基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁（Post-stroke Depression, PSD）的潜在活性成分和可能的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和蛋白质序列数据库（Uniprot）筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果：共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接...     

基于网络药理学探讨当归-牛膝防治骨关节炎的作用机制＊

目的 运用网络药理学、分子对接、细胞验证方法，探讨当归-牛膝防治骨关节炎（Osteoarthritis，OA）的作用机制。方法 从TCMSP筛选当归-牛膝的活性成分，并用Swiss Target Prediction预测其作用靶点；从GEO、GeneCards、DisGeNET、TTD数据库收集OA相关靶点。取活性成分与OA交集靶点，借助Cytoscape 3.8.2的BisoGenet构建交集靶点的蛋白相互作用（Protein-protein interaction，PPI）网络，CytoNCA拓扑分析获得PPI核心靶点，ClueGO对PPI核心靶点进行GO和KEGG富集分析。运用Autodock 4.2软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接。构建IL-1β诱导的软骨炎症细胞模型，RT-PCR与流式细胞仪验证预测结果。结果 研究显示当归-牛膝活性成分与OA的交集靶点183个，PPI核心靶点373个；PPI核心靶点的GO富集分析涉及有丝分裂细胞周期相变等调控，KEGG涉及细胞周期、泛素介导的蛋白水解等信号通路；分子对接显示槲皮素、汉黄芩素、山奈酚与关键核心靶点ESR1、RELA、MAPK1、CDKN1A、CDK2具有较好亲和力。RT-PCR显示核心药效成分可调节细胞周期信号通路靶点的mRNA表达水平，增加软骨细胞的S、G₂/M期比例，提高软骨指标ACAN、COL2、SOX9的mRNA表达水平。结论 该研究验证了当归-牛膝药对可介导细胞周期信号通路而促使炎症软骨细胞的软骨增殖与修复，其防治OA的综合机制可涉及调节软骨细胞周期相变、促进软骨的增殖与修复、抗炎、抗凋亡等方面的多靶点、多途径机制，对临床实践具有重要指导意义。关键词： 网络药理学 当归 牛膝 骨关节炎 分子对接 作用机制 细胞周期     

基于网络药理学方法及分子对接技术探究清热祛湿汤治疗膝骨关节炎作用机制

目的：采用网络药理学方法及分子对接技术研究清热祛湿汤治疗膝骨关节炎的作用机制。方法： 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP） 数据库检索清热祛湿汤药物成分靶点； 通过TTD、 Genecards、OMIM 数据库检索膝骨关节炎靶点；制作韦恩图获取药物-疾病交集靶点；通过Cytoscape3.9.0 软件 绘制药物有效成分-疾病-共同靶点网络图；利用String 数据库构建蛋白相互作用（PPI） 网络；使用R 语言软 件对交集靶点进行基因本体（GO） 富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG） 富集分析； 使用 AutoDockTools1.5.6 等软件对药物主要有效成分与疾病核心靶蛋白进行分子对接验证。结果：清热祛湿汤的有 效成分为槲皮素、木犀草素等；PPI 网络构建获得的核心靶蛋白是蛋白激酶B 抗体（AKT1）、纤溶酶原激活物 抑制物1 （SERPINE1） 等；GO 富集分析获得1 902 条GO 条目；KEGG 富集分析获得105 条信号通路；将 5 种药物有效成分与5 种核心靶蛋白进行分子对接，均具有较好的结合活性。结论：清热祛湿汤治疗膝骨关节 炎具有多成分、多靶点、多途径的特点，具体通过发挥调控炎症反应、软骨基质降解、软骨细胞的凋亡和增殖 等作用，延缓膝骨关节炎的进展。     

基于网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用

目的 采用网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索黄芩主要活性成分和作用靶点，通过OMIM、GeneCards、TTD及DrugBank等数据库筛选糖尿病和阿尔茨海默病的主要靶点，构建活性成分-靶点网络；利用STRING 11.0进行蛋白质互作分析，构建PPI网络以筛选重要靶点；运用Metascape库对关键交集靶点进行GO和KEGG富集分析；利用Cytoscape 3.7.2将分析得到的重要靶点和通路构建药物成分-疾病靶点-通路网络；进一步对关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果 筛选出黄芩重要活性成分有汉黄芩素、黄芩素、金合欢素、降穿心莲黄酮等，PPI网络中关键交集靶点61个，核心靶点有AKT1、IL-6、MAPK14、TNF、PRKCA、VEGFA等。GO富集分析得到细胞组成101条，分子功能76条，生物过程1 413条；KEGG通路富集分析得到258条，主要涉及AGE-RAGE信号介导的糖尿病并发症通路、IL-17、MAPK、TNF、PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗通路等。分子对接结果可知，汉黄芩素、金合欢素、黄芩素、红...     

基于网络药理学和分子对接探讨“杜仲-牛膝”药对治疗骨质疏松的分子机制

目的:运用网络药理学和分子对接的方法探讨“杜仲-牛膝”药对治疗骨质疏松的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选杜仲、牛膝含有的活性成分及作用靶点;利用GeneCards、DisGeNET和CTD数据库收集骨质疏松（OP）相关靶点基因;采用Cytoscape 3.8.0软件和STRING数据库进行“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络的构建与分析;FunRich3.1.3软件DAVID数据库进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG） 富集分析（P<0.05）;运用Maestro version 11.5对主要活性成分及靶点蛋白进行分子对接。结果:获得“杜仲-牛膝”药对治疗OP的活性成分共42个和133个有效靶点;获得251条GO生物过程和90条相关信号通路,涉及PI3K-AKT、TNF、Wnt、HIF-1、MAPK信号通路等。结论:“杜仲-牛膝”药对可能通过调控细胞增殖、分化与凋亡、骨代谢来治疗OP,具有多成分、多靶点、多系统的特点,为系统阐明“杜仲-牛膝”药对主要成分治疗OP的分子机制提供了参考。     

基于网络药理学探讨三物黄芩汤治疗乳腺癌分子机制

目的：基于网络药理学探讨三物黄芩汤治疗乳腺癌的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选三物黄芩汤有效活性成分及潜在靶点,在Genecard、OMIM和TTD数据库中寻找乳腺癌相关靶点基因,取三物黄芩汤靶点基因与乳腺癌相关靶点基因共同靶点。通过Cytoscape 3.5.0软件构建“三物黄芩汤活性成分-潜在靶点-乳腺癌”网络图。运用String数据库构建构建蛋白质互作（PPI）网络图。对潜在靶点基因进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果：TCMSP数据库筛选得到三物黄芩汤有效活性成分83个,主要包括有木犀草素、槲皮素、菜豆素、汉黄芩素、黄芩素、黄芩苷以及地黄多糖等。与乳腺癌相关潜在作用靶基因99个,KEGG富集通路分析主要包括脂质-动脉粥样硬化信号通路、化学致癌作用-受体激活通路、PI3K/Akt信号通路以及IL-17信号通路等。结论：三物黄芩汤具有多活性成分,能通过多靶点、多通路发挥乳腺癌治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接探讨虎杖-金钱草药对治疗肝癌作用机制

目的：通过网络药理学及分子对接方法探究虎杖-金钱草药对治疗肝癌的作用机制。方法：以TCMSP、TCMIP、BATMAN-TCM、HERB、GeneCards、OMIM、DisGeNET、TTD数据库为来源,获取虎杖及金钱草的活性成分、作用靶点及肝癌疾病靶点。使用STRING数据库和Cytoscaape软件对共同靶点绘制蛋白质相互作用网络（PPI）获取核心靶点。应用DAVID数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。应用Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点-疾病-信号通路”网络。最后运用AutoDock Tools、PyMOL进行分子对接验证。结果：经过筛选得到“虎杖-金钱草”治疗肝癌的潜在核心靶点17个。GO功能分析得到663条结果,KEGG通路富集分析主要涉及癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等139条通路。分子对接结果显示,虎杖-金钱草主要活性成分与关键潜在作用靶点Akt1、Src、EGFR、HSP90AA1和ErbB2均能自发结合且具有较好的亲和力。结论：虎杖-金钱草可能结合多个成分和靶点,调控多条通路发挥靶向治疗肝癌的作用。     

基于网络药理学探讨牛膝治疗膝骨性关节炎的有效物质与作用机制研究

目的:采用网络药理学和生物系信息学方法筛选中药牛膝治疗膝骨性关节炎的主要成分、作用靶点和作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台获取牛膝化学成分,根据口服药物生物利用度和类药性分别筛选其有效活性成分并预测其作用靶点;通过Gene Cards、OMIM数据库检索膝骨性关节炎发病相关基因,应用VENNY 2. 1. 0构建牛膝治疗膝骨性关节炎靶点;应用Cytoscape 3. 7. 1软件构建药物-成分-靶点-疾病调控网络;通过SPRING构建PPI网络图并进行核心网络可视化展示;将药物-疾病关键靶点蛋白进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果:槲皮素、山奈酚、黄芩素是牛膝治疗膝骨性关节炎的关键化合物,IL-6、IL-1β、JUN、CXCL8、CCL2、IL-10是牛膝治疗膝骨性关节炎的关键靶点,GO富集分析显示牛膝治疗膝骨性关节炎关键靶点涉及生物过程条目有1080条,细胞组成条目有8条,分子功能条目有36条,KEGG通路分析显示AGEs-RAGE、IL-17、TNF是牛膝治疗膝骨性关节炎的主要机制通路。结论:牛膝可以通过多成分、多靶点、多通路机制协同治疗膝骨性关节炎。     

基于网络药理学和分子对接探讨苏叶黄连枳实治疗慢性肾功能衰竭的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接探讨苏叶黄连枳实治疗慢性肾功能衰竭（Chronic Renal Failure,CRF）的作用机制。方法：检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选药物有效成分,利用Swiss Target Prediction预测其潜在靶点。利用Gene Cards、OMIM及Drugbank检索CRF靶点,通过Venny获取药物有效成分作用靶点与疾病基因靶点的交集。利用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用Metascape进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,利用Autodock对有效成分与关键靶点行分子对接。结果：苏叶黄连枳实治疗CRF的核心有效成分为槲皮素、木犀草素等,核心靶点为白细胞介素（Interleukin,IL）-6、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）、IL-1β等。共得到1 288个GO富集结果,232条KEGG通路,通路涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体信号通路、癌症通路等。分子对接结果显示有效成分与关键靶点的结合能均<0。结论...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨四神煎治疗膝骨关节炎的作用机制

目的：基于网络药理学及分子对接技术分析四神煎治疗膝骨关节炎活性成分及药物分子的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及ETCM数据库筛选四神煎的有效药物成分及对应的靶点基因,使用GeneCards数据库获取膝骨关节炎的疾病靶点,使用R语言Limma包筛选差异表达的基因,接着对药物靶点与疾病靶点、差异表达基因取交集,并使用R语言ClusterProfiler包进行基因本体论（GO）/京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析;利用Cytoscape软件绘制关键靶点-功能、关键靶点-通路的调控网络图;对交集基因、药物活性成分绘制中药药理调控网络;针对交集靶点绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络图,并采用Cytoscape进行可视化;最后针对蛋白质-蛋白质相互作用网络中排名居前5位的基因及其对应的活性成分进行分子对接。结果：通过TCMSP及ETCM数据库筛选出药物靶点取并集,去重复后得到四神煎的药物靶点491个,膝骨关节炎的疾病靶点共1 477个;在膝骨关节炎/正常样本之间共存在2 988个差异表达的基因,其中1 539个基因在膝骨关节炎样本中为上调表达,1 449个基...     

基于网络药理学及分子对接技术探讨熟地黄-当归药对对男性不育症作用的机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探讨熟地黄-当归药对治疗男性不育症的作用机制。方法：通过检索中药系统药理数据库与分析平台（TCMSP）数据库及查阅文献筛选出熟地黄-当归药对的活性成分和对应靶点，借助GeneCards、人类孟德尔遗传数据库（OMIM）和DisGeNET数据库收集男性不育症作用靶点并通过Venny 2.1.0获得药物-疾病共同作用靶点，再利用Cytoscape 3.9.0软件构建“药对-活性成分-作用靶点”调控网络并进行拓扑分析。然后用STRING数据库作蛋白互作（PPI）分析筛选核心靶点。再用DAVID数据库对共同作用靶点进行基因本体（GO）富集分析与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析并构建“成分-靶点-关键通路”网络图。最后用AutoDock软件通过分子对接验证活性成分与核心靶点的结合能力。结果：熟地黄-当归药对存在6个活性成分及57个相关作用靶点，与男性不育症的1 361个靶点有19个交集靶点。这些靶点涉及蛋白结合、蛋白二聚体活动、酶结合、细胞老化与凋亡过程等生物学过程，干预癌症通路、Apoptosis通路、Hepatitis B通路、TNF信号通路等发...     

基于网络药理学和分子对接探析三黄泻心汤加味治疗上消化道出血的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探析三黄泻心汤加味治疗上消化道出血(UGIB)的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索三黄泻心汤活性成分及作用靶点，通过Gene Gards、OMIM、Pharmgkb及DrugBank疾病数据库获取UGIB疾病靶点，并获取二者交集靶点，借助Cytoscape3.9.0软件及STRING数据库构建中药-活性成分-靶点网络图、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络及挖掘出网络中潜在的蛋白质功能及核心网络，采用R软件对交集靶基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，最后通过AutoDock Tools及PyMOL等平台进行分子对接，预测三黄泻心汤加味关键成分与关键靶点的结合度。结果 共得到三黄泻心汤加味有效活性成分87个，UGIB疾病靶点3350个，二者交集靶点141个，富集得到GO中2149个生物过程条目，63个细胞组分条目，179个分子功能条目和168条KEGG通路。三黄泻心汤加味主要通过槲皮素、木犀草素、山柰酚、汉黄芩素、黄芩素、金合欢素等活性成分调节关键靶点ESR1、 MYC、 TP...     

小儿化毒散治疗上呼吸道感染的网络药理学及分子对接研究

目的：探讨小儿化毒散治疗上呼吸道感染的网络药理学机制。方法：从中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选小儿化毒散中的主要化学成分并收集潜在作用靶点;从GeneCards数据库、OMIM数据库及TTD数据库筛选人的上呼吸道感染疾病靶点;利用在线程序绘制韦恩图并获得小儿化毒散与上呼吸道感染的共同靶点,应用Cytoscape软件构建“中药-重要活性成分-疾病靶点”作用网络图;运用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;使用DAVID平台进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析;应用分子对接将化合物-靶点可视化处理。结果：小儿化毒散共筛选出131个有效化合物和相应靶点107个,上呼吸道感染筛选出7 339个相关疾病靶点,并得到92个共同作用靶点,富集分析筛选后得到30个GO条目和46条KEGG信号通路,分子对接得到3个关键化合物和1个靶点。结论：小儿化毒散治疗上呼吸道感染可能通过其关键成分槲皮素、黄芩素和异鼠李素作用于IL6、HIF1A等13个关键靶点蛋白,调节炎症反应、控制缺氧机制进而发挥治疗上呼吸道感染的治疗效果。     

基于网络药理学研究真武汤治疗扩张型心肌病的作用机制

目的：通过网络药理学方法和分子对接技术研究真武汤治疗扩张型心肌病（Dilated Cardiomyopathy,DCM）的作用及其机制。方法：使用中药系统药理学数据库与分析平台（TCSMP）等数据库精选真武汤中药材的主要活性成分和功能靶点,再利用Gene Cards、OMIM等数据库获取DCM的关键靶点,进而筛选出其共同作用靶点。并利用Cytoscape 3.8.2软件来建立“真武汤-有效成分-DCM-靶点”网络图。并通过String数据库获得蛋白质-蛋白质相互作用的网络,从而筛选出了关键基因。利用DAVID数据库对关键靶点做了基因本体论（GO）功能富集和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用RCSB PDB、Pub Chem数据库,利用Chem Bio3D、Py MOL以及Auto Dock pyrx内部的Vina软件工具做分子对接,最后使用DS2019软件作图。结果：共得到真武汤中药物主要活性成分59个、重要交集靶点38个,GO富集功能分析显示条目628个,KEGG富集通路126个。真武汤主要活性成分包括β-谷甾醇、山柰酚、常春藤皂苷元等;关键靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋...     

基于数据挖掘和网络药理学的肝肾亏虚型膝骨关节炎的用药规律及机制分析

目的：基于数据挖掘和网络药理学探讨治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎的用药规律及其作用机制。方法：通过检索国家知识基础设施数据库（CNKI）近10年治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎的方剂,运用中医传承辅助平台建立数据库,利用该软件的熵聚类等算法,总结出治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎方剂中的用药频率、核心组合、核心药物模式及归经频率以及得出新方组合。再运用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、基因表达综合（GEO）、STRING、Metascape等数据库及Cytoscape软件对其核心药物靶点与差异表达基因交集进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析,并构建药物-成分-靶点关系网络图。结果：筛选符合纳入标准的72首方剂所含药物进行频次统计分析,得出频次≥10次的药物有25味,其中使用频次较高的有牛膝、当归、熟地黄;药物的归经以肝、肾、脾经为主;通过系统熵聚类的层次聚类分析挖掘出核心组合药物16个及新处方8首;对核心药物牛膝、当归与熟地黄进行网络药理学分析得到槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇等关键活性成分及靶点176个;膝骨关节炎差异表达基因258个;核心Hub基因为IL-6、MMP9、CXCL8、JUN、VEGFA;KEGG富集分析主要在IL-17、TNF、Toll样受体、核因子κB等信号通路上。结论：治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎以补益肝肾、通络止痛为主,其机制可能通过作用IL-6、MMP9等靶点及对IL-17、TNF、Toll样受体、核因子κB等复杂通路的共同干预实现。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨参苓白术散治疗抗生素相关性腹泻的分子作用机制

目的：运用网络药理学及分子对接技术探讨参苓白术散治疗抗生素相关性腹泻（Antibiotic-associated Diarrhea,AAD）可能的分子作用机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取参苓白术散的活性成分与药物作用靶点,在Gene Cards和OMIM数据库中获取AAD的靶点。采用Cytoscape 3.6.0构建“中药-活性成分-参苓白术散”对AAD作用靶点的调控网络图,结合String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选出参苓白术散对AAD调控网络中潜在的最佳靶点。利用DAVID数据库进行基因本体论（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,运用Auto Dock Tools 1.5.6和Auto Dock Vina 1.0进行分子对接验证。结果：搜索得到参苓白术散活性化合物156个,对应的靶点276个;其中作用于AAD的靶点186个,AAD疾病靶点2 787个。有GO条目440条与KEGG通路127条。参苓白术散的核心化合物木犀草素、槲皮素、山柰酚作用于关键靶蛋白JUN原癌基因（Jun Proto-oncog...     

“白术-茯苓”药对治疗膝骨关节炎的“中药-成分-靶点”调控网络研究

目的:采用网络药理学和生物信息学方法探索"白术-茯苓"药对治疗膝骨关节炎(OA)的"中药-成分-靶点"调控网络和分子机制。方法:在BATMAN-TCM数据库检索白术(BAI ZHU)及茯苓(FU LING)对应的有效成分和靶点,筛选条件为score≥20且Adjusted P-value 0.05;在Gene数据库中获得膝骨关节炎对应的靶点,关键词为"Osteoarthritis";白术-茯苓对应的靶点和骨关节炎靶点的交集作为"白术-茯苓"药对干预骨关节炎的潜在作用靶点;使用DAVID数据库分析靶点的GO和KEGG信号通路富集结果;基于STRING数据库的信息分析蛋白质-蛋白质互相作用,通过Cytoscape 3.7.0软件进行PPI网络可视化构建和关键基因筛选。结果:"白术-茯苓"药对总共筛选出32个有效成分,对应548个靶点;骨关节炎对应得到626个靶点;通过映射,筛选出交集靶点为71个;中药-有效成分-靶点调控网络包含94个节点,133条边;GO功能富集结果主要涉及RNA聚合酶II启动子转录的正调控、炎症反应、转录的正调控,DNA模板、信号转导、凋亡过程的负调控等,KEGG富集结果主要涉及TNF信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用、NF-κB信号通路、破骨细胞分化等信号通路;Hub靶点包括白介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素1β(IL-1β)、基质金属肽酶9(MMP-9)等。结论:"白术-茯苓"药对通过多成分、多靶点、多条信号通路达到治疗膝骨关节炎的效果,其分子作用机制是错综复杂的。     

基于网络药理学探讨牛膝治疗骨关节炎的分子机制

目的基于网络药理学探讨牛膝可能的物质基础,分析牛膝治疗骨关节炎可能的分子机制。方法通过TCMSP数据库挖掘获取牛膝的活性成分、作用靶点,GeneCards和OMIM数据库预测和筛选牛膝活性成分治疗骨关节炎的作用靶点,采用Cytoscape 3.7.2软件构建活性成分-作用靶点网络,采用String 10.0构建蛋白质与蛋白质相互作用(PPI)网络,最后通过GO分析和KEGG通路富集分析牛膝防治骨关节炎的作用机制。结果共筛选得到牛膝180个活性成分,涉及1035个作用靶点。结论网络分析结果表明,牛膝主要涉及细胞过程、代谢过程、对应激的应答等生物过程,通过调节AGE-RAGE、IL-17、TNF等信号通路来发挥治疗骨关节炎作用。研究体现了牛膝多成分-多靶点-多途径的作用特点,为进一步开展牛膝治疗骨关节炎作用机制的研究提供了新的思路与方法。     

基于网络药理学和分子对接探讨尿C 方治疗IgA 肾病作用机制

目的：通过网络药理学探讨尿C 方治疗IgA 肾病（IgAN） 的关键成分和作用机制。方法：通过中 药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、PubChem、Swiss ADEM 和SwissTargetPrediction 获得尿C 方作用 靶点;应用Cytoscape 3.9.1 软件构建“药物-成分-靶点”相互作用网络;通过GeneCards、OMIM 和DisGeNET 平台获得IgAN 作用靶点;通过Venn 2.1 制作韦恩图获得尿C 方和IgAN 之间的交叉靶点并进行鉴定和可视 化,并利用STRING 数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI）;借助DAVID 数据库对交集靶点进行GO 和KEGG 富集分析并运用微生信在线平台对交集靶点进行GO 和KEGG 富集分析可视化;使用Autodock Vina 软件进行分子对接验证,并利用PyMol 软件得出对接结果。结果：共筛选得到尿C 方有效成分70 种及对应 1 363 个作用靶点,其中确定了10 个关键活性成分。IgAN 相关靶点1 593 个,除重复项后获得823 个疾病靶 点,交集靶点111 个。GO 富集分析得到706 个BP 条目,63 个CC 条目,123 个MF 条目。KEGG 富集分析得 到161 条与IgAN 显著相关的通路。分子对接结果表明,核心活性成分与核心靶点之间存在较强的结合活性。 结论：尿C 方治疗IgAN 的作用机制可能是通过槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、黄芩素等调控AGE-RAGE 信号 通路、IL-17 信号通路、脂质和动脉粥样硬化等发挥治疗作用。