进行描述,并应用潜伏期、动态再生系数（R_t）估计进行分析。结果 截至6月18日广州市荔湾区累计报告新冠病毒感染者127例,年龄范围2~85岁,<18、18~59和≥60岁年龄组分别占18.9%（24/127）、43.3%（55/127）和37.8%（48/127）。男女性别比为1：1.35（54：73）;职业以离退休人员32.3%（41/127）、家务及待业18.1%（23/127）和学生16.5%（21/127）为主;主要集中在荔湾区的白鹤洞街道（70.1%,89/127）与中南街道（23.6%,30/127）;Delta变异株的中位潜伏期6（范围：1~15）d;临床分型以普通型（64.6%,82/127）为主;基本再生系数（R₀）=5.1,R_t先上升后下降,最高达7.3;传播方式以密闭空间为主,具有明显的家庭聚集性,主要传播场所为家庭（26.8%,34/127）、餐馆（29.1%,37/127）、小区（3.9%,5/127）和市场（3.1%,4/127）。密切接触者筛查（66.1%）和社区排查（33.1%）是发现感染者的主要途径。结论 本次疫情新冠病毒Delta变异株的传染性较强,广州市荔湾区本土疫情具有明显的家庭聚集性,新冠病毒感染者以18~59和≥60岁年龄组为主。     

甘肃省新型冠状病毒Delta变异株流行特征分析

目的分析甘肃省新型冠状病毒(新冠病毒)Delta变异株(B.1.617.2)引起疫情的流行病学特征, 为疫情防控工作提供科学依据。方法收集2021年10月17日至11月25日甘肃省新冠病毒肺炎(COVID-19)确诊病例资料, 包括基本信息、流行病学史、发病日期、诊断日期、暴露场所、发现方式、感染来源等。采用Excel 2016、SPSS 22、ArcGIS 10.7软件进行数据整理分析。结果截至2021年11月25日, 甘肃省累计报告COVID-19病例146例, 疫情波及5个市10个县(区), 流行过程可分为输入病例期、输入-本地病例期和本地病例期3个阶段。年龄分布为1～87岁, 其中18～59岁占59.59%(87/146)。男女性别比为1∶1.12(69/77);职业以商业服务人员(17.12%, 25/146)、离退人员(15.75%, 23/146)、学生(13.70%, 20/146)、家务及待业人员(12.33%, 18/146)为主。3个阶段中, 18～59岁年龄段病例比例分别为44.44%、54.41%、70.00%, 呈上升趋势(趋势χ2=23.24, P<...     

一起由Omicron变异株BA.2进化分支引起的本土聚集性疫情流行病学特征分析

应用描述性流行病学方法, 对2022年3月杭州市发生在余杭区物流园区的新型冠状病毒感染本土聚集性疫情的流行病学特点进行分析。此次聚集性疫情由1例发热门诊主动就诊的病例发现, 疫情历时8 d, 共发现病例58例, 其中男性40例, 女性18例;年龄为(33.29±12.22)岁;工人53例, 学生2例, 农民、老师和待业人员各1例;主要分布在杭州市的余杭区(48例, 82.77%)和上城区(7例, 12.07%)。实时再生数最高是在3月10日为2.31, 于3月15日降至0.37。指示病例测序结果与韩国2022年3月4日上传的1条序列100%同源。     

绍兴市上虞区Delta变异株引起的新型冠状病毒肺炎疫情流行特征

目的对2021年绍兴市上虞区由Delta变异株引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情的流行病学特征进行分析, 为优化疫情防控措施提供科学依据。方法收集2021年12月7-21日上虞区的COVID-19病例相关信息, 分析本次疫情的三间分布, 估算潜伏期以及实时再生数(Rt)。结果 2021年12月7-21日上虞区累计发现COVID-19病例380例, 均为确诊病例, 年龄M(Q1, Q3)为52(38, 61)岁;男女性别比为1∶1.25;职业以工人(36.58%)和农民(27.63%)为主;此次疫情共波及上虞区的9个乡镇/街道, 主要集中在曹娥街道(57.10%)和百官街道(31.53%)。COVID-19病例的潜伏期M(Q1, Q3)为4.00(3.00, 5.75)d。基本再生数(R0)为4.06, Rt早期最高为5.62, 在疫情发现后呈下降趋势, 10 d内降至1.00以下。疫情自发现后14 d(12月7-21日)单日发病人数首次下降为0, 主要的发现方式为集中隔离发现(55.53%)和居家隔离发现(40.00%);密切接触者(密接)和密接的密接(次密)新型冠状病毒感...     

新型冠状病毒基因组监测及展望

在COVID-19疫情期间, 病原基因组监测得到广泛应用。本文介绍了开展基因组监测在应对COVID-19疫情中的优势, 并总结主要国家和组织开展的SARS-CoV-2基因组监测活动。进入后疫情时代, 全球仍然面临SARS-CoV-2不断变异和传播带来的挑战, 有必要持续开展包括基因组监测在内的疫情监测。     

新型冠状病毒Omicron变异株BA.5.1.3亚型潜伏期研究

目的研究新型冠状病毒(新冠病毒)感染疫情的Omicron变异株BA.5.1.3亚型的潜伏期。方法基于315例新冠病毒感染者流行病学调查数据, 根据区间删失数据的特点, 采用log-normal和Gamma两种分布估计潜伏期, 利用离散时间马尔科夫链蒙特卡罗算法对分布函数的参数进行贝叶斯估计。结果 315例感染者年龄(42.01±16.54)岁, 男性占30.16%。其中156例报告了症状出现时间, 年龄(41.65±16.32)岁, log-normal和Gamma分布估计发病潜伏期M(Q1, Q3)分别为2.53(1.86, 3.44)d及2.64(1.91, 3.52)d;估计感染潜伏期M(Q1, Q3)分别为2.45(1.76, 3.40)d及2.57(1.81, 3.52)d。结论基于log-normal和Gamma分布进行贝叶斯估计的潜伏期接近, 潜伏期最佳分布均为Gamma分布, 感染潜伏期与发病潜伏期M相差较小, Omicron变异株BA.5.1.3亚型比以往的Omicron变异株的潜伏期M更短。     

深圳市一起新型冠状病毒Omicron BF.7变异株暴发疫情的流行病学特征

目的分析深圳市一起广东省外输入的新型冠状病毒(新冠病毒)Omicron BF.7变异株所致暴发疫情的流行病学特征, 梳理和分析其传播链条和传播特征。方法采用现场流行病学方法对病例进行调查, 整理新冠病毒感染者活动轨迹、分析代际关系等, 对新冠病毒核酸阳性标本进行基因测序分析。结果 2022年10月8-23日, 深圳市共报告196例新冠病毒感染者, 均存在流行病学关联。男、女性分别为100和96例, 年龄M(Q1, Q3)为33(25, 46)岁。本起疫情由在广东省外旅游返回深圳市的新冠病毒感染者(首发病例)引起, 4条传播链分别为首发病例现住址相关感染8例、7日晚社会面活动相关感染65例、8日写字楼工作场所相关感染累计48例、在工作场所附近的写字楼相关感染74例。本起疫情潜伏期M(Q1, Q3)为1.44(1.11, 2.17)d。室内暴露的潜伏期短于室外暴露的潜伏期, M(Q1, Q3)分别为1.38(1.06, 1.84)和1.95(1.22, 2.99)d, 差异有统计学意义(Waldχ2=10.27, P=0.001)。随着代际的增加, 基因位点突变个数及突变比例增加。在同一传...     

新型冠状病毒Omicron变异株引起的续发率及影响因素研究

目的分析新型冠状病毒Omicron变异株引起的续发率(SAR)及影响因素。方法选取2022年2—4月江苏省本土社会面发现的新型冠状病毒Omicron变异株感染病例和密切接触者, 纳入328例社会面原发病例和40 146名密切接触者, 并将密切接触者中7 d集中隔离医学观察期间核酸检测结果转为阳性者定义为续发病例。收集人口学和临床特征等相关信息, 采用多因素logistic回归模型分析SAR的影响因素。结果 328名原发病例共报告续发病例1 285例, SAR为3.2%(95%CI:3.0%～3.4%)。328例原发病例中, 男性占61.9%(203例), 年龄M(Q1, Q3)为38.5(27, 51)岁;1 285例续发病例中, 男性占59.1%(759例), 年龄M(Q1, Q3)为34(17, 52)岁。多因素logistic回归模型分析结果显示, 原发病例为男性(OR=1.632, 95%CI:1.418～1.877)、年龄20岁以下(OR=1.766, 95%CI:1.506～2.072)和60岁及以上(OR=1.869, 95%CI:1.476～2.365)、感染BA.2毒...     

甘肃省首起新型冠状病毒肺炎家庭聚集性疫情分析

分析甘肃省首起新型冠状病毒(COVID-19)肺炎(NCP)家族聚集性疫情中7例COVID-19患者及1例密切接触者的流行病学史及临床特征。首例患者A于2020年1月22日发病, 有武汉居留史, 1月24日确诊NCP重症病例;患者B, 2020年1月23日发病, 1月31日确诊, 重症病例;患者C无症状, 1月27日确诊;患者D无症状, 1月27日确诊;患者E, 1月24日发病, 1月28日确诊;患者F无症状, 1月31日确诊;患者G无症状, 1月31日确诊;密切接触者H无症状, PCR连续检测阴性, 无症状, 提前出院。7例患者中, 1例(B)加重死亡, 其他患者经过积极救治, 病情均得到有效控制。除了出院病例外, 有5例COVID-19特异IgM抗体检测阳性, 1例检测阴性。此次聚集性暴发, 4例患者始终无症状, 但PCR和IgM抗体检测阳性, 说明无症状者可能是此次控制此次疫情的关键节点, 对于咽拭子核酸检测阴性但明确有毛玻璃样肺部病变的患者进行特异性IgM抗体筛查对病例早发现早隔离至关重要。     

甘肃省首起新型冠状病毒肺炎家庭聚集性疫情分析

分析甘肃省首起新型冠状病毒肺炎(COVID-19)家族聚集性疫情中7例COVID-19患者及1例密切接触者的流行病学史及临床特征。首例患者A于2020年1月22日发病,有武汉居留史,1月24日确诊COVID-19重症病例;患者B,2020年1月23日发病,1月31日确诊,重症病例;患者C无症状,1月27日确诊;患者D无症状,1月27日确诊;患者E,1月24日发病,1月28日确诊;患者F无症状,1月31日确诊;患者G无症状,1月31日确诊;密切接触者H无症状,PCR连续检测阴性,无症状,提前出院。7例患者中,1例(B)加重死亡,其他患者经过积极救治,病情均得到有效控制。除了出院病例外,有5例COVID-19特异IgM抗体检测阳性,1例检测阴性。此次聚集性暴发,4例患者始终无症状,但PCR和IgM抗体检测阳性,说明无症状者可能是此次控制疫情的关键节点,对于咽拭子核酸检测阴性但明确有毛玻璃样肺部病变的患者进行特异性IgM抗体筛查对病例早发现早隔离至关重要。     

北京市3起新型冠状病毒Omicron变异株聚集性疫情的感染来源和传播链分析

目的对北京市3起可能通过跨境物流途径导致的新型冠状病毒(新冠病毒)Omicron变异株聚集性疫情进行调查, 分析其感染来源和传播链。方法应用流行病学调查和大数据技术核查病例的活动轨迹, 对活动轨迹涉及的风险点位进行密切接触者追踪、人员和环境采样, 应用实时荧光定量PCR进行核酸检测, 对核酸阳性标本进行基因测序分析。结果 2022年1-4月北京市3起Omicron变异株聚集性疫情病毒基因序列分别为Omicron变异株BA.1、BA.1.1、BA.2分支, 疫情分别持续8、12、8 d, 报告6、42、32例新冠病毒感染者。1起感染来源可能为国际邮件, 2起可能为进口衣物, 进口物品从境外启运至首发病例接触感染的时间间隔为3～4 d。潜伏期M(Q1, Q3)为3(2, 4)d, 代间距M(Q1, Q3)为3(2, 4)d。结论此次疫情提示常温进口货品通过物流途径输入Omicron变异株疫情的风险, 且Omicron变异株传播速度更快, 应加快流行病学调查处置。     

北京市一起冷链相关新型冠状病毒Delta变异株聚集性疫情的溯源调查

目的 对北京市一起冷链相关新型冠状病毒（新冠病毒）Delta变异株聚集性疫情进行溯源调查,分析其感染来源和传播链。方法 应用流行病学调查方法核查病例的活动轨迹,对活动轨迹涉及的风险点位进行密切接触者追踪、人员和环境采样核酸检测,对核酸阳性标本进行基因测序分析。结果 2022年1月18日至2月6日,共报告112例新冠病毒感染者,除1例待查外,其余111例存在明确的流行病学关联。感染来源为进口冷冻货品外包装,2021年1月进口冷冻货品捕捞后储存于东南亚地区某国冷库,2021年6月包装后发送到我国北京市A区A冷库存储,随后分批次于2022年1月起在B区B冷库贴标销售,首发病例在搬运阳性冷冻货品期间发生感染,继而造成共同工作、就餐和居住在B冷库及其毗邻的C冷库和D餐厅（两库一店）所在区域的人员感染,涉及77例两库一店直接相关病例。在两库一店区域外还造成16个传播支链,涉及35例病例。结论 本起疫情提示进口冷链货品外包装污染输入疫情的风险,应继续加强冷链行业管理。     

一起可能经气溶胶传播的新型冠状病毒Delta变异株聚集性疫情调查

目的:分析北京市昌平区一起新型冠状病毒（新冠病毒）Delta变异株家庭聚集性疫情的流行特征和传播链。方法:应用流行病学调查和大数据技术核查病例的活动轨迹,对活动轨迹涉及的风险点位进行密切接触者追踪、人员和环境采样核酸检测,对核酸阳性标本进行基因测序分析。结果:2021年11月1日,通过人群主动筛查,发现北京市昌平区一起...     

一起天津市集体单位内新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学调查

目的 对天津市一起新型冠状病毒肺炎（COVID-19）聚集性疫情进行详细调查和分析,旨在为COVID-19的流行病学特征提供更多证据,并对前期基于有限证据和经验实施的防控措施进行评估。方法 采用描述性研究方法对一起发生在集体单位内的聚集性病例进行三间分布及其他流行病学特征描述。结果 自第一例指示病例于1月15日发病后,该单位相继发现10例确诊病例,且疫情从单位传播到4个家庭内,致7人发病。17例病例年龄中位数为55（19~79）岁;其中10例职工病例全部为男性,7例家庭聚集病例中男性3例,女性4例。职工病例中,8例办公地点在CW车间,2例在行政办公楼。病例的暴露-发病间隔中位数为4 d,其中职工病例暴露-发病间隔中位数为4.5 d,家庭聚集病例为4 d。初期发病未实施隔离措施的病例发病-就诊间隔中位数为4 d,发病期间开始居家隔离的病例发病-就诊间隔中位数为2.5 d,发病前开始居家隔离的病例发病-就诊间隔中位数为0.5 d。结论 COVID-19传播过程中存在单位和家庭聚集性,在疫情发生初期,准确、迅速的采取封控措施完全可以阻止COVID-19聚集性疫情的大范围扩散。     

广东省新型冠状病毒肺炎聚集性疫情分析

目的分析广东省新型冠状病毒肺炎聚集性疫情特点。方法从中国疾病预防控制信息系统传染病报告管理信息系统和突发公共卫生事件报告管理信息系统中,获取2020年1月1日至2月29日的广东省新型冠状病毒肺炎病例,提取聚集性疫情流行病学调查资料,明确聚集性疫情规模、引入病例、家庭与非家庭续发病例特点。根据引入病例与续发病例发病时间间隔计算代间距,根据密接追踪结果计算续发率,比较聚集性疫情中不同病例的特点。结果本研究共收集283起聚集性疫情,涉及引入病例633例,续发病例239例。以家庭聚集为主,聚集性疫情涉及病例数最大值为27例,最小值为2例,M(P25,P75)为2.0(2.0,4.0)。广东省总体续发率为2.86%(239/8 363),家庭续发率为4.84%(276/3 697),非家庭续发率为1.32%(61/4 632)。根据广东省疫情特点分为疫情上升期、高平台期、下降期、低水平波动期4个阶段,4个阶段的续发率分别为3.5%(140/3 987)、2.3%(55/2 399)、2.6%(37/1 435)、1.3%(7/542),差异具有统计学意义(P=0.003)。结论广东省聚集性疫情主...     

新型冠状病毒感染对神经系统的影响

关于新型冠状病毒感染(COVID-19)对中枢神经系统损害的机制有很多争议。本文对近2年来COVID-19引起相关神经系统症状及疾病的研究进展进行总结和分析, 以期有助于早期识别COVID-19, 了解其神经损伤的潜在机制, 对于新型冠状病毒引起的神经系统症状、并发症进行更好的预防与处理措施。