基于网络药理学的三黄汤治疗湿疹作用机制研究

目的：基于网络药理学方法并结合体外THP-1巨噬细胞炎症模型预测三黄汤治疗湿疹的有效成分及可能作用机制。方法：采用中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）筛选三黄汤中的活性化学成分,通过GeneCard数据库查找化合物与湿疹共有靶点;采用Cytoscape软件构建“成分-靶点-疾病”网络,利用STRING数据库进行蛋白互作（PPI）网络分析,用DAVID数据库进行基因功能注释分析（GO）和信号通路富集分析（KEGG）,预测三黄汤治疗湿疹的作用机制。使用PMA联合脂多糖（LPS）刺激THP-1细胞,同时三黄汤干预,荧光定量（qRT-PCR）、酶联免疫吸附（Elisa）分别检测细胞炎症因子表达,蛋白质印迹法（Western blot）检测相关蛋白表达。结果：共筛选出42个活性化合物,74个共有靶点,分析出91条生物过程,包括细胞因子受体结合、受体配体活性、受体调节活性、转录因子活性调节序列特异性DNA结合、核受体的活动、辅因子结合等。密切相关的通路有AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路、人巨细胞病毒感染、C型凝集素受体信号通路、Th17细胞...     

基于网络药理学的肿节风治疗前列腺癌的作用机制探讨

目的 利用网络药理学方法探讨肿节风治疗前列腺癌的可能作用机制.方法 通过TCMSP、Uniprot、GeneCards在线数据库筛选肿节风活性化合物治疗前列腺癌的潜在靶点,利用Cytoscape软件构建前列腺癌-肿节风-靶点网络图,然后结合STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络;最后利用R软件...     

基于网络药理学研究汉黄芩素治疗糖尿病视网膜病变的机制

目的 基于网络药理学筛选汉黄芩素治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy, DR)的特征靶点和分子通路,并通过细胞实验对关键靶点进行初步验证,阐述汉黄芩素治疗DR的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP)筛选出汉黄芩素的作用靶点,利用比较毒理学数据库(Comparative Toxicogenomics Database, CTD)、人类基因功能和网络分析数据库(Human Gene Function and Network Analysis Database, GenCLiP)、DisGeNET和GeneCards数据库筛选出DR的相关作用靶点,利用STRING数据库及Cytoscape 3.6.1软件构建蛋白相互作用网络(Protein-Protein-Interaction-Network, PPI),利用注释可视化和集成发现数据库(Database for Annotat...     

基于网络药理学探讨连翘治疗呕吐作用机制

目的对连翘的药效物质基础和呕吐的致病靶点进行网络药理学分析,以探讨连翘镇吐止呕的作用机制。方法通过BANTMAN-TCM评分≥20,TCMSP平台以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18,并结合文献和中国药典对连翘有效成分进行收集;通过PubChem、SwissTarget Prediction数据库和ALOGPS2.1工具对连翘有效成分的靶点进行收集;通过TTD,DisGeNET和Drugbank数据库对呕吐靶点进行收集;通过STRING,IntAct和GeneMANIA数据库分析连翘治疗呕吐的靶点之间关系;通过DAVID6.8数据库进行GO分析和KEGG分析;通过Cytoscape3.2.1软件绘制"连翘-成分-靶点-通路"关系图并进行网络拓扑参数分析节点重要性。结果获得Bicuculline,Scopine,Gamma-Camphorene和kaempferol等19个连翘治疗呕吐成分;PTGS1,BCHE,HTR1A和CYP1A等20个连翘治疗呕吐重要靶点,且这些靶点中51.79%具有共同蛋白结构域、33.70%共表达、10.87%共定位、3.63%为预测靶点;对子网络"呕吐-GO生物学过程关系图",在GO分析中,生物学过程(BP)和分子功能(MF)不涉及呕吐基因KCNH2,但KCNH2存在于细胞组分(CC)的细胞膜上;在平均节点以上的GO生物学过程有10种:对药物的反应、氧化还原过程、腺苷酸环化酶抑制G蛋白偶联乙酰胆碱受体信号通路、磷脂酶C激活G蛋白偶联乙酰胆碱受体信号通路、G蛋白偶联乙酰胆碱受体信号通路、环氧酶P450途径、药物代谢过程、胆碱能突触传递、异生物质代谢过程、细胞增殖;对子网络"呕吐-KEGG通路关系图",有14条通路,在平均节点以上的通路有11条,分别是:神经活性配体-受体相互作用、肌动蛋白细胞骨架的调节、钙信号通路、胆碱能突触、化学致癌、药物代谢-细胞色素P450、cAMP信号通路、血清素能突触、细胞色素P450对异生物质的代谢、花生四烯酸代谢和亚油酸代谢。结论连翘治疗呕吐的生物学过程和通路非常广泛,钙信号通路和cAMP信号通路可能是连翘止吐作用的重要机制。     

基于网络药理学的青风藤治疗类风湿关节炎的作用机制研究

目的 应用网络药理学研究方法,探讨青风藤治疗类风湿关节炎(RA)的可能作用机制.方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选青风藤的化学成分,并依据TCMSP数据库的口服生物利用度(OB)和类药性指数(DL)筛选出主要有效活性成分.借助DRAR-CPI分子对接服务器得到有效活性成分的潜在作用靶点.通过Ge...     

基于网络药理学的四君子汤治疗胃炎的作用机制研究

目的通过网络药理学预测四君子汤治疗胃炎的主要活性成分和作用靶点,探讨其多成分-多靶点-多通路的潜在作用机制。方法通过中医药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库收集四君子汤及其中4味中药党参、白术、茯苓、甘草的化学成分,经口服吸收率(OB)、类药性(DL)、半衰期(HL)3个条件筛选得到药物的有效成分,通过SwissTargetPrediction数据库进行有效成分靶点预测;同时从TTD、Drugbank和DisGeNET数据库对胃炎的靶点进行检索及筛选;成分靶点与疾病靶点映射后使用Cytoscape 3.2.1软件构建药物有效成分-靶点蛋白相互作用网络,使用String数据库绘制靶点蛋白-靶点蛋白相互作用网络;对靶点蛋白利用DAVID数据库进行GO分析和KEGG分析,构建核心有效成分-核心靶点-代谢通路网络图。结果从四君子汤中筛选出68个化学成分,涉及治疗胃炎的10个靶点;GO分析结果表明其涉及单孢素代谢过程、杂环代谢过程、药物代谢过程、药物分解过程、类固醇代谢过程等9个生物过程,涉及氧结合、单加氧酶活性、氧化还原酶活性等10个分子功能,包括细胞器膜、内质网膜等6个细胞组成;KEGG分析结果表明其可能通过药物代谢-细胞色素P450、亚油酸代谢、细胞色素P 450对外源性物质代谢的影响、神经活性配体与受体的相互作用、化学致癌、类固醇激素生物合成、视黄醇代谢7个信号通路治疗胃炎。结论四君子汤通过多靶点、多通路治疗胃炎,为今后分子机制的研究奠定一定的基础。     

肉苁蓉治疗骨质疏松作用机制的网络药理学研究

目的:采用网络药理学方法研究肉苁蓉治疗骨质疏松的作用机制。方法:通过检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取肉苁蓉的活性成分,采用反向分子对接服务器DRAR-CPI及相关数据库GeneCards、OMIM筛选肉苁蓉活性成分治疗骨质疏松的作用靶标;采用软件Cytoscape构建肉苁蓉的"成分-靶标"网络,结合数据库String和Cytoscape绘制靶标间相互作用关系;通过服务器Systems Dock WebSite将靶标与活性成分进行分子对接评估二者间的结合活性以进行验证;最后再利用数据库DAVID对靶标基因进行基因本体分类富集分析与京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果:从肉苁蓉中筛选出的活性成分有13个,主要为毛蕊花糖苷、益母草碱、京尼平酸等;活性成分作用的潜在靶标有43个,主要有成骨分化特异性转录分子2(RUNX2)、血管内皮生长因子(VEGF)、白细胞介素6(IL-6)、骨生长蛋白因子(BGP)、肿瘤坏死因子(TNF)等;靶标作用涉及的信号通路有多条,主要为WNT(Wingless/Integrated)、VEGF、TNF等。结论:本研究初步探讨并验证了肉苁蓉治疗骨质疏松的主要靶标和通路,为后续进一步研究其作用机制奠定了基础。     

基于网络药理学的川芎作用机制研究

目的 探讨中药川芎的可能药理作用机制,为进一步开发作用靶点明确的药物提供依据.方法 利用中药系统药理学分析平台、Cytoscape 3.5.1软件、STRING数据库以及DAVID生物信息学资源数据库分别对川芎的有效化学成分以及靶标蛋白进行分析,并通过化合物及其靶标蛋白的关系构建可视化的网络进行拓扑学分析,进一步分析蛋...     

基于网络药理学的升麻治疗乳腺癌作用机制研究

目的 通过构建升麻Cimicifugae Rhizoma化学成分-靶点-代谢信号通路网络，探讨其治疗乳腺癌的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和PharmMapper获取升麻化学成分与作用靶点，将其与乳腺癌疾病靶点取交集得到升麻治疗乳腺癌的作用靶点，进一步利用靶点-成分反向筛选得到治疗乳腺癌的升麻潜在活性成分；通过GeneMANIA数据库获取间接靶标和“蛋白-靶点”互作网络，并通过蛋白-蛋白相互作用筛选关键靶标；采用Cytoscape构建“成分-靶点”网络图，使用分子对接将潜在活性成分和关键靶标配对，以证实前期靶标筛选和反向药效团匹配的可靠性；通过DAVID网站对作用靶点进行基因本体论（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析，利用R语言和在线绘图网站（omishare tools）将结果可视化。结果 获得升麻潜在活性成分共68个，与乳腺癌相关疾病靶点48个，关键靶点为ESR1、SRC和HRAS。GO功能富集分析得到生物过程（BP）条目484条，细胞组成（CC）条目7条，分子功能（MF）条目75条。KEGG通路富集筛选获得到21条信号通路。分子对接结果显示关键靶标与升麻潜在活性成分匹配性较好。结论 升麻主要通过作用于ESR1、SRC、HRAS等靶点，调节癌症通路、蛋白多糖通路和雌激素信号通路等起到治疗乳腺癌的作用。     

基于分子网络研究四逆散抗抑郁症作用的潜在生物学机制

目的 基于分子网络研究四逆散治疗抑郁症的潜在生物学机制。方法 借助于中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）数据库筛选四逆散的活性成分,筛选条件为口服利用率、药物相似性和血脑屏障透过率,并挖掘四逆散活性成分靶点和抑郁症的治疗靶点。利用韦恩图找到活性成分靶点和疾病靶点的交集靶点,对应相应成分定义为四逆散抗抑郁的有效成分。利用String在线数据库进行交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络的预测,并利用DAVID数据库进行交集靶点KEGG信号通路的富集分析。最后使用Cytoscape 3.6软件进行活性成分-靶点网络及有效成分-靶点-信号通路的构建和拓扑分析。结果 筛选出了四逆散107个有效成分和28个重要的抗抑郁症靶点。四逆散抗抑郁症的重要靶点显著富集于神经活性配体-受体相互作用、5-羟色胺能突触、多巴胺能突触、逆行内源性大麻素信号传导、钙信号通路等10个信号通路中。结论 本研究从分子网络的角度初步揭示了四逆散治疗抑郁症的潜在作用机制,其主要的生物学机制可能与以神经活性配体-受体相互作用为中心的信号通路有关。     

椒目的化学成分

目的对椒目(Zanthoxylum bungeanumMaxim.)质量分数为95%的乙醇提取物的化学成分进行研究。方法椒目用质量分数为95%的乙醇溶液回流提取,减压回收溶剂后,得浸膏加适量水混悬,依次用石油醚、氯仿、乙酸乙酯、正丁醇萃取,回收溶剂。所得各部分浸膏综合利用硅胶柱色谱S、ephadex LH 20凝胶柱色谱、薄层色谱、重结晶等各种方法进行分离纯化,根据化合物的理化性质和波谱数据分析进行结构鉴定。结果从椒目的乙酸乙酯萃取物中分离得到4个化合物,分别鉴定为:表儿茶素(Ⅰ)、槲皮素(Ⅱ)、24烯环阿尔廷酮(Ⅲ)、辛二酸(Ⅳ)。结论化合物Ⅰ~Ⅳ均为首次从该属植物中分离得到。     

不同产地花椒挥发油含量及组成成分比较研究

目的:比较研究不同产地花椒的挥发油含量和组成。方法:以水蒸气蒸馏法提取挥发油,挥发油测定器测定含量,采用气相色谱-质谱联用法(GC-MS)检测,运用自动质谱退卷积定性系统(AMDIS)结合Kováts保留指数对其化学成分进行分析。结果:6批花椒的挥发油含量在1.52~3.410mL.100g-1。6批挥发油样品共鉴定出68个化合物,其中5批样品含量最高的化合物为芳樟醇,其含量在24.28~42.10%;1批样品含量最高的化合物为乙酸芳樟酯,其含量为32.52%。结论:不同产地的花椒在挥发油含量及组成上均存在一定差异。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨黄芪甲苷抗抑郁的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术研究黄芪甲苷抗抑郁的潜在作用机制。方法 通过GEO、DrugBank、TTD、DisGeNet、GeneCards数据库获得抑郁症疾病靶点,检索PharmMapper和SwissTargetPrediction数据库获得黄芪甲苷的预测靶点。使用R软件Venn包获取黄芪甲苷与抑郁症的交集靶点基因,利用STRING网站与Cytoscape软件获得蛋白相互作用（PPI）网络,并通过R软件clusterprofile包对潜在作用靶点进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析;使用Autodock Vina 1.1.2软件进行分子对接。结果 黄芪甲苷治疗抑郁症的相关靶点共107个,主要为丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、表皮生长因子受体（EGFR）和胱天蛋白酶3(CASP3)。这些核心靶点作用于钙离子信号通路、MAPK信号通路、磷脂酰肌醇-3-羟激酶（PI3K）-蛋白激酶B(Akt)信号通路以及神经活性配体–受体相互作用信号通路等发挥抗抑郁作用,分子对接显示黄芪甲苷能与核心靶点均能较好的结合。结论 黄芪甲苷治疗抑郁症具有多靶点、多通路...     

RP-HPLC法同时测定花椒提取物中3种山椒素的含量

目的建立同时测定花椒提取物中羟基-α-山椒素、羟基-β-山椒素和羟基-γ-山椒素含量的RP-HPLC色谱法。方法采用PhenomenexSynergi C18色谱柱(250 mm×4.6 mm,4μm);流动相为乙腈(A)-水(B);流速为1.0 mL·min-1;梯度洗脱:0¹5 min,φ(乙腈)=40%15 min,φ(乙腈)=40%⁵0%,1550%,15²5 min,φ(乙腈)=50%25 min,φ(乙腈)=50%⁶0%;检测波长为270 nm;柱温为30℃。结果羟基-α-山椒素、羟基-β-山椒素和羟基-γ-山椒素分别在6.4860%;检测波长为270 nm;柱温为30℃。结果羟基-α-山椒素、羟基-β-山椒素和羟基-γ-山椒素分别在6.48⁵8.32、1.3158.32、1.31¹1.81和0.6111.81和0.61⁵.48 mg·L-1内线性关系良好。平均加样回收率分别为97.5%、97.4%和97.0%,RSD分别为1.5%、1.6%和1.4%(n=6)。该方法应用于花椒提取物的含量测定,测得3批自制花椒提取物中羟基-α-山椒素、羟基-β-山椒素和羟基-γ-山椒素的含量分别为41.2%5.48 mg·L-1内线性关系良好。平均加样回收率分别为97.5%、97.4%和97.0%,RSD分别为1.5%、1.6%和1.4%(n=6)。该方法应用于花椒提取物的含量测定,测得3批自制花椒提取物中羟基-α-山椒素、羟基-β-山椒素和羟基-γ-山椒素的含量分别为41.2%⁴6.9%、8.17%46.9%、8.17%⁹.28%和4.47%9.28%和4.47%⁵.11%。结论该方法可为花椒提取物的质量控制提供参考依据。     

基于rDNA ITS序列SNP位点的特异性聚合酶链反应引物鉴别青椒和花椒

目的设计专用于花椒与青椒鉴别的特异性聚合酶链反应(PCR)引物,建立花椒与青椒的分子鉴别方法。方法本研究提取花椒与青椒样品的DNA,并利用rDNA ITS(核糖体DNA内部转录间隔区)序列通用型引物分别对样品进行PCR扩增,PCR产物经双向测序、比对,寻找单核苷酸多态性(SNP)特异性位点,并分别针对花椒与青椒的SNP位点设计出花椒与青椒的特异性PCR引物,用于花椒与青椒的特异性PCR引物鉴别。结果所设计的特异性引物为花椒和青椒的鉴别提供了分子鉴定的依据,可以快速、准确地检测出花椒和青椒。结论本文所设计的特异性PCR引物能有效地鉴别出花椒与青椒,该方法具有准确、高效、灵敏、简便等特点,具有较好的市场应用前景。     

基于网络药理学探讨栀子豉汤治疗抑郁、焦虑和失眠的作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨栀子豉汤治疗抑郁、焦虑和失眠的作用机制.方法 筛选栀子豉汤活性成分;通过PharmMapper和CTD获取成分对应的靶点;将成分靶点与TTD、OMIM、DrugBank、CTD、Gene-Cards、DisGeNET数据库中获取的抑郁、焦虑和失眠疾病靶点分别取交集,将交集靶点分别导入Stri...     

便携式近红外光谱仪云端智能快速检测花椒饮片

目的采用国产的便携式近红外光谱仪及配套的光谱建模系统,针对3个不同产地的药典花椒品种开发定性识别模型并进行验证。方法使用了62个不同产地的花椒样品作为建模集,14个盲样作为验证集,对花椒颗粒进行直接漫反射采样,每个样本采样6次,每次采样取不同的位置取平均作为建模用光谱数据,采用LDA定性识别算法开发花椒产地识别模型。结果模型交叉验证准确率95%以上,盲样验证准确率达到100%。结论对国产便携式近红外光谱仪和配套的光谱建模系统进行了验证,实验效果良好,可以准确识别不同产地的花椒颗粒,在中药材快检领域具备巨大的应用前景。     

花椒愈痔栓的制备及其质量控制

目的制备花椒愈痔栓,并建立其质量控制方法。方法以花椒为主味药材,辅以煅石膏及冰片,以36型混合脂肪酸甘油酯及羊毛脂为基质,热熔法制备花椒愈痔栓。依据《中华人民共和国药典》附录栓剂项下的有关规定,对其性状外观、质量差异、融变时限进行检查,以HPLC法测定栓剂中羟基-α-山椒素、羟基-β-山椒素和羟基-γ-山椒素的含量,并对栓剂中的煅石膏进行化学鉴别,对冰片进行薄层色谱鉴别。结果制得的栓剂外观呈黄褐色子弹形,质量差异及融变时限符合规定,羟基-α-山椒素、羟基-β-山椒素和羟基-γ-山椒素分别在3.248～35.73、1.880～20.68和0.336～3.696 mg·L~(-1)内线性关系良好,平均加样回收率分别为97.0%、97.8%和97.2%,RSD分别为1.6%、1.5%和1.7%.结论所制备的花椒愈痔栓可为花椒在医药领域的开发及成药性评价提供参考。     

基于网络药理学探讨祛痹痛风饮治疗痛风的作用机制

目的 运用网络药理学方法探讨祛痹痛风饮治疗痛风的活性成分、作用靶点及其潜在的治疗作用机制.方法 基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取祛痹痛风饮的活性成分和作用靶点,结合Uniprot数据库对靶点进行标准化处理.采用Cytoscape 3.7.2软件绘制出祛痹痛风饮的活性成分–痛风靶点网络.通过GeneC...     

基于网络药理学探讨藤黄健骨胶囊治疗骨性关节炎的作用机制研究

目的 采用网络药理学研究藤黄健骨胶囊治疗骨性关节炎的有效活性成分及主要作用机制.方法 采用TCMSP、Uniport、DrugBank数据库检索藤黄健骨胶囊的主要化学成分及作用靶点;基于DisGeNET、DrugBank、OMIM及Genecards数据库获取骨性关节炎的相关靶点;将藤黄健骨胶囊与骨性关节炎的靶点取交集...