脂联素基因SNP+45 T/G单核苷酸多态性与冠心病的相关性研究

目的:研究中国华南地区汉族人脂联素基因SNP+45T/G单核苷酸多态性与冠心病的相关性。方法:以153例冠脉造影证实为冠心病的非糖尿病患者为冠心病组,以73例健康者为对照组,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法分析脂联素基因SNP+45T/G单核苷酸多态性与冠心病的相关性,ELISA法测定血浆脂联素水平。结果:冠心病组T/G+G/G型频率、G等位基因频率均高于对照组(P0.05)。Logistic回归分析发现脂联素基因SNP+45 T/G+G/G型与冠心病正相关(OR:2.132,95.0%C I:1.034-4.397,P0.05),血浆脂联素水平与冠心病的发病呈负相关(OR:0.868,95.0%C I:0.785-0.959,P0.05)。结论:脂联素基因SNP+45 T/G+G/G型可能是华南地区汉族人冠心病的易感基因型。     

E-选择素基因第2外显子G98T单核苷酸多态性的调查

目的 :研究湖北地区汉族人群E 选择素 (E selectin)基因第 2外显子 98位点的单核苷酸多态性 (SNP) ,比较种族间单核苷酸的基因频率分布差异。方法 :应用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性(PCR RFLP)的分析方法 ,检测了 2 40名健康者E selectin第 2外显子 98位点单核苷酸的基因型。结果 :E selectin各基因型频率GG型91.3 % ,GT型 8.7% ;G ,T各等位基因频率分别为 95 .6% ,4.4% ,这种基因多态性分布在男女间均无显著性差异 (P >0 .0 5 )。与其它种族比较 ,发现不同种族间E selectin基因型分布及等位基因频率均存在显著差异 (P <0 .0 5 )。结论 :在湖北地区汉族人群中存在E se lectin基因第 2外显子 98位点的单核苷酸多态性 ,这种多态性在种族间可能存在着较大的差异     

症状性颈动脉狭窄患者C反应蛋白+1444C/T基因多态性分析

<70%比较,CC基因型发生>70%狭窄的风险增加(OR:2.958;95%CI:1.198～7.305;P=0.019).患者组hs-CRP浓度显著高于对照组,但不同狭窄数目、不同狭窄率比较,hs-CRP浓度差异无统计学意义.结论 CRP+1444C/T多态性是颈动脉>70%狭窄的遗传风险因子.CRP浓度升高与颈动脉狭窄发生有关,与狭窄数目、狭窄率无关.     

脂联素受体1基因-3881T/C多态位点与中国人糖代谢的关系

目的研究脂联素受体1(adiponectin receptor1,ADIPOR1)基因-3881T/C多态位点与中国人糖代谢及胰岛素抵抗的相关性。方法选取上海地区中国人糖耐量正常者370名,新诊断2型糖尿病患者294例,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态检测ADIPOR1基因-3881T/C变异,并测定所选人群的临床指标。结果(1)等位基因频率分布在2型糖尿病患者和正常糖耐量人群中差异无统计学意义(P=0.6749);(2)C等位基因在胰岛素抵抗的2型糖尿病亚组中频率较低(P=0.0121);(3)糖耐量正常人群中,C等位基因携带者空腹血糖较TT基因型者低(P=0.0140);(4)2型糖尿病患者中,C等位基因携带者舒张压(P=0.0466)及胰岛素抵抗指数HOMA-IR(P=0.0498)较TT基因型者低。结论ADIPOR1基因与中国人糖代谢及胰岛素抵抗相关。     

人BLCAP基因单核苷酸多态性与宫颈癌的相关性

人膀胱癌相关蛋白 (BLCAP)基因是本研究室从细胞原癌、抑癌基因分类芯片中筛选并克隆的宫颈癌候选抑癌基因。为检测该基因调控区的单核苷酸多态性 (SNP)及其不同基因型与宫颈癌的相关性 ,采用病例 对照研究方法及动态等位基因杂交 (DASH)技术 ,对 30例原发性宫颈癌患者和 6 0例正常人BLCAP基因调控区的 2个SNP位点进行了检测。结果显示 :位于BLCAP基因下游调控区的SNPrs3795 14 7位点存在AA、AC和CC 3种基因型 ,且与宫颈癌发病存在显著相关性 (P <0 0 1)。SNPrs3795 14 7处在BLCAP基因下游调控区域 ,其多态类型可能在某种程度上影响BLCAP基因的表达调控 ,从而进一步支持了 :BLCAP基因与宫颈癌的发生、发展可能存在密切关系。     

急性白血病儿童γ-谷氨酰水解酶基因452C/T单核苷酸多态性研究

目的 研究γ-谷氨酰水解酶( γ-glutamyl hydrolase,GGH)基因452C/T单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在急性白血病(acute leukemia,AL)患儿和正常儿童中的频率及分布特征.方法 应用逆转录-PCR-变性梯度凝胶电泳结合DNA直接测序技术,对92例AL患儿和124名正常儿童的cDNAs进行GGH基因第452位点SNP筛查.结果 AL组中GGH 452 TT、CT及CC基因型频率分别为2.2％、13.0％和84.8％;对照组中相应3种基因型频率分别为1.6％、l6.9％和81.5％;两组T等位基因频率分别为8.7％和10.1％;两组间的基因型频率及等位基因频率差异无统计学意义(P＞0.05),但中国儿童与日本、非裔-美洲及墨西哥人群的T等位基因频率差异均具有统计学意义(P＜0.05).结论 确定了中国汉族儿童GGH 452C/T的等位基因频率,并初步确认GGH 452C/T基因多态性存在种、族差异.     

汉族人群血管紧张素原基因的新单核苷酸多态性位点

应用改进的PCR－SSCP技术、多种聚丙烯酰胺凝胶电泳和PCR产物直接测序等方法，分析人的血管紧张素原（AGT）基因启动子区5远侧端的单核苷酸多态性（SNP）。在非变性胶上，发现不同样品的PCR产物（双链DNA分子）电泳迁移率不同；而在变性胶上，对应的单链DNA分子电泳迁移率相同；PCR产物直接测序的结果表明，在同一PCR扩增片段中同时存在两个SNPs位点（G－1074T，A－1179G）；通过476个不同样品的实验结果，进一步证实两个SNPs位点处于完全的连锁不平衡关系。GenBank同源性比较结果显示：A－1179G为中国汉族人群所特有。     

儿茶酚-O-甲基转移酶基因单核苷酸多态性位点与精神分裂症的关联研究

目的 探讨儿茶酚-O-甲基转移酶(catechol-O-methyl transferanse,COMT)基因8个单核苷酸多态性位点(single nRcleotide polymorphism,SNP)与粤东潮汕地区精神分裂症的关系.方法 应用聚合酶链式反应-聚丙烯酰胺凝胶芯片技术检测COMf基因的8个SNP位点(rs4680、rs4818、rsl65599、rs737865、rs2075507、rs6267、rs6269、rs4633)在粤东潮汕地区的279例精神分裂症患者和100名健康对照中的分布,并借助于plink软件对所得数据进行关联分析.结果 单个位点等位基因频率在两组间的分布差异无统计学意义;单倍型(G)-G-A-A[(rs4680)-rsl65599-rs2075507-rs6269]和单倍型A-A-C-(G)[rs2075507-rs6269-rs4633-(rs6267)]频率两组分布差异有统计学意义,精神分裂症组低于正常对照组,提示它们可能是精神分裂症的保护因素.结论 在中国粤东地区汉族人群中,COMT基因的8个SNP位点(rs4680、rs4818、rsl65599、rs737865、rs2075507、rs6267、rs6269、rs4633)与精神分裂症无关联性,其中的两个单倍型可能是精神分裂症的保护因素.但本研究不能排除COMT基因可能存在其他功能性变异位点与精神分裂症相关.

Abstract：

Objective To investigate the association between 8 polymorphisms in the catechol-O-methyl transferase gene (COMT) and schizophrenia in Yuedong-Chaoshan region of China. Methods Eight single nucleotide polymorphism (SNPs), namely rs4680, rs4818, rs165599, rs737865, rs2075507, rs6267,rs6269 and rs4633, in the COMT gene were genotyped in 279 schizophrenia patients and 100 healthy controls. Results There was no significant difference between any single SNP and schizophrenia.However, association might exist between haplotypes (G)-G-A-A [(rs4680) -rs165599-rs2075507-rs6269]and A-A-C-(G) [rs2075507-rs6269-rs4633-(rs6267)] and schizophrenia. Conclusion In the population of Yuedong region of China, the eight SNPs (rs4680, rs4818, rs165599, rs737865, rs2075507, rs6267,rs6269 and rs4633) in the COMT gene are unlikely to play a major role in the susceptibility to schizophrenia.There might be protective haplotypes in the COMT gene against schizophrenia.     

系统性红斑狼疮易感基因单核苷酸多态性研究进展

系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种复杂的多基因自身免疫性疾病,遗传因素重要而复杂.SLE的易感基因包括人类白细胞抗原(HLA)基因、免疫球蛋白Fc受体(FcR)基因、细胞毒性T细胞相关抗原4(CTLA-4)基因、免疫球蛋白受体同源体(FcRL)基因等.对易感基因单核...     

儿茶酚-O-甲基转移酶基因单核苷酸多态性位点与精神分裂症的关联研究

目的 探讨儿茶酚-O-甲基转移酶(catechol-O-methyl transferanse,COMT)基因8个单核苷酸多态性位点(single nRcleotide polymorphism,SNP)与粤东潮汕地区精神分裂症的关系.方法 应用聚合酶链式反应-聚丙烯酰胺凝胶芯片技术检测COMf基因的8个SNP位点(rs4680、rs4818、rsl65599、rs737865、rs2075507、rs6267、rs6269、rs4633)在粤东潮汕地区的279例精神分裂症患者和100名健康对照中的分布,并借助于plink软件对所得数据进行关联分析.结果 单个位点等位基因频率在两组间的分布差异无统计学意义;单倍型(G)-G-A-A[(rs4680)-rsl65599-rs2075507-rs6269]和单倍型A-A-C-(G)[rs2075507-rs6269-rs4633-(rs6267)]频率两组分布差异有统计学意义,精神分裂症组低于正常对照组,提示它们可能是精神分裂症的保护因素.结论 在中国粤东地区汉族人群中,COMT基因的8个SNP位点(rs4680、rs4818、rsl65599、rs737865、rs2075507、rs6267、rs6269、rs4633)与精神分裂症无关联性,其中的两个单倍型可能是精神分裂症的保护因素.但本研究不能排除COMT基因可能存在其他功能性变异位点与精神分裂症相关.     

等位基因3′末端碱基特异性引物定量PCR检测人脂联素基因单核苷酸多态性

目的建立非探针标记荧光定量PCR的SNP检测技术,分析人脂联素(APM1)基因单核苷酸多态性(SNP)与Ⅱ型糖尿病(T2DM)的关系。方法设计3′末端碱基特异性引物,进行定量PCR反应,通过比较各对引物的扩增效率判断基因型,并进行测序验证。利用该方法确定20例T2DM、24例肥胖及28例同年龄组正常人APM1基因的45位和276位碱基的SNP。结果该方法能有效地区分不同的基因型,与测序结果符合率100%。APM1基因45位SNP与T2DM相关(P<0.05),基因型为TT纯合子者发生T2DM的危险性是G/T和GG者的3倍;而肥胖与APM1基因45和276位点SNP无关。结论等位基因3′末端碱基特异性引物定量PCR可以用于基因SNP检测。APM1基因45位碱基的SNP与T2DM发生有关。     

儿茶酚-O-甲基转移酶基因单核苷酸多态性位点与精神分裂症的关联研究

目的 探讨儿茶酚-O-甲基转移酶(catechol-O-methyl transferanse,COMT)基因8个单核苷酸多态性位点(single nRcleotide polymorphism,SNP)与粤东潮汕地区精神分裂症的关系.方法 应用聚合酶链式反应-聚丙烯酰胺凝胶芯片技术检测COMf基因的8个SNP位点(rs4680、rs4818、rsl65599、rs737865、rs2075507、rs6267、rs6269、rs4633)在粤东潮汕地区的279例精神分裂症患者和100名健康对照中的分布,并借助于plink软件对所得数据进行关联分析.结果 单个位点等位基因频率在两组间的分布差异无统计学意义;单倍型(G)-G-A-A[(rs4680)-rsl65599-rs2075507-rs6269]和单倍型A-A-C-(G)[rs2075507-rs6269-rs4633-(rs6267)]频率两组分布差异有统计学意义,精神分裂症组低于正常对照组,提示它们可能是精神分裂症的保护因素.结论 在中国粤东地区汉族人群中,COMT基因的8个SNP位点(rs4680、rs4818、rsl65599、rs737865、rs2075507、rs6267、rs6269、rs4633)与精神分裂症无关联性,其中的两个单倍型可能是精神分裂症的保护因素.但本研究不能排除COMT基因可能存在其他功能性变异位点与精神分裂症相关.     

急性心肌梗塞患者C反应蛋白基因启动子T-757C多态性相关性研究

探讨中国苏皖地区汉族急性心肌梗塞患者C反应蛋白(CRP)基因启动子T-757C多态性。方法以160例AMI患者(AMI组)和182例非冠心病者(对照组)作为研究对象,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测CRP基因T-757C多态性。结果与对照组相比,AMI组的TC基因型频率明显增高(31.2%∶41.3%,P<0.05),TT和CC基因型以及T等位基因频率分布差异无统计学意义(P>0.05)。在调整冠心病相关危险因素并经多元logistic回归分析显示,CRP基因T-757C多态性TC基因型与AMI的发生仍呈显著性相关(OR=1.650,95%CI:1.031～2.640,P<0.05)。结论在中国苏皖地区汉族人群中,CRP基因启动子T-757C多态性与AMI的发病相关。     

ATM基因rs227060位点单核苷酸多态性与肺癌易感性的相关性

目的:探讨共济失调毛细血管扩张症突变基因(ataxia telangiectasia mutated,ATM)rs227060位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与肺癌易感性之间的相关性.方法:采用聚合酶链反应-SNP敏感性分子开关方法,检测225例肺癌患者和128例健康体检者ATM基因rs227060多态位点等位基因以及基因型频率分布特点;并应用非条件Logistic回归法统计分析rs227060单核苷酸多态性与肺癌的相关性.结果:rs227060多态位点共检测出CC,CT,TT三种基因型和C,T两种等位基因,其在肺癌组与对照组的基因型分布频率为:CC基因型17.3％与29.7％、CT基因型61,4％与59.3％、TT基因型21.3％与11％,两组间基因型频率和等位基因频率分布差异均有统计学意义(P＜0.05).在对ATM rs227060基因型的多态性分析过程中发现:吸烟史在肺癌组与对照组相比差异无统计学意义(P＞0.05),而年龄、性别、肿瘤家族史在肺癌组与对照组相比差异均有统计学意义(P＜0.05);且以CC基因型作为对照,携带TT基因型的个体患肺癌的风险是携带CT基因型个体的3.49倍(OR=1.829;95％CI:1.045～3.199).结论:ATM基因rs227060位点单核苷酸多态性与肺癌易感性存在相关性,且携带TT基因型可增加肺癌的发病风险.     

汉族人群脂联素基因-11377C/G多态性与子痫前期的相关性研究

目的探讨福建莆田地区汉族人群脂联素基因（APN）单核苷酸多态性（SNP）和子痫前期（pre-eclampsi-a）及其血脂水平的关联性。方法研究对象516例,包括对照组260例,子痫前期病例组256例。采用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）法鉴定APN基因启动子-11377C/G单核苷酸多态性并测定血脂水平。结果 APN基因启动子-11377C/G位点G等位基因频率和GG＋CG基因型频率在子痫前期病例组明显升高,差异有统计学意义（P〈0.05）。子痫前期病例组内GG＋CG基因型患者血清甘油三酯（TG）、血浆总胆固醇（TC）和低密度脂蛋白（LDL）值均高于CC基因型（P〈0.05）。结论 APN基因启动子-11377C/G位点GG＋CG基因型与子痫前期及其血浆TG、TC和LDL水平升高关联,C-G多态性提高了子痫前期合并血脂代谢紊乱的风险性。     

骨保护素基因单核苷酸多态性与类风湿关节炎发病的相关性研究

 目的：探讨骨保护素（OPG）基因163A/G及245T/G单核苷酸多态性（SNPs）与我国汉族人群类风湿关节炎（RA）发病的相关性。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术检测我国南方汉族正常人群及RA患者的OPG 163A/G 和245T/G 2个SNP位点;进行Hardy-Weinberg平衡检验;计算基因型和等位基因频率,及这2个位点的连锁关系,并分析这2个SNP位点与RA的关系。结果：所研究基因分布符合Hardy-Weinberg平衡,163A/G 位点基因型AA、AG、GG分布频率在2组比较有显著差异（P<0.05）;等位基因A、G分布比较在2组有显著差异（P<0.05）,携带163GG基因型者发生RA的危险性是非携带者的1.219倍（OR=1219, 95％CI：1066~2.339, P<0.05)。但245T/G位点各基因型及等位基因频率在2组中均未见差异（P>005）。结论：OPG 基因 163A/G SNP可能与我国汉族人群RA发病相关,携带G等位基因可能是发病的危险因素。     

MiRNA基因及miRNA相关基因单核苷酸多态性与肿瘤易感性

MircoRNAs（miRNAs）是一类进化上高度保守的重要的转录后调控因子,通过调节基因的表达而参与调控细胞死亡、增殖及分化等生理过程,同时与肿瘤等疾病的发生、发展密切相关。随着miRNAs基因以及靶基因结合位点的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）和miRNA相关基因SNP的生物预测和筛选技术的不断成熟,以及下一代测序技术在肿瘤基因组研究中的广泛应用,将发现大量新的miRNAs基因的SNP位点,这些miRNAs基因以及靶基因结合位点的SNP和miRNA相关基因的SNP与肿瘤等复杂疾病的易感及预后密切相关,通过检测miRNAs基因SNP或靶基因结合位点SNP或miRNA相关基因的SNP位点,即可进行肿瘤发病风险的判断和预后预测。     

原发性开角型青光眼患者Myocilin基因的单核苷酸多态性

目的　探讨 Myocilin(MYOC)基因的单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphisms,SNPs)及其与原发性开角型青光眼 (primary open- angle glaucoma,POAG)发病的关系。方法　应用高通量构象敏感性凝胶电泳和荧光标记自动测序法筛选和鉴定香港 15 7例 POAG散发患者和 15 5名对照 MYOC基因的 SNPs。结果　在 MYOC基因所有 3个外显子及邻近的非编码区共检出 17种 SNPs:1- 83G→ A、G12 R、P16 L、A17S、R4 6 X、R76 K、R91X、T12 3T、D2 0 8E、L 2 15 P、730 35 A→ G、A2 6 0 A、I2 88I、E30 0 K、T35 3I、Y4 71C和 15 15 73G→ C。其中 ,R91X、E30 0 K和 Y4 71C仅在 POAG患者中检测到。此外 ,15 15 73G→ C各基因型在 POAG患者与对照人群中的分布差异具有显著意义 ,POAG患者中 CG型频率为 0 .6 % ,低于对照组的 4 .5 % (P=0 .0 36 )。其余 16种 SNPs各基因型在两组人群中的分布差异均无显著意义。结论　 MYOC基因多态性可能与中国人 POAG发病有关 ,提示 MYOC基因是 POAG的相关基因。     

妊娠期糖尿病3个候选基因单核苷酸多态性的研究

目的了解孕妇中妊娠期糖尿病（GDM）候选基因肝细胞核因子基因HNF4AP2、肿瘤坏死因子TNFa基因、脂联素基因APM1的单核苷酸多态性（SNP）,为大规模筛查奠定基础。方法随机选择GDM患者,采用PCR及限制性内切酶技术判定基因型并进行Hardy—Weinberg遗传平衡定律检验。结果除HNF4AP2 111T／C位点等位基因频率为0放弃继续检测外,其他位点频率大于5％而且符合Hardy—Weinberg平衡。结论说明该人群具有良好的代表性,可在孕妇中检测以进一步明确与妊娠期糖尿病的关系。