基于数据挖掘分析肺腺癌中ARHGEF16的表达及其临床意义

目的探讨Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子16(Rho guanine nucleotide exchange factor 16, ARHGEF16)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法使用Oncomine数据库挖掘ARHGEF16的信息,并对ARHGEF16在肺腺癌中的表达及临床意义进行分析,采用SPSS 22.0软件进行统计学分析,Graphpad Prism 7.0绘制患者生存曲线。结果与正常肺组织相比,肺腺癌组织中的ARHGEF16基因呈高表达(P0.001)。在肺腺癌组织中,EPHB3基因与ARHGEF16表达有相关性(r=0.933)。肺腺癌患者的总生存期与ARHGEF16基因高表达呈负相关(P=0.032)。结论肺腺癌组织中ARHGEF16的表达高于对应正常肺组织,且与患者预后呈负相关,提示ARHGEF16可能参与肺腺癌的发生、发展。     

C-erbB2过度表达对肺腺癌预后的临床观察

目的：前瞻性探讨C-erbB2表达等指标对肺腺癌的复发及生存期的影响。方法：采用免疫组化等方法检测70例肺腺癌的病理标本C-erbB2表达等，并长期随访患者。结果：患者的KPS评分、肿块大小、有无远处转移、TNM分期以及C-erbB2表达等与肺腺癌复发及生存期有关（P〈0．05）。结论：患者的KPS评分、肿块大小、有无淋巴结转移、TNM分期以及C-erbB2表达等指标可以预测肺腺癌的预后。     

基于生物信息学方法分析SHCBP1基因在肺腺癌中的表达及临床意义

目的：分析SHC的SH2结构域结合蛋白1(SHCBP1)在肺腺癌（LUAD）中的表达及临床意义。方法：应用Oncomine、TIMER、UALCAN、GEPIA、Kaplan-Meier plotter、STRING数据库探索SHCBP1对LUAD进展及免疫浸润的影响。结果：LUAD组织中SHCBP1 mRNA表达显著高于正常肺组织（P<0.05）。有吸烟史、发生淋巴结转移、临床分期较晚、TP53突变的LUAD患者组织中SHCBP1 mRNA表达明显升高（P<0.05）。GEPIA和Kaplan-Meier plotter数据库进行的生存分析表明SHCBP1 mRNA高表达的LUAD患者总体生存率较低（P<0.05）。SHCBP1 mRNA与LUAD肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞标记物、免疫检查点表达相关。结论：SHCBP1高表达与LUAD患者的不良预后和肿瘤免疫浸润相关。     

基于数据挖掘探讨BOLA2在肺腺癌中的表达及临床意义

目的：探讨BOLA2在肺腺癌（LUAD）与正常肺组织中的表达差异及临床意义。方法：Oncomine探讨LUAD与正常肺组织中BOLA2表达差异。UALCAN数据库分析BOLA2在LUAD中的表达及与患者临床特征的关系。通过Kaplan-Meier和多因素Cox回归分析BOLA2表达水平与LUAD患者预后的关系。LinkedOmics数据库探讨BOLA2相关基因的表达及其KEEG通路。TISIDB数据库分析BOLA2表达与免疫浸润水平的关系。结果：在LUAD中,BOLA2表达明显高于正常组织,并与患者临床特征（吸烟、淋巴结转移等）相关。LUAD中BOLA2蛋白及甲基化水平升高。过表达的BOLA2与LUAD患者短生存期显著相关,是LUAD预后不良的独立危险因素。BOLA2与PPP4C、MRPL12等基因呈显著正相关,与KIAA1109呈显著负相关。BOLA2与其相关基因可能参与核糖体、蛋白酶体等通路过程。BOLA2表达与多种免疫细胞浸润（NK细胞、记忆CD4 T细胞等）相关。结论：BOLA2在LUAD中高表达,其可能影响免疫微环境并为预后不良的指标,有望成为LUAD精准治疗的潜在生物标志物...     

高表达SKA3预示肺腺癌患者预后不良

目的:旨在揭示纺锤体与动粒相关蛋白3(SKA3)在肺腺癌中的表达、潜在的临床价值及其可能的调节机制.方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库RNA表达数据分析SKA3在肺腺癌中的表达,Wilcoxon秩和检验和逻辑回归分析肺腺癌患者的临床病理学特征与SKA3之间的相关性.Cox回归和Kaplan-Meier生存分析与...     

肺腺癌预后代谢相关基因的生物信息学分析

目的 基于代谢基因的生物信息学构建肺腺癌预后模型及验证。方法 获取癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因表达数据集(GEO)肺腺癌相关数据,套索(LASSO)回归构建多基因预后模型并计算风险值(RS)。单因素、多因素Cox独立预后分析,通过受试者工作特征(ROC)曲线评价模型的ROC曲线下面积(AUC)并进行生存分析。构建列线图评价模型的可行性,通过基因集富集分析(GSEA)进行代谢基因功能富集分析。肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析患者RS与免疫细胞浸润以及与免疫检查点分子表达的相关性。结果 运用TCGA数据库基于18个代谢相关基因构建肺腺癌预后模型,RS可以作为独立的预后因子。ROC曲线下面积为0.713。生存分析显示,与高风险组相比,低风险组总体生存率更高,预后模型与免疫细胞的浸润以及与免疫检查点分子的表达有关。结论 代谢相关基因肺腺癌预后模型的RS是独立预后因子,模型具有较高的预后判断价值。     

肺腺癌中α5-nAChR和VEGF的表达相关性及其对血管形成的影响

目的 探讨α5-nAChR与VEGF在肺腺癌中表达的相关性及α5-nAChR对血管形成的影响.方法 检索Oncomine、GE-PIA、Kaplan-Meier Plotter数据库分析肺腺癌中编码α5-nAChR的CHRNA5基因和VEGF基因表达相关性及预后情况.干扰A549细胞CHRNA5表达后,制备肿瘤条件培养...     

肺腺癌中CALHM2、PD-L1的表达及其预后分析

目的 探讨肺腺癌中钙稳态调节剂2(calcium homeostasis modulators 2, CALHM2)、PD-L1的表达及其预后特征。方法 利用GEPIA2数据库分析CALHM2 mRNA的表达及其预后;收集544例肺腺癌临床资料,采用免疫组化检测CALHM2、PD-L1的表达,分析两者表达与临床病理特征及预后的关系。结果 GEPIA2数据库分析显示,CALHM2 mRNA在肺肿瘤组织中明显低表达(P<0.05)。544例肺腺癌中CALHM2表达呈三种模式,包括胞质239例(43.9%)、胞核156例(28.7%)及胞质核共表达103例(18.9%)。其中,男性、有吸烟史及中分化腺癌中CALHM2胞质表达较多(P<0.05)。相关性分析显示,CALHM2的表达模式与PD-L1存在一定相关性(P<0.05)。Kaplan-Meier生存分析：单纯CALHM2胞核表达及伴PD-L1≥1%患者CALHM2胞核表达者的预后均明显优于胞质表达者(P<0.05)。结论 肺腺癌中CALHM2呈胞核、胞质表达,结合PD-L1表达共同分析可初步评估患者的预后。     

肺腺癌中微乳头结构临床病理及预后意义的探讨

目的探讨肺腺癌中微乳头结构对肿瘤侵袭行为及其对预后的影响。方法选择具有完整临床病理及随访资料结果的肺腺癌91例,将病例分成微乳头结构阳性组（41例）和阴性组（50例）。阳性组按照该成分占肿瘤的多少又分成微乳头结构＋（占肿瘤的1％～10％）,＋＋（占肿瘤的11％～30％）,＋＋＋（超过肿瘤的30％）。结果总的5年生存率是64．8％。临床分期5年生存率分别为Ⅰ期88．9％、Ⅱ期46．2％、Ⅲ期23．8％。不同临床分期病例间的生存率差异有统计学意义（P=0．000）。微乳头结构含量多少与临床分期、肿瘤大小和5年生存率无关,P值分别是0．065、0．358、0．206。而微乳头结构阳性组和阴性组5年生存率分别是：41．5％和84．0％,P=0．000,且淋巴结转移率前者（65．9％）明显高于后者（20．0％）,P=0．000。有无微乳头结构与临床分期和肿瘤大小有关,P值均为0．000,即分期越晚,肿瘤越大,出现此结构的几率越高。而有无微乳头结构与性别、吸烟史无关。同一临床分期中阳性组与阴性组5年生存率分别是：Ⅰ期：78．6％、92．6％（P=0．1548）;Ⅱ期：30．0％,100％（P=0．0598）;Ⅲ期：17．7％,28．6％（P=0．4045）,但差异无统计学意义。结论肺腺癌中微乳头结构成分提示肿瘤高侵袭转移行为,是影响预后的重要因素,该病理形态的出现应提醒临床采取积极治疗措施并密切随访。     

The Effects of Cyclic Stretching on the Proliferation of Lung Adenocarcinoma Cells in Vitro

Using FX-4000 strain unit, the prolieration in human lung adenocarcinoma A549 cells that underwent mechanical strain of different waveform、frequency and duration were studied. Image analysis revealed that cellular proliferation rate(PR) reduced significantly after cells were subjected to square wave with 0～20% elongation at frequency 30,40,50 and 60 cycles/min for 2h. The PR had no distinct difference at heart wave , triangle wave and sine wave group compared with control. It is concluded that square wave and higher frequency play an important role in inhibiting A549 cells proliferation.     

基于深度学习的肺腺癌肿瘤突变负荷的预测

肿瘤突变负荷(TMB)与非小细胞肺癌(NSCLC)的免疫治疗疗效呈正相关,并且在近期的相关研究中,肿瘤突变负荷对靶向治疗及化疗的疗效也有一定的预测作用.因此,提出一种融合注意力机制的Inception深度学习模型(CAIM),用于对TCGA数据库中的非小型细胞肺癌中的肺腺癌的病理切片进行识别.首先,对数据样本进行切分,...     

精准医学背景下肺腺癌肿瘤标志物的研究进展

该文基于测序技术和人类基因组计划的不断发展,对医学工作者和生物信息工作者在肺腺癌领域取得的成果进行归纳分析,阐述了肺腺癌标志物的研究进展等。该文首先介绍了传统通过血清检测的肺腺癌标志物的研究进展,梳理了传统标志物从单一检测到联合检测的发展过程。其次介绍了在精准医学背景下,以多组学数据为依据的肺腺癌肿瘤标志物的研究进展。最后对该领域后期工作提出了展望,有利于研究人员准确掌握发展动态,开阔研究思路。     

双丁酰cAMP对癌细胞膜上凝集素受体的影响及其与侵袭能力的相关性

双丁酰ｃＡＭＰ是一种诱导分化剂，对体外培养的癌细胞具有一定诱导分化作用。本文着重观察了双丁酰ｃＡＭＰ对培养的人肺腺癌细胞膜上多种凝集素受体表达的影响，并将体外经双丁酰ｃＡＭＰ处理的癌细胞接种于裸鼠皮下，观察移植瘤自发性生长状况。结果表明，经双丁酰ｃＡＭＰ处理的人肺腺瘤细胞表面数种凝集素受体表达降低，同时伴有移植后成瘤潜伏期延长、侵袭能力下降。由于癌细胞膜结构和功能的改变与癌细胞的识别粘附及侵袭能力密切相关，这一结果提示双丁酰ｃＡＭＰ对癌细胞膜的影响可能是恢复癌细胞间粘附识别作用，降低其侵袭能力的机制之一。     

基于数据挖掘的罗秀丽教授治疗三阴性乳腺癌的临床经验研究

目的 借助数据挖掘方法,客观总结罗秀丽教授中医药治疗三阴性乳腺癌的临床经验。方法 以罗秀丽教授2018年1月~12月收治的三阴乳腺癌患者68例为资料建立数据库,借助中医传承辅助平台（V2.5）的数据挖掘技术分析患者的年龄、证型、中药四气五味归经的分布与用药的关联规律。结果 患者年龄主要集中在40~69岁（77.94%）,证型以肝郁气滞证和脾虚痰湿证为主;用药频次前3位的依次为甘草、鳖甲、猪殃殃;治法以清热解毒为主,用药以平、温、微寒为主,少用大寒大热之品。置信度最高的药对为猪殃殃和鳖甲,置信度最高的药组为天葵子、猪殃殃、鳖甲。结论 罗秀丽教授认为乳岩多与肝脾二脏有关,治疗上多以清热解毒为主,用药时注重顾护脾胃,以甘平为主,擅长用药对、药组。     

数据挖掘在研究住院费用的应用

本文以病毒性肝炎为例，通过数据挖掘的过程，分析病毒性肝炎的住院费用情况，最后分别给出了病毒性肝炎的费用控制的上下限，从而起到控制医院的住院费用的作用。     

The Different Effect of VEGF Polymorphisms on the Prognosis of Non-Small Cell Lung Cancer according to Tumor Histology

Vascular endothelial growth factor (VEGF) contributes to tumor angiogenesis. The role of VEGF single nucleotide polymorphisms (SNPs) in lung cancer susceptibility and its prognosis remains inconclusive and controversial. This study was performed to investigate whether VEGF polymorphisms affect survival outcomes of patients with early stage non-small cell lung cancer (NSCLC) after surgery. Three potentially functional VEGF SNPs (rs833061T>C, rs2010963G>C, and rs3025039C>T) were genotyped. A total of 782 NSCLC patients who were treated with surgical resection were enrolled. The association of the SNPs with overall survival (OS) and disease free survival (DFS) was analyzed. In overall population, none of the three polymorphisms were significantly associated with OS or DFS. However, when the patients were stratified by tumor histology, squamous cell carcinoma (SCC) and adenocarcinoma (AC) had significantly different OS (Adjusted hazard ratio [aHR] = 0.76, 95% CI = 0.56–1.03 in SCC; aHR = 1.33, 95% CI = 0.98–1.82 in AC; P for heterogeneity = 0.01) and DFS (aHR = 0.75, 95% CI = 0.58–0.97 in SCC; aHR = 1.26, 95% CI = 1.00–1.60 in AC; P for heterogeneity = 0.004) according to the rs833061T>C genotypes. Our results suggest that the prognostic role of VEGF rs833061T>C may differ depending on tumor histology.     

基于数据挖掘技术的消化道恶性肿瘤诊断

目的 探讨数据挖掘技术在血清肿瘤标志物（STM）联合检测诊断消化道恶性肿瘤（DTC）中应用的可能性,并比较Logistic回归模型、神经网络和朴素贝叶斯分类器及临床单一及联合STM诊断DTC的性能.方法 对301例DTC和114例消化道良性疾病患者的血清肿瘤标志物CA19-9、CA242、CA50、CEA检测值,分别建立基于统计Logistic回归、反向传播神经网络和朴素贝叶斯方法的诊断分类器,并进行10折交叉验证.利用诊断敏感度、特异度和接受者操作特征（ROC）曲线下面积对三种数据挖掘分类器、CA19-9以及4种STM并联诊断DTC的性能进行评价.结果 神经网络诊断模型的敏感度和ROC曲线下面积（Az）分别为92.0%和0.903,高于STM并联诊断的敏感度83.4%（P＜0.001）和CA19-9诊断的ROC曲线下面积0.806（P＜0.001）,特异度69.3%与STM并联诊断的特异度68.4%相当（P=1.00）;Logistic回归模型的敏感度91.4%高于STM并联诊断（P＜0.001）,特异度45.6%低于STM并联诊断（P＜0.001）,Az=0.819与CA19-9诊断相当（P=0.55）;贝叶斯分类器的敏感度72.8%低于STM并联诊断（P＜0.001）,特异度75.4% 和Az=0.797与STM并联诊断和CA19-9诊断相当（P=0.13和P=0.61）.结论 数据挖掘技术的分类方法中,神经网络的分类方法比单一STM及其并联诊断的准确性高,Logistic回归和贝叶斯方法的诊断水平与普通STM并联诊断水平相当;神经网络分类器的诊断性能优于Logistic回归模型和贝叶斯分类器,可进一步应用于计算机辅助诊断中.     

重组人血管内皮抑素联合放疗对Lewis肺癌小鼠肿瘤生长及VEGF表达的影响

目的:研究重组人血管内皮抑素(rh-Endostatin,YH-16,恩度)对不同放射剂量治疗的Lewis肺癌小鼠肿瘤生长及血管内皮生长因子(VEGF)表达的影响。方法:制作Lewis肺癌细胞接种肿瘤的动物模型,并将60只模型小鼠随机分为5组:A,空白对照组(不予任何治疗);B,小剂量多次放疗组(1Gy/f,隔日一次,共4次);C,大剂量单次放疗组(4Gy/f,共1次);D,小剂量多次放疗联合恩度组(放疗前4天起每天右侧腹股沟区皮下注射恩度0.1ml,共15天,放射剂量为1Gy/f,隔日一次,共4次);E,大剂量单次放疗联合恩度组(放疗前4天起每天右侧腹股沟区皮下注射恩度0.1ml,共15天,放射剂量为4Gy/f,共1次)。分别给予上述处理后计算抑瘤率,并用免疫组化SP法测定各组VEGF的阳性表达率。结果:与C、E组比较,B、D组的抑瘤作用及VEGF表达下降明显(P<0.05),尤以D组抑瘤更强(P<0.05)、VEGF下降最多(P<0.05)。结论:放疗前使用恩度可使Lewis肺癌小鼠对放疗的敏感性增加,其机制可能与下调VEGF的表达有关。