一起旅行团诺如病毒感染性腹泻暴发疫情调查

目的 对一起感染性腹泻暴发疫情的病原和危险因素进行调查分析.方法 根据病例定义进行主动搜索,利用回顾性队列研究寻找可疑餐次和可疑食物.采集病例和密切接触者粪便、肛拭子等标本进行诺如病毒核酸检测和肠道致病菌分离培养.结果 该旅行团共发现病例28例,流行曲线提示为点源暴露.共采集患者和密切接触者标本分别为12件和7件,经RT-PCR检测11名患者和2名密切接触者GⅡ组诺如病毒核酸检测阳性.对其中1份阳性标本进行测序,该病毒与2014年8月日本提交的GⅡ.17型AB983218和2014年12月中国台湾提交GⅡ.17型KJ156329毒株相似度达到98％.根据诺如病毒的潜伏期和病例的发病时间推测暴露时点为2月6日中餐和晚餐可能性大.应用回顾性队列研究结果显示2月6日晚餐中的深海鱼是危险食物(RR=6.25,95％CI:1.05～37.32).结论 该起疫情是旅行团外出引起的诺如病毒感染性腹泻的暴发,感染来源可能是在旅行期间食用了诺如病毒污染的深海鱼.     

GII.P7/GII.14型诺如病毒暴发的分子特征分析

目的 了解江苏地区3起诺如病毒(Norovirus,NoV)暴发疫情中病毒感染情况,并对其分子流行病学特征进行初步研究.方法 收集暴发疫情中患者的肛拭子标本53份,采用实时荧光RT-PCR定性检测NoV,阳性标本利用普通RT-PCR对其聚合酶区(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)及衣壳蛋白区(VP1)片段进行扩增和测序分析.结果 3起NoV暴发疫情中,阳性检出率为56.6%(30/53).对30株阳性标本序列进行分析,其RdRp区与GII.P7的同源性最高(93.86%),VP1区与GII.14的同源性较高(97.13%).初步判断为GII.P7/GII.14重组毒株,SimPlot分析可能的重组位点在核苷酸5009位.对其氨基酸序列进行分析发现在RdRp区和VP1区均出现部分氨基酸突变.结论 3起NoV暴发疫情均由同一重组毒株引起,提示GII.P7/GII.14重组株传染性较强,有可能再次引起暴发,应加强监测防控.     

我国沈阳一起GI.6型札如病毒引起的胃肠炎暴发的分子病原学特征研究

目的明确我国沈阳一起急性胃肠炎暴发的病原学及其基因进化特征。方法采集2021年11月沈阳某高校暴发疫情中的学生病例肛拭子和环境涂抹标本共计57份, 采用实时荧光RT-PCR进行常规腹泻病毒基因检测, 并对札如病毒核酸阳性标本采用传统RT-PCR方法扩增、序列测定、拼接和遗传进化分析。结果实时荧光RT-PCR检测确定26份标本为札如病毒核酸阳性, 成功扩增15份标本的衣壳蛋白基因片段。遗传进化分析表明, 15个阳性标本札如病毒分子分型均为GI.6基因型, 各标本序列间同源性为99.99%, 与2005日本的LC380411毒株亲缘较近为98.84%。结论引起本次暴发的病原札如病毒在东北地区较少检出, 其基因型为GI.6亚型引起暴发全球罕见报道。     

一起疑似食源性诺如病毒暴发的流行病学调查

目的调查广州市某小学出现多名急性胃肠炎病例的感染来源、传播途径和危险因素。方法按照病例定义开展病例搜索,采用描述性流行病学和病例对照研究方法进行分析;样本采用RT．PCR方法检测诺如病毒核酸。结果2013年3月28～31日,共发生诺如病毒感染性腹泻27例,罹患率为3．31％（27／816）。3月28日14：00—22：00时为发病高峰,病例有班级聚集性,病例对照结果显示饭前洗手（OR=0．13,95％CI：0．03—0．63）和每天洗手次数≥5次（OR=0．26,95％CI：0．10～0．72）为保护因素。采集患者、厨工肛拭子、剩余食物及环境涂抹样等85份标本,其中5份检出诺如病毒GII-4型。结论这是一起由诺如病毒GII-4型引起的急性胃肠炎暴发,暴发原因是带毒厨工污染部分食物所致,以食源性传播为主。     

河北省保定市一起水源性诺如病毒暴发疫情的流行特征及病原学研究

目的:对河北省保定市一起水源性诺如病毒感染性腹泻暴发疫情进行调查分析,了解其流行特征,确定致病原。方法:开展现场流行病学调查,采集患者呕吐物、肛拭子或粪便标本,居民末梢水以及污水井井水标本,采用荧光定量PCR（real-time PCR）检测诺如病毒核酸,对阳性标本进行扩增并测序分析。结果:该小区发现病例70例,罹患率...     

一起由札如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情的分子流行病学研究

目的 调查深圳市某幼儿园发生的一起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,并分析病原体的分子流行病学特征.方法 收集患病幼儿及相关人员的粪便标本16份,剩余食物6份,采用国家卫生行业标准规定方法检测肠道致病菌、实时荧光RT-PCR法检测诺如病毒、札如病毒、轮状病毒核酸,逆转录RT-PCR法对病毒衣壳区和聚合酶区序列进行扩增,对PCR产物进行序列测定.序列用Clustalx软件进行多重比对、Mega 5.0软件绘制系统进化树.结果 16份样本中检出11例札如病毒核酸阳性,对其中3例阳性标本进行札如病毒衣壳区和聚合酶区序列测定,3株札如病毒与GII.3型参考株AY603425衣壳区核苷酸同源性为86.3％,聚合酶区核苷酸同源性为90.2％,3株札如病毒与GII.3型参考株AY603425、AB455793同属于GII.3型遗传分支.结论 此起急性胃肠炎爆发是由GII.3型札如病毒导致,GII.3型引起的急性胃肠炎暴发属广东省首次报道.     

2019—2021年深圳地区诺如病毒暴发分子流行特征

目的了解深圳地区2019—2021年诺如病毒暴发分子流行特征。方法收集2019年1月至2021年12月诺如病毒暴发信息及标本, 应用实时荧光反转录聚合酶链式反应样本进行诺如病毒检测, 阳性样本通过RT-PCR扩增、测序和序列分析;对其中3株GII.2[P16]进行基因组扩增和序列分析。结果 2019年1月至2021年12月, 共报告诺如病毒暴发246起, 主要发生在幼儿园(132, 53.66%)和小学(52, 21.14%)。每起暴发发病数范围为3～130, 中位数为8。每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰。211起暴发分型成功, GI和GII分别检出7种和11种基因型, 78起(36.97%)诺如病毒暴发由GII.2[P16]引起。对GII.2[P16]基因组分析表明, 深圳2020年暴发株仍属于GII.2[P16](2016-2017)亚群, 在非结构蛋白P22(L777S)和3C蛋白酶(A1047V和P1074T)上出现氨基酸变异。结论 GII.2[P16]是2019年1月至2021年12月引起深圳市诺如病毒暴发的流行株, 主要发生在学校和幼儿园, 持续监测和基因组分析...     

分型引物RT-PCR法在杯状病毒分子流行病学研究中的应用

目的:应用分型引物RT-PCR法确定五个地区病毒性腹泻粪便标本中杯状病毒流行型别及感染情况。方法:对五个地区收集的<5岁病毒性腹泻粪便标本应用针对病毒壳体区域设计的四对引物(GI-SKF/GI-SKR、COG2F/G2-SKR、SLV5317/SLV5749、PreCAP1/82b)进行反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增诺如病毒GI和GII组、扎如、星状病毒(Astrovirus),扩增产物通过1·5%琼脂糖凝胶电泳鉴定。选取部分阳性标本测序研究型别流行特点。结果:本实验从663例标本中共检出单独感染诺如病毒、扎如病毒和星状病毒阳性标本数分别为84、4、11株,同时还发现3株混合感染标本。选取24株诺如病毒阳性标本测序分析发现19株为GII/4型,2株为GII/3型,1株为GII/1型,1株为GII/13型,1株为GII/15型,4株扎如病毒中2株为SGI/1型,1株为SGII/3型,1株为SGII/1型。结论:研究表明杯状病毒是我国婴幼儿腹泻重要病原体,诺如病毒流行株为GII/4型毒株,同时存在其它型别的散在流行;福建、兰州检测到不同型别扎如病毒证明我国存在多种型别的扎如病毒感染。     

一起腺病毒引起的急性呼吸道感染暴发疫情分析

目的调查潼南县米心小学流感样病例暴发疫情。进行暴发流行病学和疾病传播模式描述,研究暴发危险因素和控制措施。方法对所有疑似病例开展流行学调查和采集血,咽拭子标本进行实验室检测,同时隔离治疗病例和采取应急接种措施控制疫情蔓延。对收集到的数据进行暴发流行病学描述。结果全校共报告急性呼吸道感染病例44例(8.32%),18例现症患者的鼻咽拭子进行实验室检测,腺病毒核酸检测为阳性,其中2例合并甲型H1N1流感病毒核酸阳性。     

一起诺如病毒性胃肠炎暴发的队列研究

目的调查分析某村一起诺如病毒性胃肠炎暴发的发病原因。方法采用历史性队列研究方法，应用ELISA对标本进行实验室检测。结果该起暴发共报告病例34例，发病与接触腹泻病人（X^2=6．51，P=0．00）、食物暴露于苍蝇（X^2=4．61，P=0．00）及村民暴露于患者呕吐物或粪便1m内（X^2=3．09，P=0．00）有统计学意义上的关联，与饮用水来源（X^2=1．68，P=0．14）没有统计学意义上的关联。在采集的8份肛拭子样本中1份ELISA法检出诺如病毒抗原阳性：4份粪便样本中2份ELISA法检出诺如病毒抗原阳性。结论这是一起由诺如病毒感染所致的急性胃肠炎暴发．密切接触是此次暴发的主要传播途径。     

一起诺如病毒疫情中密切接触者感染和环境污染状况调查

目的了解诺如病毒疫情中密切接触者感染和环境污染状况。方法在一起诺如病毒疫情中采集患者、密切接触者的肛拭子和其工作生活相关环境的表面涂抹样品,进行实时荧光RT-PCR检测,并对结果进行分析。结果166名密切接触者中有34名感染诺如病毒,感染率为21.6%;其中31名感染者无临床相关症状;21天后所有感染者检测结果才完全转阴。57份环境样本中检出诺如病毒核酸阳性共17份,阳性率为29.8%,厨房和员工宿舍受污染较重。结论诺如病毒感染力强,隐形感染者多,排毒时间长,传播途径多样,容易污染环境。严格控制密切接触者,加强环境清洁消毒,是预防感染和控制疫情的重要措施。     

感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学分析

目的 研究感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学特点.方法 对2008-2010年湖州地区的感染性腹泻疫情标本共119份进行诺如病毒核酸检测,并选取部分阳性扩增产物经序列测定分析诺如病毒的基因型.结果 119份感染性腹泻标本荧光定量PCR检测阳性50份,其中GⅠ型9份,GⅡ型35份,GⅠ和GⅡ混合感染6份.对12份PCR扩增阳性产物进行序列分析显示：5株GⅠ型诺如病毒毒株分属于GⅠ/2和GⅠ/3两种基因型;7株GⅡ型诺如病毒毒株中除1株属于新基因型GⅡb外,其余6株均属于GⅡ/4基因型.结论 诺如病毒是引起湖州地区感染性腹泻疫情最重要的病原菌之一,且湖州地区的诺如病毒存在很高的遗传多样性,同时也存在基因型别的差异.     

一起不明原因感染性腹泻疫情的病原学诊断

目的 明确一起不明原因感染性腹泻疫情的病原体及其基因型别.方法 通过流行病学调查的方法,查明罹患率.对28例疑似病例的28份样本(粪便22份,呕吐物3份,肛拭子3份)采用RT-PCR方法进行诺如病毒核酸检测,并对5份阳性标本的核酸进行序列测定及遗传进化分析.结果 在调查的5694人中,发病160例,罹患率为2.81%.2007年3月7-9日为发病高峰.RT-PCR检测28份样本中,确定14份为阳性.对其中的5株毒株的核酸序列测定及序列遗传进化分析确定为GⅡ/4型诺如病毒,并与2006年诺如病毒流行株2006b同源性最高,为97.9%.结论 本次感染性腹泻疫情由诺如病毒引起.     

濮阳市校园诺如病毒感染暴发疫情分析

目的:分析濮阳市校园诺如病毒感染暴发疫情的流行特征.方法:收集2017年12月至2020年12月濮阳市疫情信息,一共确认2016起校园诺如病毒感染暴发疫情,并以此作为研究对象.整理流行病学特征、并分析致病因素.结果:2017年12月至2020年12月濮阳市校园诺如病毒疫情共报告16起,平均罹患率为5.54％.其中,2019年暴发率最高,中学和小学以及男生和女生罹患率对比无显著性差异.学校规模大、学生卫生习惯差、食堂卫生等级B级为校园诺如病毒感染暴发疫情的独立危险因素(P<0.05).结论:濮阳市校园诺如病毒感染疫情主要发生在中小学,学校老师和家长应培养孩子卫生意识,减少感染风险.     

3起老人院诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

目的分析3起发生在老人院内的诺如病毒胃肠炎局部暴发疫情的流行特征,为今后预防类似事件的发生提供参考依据。方法收集2007年佛山市老人院诺如病毒胃肠炎暴发疫情现场流行病学调查报告．采用描述性流行病学方法对疫情调查处理情况进行分析。结果2007年佛山市共报告3起老人院诺如病毒胃肠炎暴发疫情,共发病56例,无死亡病例;疫情集中发生在2～3月份;每起疫情均从部分患者粪便标本中检测诺如病毒Ⅱ型核酸;3起疫情主要以人-人密切接触的途径传播。结论早发现、早报告、早处理疫情．以及日常加强院内卫生,强化护工的规范操作,是预防和控制诺如病毒胃肠炎在老人院发生的关键。     

我国重组型GII.2[P16]诺如病毒进化动力学和传播模式

目的:2016年冬季出现了一种重组型GII.2[P16]诺如病毒（norovirus,NoV）,并造成了我国急性胃肠炎大规模暴发,本研究旨在探究2016—2017年该病毒在我国的进化动力学和时空传播模式。方法:利用MEGA 7.0和BEAST等软件对先前获得的暴发标本中GII.2[P16] NoV全基因组、主要结构蛋白...     

2014年北京市某校连续三起诺如病毒疫情调查分析

目的 调查北京市某校连续三起诺如病毒疫情,为减少同类事件提供经验.方法 应用描述性分析方法,对三起疫情的调查结果进行分析.结果 2014年,北京市某小学2013级新生中连续发生三起诺如病毒疫情,罹患率分别为13.5％、10.56％及9.0％.随疫情起数增加,患儿就诊率下降(趋势x2=34.112,P＜0.001),且就诊患儿均未被诊断为法定报告传染病.造成三起疫情的诺如病毒基因型分别为GII.7型、GII.6型和GII.17型.结论 诺如病毒极易在集体单位内传播,扎实做好日常消毒和疫情报送工作,是预防及处置诺如疫情的关键措施.     

一起发生在医院病房的诺如病毒胃肠炎的调查

目的对一起发生在某医院内科病区的群体性胃肠炎进行调查和分析。方法应用现场流行病学调查方法进行调查，对标本进行ELISA检测。结果共报告病例14例，包括7名住院病人和7名医护人员，在3人的粪便标本中检出诺如病毒抗原阳性。通过隔离治疗病人、加强消毒和卫生宣教等综合措施，疫情得到有效控制。结论本次胃肠炎暴发疫情由诺如病毒引起，感染来源尚不明确。     

新型联检GI和GII型诺如病毒荧光微球检测条的研制和应用

制备并评估联检GI和GII型诺如病毒荧光微球检测条的检测效率。以层析材料和特异性双抗体,按常规双抗体夹心法制备联检GI和GII型诺如病毒荧光微球检测条。以轮状病毒细胞培养物和343例临床表现为胃肠道感染症状病人的粪便标本作为检测对象,用联检GI和GII型诺如病毒荧光微球检测条检测并与CerTest Norovirus GI-GII one step combo card test检测结果比较。成功制备了联检GI和GII型诺如病毒荧光微球检测条。检测性能:1联检GI和GII型诺如病毒荧光微球检测条的敏感性较CerTest Norovirus GI-GII one step combo card test方法高(4~8)倍;2与轮状病毒(Wa株)等一些肠道病毒无交叉反应。结果表明成功制备联检GI和GII型诺如病毒荧光微球检测条,其检测性能良好。