柴胡疏肝散治疗代谢相关脂肪性肝病的网络机制研究＊

目的 分析疏肝理气代表方柴胡疏肝散治疗代谢相关脂肪性肝病（MAFLD）的作用机制。方法 根据TCMSP数据库、GeneCards数据库、OMIM数据库，预测和筛选柴胡疏肝散的活性成分和MAFLD的相关基因，得到柴胡疏肝散治疗MAFLD的潜在靶点，使用Cytoscape软件和STRING数据库，构建柴胡疏肝散活性成分与MAFLD相关靶点的成分-靶点网络，分析网络获得重要靶点，并利用DAVID数据库对其进行基因本体（GO）和京都基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。同时作分子对接及历史文献研究对相关靶点进行验证。结果 从中药复方柴胡舒肝散中经ADME筛选后到了槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、柚皮苷、和异鼠李素、柠檬烯等140种化学成分，能够作用于65个MAFLD的疾病靶点，其中前十位的PTGS2、ESR1、AR、GSK3B、PTGS1、ESR2、ADRB2、AKT1、TP53、PGR和EGFR为最重要的核心靶点，可以调控的信号通路主要为HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路、VEGF信号通路、TNF信号通路、p53信号通路、PPAR信号通路和Jak-STAT信号通路，参与MAFLD的RNA聚合酶II启动子转录、基因表达与DNA转录的正调控等过程。分子对接结果显示药物关键成分槲皮素与山柰酚与疾病核心靶点IL-6成功建立对接，且具良好的结合活性。结论 柴胡疏肝散在干预MAFLD的过程中，主要通过调节免疫和肿瘤抑制作用治疗脂肪性肝病，整个过程通过多靶点和多途径对机体起到积极治疗作用。     

基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁（Post-stroke Depression, PSD）的潜在活性成分和可能的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和蛋白质序列数据库（Uniprot）筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果：共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接...     

柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的网络药理学研究

目的用计算机网络药理学技术分析柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的有效成分,并预测其作用机制。方法从中药系统药理学分析平台(TCMSP)中获取柴胡疏肝散的化学成分和靶点,同时利用OMIM、TTD和Pharm Gkb数据库获取治疗卒中和抑郁的共有靶标。采用Excel筛选分子和靶标,Cytoscape软件建立柴胡疏肝散的中药成分-靶点网络图,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对基因功能及代谢通路进行分析。结果从数据库筛选出柴胡疏肝散122个中药成分与卒中后抑郁的42个靶蛋白相互作用,其中雌激素受体(ESR1)、前列素内环氧化物合成酶2(PTGS2)、糖原合成酶激酶3β(GSK3β)、SLC6A4和白三烯A4水解酶(LTA4H)为柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的作用靶点,主要涉及花生四烯酸代谢通路、5-羟色胺能突触通路、催乳素信号通路和甲状腺激素信号通路,通过调节炎症应答、突触合成、雌激素应答、记忆、生物合成、药物反应和昼夜节律从而治疗卒中后抑郁。结论通过网络药理学研究揭示了柴胡疏肝散治疗卒中后抑郁的可能机制,为进一步阐明其作用靶点奠定了基础。     

基于网络药理学的柴胡疏肝散治疗失眠作用机制探讨

目的:通过网络药理学方法探讨柴胡疏肝散治疗失眠的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索柴胡疏肝散复方中7味中药有效成分和相关靶点;在GeneCard和OMIM数据库检索失眠的疾病靶点;运用Perl语言计算分析中药复方中药物与疾病之间的交集靶点,利用String在线网站构建复方与疾病之间的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;运用DAVID数据库对核心靶点蛋白进行基因本体(GO)分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,构建KEGG-PPI网络核心蛋白关系图。结果:根据筛选条件共得到柴胡疏肝散有效成分157个,相关作用靶点8488个。PPI网络显示,白细胞介素-6(IL-6)、蛋白激酶B1(Akt1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、Fos、过氧化氢酶(CAT)等很可能为柴胡疏肝散治疗失眠的关键蛋白。GO功能富集分析结果显示,BP涉及1624条目,细胞功能(CC)涉及62条目,分子功能(MF)涉及97条目。KEGG富集结果显示,有103条通路与柴胡疏肝散治疗失眠相关,主要包括糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、前列腺癌通路、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染通路、内分泌抵抗通路、多巴胺能突触、IL-17信号通路、催乳素信号通路等。结论:通过网络药理学初步阐明了柴胡疏肝散治疗失眠的作用机制,柴胡疏肝散是通过多成分-多靶点-多通路发挥治疗作用。     

小儿化毒散治疗上呼吸道感染的网络药理学及分子对接研究

目的：探讨小儿化毒散治疗上呼吸道感染的网络药理学机制。方法：从中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选小儿化毒散中的主要化学成分并收集潜在作用靶点;从GeneCards数据库、OMIM数据库及TTD数据库筛选人的上呼吸道感染疾病靶点;利用在线程序绘制韦恩图并获得小儿化毒散与上呼吸道感染的共同靶点,应用Cytoscape软件构建“中药-重要活性成分-疾病靶点”作用网络图;运用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;使用DAVID平台进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析;应用分子对接将化合物-靶点可视化处理。结果：小儿化毒散共筛选出131个有效化合物和相应靶点107个,上呼吸道感染筛选出7 339个相关疾病靶点,并得到92个共同作用靶点,富集分析筛选后得到30个GO条目和46条KEGG信号通路,分子对接得到3个关键化合物和1个靶点。结论：小儿化毒散治疗上呼吸道感染可能通过其关键成分槲皮素、黄芩素和异鼠李素作用于IL6、HIF1A等13个关键靶点蛋白,调节炎症反应、控制缺氧机制进而发挥治疗上呼吸道感染的治疗效果。     

整合生物信息学与实验验证解析黄芪-莪术药对抗肝癌配伍机制

目的 整合生物信息学、网络药理学及分子对接技术预测黄芪-莪术药对抗肝癌配伍机制,并进行细胞实验验证。方法 利用R软件包Limma分析GEO数据库中肝癌基因表达数据,筛选肝癌靶点;通过TCMSP数据库结合文献报道,筛选潜在活性成分;采用TCMSP、SEA和SwissTargetPrediction数据库进行成分靶点预测,筛选抗肝癌靶点;对靶点进行京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析;构建蛋白质-蛋白质相互作用网络、成分-靶点网络、关键成分-靶点-通路网络,并结合网络贡献指数,筛选关键肝癌靶点、关键抗肝癌成分及其靶点、核心抗肝癌成分及其靶点;使用Autodock Vina软件对核心成分与核心靶点进行分子对接;通过细胞实验,验证所预测成分抗肝癌活性及其作用机制。结果 预测得到黄芪-莪术抗肝癌活性成分33个,抗肝癌靶点180个,关键肝癌靶点112个;筛选后得到关键成分29个,对应靶点15个;KEGG通路分析显示关键成分主要通过协同影响细胞周期、细胞衰老、p53信号通路等发挥配伍作用;进一步筛选得到核心成分6个（黄芪中黄芪皂苷II、黄芪甲苷、芒柄花素,莪术中莪术醇、姜黄素、双去甲氧基姜黄素）,对应靶点5个[细胞周期蛋白依赖性激酶1（cyclin-dependent kinase 1,CDK1）、DNA拓扑异构酶2A（topoisomerase 2A,TOP2A）、极光激酶B（aurora B,AURKB）、检查点蛋白激酶1（check point kinase 1,CHEK1）、AURKA]。细胞实验结果显示,黄芪-莪术药对6个核心成分均对HepG2细胞增殖具有显著的抑制作用（P＜0.01）,且黄芪皂苷II与双去甲氧基姜黄素具有协同增效作用;黄芪皂苷II与双去甲氧基姜黄素可通过下调细胞周期相关蛋白表达水平（P＜0.05、0.01）,进而阻滞细胞周期。结论 黄芪-莪术药对的多种活性成分通过作用于相同或不同靶点抑制细胞周期、p53信号通路等相同或不同相关信号关通路,从而发挥协同配伍抗肝癌作用。     

基于网络药理学和实验验证研究柴胡疏肝散治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制＊

目的 通过网络药理学的方法进行预测，再深一步进行动物实验验证来研究柴胡疏肝散治疗CAG的作用机制。方法 首先在TCMSP数据库中检索柴胡疏肝散的所有活性成分与药物靶点；通过收集PharmGkb、OMIM、GeneCards和DrugBank数据库中收录的慢性萎缩性胃炎的相关靶点。将药物靶点与疾病靶点进行映射筛选出交集靶点，将得到的交集靶点构建PPI网络与活性成分-共同靶点网络，并对其进行GO和KEGG富集分析。最后利用Vina软件进行分子对接实验验证，并通过免疫印迹法验证柴胡疏肝散对两种受体蛋白EGFR和STAT1的影响。结果 最终筛选得到柴胡疏肝散活性成分104个，潜在靶点238个，与慢性萎缩性胃炎的交集靶点52个；GO与KEGG富集分析分别得到2166条目和148条目，主要涉及到JAK-STAT信号通路、TNF信号通路、HIF-1信号通路等；分子对接结果显示EGFR、STAT1两个靶点能够与核心活性成分能够自发结合成较为稳定的构像；免疫印迹法实验证明柴胡疏肝散能够降低大鼠胃黏膜组织EGFR和STAT1蛋白表达。结论 通过网络药理学和实验验证，发现柴胡疏肝散可能通过调节EGFR和STAT1蛋白表达来共同调控胃黏膜细胞增殖与凋亡，进而发挥着治疗慢性萎缩性胃炎的效果，为深入进行柴胡疏肝散治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制研究提供新思路和新方法。     

基于网络药理学探究柴胡-石菖蒲治疗癫痫的作用机制

目的：基于网络药理学方法探讨中药配伍“柴胡-石菖蒲”的有效活性成分,探讨该药对配伍同疾病的相关通路和关键靶点,明确治疗癫痫的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台检索中草药柴胡、石菖蒲的有效活性成分及靶点,在GeneCards数据库中查找癫痫疾病相关的基因靶点,通过String数据库建立蛋白质相互作用网络,在Metascape软件中对核心靶点进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：获得柴胡的有效成分56种,石菖蒲的有效成分28种,药物靶点285个,疾病靶点1 523个,筛选得到潜在药物治疗靶点71个。GO功能富集分析结果表明主要可能与对激素的反应、细胞对氮化合物的反应、细胞群增殖的负调控等有关。KEGG信号通路富集分析结果表明主要与癌症通路、缺氧诱导因子（Hypoxia Inducible Factor,HIF）-1信号通路及白细胞介素（Interleukin,IL）-17信号等通路相关。结论：柴胡-石菖蒲药对能通过多种有效活性成分、多种途径、多种靶点起到控制癫痫的作用。     

基于网络药理学探讨异功散治疗支气管哮喘作用机制

目的：运用网络药理学、分子对接探讨异功散治疗支气管哮喘（BA） 作用机制。方法：通过 BATMAN-TCM、中医药百科全书（ETCM） 平台、SymMap、TCM Database@Taiwan、中药系统药理学数据库和 分析平台（TCMSP） 获取异功散各药物的潜在活性成分及对应靶点;利用DisGeNET、TTD、GeneCards、 PharmGkb、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、NCBI、人类表型本体（HPO） 和Drugbank 数据库收集BA 疾病作用靶点,使用Bioinformatics ＆ Evolutionary Genomics 平台筛选药物与疾病共有靶点;利用GEO 下载基 因芯片,使用R 语言分析获取差异表达基因,通过药物与疾病共有靶点基因交叉验证获得关键靶点,构建 “活性成分-关键靶点”网络;使用R 软件对关键靶点进行基因本体论（GO） 生物功能分析和京都基因和基因 组百科全书（KEGG） 通路富集分析;采用STRING 数据库和Cytoscape 软件获得关键靶点蛋白相互作用关系, 筛选出核心靶点;通过AutoDock 软件进行核心靶点与活性成分的分子对接验证。结果：共筛选176 个药物活 性成分及其对应的作用靶点265 个,获得差异基因1 263 个,交叉验证得到原癌基因1（PIM1）、人肾上腺素 能受体β2（ADRβ2）、V-rel 网状内皮细胞病毒癌基因同源物A（RELA）、碳酸酐酶2（CA2） 基因、肿瘤坏死 因子（TNF） 等16 个关键靶点,关联的活性成分有槲皮素、甘草查尔酮A、甘草查尔酮B、山柰酚、柚皮素 等。异功散治疗BA 的关键靶点主要富集通路有NOD 样受体信号通路、C 型凝集素受体信号通路、TNF 信号 通路等。分子对接结果显示,TNF、RELA、白细胞介素1A（IL1A）、连环蛋白β1（CTNNβ1）、螺旋环螺旋结 构域扩散激酶（CHUK）、CXC 型趋化因子配体2（CXCL2）、磷酸酶-张力蛋白基因（PTEN）、信号转导子和转 录激活子1（STAT1） 等核心靶点与槲皮素、甘草查尔酮A、甘草查尔酮B、山柰酚、柚皮素等活性成分均具 有良好的结合能力。结论：异功散中槲皮素、甘草查尔酮A、甘草查尔酮B 等成分可通过PIM1、ADRβ2 等多 靶点调控NOD 样受体、C 型凝集素受体信号通路、TNF 信号通路等治疗BA。     

基于网络药理学探究茵陈-栀子药对乙型肝炎肝硬化的作用机制

目的：基于网络药理学探究茵陈-栀子药对治疗乙型肝炎肝硬化的作用机制。方法：通过药物数据库筛选出茵陈-栀子的有效化学成分及靶点,并预测和筛选茵陈-栀子药对治疗乙型肝炎肝硬化疾病的作用靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-成分-靶点的网络图。绘制关键靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络。采用Metascape数据库对有效作用靶点进行基因本体论（GO）注释分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出茵陈的化合物36个,有效靶点481个;栀子的化合物101个,有效靶点798个;通过筛选得到茵陈-栀子药对与乙型肝炎肝硬化的交集靶点254个。蛋白质-蛋白质相互作用网络发现丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1 (Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor, TNF）、肿瘤抑制蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)等可能是茵陈-栀子药对治疗乙型肝炎肝硬化的关键靶点。GO注释分析涉及对激素的反应、对异种刺激的反应、膜筏、受体复合物、蛋白激酶活性、激酶结合等信号通路。KEGG通路...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨黄葵胶囊治疗肾病综合征的作用机制

目的：基于网络药理学探讨黄葵胶囊治疗肾病综合征的作用靶点及分子机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、PubChem、Swiss Target Prediction数据库及国内外文献检索黄葵胶囊的活性成分,利用GeneCards、OMIM数据库筛选出肾病综合征相关靶点;运用Cytoscape 3.6.1软件构建“成分-潜在靶点”网络,并基于STRING平台构建黄葵胶囊治疗肾病综合征交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选关键靶点;使用Metascape数据库对潜在靶点进行基因本体论（GO）及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。将前3名关键化合物与排名居前3位的关键靶点蛋白利用PyMOL及AutoDock Vina等软件进行分子对接。结果：通过筛选共获得黄葵胶囊有效活性成分16个,潜在靶点358个,与肾病综合征共同靶点93个,其中关键靶点涉及白蛋白（Albumin,ALB）、蛋白丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、表皮生长因子受体（Epidermal Growth Factor Recep...     

西黄丸治疗非小细胞肺癌作用机制的网络药理学探究和分子对接验证

目的：采用网络药理学和分子对接的方法探究西黄丸防治非小细胞肺癌（NSCLC）潜在分子机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及BATMAN-TCM数据库中筛选分析西黄丸的有效活性成分及作用靶点。在GeneCards数据库与人类孟德尔遗传数据库（OMIM）中检索获取NSCLC的相关靶点,选取与西黄丸的交集靶点作为研究靶点。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图。采用Cytoscape 3.7.0软件构建药物-靶点-疾病可视化互作网络图。使用DAVID数据对筛选分析出的关键靶点,进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最后运用AutoDock Vina软件和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果：通过筛选得到西黄丸51个主要活性成分,包括槲皮素、β-谷甾醇等,其中作用于NSCLC的靶点有178个,关键靶点有MAPK1、JUN、AKT1、TP53、RELA等。GO和KEGG分析结果显示,西黄丸治疗NSCLC的机制涉及多个生物学过程及PI3K-AKT信号通路、MAPK信号通路、TNF信号通路等多种信号通路。药物有效活性成分与关键靶点对接活性良好。结论：网络药理学分析显示西黄丸治疗NSCLC是多成分、多靶点、多通路协同起效,为后续相关实验提供了充分的理论依据。     

基于网络药理学和分子对接探讨虎杖-金钱草药对治疗肝癌作用机制

目的：通过网络药理学及分子对接方法探究虎杖-金钱草药对治疗肝癌的作用机制。方法：以TCMSP、TCMIP、BATMAN-TCM、HERB、GeneCards、OMIM、DisGeNET、TTD数据库为来源,获取虎杖及金钱草的活性成分、作用靶点及肝癌疾病靶点。使用STRING数据库和Cytoscaape软件对共同靶点绘制蛋白质相互作用网络（PPI）获取核心靶点。应用DAVID数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。应用Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点-疾病-信号通路”网络。最后运用AutoDock Tools、PyMOL进行分子对接验证。结果：经过筛选得到“虎杖-金钱草”治疗肝癌的潜在核心靶点17个。GO功能分析得到663条结果,KEGG通路富集分析主要涉及癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等139条通路。分子对接结果显示,虎杖-金钱草主要活性成分与关键潜在作用靶点Akt1、Src、EGFR、HSP90AA1和ErbB2均能自发结合且具有较好的亲和力。结论：虎杖-金钱草可能结合多个成分和靶点,调控多条通路发挥靶向治疗肝癌的作用。     

基于网络药理学及体外实验探讨淫羊藿及其活性成分治疗肝癌的作用机制

目的 通过网络药理学、分子对接技术和体外实验验证研究淫羊藿及其活性成分治疗肝癌的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）筛选淫羊藿的活性成分和作用靶点,利用GeneCards、DrugBank等5个数据库筛选肝癌相关靶点。筛选二者共同的潜在功能靶位,运用Cytoscape 3.9. 0软件构建肝癌-淫羊藿活性成分-靶点网络图,使用R语言进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结合STRING数据库和Cytoscape3.9. 0对交集靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选核心靶点。运用AutoDock、Vina和PyMOL软件对淫羊藿关键成分与核心靶点进行分子对接验证。最后通过体外细胞实验验证网络药理学结果。结果 分析获得19个淫羊藿主要活性成分,淫羊藿与肝癌共同靶点139个,靶点经富集分析得到2 347个GO生物学功能和171条信号通路;分子对接结果显示核心成分与关键靶点均有较高的结合能力。体外实验结果表明核心成分淫羊藿素能显著抑制肝癌细胞系MHCC97H和MHCC97L的增殖,并抑制Bcl-2凋亡调节因子（Bcl-2）和...     

连翘治疗痤疮的网络药理学作用机制

目的：运用网络药理学及分子对接技术探讨连翘治疗痤疮的作用机制。方法：利用Gene Cards、OMIM和NCBI数据库收集相关的痤疮靶点,并通过中药系统药理数据库与分析平台（TCMSP）检索连翘的有效成分。利用Swiss Target Prediction数据库获取连翘活性成分的靶点。将痤疮相关靶点与连翘活性成分靶点取交集即为连翘治疗痤疮的潜在靶点,利用STRING数据库构建靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并将结果导入Cytoscape 3.7.1软件进行拓扑分析,提取核心靶点。运用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建“活性成分-核心靶点-通路”网络,并进行拓扑分析,筛选得到核心成分和核心靶点。通过Auto Dock Vina进行分子对接,验证核心成分和核心靶点的相互作用。结果：共获得连翘活性成分19个,对应靶点509个、疾病靶点1 561个、共有靶点89个,经过蛋白质-蛋白质相互作用分析及拓扑分析,得到核心靶点16个,核心靶点涉及681个基因功能条目和160条通路（P <0.05）。对“活性成分-核心靶点-通路”网络图进行拓扑分析,共筛选...     

基于网络药理学探讨杜仲治疗类风湿关节炎的作用机制

目的：基于网络药理学探讨杜仲治疗类风湿关节炎（Rheumatoid Arthritis,RA）的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）筛选杜仲的活性成分及其作用靶点;利用GeneCards及OMIM数据库检索RA相关靶点基因,并借助String数据库、Cytoscape 3.7.1软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络、活性成分-靶点网络;通过David数据库进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：筛选后得到杜仲活性成分28个、作用靶点181个、RA相关靶点4 822个、杜仲治疗RA的潜在作用靶点135个。包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt serine/Threonine kinase1,AKT1)、白细胞介素（Interleukin,IL）-6、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)、IL-1β等。GO富集分析获得生物过程561条,细胞组分60条和分子功能117条。KEGG富集分析得到156条通路,涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物（Advanced ...     

基于广泛靶向代谢组学技术和网络药理学方法探讨五味沙棘散治疗慢性阻塞性肺病的作用机制

目的：运用广泛靶向代谢组学技术、网络药理学方法和分子对接技术探讨五味沙棘散治疗慢性阻塞性肺病的活性成分及潜在的作用机制，为后续开展实验研究提供生物信息学基础。方法：采用广泛靶向代谢组学技术鉴定五味沙棘散的化学成分。通过SEA数据库预测五味沙棘散活性成分的潜在靶点；通过GeneCards数据库、Drugbank数据库等数据库筛选五味沙棘散治疗慢性阻塞性肺病的核心靶标，利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体（GO）分析和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，应用Cytoscape 3.8.2软件构建“成分-交集靶点-关键通路-疾病”网络，并通过Discovery Studio 2019软件对五味沙棘散的关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证。结果：采用广泛靶向代谢组学鉴定了472种化学成分。其中，有18个成分与慢性阻塞性肺病密切相关，分别为Benzyl acetate、1-Naphthylacetic acid、Ferulic acid、Moschamine、Ethyl trans-p-methoxycinnamate、1,3-Diphenyl-2-propen-1-one、Meth...     

基于网络药理学及分子对接探讨疏肝降脂片治疗乳腺癌相关血脂异常的作用机制

目的：运用网络药理学及分子对接探讨疏肝降脂片治疗乳腺癌相关血脂异常的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索疏肝降脂片所含药物的有效成分及作用靶点,采用GeneCards、DRUGBANK数据库筛选疾病靶点,使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络,利用STRING平台构建核心靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,在Metascape平台针对核心靶点蛋白开展基因本体（GO）功能与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,用AutoDock Vina软件进行活性成分与核心靶点的分子对接。结果：筛选药物有效活性成分104个及其潜在靶点288个,乳腺癌靶点6 302个,血脂异常靶点1 852个。药物活性成分主要有槲皮素、山柰酚、木樨草素、柚皮素、异鼠李素、黄柏酮,核心靶点主要有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1 (AKT1)、肿瘤坏死因子（TNF）、V-JUN肉瘤病毒17癌基因同源物（JUN）、信号传导转录激活因子3 (STAT3)、肿瘤蛋白P53 (TP53)、磷脂酰肌醇-3-激酶（PIK3CA）、白细胞介素-6 (IL-6...     

基于网络药理学的柴胡疏肝散治疗抑郁症、肠易激综合征、动脉粥样硬化的异病同治机制分析全文替换

目的：随着社会发展抑郁症（Major Depressive Disorder,MDD）、肠易激综合征（Irritable Bowel Syndrome,IBS）、动脉粥样硬化（Atherosclerosis,AS）发病率日益升高,且随着时间推移,常常互相伴发,给临床用药造成了困扰。而中药复方的整体治疗观念,具有多成分、多靶点、多层次治疗的优势,提高疗效的同时,可以减少患者的用药频次。以中医理论为指导的原则下,通过网络药理学研究模式,从分子层面挖掘柴胡疏肝散对MDD、IBS、AS“异病同治”的潜在作用机制。方法：使用中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）、STITCH、Gene cards数据库筛选出柴胡疏肝散的化学成分、作用靶点及疾病靶点。将药物靶点及疾病靶点取交集获取共有靶点,借助STRING数据库获得蛋白质相互关系。通过Cytoscape3.8.0软件构建“中药-化合物-靶点-疾病”网络、“异病同治”共有机制网络及蛋...     

基于网络药理学和分子对接技术的银柴胡解热作用机制探讨

目的：采用网络药理学与分子对接技术探讨银柴胡解热作用的机制。方法：借助中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中医药整合药理学研究平台（TCMIP）和中药分子机制生物信息学分析工具（BATMANTCM）筛选银柴胡活性成分和相关作用靶点;使用GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选发热相关靶点;通过STRING数据库构建活性成分靶点与发热疾病靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用Cytoscape软件的Network Analysis插件对获得的PPI网络进行拓扑分析,筛选核心节点;使用Venny软件获得银柴胡活性成分靶点、发热疾病靶点和核心节点的交集靶点,并通过进一步的拓扑分析筛选得到关键成分和关键靶点;通过DAVID数据库进行基因本体（GO）功能注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Schr?dinger软件对关键靶点与对应的关键成分进行分子对接。结果：银柴胡解热关键成分为银柴胡胺D和银柴胡新木质素-β-D-葡萄糖苷A～D,71个关键靶点主要包括促丝裂原活化蛋白激酶10 (MAPK10)、蛋白激酶B1 (Akt1)、热休克蛋白90AA1(HS...