常染色体显性视网膜色素变性家系基因定位的研究

目的 对一个常染色体显性视网膜色素变性大家系进行基因定位。方法 收集视网膜色素变性家系,并对该家系成员进行详细眼部检查;抽取外周血3－5ml并提取DNA;采用多个已知遗传标记与该家系致病基因位点进行连锁分析。结果 两点连锁分析结果显示该家系致病基因位点与遗传位标D3S1292连锁,在θ＝0．1时间到最大LOD值2．73。结论 D3S1292位于3号染色体长臂2区1带（3q21),从而将该家系致病基因位点大致定位于3q21附近。同时有文献报道视紫红质基因位点也位于3q染色体上,且与D3S1292邻近,因此该家系的致病基因很可能是视紫红质基因。     

原发性开角型青光眼家系致病基因的定位研究

目的采用候选位点连锁分析的方法对常染色体显性遗传的原发性开角型青光眼（POAG）一家系的致病基因进行定位。方法对重庆一大型POAG家系进行全面遗传学调查和样本采集,以短串联重复序列（STR）为分子遗传学标记,首先采用候选位点连锁分析的方法对该家系进行MYOC、OPTN、WDR36和CYP1B1基因的筛查定位,然后在阳性位点D2S2259上下游加密STR进一步行精细定位及单体型分析。结果由D2S2369、D2S2352、D2S378和D2S337所确定的染色体区域与该家系的致病基因紧密连锁（θ=0.00时,LODs分别为：D2S2369=4.584;D2S2352=2.992;D2S378=6.238;D2S337=4.892）。该区域位于人类染色体2p15～p16.3,长约7cM/7.5Mb,其中共有12个基因在眼部表达。结论研究与2007年Suriyapperuma SP等对7个欧裔成人型POAG家系的定位区域一致,且范围更小。     

常染色体显性遗传性先天性白内障一家系致病基因的初步定位

目的 初步定位常染色体显性遗传性先天性白内障(ADCC)一家系的致病基因。方法 收集ADCC一家系资料,在已知先天性白内障致病基因和位点附近,选择合适的短串联重复序列多态性标记(STRP),对ADCC一家系进行连锁分析,使用Mlink软件采用对数优势记分法(LOD)计算LOD值。结果 在STRP中,D17S805、D17S1294及D17S1293与致病基因位点连锁的最大LOD值分别为2．03、2．49及2．22(重组率0=0)。结论 该ADCC家系的致病基因初步定位在第17对染色体上;CRYBA1基因为候选基因。（中华眼科杂志,2004,40：824-827)     

我国常染色体显性遗传视网膜色素变性家系中PRPF31基因新的剪切位点突变

目的　研究我国一个4代常染色体显性遗传视网膜色素变性(RP)家系患者的致病基因突变位点及临床表型特征。方法　对RP家系中的所有患者进行眼部及视觉电生理检查;对全部家系成员进行全基因组扫描及连锁分析, 对候选基因直接测序并通过限制性内切酶反应证实突变位点。结果　RP家系患者致病基因定位于染色体带19q13 4,微卫星标记物D19S589和D19S254之间不到4Mb区域。在所有患者的PRPF31基因内含子8的第一个碱基处发现一新的杂合突变(G>C),使内含子8的剪切供体由GT变为CT。RP家系患者的临床表型符合早期发病且弥漫型的RP患者类型。结论　我国该4代RP家系中的患者由PRPF31基因中一新的剪切位点的杂合突变致病(IVS8+1G>C)。     

汉族常染色体显性视网膜色素变性一家系的连锁分析及突变筛查

背景 原发性视网膜色素变性(RP)有明显的遗传异质性和表型异质性,目前已确定的致病基因较多,确定患病家系的致病基因是进行基因治疗的基础. 目的 对患常染色体显性遗传性RP(ADRP)的一个汉族家系进行致病基因的定位和基因突变分析.方法 此家系的5代21名成员纳入研究,包括12例ADRP患者和9名表型正常者.12例患者进一步接受中心视野、间接检眼镜、眼电图(EOG)、视网膜电图(ERG)检查.对22个已知的ADRP致病基因所在染色体位点进行连锁分析,以确定该家系与疾病连锁的染色体区域,随后对该区域附近的候选基因视紫红质(RHO)进行直接测序评估其突变情况. 结果 间接检眼镜检查该家系先证者眼底表现符合原发性RP表现,EOG和ERG表现为波形记录不到,视野呈向心性缩小.两点连锁分析结果显示,该家系致病基因位点与遗传标记D3S1292连锁,在θ=0.0时得到最大优势对数(LOD)值为3.6671.候选的RHO基因直接测序结果发现,该家系所有患者第53位密码子的第2个核苷酸均出现了C→G的突变,致其氨基酸由脯氨酸变为精氨酸(Pro53Arg),而该家系正常成员中未发现此突变. 结论 RHO基因的错义突变Pro53Arg与RP疾病出现共分离现象,可确定为该ADRP家系的致病基因.     

常染色体显性视网膜色素变性家系基因定位的研究与视紫红质基因突变的检测分析

对一常染色体显性视网膜色素变性 (autosomaldominantretinitispigmentosa ,ADRP)大家系进行基因定位 ,并检测该家系12名患者的视紫红质基因是否存在突变。方法 :采用多个已知位点的遗传标记对该ADRP家系进行连锁分析 ,确定致病基因的大致染色体位置 ;在所定位的染色体区域将RHO基因作为侯选基因进行直接测序检测突变。结果 :连锁分析结果发现遗传标记D3S12 92 ,当θ =0 1时有最大Lod值 =2 732 85 2 ,因此考虑该家系致病基因位于D3S12 92附近。直接测序结果发现该家系中大部分患者在RHO基因的第 3外显子序列 ,第 182密码子的第 2个碱基发生G→A置换突变 ,导致甘氨酸 (Gly)变为天冬氨酸 (Asp) ,命名为Gly -182 -Asp突变 ,而在 2例患者中则未发现突变 ;同时 ,在该家系正常成员以及正常对照者中均未发现此突变。结论 :ADRP存在分子水平的遗传异质性 ,某些ADRP是由于RHO基因突变所致。但是由于本研究所涉及的ADRP家系中尚有2名患者未找到RHO基因突变 ,故不能将Gly -182 -Asp突变认为是该家系的致病原因。在D3S12 92与RHO基因之间可能存在新的基因 ,还需进一步研究证明。     

先天性核性白内障家系致病基因的定位与候选基因突变检测

目的 对中国一常染色体显性遗传性先天性核性白内障家系进行致病基因的定位与候选基因突变检测.方法 实验研究.采集家系成员的外周静脉血,提取基因组DNA.用约400个中密度微卫星标记进行基因扫描,平均遗传距离10厘摩(cM).利用LINKAGE软件包进行连锁分析.在阳性定位区域内选取更为精细的微卫星标记进行精细定位.利用CYRILLIC软件进行单体型分析,确定候选基因所在染色体区域.候选基因直接测序检测基因突变.结果两点间连锁分析在微卫星标记D2S325处获得最大对数优势计分(LOD)值Zmax=2.29(θmax=0.00).精细定位和单体型分析将致病基因定位于微卫星标记D2S117和D2S2382之间,遗传距离约19.04 cM,染色体位置为2q32.3-q35.候选基因直接测序发现CRYGC基因第3外显子第470碱基一个G→A的点突变.结论本研究将我国一个先天性核性白内障家系的致病基因定位于2号染色体2q32.3-q35约19.04cM区域内,并在CRYGC基因发现一个新的点突变与此家系共分离.(中华眼科杂志,2009,45:234-238)     

花冠状常染色体显性遗传性先天性自内障致病基因初步定位

目的 初步定位具有花冠状表型的常染色体显性遗传性先天性白内障一家系的致病基因.方法 收集家系成员的资料,提取基因组DNA,据文献报道在已知先天性白内障致病基因和位点附近,选择合适的短串联重复序列多态性标记,使用LINKAGE 5.1软件计算标准LOD值,对此家系进行连锁分析.结果 此表型先天性白内障的致病基因定位在3q22.3-q25.2,即D3S3612至D3S1594之间15.2 cM范围内.在D3S1569和D3S3599处,得到与致病基因住点连锁的最大LOD值均为3.01(重组率=0.00).结论 该花冠状常染色体显性遗传性先天性白内障致病基因初步定位在第3对染色体上3q22.3-q25.2.     

Avellino角膜营养不良家系致病基因的定位研究

目的：对收集到的一个常染色体显性遗传性Avellino角膜营养不良家系的致病基因进行初步定位。
　　方法：采集家系中所有成员的外周静脉血,从中提取基因组DNA样本。在热点区域内选取微卫星标记进行基因扫描,分别利用LINKAGE软件和CYRILLIC软件进行连锁分析及单体型分析,以确定候选基因所在的染色体区域。
　　结果：该Avellino角膜营养不良家系的连锁分析结果在D5 S396和D5 S393这两个微卫星标记处获得最大优势对数计分(LOD)值,Zmax=3.01(θ=0.00)。单体型分析将致病基因定位于微卫星标记D5 S808和D5 S638之间。
　　结论：该Avellino角膜营养不良家系的致病基因初步定位于染色体5q上的遗传距离约为11.2厘摩( cM)的一段区域内。     

遗传性核性金黄色结晶样白内障患者γ晶状体蛋白基因错义突变

目的确定中国北方常染色体显性遗传性白内障（ADCC）-家系的致病基因。方法收集ADCC-家系资料,提取血液白细胞DNA,运用微卫星位点多态性连锁分析,对提示连锁的染色体区域内的候选基因测序,寻找突变。结果该家系致病基因定位在2q33．3-34区域内,对其候选基因γ晶体蛋白基因簇各基因进行测序,发现γD晶体蛋白基因第二外显子有一个杂合子的错义突变（109C→A）与家系患者共分离,此突变可导致其编码的第36位精氨酸被丝氨酸取代。结论此γ晶体蛋白基因突变引起该家系核性结晶样先天性白内障,是由1D晶体蛋白基因109C→A（R36S）突变引起的。（中华腰群杂志,2006,42：913—917）     

视网膜色素变性PRPF-31基因剪接位点突变及其相关表型特征研究

目的 研究一个常染色体显性遗传视网膜色素变性（ADRP）大家系的致病基因及其相关表型特征。方法 应用基因组扫描定位和突变检测法确定该家系的致病基因,并对其进行详细的家系调查,同时选取该家系不同代别中11例有症状的患者和7例无症状的个体,进行视网膜电图（ERG）、多焦视网膜电图（mERG）、心理物理学及荧光素眼底血管造影等检测。结果 在19号染色体PRPF-31基因5号内含子-1处发现一新的剪接位点突变（IVS5—1G→A）。家系中有症状的患者均在10岁以前发病,病情进展快而严重,呈Ⅰ型弥漫性视网膜色素变性（RP）表现。Goldmann视野检查,30岁以上患者动态视野大范围缺损,部分患者仅存颞侧视岛,静态视野阈值无法查出;mERG检测：双眼暗视a、b波振幅极度下降且低平,呈熄灭型;多焦视网膜电图显示双眼黄斑区及其周围视网膜反应密度显著降低;荧光素眼底血管造影显示黄斑中央凹周围色素上皮萎缩,呈“牛眼样”外观。7例无症状者中,1例经mERG、心理物理学及分子遗传学检测,证实其为轻症RP患者,另1例为疾病基因的杂合携带者。结论 PRPF-31基因5号内含子-1剪接位点突变（IVS5—1G→A）是ADRP的一种新的突变位点。该突变所致的ADRP表型主要为Ⅰ型弥漫性RP,同时,还存在基因外显不全和表现度不一的变异性表达。     

Autosomal recessive retinitis pigmentosa is associated with mutations in RP1 in three consanguineous Pakistani families

PURPOSE: To localize and identify the gene and mutations causing autosomal recessive retinitis pigmentosa in three consanguineous Pakistani families. METHODS: Blood samples were collected and DNA was extracted. A genome-wide scan was performed by using 382 polymorphic microsatellite markers on genomic DNA from affected and unaffected family members, and lod scores were calculated. RESULTS: A genome-wide scan of 25 families gave an hlod = 4.53 with D8S260. Retinitis pigmentosa in all three families mapped to a 14.21-cM (21.19-Mb) region on chromosome 8 at q11, flanked by D8S532 and D8S260. This region harbors RP1, which is known to cause autosomal dominant retinitis pigmentosa. Sequencing of the coding exons of RP1 showed mutations in all three families: two single-base deletions, c.4703delA and c.5400delA, resulting in a frame shift, and a 4-bp insertion, c.1606insTGAA, all causing premature termination of the protein. All affected individuals in these families are homozygous for the mutations. Parents and siblings heterozygous for the mutant allele did not show any signs or symptoms of RP. CONCLUSIONS: These results provide strong evidence that mutations in RP1 can result in recessive as well as dominant retinitis pigmentosa. The findings suggest that truncation of RP1 before the BIF motif or within the terminal portion results in a simple loss of RP1 function, producing a recessive inheritance pattern. In contrast, disruption of RP1 within or immediately after the BIF domain may result in a protein with a deleterious effect and hence a dominant inheritance pattern.     

Autosomal dominant pericentral retinal dystrophy caused by a novel missense mutation in the TOPORS gene

Purpose: This study aimed to identify the genetic cause of autosomal dominant pericentral retinal dystrophy (adPRD) in a large Norwegian family with 35 affected members. Methods: The family was characterized by clinical ophthalmological examination along with fundus photography, dark adaptometry and electroretinography. We performed a genome‐wide linkage analysis followed by sequencing of a candidate gene to identify the mutation causing the disease. Results: The ophthalmological examinations revealed an atypical form of retinitis pigmentosa (RP), which we prefer to call adPRD. Compared with classical RP, this phenotype has a favourable prognosis. Linkage analysis showed a linkage peak covering the most recently reported adRP gene TOPORS. This gene was sequenced in 19 family members and a novel missense mutation, c.1205a>c, resulting in an amino acid substitution p.Q402P, was detected in all affected members. The mutation showed complete co‐segregation with the disease in this family, with a LOD score of 7.3. It is located in a highly conserved region and alignment with the appropriate DNA sequence from other species shows complete conservation of this amino acid. The mutation was not detected in 207 healthy, unrelated controls of Norwegian origin. Conclusions: We present a novel mutation in the TOPORS gene co‐segregating with a distinct phenotype of adPRD in a large Norwegian family.     

视网膜色素变性显性遗传家系3号染色体连锁分析

目的：用连锁分析法对三个显性视网膜色素变性家系(CY、WN、ZH)3号染色体进行分析，确定致病基因。方法：随机选取3号染色体视紫红质(rhodopsin，RH0)基因上下约5厘摩(centimorgan cM)范围内的6对微卫星标记(marker)，确立单倍体型，用两点法计算最大优势对数(LOD SCORE)值。结果：所选微卫星标记与CY、WN家系表型间LOD值呈负相关关系，而ZH家系与位点D3S3606间LOD值为2．52。结论：RH0基因为CY、WN家系的非候选基因，RHO基因可能是家系ZF致病基因。     

中国人一个显性视网膜色素变性家系8号染色体连锁分析

目的用连锁分析法对中国人一个显性视网膜色素变性家系8号染色体进行分析，确定致病基因。方法随机选取8号染色体RP1基因上下约10厘摩(cm)范围内的10对微卫星标记(marker)，确立单倍体型，用两点法计算最大优势对数(LOD SCORE)值。结果所选微卫星标记与该家系表型间最大LOD值小于1。结论RP1基因可能为该家系的非致病性基因，用连锁分析法进行致病基因排除对最终确立致病基因所在染色体的范围具有重要的价值。     

Mutation screening of Pakistani families with congenital eye disorders

To map the disease loci several Pakistani families suffering from autosomal recessive retinitis pigmentosa with preserved para-arteriolar retinal pigment epithelium and Leber congenital amaurosis (LCA) were analyzed. Analysis revealed close genetic linkage between the disease phenotype of some of the families (3330RP, 111RP and 010LCA) and the microsatellite markers on chromosome 1q31. Mutation screening of the candidate gene CRB1 revealed a G to A transversion in exon 7 in arRP family 330RP and a T to C substitution in another arRP family, 111RP. In exon 9 of the CRB1 gene a T to C transversion was found in the family suffering from LCA (010LCA).The LCA phenotype of another family (011LCA) in which the CRB1 locus was excluded, showed linkage with microsatellite markers D17S1294 and D17S796 on chromosome 17p13.1. The association of the candidate gene GUCY2D (17p13.1) with the disease phenotype was excluded as no disease-associated mutation was found in any of its exons. Mutation screening of another candidate gene, AIPL1 located in the same region, showed a novel homozygous C to A substitution in exon 2. These sequence changes are unique for the Pakistani families and some of these have not been reported previously.     

一个常染色体显性遗传视网膜色素变性家系疾病基因排除性定位分析

目的 确定一个常染色体显性遗传视网膜色素变性(autosomal dominantret initis pigmentosa,ADRP)家系中的疾病基因与3号染色体视紫红质基因的关系。方法 选择一个连续5代发病的ADRP家系,采集到该家系中16个正常个体、18个受累个体的血样。选取3号染色体上的14对用6-FAM、HEX、NED3种荧光染料标记的微卫星标记DNA引物,对该家系进行连锁分析。结果 3号染色体上的14对微卫星NDA标记位点的LOD值均≤-2,证实3号染色体上的14对微卫星标记DNA位点与该家系致病基因不连锁。结论 该家系的致病基因位于其他染色体上。