100例乙型肝炎病毒基因分型的探讨

目的:为了解宁波及毗邻地区乙型肝炎患者HBV基因型分布、优势型与临床的相关性。方法:选择宁波及毗邻地区HBV DNA阳性的HBV感染者100例,应用基因芯片对其进行基因分型,其中7例优势基因型进行S基因序列同源性测序复核。结果:100例HBV阳性的血清标本分型率为96.0%,其中B基因型36例(37.5%),C基因型47例(48.9%),BC混合基因型11例(11.5%)及BCD混合基因型2例(2.1%),未分出型的4例。乙型肝炎感染者检出的基因型以B、C型为主;重型肝炎与肝癌组中C型检出率分别为60%和55%,明显高于其他基因型(P<0.05),B、C基因型与HBV DNA拷贝数、丙氨酸氨基转移酶水平及总胆红素在统计学上无显著差异(P>0.05)。结论:基因芯片分型方法可应用于HBV基因的分型。宁波及毗邻地区的HBV基因型以B、C为优势基因型,重型肝炎和肝癌患者检出的基因型多为C型,提示C基因型患者预后较差。     

浙东地区乙型肝炎病毒基因型分布及临床意义

目的：了解浙江东部地区乙型肝炎病毒（HBV）基因型的分布、优势型及其与临床的相关性。方法：选择浙江东部地区HBVDNA阳性的HBV感染者100例，应用基因芯片对其进行基因分型，其中对7例优势基因型进行S基因序列同源性测序复核。结果：100例HBV阳性的血清标本分型率为96．0％，其中B基因型36例（36．0％），C基因型47例（47．0％），BC混合基因型11例（11．0％）及BCD混合基因型2例（2．0％），未分出型的4例（4．0％）。基因芯片分型与S基因序列同源性测序分型结果一致，乙型肝炎感染者检出的基因型以C、B型为主；重型肝炎与肝癌组中c型检出率分别为60％和55％，明显高于其他基因型（P〈0．05），C、B基因型与HBVDNA拷贝数、丙氨酸氨基转移酶水平及总胆红素在统计学上无显著差异（P〉0．05）。结论：HBV的基因型存在地区性差异，浙江东部地区的优势基因型为c、B型，与以往报道的结论不太一致。不同临床肝炎型与基因型存在一定的相关性，主要表现为重型肝炎和肝癌患者检出的基因型多为C型，提示C基因型患者预后较差。基因芯片分型方法可应用于HBV基因的分型，方便、快速。     

克拉玛依地区HBV基因分型及进化分析

目的：研究克拉玛依地区乙肝病毒（HBV）的基因分型，并且进行进化分析。方法：利用限制性片段多态性分析的方法对272例慢性乙型肝炎患者血清进行基因分型，采用限制性内切酶MboI、Earl酶切扩增产物，以A、B、c、D基因参照品作为对照，12例扩增产物进行测序证实其基因型。结果：272例样品有241例成功分型。C型44．8％，B型36．9％，D型4．2％，B／C型10．8％，B／D型3．3％。少数民族c型40．4％，B型30．8％，D型9．6％，B／C型11．5％，B／D型7．7％，未检测到A型。12例测序结果与39例GenBank中已发表的B、C、D型的同源性在97．8％～98．7％，96．9％～99．3％，97．5％～99．0％。结论：克拉玛依地区HBV基因型主要是C型和B型，其次是D型和混合型，未见A型。进化树分析图显示12例B、C、D型毒株与GenBank序列毒株分别属于同一分支。克拉玛依地区2例D型与新疆哈密地区D型进化距离最近。     

新疆维族、汉族人群HBV基因型的分布与特点

目的 了解新疆地区维吾尔族、汉族慢性乙型肝炎患者HBV基因型分布特点.方法 采用PCR-反向斑点杂交方法,对910例维吾尔族、汉族慢性乙肝HBV DNA阳性的患者进行HBV基因分型,并以序列测定方法验证了部分基因型别.结果 成功分型504例,其中维族260例,基因型分别为B型10例(3.85％),C型19例(7.31％),D型219例(84.23％),混合感染BC型4例、DB型5例、DC型3例(共占4.61％),维族D型以绝对优势显著高于其他型别.汉族244例,基因型分别为B型64例(26.23％),C型128例(52.46％),D型33例(13.52％),混合感染BC型19例(7.79％),汉族以C型为主,两民族除上述类型外,未见有其他型别.HBV基因载量测定显示,除维汉族B型间差异差异有统计学意义外,其他型别间差异无统计学意义.统计各基因型别所占比率,呈现男性高于女性.而在年龄层面,表现为随着年龄增加,基因型所占比率逐渐递减.结论 新疆地区维族HBV基因型以D型占绝对优势,汉族以C型为主.形成了本地区独有的构成特点,是我国一个十分特殊的HBV基因型分布带.     

内蒙古部分地区乙肝病毒基因型分布特点研究

目的研究内蒙古部分地区HBV基因型的分布特点,为推测内蒙古地区乙肝的流行趋势提供数据资料。方法对内蒙古地区46份乙肝大三阳血样进行HBVDNA提取,之后用PCR法扩增HBV DNA的S基因片段,再对PCR体系进行基因测序,之后基因分型。结果B型1例(2.17%),C型43例(93.48%),D型2例(4.35%)。结论我区HBV DNA基因型分布以C型为主。     

兰州地区乙型肝炎病毒相关肝癌患者中病毒基因型分布特征

目的 了解中国兰州地区HBV相关肝癌患者中病毒基因型分布特征,探讨HBV基因型及其亚型与HCC之间的相关性.方法 筛选兰州地区慢性HBV感染者包括慢性乙型肝炎组(CHB组)、乙型肝炎肝硬化(LC组)和乙型肝炎相关性HCC(HCC组)共142份血清样本,其中HBeAg阳性62份,HBeAg阴性80份.对各组进行HBV DNA的提取及HBV基因组S基因的PCR扩增和测序.将测序后得到的前S/S基因序列引入NCBI的在线病毒基因分型工具来确定HBV基因型.然后采用MEGA4软件构建系统进化树进行HBV基因亚型分析.结果 慢性乙型肝炎组C基因型19份,其中C1亚型9份,C2亚型10份,B基因型17份,均为B2亚型,B型C型混合型2份,D基因型6份,均为D2亚型;乙型肝炎肝硬化组C基因型26份,其中C1亚型9份,C2亚型17份,B基因型8份,均为B2亚型,D基因型2份,均为D2亚型;乙型肝炎相关性HCC组C基因型23份,C1亚型5份,C2亚型18份,B基因型6份,均为B2亚型,B型C型混合型1份,D基因型2份,均为D2亚型.HBV基因C2亚型在慢性乙型肝炎组、乙型肝炎肝硬化组、乙型肝炎相关性HCC组中的分布差异有统计学意义(x2=10.498,P均＜0.05).结论 兰州地区HBV感染者中基因型有B型、C型、D型及B型C型混合型.其中B基因型均为B2亚型,C基因型中检出C1、C2亚型,D基因型均为D2亚型.HCC患者和LC患者的C型检出率均显著高于CHB组,C基因型与较为严重的肝病(LC和HCC)有关.     

萍乡地区乙肝病毒基因多态芯片酶联分析基因分型检测报告

目的 了解本地区乙肝基因型分布。方法 用上海瑞芯生物科技有限公司和中科院上海微系统与信息技术研究所提供试剂，对113例血清标本进行基因分型，并检测各型之间与ALT、HBV—DNA含量以及HBeAg表达。结果 113例HBV-DNA阳性患者基因分型分布为：B型77例，C型14例，BC混合型15例，未分型7例。结论 本地区HBV—DNA基因分型以B型为主，基因型B与年轻非肝硬化患者HCC发生有关，基因型C可能与肝炎症状加重有关，如果BC混合感染，两种基因“相互促进作用”可能更加重肝炎症状。     

唐山地区慢性乙型肝炎患者临床特征与HBV基因型的相关性研究

目的探讨唐山地区慢性乙型肝炎(CHB)患者的临床特征、肝功能指标,乙型肝炎病毒(HBV)标志物和DNA复制水平与HBV基因分型之间的相关性。方法对2009年10月-2014年4月就诊于唐山市传染病医院门诊和住院的467例CHB患者血清进行HBV基因分型的检测,同时检测肝功能指标、HBV五项标志物和HBV-DNA载量,采用SPSS 20.0软件进行统计分析。结果 467例CHB患者送检标本中有455例检出HBV基因型,共B、C、D 3种基因型,其中B基因型64例、C基因型380例、D基因型1例,分别占14.38%、85.39%、0.23%;C基因型感染患者血清中HBeAg阳性率高于B基因型,差异有统计学意义(χ2=20.945,P0.01);C基因型感染患者血清中抗-HBe阳性率低于B基因型,差异有统计学意义(χ2=22.671,P0.01);在肝硬化患者中C基因型所占比例B基因型,差异有统计学意义(χ2=4.804,P0.05)。结论唐山地区CHB患者肝脏损伤的严重程度与C基因型相关度较高,感染C基因型的CHB患者临床预后明显较B基因型的感染患者差。     

乙型肝炎病毒基因型的研究

目的 研究常德市乙型肝炎病毒(HBV)基因型。方法 随机选择HBsAg阳性携带者65例，慢性乙型肝炎患者5例。应用FQ-PCR方法检测血清HBVDNA含量。采用微板核酸杂交-ELISA技术进行血清HBVA-F6种基因分型。结果 43例HBVDNA定量阳性血中B、D混合型占51．2％(22例)，B型占27．9％(12例)，C型占9．3％(4例)，C、D混合型占4．7％(2例)，B、C混合型占2．3％(1例)，未分型者2例，未发现A型、单纯D型、E型和F型。结论 常德市HBV基因型以B、D混合型为主，次为B型、C型，C、D混合型及B、C混合型。     

四川遂宁地区居民乙肝病毒基因型别分析

目的了解遂宁地区人群乙型肝炎病毒(HBV)基因型及血清亚型流行特征。方法在遂宁6个县级行政区域内共采集血清样本1 468人份筛出HBsAg检测阳性的血清样本,用巢氏PCR法扩增提取HBV DNA S区,根据PCR产物基因测序结果对样本HBV进行基因分型。结果测出基因序列118例HBsAg阳性标本中,B基因型40例(33.89%),C基因型73例(61.86%),D基因型5例(4.23%),未发现BCD以外的其他基因型。42份(35.59%)血清亚型分型为adr型,76份(64.41%)为adw型。结论遂宁地区乙肝病毒基因型别以B、C为主要基因型,其中C型基因占优势,存在少量D基因型。血清亚型的分布以adr\adw亚型为主,其中adw亚型占优势。     

Genotype determination in Moroccan hepatitis B chronic carriers

BACKGROUND: In Morocco, chronic liver disease related to hepatitis B virus (HBV) is a public health burden. Treatment of chronic hepatitis B is often complicated by the appearance of escape mutants after treatment with nucleoside analogs, especially with genotypes responsible for the more severe form of the disease. OBJECTIVES: In the present study we investigate the prevalence of the different HBV genotypes in Morocco since no previous careful study has been attempted. METHODS: Epidemiological data from 91 chronically infected patients (45 women and 46 men) were collected prospectively. Sera were tested for anti-HBc IgG, HBeAg, anti-HBe antibody and liver enzymes. Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) analysis was confirmed by subsequent sequencing of the pre-S and S region of the viral genome in order to determine which HBV genotypes were prevalent among Moroccan patients. RESULTS: The mean age was 41+/-12.4 years. Ten patients (11%) were positive for hepatitis B e antigen (HBeAg) and 81 (89%) were positive for anti-HBe antibodies. By the RLFP method, genotype D, pattern D2, was found in the 77 cases where HBV was successfully amplified. Phylogenetic analysis based on pre-S/S sequences revealed that genotype D in Morocco differed from others D strains subgenotypes (D1, D2, D3 and D4). In addition, the pre-core mutant defined as HBeAg-negative/anti-HBe-positive and HBV DNA positive was detected in 86% of cases. CONCLUSIONS: Our results clearly show that genotype D and pre-core mutant are highly prevalent in Morocco.     

HBV基因型与慢性乙型肝炎疾病谱的关系

目的　探讨乙型肝炎病毒 (HBV)基因型与慢性乙型肝炎疾病谱相关性。方法　用S基因聚合酶链式反应 -限制片段长度多态性 (PCR -RFLP)的基因型分型方法对广东地区HBV感染者中无症状携带者 (AsC)组 80例和肝硬化组 (LC) 12 0例血清标本分型 ,比较两组基因型分布的异同。结果　基因型在AsC组分布 :B型 45 0 % ( 3 7/ 80 ) ;C型 3 3 75 % ( 2 6/ 80 ) ;D基因型 2 1 2 5 % ( 17/80 ) ;LC组HBV基因型分布B型 3 2 5 % ( 3 9/ 12 0 ) ;C型 65 8% ( 79/ 12 0 ) ;D基因型 1 6% ( 2 / 12 0 )。广州地区未发现A、E和F基因型 ,基因型在两组中的分布均与e抗原状态无显著性差异 (P >0 0 5 ) ;ASC与LC组两组间基因型的分布有显著性差异 ( χ2 =3 1 92 4,P=0 0 0 0 )。结论　可初步认为广东地区HBV感染者以B和C型为优势基因型 ,AsC组中以B型为优势基因型 ,感染HBVD基因型病情轻 ,感染HBVC基因型病情更易于加重。     

50例HBV基因分型及P区耐药突变分析

目的:调查温州乙型肝炎患者血清HBV基因分型和P区基因逆转录酶区(RT区)序列的突变情况。方法:选取50例接受核苷类似物治疗后的乙型肝炎患者作为研究对象,采用PCR产物直接测序法,并对扩增产物进行测序,将测序结果与GenBank中的标准序列进行比对分析,同时确定基因型。结果:在50例中C型44例,占88%,B型6例,占12%。存在位点突变者25例(50%)。其中检出以单位点rtM204I/V/S突变为主,9例,占36%,rtA181V/T突变4例,占16%,rtM204I/V/S+rtL180M突变5例,占20%,rtV214A,rtA181V/T+rtV173L,rtM204I/V/S+rtQ215H,rtM204I/V/S+rtL180M+rtV173L,rtM204I/V/S+rtL180M+rtV207I,rtM204I/V/S+rtL180M+rtT184A/G/I/S,rtM204I/V/S+rtL180M+rtT184A/G/I/S+rtA181V/T突变各占1例,占4%。结论:多数乙型肝炎患者在HBV P区可检出突变,突变形式多样,其中以rtM204I/V/S突变为主,应用DNA序列测定法分析HBV P区基因突变,获得的信息全面,对临床评估病情进展和实施抗病毒治疗有参考价值。     

福建省部分地区乙型肝炎病毒基因型分布及其临床意义

目的首次调查福建省5个地区乙型肝炎病毒(HBV)基因型的分布状况,并探讨HBV基因型与HBV相关肝病临床的可能相关性.方法收集福州市、厦门市、泉州市、三明市、莆田市等地区慢性HBV感染者的血清,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法检测HBV基因型,应用多因素logistic回归分析、对应分析研究HBV基因型与临床的相关性.结果 431例HBV DNA阳性血清中基因B型275例(63.8%),C型100例(23.2%),D型及其混合型共51例(11.8%),未见A、E、F型.多因素logistic回归分析显示,泉州和三明地区HBV基因B型所占比例显著高于福州地区(P=0.002;P=0.006);无症状携带者、慢性肝炎、重型肝炎组都是以基因B型为主要基因型;基因C型在肝硬化中所占比例(47.0%)显著高于无症状携带者(14.5%)和重型肝炎组(14.7%)(P=0.009;P＜0.001);基因B型的e抗原阳性率(52.4%)显著低于C型(56.0%)(P=0.008);基因D型患者e抗原阳性率(30.8%)也低于C型(P=0.051).对应分析表明原发性肝癌(HCC)与基因D型及其混合型关系密切.结论 (1)福建省HBV感染以基因B型为主,其次是C型,也存在基因D型的流行.(2)福建省部分地区基因型B和C的分布可能存在差异.(3)基因B型在年轻患者中可能与重型肝炎的发展有关;基因C型在年长患者中可能更易导致肝硬化.(4)基因D型与HCC可能有一定的相关性,值得进一步研究.     

贵州省乙型肝炎病毒前C区及基本核心启动子变异分布

目的调查贵州省乙型肝炎病毒(HBV)前C区A1896、基本核心启动子区(BCP) T1762/A1764变异分布。方法收集贵阳、遵义、凯里、都匀4地区不同民族无症状携带者(ASC)、慢性肝炎(CH)、肝炎肝硬化(LC)、肝细胞肝癌(HCC)患者血清482份,用测序及限制性片段长度多态性检测A1896、T1762/A1764变异,用S基因PCR-RFLP确定基因型。结果A1896、T1762/A1764变异检出率分别为23.03%和29.67%。汉族感染者A1896、T1762/A1764变异检出率为27.64%和36.04%,高于侗、苗、布依族感染者合并后的7.96%、8.85%(P<0.01)。A1896变异在B、C基因型中的分布为20.34%和27.13%(P>0.05),T1762/A1764变异为18.97%和46.28%(P<0.01)。A1896、T1762/A1764变异在HBeAg阴、阳性组间的分布差异有统计学意义(P值均<0.01)。从ASC到HCC组,A1896、T1762/A1764变异分布逐渐增高,LC、HCC组的检出率明显高于CH和ASC组(P值均<0.01)。A1896、T1762/A1764变异的分布:贵阳(分别为31.79%和41.06%)高于遵义(10.94%和14.06%)、都匀(8.64%和11.1I%)及凯里(2.86%和2.86%),但多因素logistic回归分析在控制了HBeAg、HBV基因型及临床类型影响后,在地区间分布差异无统计学意义。结论A1896、T1762/A1764变异在贵州省不同民族间分布有一定差异。C型感染者易发生T1762/A1764变异,两种变异均与疾病进展有关。     

新疆维吾尔族慢性乙型肝炎患者HBV基因型及亚型分析

目的探讨新疆维吾尔族(维族)慢性乙型肝炎患者中乙型肝炎病毒(HBV)基因型及基因亚型。方法用本实验室建立的HBV基因型及基因亚型特异性引物巢式聚合酶链反应(nPCR)法,对54份新疆维族慢性乙型肝炎患者血清样本进行HBV基因型及亚型分析。随机选取11株经nPCR法鉴定为D基因型的样本,同时进行PreS/S区及PreC/C区测序以鉴定D基因亚型。随机选取2株D型HBV进行基因组全长扩增并克隆测序。从GenBank下载75株各国HBVD1亚型参考序列,根据Kimuratwo-parameter法计算中国新疆地区与其他国家的HBVD1亚型株进化距离。结果新疆维族人群HBV感染以D基因型为主,占66.67%,同时存在B(5.56%)、C(5.56%)基因型及混合感染(22.22%)。新疆存在D1和D3两种亚型,以D1亚型为主。新疆D1亚型与中亚哈萨克斯坦、乌兹别克斯坦、蒙古等国及中东地区土耳其、伊朗、埃及等国的进化距离较近。结论新疆维族慢性乙肝患者中D基因型为优势株,主要为D1亚型,其进化距离与中亚中东等国较为接近。     

遂宁市乙型肝炎病毒主要基因型S区氨基酸位点置换分析

目的分析四川省遂宁市自然人群中乙型肝炎（乙肝）病毒（Hepatitis B Virus,HBV）主要基因型S基因主要亲水区[Major Hydrophilic Region,MHR;氨基酸（Amino Acid,aa）99-169]及人类白细胞抗原I型（The Putative Human Leukocyte Antigen Class I-Restricted,HLA-I）细胞毒性T淋巴细胞（Cytotoxic T Lymphocyte,CTL）表位aa位点置换特点。方法遂宁市乙肝血清流行病学调查中乙肝病毒表面抗原阳性人群,扩增HBV S基因片段并测序得到的完整S基因片段序列,进行生物信息学比对分析。结果在遂宁市共得到108份序列,其中B基因型40份,C基因型68份,在S基因MHR发生aa置换位点为Y100C、Q101H、L110F、T126A/S、T131I、S136F、T143M、G145R、V168A,在HLA-I型CTL表位aa置换位点为V47A、P46L、T47K、L88P、I92T、L98V、Y100C、Q101H、V177A、V194A,位点置换在年龄分布和基因型分布的差异无统计学意义。结论遂宁市HBV S基因MHR及HLA-I型CTL表位aa位点置换与基因型分布无关,未发现接种乙肝疫苗与人群中HBV S区aa位点置换相关。     

乙肝基因分型与耐药位点突变的关系

目的:检测本地区乙肝病毒复制病人中基因型分布情况,探讨HBV基因型与抗病毒疗效关系。方法:应用乙肝病毒型特异性引物采用巢式PCR方法,对45例HBV-DNA阳性患者进行HBV基因型分析,用DNA测序方法检测耐药位点突变。结果:B型7例,占15.56%;C型34例,占75.56%;未分型3例,占6.67%;B+C混合型1例,占2.22%。未发现其他型别。C型病人人均病毒载量5.67±1.61(1oglncopies/m1)较B+C混合型5.54(只有1例)、B型(4.42±1.39)及未分型(2.65±0.57)高。C型病人耐药变异位点多,病人比例高。结论:浙江等地区HBV—DNA基因分型以C、B为主,而B基因型抗病毒治疗疗效最好,C型、混合型及其它型对抗病毒治疗药物疗效较差。     

实时荧光PCR法检测乙型肝炎病毒基因型

目的:建立实时荧光PCR法检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型。方法:根据乙肝病毒基因序列选取保守区域设计引物,结合不同基因型的差异设计各型的特异荧光探针检测乙型肝炎基因B、C型。结果:200例HBV感染者中基因B型70例占35%,基因C型120例占60%,基因B,C混合型10例占5%,未捡出基因型A、D、E、F,分别取B、C型基因标本10例进行测序结果一致。结论:实时荧光PCR检测乙型肝炎基因型操作简单、快速、适合临床常规检测。     

南通地区乙型肝炎病毒基因分型及其临床意义研究

目的了解南通地区乙型肝炎病毒基因分型情况及其临床意义。方法用PCR法扩增HBV PreS基因并测序,共分析慢性无症状携带者(ASC)、慢性活动性肝炎患者(CAH)和肝癌(HCC)患者血清86份。用C lustalx1.8软件比对,用MEGA3.1作树分型,同时测定样品HBeAg和HBV-DNA。结果南通地区存在HBV B型、C型和B/C混合感染型,其中C型比例最高,占67.44%,而B型和B/C混合感染型均占16.28%。C型患者的血清HBeAg阳性率和HBV-DNA浓度显著高于其他基因型(p<0.05)。结论南通地区存在HBV B型、C型以及B+C混合型,C型为优势型;C型患者的病毒复制最为活跃。