基于网络药理学探讨独活-桑寄生治疗骨质疏松症的活性成分及生物学基础

目的运用网络药理学探究独活-桑寄生治疗骨质疏松症的活性成分,并通过筛选分析阐述独活-桑寄生治疗骨质疏松症的生物学基础。方法中药独活、桑寄生的活性成分及靶标通过中药数据库TCMSP、BATMAN检索出,骨质疏松症的预测靶点通过疾病靶点数据库Gene Cards检索出,将药物和疾病靶点进行映射,利用网络可视化软件Cytoscape3.6.0整理并筛选出核心成分及有效靶点,再将有效靶点通过Omic Share云平台进行GO富集分析、David6.8数据库进行KEGG通路富集分析。结果独活和桑寄生活性成分根据筛选条件得到核心成分共3个,分别为槲皮素、蛇床子素和补骨脂素;核心靶点24个,包括PTGS2、PTGS1、ESR1、ADRB2等;获得2 509条GO生物过程,包括对含氧化合物的反应、对有机物的反应、细胞对化学刺激的反应等; 193条分子功能,包括对酶结合、同一蛋白结合、信号受体结合等; 113条细胞组成,包括膜筏、膜微区、膜区等;获得KEGG信号通路12条,肿瘤坏死因子信号通路、低氧诱导因子-1信号通路、PI3K-Akt信号通路等为治疗骨质疏松症关键通路。结论独活和桑寄生配伍的多成分、多靶点、多通路通过抗炎和抗氧化的作用,从而治疗骨质疏松症,为中药复方治疗疾病的作用机制提供科学依据。     

独活寄生汤在膝骨关节炎治疗中的特色

独活寄生汤邪正兼顾,具有祛风湿、止痹痛、补气血、益肝肾之功。独活寄生汤临床运用广泛,尤其在膝骨关节炎治疗中疗效颇佳。文章从膝骨关节炎病因病机特点、独活寄生汤组方特点及临床应用现状和疗效特色等方面对该方在膝骨关节炎治疗中的特色加以阐述。     

基于网络药理学研究女贞子-淫羊藿药对活性成分抗骨质疏松的分子机制

目的基于网络药理学探讨女贞子-淫羊藿中活性成分,通过筛选抗骨质疏松症(osteoporosis,OP)的活性靶点,完成“活性成分-靶点-通路”的图解,阐述女贞子-淫羊藿联合应用的分子调控机制及其配伍的科学性。方法女贞子和淫羊藿的活性成分使用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)进行筛查,采用维恩图对其进行筛查,OP的活性靶点运用疾病靶点数据库进行筛选,将以上数据导入网络可视化软件Cytoscape 3.7.1进行整理,对有效靶点可以使用KEGG数据库进行信号通路富集分析。结果女贞子、淫羊藿活性成分根据药物相似性(DL)和口服生物利用度(OB)值检索出潜在活性成分共33个,及其相对应的227个潜在作用靶点;检索疾病靶点数据库得出与OP密切相关的靶点190个;KEGG通路富集分析,治疗OP的关键通路主要为破骨细胞分化通路、癌症途径等12条信号通路。结论女贞子-淫羊藿配伍的多成分在治疗OP方面具有多靶点、多通路的中医药特点。     

芪骨胶囊治疗绝经后骨质疏松症的分子机制

目的运用网络药理学的方法探究芪骨胶囊治疗绝经后骨质疏松症(postmenopausal osteoporosis,PMOP)的活性成分与潜在分子机制。方法从BATMAN-TCM数据库中获取芪骨胶囊的主要活性成分及其对应的靶点,在Gene Cards数据库和GEO数据库中筛选PMOP疾病靶点,将药物靶点与疾病靶点取交集,运用Cytoscape软件构建"药物-成分-靶点"网络图,同时将交集靶点导入String在线软件构建蛋白互作网络,筛选出核心靶点进行GO(gene ontology)生物过程及KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集分析。结果筛选获得67个活性成分,核心活性成分包括24-羟基-11-脱氧甘草次酸、菊油环酮、β-谷甾醇、γ-谷甾醇等;获得交集靶点共57个,其中核心靶点有胰岛素(INS)、白介素-6(IL-6)、胰岛素样生长因子-1(IGF-1)等。核心靶点GO生物过程和KEGG通路富集分析结果显示,GO生物过程主要涉及女性怀孕、多细胞生物过程等,KEGG通路主要涉及雌激素信号通路、卵巢甾体生成、流体剪切应力与动脉粥样硬化、白细胞介素17信号通路等。结论对于芪骨胶囊治疗PMOP的作用机制可能与菊花、黄芪、肉苁蓉中的主要成分如α-蒎烯、菊油环酮、β-谷甾醇等有关,并可能通过雌激素、白细胞介素等信号通路作用于人体INS、IL-6、IGF-1等靶点发挥疗效。     

二仙汤防治骨质疏松症的网络药理学研究

目的通过网络药理学分析二仙汤防治骨质疏松症(osteoporosis,OP)的关键靶点,探讨二仙汤防治OP的可能机制及信号通路。方法检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),筛选二仙汤的入血活性成分并预测其作用靶点;利用基因表达数据库(GEO)获取GSE56116基因芯片原始数据,分析二仙汤的治疗靶点;从疾病相关数据库检索已知OP致病基因;通过STRING和Cytoscape软件映射获得二仙汤治疗OP的关键靶点,建立关键靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行KEGG和GO富集分析揭示其可能的作用机制。结果通过检索TCMSP获得符合筛选标准的二仙汤活性成分84个,21个活性成分预测出145个作用靶点;通过R语言对基因芯片进行分析筛选出84个可能致病靶点,通过疾病相关数据平台获得691个OP相关致病靶点,利用STRING和Cytoscape构建PPI网络筛选出40个关键作用靶点和9个核心作用靶点。KEGG和GO分析结果显示,二仙汤治疗OP的关键靶点主要富集在RNA聚合酶II启动子对转录的正向调节、一氧化氮合酶等生物学进程,主要富集的信号通路为TNF信号通路、低氧诱导因子1信号通路和雌激素信号通路等。结论通过网络药理学方法阐释二仙汤可能通过TNF信号通路和HIF-1信号通路治疗OP,本研究为揭开中药复方治疗疾病的作用机制提供了科学的方法。     

基于网络药理学和分子对接探讨程氏萆薢分清饮治疗慢性前列腺炎的机制研究

目的:运用网络药理学研究和分子对接技术,探讨程氏萆薢分清饮治疗慢性前列腺炎(CP)的潜在机制.方法:借助TCMSP数据库筛选萆薢分清饮的活性成分及对应蛋白靶点,并利用Uniprot数据库确定基因靶点简称,通过Cytoscape3.7.2软件构建"中药-有效成分-靶点"作用网络.借助GeneCards和OMIM数据库筛选...     

大黄治疗慢性肾衰竭的网络药理学研究

目的:通过网络药理学方法,研究大黄治疗慢性肾衰竭(CRF)的药效成分、作用靶点及相关通路,构建"成分-靶点-通路-疾病"网络,拟阐述大黄治疗慢性肾衰竭的作用机制。方法:通过TCMSP数据库和文献挖掘获取大黄活性成分,利用Pharmmapper、GeneCards等数据库筛选大黄治疗CRF的潜在靶点,使用Gephi软件构建"活性成分-靶点"网络。借助DAVID数据库对靶点进行GO分析和KEGG通路分析。结果:筛选得到大黄素、番泻苷D等16个大黄活性成分、大黄治疗CRF潜在靶点113个,靶点主要涉及信号转导、细胞增殖的正调控、凋亡过程的负调控、蛋白质结合等生物过程;大黄可能通过抑制PI3K/Akt、HIF-1等信号通路延缓CRF的进展。结论:大黄素等蒽醌类化合物可能是大黄治疗CRF的核心药效成分,可能主要通过PI3K/Akt、HIF-1等信号通路调控细胞凋亡、抑制细胞外基质合成、干预异常的脂质代谢以延缓CRF进展。     

基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病的作用机制

目的:基于网络药理学探讨健脾养血排毒方治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease, CKD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库收集药物活性成分和潜在靶点,通过GeneCards和Disgenet数据库获取CKD靶点;利用软件Venny2.1获取药物-疾病交集靶点,采用STRING数据库构建PPI蛋白网络,并筛选核心靶点;通过DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析,借助软件Cytoseape3.9.1构建活性成分-疾病-靶点-信号通路网络。结果:筛选得到健脾养血排毒方有效成分130种,主要为槲皮素、山柰酚、刺芒炳花素等,涉及257个靶点基因;疾病靶点1 817个,健脾养血排毒方-CKD交集靶点156个,经拓扑分析获得TNF、VEGFA、TP53等69个核心靶点;富集分析涉及PI3K-Akt、AGE-RAGE及MAPK信号通路。结论:本研究初步探析了健脾养血排毒方治疗CKD的活性成分、潜在靶点及信号通路,为其干预CKD的作用机制提供了理论依据。     

基于网络药理学探究三芪口服液治疗慢性肾小球肾炎的效应机制

目的:研究三芪口服液治疗慢性肾小球肾炎(chronic glomerulonephritis,CGN)的网络药理学机制。方法:根据药物的药物动力学(ADME)特性,通过TCMSP平台筛选以三七、黄芪复方研制的三芪口服液的活性成分,通过Pub Chem平台、Swiss Target Prediction平台进行作用靶点的预测;基于Gene Cards数据库、Dis Ge NET数据库、OMIM数据库检索CGN相关靶点,采用Venny分析工具对药物靶点及疾病靶点进行重叠;借助cytoscape软件构建"活性药物-活性成分-靶点基因"网络,采用String数据库构建蛋白质相互作用网络。并将重叠的靶点信息利用DAVID数据库分析生物过程及通路富集。结果:本研究共获得27个药物活性成分,对应211个靶点,与疾病靶点有关的潜在靶点为42个;主要通过调节激素受体结合、蛋白酪氨酸激酶活性、Rap1信号通路、PI3K-Akt信号通路等发挥治疗CGN治疗作用。结论:三芪口服液通过多靶点-多通路治疗CGN,为解释其效应机制提供理论基础及科学依据。     

山药-黄芪药对治疗2 型糖尿病性骨质疏松的网络药理学机制研究

目的筛选山药-黄芪药对的化学成分并预测其作用靶点,建立药物活性成分-作用靶点-信号通路网络,分析山药-黄芪药对治疗2型糖尿病性骨质疏松(type 2 diabetic osteoporosis,T2DOP)的作用机制。方法通过中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)检索山药、黄芪的所有潜在活性成分及其对应的作用靶点,通过Gene Cards和OMIM数据库检索2型糖尿病性骨质疏松的相关靶基因,构建山药、黄芪"化学成分-候选靶标-T2DOP相关靶标"网络,筛选节点并对节点中的靶标进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。最终利用Cytoscape软件绘制"化学成分-关键作用靶点-信号通路"网络。结果筛选得到活性化合物36个,其中山药16个、黄芪20个,共涉及698个靶点,T2DOP直接相关靶基因3 305个;筛选节点40个,其中31个为T2DOP相关靶基因。这些基因主要涉及56个生物学过程,21个分子功能,10个细胞组分条目,作用于17条信号通路中的关键靶点;山奈酚等13个化合物可能为核心活性分子,CDK2等15个靶标为核心靶标。结论本研究结果初步阐释了山药-黄芪药对治疗T2DOP的物质基础及作用机制,体现了中药多成分、多靶点、多途径的特点,为进一步深入揭示其作用机制奠定了良好基础。     

通过网络药理学研究白术治疗前列腺癌的作用机制

目的:研究白术治疗前列腺癌的潜在靶点和作用机制.方法:使用公共数据库(TCMSP数据库、Genecard数据库、OMIM数据库、CTD数据库、DigSee数据库),筛选出白术的潜在活性成分及药物治疗疾病的预测靶点、前列腺癌靶点,构建成分-疾病-靶点网络图.通过生物信息学分析,包括构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)...     

基于网络药理学的三仙汤治疗骨质疏松症作用机制研究

目的通过网络药理学方法探讨三仙汤干预骨质疏松症(OP)的有效成分、作用靶点及信号通路等,从而明确其作用机制。方法应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索获得三仙汤中3味药物的化学成分,通过Uniprot数据库,将已筛选出的靶点名称进行标准化。通过Genecards、OMIM数据库检索骨质疏松症的相关靶基因。将药物靶点与疾病靶点取交集,筛选得到疾病-药物成分共同靶蛋白在String网站构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络模型。在Cytoscape软件中绘制药物、疾病、靶基因网络图,并进行基因GO功能和KEGG通路富集分析,探讨三仙汤治疗骨质疏松症的作用机制。结果通过数据库筛选得到三仙汤的28种有效成分以及与骨质疏松症相关的靶点127个,其中蛋白激酶、白介素6、血管内皮生长因子等基因为PPI网络中的核心基因; GO富集分析显示靶点主要影响核受体活性、转录因子活性、类固醇激素受体活性、细胞因子受体结合、蛋白质异二聚活性、血红素结合等生物过程;以及影响AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化通路、IL-17信号通路、前列腺癌通路、肿瘤坏死因子信号通路、乙型肝炎等信号通路。结论三仙汤中的有效成分通过关键信号通路作用于核心基因,影响细胞分化、凋亡、炎症、氧化应激等多种生物学过程发挥抗骨质疏松的作用,为其后续研究提供了科学依据。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨夏枯草治疗甲状腺癌的作用机制

目的 运用网络药理学联合分子对接技术分析夏枯草治疗甲状腺癌的分子机制。方法 利用TCMSP数据库预测夏枯草的主要活性成分,并用TCMSP和PubChem数据库获取所有活性成分对应靶点;通过GeneCards及OMIM数据库收集甲状腺治疗甲状腺癌的靶点。利用STRING数据库获取蛋白间的相互作用信息,并通过R语言进行拓扑学分析及可视化。利用R包clusterProfiler对上述取得的药物和疾病的交集靶点进行GO和KEGG pathway分析。利用Cytoscape 3.7.2构建活性成分-靶点-疾病网络,并进行拓扑学分析,得到核心化合物,用分子对接对核心靶点和化合物进行验证。结果 槲皮素、木犀草素、山奈酚、谷甾醇可能是夏枯草治疗甲状腺癌的核心成分,AKTI、VEGFA、CASP3、MYC、JUN、MAPK8、IL6、EGFR、MAPK1、EGF可能是治疗的重要靶点。结论 夏枯草治疗甲状腺癌体现了多成分、多靶点、多通路的特点,为夏枯草有效成分的筛选及进一步研究提供了理论基础。     

基于网络药理学的穿心莲抗骨质疏松的分子机制研究

目的 基于网络药理学研究方法挖掘穿心莲的活性成分和预测其治疗骨质疏松症的靶点，探究其抗骨质疏松症的分子机制。方法 在TCMSP数据库筛选穿心莲的活性化合物，通过PharmMapper反向对接获得药物作用预测靶点。从GeneCrads和CTD数据库搜索疾病靶点，建立药物-疾病靶标交互作用网络，筛选出穿心莲抗骨质疏松的特异性靶点，富集分析其信号通路。结果 检索到49种穿心莲的活性化合物，筛选出入血活性成分21种。获得206个药物作用预测靶点和与骨质疏松症发生发展相关的691个疾病靶点，通过药物-疾病靶标交互作用网络筛选出36个关键基因。富集分析结果显示穿心莲直接参与骨质疏松症发生发展的信号通路有Adherens junction、MAPK等。它还间接通过神经营养蛋白、VEGF、ErbB、Toll样受体、胰岛素等信号通路调节骨代谢。结论 穿心莲具有治疗骨质疏松症的药物潜能，其作用机制主要通过多靶点和多通路参与骨平衡的调控。     

基于网络药理学与分子对接技术探讨六味地黄丸抗骨质疏松症的机制研究

目的基于网络药理学及分子对接方法探讨六味地黄丸在治疗骨质疏松症(osteoporosis,OP)过程中的有效成分及作用机制。方法通过TCMSP数据库获得六味地黄丸组方的药物有效成分及其预测靶点;利用疾病数据库筛选骨质疏松症相关疾病作用靶点;将获得的关键靶点上传至STRING数据库完成PPI网络分析;利用DAVID数据库完成关键靶点的富集分析;通过Auto Dock Vina等软件完成化学有效药物成分与关键靶点的分析对接验证。结果共获得六味地黄丸组方化学有效成分69个、药物靶点蛋白128个及药物与骨质疏松症共同相关靶点81个;获得了IL6、TP53、VEGFA、TNF、JUN、MAPK1、EGF、EGFR、ESR1、CAT等PPI网络中的关键靶点。富集分析结果显示,其通过参与细胞增殖与凋亡过程、药物代谢、雌激素反应调节与细胞抗缺氧、抗衰老等生物学进程,调控TNF、药物代谢过程、HIF-1、VEGF、雌激素调节等信号通路,参与骨质疏松症的治疗过程;分子对接结果显示,调控网络中的关键靶点与相关有效成分之间具有较高的结合活性。结论借助生物信息学手段和分子对接技术,初步揭示了六味地黄丸抗骨质疏松症的作用机制,为后续进一步的机制研究及实验验证提供了目标与思路。     

探讨彝药恒古骨伤愈合剂治疗骨质疏松症的系统药理学作用机制

目的 借助系统药理学探讨彝药恒古骨伤愈合剂（osteoking,OK）治疗骨质疏松症（osteoporosis,OP）的药效成分、作用靶点及作用机制，并运用分子对接技术进行对接验证。方法 借助TCMSP筛选OK的活性成分及作用靶点；查询GeneCard、OMIM、DisGeNet、TTD等数据库，筛选OP相关的基因靶点；利用STRING和 Cytoscape 软件构建交集基因靶点蛋白互作网络（PPI），查找OK治疗OP的核心靶点基因，对核心靶点借助DAVID、KEGG Mapper数据库进行GO、KEGG分析。最后运用Autodock进行对接验证。结果 收集到槲皮素、山奈酚、反式十八烷酸、反11-二十碳烯酸、熊果酸、β-谷甾醇、委陵菜酸等主要活性成分；涉及到细胞对脂质、有毒物质、脂多糖、细菌源分子、无机物、有机环化合物、有机氮化合物的反应等生物学过程；可能通过PI3K/Akt、Ras、MAPK等多通路发挥作用。分子对接提示熊果酸与AKT1、ALB、IL-6结合效果较好。结论 初步明确了OK通过多靶点、多通路参与促成骨、抑制破骨的作用，为下一步实验研究提供理论支持与设计思路。     

基于网络药理学探讨骨碎补治疗骨质疏松症的作用机制

目的运用网络药理学筛选骨碎补有效成分治疗骨质疏松症的作用靶标及信号通路。方法首先借助TCMSP分析平台、GeneCards数据库和OMIM数据库,分别筛选中药活性成分、疾病及相应的靶标,将中药靶标与疾病靶标取交集,得到中药-疾病共同靶标并构建中药-疾病-靶标调控网络。然后通过构建中药-疾病共同靶标的蛋白互作网络,筛选核心靶点基因。最后将中药-疾病共同靶标进行GO功能富集分析和KEGG功能富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路。结果筛选得到骨碎补治疗骨质疏松症的18个有效成分和98个中药-疾病共同靶标,并推断其作用机制可能与糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、HIF-1信号通路、Th17细胞分化信号通路等有关,且白介素-6基因、JUN基因、丝裂原活化蛋白激酶-1基因和表皮细胞生长因子基因可能起着关键性作用。结论基于网络药理学探讨了骨碎补治疗骨质疏松症的作用靶标及信号通路,为中药现代化研究提供了思路。     

基于网络药理学探讨六君安胃方减少结肠癌化疗期间消化道不良反应的作用机制研究

目的 通过网络药理学方法探讨六君安胃方减少结肠癌化疗期间消化道不良反应的作用机制.方法 通过检索中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)对六君安胃方中六味中药的化...