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相似文献
 共查询到18条相似文献,搜索用时 187 毫秒
1.
目的:建立卵巢癌患者血清差异表达多肽谱,并探讨其潜在诊断价值?方法:应用磁珠富集多肽结合基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)检测方法,筛选上皮性卵巢癌组和健康对照组差异表达多肽峰,利用ClinProTools软件比较两组血清多肽表达差异并建立差异表达多肽谱及早期诊断模型?结果:在卵巢癌组血清中,m/z 2 662.02?2 653.68?5 859.21?5 901.69?5 937.06表达显著上调;m/z 1 857.82?2 074.28?2 856.33表达显著下调?差异表达图谱建立的诊断模型预测早期卵巢癌的准确率达到81.8%(9/11),利用9例宫颈癌血清验证均为阴性,特异性达100%(0/9)?结论:磁珠富集-质谱结合ClinProTools生物信息学分析技术,有望成为新的人卵巢癌辅助诊断技术?  相似文献   

2.
目的本实验应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)寻找RA患者血清中与疾病相关的差异性表达多肽,尝试建立RA的多肽鉴别诊断模型。方法以25名RA患者作为实验组,以24名健康志愿者作为健康对照组。应用弱阳离子交换磁珠分离纯化血清样本,MALDI-TOF-MS获取样本生物学信息,建立分类预测模型。结果成功检测并鉴别出了一系列的差异性多肽,建立了具有高的预测能力和交叉验证能力诊断预测模型。盲法验证该分类模型显示,对RA组的诊断敏感性达80%,对正常对照组的诊断特异性达93.3%。结论运用蛋白质组学技术从一个整体的角度进行疾病研究,为更好地理解RA的发病机制和改进RA的诊断方法进行了初步的探索。  相似文献   

3.
大肠癌唾液蛋白指纹图谱分子诊断模型研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:研究建立大肠癌(colorectal cancer,CRC))唾液蛋白质指纹图谱新型分子诊断模型。方法采集34例肠癌患者、45例健康志愿者(正常组)的唾液标本,用弱阳离子交换型(WCX)纳米磁珠联合基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF MS)技术进行检测,获得各标本的蛋白指纹图谱。用Biomarker Wizard软件分析所获得的蛋白指纹图谱找出差异蛋白,再用Biomarker Patterns 5.0.2建立鉴别诊断模型。结果共检测到312个肠癌差异蛋白质峰,两组比值大于3(肠癌/正常对照>3,或者正常对照/肠癌>3),其中有37个差异蛋白质峰有统计学意义(P<0.05);其中有7个差异蛋白质峰肠癌组表达上调,28个差异蛋白质峰肠癌组表达下调,有35个差异蛋白质峰有显著差异(P<0.01)。筛选建立了由m/z为2501.26、4779.95、3140.39的3个差异蛋白峰组成的肠癌与正常组的诊断模型,该模型的灵敏度和特异度分别为88%(30/34)和98%(44/45);通过交叉验证法进一步验证诊断模型的可靠性,结果该模型的灵敏度和特异度分别为85%(29/34)和88%(37/45)。结论用WCX结合MALDI-TOF-MS技术建立的唾液蛋白诊断模型为肠癌的诊断提供了新途径。  相似文献   

4.
  目的  探讨健康人群唾液微生态组成与其促甲状腺激素(TSH)水平之间的关系。  方法  将纳入的健康人群根据TSH水平分为TSH高组(n=22,TSH 3.00~4.20 mIU/L)和TSH低组(n=24,TSH 0.60~1.80 mIU/L),通过临床和实验室检查对相关的临床和生化指标进行测量分析,并分别对两类人群的唾液样本进行16S rDNA测序和生物信息学分析。  结果  TSH高组和TSH低组的相关临床和生化指标差异并无统计学意义(P>0.05),TSH水平较高的个体的唾液微生物组具有较高的丰度和物种多样性。偏最小二乘判别分析(PLS-DA)显示TSH高组和TSH低组的唾液微生态组β多样性的差异(Adonis,P=0.0460)。Wilcoxon秩和检验和LEFSe分析发现梭杆菌属的丰度在TSH高组和TSH低组间的差异有统计学意义。  结论  健康人群中高TSH和低TSH水平受试者存在不同的唾液微生态组成,其中梭杆菌属在TSH高组和TSH低组中差异最为显著。  相似文献   

5.
  目的  本研究旨在利用高通量测序技术分析长链非编码RNA(lncRNA)在大鼠自体静脉桥中的时间差异性表达,筛选出与静脉桥失效具有显著相关性的lncRNA。  方法  根据不同采样时间点将12只雄性SD大鼠随机分为4组 (分别为0 d、术后7 d、术后14 d、术后28 d组,每组3只)。其中以0 d组为对照组,其余3组为实验组(实验组大鼠制备颈外静脉-颈动脉旁路模型)。对静脉移植物样本进行高通量测序,并利用实时定量PCR(RT-qPCR)进行样本验证。通过识别在不同时间点差异表达的lncRNA及基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,对lncRNA-mRNA对进行功能预测,筛选出在静脉移植物管腔再狭窄过程中可能发挥潜在作用的lncRNA,并用RT-qPCR进行样本验证。  结果  高通量测序共获得了 2 572个静脉移植术后持续差异表达的lncRNA,同对照组(0 d)相比,分别在术后7、14、28 d差异表达程度前十位的lncRNA在文中列出。基于GO富集分析及KEGG通路分析结果,我们制定了以下筛选标准筛选出可能在冠脉动脉旁路移植术后移植物失效过程中发挥潜在关键作用的lncRNA-mRNA:①参与上述生物学过程或信号通路;② lncRNA可调节靶向mRNA转录;③既往已有报道靶向mRNA在血管病变过程中发挥作用;④lncRNA和mRNA均有显著性差异表达。最终筛选出包括MRAK083052-Nrp1在内的15对在静脉移植物管腔再狭窄过程中可能发挥潜在作用的lncRNA-mRNA。RT-qPCR结果与高通量测序结果一致。  结论  本研究发现大鼠静脉桥管腔再狭窄过程中lncRNA的表达变化情况与时间具有相关性。筛选并验证了15对在静脉移植物管腔再狭窄过程中可能发挥重要作用的lncRNA-mRNA。  相似文献   

6.
  目的  miRNA可作为预测糖尿病发生和发展的生物标志物,探索miR-1181在2型糖尿病(Type 2 Diabetes Mellitus,T2DM)患者的表达情况。  方法  运用Agilent miRNA芯片对T2DM患者(n = 5)和正常对照组(n = 5)血浆样本进行差异筛选,荧光定量PCR技术(quantitative Real Time PCR,qRT-PCR)验证出差异表达的miRNA;通过生物信息学方法预测其靶基因并绘制miRNA-靶基因-代谢通路关系网络图,扩大样本检测血浆中差异表达的miRNA:miR-1181和靶基因MAP2K2、MAPK12表达水平。  结果  miRNA芯片筛选和qRT-PCR验证出与T2DM相关的差异表达miRNA:miR-1181,生物信息学分析得出miR-1181靶基因有CCND1、PI3KR2、MAP2K2和MAPK12;T2DM患者血浆中 miR-1181的表达水平明显下降(P < 0.001),而靶基因MAPK12 mRNA的表达水平明显升高(P < 0.01)。  结论  2型糖尿病患者血浆miR-1181水平降低,可能与其抑制靶基因MAPK12对MAPK通路影响有关。  相似文献   

7.
  目的   本研究旨在通过挖掘宫颈癌TCGA数据库,分析N6-甲基腺嘌呤(N6-methyladenosine, m6A)修饰相关长链非编码RNA(lncRNA)与宫颈癌预后不良及免疫治疗的相关性,从而有效地评估宫颈癌患者的预后和宫颈癌免疫治疗的可行性。   方法   基于TCGA数据库宫颈癌样本,利用生物信息学的方法鉴定与宫颈癌预后相关的m6A修饰相关lncRNA,并以此构建宫颈癌的预后风险模型。   结果   从304例患者样本中筛选出343个m6A修饰相关lncRNA,通过单因素Cox回归分析得到26个m6A修饰相关lncRNA与宫颈癌患者预后相关,并利用Lasso回归分析得到7个m6A修饰相关lncRNA(DLEU1、AC099850.4、DDN-AS1、EP300-AS1、AC131159.1、AL441992.2、AL021707.6)用以构建预后风险模型。Kaplan-Meier曲线显示低风险组的OS高于高风险组(P<0.001);ROC曲线下面积(AUC)表明本风险模型准确性高、可信度强;多因素Cox分析显示风险评分是评估宫颈癌患者预后的独立因素。TIDE评分预测高风险组接受免疫治疗后获益更大。免疫检查点PD1与DDN-AS1等m6A修饰相关lncRNA表达相关,且在高风险组中表达更高(P<0.05)。   结论   基于上述7个m6A修饰相关lncRNA构建的预后风险模型能够有效预测宫颈癌患者的预后,并能评估以PD1为靶点的免疫治疗疗效。  相似文献   

8.
  目的  探讨牙周炎对口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma, OSCC)发展的作用,明确牙周炎微生物是否诱导M2巨噬细胞极化并促进肿瘤进展。  方法  通过收集有无牙周炎的OSCC患者肿瘤组织,免疫组化验证M2巨噬细胞变化趋势;将连续3 d用含四联抗生素饮用水处理后的小鼠,每隔1 d涂牙周炎患者唾液集合菌5次,颊黏膜注射小鼠口腔鳞状细胞癌细胞(SCC7)建立伴牙周炎OSCC小鼠模型,观察牙周炎对OSCC发展的影响,分析肿瘤组织M2巨噬细胞含量,检测小鼠唾液菌群结构、脾脏和结肠组织的病理变化;最后,将收集的来自牙周炎患者的唾液,与小鼠外周血单个核细胞(PBMC)和SCC7细胞共同培养,流式细胞术检测M2巨噬细胞含量。  结果  临床样本的免疫组化结果显示,伴牙周炎OSCC患者(27.01%±2.12%)比不伴牙周炎OSCC患者(17.00%±3.66%)肿瘤组织中M2极化巨噬细胞增多(P<0.05)。伴牙周炎OSCC小鼠(PO组)肿瘤体积更大,生存率更低,Ki67阳性细胞表达率(35.49%±5.00%)高于OSCC组(O组)(23.89%±4.13%)(P<0.05);流式细胞术结果表明,PO组小鼠肿瘤组织中M2巨噬细胞含量(24.97%±4.41%)高于O组(5.75%±0.52%)(P<0.05),同时qPCR结果显示M2巨噬细胞相关因子Arg1、IL-10、CD206的表达总体呈现上升趋势;免疫组化结果表明PO组小鼠肿瘤组织中M2巨噬细胞阳性表达(21.82%±4.16%)相对O组(9.64%±0.60%)增加(P<0.05);PO组小鼠口腔菌群结构改变,条带增多,多样性增加,脾脏组织白髓减少,红髓分界不明,出血严重,结肠组织腺体形态异常,隐窝结构破坏较严重。细胞实验结果表明,PBMC与SCC7细胞共培时,牙周炎微生物的存在增加了M2巨噬细胞极化(71.00%±0.66%)。  结论  牙周炎促进了OSCC的发展,诱导肿瘤相关巨噬细胞向M2极化,牙周炎症治疗对OSCC患者具有重要价值。  相似文献   

9.
  目的  对喙尾琵甲干燥虫体的挥发性化学成分进行分析。  方法  采用顶空固相微萃取方法,结合气质联用技术对其中挥发性成分进行分析和鉴定,通过峰面积归一化法测定各成分的相对含量。  结果  经质谱扫描结合标准谱库检索对比,共鉴定出其中40个成分,占总峰面积的92.80%。其中烃类16种,占总含量的35.73%,以直链和支链烷烃为主;脂肪酸类8种,占总含量的35.87%,以短链脂肪酸为主;此外,还含有胺类、醇类、酯类、醛类、酚类、酮类、醚类等成分。含量在5%以上的组分有十三烷(21.47%)、3-甲基丁酸(16.88%)、2-甲基丁酸(7.67%)、三甲胺(6.59%)和乙酸(5.47%)。  结论  喙尾琵甲干燥虫体中的挥发性成分以烃类和短链脂肪酸类化合物为主,这些成分具有多种生理活性,为药用昆虫资源的进一步开发利用提供参考。  相似文献   

10.
目的:分析乳腺癌与健康人血清蛋白质谱差异,筛选特异性蛋白标志物,建立乳腺癌诊断预测模型,评价其诊断价值。方法将58例乳腺癌和57例健康女性的血清,随机分为建模组和验证组,应用弱阳离子纳米磁珠(MB-WCX)结合基质辅助激光解吸离子飞行质谱(MALDI-TOF-MS)技术建立血清蛋白质谱,选择遗传算法建立乳腺癌诊断预测模型,利用诊断模型对验证组进行盲筛验证。结果通过蛋白质谱,筛选出29个显著差异蛋白质峰(P<0.05)。其中乳腺癌中表达上调2个,表达下调27个,利用其中8个差异峰(质荷比分别为698.3、797.37、1449.56、1466.65、1520.74、1584.55、2379.26、2739.69)建立诊断模型,获得了96.55%(28/29)的敏感性和96.42%(27/28)的特异性,经独立样本双盲验证,得到灵敏度为93.10%(27/29),特异度为96.55%(28/29)。结论应用弱阳离子纳米磁珠联合MALDI-TOF-MS技术可筛选出血清蛋白质谱中的差异蛋白质,据此建立的诊断模型具有较高的敏感性和特异性,对于乳腺癌的辅助诊断有一定的临床意义。  相似文献   

11.
目的探讨帕金森病(Parkinson’s disease,PD)患者血清蛋白质生物标志物。方法选择原发性PD患者和正常人血清为样本,用弱阳离子交换(weak cationic exchange,WCX)磁珠捕获血清蛋白质组分,用基质辅助的激光解析离子化飞行时间质谱仪(matrix assisted laser desorption/ionization time of flight masss pectrometer,MALDI-TOF-MS)检测各捕获组分的蛋白质质谱,用统计学方法分析原发性PD患者和健康人的蛋白质谱,筛选差异分子,用LC-MALDI-TOF/TOF鉴定差异分子,用酶联免疫吸附法(ELISA)测定差异表达分子含量。结果在相对分子质量1000~50000范围内共检测到107个蛋白峰,其中9个蛋白质的表达发生显著变化(P<0.01)。一个相对分子质量为2260.1的蛋白质在PD血清中显著升高,是血清富组氨酸糖蛋白(histidine-rich glycoprotein,HRG)的C端降解产物。ELISA方法测定结果显示PD患者血清HRG含量低于正常人(P<0.05)。结论 PD患者血清低相对分子质量蛋白质的表达与正常人差异有统计学意义。HRG在PD患者血清中的含量低于正常人,而其C端降解片段在PD患者血清中的表达显著高于正常人。  相似文献   

12.
  目的  检验双重任务训练对帕金森患者运动功能的影响。  方法  56名帕金森患者随机分为实验组和对照组。每组患者接受为期2周,每周5次,每次60 min的训练,并比较2组患者训练前后的运动和认知功能。  结果  尽管2组患者完成10 m步行和起立行走计时(TUG)测试的时间变化值无显著差异(P > 0.05),但仅有实验组在双重任务状态下改善显著(P < 0.05)。对于简易平衡评定系统测试和特定活动平衡信心量表,仅有实验组呈现出显著的时间效应。  结论  双重任务训练对帕金森患者步行速度和平衡功能具有改善趋势。未来的研究应该探索改善帕金森病患者运动功能的最佳训练方案,以及将获得的能力转移到其他新的双重任务场景的问题。  相似文献   

13.
  目的  肺泡Ⅱ型细胞表面抗原-6(KL-6)主要表达于Ⅱ型肺泡上皮及支气管上皮细胞, 在肺部感染、间质性肺疾病中表达升高,本研究拟探讨KL-6在类风湿关节炎相关性间质性肺疾病中的表达。  方法  收集2018年1月—2020年12月在宁夏医科大学总医院风湿免疫科住院的初次诊断且未经治疗的类风湿关节炎(RA)患者68例,其中经胸部CT证实未合并肺间质病变的单纯RA患者35例,合并肺间质病变的RA(RA-ILD)患者33例,同时期健康体检者30名,分别留取3组研究对象血清及部分单纯RA组和RA-ILD组患者关节腔积液,采用EILSA法检测KL-6的表达水平。分析单纯RA组和RA-ILD组患者性别、年龄及病程等临床特征;分析单纯RA组中合并慢性阻塞性肺疾病(COPD)和未合并COPD患者血清KL-6的表达水平。  结果  单纯RA组和RA-ILD组患者性别、年龄差异无统计学意义,RA-ILD组患者病程明显长于单纯RA组[(163.50±88.07)月vs. (94.42±50.14)月,P<0.05];单纯RA组中,有6例患者合并COPD,与同组未合并COPD患者比较,血清KL-6水平差异无统计学意义;RA-ILD组患者血清KL-6表达水平[(100.96±14.29)U/mL]明显高于单纯RA组患者[(30.33±5.30)U/mL]及正常对照组[(26.67±2.78)U/mL],单纯RA组血清KL-6水平与正常对照组差异无统计学意义。单纯RA患者关节腔积液KL-6水平明显低于RA-ILD患者,差异有统计学意义(P<0.05)。  结论  KL-6在RA-ILD患者中表达增高,是反映RA-ILD患者肺间质病变严重程度的有效指标。   相似文献   

14.
  目的  探讨冠心病急性心肌梗死患者外周循环血单核细胞中差异基因表达及功能。  方法  收集2020年9月至2021 年9月在昆明市第一人民医院接受冠脉造影的患者,提取外周血单核细胞总RNA,使用DNBSEQ平台进行第2代高通量测序。检测并筛选差异表达基因,进行KEGG及GO富集分析。  结果  冠心病急性心肌梗死组与冠脉正常组对比,其中差异基因89个,上调基因67个,下调基因22个;其中差异lncRNA14个,差异mRNA72个,差异circRNA3个。完成KEGG pathway富集分析、KEGG disease富集分析、KEGG molecular富集分析。完成GO cell composition富集分析、GO cell function富集分析、GO biological process molecular富集分析。  结论  筛选出显著差异的10个mRNA、6个lncRNA、2个circRNA。富集分析中涉及感染、转录失调、PI3K-Akt信号通路、脂类合成、吞噬泡腔、细胞外基质、脂多糖结合等,与冠状动脉粥样硬化的发生与发展及急性血栓事件的发生可能相关。  相似文献   

15.
目的 研究慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)患者肺功能指标与高分辨率计算机断层扫描(high resolution computed tomography,HRCT)下测量的支气管壁厚度的相关性.方法 将80例慢阻肺患者根据新版的COPD全球倡议分级...  相似文献   

16.
  目的  观察类风湿性关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者牙周状况及唾液微生物的多样性,分析RA患者口腔微生物菌群构成特点与类风湿性关节炎发病的相关性。  方法  选取确诊RA患者24例和正常对照20例,记录牙周临床指标〔牙周探诊深度(probing depth,PD),探诊出血(bleeding on probing,BOP),临床附着丧失(clinical attachment loss,CAL)〕,同时收集非刺激性唾液,提取唾液DNA后进行高通量测序,并进行数据分析。  结果  RA组牙周临床指标中PD和BOP略高于健康对照组,但PD(P=0.65),BOP(P=0.27)和CAL(P=0.508)三个指标差异均无统计学意义。RA患者和健康对照组唾液微生物α多样性差异无统计学意义。在门水平上,共发现13个门,其中厚壁菌门Firmicutes(30.2%)、变形菌门Proteobacteria(29.3%)、拟杆菌门Bacteroidetes(23.8%)、梭杆菌门Fusobacteria(7.3%)、放线菌门Actinobacteria(5.6%)为优势菌门,RA组拟杆菌门Bacteroidetes (P=0.04)和螺旋体门Spirochaetes(P=0.01)的含量高于健康对照组。在属水平上共发现144个菌属,优势菌属共12个,RA组及健康对照组在属水平上共发现11个菌属差异有统计学意义,RA组普雷沃菌属Prevotella (P=0.03)、卟啉单胞菌属Porphyromonas (P=0.005 7)、密螺旋体属Treponema (P=0.001 9)及坦纳菌属Tannerella(P=0.010)含量高于健康对照组。RA组组内微生物群落相似度高于健康对照组。  结论  与健康人群相比,RA患者的牙周临床指标中PD和BOP略高于健康对照组,但差异无统计学意义。与健康人群相比,RA患者口腔唾液具有独特微生物多样性结构,两者间口腔微生物菌群结构有所区别。  相似文献   

17.
  目的  调查慢性阻塞性肺疾病(COPD)急性加重患者出院后1年内再入院状况,并分析其影响因素。  方法  选取上海市第十人民医院2019年2月—2020年8月收治的COPD急性加重期患者208例为研究对象,对患者出院后1年内进行随访,调查其是否再入院,并根据患者是否再入院分为再入院组(82例)和非再入院组(126例),采用logistic回归分析研究影响患者再入院的相关因素。  结果  患者出院后1年内再入院共82例(39.42%),其中再入院次数为1次者共58例(27.88%),再入院次数≥2次者共24例(11.54%)。2组在年龄、吸烟指数、高血压、冠心病、中低强度日均活动时间、前1年内急性加重次数、家庭氧疗、规律服药、第一秒用力呼吸容积占预计值百分比(FEV1%Pred)、家庭照顾能力等方面比较差异有统计学意义(均P<0.05)。多因素logistic回归分析显示中低强度日均活动时间(<2 h)、FEV1%Pred<50%、前1年内急性加重次数≥2次、家庭照顾能力下降是影响COPD急性加重患者再入院的独立危险因素。1年内1次再入院组与≥2次再入院组患者在年龄、中低强度日均活动时间、前1年内急性加重次数、FEV1%Pred、家庭照顾能力指标等方面比较差异有统计学意义(均P<0.05)。  结论  COPD急性加重患者出院后1年内再入院率较高,中低强度日均活动时间、FEV1%Pred、前1年内急性加重次数、家庭照顾能力是患者再入院的影响因素。   相似文献   

18.
  目的  分析基于疾病诊断相关分组(DRGs)的云南某医院慢性阻塞性肺疾病(COPD)患者重复入院的影响因素。  方法  整群抽取2017年1月至2019年12月仅在云南某三甲医院发生再入院的COPD患者以及同时间段内就诊于同一医院并且未发生任何医疗机构再入院的COPD患者进行分析。  结果  重返组COPD患者平均年龄、居住地为昆明市区、离医院距离0~10 km的比例、平均相对权重RW和平均住院天数均高于非重返组(P < 0.01),而非重返组COPD患者农民或无业、使用呼吸机的比例、病程在1 a以下的比例均明显高于重返组(P < 0.01);多元线性回归分析结果表明,年龄越大、居住地为市区、病程越长、病情越重和平均住院天数越长的COPD患者重返入院的可能性越大(P < 0.01)。  结论  可利用分级诊疗等措施对于年龄越大、居住于昆明市区、病程较长、根据DRGs数据平台相关反馈患者权重高、有呼吸机治疗、特定DRG分组、住院平均时间长进行分级,难度较高较危重的患者该三甲医院可制定有针对性的治疗措施及临床路径,而对于情况较好的患者可在距离较近的社区医院进行普通治疗,从而降低COPD患者的重复入院次数,合理减轻患者的经济负担,提高患者的生活质量。  相似文献   

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