柯萨奇病毒A组2型分离毒株序列及遗传进化分析

目的研究柯萨奇病毒A组2型(CVA2)分离株基因特征和遗传进化规律。方法利用分子信息学软件对GenBank核苷酸数据库收录CVA2分离株进行全长VP1区基因序列分析,构建系统进化树,测算分离毒株核苷酸和氨基酸同源性,计算核苷酸分子进化速率。采用Datamonkey在线软件预测正向选择位点,用Bioedit软件计算氨基酸置换熵值。结果共纳入CVA2分离株108株,主要为基因型D分离株;与原型株Fleetwood相比,各基因型分离株核苷酸和氨基酸同源性为79.3%～83.0%和94.6%～97.3%;基因型D分离株核苷酸进化速率为4×10~(-3)位点/年;选用SLAC模型发现1个正向选择位点,氨基酸置换熵值分析合计6个熵值大于0.6的位点。结论 CVA2分离株VP1区未出现明显的基因变异,与原型株亲缘性关系较远,需加强对CVA2分离毒株的实验室和分子流行特征监测。     

手足口病相关柯萨奇病毒A组8型全基因组序列特征分析

目的:研究中国2013-2018年手足口病病例分离的柯萨奇病毒A组8型（CV-A8）全基因组序列特征及对全基因组各编码区进行遗传进化分析。方法:对我国不同地区手足口病患者分离的11株CV-A8的全基因组序列,采用Sequencher 5.0、MEGA 7.0等软件对获取的全基因组序列进行比对和遗传进化分析。结果:序列比...     

柯萨奇病毒A组16型

柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A Group 16 Strain,CVA16）是手足口病（Hand,Footand Mouth Disease,HFMD）的主要致病原之一,对其生物学特征、致病机理、临床表现、实验室诊断、流行病学和分子流行病学的认识,有助于提高HFMD及其它相关疾病的防治水平。研发CVA16的诊断方法和疫苗,建立健全CVA16的流行病学和实验室监测网络,可以对CVA16引起的HFMD的流行进行预测和预警,对预防CVA16引起的HFMD有重要的意义。     

柯萨奇病毒A组16型研究进展

柯萨奇病毒A组16型（Coxsackievirus A Group 16 Strain,CA16）是手足口病（Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD）主要致病原之一。自1948年从脊髓灰质炎患儿的粪便中分离出该病毒以来,已在全世界引起多次爆发或流行,累及地域广、人口多,受到人们的广泛关注。本研究对CA16病毒生物学特征、分子流行病学、实验室诊断等方面的研究进展作一概述。     

北京地区柯萨奇病毒A组6型、肠道病毒EV71型和柯萨奇病毒A组16型手足口病流行特征及临床特点比较

目的 了解柯萨奇病毒A组6型、肠道病毒71型和柯萨奇A组16型手足口病流行特征、临床特点,为指导临床诊断,调整手足口病防控策略提供科学依据.方法 采用前瞻性调查的方法,采集2013年8月至2015年9月在北京市儿童医院诊断的手足口病临床确诊病例的咽拭子,将手足口病原核酸检测阳性的病例分为CA6、EV71、CA16 3组,分析比较3组的临床特点、流行特征、预后及影响因素.结果 共采集HFMD临床诊断病例574例患儿咽拭子,CA6入组122例,EV71入组107例,CA16入组124例.①3组年龄、性别分布一致,差异无统计学意义.②不同年份流行主要毒株不同,但3种病原体引起的手足口病高峰均在夏季.③CA6组发热比例高达78.69％,明显高于EV71组(35.51％)和CA16组(37.90％) (P ＜0.001),平均体温约为38.78℃.CA6组表现大疱疹(9.01％)、结痂(8.20％)、皮疹部位疼痛(29.51％)、恢复期脱皮(38.52％)、脱甲(35.25％)、色素沉着(11.47％)比例高于EV71组、CA16(P ＜0.001).④3组在卫生学指标方面差异无统计学意义.结论 CA6、EV71和CA16感染所致的HFMD发病高峰季节一致;与EV71、CA16感染相比,CA6感染引起的高热比例较高,部分病例可表现为大疱疹,疼痛、脱皮、脱甲、色素沉着、结痂发生率高,预后较好.     

柯萨奇病毒A组6型手足口病的流行病学研究进展

自2008年以来,柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)在全球范围内引起了多次手足口病暴发,成为引发手足口病的主要病原体之一。作为导致手足口病流行的新病原体,目前尚无预防CVA6型手足口病的有效疫苗上市。CVA6易发生重组和变异,不仅小儿易感,也可对成年人造成感染,并常引起非典型症状,如脱甲等。因此,CVA6型手足口病已成为手足口病防控的重大挑战。本文就CVA6的病原学特征及其所致的CVA6型手足口病的流行特征、影响因素及防控措施等研究进展进行综述,为CVA6型手足口病预防控制措施的制定提供科学依据。     

济南市柯萨奇病毒A组6型手足口病流行病学特征分析

摘要:目的　分析济南市柯萨奇病毒A组6型手足口病（HFMD）的流行病学特征,为该病的诊治与防控提供科学依据。方法　选取2013年济南市临床诊断为HFMD的病例为对象,采集患者发病1周内的粪便、咽拭子等标本,实时荧光定量聚合酶链反应（RT-PCR）方法进行病原学鉴定;对判定为柯萨奇病毒A组6型（CVA6）的手足口病确诊病例,采用描述流行病学方法进行流行病学特征分析。结果　2013年接受病原学检测的HFMD患儿共计848例（包括19例重症病例）,670例检测到肠道病毒（79.01%）。CVA6阳性141例（包括2例重症）,占阳性病例的21.04%（141/670）,在HFMD确诊病例的病原构成中居第3位;其中包括2起暴发、7起聚集性手足口病疫情。141例感染CVA6的HFMD患儿中,男女比例为1.71∶1（89/52）;病例年龄主要集中于3岁以下儿童（73.76%）,尤其是1岁以下患儿（26.95%）,两例重症病例均不到1岁;全市各县（市、区）全年均有发病,流行高峰期集中于7-11月（69.59%）。结论　CVA6是手足口病的重要病原体之一,可引起重症、暴发及聚集性疫情,应加强监测与研究。     

柯萨奇病毒B组3型四川分离株的基因特征分析

目的了解从四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例和手足口(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)病例中分离到的柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus B3,CVB3)的基因特征,探索其变异规律及在四川省的传播动态。方法对2008—2020年AFP病例和2013—2019年非肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV 71)和柯萨奇A16型(Coxsackie virus A16,CVA 16)感染的HFMD病例标本进行细胞分离培养,血清学鉴定,全VP1基因序列的测定及核苷酸同源性和遗传进化的分析,用MEGA6.0软件以邻位连接法构建遗传进化树,bootstrap检验1 000次;以Kimura 2参数方法计算基因型间遗传距离。结果从2008—2020年4 378份四川省AFP病例标本中分离鉴定到13株CVB3,从2013—2019年四川省454份非EV 71和CVA16感染的HFMD病例标本中分离鉴定到1株CVB3。14株CVB3四川分离株之间核苷酸同源性为84.4~98.8%,氨基酸同源性为84.1~100.0%。14株CVB3均属于G基因型,其中11株在G1基因亚型,3株在G2基因亚型。结论四川省存在CVB3病毒的多条传播链,流行趋势呈现周期性变化;G1、G2两种基因亚型在四川省同时流行,G1基因亚型为四川省CVB3的优势基因亚型。     

柯萨奇病毒A组16型手足口病疫苗研究现况

手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)严重影响着婴幼儿健康。肠道病毒A组71型(enterovirus A71,EV71)及柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CA16)是引起手足口病的主要病原体,曾在全球多个国家或地区暴发,接种疫苗是预防手足口病的有效途径,EV71疫苗已上市,但是CA16疫苗相关研发进展较缓慢,目前仍无相关疫苗上市。本文对CA16型灭活疫苗、减毒活疫苗、病毒样颗粒(virus-like particle,VLP)疫苗、DNA疫苗、重组嵌合病毒疫苗及亚单位疫苗的相关研究进展做一综述。     

广东省2012-2016年柯萨奇病毒A组16型感染手足口病病例流行特征分析

目的 了解2012－2016年广东省柯萨奇病毒A组16型（Cox A16）感染手足口病病例流行特征。方法 在广东省8个城市共选取8家哨点医院开展手足口病普通病例Cox A16感染监测,结合手足口病个案及暴发数据,估算Cox A16感染手足口病发病情况并分析人群和时间分布特征。结果 ①广东省Cox A16感染手足口病估算发病率以2014年（113.0/10万）最高,其次为2016年（86.4/10万）、2012年（79.1/10万）;2015年（29.0/10万）和2013年（28.8/10万）较低。②暴发以Cox A16感染（54.6%,89/163）为主,高流行年份年均暴发数（28起）是低流行年份（2.5起）的11.2倍。③估算发病率随年龄升高呈下降趋势（趋势χ²=853 905.63,P<0.01）,高发年龄组依次为1～（1 449.2/10万）、3～（1 097.0/10万）、2～（1 083.5/10万）、4～（687.8/10万）和0～岁（604.9/10万）;随月龄增加呈上升趋势（趋势χ²=5 541.77,P<0.01）,高发月龄依次是11～（2 105.1/10万）、10～（1 448.6/10万）、9～（938.3/10万）、8～（703.3/10万）和6～月龄（664.6/10万）。④高发月份是5月（143.9/10万）和6月（131.5/10万）。结论 2012－2016年广东省Cox A16感染手足口病在各年份流行强度不同;Cox A16感染水平高时,暴发疫情增多,主要发生在托幼机构,5－6月常见,0～4岁儿童是Cox A16感染手足口病高危人群,6～11月龄为高发月龄。     

中国柯萨奇病毒A组6型分离株全基因序列特征分析

目的  分析中国2007-2019年柯萨奇病毒A组6型(coxsackievirus A6,CVA6)毒株遗传进化规律,以期为疾病预防及疫苗研发提供理论依据。方法  收集中国截至2021年3月1日Genbank数据库中454株CVA6毒株全基因序列,分析毒株分离年份、地区信息,构建系统发育树揭示进化规律并进行基因重组分析。结果  地区信息显示,毒株主要分布于中国沿海及南方地区,时间信息表明,自2013年起,CVA6毒株报告数量逐渐增加。系统进化结果表明,454株CVA6毒株分10个分支,A分支中3株分离自江西省的毒株与CVA6原型毒株Gdula(AY421764)亲缘关系极为接近,核酸序列相似度近乎100%,J分支是中国流行最广泛的毒株群,包含了中国较多省份如山东省、广东省等。基因重组分析显示,基因重组现象较为普遍,大部分CVA6代表毒株在P2区和P3区与其他肠道病毒A组毒株之间存在基因重组现象。结论  2007-2019年CVA6毒株在中国广泛传播,毒株间基因重组现象普遍存在。     

Phylogenetic and antigenic analyses of coxsackievirus A6 isolates in Yamagata,Japan between 2001 and 2017

Although coxsackievirus A6 (CV-A6) is generally recognized as a causative agent of herpangina in children, CV-A6 infections globally emerged as a new and major cause of epidemic hand-foot-and-mouth-diseases (HFMDs) around 2008. To clarify the longitudinal epidemiology of CV-A6, we carried out sequence and phylogenetic analyses for the VP1 and partially for the VP4-3D regions as well as antigenic analysis using 115 CV-A6 isolates and 105 human sera in Yamagata, Japan between 2001 and 2017. Phylogenetic analysis revealed that CV-A6 isolates were clearly divided into two clusters; strains in circulation between 2001 and 2008 and those between 2010 and 2017. Neutralizing antibody titers of two rabbit antisera, which were immunized with Yamagata isolates in 2001 and 2015, respectively, against 28 Yamagata representative strains as well as the prototype Gdula strain were 1:2560–1:5120 and 1:160–1:640, respectively. The neutralizing antibody titers among residents in Yamagata against the above two strains were similar. Our analyses revealed that there were cross-antigenicities among all analyzed CV-A6 strains, although the newly emerged strains were introduced into Yamagata around 2010 and replaced the previous ones. With regard to control measures, these findings suggest that we can prevent CV-A6 infections through the development of a vaccine that effectively induces neutralizing antibodies against CV-A6, irrespective of genetic cluster.     

南京市20 1 0年柯萨奇病毒A组1 6型VPl区基因特征分析

柯萨奇病毒A组16型(CAl6)是引起手足El病的常见病原之一,与另一种手足口病的致病原--人肠道病毒7l型(EV71)相比,CAl6所致手足口病症状相对较轻?。近几年研究发现,CAl6感染可能引起严重并发症、21,偶尔引起新生儿死亡。本研究对20lo年从南京地区分离的CAl6进行VPl区序列测定和分析,以了解CAl6的流行情况及分子生物学特征。     

2008年柯萨奇病毒A组16型昆明分离株KMM08全基因组序列分析

目的 分析柯萨奇病毒A组16型(CA16)昆明分离株KMM08全基因序列,了解其遗传特性.方法 设计针对CA16引物,提取病毒RNA,RT-PCR扩增和产物直接测序获得序列.利用Mega 4.1,RDP3和SimPlot 3.5.1等软件分析全基因序列.结果 获得KMM08全基因组核苷酸序列长度为7409bp,编码含2193个氨基酸残基的多聚蛋白;与其他CA16参考株核苷酸和氨基酸同源性分别为79.0％～ 98.2％和94.5％ ～ 99.3％,其中SZ-HK08-3与国际标准株G10核苷酸和氨基酸同源性分别79.1％和94.8％;而与肠道病毒71型(EV71)标准株BrCr同源性分别为78.7％和89.0％.在各个区段上,KMM08与SZ-HK08-3的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.0％～99.0％和98.0％～100.0％,同源性最高;与G10的核苷酸和氨基酸同源性分别为74.2％ ～ 86.9％和90.9％ ～97.0％;与EV71 BrCr核苷酸和氨基酸同源性分别在65.0％ ～ 84.9％和71.0％～95.2％.进化分析发现KMM08属于B基因型的一个分支.RDP3和SimPlot 3.5.1软件分析发现Tainan-5079-98序列发现重组信号,而KMM08未发现.结论 KMM08分离株为B基因型;CA16与EV71在非结构区发生重组.     

肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型细胞受体的研究进展

近几年手足口病在亚太地区的流行大幅上升并伴随严重的中枢神经系统并发症,而针对其主要致病原肠道病毒71型和柯萨奇病毒A16型现在还缺乏有效的预防疫苗和抗病毒制剂.确定它们的特异性细胞受体对于进一步阐明病毒与宿主细胞早期互相作用的分子机制及其致病机制至关重要.过去一年中,P-选择素糖蛋白配体-1、B类清道夫受体Ⅱ和唾液酸化...     

Characterization of an inactivated whole-virus bivalent vaccine that induces balanced protective immunity against coxsackievirus A6 and A10 in mice

Coxsackievirus A6 (CVA6) and CVA10 are two of the major pathogens associated with hand, foot and mouth disease (HFMD) in children. The majority of CVA6 and CVA10 infections result in mild, self-limiting episodes (fever and herpangina) in pediatric populations; however, in some cases, can proceed to severe neurological disease and death. Efforts to mitigate viral transmission to decrease the morbidity and mortality associated with infection would be greatly strengthened by the availability of an efficacious CVA6 and CVA10 bivalent vaccine. Here we report the immunogenicity and protective efficacy of a bivalent combination vaccine comprised of formaldehyde-inactivated, whole-virus CVA6 and CVA10. We demonstrate that subcutaneous delivery of the bivalent vaccine can induce antigen-specific systemic immune responses, particularly the induction of polyfunctional T cells, which elicit active immunization to achieve a protection rate of >80% in the infected neonatal mice. Furthermore, passive transfer of the antisera from vaccinated mice potently protected recipient mice against CVA6 and CVA10 challenge. Importantly, the bivalent vaccine could induce high levels of IgG and neutralizing antibodies in adult female mice and the maternal antibody transmitted to the recipient mice played an important role in controlling homotypic and heterotypic CVA6 and CVA10 infections and viral replication in vivo. Collectively, these findings indicate that there is no immunological interference between the two antigens with respect to their ability to induce virus-specific immune responses, and thus provides proof-of-concept for further development of multivalent vaccines for broad protection against HFMD.     

中国大陆地区2004-2016年柯萨奇病毒A组10型的分子流行病学特征分析

目的 分析中国大陆地区2004-2016年柯萨奇病毒A组10型（coxsackievirus group A type 10,CA10）流行毒株基因型分布概况和进化规律,为手足口病防控提供数据支撑。方法 利用MEGA 6.0软件对GenBank核酸数据库收录的流行于中国大陆地区的CA10毒株VP1区基因序列进行分析,构建系统进化树,并对毒株彼此间的核苷酸和氨基酸同源性进行计算。结果 纳入本研究的中国大陆地区CA10毒株共计218株,中国大陆地区CA10流行毒株的基因型以C型为主。与原型株CA10-Kowalik相比,中国大陆地区CA10毒株核苷酸和氨基酸的同源性分别为69.4%~73.9%和90.6%~93.6%;中国大陆地区CA10毒株内部的核苷酸和氨基酸同源性分别为76.4%~100.0%和92.9%~100.0%。结论 本研究提示应针对CA10毒株流行趋势和基因型分布情况,采取有效措施防控手足口病。     

2009—2017年柯萨奇病毒A组4型贵州分离株的基因特征分析

目的 分析贵州省柯萨奇病毒A组4型（coxsackievirus A4,CVA4）分离株的基因特征。方法 对2009—2017年贵州省急性弛缓性麻痹（acute flaccid paralysis, AFP）病例中分离到的19株CVA4,采用反转录-聚合酶链反应（RT - PCR）方法进行VP1区扩增并对扩增产物测序,通过MEGA 7.0软件采用邻位相接法（neighbor joining method）构建遗传进化树进行基因特征分析,可靠性通过1 000 Bootstrap值评估。结果 19株CVA4贵州分离株之间的的核苷酸同源性为92.0%～100.0%,氨基酸同源性为96.1%～100.0%,与原型株high point株之间的核苷酸同源性为83.3%～85.7%,氨基酸同源性为95.1%～98.4%; 19株CVA4均为C2基因亚型,主要聚集在Cluster1和Cluster 2分支,其中Cluster1是2009年后贵州地区持续传播的优势群体。结论 2009—2017年贵州省AFP病例中CVA4贵州分离株为C2基因亚型。