应用mNGS技术诊断鹦鹉热衣原体肺炎临床特征分析

目的 分析总结鹦鹉热衣原体肺炎患者临床特征,以提高该疾病早期诊断能力及救治水平。方法 回顾性分析空军军医大学第一附属医院、吉林大学第一医院二部、西安交通大学第二附属医院呼吸与危重症医学科于2018年1月-2022年1月经宏基因组二代测序（mNGS）方法确诊的14例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,分析总结其临床特点。结果 14例患者中仅2例有明确的鸟类或禽类接触史。所有患者均急性高热起病,10例伴呼吸道症状。白细胞计数正常13例,中性粒细胞百分比升高7例。所有患者超敏C反应蛋白、白细胞介素-6、血沉均显著升高。所有患者胸部CT均表现为斑片影和/或实变影,可累及不同肺叶,但所有患者肺下叶均受累。所有患者均经支气管肺泡灌洗液或外周血mNGS检查确诊。经多西环素、米诺环素、莫西沙星、阿奇霉素单药或两药联合方案,13例患者均好转出院,1例死亡。结论 高热伴胸部影像学异常应考虑鹦鹉热衣原体肺炎可能,其快速精准诊断有赖于m NGS技术,早期靶向抗生素治疗效果良好。     

二代测序辅助诊断鹦鹉热衣原体肺炎3例报道并文献复习

鹦鹉热衣原体肺炎是一种由鹦鹉热衣原体感染引起的人畜共患病,通过受感染的鸟类传播。由于病原学培养及血清学诊断困难,其误诊和漏诊时有发生,大规模流调也难以开展。本文报道浙江大学医学院附属杭州市第一人民医院收治的3例鹦鹉热衣原体肺炎患者,其中2例有病情快速进展,重症化趋势。均有禽类、鸟类接触史,临床表现有咳嗽咳痰、呼吸困难、呼吸衰竭,1例行高流量呼吸支持治疗,最终通过宏基因二代测序（mNGS）技术辅助诊断鹦鹉热衣原体肺炎,3例患者经治疗好转出院。本文提示病原学诊断在鹦鹉热衣原体肺炎中具有重要地位,而mNGS对于诊断这种少见复杂的感染性疾病是有效的补充手段。     

9例重症鹦鹉热衣原体肺炎的临床特点及诊治分析

目的 探讨重症鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床特点及宏基因二代测序(mNGS)在其病原学诊断中的应用。 方法 收集2019年11月-2021年2月住院的重症鹦鹉热衣原体肺炎患者9例,男性5例,女性4例,年龄中位数67岁。回顾性分析患者的病历资料,描述其临床表现、实验室检查、影像学特点、mNGS病原学结果及治疗过程。 结果 9例中,4例发病前接触过鸟类或禽类。临床表现主要为高热、咳嗽、呼吸困难、乏力、肌肉酸痛;白细胞计数正常或轻度升高,中性粒细胞比例和降钙素原明显升高,部分患者出现肝、肾功能异常;胸部CT检查主要表现为单侧或双侧肺叶斑片状实变影。所有患者均进行mNGS检测,均检出鹦鹉热衣原体核酸序列,予多西环素单药或联用莫西沙星为基础的治疗,均痊愈。 结论 鹦鹉热衣原体肺炎发病率低,但病情危重,对疑似病例应尽早完善mNGS检测,及时启动以四环素类药物为基础的治疗方案。     

鹦鹉热衣原体肺炎临床及病理学特征分析

目的 通过分析鹦鹉热衣原体肺炎的临床及病理学特征,加深对鹦鹉热衣原体肺炎的认识。方法 回顾性分析2021年11月-2022年11月于南京医科大学附属明基医院经mNGS诊断的5例鹦鹉热衣原体肺炎并有气管镜下肺组织活检病理结果的患者临床及病理学特征。结果 5例患者中,男2例,女3例;平均年龄（65±9）岁;住院时间（11～13）d;5例患者首发症状均为发热;其中有3例合并低氧血症;其伴随症状包括畏寒、寒战、乏力、头痛、咳嗽咳痰、肌肉酸痛、听力下降等。实验室指标中,白细胞计数基本无明显异常,炎性因子中C反应蛋白和降钙素原偏高。肺部CT表现中,单侧病变较多,以右侧为著（3例）;形态有肺部实变、磨玻璃影、胸腔积液、胸膜增厚等;肺泡灌洗液mNGS结果显示,5例患者BALF均检出鹦鹉热衣原体;肺组织活检病理示肺间质内纤维明显增生,部分纤维化,伴组织细胞反应及少量淋巴细胞浸润。结论 对疑似鹦鹉热衣原体感染的肺炎患者,尽快明确诊断并及时抗感染治疗,避免肺间质进一步受损最终导致肺功能恶化以及进展为重症肺炎。     

鹦鹉热肺炎11例临床特征分析

目的探讨鹦鹉热肺炎的临床特点、诊治方法和预后,提高对本病的认识。方法回顾性分析2019年12月至2020年12月海宁市人民医院确诊的11例鹦鹉热肺炎患者的临床资料。结果6例鹦鹉热肺炎患者均有明确禽类接触史。所有患者均出现发热症状,其次表现为咳嗽、咳痰、胸闷等;可伴有Hb下降,降钙素原、CRP升高;均出现电解质紊乱和凝血功能异常;胸部影像表现：肺实变伴支气管充气征10例,可合并磨玻璃影、叶间裂牵拉、小叶间隔增厚,单侧肺累及8例,双侧肺累及3例;胸腔积液9例。11例患者给予四环素类、大环内酯类或者喹诺酮类药物治疗,均好转出院。结论鹦鹉热肺炎临床表现、影像学特征不典型,支气管肺泡灌洗液宏基因组二代测序可早期、及时诊断。     

10例鹦鹉热衣原体肺炎的临床特征分析

目的 分析鹦鹉热衣原体肺炎的临床特征,以提高临床医生对该类疾病的早诊早治水平。方法 回顾性分析2020年3月至2022年4月重庆大学附属江津医院收治的经宏基因组二代测序(mNGS)诊断的10例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,收集患者基本情况、临床表现、实验室检查[WBC、淋巴细胞计数(LYM)、中性粒细胞百分比、C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、红细胞沉降率(ESR)、Fe²⁺、AST、ALT、脑钠肽(BNP)、尿白蛋白]、影像学表现、mNGS检测结果、治疗及转归并总结归纳。结果 10例鹦鹉热衣原体肺炎患者中男6例,女4例,年龄47～90岁,中位年龄57.5岁;主要表现为发热10例(其中5例高热),咳嗽7例,相对缓脉7例,头痛5例,咯痰4例;80%的病例有明确鸟类或家禽类接触史。8例WBC正常,7例LYM降低,8例中性粒细胞百分比升高,9例CRP升高(5例>200 mg/L),6例PCT正常,10例血Fe²⁺降低。9例肺部表现为边界模糊的斑片实变影,1例表现为反晕征,所有患者病灶均累及胸膜,但胸腔积液者仅3例。10例患者均以支气...     

重症鹦鹉热衣原体肺炎四例及文献复习

社区获得性肺炎由鹦鹉热衣原体感染引起约占1%[1],鹦鹉热衣原体肺炎临床表现无特征性,部分患者可表现为重症,进展迅速,如不能及时明确病原体,可导致多脏器功能衰竭,危及生命。宏基因组二代基因测序（mNGS）是一种精准诊断病原体的检测技术,能够快速从患者体液、病变组织中检测到病原体信息,已越来越多地用于感染性疾病的病原体诊断。本研究通过4例重症鹦鹉热衣原体肺炎的临床特点进行回顾性分析,探讨肺泡灌洗液宏基因组二代测序技术对疾病的快速诊断及指导治疗的意义。     

鹦鹉热衣原体肺炎并发机化性肺炎一例并文献复习

目的 阐述鹦鹉热衣原体肺炎并发机化性肺炎的临床特点、诊治要点及可能机制。方法 报道鹦鹉热衣原体肺炎并发机化性肺炎1例。并以“鹦鹉热衣原体”和“机化性肺炎”为检索词,检索中国知网、万方、维普数据库,以“psittacosis”或“Chlamydia psittaci”和“organizing pneumonia”为检索词,检索PubMed数据库。结果 该鹦鹉热衣原体肺炎并发机化性肺炎患者主要表现为咳嗽、咳痰伴持续高热,外院给予喹诺酮治疗后病情仍进展,行肺泡灌洗液宏基因组测序检出鹦鹉热衣原体,并经冷冻肺活检病理示机化性肺炎,给予抗感染联合激素治疗后病情好转,复查胸部CT病灶较前明显吸收,患者最终好转出院。国内外有两篇报道,一篇文献报道1例严重鹦鹉热衣原体肺炎可疑发展为机化性肺炎,另一篇报道从病理学角度证实了鹦鹉热衣原体感染后并发机化性肺炎。结论 鹦鹉热衣原体肺炎在临床上易被漏诊,易发展为重症,可并发机化性肺炎,目前机制尚不十分明确,可能考虑与宿主免疫力低下、特殊感染等相关。     

基于宏基因组二代测序诊断15例鹦鹉热衣原体肺炎临床特征与诊治分析

目的 探讨和分析少见鹦鹉热衣原体肺炎的临床特征、诊治及预后,以期提升临床相关学科领域对该病的认识。方法 回顾性研究赣南医学院第一附属医院2017年1月至2022年12月确诊的15例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,总结并分析该病的临床特征、诊断与鉴别要点,同时检索国内外文献资料对鹦鹉热衣原体肺炎的最新诊疗进展予以系统性讨论。结果 纳入本研究的15例鹦鹉热衣原体肺炎患者中,男性10例（66.67％）,女性5例（33.33％）,年龄62（32～79）岁,禽类接触史14例（93.33％）,基础疾病史8例（53.3％）,转化为重症肺炎5例（33.33％）。15例患者中,白细胞计数（white blood cell count,WBC）正常8例（53.3％）,WBC升高5例（33.3％）,WBC减低2例（13.3％）;血红蛋白（hemoglobin,HGB）正常9例（60.0％）,减低6例（40.0％）;中性粒细胞百分比（neutrophils,NE）升高13例（86.7％）;所有患者（100.0％）C反应蛋白（C-reactive protein,CRP）均显著升高;13例（86.67％）患者降钙素原（procalcitonin,PCT）升高;12例（80.0％）患者乳酸脱氢酶（lactate dehydrogenase,LDH）升高;11例（73.33％）肝功能异常;8例（53.33％）肾功能异常;6例（40.0％）凝血功能异常;13例（86.7％）电解质紊乱。此外,11例（73.33％）患者动脉血气分析显示不同程度血氧分压降低,8例（53.33％）氧合指数（oxygenation index,OI）低于300 mmHg,4例（26.67％）患者无明显呼吸困难,未进行动脉血气分析检查。本研究所有患者均已完善经支气管镜检查,并获取支气管肺泡灌洗液（bronchoalverolar lavage fluid,BALF）行宏基因组二代测序（metagenomic next-generation sequencing,mNGS）检测,检出的病原体除鹦鹉热衣原体外,所有患者均合并多种病原体感染。15例患者均已完善肺部电子计算机断层扫描（computed tomography,CT）等影像学检查,单侧肺部实变7例（46.67％）,双侧实变8例（53.33％）;9例（60.0％）患者伴有胸腔积液,部分患者可以表现出多种影像学表现,包括实变影、磨玻璃影、团块样实变影、反晕征、纵隔和肺门淋巴结肿大等。15例鹦鹉热衣原体肺炎患者在确诊后均予规范抗感染治疗,其中5例重症肺炎患者中2例患者予体外膜肺氧合（extracorporeal membrane oxygenation,ECMO）辅助治疗,所有患者均未见治疗相关不良反应或不良事件,平均住院日为13.9 d。本研究所有患者未见死亡,均好转出院。结论 鹦鹉热衣原体肺炎临床特征及表现缺乏特异性,易出现重症化,经支气管肺泡灌洗液予mNGS检测可精准确诊,早期予四环素类及喹诺酮类抗生素可最大程度改善患者预后。     

9例鹦鹉热衣原体肺炎患者临床特征分析

目的 探讨鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床特征,以提高对该病的认识,以助精准诊断和治疗。方法 回顾性分析郑州大学第二附属医院2020年10月至2022年8月确诊的9例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料。结果 9例患者中,男5例,女4例,7例患者有家禽类接触史,年龄为47～69岁,中位年龄为56岁,临床表现主要为高热9例、咳嗽9例、乏力9例、呼吸困难7例、肌肉酸痛5例、头痛4例等,1例迅速进展为呼吸衰竭。白细胞计数正常4例、轻度升高5例,中性粒细胞计数升高9例、淋巴细胞计数下降9例、C反应蛋白(CRP)升高9例,降钙素原(PCT)升高9例,天门冬氨酸氨基转移酶(AST)、丙氨酸氨基转移酶(ALT)升高5例。胸部CT均表现为斑片状实变影、其中9例伴有支气管充气征,累及单侧肺叶6例、双侧肺叶3例、胸腔积液6例。9例患者均由宏基因二代测序(mNGS)检出鹦鹉热衣原体核酸序列。治疗上7例使用多西环素治疗、2例使用阿奇霉素治疗、7例使用莫西沙星治疗,其中3例使用西维来斯他纳治疗急性呼吸窘迫综合征后呼吸衰竭症状明显好转。9例患者治疗后均好转出院。结论 鹦鹉热衣原体肺炎患者有明显肺部症状、病情进展较快、经验性抗...     

鹦鹉热衣原体肺炎合并横纹肌溶解5例临床分析

为探讨鹦鹉热衣原体肺炎合并横纹肌溶解(RM)患者的临床特征及治疗方法, 收集我院2020年1月至2021年11月经宏基因组二代测序(mNGS)确诊的鹦鹉热衣原体肺炎患者的病例资料, 对合并RM患者的一般情况、临床表现、实验室检查、胸部CT表现及诊疗过程进行总结分析。21例鹦鹉热衣原体肺炎患者中10例(47.6%)血肌酸激酶(CK)升高, 5例(23.8%)合并RM。5例鹦鹉热衣原体肺炎合并RM患者均为重症, 主要临床表现为高热、气促、头痛、肌肉酸痛, 2例继发急性肾损伤(AKI)及神志改变。所有患者肌酶谱(CK、肌红蛋白、乳酸脱氢酶)、炎症指标(高敏C反应蛋白、白细胞介素6)及D-二聚体均明显升高。5例患者胸部CT表现以肺大片实变为主, 1例合并磨玻璃改变, 2例并发少量胸腔积液。患者入院后经mNGS检查很快确定诊断并及时予针对性治疗, 除1例因多脏器功能衰竭死亡外, 其余4例患者好转出院。提示鹦鹉热衣原体肺炎容易继发RM, 早发现、早治疗可有效改善患者预后。     

宏基因组二代测序诊断的鹦鹉热衣原体肺炎16例临床分析

目的 总结肺泡灌洗液宏基因组二代测序确诊的鹦鹉热衣原体肺炎的临床特点。方法 分析16例宏基因组二代测序确诊的鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床特征、流行病学、实验室结果、治疗及预后。结果 有禽类接触史9例（56.3%）,发热14例（87.5%）,咳嗽咳痰12例（75.0%）,胸痛5例（31.3%）,呼吸困难5例（31.3%）,腹泻4例（25.0%）,咯血2例（12.5%）、嗜睡2例（12.5%）,神志不清2例（12.5%）,呼吸衰竭2例（12.5%）;16例(100.0%)降钙素原升高,12例(75.0%)中性粒细胞升高,6例(37.5%)肌酶升高;16例(100.0%)有肺实变;莫西沙星、多西环素、米诺环素治疗有效。结论 对不明原因社区获得性肺炎患者要注意鹦鹉热衣原体肺炎可能,肺泡灌洗液宏基因组二代测序有助于其早期确诊。     

鹦鹉热衣原体肺炎的CT表现特征

目的 探讨鹦鹉热衣原体肺炎患者的CT表现特征。方法 回顾性分析笔者医院经宏基因二代测序（macrogene second-generation sequencing,m NGS）技术确诊10例鹦鹉热衣原体肺炎患者的胸部CT图像。结果 7例（70%）患者与鸟（禽）类或其粪便有接触史。入院胸部CT均表现为团片状渗出实变影,均位于单肺,其中累及单叶8例（80%）、双叶2例（20%）;10例（100%）均伴有支气管充气征,9例（90%）有磨玻璃影,8例（80%）局部小叶间隔或小叶内间隔增厚;1例（10%）病灶呈“扇形”改变,1例（10%）病灶见“反晕症”,9d内复查9例（90%）有进展,表现为病灶融合增大呈更大范围实变或新出现病灶。结论 鹦鹉热衣原体肺炎CT表现具有一定特征,结合鸟（禽）类接触史可提示诊断。     

奥马环素治疗鹦鹉热衣原体肺炎1例

本文报道1例高热肺炎患者经莫西沙星、头孢哌酮舒巴坦钠抗感染治疗后,症状仍无缓解。经完善气管镜检查,肺泡灌洗液宏基因组高通量测序（metagenomics nextgeneration sequencing,mNGS）结果回报：检出鹦鹉热衣原体,更换三代四环素（奥马环素）进行治疗后病情明显好转且不良反应少。通过分析该例患者的治疗过程并结合文献复习,总结此病的临床特点及治疗用药。     

鹦鹉热衣原体肺炎2例报告及文献复习

目的:分析鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床表现、诊断方法和治疗过程,提高临床医生对该病的认识,以进一步提高其临床诊治效率并改善其预后.方法:收集2例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料,对诊治经过进行总结,分析患者的感染指标、氧合功能和肺部影像学的动态变化,对比培养法、血清学方法和宏基因组二代测序技术(mNGS)等病原学诊断方法,...     

探讨宏基因组学第二代测序在肺部感染病原体检测中的临床价值

目的：探讨肺泡灌洗液行宏基因组学第二代测序(mNGS)在肺部感染患者中致病病原微生物检测的临床价值。方法：回顾性分析于2021年4月—2022年8月在我院呼吸与危重症医学科收治的87例肺部感染患者的临床数据，所有患者均进行常规的细菌真菌涂片+培养方法，同步行电子支气管镜检查收集肺泡灌洗液使用mNGS技术进行病原体检测。结果：在87例患者中，mNGS技术对病原微生物的检出率明显优于常规方法(P<0.05)。共检测到47例细菌、12例真菌、11例病毒、2例支原体、2例衣原体，其中最多的是结核分枝杆菌，共检测到19例(21.84%)。从细菌的检出率来看mNGS技术对肺部感染患者肺泡灌洗液中的病原微生物检出率显著高于常规涂片+培养方法。结论：mNGS技术在肺部感染患者肺泡灌洗液中的病原微生物检出率显著高于常规涂片+培养方法，并且能检出的病原体微生物种类也更广泛，在临床明确病原体和治疗中具有较高的指导作用。     

鹦鹉热衣原体肺炎胸部CT影像学特征分析

目的 探讨鹦鹉热衣原体肺炎患者胸部CT影像学特征.方法 回顾性分析2018年9月至2021年1月温州医科大学附属第一医院呼吸与危重症医学科收治的39例鹦鹉热衣原体肺炎患者的胸部CT影像.结果 39例患者的肺部病变均表现为实变影,并表现有支气管充气征36例,磨玻璃影23例及胸腔积液28例,实变影、磨玻璃影及胸腔积液同时存...     

鹦鹉热衣原体肺炎13例临床分析

目的探讨鹦鹉热衣原体肺炎的临床特征。方法回顾性分析厦门大学附属第一医院2018年11月至2021年2月连续收治的13例鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床资料。结果 13例患者均有发热, 合并呼吸困难11例、咳嗽9例、乏力8例、头痛6例。所有患者就诊时序贯器官衰竭估计(SOFA)评分≥2分, 肺炎严重指数(PSI)评分Ⅱ级者2例, PSI评分Ⅳ/Ⅴ级者11例。实验室检查结果显示, 所有患者的C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)均升高, 其中CRP≥100 mg/L者11例, PCT≥0.5 ng/ml者9例。合并呼吸衰竭者12例, 转氨酶升高者12例。患者胸部CT多表现为多发的片状渗出影、局灶实变, 可见空气支气管征, 8例患者病变发生于下肺。所有患者经宏基因二代测序技术确诊并及时调整以多西环素为基础的药物治疗方案及积极器官支持后病情好转, 病灶可完全吸收, 预后均良好。结论鹦鹉热衣原体肺炎患者常表现为脓毒症, 病情进展迅速, 宏基因二代测序技术对于早期诊断鹦鹉热衣原体肺炎具有重要意义, 确诊后及时调整治疗预后良好。     

宏基因组二代测序（mNGS）联合体外膜氧合（ECMO）救治鹦鹉热衣原体重症肺炎1例报道

成人社区获得性肺炎（Community Acquired Pneumonia,CAP）指在医院外罹患的肺实质（含肺泡壁,即广义上的肺间质）炎症,包括具有明确潜伏期的病原体感染在入院后于潜伏期内发病的肺炎。CAP常见致病菌主要包括肺炎链球菌、流血嗜血杆菌、肺炎支原体、肺炎衣原体等。而鹦鹉热衣原体肺炎是衣原体肺炎的一种,属于非典型病原体。鹦鹉热衣原体肺炎在临床上较比少见,临床症状无特异性,且致病性强,因而临床快速早期诊断对治疗有重大的指导意义。本文通过宏基因组二代测序（mNGS）技术及体外膜氧合（ECMO）技术抢救鹦鹉热重症肺炎1例进行报道。     

mNGS诊断鹦鹉热衣原体致重症社区获得性肺炎1例并文献复习

<正>鹦鹉热是由鹦鹉热衣原体感染所导致的罕见疾病,缺乏特异性临床表现及影像学特征,易误诊。本文报道佛山市第一人民医院收治的重症社区获得性肺炎1例,血液及痰液mNGS检测结果为鹦鹉热衣原体,予多西环素抗鹦鹉热衣原体治疗效果不佳,予多西环素+莫西沙星联合抗感染治疗后病情好转出院。该研究经医院伦理委员会批准,患者已签署知情同意书。1 病例资料患者男,主因“咳嗽咳痰发热5d”于2021年3月16日于佛山市第一人民医院全科医学科住院治疗。