ISO15189认可关于CYP2C19基因多态性检测性能验证评价

目的评价荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测人类CYP2C19基因多态性的分析性能。方法依据ISO15189认可要求对试剂盒的准确度(与金标准比较)、特异度、精密度、检测下限和抗干扰能力进行性能评价。结果 20份临床标本荧光定量PCR与Sanger测序法结果比对,准确度符合率为100%(测序符合率为100%);10份临床标本3个基因型位点荧光定量PCR与Sanger测序法结果均为野生型,特异度符合率为100%;荧光定量PCR对临床标本重复检测15次的结果完全一致,且Ct值CV≤5%;试剂盒最低检出限为0.550ng/μL;血红蛋白、胆红素和三酰甘油3种干扰物质加入已知基因型结果的血液标本后进行检测,与对照结果符合率为100%。结论荧光定量PCR检测人类CYP2C19基因多态性的性能验证满足ISO15189认可要求,适合于临床应用。     

CYP2C9和VKORC1基因多态性检测试剂盒的性能验证

目的对华法林代谢相关的人细胞色素P450超家族第二亚家族C9代谢酶(CYP2C9)和维生素K环氧化物还原酶复合体亚单位1(VKORC1)基因多态性检测试剂盒进行性能验证。方法根据中国合格评定国家认可委员会(CNAS)制定的有关要求,结合试剂说明书,从符合率、精密度、检出限、抗干扰能力4个方面对苏州旷远生物分子技术有限公司的人CYP2C9与VKORC1基因多态性检测试剂盒(荧光PCR法)进行性能验证。结果20例临床标本的荧光PCR检测结果与Sanger测序法检测结果的符合率为100%;荧光PCR对1例临床标本重复检测15次,CYP2C9与VKORC1基因荧光通道的Ct值变异系数(CV)均<5%;试剂盒最低检测限为10 ng/μL;已知基因型的血液标本中加入干扰物血红蛋白、胆红素和胆固醇之后的基因型结果与对照组完全一致。结论人CYP2C9与VKORC1基因多态性检测试剂盒(荧光PCR法)符合ISO15189质量管理要求,可以在保证项目验收的基础上,为临床提供可靠的检测结果。     

人CYP2C19基因分型检测试剂性能验证

目的 通过设计合理的实验对人CYP2C19基因分型检测试剂盒[荧光聚合酶链反应(PCR)法]进行性能验证,证实其检测结果的可靠性。方法 参照CNAS-GL039:2019《分子诊断检验程序性能验证指南》要求,选择符合实验条件的样本,严格按照CYP2C19基因分型检测试剂盒标准操作流程进行基因型别的检测。通过数据分析和统计,对试剂盒性能进行多方面评估,包括方法符合率、检出限、交叉反应以及抗干扰能力。结果 15例临床样本(10例突变型+5例野生型)试剂盒检测结果与金标准测序结果完全一致,方法符合率为100%;经梯度稀释验证,试剂盒最低检出限为10 ng/μL;CYP2C19 1*/1*型(c.681G和c.636G)临床样本中,加入CYP2C19*17等位基因(c.-806C>T)和同源基因CYP2C9(c.1075A>C)突变型质粒,检测结果仍为1*/1*型,满足交叉反应验证要求;干扰物质(血红素20.0 g/L,甘油三酯11.0 mmol/L,总胆红素60.0μmol/L)对试剂盒检测结果无影响,抗干扰能力合格。结论 人CYP2C19基因分型检测试剂盒(荧光PCR法)性能评...     

CYP2C19基因多态性检测的临床实验室性能验证

目的对人细胞色素P450酶等位基因(CYP2C19)多态性检测试剂盒进行性能验证。方法根据中国合格评定国家认可委员会CNAS-GL039:2019《分子诊断检验程序性能验证指南》相关要求,结合试剂盒说明书,从符合率、精密度、检出限和抗干扰能力4个方面对“人CYP2C19基因多态性检测试剂盒(荧光PCR法)”进行性能验证。符合率验证采用荧光PCR法和Sanger测序法检测;精密度验证选择杂合突变CYP2C19 c.681GA、c.636GA样本进行检测;抗干扰能力验证判断基因型检测是否受影响。结果PCR法和Sanger测序法的检测符合率为100%;CYP2C19 c.681 G和A等位基因的FAM和ROX荧光通道精密度检测CV值分别为3.78%、1.76%、3.76%和3.56%;CYP2C19 c.636 G和A等位基因的FAM和ROX荧光通道精密度检测CV值分别为3.08%、2.81%、3.40%和3.73%;样本最低检出限为10 ng/μL;抗干扰能力验证显示基因型可以正常检测。结论人CYP2C19基因多态性检测试剂盒(荧光PCR法)符合ISO15189质量管理要求,可以为临床提供准确可靠的检测结果。     

粪便SDC2基因甲基化检测在结直肠癌筛查中的应用价值

目的 探讨粪便硫酸类肝素蛋白多糖2(SDC2)基因甲基化检测在结直肠癌(CRC)筛查中的临床应用价值。方法 通过荧光聚合酶链反应(PCR)法检测在该院胃肠外科或消化内科就诊的96例患者粪便中SDC2基因甲基化情况,并收集其6种血清肿瘤标志物[血清癌胚抗原(CEA)、糖类抗原(CA)19-9、CA125、铁蛋白(SF)、细胞角蛋白19片段(CYFRA-21)、胃泌素释放肽前体(ProGRP)]的联合检测结果及肠镜、病理检查结果,以肠镜及病理检查结果为“金标准”分析比较粪便SDC2基因甲基化与6种血清肿瘤标志物检测对CRC的诊断效能。同时分析粪便SDC2基因甲基化与TNM分期及癌变部位等临床病理特征的关系。结果 根据肠镜或病理检查结果,将96例就诊者分为CRC组(32例)和对照组(64例),CRC组中粪便SDC2基因甲基化检测阳性率为84%(27/32),6种血清肿瘤标志物联合检测阳性率为44%(14/32);对照组中粪便SDC2基因甲基化检测阳性率为3%(2/64),6种血清肿瘤标志物联合检测阳性率为20%(13/64)。粪便SDC2基因甲基化诊断CRC的特异度(97%)、灵敏度(84%...     

SLCO1B1&APOE基因多态性检测性能验证

目的对人类SLCO1B1APOE基因检测试剂盒(PCR-荧光探针法)进行性能验证。方法参照产品行业标准要求及相关文献,设计验证方案,对武汉友芝友医疗公司生产的人类SLCO1B1APOE基因检测试剂盒的准确性(与金标准测序法结果比较)、特异性、最低检出限和抗干扰能力4个方面进行性能验证。结果 20个临床样本的荧光定量PCR检测结果与测序法结果比对,符合率为100%,满足试剂准确性验证要求;40个临床样本荧光PCR野生型位点的检测结果用测序方法均未检出突变,满足试剂特异性验证要求;基因检测试剂盒的最低检出限为10 ng/μL;血红蛋白、总胆红素和三酰甘油3种干扰物质加入已知基因型结果的血液样本后进行检测,与对照组结果均符合,满足试剂抗干扰能力验证要求。结论人类SLCO1B1APOE基因检测试剂盒各项性能验证参数与厂家声明基本一致,符合相关质量管理要求,可应用于临床标本检测。     

粪便SDC2基因甲基化检测联合结肠镜在早期结直肠癌筛查中的意义

目的探讨粪便SDC2基因甲基化检测联合结肠镜在早期结直肠癌(CRC)筛查中的意义。方法选择2018年1月-2019年10月在深圳市宝安区中心医院体检的1 000例体检者作为研究对象,使用试剂盒分别检测粪便SDC2基因甲基化和血浆SEPT9基因甲基化,对两者任一结果为阳性者再行结肠镜检查。比较SDC2和SEPT9基因甲基化检测的阳性率以及两者联合结肠镜对进展性腺瘤和CRC的检出率。结果在1 000例筛查对象中,粪便SDC2基因甲基化检测阳性率明显高于血浆SEPT9基因甲基化〔18.10%(181/1 000)比9.80%(98/1 000)〕,差异有统计学意义(P<0.05);粪便SDC2基因甲基化检测联合结肠镜对进展性腺瘤和CRC的检出率均明显高于血浆SEPT9基因甲基化检测联合结肠镜筛查〔进展性腺瘤检出率:2.50%(25/1 000)比1.00%(10/1 000),CRC检出率:1.50%(15/1 000)比0.50%(5/1 000)〕,差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论粪便SDC2基因甲基化检测是一种简单无创的CRC筛查新技术,患者接受程度更高,能够避免大规模肠镜筛查带来的弊端,联合结肠镜检测可作为CRC早期筛查的首选策略。     

2种HLA-B27检测方法在强直性脊柱炎诊断中的比较

目的：通过比较2种中国药监局（CFDA）批准的人类白细胞抗原（HLA）-B27体外诊断试剂盒,探讨荧光聚合酶链式反应（PCR）体外诊断试剂盒在 HLA-B27检测中的临床应用价值。方法收集该院573例临床血液样本,分别采用基于荧光PCR 技术和流式细胞法的2种上市获批试剂盒进行 HLA-B27检测,对于2种方法检测结果不一致的样本采用 PCR 测序方法进行确认,同时随机抽取5％的荧光 PCR 法检测结果为阳性的样本进行复验。结果573例样本,采用流式细胞法试剂盒检测出阳性191例,阴性382例;相同样本使用荧光 PCR 试剂盒检测 HLA-B27基因阳性共194例,阴性379例。最终结果以流式细胞法作为参照,2种试剂盒阳性符合率为96.33％（184／191）,阴性符合率为94.76％（362／382）,27例样本不符（占总样本数的4.71％）,2种方法的总符合率为95.29％[（184＋362）／573],Kappa 值为0.896,（P ＝0.02）;四格表资料卡方检验 P ＝0.021,2种方法检测结果一致性较高,但检测结果存在差异。复测标本中（包括27例检测结果不一致标本）HLA-B27基因测序结果与荧光PCR 试剂盒检测判断结果一致。结论相比临床 HLA-B27检测的权威方法流式细胞方法,荧光 PCR 法试剂盒在保证较高结果一致性的基础上,在 HLA-B27检测上可能具有更为准确的判断能力,且相比标本制备和操作更为简单,具有较强的临床应用价值和前景。     

基于荧光定量PCR技术的人类CYP2C9和VKORC1基因多态性检测方法学评价

目的:对基于荧光定量PCR技术的人类CYP2C9和VKORC1基因多态性检测试剂盒进行性能评价。方法:选取20例已通过Sanger测序确定基因分型的临床样本编盲,按照试剂盒流程进行实时荧光PCR检测,评价其准确度;对4种基因型样本(CYP2C9*3纯合野生型、CYP2C9*3杂合突变型、VKORC1-1639GA纯合突变型和VKORC1-1639GA杂合突变型)重复检测10次,评价其批内精密度;DNA样本梯度稀释,评价最低检测限。结果:实时荧光PCR法与测序结果对比分析,结果全部一致,准确度100%。不同基因型批内精密度均≤5%,批内精密度可接受。DNA浓度在0.964μg/μL仍可检测标本的基因型。结论:实时荧光PCR技术对人类CYP2C9和VKORC1基因分型检测在方法学上稳定可靠,此评价模式可适用于基于荧光PCR技术的其他基因多态性试剂盒的评价。     

血浆Septin9基因甲基化检测性能评价及对结直肠癌患者的筛查价值

摘要：目的：评价血浆 Septin9 基因甲基化检测试剂盒对结直肠癌(CRC)的诊断价值，并进行性能验证。 方法：收集2016年10月至2017年5月CRC手术患者的术前血浆标本32例及健康成人血浆标本10例。采用血浆 Septin9 基因甲基化检测试剂盒检测两组血浆 Septin9 基因甲基化水平，对该试剂盒诊断CRC的符合率、最低检出限和精密度进行评价，并与癌胚抗原（CEA）和粪便隐血试验（FIT）进行方法学比较。 结果：血浆 Septin9 基因甲基化试剂盒检测CRC患者的阴、阳性符合率为100%；检测限参考品阳性；精密度变异系数＜5%，符合基本性能要求。 Septin9 基因甲基化检测用于诊断CRC的敏感性为62.50%，特异性为90.00%，阳性预测值为95.20%，阴性预测值为42.90%。血浆 Septin9 基因甲基化检测对于CRC的检出率为62.50%，明显高FIT（28.13%）及CEA（28.13%）的检出率，差异均具有统计学意义（P均＜0.05）。 Septin9 基因甲基化检测的曲线下面积（AUC^ROC）为0.762。 Septin9 基因甲基化检测对于Ⅰ期CRC的检出率为50.00%。 结论：该血浆 Septin9 基因甲基化试剂盒的性能指标满足预期临床用途要求，可以作为CRC血清学辅助诊断标志物。     

1种新型冠状病毒核酸检测试剂的性能验证

摘要：目的?验证一种新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒的检测性能。方法?依据CNAS-GL039《分子诊断检验程序性能验证指南》，使用2019-nCoV RNA液体性能验证参考品，依次对实时荧光RT-PCR试剂的符合率、检出限、交叉反应、精密度和抗干扰能力进行验证及评价。结果?实时荧光RT-PCR试剂检测2019-nCoV RNA的符合率为100%，检出限为125 copies/mL。该试剂检测人冠状病毒HCoV-OC43、人冠状病毒HCoV-HKU1、人冠状病毒HCoV-229E、人冠状病毒HCoV-NL63、SARS冠状病毒、中东呼吸综合征(MERS)冠状病毒、甲型流感病毒、乙型流感病毒、呼吸道合胞病毒、人副流感病毒、腺病毒、肠道病毒、肺炎支原体、EB病毒、人巨细胞病毒和结核分枝杆菌无交叉反应；2.0×103?copies/mL和2.0×105?copies/mL的精密度参考品N基因检测的批内变异系数(CV)为0.70%及1.36%，批间CV为1.17%及1.72%；ORF1ab基因的批内CV为0.48%及0.52%，批间CV为1.36%及2.39%；加入内源性干扰物血红蛋白及清蛋白、外源性干扰物利巴韦林及阿奇霉素对2019-nCoV RNA的检测结果无影响。结论?该试剂检测2019-nCoV RNA的符合率、检出限、交叉反应、精密度和抗干扰能力均符合临床分子生物学扩增检验的要求，可为临床提供可靠依据。     

新型冠状病毒核酸检测的性能验证及评价

目的验证实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测新型冠状病毒(SARS-CoV-2)检测系统的主要性能。方法参考《医学实验室质量和能力的要求》第1部分通用要求GB/T22576.1-2018和第10部分分子生物检验学领域的要求GB/T22576.10-2018对该实验室RT-qPCR检测SARS-CoV-2核酸的检测系统的符合率、重复性、检出限、抗干扰能力、交叉反应等性能特征进行验证及评价。结果该实验室与国家卫生健康委临床检验中心2020年第1、2次SARS-CoV-2室间质评标本的阳性符合率为92%,阴性符合率为100%,总符合率为95%,其中有1例阳性标本未检出阳性,系标本浓度低于最低检测限;弱阳性标本检测的靶基因ORF-1ab和N的Ct值的批内变异系数(CV)分别为1.38%和1.16%,批间CV分别为1.84%和1.72%,均小于5%;检测限浓度(500 copies/mL)标本5次重复检测SARS-CoV-2核酸结果均为阳性;在加入严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、磷酸盐缓冲液(PBS)、人冠状病毒NL63(NL63)、人冠状病毒HKU1(HKU1)、人冠...     

焦磷酸测序法检测ALDH2*2和MTHFR 677基因多态性的性能验证

目的对实验室自建焦磷酸测序法检测乙醛脱氢酶2(ALDH2)*2和亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)677基因多态性的方法进行性能评价。方法对不同浓度(10.0、2.0、0.4、0.0ng/μL)的杂合型DNA标本进行检测,评价方法的检出限;采用经焦磷酸测序法验证的DNA标本的PCR产物各20例,与Sanger测序法进行比较,评价方法的准确度;对3种(野生、杂合和突变型)基因型标本重复检测4次,评价方法的重复性。结果焦磷酸测序法检测ALDH2*2和MTHFR 677多态性的检出限为2ng/μL基因组DNA;焦磷酸测序法的分型结果与Sanger测序法一致,准确度为100%;批内重复4次检测结果完全一致。结论焦磷酸测序法检测ALDH2*2和MTHFR 677基因多态性稳定可靠,满足江苏省临床检验中心的要求,可用于临床检测。     

7种微小RNA检测试剂的多中心评估

目的 评估某品牌7种微小RNA(miRNA)检测试剂盒的检测性能。方法 采用多中心横向联合评价方法,在全国范围内选择10家检测中心在同一时间使用同一批样本,对同一批号试剂进行性能评估。检测项目为miR-21、miR-26a、miR-27a、miR-122、miR-192、miR-223和miR-801,以miR-1228为内参。评估参数包括精密度、符合率、检出限和抗干扰能力。结果 10家检测中心检测8种miRNA的循环阀值(Ct)的批内变异系数(CV)均<5.00%,批间CV均<6.50%。10家检测中心检测20例临床血浆样本的总符合率均为100.00%(20/20),对50拷贝/μL标准参考品的检出率均为100.00%(20/20)。血红蛋白200 g/L、胆红素1 000 μmol/L和三酰甘油100 mmol/L对检测结果无明显干扰。结论 该试剂盒检测7种miRNA的精密度、符合率、检出限和抗干扰能力表现良好,可满足不同地区、不同实验室和不同检测系统的使用需求和预期用途,具有一定的临床应用价值。     

粪便SDC2基因甲基化检测在结直肠癌辅助诊断中的价值

目的 探讨粪便黏结蛋白聚糖2(SDC2)基因甲基化检测在结直肠癌辅助诊断中的价值。方法选取结直肠癌患者51例（结直肠癌组）、结直肠腺瘤患者22例（腺瘤组）、健康体检者39名（正常对照组）,同时收集所有对象的粪便和血清样本,检测粪便SDC2基因甲基化和血清癌胚抗原（CEA）、糖类抗原19-9(CA19-9)水平;其中有26份粪便样本采用P12全自动样本预处理仪和手工法同时进行样本预处理,比较2种方法预处理后检测结果的相关性。采用Peason相关分析评估2种方法之间的相关性,采用kappa检验分析2种方法的一致性。结果 结直肠癌组粪便SDC2基因甲基化阳性率显著高于腺瘤组和正常对照组（P<0.01）。结直肠癌组粪便SDC2基因甲基化阳性率显著高于血清CEA和CA19-9的阳性率（P<0.01）。结直肠癌Ⅰ～Ⅳ期患者之间粪便SDC2基因甲基化阳性率差异均无统计学意义（P>0.05）。结直肠癌Ⅰ～Ⅲ期患者的粪便SDC2基因甲基化阳性率显著高于血清CEA和CA19-9的阳性率（P<0.01）。ROC曲线分析结果显示,粪便SDC2基因甲基化、血清CEA、CA19-9单项检测...     

系统性红斑狼疮的诊断新方法与临床验证

目的验证IFI44L基因甲基化位点作为系统性红斑狼疮(SLE)标志物在临床诊断中的意义,评估采用该方法的试剂盒检测结果的准确性和有效性。方法收集患者外周血标本共136份,经临床诊断,SLE确诊患者标本74份,非SLE患者标本62份。对标本随机编号后,使用SLE基因甲基化检测试剂盒[甲基化特异性高分辨率溶解曲线法(MS-HRM法)]对标本的IFI44L基因甲基化位点进行检测,并根据检测结果区分SLE与非SLE患者标本,标本揭盲后,对结果的灵敏度、特异度、总符合率及一致性系数Kappa值进行评价。结果IFI44L患者结果显示,该方法与临床确诊结果的总符合率为94.85%,灵敏度为93.24%,特异度为96.77%,Kappa值为0.8967。该检测方法与临床确诊方法对于SLE的诊断差异无统计学意义(χ^2=0.133,P>0.05)。结论IFI44L基因甲基化水平可作为诊断SLE及判断SLE病情变化的重要指标。IFI44L基因甲基化位点检测方法是除了SLE传统诊断方法外的另一种有效诊断手段,并从表观遗传学角度提供了SLE发生的证据。     

荧光PCR检测高血压用药相关基因多态性方法的建立

目的 建立联合检测高血压用药相关基因多态性的荧光PCR检测方法.方法 针对CYP2D6*10、CYP2C9*3、ADRB1(1165G>C)、AGTR1(1166A>C)、ACE(I/D)突变位点分别设计特异性引物和探针,优化建立荧光PCR反应体系.验证该方法的敏感性、特异性、准确度、检出限、抗干扰能力.收集收集201...     

BCR-ABL融合基因定性检测试剂盒的性能评价

目的 使用BCR-ABL参考品,评价BCR-ABL融合基因定性检测试剂盒的性能。方法 提取参考品的RNA,测定其浓度和纯度。使用白血病融合基因检测试剂盒（荧光PCR法）进行PCR扩增。使用不同平台的荧光定量PCR仪进行检测,并使用仪器软件进行分析,获得参考品的BCR-ABL融合基因结果。结果 阳性参考品在BCR-ABL反应通道扩增曲线有明显对数增长期且Ct值<试剂盒的阳性界值,为BCR-ABL融合突变阳性,BCR-ABL融合基因突变阴性和其他白血病融合基因突变的阴性参考品在BCR-ABL反应通道没有扩增曲线,为BCR-ABL融合突变阴性,不高于100拷贝/反应的检测限参考品在BCR-ABL反应通道扩增曲线有明显对数增长期且Ct值<阳性界值,为BCR-ABL融合突变阳性,重复性参考品的BCR-ABL反应通道Ct值的变异系数（CV,%）为0.4%～1.8%。结论 BCR-ABL融合基因定性检测试剂盒能够准确检出参考品的BCR-ABL融合基因突变,符合《断裂点簇集区-艾贝尔逊白血病病毒（BCR-ABL）融合基因检测试剂盒》标准中的阳性参考品符合率、阴性参考品符合率、检出限和重复性...     

13种呼吸道病原体多重检测试剂的性能验证

目的对13种呼吸道病原体多重检测试剂盒(PCR毛细管电泳片段分析法)进行性能验证。方法参照CNAS-GL039:2019《分子诊断检验程序性能验证指南》和厂商性能确认方法,用包含13种病原体(经参比方法测序法确认)的临床咽拭子样本进行方法符合率验证,用国家参考品、慢病毒载体和质粒混合样本(包含所有13种病原体)进行检出限验证,用包含其他7种病原体的临床咽拭子样本进行交叉反应验证,用分别添加终浓度为5%的全血、1.2 mg/mL的硫酸沙丁胺醇的临床咽拭子样本进行抗干扰能力验证,以试剂盒说明书的性能指标作为结果判断标准。结果包含13种病原体的临床咽拭子样本经本试剂盒检测,各自出现所检测病原体的特征峰,满足方法符合率的验证要求;以国家参考品、慢病毒载体和质粒混合后的样品重复检测20次,对应的13种病原体均为阳性,满足检出限的验证要求;包含其他7种病原体的临床咽拭子样本均未出现本试剂盒所检测的病原体特征峰,满足交叉反应的验证要求;分别添加终浓度为5%的全血、1.2 mg/mL的硫酸沙丁胺醇的临床咽拭子样本检测结果与未添加干扰物质的对照组检测结果相同,满足抗干扰能力的验证要求。结论 13种呼吸道病原体多重检测试剂盒各项性能验证参数与厂商声明的标准一致,可正式应用于临床检测。     

一氧化氮检测试剂盒的性能验证和临床应用评价

目的对一氧化氮检测试剂盒进行性能验证和临床应用评价。方法根据美国临床和实验室标准协会(CLSI)的标准要求,使用7600-020日立全自动生化分析仪,对一氧化氮检测试剂盒的精密度、正确度、检出限、线性范围、参考区间进行验证,并将检测结果和厂家提供的性能指标进行比较。结果该试剂盒检测一氧化氮的批内精密度为3.69%、批间精密度为4.84%,均小于厂家提供的指标;正确度在允许偏倚范围内;检出限为2.52μmol/L;线性斜率为0.982 5,r^2为0.999,大于0.995符合要求;生物参考区间符合率95%。结论该一氧化氮检测试剂盒在7600-020全自动生化分析仪上主要分析性能符合厂家的声明,结果准确、可靠,可以用于临床检验分析。