PTTG及c-myc与恶性肿瘤

恶性肿瘤是目前严重危害人类健康的一类疾病，其发生与发展是一个长期的、多因素、分阶段的过程，单个的基因改变尚不足以造成细胞的完全性恶性转化，细胞完全性的恶性转化需要多个基因的改变，包括几个癌基因的激活，两个或更多肿瘤抑制基因的失活，以及凋亡调节和DNA修复基因的改变。垂体肿瘤转化基因PTTG是新近发现的一种癌基因，其高表达在促进细胞增殖、转化及肿瘤发生中具有十分     

单细胞测序技术在肿瘤中的研究进展

肿瘤异质性是恶性肿瘤的特征之一,单细胞测序技术是在单个细胞水平上进行全基因组、转录组以及表观遗传学测序,从而为肿瘤异质群体的细胞亚群分类提供依据,进而有效揭示肿瘤细胞内有关遗传、转录和表观遗传水平复杂性改变的过程。本文介绍测序技术的进展、单细胞测序技术方法以及单细胞测序技术在具体肿瘤中的应用进展,并对其发展前景进行了展望。     

单细胞转录组测序技术及其在肿瘤研究中的应用

单细胞转录组测序是指对单个细胞的全部RNA进行逆转录、扩增和测序,再进行生物信息学分析的技术。自2009年Tang等基于高通量测序平台开始单细胞转录组测序之后,该技术发展突飞猛进。由于该技术能在单细胞水平诠释细胞的异质性,因此已广泛应用于生命科学各领域尤其是肿瘤等疾病研究。本文将主要综述单细胞转录组测序技术流程和技术发展,及其在肿瘤异质性、肿瘤转移、肿瘤微环境、肿瘤药物等研究中的应用进展。     

单细胞测序技术在妇科恶性肿瘤研究中的应用

妇科恶性肿瘤包括宫颈癌、卵巢癌、子宫内膜癌等,具有高度的异质性,一旦进入晚期,预后往往不良。单细胞测序技术的出现和发展为在单个细胞水平上探究肿瘤发生发展的机制,鉴定稀有细胞,绘制细胞谱系,指导肿瘤靶向精准治疗和预测患者预后等提供了更好的平台。本文就单细胞测序技术的兴起与发展及其在妇科恶性肿瘤研究中的应用进行综述。     

单细胞转录组测序技术及其在肿瘤研究中的应用进展

单细胞转录组测序是指对单个细胞的全部RNA进行逆转录、扩增和测序后再进行生物信息学分析的技术,近年来发展迅猛。该技术能在单细胞水平诠释细胞的异质性,已广泛应用于生命科学各领域尤其是肿瘤等疾病的研究。本文主要介绍单细胞转录组测序技术的流程和技术发展,同时分析总结其在肿瘤异质性、肿瘤转移、肿瘤微环境和抗肿瘤药物研发等方面的应用进展。     

结直肠癌肝转移瘤远癌组织亚细胞结构与表达谱改变

目的:探讨结直肠癌肝转移瘤中肝脏远癌组织的亚细胞结构与表达谱改变情况。方法:电镜观察人体肝脏远癌组织亚细胞结构变化,通过建立动物结直肠癌肝转移模型观察小鼠远癌肝组织亚细胞结构变化;利用转录组测序探究动物模型中肝脏远癌组织的表达谱改变。结果:人与小鼠肝转移组织中的亚细胞结构均发生异于正常组织的改变。转录组分析结果显示在远癌组织中上调基因的表达和富集通路均与肿瘤发生发展相关。结论:远癌组织的形态结构与基因表达发生类似于肿瘤组织的改变。     

肿瘤相关基因ADAM15在结肠癌中一个非同义变异对细胞黏附及侵袭的影响

目的 解析ADAM15基因单核苷酸变异(single nucleotide variant, SNV)在结肠癌肿瘤发生发展相关的细胞学过程中的具体功能作用。方法 首先对具有侵袭表型的结肠癌患者癌组织及癌旁组织全外显子组测序,然后进行野生型/突变型ADAM15结肠癌HCT-8细胞系细胞功能实验,进而完成野生型/突变型ADAM15细胞系的转录组测序分析。结果 采用全外显子组测序在预后不良的患者中检出ADAM15基因SNV rs6427128,提示可能影响结肠癌的进展。细胞功能实验显示,rs6427128损失了ADAM15所具有的上调细胞侵袭能力的作用,而使细胞黏附能力增加约26%。转录组测序分析显示,与野生型相比,rs6427128过表达细胞的差异表达基因富集在细胞黏附、DNA的复制与转录、炎症反应等多种细胞生物学过程,提示rs6427128变异可能通过促进肿瘤细胞的黏附参与调节肿瘤微环境的重塑,从而影响结肠癌的进展。结论 结合适当的细胞模型和较为精细的分析方法,深入解析临床样本中所检出的一些高频非同义潜在功能性变异体,可以为肿瘤相关基因的结构功能关系提供有益的提示性实验室数据。     

激光捕获显微切割技术在肿瘤分子病理学中的应用原理及研究进展

组织发生、分化以及病理改变是多基因调控的复杂过程。要在基因水平了解其机制,就必须准确深入地分析特定细胞基因结构和表达的动态变化。为了阐明在肿瘤发生和发展不同阶段如不典型增生、原位癌、浸润癌及转移癌发生时特定细胞内的分子生物学改变,以及前一阶段向后一阶段进展时,其关键的分子生物学改变是什么等重要信息,需要获得单一的同类细胞群。组织是多种细胞群体相互作用的三维空间结构,但以往的各种技术所获得的细胞,其内既有肿瘤细胞,又多少不等地含有一些其他细胞。同时,体外培养的细胞系虽能解决组织异质性问题,但其培养环境与组织内环境有一定差距,因此,无法真实反映在体内复杂环境下生长的肿瘤细胞具有的各种特性。组织细胞异质性已成为肿瘤基因组学研究的一大障碍。而激光捕获显微切割技术（Laser capture microdissection,LCM）是一项在显微镜直视下从组织切片中确定、分离、纯化单一类型细胞群或单个细胞的技术,它成功解决了细胞异质性问题,是肿瘤基因组学研究的一项革命性技术。     

单细胞测序技术在慢性阻塞性肺疾病研究中的应用进展

慢性阻塞性肺疾病简称慢阻肺病,是基因与环境相互作用导致的多基因疾病,以持续气流受限为主要临床特征。目前缺乏可靠的慢阻肺病的早期诊断方法,不能及时对早期慢阻肺病患者进行有效干预,无法阻止疾病的进展,导致其发病率、患病率和死亡率高,造成严重的疾病负担。随着人类细胞图谱计划的启动和测序技术的发展,单细胞测序的应用前景被广泛看好,它是在单个细胞水平上对基因组、转录组和蛋白质组等进行测序分析的一项新技术,够揭示单个细胞的基因结构和表达,发现细胞间的异质性和稀有细胞等。为研究新技术以助于深入研究慢阻肺病的发病机制、发现早期诊断方法及新的治疗方法,本文就单细胞测序技术及其在慢阻肺病研究中的应用进展进行综述。     

DNA甲基化与肿瘤

DNA甲基化是一种重要的基因调控方式，DNA甲基化水平的改变在肿瘤的发生、发展中有重要的作用，DNA甲基化改变引起细胞中C→T突变、癌基因的低甲基化、抑癌基因的高甲基化、错配修复基因异常以及诱导染色体不稳定从而导致肿瘤的发生，利用肿瘤发生中DNA甲基化特征可对其进行有效的治疗。     

单细胞测序在儿科疾病中的应用进展

单细胞测序是一项新兴的测序技术,指在单个细胞水平上对细胞基因组和转录组等组学进行测序。相比传统的测序方法,单细胞测序在揭示生物异质性方面具有独特优势,有利于更深层次地揭示疾病发生、发展的机制。同时,单细胞测序在发现稀有细胞群体、展现细胞起源和分布状态、检测生物标志物中也发挥重要作用,其研究成果涉及了免疫治疗、靶向用药、胚胎发育等众多领域,该技术正逐渐成为由基础研究向临床转化的桥梁。本文就单细胞测序的主要流程及该技术在儿童肠道疾病、免疫性疾病、肿瘤等领域的应用进展作一综述,探讨该技术在儿童群体中的未来发展方向,以期更好地应用于后续儿科疾病的诊治。     

同源盒基因与肿瘤的研究进展

同源盒(HOX)基因是一种多基因家族的转录调节基因,通过结合DNA来对目的基因进行激活或抑制,在肿瘤的发生、发展中可对胚胎的发育和分化进行调节,在细胞增殖和分化中发挥重要的作用。在不同种类的肿瘤组织中,HOX基因表达水平也不同,另外,肿瘤的组织学类型及肿瘤发生位置不同,其表达水平也不尽相同。实体肿瘤中HOX基因的表达水平存在的这种差异为研究肿瘤的发生、发展提供可能,同时可以通过改变其异常的基因表达达到抑制肿瘤发生、发展的目的。     

单细胞转录组测序在肺部疾病中的应用进展

单细胞转录组测序又称单细胞RNA测序,是通过分离单个细胞获得它们的转录本,并将转录本映射到单个细胞的测序库,进而分析评估细胞特性的一项高通量测序技术。近年来单细胞转录组测序技术已广泛应用于肺部疾病的研究,以深入了解疾病状态下肺组织细胞的生物学特征。本文对单细胞转录组测序技术的基本原理及其在肺部疾病研究中的应用进展进行综述,为各种常见肺部疾病状态下肺组织的细胞异质性、亚群鉴定及基因表达调控机制等相关研究的开展提供参考。     

多肿瘤抑制基因P_(16)研究进展

<正> 肿瘤是人类生命面临的最大难题之一。随着分子生物学和基因工程迅速发展,使我们认识到肿瘤发生的关键是正常细胞内基因组发生了改变。自发的化学、物理性及病毒性致癌因素只是诱因,基因改变才是肿瘤发生的根本原因。在癌基因研究的基础上,人们发现细胞基因组还存在着抑     

基因表达谱及其在人体肿瘤研究中的应用

肿瘤发生是遗传、环境等多种致瘤因子共同作用的结果,经历了多个不同的发展阶段。每一阶段中机体机能的改变必然反应一系列基因功能的变化,构成机体在每一种机能状态时的特征性基因表达。要揭示肿瘤发生、发展的规律,最终找到攻克肿瘤的可靠途径,必须从研究肿瘤相关基因入手。基因芯片提供了一种大通量研究手段,通过基因芯片构建肿瘤相关基因表达谱,研究肿瘤相关基因在肿瘤发生、发展过程中的功能,就是找到了研究肿瘤发生、发展规律的金钥匙,为肿瘤病原、病因、病理学研究,各种肿瘤的临床诊断、治疗药物筛选、预后判断、治疗效果监测甚至肿瘤预防等领域的研究开辟了广阔的前景。     

空间转录组测序技术在肿瘤发生发展机制中的应用及前景

恶性肿瘤是一类死亡率较高的疾病, 其发生、发展机制较为复杂, 基因组测序技术对揭示肿瘤作用机制有一定意义。肿瘤组织中的细胞具有异质性, 而细胞的空间位置分布对其异质性及组织生物功能有一定的影响。近几年, 空间转录组测序技术发展迅速, 可以对组织中细胞进行高通量、高分辨率的空间转录分析, 从空间层面上展示转录组信息, 揭示生物组织的细胞构成以及细胞间的相互作用关系。本文将对空间转录组测序技术在肿瘤中的应用进行阐述、前景进行展望。     

自噬在肿瘤耐药中的作用研究进展

自噬是一种通过溶酶体途径分解代谢细胞内组分的过程。在细胞应激状态下,细胞通过自噬清除线粒体等损坏的细胞器和蛋白。在肿瘤发生发展的早期和晚期,自噬发挥的作用是不同的:肿瘤发生早期,自噬降低肿瘤原发性基因不稳定性和蛋白聚集,以及激发抗肿瘤性免疫应答;在成熟的肿瘤中,细胞通过自噬对营养不足以及细胞过度增殖所致的代谢应激产生抵抗。自噬不仅促进肿瘤细胞存活,在特殊条件下,也可导致肿瘤细胞自噬性细胞死亡。自噬性细胞死亡可增加发生凋亡的肿瘤细胞对辐射治疗的敏感性。因此,肿瘤发生及肿瘤治疗中自噬的作用是双向的,需要更加深入的研究阐明自噬在肿瘤中发挥作用的详细机制。本文对自噬在肿瘤细胞化疗耐药中发挥作用的研究进展进行综述。     

肿瘤标志的基础与临床应用(九)

10血中癌基因蛋白 随着肿瘤分子生物学的发展,人们把目光逐渐转向了癌基因。已经公认,癌基因的异常表达是肿瘤发生的起因。癌基因仅存在于细胞中,无法作为常规无创检查项目。随着检测技术的进步,学术界开始考虑血清癌基因表达蛋白作为肿瘤标志用于诊断的可能性。迄今为止,虽然已发现了近100个癌基因与肿瘤发生、发展有关,但仅有少数几种癌基因蛋白可在血清中检出。 10.1 ras基因蛋白:ras族基因编码     

在结直肠肿瘤发生的过程中β-catenin突变不伴随K-ras突变

APC、K-ras和β-catenin基因的突变被认为是结直肠肿瘤发生过程中的早期改变。众所周知,这些突变是Vogelstein肿瘤发生模式的组成部分,然而它们之间的关系尚不清楚。评价它们之间的关系对于理解结直肠肿瘤发生很重要。分析临床结直肠标本的β-catenin和K-ras基因突变的关系。选取无结直肠癌家族史的64例结直肠癌病例(44例为近端肿瘤,20例为远端肿瘤)进行研究。通过对新鲜手术标本的纯化基因组DNA进行采用AmpliTaq聚合酶FS的BigDye终止子循环测序试剂盒的PCR直接测序,分析β-catenin(外显子3)和K-ras(密码子12和13)的突变。发现存在2…     

转录组的重编写：腺苷到肌苷RNA碱基在肿瘤进展中的作用

腺苷至肌苷RNA编辑（AIRE）是指转录前体RNA在腺苷酸脱氨酶的作用下,某些位点的腺苷发生脱氨反应转变成肌苷的过程,在碱基配对时,肌苷被识别作鸟苷,导致转录组重编写。随着高通量测序技术的不断进步,大量异常的AIRE被发现可导致氨基酸编码改变、RNA剪切异常以及microRNA-mRNA重定向等过程,从而参与肿瘤的发生发展。绝大部分的AIRE位点均位于基因非编码区,解析它们的生物学功能仍存在一定的挑战。本综述旨在描述AIRE的生物学机制和AIRE位点在不同肿瘤发生发展作用的进展,为AIRE与肿瘤的研究提供思路。