基于网络药理学研究益气温阳护卫汤治疗哮喘的分子机制

目的：运用网络药理学研究益气温阳护卫汤治疗哮喘的分子机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索益气温阳护卫汤中十味中药的主要化学成分,通过TCMSP、DrugBank、Swiss平台查找及预测中药化合物对应靶点,在OMIM、Malacards、CTD、Disgent数据库中搜索哮喘相关靶点,取二者交集导入Swiss平台,获得蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选核心作用靶点并构建益气温阳护卫汤-潜在靶点-哮喘作用网络。对核心靶点进行基因本体论（GO）分子功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析。采用DiscoverStiudio软件对活性成分与靶点进行分子对接。结果：筛选得益气温阳护卫汤中主要活性成分221个,该活性成分有效靶点为770个,哮喘疾病靶点259个,取交集得核心靶点66个。GO富集分析显示靶点基因主要涉及炎症反应、凋亡过程的负调控、调控血管生成、酶结合、细胞因子活性、血红素结合、激酶活性等;KEGG信号通路主要包括癌症通路、缺氧诱导因子-1信号通路、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）信号通路、钙信号通路、核因子-κB...     

宣白承气汤治疗支气管哮喘的网络药理学分析

目的 运用网络药理学方法探讨宣白承气汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选宣白承气汤的活性成分及作用靶点,通过GeneCards数据库筛选支气管哮喘的疾病相关靶点,获取二者交集靶点,即宣白承气汤治疗支气管哮喘的潜在作用靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“疾病-药物-活性成分-靶点”网络,并分析网络中的核心活性成分;将交集靶点导入STRING数据库进行蛋白互作（PPI）网络分析,筛选出潜在核心靶点;运用R语言软件包对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 共筛选得到34个活性成分及64个潜在作用靶点（交集靶点）;获得香叶木素、羟基芫花素、泽兰黄醇素、α-菠菜甾醇等核心活性化合物,IL-6、MAPK3、MMP-9、PPARG和ICAM1等核心靶点;共筛选得到67条信号通路,关键通路包括神经活性配体-受体相互作用信号通路、c AMP信号通路、钙信号通路、TNF信号通路、Th17细胞分化、Th1/Th2细胞分化等。结论 宣白承气汤可能是通过香叶木素、羟基芫花素等关键活性成分,作用于IL-6、MAPK3、MMP-9等潜在核心靶点,调控神经活性配体-受体...     

基于网络药理学探讨补肾益气方治疗支气管哮喘的作用机制

目的?采用网络药理学方法探讨补肾益气方治疗支气管哮喘的物质基础和作用机制。方法 采用中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）结合文献检索获取补肾益气方的有效成分，并结合UniProt知识库得到对应的靶点信息。利用OMIM、DrugBank、TTD和Genecards数据库挖掘哮喘相关靶点。通过Cytoscape3.7.1软件构建补肾益气方有效成分-靶点及哮喘-靶点网络，绘制维恩图以获得重叠靶点。利用String平台构建重叠靶点的蛋白相互作用网络，通过Cytoscape的Cytohubba模块依据度值获得核心靶点。使用Metascape数据库，对所获靶点进行富集分析。结果?筛选到黄芪17种有效成分及209个潜在靶点，淫羊藿23种有效成分及222个潜在靶点，生地黄2种有效成分及31个潜在靶点，综合分析得到237个补肾益气方有效成分的相关靶点，并同时筛选到930个哮喘相关靶点，匹配到103个重叠靶点。通过生物信息学分析，定位到20个核心靶点，进一步富集分析发现其发挥作用可能涉及白细胞介素-17（IL-17）、肿瘤坏死因子（TNF）、Toll样受体、NF-κB、NOD样受体、MAPK、PI3K-Akt等信号通路。结论?补肾益气方中槲皮素、山柰酚、刺芒柄花素、淫羊藿苷、淫羊藿素、谷甾醇、豆甾醇等成分可能是治疗哮喘的物质基础，与调节炎症反应、T细胞分化、氧化应激、平滑肌细胞增殖等机制有关。     

基于网络药理学探讨玉屏风散治疗支气管哮喘的作用机制

目的:运用网络药理学筛选玉屏风散治疗支气管哮喘的作用靶标及信号通路,为临床治疗提供有力依据。方法:利用TCMSP筛选中药活性成分和有效成分靶点信息。利用Uniprot数据库和Excel找出有效成分靶点信息基因名。在Gene Cards、OMIM、Drugbank数据库搜集疾病相关靶标,采用Venny软件对中药靶点基因与疾病靶点基因取交集,得到Venny交集图。将各个中药靶点基因共同输入Cytoscape软件,得到中药-靶标调控网络。通过String软件构建中药-疾病共同靶标的蛋白互作网络。将中药-疾病共同靶点基因进行GO和KEGG功能富集分析,采用Cytoscape软件做出共同靶点通路。结果:筛选得到玉屏风散治疗支气管哮喘的主要活性成分17个,中药-疾病共同靶点基因114个,推断其作用机制可能与糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、癌症途径、IL-17信号通路、PI3K-Akt信号通路等相关,并且可能起到关键作用。结论:基于网络药理学探讨玉屏风散治疗支气管哮喘的作用机制,有利于临床治疗。     

基于UPLC-Q-TOF-MS/MS及网络药理学探讨麻杏止哮颗粒治疗哮喘的有效成分和作用机制

目的 基于UPLC-Q-TOF-MS/MS技术和网络药理学探讨麻杏止哮颗粒治疗哮喘的有效成分和作用机制。方法 通过UPLC-Q-TOF-MS/MS技术及中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选麻杏止哮颗粒的活性成分和相关靶点;利用Disgenet、Genecards数据库检索哮喘疾病靶点,利用韦恩图绘制平台获取共有靶点,并将信息导入Cytoscope3.9.1软件和STRING在线分析平台,进行网络拓扑学分析,构建药物关键活性成分-关键靶点网络和药物-有效成分-核心靶点网络;基于核心靶点通过DAVID数据库进行基因本体（gene ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）富集分析。结果 结合质谱分析与数据库筛选得到药物活性成分24个,药物靶点147个,疾病靶点1483个,共同靶点106个,关键活性成分23个;经蛋白质相互作用分析及网络拓扑分析后,获取核心靶点10个,分别是肿瘤坏死因子、白细胞介素-6、细胞肿瘤抗原p53、白细胞介素-1β、血管内皮生长因子A、表皮生长因子受体、分裂原活化蛋白激酶3、半胱氨酸蛋白酶3、基质金属蛋白酶9、纤连蛋白1,药物有效成分5个,包括槲皮素、异鼠李素、汉黄芩素、柚皮素、儿茶素;GO富集到基因功能69个,KEGG富集到基因通路70条,分析结果表明,麻杏止哮颗粒治疗哮喘的作用机制是通过调节晚期糖基化终末化产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路在糖尿病并发症中的作用、分裂原活化蛋白激酶信号通路、白细胞介素-17信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路、人类巨细胞病毒感染通路等来发挥治疗哮喘的作用。结论 初步揭示了麻杏止哮颗粒治疗哮喘的有效成分和作用机制,为麻杏止哮颗粒药效物质基础研究奠定基础,为质量控制提供参考依据。     

基于网络药理学探讨麻杏二三汤治疗支气管哮喘作用机制

目的：联合网络药理学数据库研究麻杏二三汤治疗支气管哮喘的作用机制。方法：运用传统中药系统药理学数据库和分析平台与有机小分子生物活性数据库获取麻黄、苦杏仁、陈皮、半夏、茯苓、紫苏子、莱菔子、白芥子、诃子、甘草的有效成分及对应靶点;从人类基因数据库和在线人类孟德尔遗传数据库获取支气管哮喘相关靶标,同时利用Venny 2.1在线网络获取交集基因;运用Cytoscape (Version3.7.2)和STRING数据库构建药物-成分-靶标-疾病网络图和蛋白质-蛋白质相互作用网络,进而运用cytoHubba插件鉴定出核心靶标。最后,运用Metascape数据库进行基因本体（GO）富集分析与京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：研究筛选得到麻杏二三汤治疗支气管哮喘的主要治疗靶标包括血管内皮生长因子A (VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子（TNF）、禽肉瘤病毒17(JUN)、p53肿瘤蛋白（TP53）、信号转导及转录激活蛋白3 (STAT3)、促分裂素原活化蛋白激酶3 (MAPK3)、前列腺内过氧化物合成酶2 (PTGS2)、促分裂素原活化蛋白激酶1 (MAPK...     

基于网络药理学探讨丹参饮治疗胃癌前病变的作用机制

目的:利用网络药理学分析探讨丹参饮治疗胃癌前病变的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取丹参、砂仁、檀香的活性成分及靶点,通过GeneCards数据库获取胃癌前病变疾病基因,在与丹参饮靶点映射后获得交集靶点,利用Cytoscape 3.7.1软件构建“中药-有效成分-交集靶点-疾病”网络图,并分析该网络;通过STRING数据库结合Cytoscape 3.7.1软件构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络;将交集靶点导入至DAVID(2021 Update)数据库,进行基因本体论(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:预测获得丹参饮治疗胃癌前病变的有效活性成分76个,67个交集靶点。蛋白质-蛋白质相互作用分析得到18个核心靶点。GO功能富集分析获得369项条目,KEGG富集在90条通路上。结论:丹参饮可能通过木犀草素、丹参酮ⅡA等有效成分调节磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路、叉头框蛋白(FoxO)信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1α信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等,发挥抗炎、...     

基于网络药理学探讨哮喘宁颗粒治疗支气管哮喘的作用机制及PI3K/Akt信号通路验证

目的 基于网络药理学预测哮喘宁颗粒治疗支气管哮喘的潜在分子机制，并采用卵蛋白（OVA）致敏诱发的支气管哮喘大鼠模型对关键信号通路之一磷脂酰肌醇3-激酶（PI3K）/蛋白激酶B（Akt）进行实验验证。方法 利用传统中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）和中药分子机制生物信息学分析网络（BATMAN-TCM）筛选哮喘宁颗粒的主要有效成分和作用靶点。通过人类基因数据库（GeneCards）、人类孟德尔遗传靶点数据库（OMIM）等5个疾病数据库获取支气管哮喘相关的疾病靶点。筛选并通过韦恩图获得两者的共同靶标，使用蛋白相互作用数据库（STRING）构建化合物-疾病的蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI），并用Cytoscape 3.8.0建立“哮喘宁关键活性成分-核心靶基因”网络。通过基因本体（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。制备OVA刺激诱导的支气管哮喘大鼠模型，通过苏木素-伊红（HE）染色观察支气管与肺组织炎症情况，蛋白免疫印迹法（Western blot）实验验证网络药理学富集分析结果。结果 该实验分别获取哮喘宁活性成分232个，相关靶点4 687个，收集哮喘宁与支气管哮喘的共同靶点233个，包括嗜酸性粒细胞衍生神经毒素1（EDN1）、环磷腺苷效应元件结合蛋白1（CREB1）、细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A（CDKN1A）、表皮生长因子受体（EGFR）、丝裂原活化蛋白激酶14（MAPK14）、Akt1等。KEGG通路分析筛选了186条相关信号通路，显示PI3K/Akt信号通路可能在哮喘宁治疗支气管哮喘的过程中起关键作用。动物实验表明，与哮喘模型组比较，哮喘宁组可明显减轻大鼠气道炎症反应和平滑肌增生，并明显下调PI3K、Akt蛋白表达（P<0.05）。结论 哮喘宁治疗哮喘具有多成分、多靶点、多通路协同作用的特点，其中哮喘宁可能通过调控PI3K/Akt信号通路相关基因的表达，进一步发挥抗炎症的药理效应，为后续深入研究哮喘宁治疗支气管哮喘的复杂机制提供了理论依据。     

基于网络药理学的三七治疗消化性溃疡的作用机制研究

目的：运用网络药理学方法预测三七治疗消化性溃疡的潜在作用靶点及通路。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）获取三七有效成分及相应的蛋白质靶点,通过Uniprot数据库进行蛋白质靶点-基因匹配,并标准化蛋白质信息。借助人类基因组注释（GeneCards）数据库获取消化性溃疡发病相关基因,与三七作用靶点取交集后获得三七—消化性溃疡的交集靶点。通过STRING在线数据库构建蛋白质相互作用（Protein-Protein Interaction,PPI）网络,利用Cytoscape 3.7.1软件构建中药调控网络并进行可视化展示。使用Metascape数据库进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路富集分析。最后利用Cytoscape 3.7.1软件,制作“活性成分-靶点-通路”网络。结果：预测到三七有8个有...     

基于网络药理学和分子对接探讨尿C 方治疗IgA 肾病作用机制

目的：通过网络药理学探讨尿C 方治疗IgA 肾病（IgAN） 的关键成分和作用机制。方法：通过中 药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、PubChem、Swiss ADEM 和SwissTargetPrediction 获得尿C 方作用 靶点;应用Cytoscape 3.9.1 软件构建“药物-成分-靶点”相互作用网络;通过GeneCards、OMIM 和DisGeNET 平台获得IgAN 作用靶点;通过Venn 2.1 制作韦恩图获得尿C 方和IgAN 之间的交叉靶点并进行鉴定和可视 化,并利用STRING 数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用网络（PPI）;借助DAVID 数据库对交集靶点进行GO 和KEGG 富集分析并运用微生信在线平台对交集靶点进行GO 和KEGG 富集分析可视化;使用Autodock Vina 软件进行分子对接验证,并利用PyMol 软件得出对接结果。结果：共筛选得到尿C 方有效成分70 种及对应 1 363 个作用靶点,其中确定了10 个关键活性成分。IgAN 相关靶点1 593 个,除重复项后获得823 个疾病靶 点,交集靶点111 个。GO 富集分析得到706 个BP 条目,63 个CC 条目,123 个MF 条目。KEGG 富集分析得 到161 条与IgAN 显著相关的通路。分子对接结果表明,核心活性成分与核心靶点之间存在较强的结合活性。 结论：尿C 方治疗IgAN 的作用机制可能是通过槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、黄芩素等调控AGE-RAGE 信号 通路、IL-17 信号通路、脂质和动脉粥样硬化等发挥治疗作用。     

麻杏石甘汤“异病同治”肺炎支原体肺炎与支气管哮喘的网络药理学机制研究

[目的] 研究利用网络药理学及分子对接技术探究麻杏石甘汤“异病同治”肺炎支气体肺炎（MPP）与支气管哮喘（BA）的共同潜在靶点及作用机制。[方法] 通过检索中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）与中国知识资源总库（CNKI）筛选麻杏石甘汤的活性成分及其作用靶点,运用UniProt数据库将其进行标准化。运用GeneCards、OMIM数据库收集MPP与BA疾病相关靶点。利用Venny2.1获取药物-疾病共有靶点。利用Cytoscape3.9.1软件构建疾病-药物-成分-靶点网络;将交集靶点输入STRING数据库进行蛋白相互作用蛋白相互作用（PPI）网络构建。利用DAVID数据库对共同靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。最后利用AutoDockTools软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。[结果] 筛选得到麻杏石甘汤有效成分123种,相关靶点208个。MPP疾病靶点374个,BA疾病靶点2 623个,药物-疾病交集靶点46个。GO富集分析获得生物过程276个（P<0.05）,细胞组成15个（P<0.05）,分子功能33个（P<0.05）。KEGG通路富集分析获得麻杏石甘汤治疗MPP与BA的共同通路主要有糖尿病并发症晚期糖基化终产物及其受体（AGE-RAGE）信号通路、白细胞介素-17（IL-17）信号通路、肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、低氧诱导因子-1（HIF-1）信号通路等;分子对接表明核心成分与关键靶点多能形成稳定结构。[结论] 麻杏石甘汤通过多成分、多靶点、多途径的特点治疗MPP与BA,为中医“异病同治|理论提供新的思路,同时也为麻杏石甘汤的临床应用及机制研究提供了生物信息学依据。     

基于网络药理学探讨茵栀黄口服液治疗黄疸的作用机制研究

目的：基于网络药理学方法构建茵栀黄口服液成分-靶点-通路的相互作用网络,探究其治疗黄疸可能的分子机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取茵栀黄口服液4种成分-茵陈、栀子、黄芩、金银花的有效活性成分,并对潜在靶点进行预测,进而绘制药物有效活性成分韦恩图及化合物-靶点网络图,通过人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、GeneCards及Drugbank数据库筛选出黄疸相关靶点,与获得的药物预测靶点取交集,再将交集靶点导入STRING数据库及Cytoscape 3.7.2,得到蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图;通过Metascape对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：茵栀黄口服液的4种成分-茵陈、栀子、黄芩、金银花在TCMSP数据库中共检索到530个化学成分,根据口服生物利用度(OB)和类药性(DL)共筛选出87个活性成分,得到作用于黄疸的靶点共233个,通过与疾病数据库筛选出黄疸相关靶点取交集,获得交集靶点122个,GO功能分析集中在对细胞凋亡、细胞因子受体结合的调控,对多种蛋白激酶活性的调节等方面,KEGG通路分析得到T细胞受体信号通路、IL-17信号通路、PI3K-AKT信号通路、核因子κB信号通路等通路。结论：本研究结果显示茵栀黄口服液治疗黄疸具有多成分、多靶点的作用特点,并预测了可能的作用机制,为后期实验研究提供了理论依据。     

基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁（Post-stroke Depression, PSD）的潜在活性成分和可能的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和蛋白质序列数据库（Uniprot）筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果：共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接...     

基于网络药理学及动物实验探讨抗敏止嗽颗粒治疗支气管哮喘的作用机制

目的利用网络药理学方法探讨抗敏止嗽颗粒治疗支气管哮喘的潜在作用机制, 并结合动物实验加以验证。方法借助BATMAN-TCM数据库筛选抗敏止嗽颗粒的活性成分及对应靶点信息, 通过GeneCards、OMIM数据库获得支气管哮喘的相关疾病靶点, 将药物靶点与支气管哮喘靶点取交集后导入STRING数据库, 建立PPI网络, 采用Cytoscape 3.9.1软件构建"药物-活性成分-交集靶点"网络, 筛选核心靶点, 利用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。制备卵蛋白诱导的哮喘小鼠模型, 经抗敏止嗽颗粒干预后, 观察小鼠肺组织病理学变化, 采用ELISA法检测血清TNF-α、IL-6、IL-1β水平。结果得到抗敏止嗽颗粒活性成分240个, 潜在作用靶点1 364个, 筛选得到TNF、IL-6、AKT1、ALB、IL-1β等11个核心靶点。GO功能富集分析结果显示, 抗敏止嗽颗粒治疗支气管哮喘主要涉及蛋白质磷酸化的正调节、炎症反应的调节、脂多糖反应等生物进程及TNF、MAPK、IL-17等信号通路。动物实验显示, 抗敏止嗽颗粒可降低血清TNF-α、IL-6、IL-1β水...     

基于网络药理学和分子对接探究天冬治疗过敏性哮喘的作用机制

目的：运用网络药理学方法和分子对接技术探究天冬治疗过敏性哮喘的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、TCMID及BATMAN-TCM、STP数据库获取天冬活性成分和靶点，通过GeneCards和OMIM、TTD数据库获得过敏性哮喘的治疗靶点，利用Venny 2.1得到交集靶点，并采用STRING数据库绘制蛋白互作(PPI)网络。应用Metacape进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析，使用Cytoscape 3.9.1构建“药物-活性成分-疾病-靶点网络”,运用Autodock vina 1.1.2进行分子对接验证。结果：筛选得到天冬8个活性成分、323个活性成分靶点基因和2629个疾病靶点基因以及169个交集基因，关键靶点包括蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、SRC、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、MMP9、白细胞介素2(IL2)等；涉及治疗过敏性哮喘的GO分析2212条，KEGG分析193条，主要通过磷酯酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、受体相关蛋白1(Rap...     

连翘治疗痤疮的网络药理学作用机制

目的：运用网络药理学及分子对接技术探讨连翘治疗痤疮的作用机制。方法：利用Gene Cards、OMIM和NCBI数据库收集相关的痤疮靶点,并通过中药系统药理数据库与分析平台（TCMSP）检索连翘的有效成分。利用Swiss Target Prediction数据库获取连翘活性成分的靶点。将痤疮相关靶点与连翘活性成分靶点取交集即为连翘治疗痤疮的潜在靶点,利用STRING数据库构建靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并将结果导入Cytoscape 3.7.1软件进行拓扑分析,提取核心靶点。运用DAVID数据库对核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建“活性成分-核心靶点-通路”网络,并进行拓扑分析,筛选得到核心成分和核心靶点。通过Auto Dock Vina进行分子对接,验证核心成分和核心靶点的相互作用。结果：共获得连翘活性成分19个,对应靶点509个、疾病靶点1 561个、共有靶点89个,经过蛋白质-蛋白质相互作用分析及拓扑分析,得到核心靶点16个,核心靶点涉及681个基因功能条目和160条通路（P <0.05）。对“活性成分-核心靶点-通路”网络图进行拓扑分析,共筛选...     

基于网络药理学探讨蠲哮汤治疗哮喘的作用机制

目的：运用网络药理学方法探讨蠲哮汤对哮喘的防治作用及可能的分子机制。方法：利用中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）筛选蠲哮汤药物活性成分及作用的靶蛋白,通过PubChem和Swiss Target Prediction数据库收集活性成分作用靶点的基因名,从GeneCards和OMIM数据库中获得哮喘疾病相关靶点,利用Venny 2.1.0获得的二者交集靶点即为蠲哮汤治疗哮喘的潜在作用靶点。利用Cytoscape 3.9.0软件构建“中药-活性成分-作用靶点”网络图,采用STRING数据库构建蠲哮汤治疗哮喘潜在作用靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络,并利用Cytoscape 3.9.0软件对其进行拓扑学分析,筛选出核心靶点。进一步利用DAVID数据库对筛选得到的靶点进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,进一步筛选重要化合物与疾病靶点,进行分子对接预测。结果：共得到蠲哮汤60个潜在活性成分,预测到110个作用靶点。收集哮喘靶点1 432个,取交集得到蠲哮汤治疗哮喘的作用靶点36个,对应活性成分23个,其中以槲皮素、山柰酚、芦丁和柚皮素为主。拓扑分析得到3...     

基于网络药理学和生物信息学筛选小青龙汤治疗支气管哮喘的关键基因和通路

目的 运用网络药理学与生物信息学方法构建“疾病-基因-靶点-成分-药物”网络以探索小青龙汤治疗支气管哮喘的关键基因和信号通路。方法 基于高通量基因表达（GEO）数据库筛选哮喘与健康人差异基因,通过TCMSP数据库检索小青龙汤中药物活性成分,筛选疾病基因和药物成分靶点作为交集基因,采用R语言,Cytoscape 3.7.2软件中不同软件包分别对交集基因进行蛋白互作（PPI）分析,基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果 GEO数据库中编号为Series GSE43696符合研究要求,内含108张芯片数据,通过筛选得到差异表达基因820个;小青龙汤中共含有活性成分169个,对应作用靶点246个;通过小青龙汤靶基因与疾病基因取交集共获得25个交集基因;PPI网络结果提示91个靶点可能参与小青龙汤作用机制中;GO富集分析共涉及包括氧化应激、炎症反应、细胞外基质调控、血管内皮生长因子功能调控在内的180条基因功能;KEGG富集分析共获得包括辅助性T细胞17（Th17）分化调控,白细胞介素-17（IL-17）,肿瘤坏死因子（TNF）,低氧诱导因子-1α（HIF-1α）在内的39条信号通路。结论 小青龙汤在哮喘干预中体现了多成分、多靶点、多通路特征,该研究结果可为小青龙汤机制挖掘提供重要依据。     

附子理中汤联合香砂六君子汤治疗脾肾阳虚型结直肠癌的网络药理学研究

目的：基于病证结合理论,运用网络药理学方法探讨附子理中汤联合香砂六君子汤治疗脾肾阳虚型结直肠癌（Colorectal Cancer,CRC）的潜在作用机制。方法：检索中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）数据库,获取附子理中汤合香砂六君子汤的活性成分,查询对应靶点;在Gene Cards、TTD和Drugbank数据库查找脾肾阳虚型CRC的主要靶点;构建药物有效成分、脾肾阳虚证与CRC靶点的交集韦恩图,借助STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用网络构建;在Metascape数据库进行基因本体论（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。利用Cytoscape 3.7.1软件绘制核心靶点网络图、“复方-成分-靶点-通路-疾病”网络图。结果：筛选获得附子理中汤合香砂六君子汤活性化合物204种,涉及潜在靶点236个,核心活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等。从Gene Cards、TTD和Drugbank数据库获得脾肾阳虚证基因1 068个,CRC基因1423个,药-证-病交集靶点77个。蛋白质-蛋白质相互作用网络图显示靠前的核心蛋白包括丝氨酸/苏氨...     

基于网络药理学探讨葶苈子治疗骨质疏松症的作用机制

目的：通过网络药理学研究葶苈子治疗骨质疏松症的作用机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台中检索葶苈子的有效成分及相关靶点;在Gene Cards数据库、OMIM数据库中检索骨质疏松症的疾病基因靶点;通过Perl脚本找到葶苈子与骨质疏松症的共同基因,使用String网站构建葶苈子与骨质疏松症之间蛋白质-蛋白质相互作用的关系网络;最后利用R软件对葶苈子与骨质疏松症交集基因进行基因本体论（GO）功能富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：从葶苈子中筛选出9个有效成分,作用于骨质疏松症127个靶点。蛋白质-蛋白质相互作用网络中的核心蛋白有蛋白激酶B(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素（Interleukin,IL）-6、血管内皮生长因子（Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF）A、JUN蛋白、IL-1β。基因KEGG富集分析得到与骨质疏松症紧密相关通路主要有晚期糖基化终末产物（Advanced Glycation End Products,AGE）-晚期糖基化终末产物受体（A...