柯萨奇病毒A组2型分离毒株序列及遗传进化分析

目的研究柯萨奇病毒A组2型(CVA2)分离株基因特征和遗传进化规律。方法利用分子信息学软件对GenBank核苷酸数据库收录CVA2分离株进行全长VP1区基因序列分析,构建系统进化树,测算分离毒株核苷酸和氨基酸同源性,计算核苷酸分子进化速率。采用Datamonkey在线软件预测正向选择位点,用Bioedit软件计算氨基酸置换熵值。结果共纳入CVA2分离株108株,主要为基因型D分离株;与原型株Fleetwood相比,各基因型分离株核苷酸和氨基酸同源性为79.3%～83.0%和94.6%～97.3%;基因型D分离株核苷酸进化速率为4×10~(-3)位点/年;选用SLAC模型发现1个正向选择位点,氨基酸置换熵值分析合计6个熵值大于0.6的位点。结论 CVA2分离株VP1区未出现明显的基因变异,与原型株亲缘性关系较远,需加强对CVA2分离毒株的实验室和分子流行特征监测。     

手足口病相关柯萨奇病毒A组8型全基因组序列特征分析

目的:研究中国2013-2018年手足口病病例分离的柯萨奇病毒A组8型（CV-A8）全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析。方法:对我国不同地区手足口病患者分离的11株CV-A8的全基因组序列,采用Sequencher 5.0、MEGA 7.0等软件对获取的全基因组序列进行比对和遗传进化分析。结果:序列比...     

柯萨奇病毒A组16型

柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A Group 16 Strain,CVA16）是手足口病（Hand,Footand Mouth Disease,HFMD）的主要致病原之一,对其生物学特征、致病机理、临床表现、实验室诊断、流行病学和分子流行病学的认识,有助于提高HFMD及其它相关疾病的防治水平。研发CVA16的诊断方法和疫苗,建立健全CVA16的流行病学和实验室监测网络,可以对CVA16引起的HFMD的流行进行预测和预警,对预防CVA16引起的HFMD有重要的意义。     

柯萨奇病毒A组16型研究进展

柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A Group 16 Strain,CA16）是手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD）主要致病原之一。自1948年从脊髓灰质炎患儿的粪便中分离出该病毒以来,已在全世界引起多次爆发或流行,累及地域广、人口多,受到人们的广泛关注。本研究对CA16病毒生物学特征、分子流行病学、实验室诊断等方面的研究进展作一概述。     

北京地区柯萨奇病毒A组6型、肠道病毒EV71型和柯萨奇病毒A组16型手足口病流行特征及临床特点比较

目的 了解柯萨奇病毒A组6型、肠道病毒71型和柯萨奇A组16型手足口病流行特征、临床特点,为指导临床诊断,调整手足口病防控策略提供科学依据.方法 采用前瞻性调查的方法,采集2013年8月至2015年9月在北京市儿童医院诊断的手足口病临床确诊病例的咽拭子,将手足口病原核酸检测阳性的病例分为CA6、EV71、CA16 3组,分析比较3组的临床特点、流行特征、预后及影响因素.结果 共采集HFMD临床诊断病例574例患儿咽拭子,CA6入组122例,EV71入组107例,CA16入组124例.①3组年龄、性别分布一致,差异无统计学意义.②不同年份流行主要毒株不同,但3种病原体引起的手足口病高峰均在夏季.③CA6组发热比例高达78.69％,明显高于EV71组(35.51％)和CA16组(37.90％) (P ＜0.001),平均体温约为38.78℃.CA6组表现大疱疹(9.01％)、结痂(8.20％)、皮疹部位疼痛(29.51％)、恢复期脱皮(38.52％)、脱甲(35.25％)、色素沉着(11.47％)比例高于EV71组、CA16(P ＜0.001).④3组在卫生学指标方面差异无统计学意义.结论 CA6、EV71和CA16感染所致的HFMD发病高峰季节一致;与EV71、CA16感染相比,CA6感染引起的高热比例较高,部分病例可表现为大疱疹,疼痛、脱皮、脱甲、色素沉着、结痂发生率高,预后较好.     

柯萨奇病毒A组6型手足口病的流行病学研究进展

自2008年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)在全球范围内引起了多次手足口病暴发,成为引发手足口病的主要病原体之一。作为导致手足口病流行的新病原体,目前尚无预防CVA6型手足口病的有效疫苗上市。CVA6易发生重组和变异,不仅小儿易感,也可对成年人造成感染,并常引起非典型症状,如脱甲等。因此,CVA6型手足口病已成为手足口病防控的重大挑战。本文就CVA6的病原学特征及其所致的CVA6型手足口病的流行特征、影响因素及防控措施等研究进展进行综述,为CVA6型手足口病预防控制措施的制定提供科学依据。     

柯萨奇病毒A组16型手足口病疫苗研究现况

手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)严重影响着婴幼儿健康。肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EV71)及柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)是引起手足口病的主要病原体,曾在全球多个国家或地区暴发,接种疫苗是预防手足口病的有效途径,EV71疫苗已上市,但是CA16疫苗相关研发进展较缓慢,目前仍无相关疫苗上市。本文对CA16型灭活疫苗、减毒活疫苗、病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)疫苗、DNA疫苗、重组嵌合病毒疫苗及亚单位疫苗的相关研究进展做一综述。     

济南市柯萨奇病毒A组6型手足口病流行病学特征分析

摘要:目的　分析济南市柯萨奇病毒A组6型手足口病（HFMD）的流行病学特征,为该病的诊治与防控提供科学依据。方法　选取2013年济南市临床诊断为HFMD的病例为对象,采集患者发病1周内的粪便、咽拭子等标本,实时荧光定量聚合酶链反应（RT-PCR）方法进行病原学鉴定;对判定为柯萨奇病毒A组6型（CVA6）的手足口病确诊病例,采用描述流行病学方法进行流行病学特征分析。结果　2013年接受病原学检测的HFMD患儿共计848例（包括19例重症病例）,670例检测到肠道病毒（79.01%）。CVA6阳性141例（包括2例重症）,占阳性病例的21.04%（141/670）,在HFMD确诊病例的病原构成中居第3位;其中包括2起暴发、7起聚集性手足口病疫情。141例感染CVA6的HFMD患儿中,男女比例为1.71∶1（89/52）;病例年龄主要集中于3岁以下儿童（73.76%）,尤其是1岁以下患儿（26.95%）,两例重症病例均不到1岁;全市各县（市、区）全年均有发病,流行高峰期集中于7-11月（69.59%）。结论　CVA6是手足口病的重要病原体之一,可引起重症、暴发及聚集性疫情,应加强监测与研究。     

柯萨奇病毒B组3型四川分离株的基因特征分析

目的了解从四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例和手足口(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)病例中分离到的柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus B3,CVB3)的基因特征,探索其变异规律及在四川省的传播动态。方法对2008—2020年AFP病例和2013—2019年非肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV 71)和柯萨奇A16型(Coxsackie virus A16,CVA 16)感染的HFMD病例标本进行细胞分离培养,血清学鉴定,全VP1基因序列的测定及核苷酸同源性和遗传进化的分析,用MEGA6.0软件以邻位连接法构建遗传进化树,bootstrap检验1 000次;以Kimura 2参数方法计算基因型间遗传距离。结果从2008—2020年4 378份四川省AFP病例标本中分离鉴定到13株CVB3,从2013—2019年四川省454份非EV 71和CVA16感染的HFMD病例标本中分离鉴定到1株CVB3。14株CVB3四川分离株之间核苷酸同源性为84.4~98.8%,氨基酸同源性为84.1~100.0%。14株CVB3均属于G基因型,其中11株在G1基因亚型,3株在G2基因亚型。结论四川省存在CVB3病毒的多条传播链,流行趋势呈现周期性变化;G1、G2两种基因亚型在四川省同时流行,G1基因亚型为四川省CVB3的优势基因亚型。     

宁夏地区2008年柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析

目的 研究宁夏地区2008年引起手足口病(HFMD)暴发的柯萨奇病毒A组16型(CVA16)的基因特征.方法 对宁夏地区2008年HFMD患者临床标本中分离到的CVA16,采用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)进行VP1编码区基因扩增,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析.根据VP1区核苷酸序列与国内其他省份以及国际报道的CVA16株序列(来源于基因库)构建基因亲缘关系树.结果 共分离到70株CVA16,其在VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别为90.8%～100.0%和98.9%～100.0%.亲缘进化树显示全部CVA16株可分为A和B两个基因型,B基因型又可分为B1和B2两个基因亚型.宁夏地区CVA16全部属于B1基因亚型,同时包含B1a和B1b两条进化分支,提示存在两大传播链.结论 宁夏地区分离的CVA16株与国内其他地区CVA16株类似,有B1a和B1b两个进化分支在共同循环,且与周边国家和地区流行的CVA16在基因亲缘关系和流行时间关系上都很接近,存在共同进化和循环.     

广州市2019年H3N2流感病毒分子流行特征分析

目的 对广州市2019年不同来源的H3N2流感病毒进行基因测序,分析H3N2流感病毒的进化变异特点。方法 对广州市2019年门诊监测、暴发疫情、住院重症病例等不同标本来源的H3N2流感病毒进行分离并对其血凝素（HA）和神经氨酸酶（NA）基因进行测序,运用DNA Star 7.1、Mega 6.0软件分析病毒的变异和进化特点。结果 2019年广州市H3N2流感表现为流行期Ⅰ（2019年1-8月）和流行期Ⅱ（2019年11-12月）2个流行高峰。男性和女性的H3N2流感病毒阳性率分别为13.46%（703/5 221）和11.50%（510/4 435）,差异有统计学意义（χ²=8.43,P=0.00）。10~20岁年龄组H3N2流感病毒阳性率最高（25.18%,665/2 641）,各年龄组阳性率差异有统计学意义。测序发现,不同标本来源的毒株高度同源,亲缘关系相近,属于3C.2a.1分支。根据流行时间和进化特点,进一步划分为Group 1~3共3个小进化分支,Group 1分支流行于流行期Ⅰ、Group 3分支流行于流行期Ⅱ,Group 2分支为2个流行期过度的进化分支,流行期Ⅱ的病毒由流行期Ⅰ的病毒进化而来,且不同分支存在基因重组的现象。在疫苗选择压力下,Group 1~3分支逐渐出现HA抗原位点突变,导致新的抗原漂移。HA抗原位点变异主要发生A和B区,Group 1分支和Group 3分支受体结合位点变异发生在前壁和后壁,Group 2~3分支在HA抗原位点A区缺失2个糖基化位点。结论 2019年广州市H3N2流感病毒的遗传变异包括位点突变和基因重组。在疫苗免疫压力下H3N2流感病毒发生快速的进化变异,抗原位点变异逐渐累积,进而出现新的抗原漂移。应对H3N2流感病毒分子流行特点进行持续监测。     

广州市201 1年柯萨奇病毒A组6型的分子流行病学特征

手足口病主要由柯萨奇病毒A组16型(CvAl6)与人肠道病毒71型(EV71)感染引起,也有少量由CVA6感染引起。本研究对2011年广州市手足口病标本检出的CVA6病毒开展分子流行病学研究。     

Recombinant human enterovirus 71 in hand, foot and mouth disease patients

Hand, foot and mouth disease (HFMD) is a common illness of infants and young children <10 years of age. It is characterized by fever, ulcers in the oral cavity, and rashes with blisters that appear on the palm and sole. The most common causal agents of HFMD are coxsackievirus A16 (CV-A16) and human enterovirus 71 (HEV71), but other enteroviruses, including CV-A5 and CV-A10, can also cause it. When caused by CV-A16 infection, it is usually a mild disease, and patients normally recover without requiring any special medical attention.     

15例儿童误服汞病例分析

目的　了解北京市某中学一起疱疹性咽峡炎暴发疫情的流行特征,为疱疹性咽峡炎的防控提供科学依据。方法　对病例开展个案调查,采集咽拭子标本进行检测,采用描述性流行病学方法对疫情的流行病学特征和临床特点进行分析。结果　2017年10月11日—11月2日,北京市某中学累计报告疱疹性咽峡炎病例92例,罹患率2.39%。临床表现以口腔疱疹（92.39%）、咽痛（71.74%）、发热（69.56%）为主。共采集43例病例咽拭子标本进行检测,24例柯萨奇病毒A6型阳性,6例肠道病毒未分型阳性。结论　本起暴发疫情是由柯萨奇病毒A6型感染引起,学生交叉上课、共用餐厅等公共场所导致疫情的传播,探索一套适应教育改革后传染病的防控方案势在必行。     

中国柯萨奇病毒A组6型分离株全基因序列特征分析

目的  分析中国2007-2019年柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)毒株遗传进化规律,以期为疾病预防及疫苗研发提供理论依据。方法  收集中国截至2021年3月1日Genbank数据库中454株CVA6毒株全基因序列,分析毒株分离年份、地区信息,构建系统发育树揭示进化规律并进行基因重组分析。结果  地区信息显示,毒株主要分布于中国沿海及南方地区,时间信息表明,自2013年起,CVA6毒株报告数量逐渐增加。系统进化结果表明,454株CVA6毒株分10个分支,A分支中3株分离自江西省的毒株与CVA6原型毒株Gdula(AY421764)亲缘关系极为接近,核酸序列相似度近乎100%,J分支是中国流行最广泛的毒株群,包含了中国较多省份如山东省、广东省等。基因重组分析显示,基因重组现象较为普遍,大部分CVA6代表毒株在P2区和P3区与其他肠道病毒A组毒株之间存在基因重组现象。结论  2007-2019年CVA6毒株在中国广泛传播,毒株间基因重组现象普遍存在。     

南京市20 1 0年柯萨奇病毒A组1 6型VPl区基因特征分析

柯萨奇病毒A组16型(CAl6)是引起手足El病的常见病原之一,与另一种手足口病的致病原--人肠道病毒7l型(EV71)相比,CAl6所致手足口病症状相对较轻?。近几年研究发现,CAl6感染可能引起严重并发症、21,偶尔引起新生儿死亡。本研究对20lo年从南京地区分离的CAl6进行VPl区序列测定和分析,以了解CAl6的流行情况及分子生物学特征。