四妙丸对类风湿性关节炎和湿疹“异病同治”作用机制的网络药理学探讨

目的运用网络药理学方法分析四妙丸治疗类风湿性关节炎和湿疹的活性成分、作用靶点及关键通路,探讨该方“异病同治”的作用机制。方法通过检索中药系统药理学分析平台（TCMSP）数据库并结合文献筛选四妙丸中的活性成分及其作用靶点;利用OMIM、GeneCards、Drugbank 等数据库收集类风湿性关节炎和湿疹的疾病相关靶点;活性成分作用靶点与疾病靶点取交集得到四妙丸治疗类风湿性关节炎和湿疹的共同靶点。通过Cytoscape 3.7.1 软件构建“中药-活性成分-疾病共同靶点”网络;运用STRING 数据库构建共同靶点蛋白互作（PPI）网络。通过Metascape 和DAVID 数据库对共同靶点分别进行GO 功能富集分析和KEEG 通路富集分析。结果共筛选出四妙丸治疗类风湿关节炎和湿疹的共同靶点46 个,对应四妙丸中的45 种活性成分。四妙丸主要通过槲皮素、山柰酚、汉黄芩素、油酸、3β-乙酰氧基苍术酮等活性成分,对TNF、IL6、IL1B、CCL2、CXCL8 等关键基因进行调控,实现对类风湿关节炎和湿疹的异病同治作用。其作用机制可能与细胞黏附、白细胞迁移、对脂多糖的反应等生物过程有关,并通过TNF 信号通路、类风湿性关节炎、Toll 样受体信号通路等相关通路实现。结论四妙丸是通过多成分、多靶点、多种信号通路来发挥治疗类风湿关节炎和湿疹的作用,与其抗炎及免疫调节作用密切相关。     

交泰丸对糖尿病、抑郁和失眠症“异病同治”的网络药理学机制分析

目的：从分子水平探讨交泰丸对糖尿病、抑郁和失眠症“异病同治”的作用机制。方法：运用网络药理学技术,通过数据库检索,以交泰丸的有效成分、作用靶点、治疗疾病种类为网络节点,使用Cytoscape构建相互作用网络,MAS进行生物信息学分析。结果：交泰丸中的20个化合物可作用于92个靶点发挥对3种疾病的治疗作用,HTR2A和HTR2C为交泰丸治疗糖尿病、抑郁和失眠的共同靶点。交泰丸治疗糖尿病的靶点主要富集在抗细胞凋亡生物过程和Toll样受体信号通路,治疗抑郁的靶点主要富集在信号转导生物过程和神经活性配体-受体相互作用通路,治疗失眠的靶点主要富集在5-羟色胺受体,磷脂酶C激活途径生物过程和神经活性配体-受体相互作用通路。结论：交泰丸具有多成分、多靶点、多途径的特点,该研究为交泰丸“异病同治”的作用机制提供参考。     

基于网络药理学和分子对接探讨桂枝茯苓丸“异病同治”多囊卵巢 综合征和子宫内膜异位症的作用机制

探讨桂枝茯苓丸治疗多囊卵巢综合征（PCOS）和子宫内膜异位症（EMT）的异病同治作用机制。【方法】利用 TCMSP获取桂枝茯苓丸组成中药的活性成分及相关靶点。通过GeneCards、PharmGKB、TTD数据库分别筛选PCOS和EMT疾 病靶点。使用R软件中的Venn R包获取药物与疾病的交集靶点后绘制Venn图,在Cytoscape中制作药物-活性成分-潜在靶点 互作网络图,STRING平台中绘制交集靶点蛋白互作网络（PPI）图,Cytoscape对PPI网络进行优化并筛选核心靶点。应用R语 言进行基因本体论（GO）富集和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,AutoDockTools进行分子对接。【结果】获得桂 枝茯苓丸85个活性成分及191个相应靶点,桂枝茯苓丸治疗PCOS、EMT的潜在靶点77个。桂枝茯苓丸治疗PCOS、EMT的 核心活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、常春藤皂苷元、黄芩素,核心靶点为AKT1、EGFR、IL-6、TNF、TP53。GO 功能分析获得2 020个生物过程、34个细胞成分、126个分子功能,KEGG富集分析得到165条信号通路。分子对接显示该方 中核心成分与靶点对接良好。【结论】桂枝茯苓丸可能通过槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、常春藤皂苷元、黄芩素,调节脂质 和动脉粥样硬化、AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力和动脉粥样硬化、化学致癌-受体激活等信号通路,作用于靶点 AKT1、EGFR、IL-6、TNF、TP53,从而“异病同治”PCOS和EMT。     

基于网络药理学与分子对接探讨二至丸“异病同治”治疗围绝经期综合征及异常子宫出血的作用机制

目的 通过网络药理学与分子对接技术探讨二至丸“异病同治”治疗围绝经综合征和异常子宫出血的作用机制。方法 利用TCMSP数据库获取二至丸的药物活性成分及作用靶点,通过Genecard数据库获取围绝经综合征和异常子宫出血疾病相关靶点;获取药物活性成分作用靶点与疾病相关靶点的交集靶点(共有靶点),即二至丸异病同治治疗围绝经期综合征及异常子宫出血的潜在作用靶点;利用Cytoscape 3.9.0构建药物-活性成分-靶点网络,并筛选出核心活性成分,运用STRING数据库构建共有靶点蛋白互作(protein-protein interaction, PPI)网络,筛选核心靶点;通过Metascape数据库对共有靶点进行GO及KEEG富集分析。利用AutoDock4.2.6对核心靶点及活性成分进行分子对接。结果 获得二至丸药物活性成分23种,二至丸异病同治围绝经综合征和异常子宫出血潜在作用靶点28个;槲皮素、木犀草素、山奈酚等被确定为关键活性成分,表皮生长因子受体(epithelial growth factor receptor, EGFR)、雌激素受体1(estrogen receptor 1,...     

高尿酸血症和非酒精性脂肪肝异病同治规律及分子机制预测

目的:探索高尿酸血症和非酒精性脂肪肝异病同治的规律及分子机制。方法:采用文本挖掘技术分析高尿酸血症和非酒精性脂肪肝中医证候分类及用药规律并进行可视化,提取两病共同的证候分类及其相应的中药配伍组合。检索中药配伍组合活性成分对应的人类靶蛋白和两病的相关基因;在分子网络分析平台分别构建靶蛋白和基因分子网络,通过网络映射分析,找到中药配伍组合治疗两病相关的通路和高连接分子。结果:痰瘀互结证是两病最常见的共同证型,方证对应,中药配伍组合(丹参、大黄、茯苓、泽泻、当归、白术)是治疗两病共用使用最多的药物;这些药物可能通过调控5个分子(26 S蛋白酶体,细胞外信号调节激酶1/2,核转录因子-κB,泛素C和蛋白激酶B)和1个生物学通路(肝X受体/维甲酸X受体激活通路)对两病发挥协同治疗效应。结论:高尿酸血症和非酒精性脂肪肝具有异病同治的生物学基础;文本挖掘和生物信息分子网络分析是探索疾病异病同治基础的有效方法。     

基于网络药理学探讨二陈汤异病同治机制

目的 应用网络药理学对二陈汤治疗高血压、糖尿病、慢性心衰、肺炎、高血脂、冠心病、肾炎、关节病、脑卒中、哮喘十种病的主要活性成分的作用靶点、信号通路等进行探索,从而揭示二陈汤异病同治的分子机制.方法 基于网络药理学,通过TCMSP,CooLGeN,Venny 2.1,DAVID,NCBI,STRING,Cytoscape...     

基于网络药理学和分子对接探讨杜仲-牛膝药对治疗强直性脊柱炎机制

目的 运用网络药理学和分子对接探讨杜仲-牛膝药对治疗强直性脊柱炎(AS)的关键靶点和分子机制。方法 利用TCMSP数据库检索杜仲-牛膝药对的活性成分,预测其对应靶点;利用GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD、PharmGkb数据库检索AS疾病相关靶点,利用Uniprot数据库将预测靶点和疾病靶点名称标准化后筛选出交集靶点,利用Cytoscape3.9.1绘制并分析中药-成分-靶点-疾病网络图。将共同靶点导入STRING数据库获得蛋白质互作网络并利用CytoNCA筛选出核心靶点。将共同靶点导入富集分析库(Metascape)数据库进行GO、KEGG富集分析。利用Auto Dock Tools1.5.7软件进行分子对接。结果 杜仲-牛膝有效活性成分35个,预测对应靶点150个,疾病相关靶点1914个,主要活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、汉黄芩素,核心靶点为白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素1β(IL-1β)、前列腺素内过氧化物合成酶2(PTGS2)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、C-X-C基序趋化因子配体8(CXCL8)。富集分析方面：...     

基于网络药理学与分子对接技术探究冬虫夏草治疗支气管哮喘和慢性肾衰竭“异病同治”作用机制

目的 以中医“异病同治”理论为依据,采用网络药理学与分子对接方法探究冬虫夏草对支气管哮喘和慢性肾衰竭的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及SwissTargetPrediction数据库检索获取冬虫夏草活性成分及潜在靶点,利用TTD、DrugBank、GeneCards等多数据库获取疾病靶点,将两者取交集获取共有靶点,通过STRING 11.5数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,使用Cytoscape 3.9.0构建冬虫夏草“成分-靶点-疾病”网络,利用Metascape平台工具对共有靶点进行富集分析,运用Autodock 4.2软件进行分子对接。结果 筛得疾病与药物共有靶点60个,核心靶点主要涉及蛋白激酶B1（Akt1）、非受体酪氨酸激酶肉瘤病毒蛋白（Src）、TP53、基质金属蛋白酶-9（MMP-9）、前列腺素G/H合酶2（PTGS2）等,潜在靶点主要富集在肾素-血管紧张素系统（RAS）,Rap1,磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）,丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）等多条信号通路中。结论 冬虫夏草中多种活性成分通过多靶点、多途径发挥抑制炎症反应、降低纤维化和细胞凋亡作用,初步揭示了冬虫夏草“异病同治”支气管哮喘与慢性肾衰竭的潜在靶点与现代生物学机制,为深入研究开展实验及临床应用提供参考。     

基于网络药理学探讨加味二至丸“异病同治”绝经综合症和原发性失眠的作用机制

目的 运用网络药理学研究方法探究加味二至丸“异病同治”绝经综合征和原发性失眠的作用机制。方法 通过TCMSP(traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)数据库获取女贞子、墨旱莲、淫羊藿的主要化学成分及其靶点,根据ADME筛选中药活性组分,通过GeneCards、OMIM、DisGeNET、DrugBank数据库分别获取绝经综合症和原发性失眠主要靶点,采用Cytoscape3.9.0软件构建“加味二至丸-成分-靶点-疾病”网络,利用STRING11.5平台进行蛋白质相互作用分析,构建PPI网络并筛选网络中得分较高基因探析。最后采用Metascape平台进行生物过程及通路分析。结果 加味二至丸调治绝经综合征和原发性失眠的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、熊果酸等,核心靶点有PTGS2、ESR1、NOS2、 ADRB2、 GABRA1等,加味二至丸调治绝经综合征和原发性失眠的生物学通路主要作用于AGE-RAGE信号通路、脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化、...     

基于网络药理学和分子对接探讨五仁丸治疗便秘作用机制研究

目的:运用网络药理学和分子对接方法探讨五仁丸治疗便秘的作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选五仁丸的有效成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank等数据库搜集便秘相关靶点;应用R语言获取化合物与疾病共同靶点,运用Cytoscape 3.8....     

基于网络药理学和分子对接技术探讨血府逐瘀汤“异病同治”治疗冠心病和缺血性脑卒中的作用机制

目的 通过网络药理学方法结合分子对接技术探讨血府逐瘀汤“异病同治”治疗冠心病和缺血性脑卒中的作用机制。方法 在TCMSP数据库检索并结合文献筛选血府逐瘀汤11味中药的活性成分和作用靶点,通过Uniprot数据库匹配靶点官方名称。从OMIM、DrugBank、DisGNET、TTD、GeneCards数据库获取冠心病和缺血性脑卒中相关疾病靶点,取交集靶点,构建“单味药—共有靶点—疾病”网络。建立蛋白间相互作用网络,利用Centiscape插件筛选关键靶点,利用MetaScape数据库进行GO功能分析和KEGG通路富集分析。通过AutoDockTools-1.5.6进行分子对接预测。结果 筛选后得到血府逐瘀汤活性成分192个,作用靶点394个;与冠心病和缺血性脑卒中相关且排序靠前的通路有脂质和动脉粥样硬化、缺氧诱导因子-1、松弛素、核因子-κB信号通路等,主要与脂质代谢、炎症反应、氧化应激、血管生成和细胞凋亡等生物学过程相关。本方中主要活性成分木犀草素、山柰酚、柚皮素与靶点蛋白蛋白激酶1、白蛋白、胰岛素结合较好。结论 基于网络药理学的方法发现血府逐瘀汤通过多靶点、多途径治疗冠心病和缺血性脑...     

基于网络药理学和分子对接法探讨乙字汤治疗痔病的作用机制

目的:应用网络药理学和分子对接法探究乙字汤治疗痔病的活性成分和作用机制.方法:利用Pubchem和TC-MSP数据库筛选乙字汤的有效活性成分并预测作用靶点,通过Genecards数据库获取痔病相关的疾病靶点,并用UniProt数据库标准化蛋白名称.取药物疾病共同靶点,以STRING平台进行蛋白互作(PPI),借助Cyt...     

"异病同治"探讨中医药治疗高血压病合并高尿酸血症的机制

从中医角度看,高尿酸血症与高血压病有相同的病因病机,均属本虚标实之证,是异病同治的基础.中医药治疗有明显优势,文章研究的自拟化湿降浊汤遵循辨病与辨证相结合,主要发挥化湿降浊、活血化瘀之功,兼能健脾、助阳,标本兼顾,结合现代药理佐证具有降尿酸协同降压的作用,值得进一步研究.基于"异病同治"探讨中医药治疗高血压病合并高尿酸...     

基于网络药理学和分子对接探究健脾渗湿方治疗高尿酸血症的作用机制

目的 运用网络药理学方法和和分子对接技术探讨健脾渗湿方 （Jianpi Shenshi Formula） 治疗高尿酸血症 （hyperuricemia,HUA） 的潜在作用机制。方法 通过 TCMSP、BATMAN 以及 TCM-ID 结合文献检索,筛选健 脾渗湿方的活性成分,再通过 SwissTargetPrediction 获取成分对应的靶点。使用 Cytoscape 3.8.0 软件构建“药 物-成分”网络,分析获取健脾渗湿方的主要活性成分。通过 GeneCards、OMIM 以及 disgenet 数据库获取高尿 酸血症的相关靶点。将健脾渗湿方和高尿酸血症的交集靶点导入 STRING 数据库中进行蛋白互作 （protein- protein interactions,PPI） 网络分析,通过 CytoHubba 插件筛选网络 hub 靶点;同时使用 R4.2.2 软件对交集靶点 进行 GO 功能及 KEGG 通路富集分析。运用 CB-DOCK 2 对 hub 靶点和主要成分进行分子对接。结果 共筛选 得到健脾渗湿方 90 个活性成分,其中槲皮素、山柰酚、木犀草素、豆甾醇、亚油酸乙酯等是主要活性成分, 成分对应的 837 个靶点中有 64 个靶点与疾病相关靶点相交,其中 CASP3、IL1B、IL6、PPARG、SIRT1、 MAPK3、TNF、STAT3、TGFβ1、PTGS2、XDH 等是 hub 靶点。潜在作用靶点主要富集在炎症、代谢、环境、 细胞过程、生物系统及疾病等相关信号通路。结论 健脾渗湿方可能通过槲皮素、山柰酚、木犀草素、豆甾 醇、亚油酸乙酯等多种活性成分,对高尿酸血症相关的疾病信号通路 （包括肿瘤、感染性疾病、代谢性疾病、 心血管疾病等）以及代谢、免疫、炎症等生物学通路进行调节,发挥抑制尿酸生成和/或增加尿酸排泄、抗炎 以及改善相关并发症的作用。     

基于网络药理学探讨枳术丸异病同治功能性便秘和功能性消化不良的作用机制

目的：以中医“异病同治”理论为依据,基于网络药理学探讨枳术丸治疗功能性便秘(functional constipation, FC)和功能性消化不良(functional dyspepsia, FD)的作用机制。方法：使用中药系统药理学数据库与分析平台获取并筛选枳术丸的活性成分及其作用靶点;使用GeneCards数据库获取FC和FD的疾病靶点;将枳术丸活性成分相关靶点与FC和FD疾病靶点导入微生信在线作图平台绘制韦恩图,得到交集靶点,即为枳术丸治疗FC和FD的潜在靶点;采用STRING数据库获取潜在靶点的蛋白质相互作用关系,并利用Cytoscape 3.7.2软件绘制蛋白相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络图。将潜在靶点导入Metascape数据库进行基因本体(gene ontology, GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析。结果：筛选得到枳术丸活性化学成分29个,相关靶点126个;FC和FD疾病靶点分别有1 299个和1 ...     

基于网络药理学和分子对接探究经典名方桃红四物汤异病同治作用机制

目的 以经典名方桃红四物汤养血、活血、逐瘀功效为核心,通过构建成分-靶点-通路-疾病作用网络探讨其临床异病同治的作用机制.方法 利用生物科学与网络药理学平台、蛋白数据库和String数据库收集桃红四物汤化学成分及其相关靶点数据,建立成分-靶点作用网络;基于筛选得到的靶点,对桃红四物汤治疗的疾病进行关联分析,建立...     

基于网络药理学探讨四妙丸治疗骨关节炎的作用机制

目的：采用网络平台药理学的研究方法,对四妙丸（SMW）用于治疗骨关节炎（OA）的药理作用以及机制问题进行了研究和探讨。方法：主要通过在TCMSP网络平台对四妙丸进行活性药物成分的筛选、在DrugBank数据库的基础上进行了靶标的预测,应用Cytoscape 3.7.1软件构建了化合物-靶点数据分析网络;在TTD及DisGenet进行数据库的检索,获取了疾病的靶点;通过构建韦恩图,取得了疾病与活性药物作用靶点的交集,得到了四妙丸治疗OA的作用靶点;并对四妙丸进行了GO功能注释功能通路注释和KEGG通路富集分析;构建了四妙丸中药-成分-靶点-信号通路网络。结果：分析研究显示共挖掘到了四妙丸中64种共同作用成分及163个潜在共同作用靶点,OA疾病989个成分及相关共同作用靶点,得到四妙丸-疾病共同靶点18个,共同信号作用的靶点主要富集于34个生物过程和26条信号通路上。结论：四妙丸中药可能主要是通过调节PTGS2、TNF、AR等共同靶点,调控IL-17信号通路、TNF信号通路、松弛素、破骨细胞分化、松弛素等方式来抑制机体炎性反应,进一步调节机体免疫功能来治疗骨关节炎。     

强直性脊柱炎与类风湿关节炎异病同治36例报告

近4年来,我科采用中西医结合四联疗法治疗强直性脊柱炎与类风湿关节炎36例,取得较好的疗效,现报告如下.     

基于网络药理学和分子对接技术探讨桂枝附子汤“异病同治”类风湿关节炎与冠心病的作用机制

目的 运用网络药理学的方法探讨桂枝附子汤“异病同治”类分湿关节炎(RA)与冠心病(CHD)的潜在作用机制。方法 通过TCMSP数据库筛选桂枝附子汤的主要活性成分和作用靶点,通过Genecards、TTD、OMIM、PharmGkb、DrugBank数据库数据库搜集RA和CHD的相关疾病靶点,将药物靶点与疾病靶点通过Uniprot校正后,取交集靶点,利用Cytoscape3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络,获取关键活性成分;通过STRING数据库构建交集靶点的蛋白相互作用网络,并利用Cytoscape3.9.1中的CytoNCA插件对交集靶点进行分析,筛选出核心靶点;运用R4.1.3软件进行GO功能富集和KEGG通路分析,比较关键靶点及KEGG通路富集基因,选取关键活性成分及核心靶点,应用AutoDock vina进行分子对接验证。结果 筛选出桂枝附子汤活性成分154个,主要成分包括槲皮素、柚皮素、山奈酚等;疾病交集靶点146个,核心靶点为AKT1、STAT3、MAPK1、MAPK3、TP53等;GO分析结果表明桂枝附子汤治疗RA与CHD主要涉及氧化应激反应、活性氧代谢过程、脂代...