中成药临床证据知识图谱元素关系与延展路径

研究构建中成药临床证据知识图谱元素关系与延展路径,为中成药证据链形成与转化应用提供基础技术支持,为海量中成药临床杂乱小数据提供收集、归纳、总结方案。基于循证PICOS要素,收集并总结知识图谱常规构建方法。首先,将中成药相关数据实体进行分类,并进行实体链指(消歧);其次,围绕数据实体完成其属性信息的关联和归类;最终,构建实体间的逻辑关系,进而总结得到符合中成药临床证据特点的知识图谱元素关系和延展路径。中成药临床证据知识图谱的构建以流程设计及逻辑结构为主,遵循PICOS原则和证据等级进行知识图谱内元素关系的表达;延展路径跨越3个层级：模式层、数据层应用、新证据应用,具体从疾病、核心评价指标、中成药、核心组方、证治法则、医案对比(演变规律)等逐步探索至新药研发路径。通过该研究,中成药临床证据知识图谱构建的顶层设计已较为明晰,但仍需交叉学科的共同努力,随着符合中医药特色的图谱构建技术的不断完善,将进一步为中医药学科发展提供必要的基础技术支持和借鉴。     

基于“病脉证并治”诊疗思维的《伤寒论》知识图谱构建与应用＊

目的 基于“病脉证并治”诊疗思维模式设计、构建《伤寒论》知识图谱，梳理古籍文字的逻辑关系并可视化展示，深入挖掘隐性知识，充分利用潜在价值。方法 首先探讨知识图谱的基础理论与构建技术；其次采用人工标引的方法提取《伤寒论》中语义实体，梳理语义关系，利用Python处理所形成的逻辑数据，并基于Neo4j构建知识图谱，将古籍条文以“病脉证并治”的形式储存和展示。结果 知识图谱的模式层定义了病证、证候表现、脉象等12种语义类型，形成13种语义关系及其约束规则；数据层从《伤寒论》中共提取3731个节点和5416条连边；构建出具有中医诊疗逻辑的知识图谱，可形成病-证、方-证、方-药等关系网络，实现逻辑推理和智能问答应用。结论 改进了以往中医药知识图谱结构欠缺逻辑的不足，为《伤寒论》服务于中医临床、科研与教学等工作提供新思路和新方法，此即未来中医古籍知识可视化、中医药知识服务智能化以及方药推荐、临床决策支持系统的雏形。     

中药炮制学学科研究前沿、热点及发展趋势——基于知识图谱的“中药炮制” 可视化研究

目的：整理中药炮制学学科的发展脉络,揭示该学科的研究前沿及发展趋势。方法：以“Chinese Materia Medica Processing/中药炮制”为主题词,分别利用Web of Science数据库（WoS）及中国期刊全文数据库（CNKI）进行文献检索,使用CiteSpaceⅡ及Ucinet & Netdraw等软件对所得的中英文文献数据进行知识图谱的构建。结果：分别构建出“中药炮制”中英文文献的共引文献、来源期刊、作者、关键词等的知识图谱,得出“中药炮制”中英文文献的引文文献来源、代表作者、高频关键词及研究领域等信息。结论：本学科中文文献快速发表期早于英文文献近15年,且英文文献总数远小于中文文献总数。使用科学知识图谱分析软件可理清中药炮制学科的发展脉络、揭示中药炮制学科研究前沿及未来发展趋势。     

基于医案文本的名老中医诊疗知识图谱构建方法及应用

目的 以名老中医临床病案为研究对象,设计中医诊疗知识图谱构建方法并进行应用。方法 首先,设计深度学习和正则表达式相结合的医案文本实体抽取方法,对非结构化医案文本的疾病、症状、病机和中药实体进行自动抽取;其次,定义实体关系,利用HAN方法计算实体之间的相关性,形成“实体-关系-实体”三元组;最后,利用图数据库Neo4j进行知识存储、Gephi进行可视化展示并在名老中医诊治肺癌医案上进行应用验证。结果 知识抽取模型对医案实体抽取的精确率、召回率和F1分别为88.49%、90.02%、89.25%,各指标优于对比方法;通过实体相关性计算共提取了1077条三元组,并成功构建了知识图谱,能够反映名老中医诊治肺癌“病-症-机-药”之间的关系。结论 本文方法可以有效解决名老中医临床医案文本知识的抽取、组织和表达问题,实现了从医案文本到知识图谱的自动化构建过程,相关研究思路和方法可以为名老中医诊疗知识图谱构建提供参考。     

近10年“大承气汤”相关研究知识图谱分析

目的通过可视化知识图谱方式,整体分析近10年经方"大承气汤"的研究概况及趋势。方法以"大承气汤"为主题词,检索2009年1月1日至2019年2月1日中国知网(CNKI)数据库中相关文献,通过CiteSpace软件对纳入的数据分别以作者、研究机构及关键词为节点进行分析,并对其出现频次进行统计。结果共纳入数据1 275条,发现了以唐文富为代表的主要研究人员及团队,研究机构以华西医院及天津中医药大学为主,肠梗阻、急性胰腺炎和急性肺损伤是与大承气汤最为相关的疾病。结论在近10年的"大承气汤"学术文献中,研究领域涉及临床、药理学、炮制等多个学科,其有效成分在治疗疾病中的机制研究仍是主要方向。     

地黄研究前沿、热点及发展趋势——基于知识图谱的“地黄”可视化研究

目的:整理中药"地黄"的研究进展,揭示该中药的研究热点及发展趋势。方法:以"Radix rehmanniae/地黄"为主题词,分别利用Web of Science数据库(Wo S)及中国期刊全文数据库(CNKI)进行文献检索,使用Cite SpaceⅡ及SATI(sattistieal Analysis Toolof I nofmraties)等软件对所得的中英文文献数据进行知识图谱的构建。结果:分别构建出"地黄"中英文文献的来源期刊、作者、关键词等的知识图谱,得出"地黄"中英文文献的共引文献来源、代表作者、高频关键词及研究领域等信息。结论:"地黄"中文文献快速发表期早于英文文献快速发表期近12年左右,且英文文献总数远小于中文文献总数;使用科学知识图谱分析软件可梳理地黄的研究进展、揭示地黄的研究前沿及未来发展趋势。     

知识元标引在中医古籍临证文献标引中的应用

中医古籍临证文献数量庞大,内容复杂,包括理、法、方、药等方面,如要获取和利用古籍中的临证知识,必须建立一套相对严谨的知识网络和语义关系网络。知识元标引是对古籍文献内容进行合理解构,揭示古籍中蕴含的知识和信息,成为发现知识的重要方法和途径。     

基于名老中医医案的知识图谱构建

目的:尝试用知识图谱的技术将名老中医医案的知识结构及其相互关系予以形象的表现,用可视化的方式剖析中医医案中蕴含的名老中医诊疗经验。方法:基于中医药行业术语规范标准将文本形式的医案转换为符合图谱要求的结构化数据;遵循中医辨证论治理论定义图谱实体之间的相互关系;依据XML的三层模型实现系统架构;采用ECharts作为可视化工具,将中医医案知识结构化、层次化的关联予以呈现。结论:通过知识图谱将"平面化"的中医医案进行"多维度"呈现,可以清晰地梳理出临床病案中所包含的疾病、证型、治法、处方、药物之间的关系,并基于知识图谱进行渐进式的学术思想发现,可为更好地研究名老中医经验传承和临床知识总结提供新的技术手段。     

基于古籍胸痹病机的知识图谱研究

目的:基于中医辨证论治理论架构,从中医古籍文本中提取胸痹证治知识元、语义、关系等,构建本体化的胸痹证治知识库,分析胸痹的证治规律,并以图片的形式展示胸痹辨证论治知识图谱,为直观理解胸痹心痛辨证论治的基本理论和指导胸痹的临床治疗提供借鉴。方法:选择胸痹研究中引用较多的20部中医古籍为研究对象,对文献进行知识元标记、入库以及语义提取和关联分析,构建胸痹中医辨证论治知识图谱。结果:从古籍中摘录胸痹相关文本364条,其中有关胸痹的证治知识内容186条,方剂知识内容164条,其他14条;病因频数统计分析结果显示胸痹常见的病因有饮食不当、寒邪、风邪、劳倦体虚、热邪、气滞痰凝、情志失调、瘀血内阻、气虚以及虫毒感染;病机关联分析显示寒气乘心、肾阳虚、水饮停心、瘀血痹阻心胸等联系密切。结论:研究构建的胸痹中医辨证论治知识图谱直观反映了胸痹的辨证与治疗的各种关系,有利于理解中医古籍对胸痹的证治知识。知识图谱作为一种直观、多维的知识展示方式,适用于中医古籍知识的整理,该研究方法对中医古籍的整理具有方法学的借鉴意义。     

基于中医疾病相关语义关系的正则表达式及知识抽取研究

目的：目前已有的知识抽取方法虽然多面向英文,但中文医学文献的数量也正在迅速增长,而且中医古籍文献中也有很多有价值的知识需要获取。基于此,本文以疾病“崩漏”为例,以正则表达式为规则,试图抽取中医古籍中疾病相关的知识,以构建中医疾病知识的语义框架。方法：建立崩漏相关的等同关系、因果关系、治疗关系的正则表达式,进而建立以正则表达式为规则的知识抽取及可视化平台。结果：实现对崩漏相关知识框架的抽取与表达,通过人工抽取和计算机知识平台抽取方式构建中医疾病语义框架,并在此基础上完成中医疾病相关的知识框架描述。结论：研究发现,以正则表达式为规则的知识抽取可视化平台,可以实现对崩漏相关知识框架的抽取与表达,并为中医疾病知识的逻辑化描述与未来的抽取及应用提供了方法,为实现中医疾病相关的知识框架描述奠定基础,可单一地基于正则表达式的信息抽取方式难以达到很好的召回率,如果在正则表达规则的基础上考虑篇章结构,同时整合机器学习与语义标注的混合信息抽取方法可能进一步提高抽取的效能。     

基于知识组织的医案古籍知识库的构建与思考

以医案类中医古籍为研究对象,探索医案古籍的知识组织方法,通过对医案古籍中所蕴含知识信息的解析、重组和规范,尤其对中医古籍后控词表的完善和应用,设计并构建医案古籍知识库,并将各类医案古籍知识内容进行全面、准确、系统地表达与显示,以满足不同用户对医案古籍知识不同层面的需求,实现医案古籍的知识化检索与服务;同时对目前知识库构建中遇到的术语规范与标准化程度、机器学习的可靠性与可行性等突出问题进行探讨。     

基于文献数据的知识图谱构建——以中医药治疗糖尿病周围神经病变为例

目的 系统梳理现有文献中关于中医药治疗糖尿病周围神经病变（DPN）的“病-证-治-方-药”知识框架和概念逻辑关系，构建中医药治疗DPN的知识图谱，促进中医药治疗DPN的文献中隐性知识显性化。方法 以中国知网中有关中医药治疗DPN的文献为主要数据来源，通过人工标引构建中医相关概念和实体，并建立实体之间的对应关系；利用Python 3.7处理形成结构化数据，并基于Neo4j 3.5.34图数据库构建知识图谱。结果 该知识图谱在模式层定义了方剂、中药、证型等12种节点标签，以及包含、对应、选择、组成这4种关系类型，形成了具备中医诊疗逻辑的知识图谱，可支持中医药治疗DPN证候要素、证候类型、治法等节点及各节点之间关系的查询与发现。结论 该研究基于文献数据探索性构建了中医药治疗DPN的知识图谱，汇聚了中医药治疗DPN的多种方式，包括内治法及外治法等，并从证素分析、证型组成至治法选择形成了辨证分型治疗DPN的全链条知识结构，可为文献数据服务于临床、科研工作提供新思路和新方法，并可为中医文献知识可视化、中医药知识服务智能化、中医标准化和规范化诊疗提供参考。     

青蒿研究进展的CiteSpace知识图谱建立

目的 建立青蒿研究进展的CiteSpace知识图谱.方法 以中国知网(CNKI)和Web of Science核心集数据库中2000年至2020年收录的青蒿文献为研究对象,采用CiteSpace 5.7.R3软件对发文机构、国家、作者、关键词等进行可视化展现和分析.结果 共纳入与医药卫生科技和农业科技研究相关的中文文献...     

基于CiteSpace的心肾相交知识图谱可视化分析

目的:对心肾相交相关文献进行文献计量分析及可视化分析,探究心肾相交研究领域的研究现状、研究热点和研究趋势。方法:以中国知网期刊数据库为数据来源,利用CiteSpace对心肾相交相关研究的作者、机构和关键词进行可视化分析。结果:共纳入文献1 104篇,年发文量呈现直线上升趋势。作者合作网络得到以刘雁峰、李跃华、辛明蔚等为核心的3个稳定团队图谱;北京中医药大学、山东中医药大学、天津中医药大学是研究的主要机构。心肾相交研究涉及的疾病主要有失眠、更年期综合征;主要方剂有交泰丸、黄连阿胶汤;涉及的治疗方法有针灸治疗和中药治疗。近5年突现的关键词是中医疗法、不寐、交通心肾法、中医药治疗、临床经验、心肾不交证等。结论:心肾相交的研究热点主要以失眠、更年期综合征的中医药治疗为主,且已形成相对稳定的若干研究团队,但不同团队及机构间的研究比较分散,今后需要加强合作,进行多学科、多中心的研究。     

近12年针刺镇痛的知识图谱分析

针刺作为镇痛的有效治疗手段,在古今中外都得到了认可。基于Web of Science核心合集数据库中的相关文献,通过科学计量学的方法,运用CiteSpace5.2R1信息可视化软件对近12年针刺镇痛领域的研究进行了文献计量分析。利用大量文献数据信息绘制该领域科学知识图谱,系统梳理了针刺镇痛领域的文献,以揭示该领域发展脉络及其知识领域结构,找到核心的学科领军人物及研究单位,发现该领域研究热点、前沿及发展趋势。以此为科研工作者提供研究方向信息,为科学管理者决策提供数据参考。     

近40年来中医教育研究热点及趋势的知识图谱分析

目的通过知识图谱对1978—2018年间我国中医教育研究进行可视化分析和数据解读。方法检索中国知网1978年1月1日至2018年5月1日期间以中医教育为研究目的的文献,对纳入文献进行可视化处理,分别为内容热度处理、时间热度处理和合作者关系处理,生成关键词共现知识图谱、关键词最强引文突现图谱和合作者关系图谱。结果纳入有效文献1500篇。我国中医教育研究的热点内容(高频词)包括中医教育、人才培养、医学教育等;中医学院、医学教育是最早兴起的中医教育研究领域,而持续时间最长的研究热点是医学教育,近年出现的新兴热点是中医文化和人才培养;合作关系上我国研究者有点型、总线型和混合型3种合作关系。结论近40年来中医教育研究的特征可以用"四多四少"来概括,即中医多、教育少,宏观多、专门少,独立多、合作少,总结多、量化少。     

基于语义关联的温病古籍知识检索系统的构建研究

文章以温病类中医古籍为研究对象,参考本体论的研究方法,对温病古籍知识进行多维度描述,对温病古籍中词和术语的提取,通过语义属性关联形成温病古籍知识体系,描述温病古籍所蕴含的知识及内在联系,并基于此构建温病古籍知识检索系统,实现温病古籍知识的可视化深度检索与利用。     

基于CiteSpace对中医药治疗肝硬化腹水知识图谱可视化分析

目的:对中国知网(CNKI)数据库中中医药治疗肝硬化腹水相关文献绘制知识图谱并分析其热点及趋势,为肝硬化腹水治疗及研究提供参考。方法:检索1990年1月1日-2022年12月31日中国知网(CNKI)数据库中中医药治疗肝硬化腹水相关文献,并运用CiteSpace V.6.1.R6(64-bit)软件对文献中的关键词、作者、机构等进行知识图谱可视化分析。结果:通过筛选,最终纳入符合标准文献977篇。涉及作者766位,其中,刘成海发文最高7篇,无>10篇的发文作者;形成以陈京芬、王传波、谢体学为主,及以姚立红、谢冬梅、陈志文为主的两大合作群体,发文机构以广西中医药大学(20篇)、广西中医药大学第一附属医院(17篇)、广州中医药大学第一附属医院(10篇)为主;形成以广西中医药大学和广州中医药大学为主的合作群;关键词分析形成12个聚类标签,高频关键词包括：肝硬化、腹水、臌胀、综述、中医治疗等。结论:中医药治疗肝硬化腹水研究发展趋势呈缓慢上升趋势,但研究机构之间合作交流欠紧密,研究热点有临床观察、名医经验、穴位贴敷、中药敷脐等,推测肝功能、鼓胀、五苓散、生活质量、数据挖掘可能是未来的研究趋...     

基于CiteSpace的国内痰湿体质知识图谱可视化分析

目的：基于CiteSpace分析国内痰湿体质的研究现状、热点以及趋势,为进一步开展相关研究提供参考。方法：检索国家知识基础设施数据库(CNKI)、中国生物医学文献数据库(CBM)、中国学术期刊数据库(CSPD)及中文科技期刊数据库(CCD)从建库到2020年12月的所有以痰湿体质为研究主体的相关文献,利用EndNote进行去重,运用Excel对符合纳入标准的文献进行统计,应用CiteSpace对作者、机构、关键词进行可视化分析。结果：共计纳入文献440篇。作者合作图谱中纳入377位作者,据统计核心作者有14位,共发文59篇,占总发文量13.4%,其中作者王琦为痰湿体质研究关键人物,以其为核心的团队与成果产出非常显著;研究机构合作图谱中纳入253所机构,发文量≥4篇的研究机构有15所,北京中医药大学在机构间、机构内部的合作均较广泛;关键词图谱中纳入408个关键词,关键词出现频率≥5次的有35个,起“桥梁”作用的关键词有8个,形成有意义的聚类12个。结论：国内痰湿体质研究的热点主要在痰湿体质与相关疾病的关系以及痰湿体质的调理方面,痰湿体质体病相关又以代谢综合征、多囊卵巢综合征、中风的研究为...     

基于海洋中药知识图谱的数据挖掘与知识补全研究

目的：探索海洋中药数据挖掘和知识补全技术，挖掘海洋中药文献的隐藏知识，为古籍文献的中医药知识挖掘和知识图谱质量提升提供借鉴。方法：针对领域知识图谱的特点提出了一种融合知识图谱与数据挖掘的领域知识图谱补全方法。从海洋中药知识图谱中检索补肾类海洋中药及相关效方，利用关联规则、聚类对海洋中药功效、主治、效方配伍、性味归经等之间的关联关系进行分析与聚类，对海洋中药知识图谱进行知识补全。结果：检索出补肾类海洋中药51味，相关效方123首，以此为数据源进行数据挖掘。发现补肾类海洋中药大多味咸，性温，归肝、肾两经。筛选出83首补肾类效方，发现补肾常用海洋中药有海马、海狗肾、海参、石首鱼和4类核心药组。将挖掘结果以三元组的形式补充到海洋中药知识图谱中，可有效完善补肾类效方的核心配伍关系。结论：以知识图谱为数据源进行数据挖掘，并将挖掘结果补充知识图谱，可以使知识图谱更为完整，相关思路与方法可为中医药领域数据挖掘、中医药知识图谱质量提升提供参考。