寻常性银屑病患者白介素20基因多态性研究

目的:选取位于1q32区域的白介素(IL)-20基因,通过检测基因序列研究基因多态性与银屑病的相关性.方法:提取银屑病患者(203例)和正常人(91名)基因组DNA并进行扩增,通过自动测序的方法测定IL-20基因及启动子区域的序列,检测其单核苷酸多态性(SNP)位点,并以SPSS软件进行统计学处理.结果:①IL-20启动子SNP位点-1723 C>G多态性的G等位基因频率,在以上呼吸道感染为发病诱因或加重因素的寻常性银屑病患者组和正常对照组间的频率分别为45.8%和32.4%,两组间差异有统计学意义(X2=5.539,P=0.019).结论:位于IL-20基因启动子区的SNP位点-1723C>G可能与以上呼吸道感染为发病诱因或加重因素的寻常性银屑病相关.     

Toll样受体9基因多态性与尖锐湿疣的研究

目的探讨Toll样受体9的单核苷酸多态性与尖锐湿疣(CA)发病的相关性.方法抽取63例CA患者和23例正常人对照组的外周静脉血,采用TLR9基因直接测序的方法分析TLR9受体的单核苷酸多态性.结果 TLR9基因自翻译起始点第1 174、1635、1269、1724位均存在单核苷酸多态性位点,分别称为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4,其中SNP3、SNP4为新发现位点,SNP1、SNP2为NCBI数据库中公布的位点,登录号分别为rs352139、rs352140.CA患者与正常人对照组的SNP1位点的等位基因A的频率分别为0.690、0.609,等位基因G的频率0.309、0.391,两组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).SNP2位点的等位基因A的频率分别为0.302、0.369,等位基因G的频率0.698、0.630,两组间比较差异无统计学意义(P>0.05).SNP1、SNP2两个多态性位点存在4种单倍体型,分别为AA、AG、GA、GG.每种单倍体型在CA患者组和正常人对照组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).结论 TLR9基因在广东汉族人群中存在4个单核苷酸多态性位点,分别为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4.SNP1、SNP2两位点与CA的发病易感性可能无相关性.     

Toll样受体9基因多态性与尖锐湿疣的研究

目的探讨Toll样受体9的单核苷酸多态性与尖锐湿疣(CA)发病的相关性.方法抽取63例CA患者和23例正常人对照组的外周静脉血,采用TLR9基因直接测序的方法分析TLR9受体的单核苷酸多态性.结果 TLR9基因自翻译起始点第1 174、1635、1269、1724位均存在单核苷酸多态性位点,分别称为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4,其中SNP3、SNP4为新发现位点,SNP1、SNP2为NCBI数据库中公布的位点,登录号分别为rs352139、rs352140.CA患者与正常人对照组的SNP1位点的等位基因A的频率分别为0.690、0.609,等位基因G的频率0.309、0.391,两组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).SNP2位点的等位基因A的频率分别为0.302、0.369,等位基因G的频率0.698、0.630,两组间比较差异无统计学意义(P>0.05).SNP1、SNP2两个多态性位点存在4种单倍体型,分别为AA、AG、GA、GG.每种单倍体型在CA患者组和正常人对照组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).结论 TLR9基因在广东汉族人群中存在4个单核苷酸多态性位点,分别为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4.SNP1、SNP2两位点与CA的发病易感性可能无相关性.     

Toll样受体9基因多态性与尖锐湿疣的研究

目的探讨Toll样受体9的单核苷酸多态性与尖锐湿疣(CA)发病的相关性.方法抽取63例CA患者和23例正常人对照组的外周静脉血,采用TLR9基因直接测序的方法分析TLR9受体的单核苷酸多态性.结果 TLR9基因自翻译起始点第1 174、1635、1269、1724位均存在单核苷酸多态性位点,分别称为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4,其中SNP3、SNP4为新发现位点,SNP1、SNP2为NCBI数据库中公布的位点,登录号分别为rs352139、rs352140.CA患者与正常人对照组的SNP1位点的等位基因A的频率分别为0.690、0.609,等位基因G的频率0.309、0.391,两组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).SNP2位点的等位基因A的频率分别为0.302、0.369,等位基因G的频率0.698、0.630,两组间比较差异无统计学意义(P>0.05).SNP1、SNP2两个多态性位点存在4种单倍体型,分别为AA、AG、GA、GG.每种单倍体型在CA患者组和正常人对照组间比较差异均无统计学意义(P>0.05).结论 TLR9基因在广东汉族人群中存在4个单核苷酸多态性位点,分别为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4.SNP1、SNP2两位点与CA的发病易感性可能无相关性.     

CTLA-4基因启动子区域多态性与寻常型银屑病的相关性

目的: 探讨CTLA-4基因启动子区-1722位点(T/C)多态性和-1661位点(A/G)多态性与中国汉族人群寻常型银屑病的相关性.方法: 采用聚合酶链反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)方法,对87例寻常型银屑病和116例中国汉族正常对照者进行CILA-4基因-1722位点和-1661位点多态性检测.结果: 与正常对照组比较,银屑病患者CTLA-4基因-1661位点A/G+G/G基因型频率显著升高(P=0.003);G等位基因基因型频率显著升高(P=0.002);G等位基因携带者也是明显高于对照组(P=0.003).结论: CTLA-4基因启动子区-1661位点G等位基因与中国汉族寻常型银屑病显著相关.     

Toll样受体9基因多态性与尖锐湿疣的研究

目的 探讨Toll样受体9的单核苷酸多态性与尖锐湿疣（CA）发病的相关性。方法 抽取63例CA患者和23例正常人对照组的外周静脉血,采用TLR9基因直接测序的方法分析TLR9受体的单核苷酸多态性。结果 TLR9基因自翻译起始点第1174、1635、1269、1724位均存在单核苷酸多态性位点,分别称为SNP1、SNP2、SNP3和SNP4,其中SNP3、SNP4为新发现位点,SNP1、SNP2为NCBI数据库中公布的位点,登录号分别为rs352139、rs352140。CA患者与正常人对照组的SNP1位点的等位基因A的频率分别为0.690、0.609,等位基因G的频率0.309、0.391,两组间比较差异均无统计学意义（P ＞ 0.05）。SNP2位点的等位基因A的频率分别为0.302、0.369,等位基因G的频率0.698、0.630,两组间比较差异无统计学意义（P ＞ 0.05）。SNP1、SNP2两个多态性位点存在4种单倍体型,分别为AA、AG、GA、GG。每种单倍体型在CA患者组和正常人对照组间比较差异均无统计学意义（P ＞ 0.05）。结论 TLR9基因在广东汉族人群中存在4个单核苷酸多态性位点,分别为SNP1、SNP2、SNP3、SNP4。SNP1、SNP2两位点与CA的发病易感性可能无相关性。     

特应性皮炎患者IgE受体FcεRIα基因多态性研究

目的 探讨FcεRIα基因序列研究基因多态性与特应性皮炎的相关性.方法 提取特应性皮炎患者(97例)和正常人(283例)基因组DNA并进行扩增,通过高温连接酶检测法(PCR-LDR)测定FcεRIα基因远端启动子的序列,检测其SNP位点,并用SPSS软件进行统计处理.结果 ①FcεRIα基因启动子区rs61828219位点存在G＞T多态性,rs12135235位点为TT纯合子,rs36233780位点为AA纯合子.②特应性皮炎患者组和正常人对照组间的rs61828219位点基因突变频率分别为1.04%和2.17%,两组间差异无统计学意义(P＞0.05).结论 汉族人FcεRIα基因rs61828219位点存在G＞T基因多态性,与特应性皮炎相关性不显著,s12135235位点和rs36233780位点不存在多态性.     

寻常性银屑病患者肿瘤坏死因子α基因启动子多态性的检测

有研究表明,肿瘤坏死因子-α(TNF-α)与银屑病关系密切^[1],TNF-α基因极可能是银屑病的一个重要候选基因。在TNF-α基因启动子区域内存在着多态性位点,尤以-238、-308位点的G→A碱基变化较为多见,通常将该位点为G时定义为TNF1,为A时定义为TNF2^[2]。我们采用聚合酶链反应(PCR),结合直接测序法,检测寻常性银屑病患者TNF-α基因启动子区域的多态性位点,探讨其在银屑病发病中的作用。     

维生素D受体基因CDX2多态性与阿达木单抗治疗中重度斑块型银屑病疗效相关性研究

目的探讨维生素D受体(VDR)基因位点多态性与阿达木单抗治疗斑块型银屑病疗效的关联性,以期对生物制剂治疗银屑病效果进行预测。方法采用中高通量单核苷酸多态性(SNP)分型技术,对达到和未达到银屑病面积与严重程度指数改善75%(PASI75)的2组患者VDR基因CDX2(rs11568820)位点多态性进行检测,比较2组CDX2基因型和等位基因分布频率差异。结果有效组和无效组VDR基因CDX2位点的基因型和等位基因的分布频率相比差异均无统计学意义(P0.05)。结论 VDR基因CDX2位点多态性与阿达木单抗治疗中重度斑块型银屑病疗效无相关性。     

汉族寻常性银屑病患者IFN-γ受体2基因多态性研究

目的 探讨IFN-γ受体2(IFN-γR2)基因氨基酸位点Gln64Arg多态性与中国汉族寻常性银屑病的相关性.方法 采用PCR-限制性片段长度多态性(RFLP)方法及DNA测序方法,检测苏皖地区182例汉族寻常性银屑病患者和114例正常人对照IFN-γR2基因Gln64Arg位点多态性.结果 寻常性银屑病患者与正常人对照组IFN-γR2基因Gln64Arg多态性位点各基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义(P>0.05).伴甲损害银屑病组与无甲损害银屑病组之间Gln64/Gln64基因型分布频率分别为57.5%和38.1%.差异有统计学意义(X~3=5.33,P=0.02);Arg4等位基因(Gin64等位基因)分布频率分别为19.3%(80.7%)和30%(70%),差异也有统计学意义(X~2=5.03,P=0.02).伴甲损害的银屑病患者组Gln64/Arg64基因型分布频率为29.8%,正常人对照组为49.1%,两组间分布差异有统计学意义(X~2=5.48,P=0.01);Gln64/Gln64基因型分布频率在两组间分别为57.5%和35.1%,差异有统计学意义(X~2=6.23,P=0.01);无甲损害组与正常人对照组之间差异则无统计学意义.在以上呼吸道感染为诱因或加重因素的银屑病组与非上呼吸道感染银屑病组之间Arg64/Arg64基凶型分布频率分别为33.3%和15.5%,差异有统计学意义(X~2=4.94,P=0.03);Arg64等位基因(Gin64等位基因)分布频率为51.9%(48.1%)和35.2%(64.8%),差异也有统计学意义(X~2=5.46,P=0.02).结论 IFN-γR2基因Gln64Arg多态性位点可能与寻常性银屑病患者是否伴有甲损害有关,也可能与以上呼吸道感染为诱因或加重因素的寻常性银屑病有关.     

SPRR2E基因编码区单核苷酸多态性与银屑病

目的通过测定32个中国汉族人寻常性银屑病家系共157人SPRR2E基因的外显子编码区序列,研究SPRR2E基因与银屑病发病的关系。方法提取基因组DNA,对32个银屑病家系DNA进行扩增,产物经377DNA测序电泳仪电泳,用自动测序的方法测定SPRR2E基因的外显子编码区序列,并以ETDT及GENEHUNTER软件进行统计处理。结果SPRR2E基因编码区第156核苷酸( 156bp)处存在A或G二态性,可表现为AA纯合、GG纯合和AG杂合三种基因型,虽然该SNP不改变蛋白质编码,但它与银屑病存在传递不平衡,等位基因A优先传递给患病子代(P<0.05)。结论SPRR2E基因的外显子编码区中的一个核苷酸多态性与中国汉族人寻常性银屑病的发病相关联。     

新疆汉族SPRR2E基因单核苷酸多态性与寻常性银屑病的关系

目的通过测定中国新疆汉族非家系寻常性银屑病SPRR2E基因的外显子编码区序列,研究SPRR2E基因与新疆汉族银屑病发病的关系。方法从新疆汉族正常人和寻常性银屑病患者的外周血中提取基因组DNA,用自动测序的方法测定SPRR2E基因的外显子编码区序列,对结果进行统计学分析处理。结果SPRR2E基因编码区第156核苷酸(+156bp)处存在A或G二态性,可表现为AA纯合、GG纯合和AG杂合三种基因型,病例组AA基因型频率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论SPRR2E基因外显子编码区序列的第156核苷酸多态性与新疆汉族非家系寻常性银屑病的发病有关。     

眼皮肤白化病1家系致病基因鉴定

【摘要】 目的 利用全外显子测序及Sanger测序技术对两兄弟眼皮肤白化病患者的（OCA）家系进行致病基因筛选和鉴定。方法 收集1个OCA家系的临床资料，提取家系成员的外周血DNA，通过全外显子组测序技术对先证者的全外显子编码区进行直接测序以寻找可能存在的基因突变，并利用Sanger测序进行一代验证。结果 先证者及其弟弟均表现为全身皮肤、毛发变白，双眼球震颤，畏光，虹膜半透明，结膜充血，双眼屈光不正。先证者父母、祖父母、外祖父母及子女表型均正常，父母非近亲结婚。两兄弟OCA2基因中均出现3个杂合变异，即c.1290T>A无义突变、c.1363A>G错义突变和c.1204T>C错义突变。其中，OCA2 c.1204T>C尚未有报道，为OCA2基因的新突变位点。此外，先证者父亲OCA2基因存在杂合变异c.1204T>C；先证者母亲OCA2基因存在杂合变异c.1290T>A及c.1363A>G；先证者儿子OCA2基因存在杂合变异c.1290T>A；先证者女儿OCA2基因存在杂合变异c.1204T>C，先证者弟弟的女儿OCA2基因存在杂合变异c.1290T>A。结论 本研究中2例OCA2患者均出现3处OCA2基因突变，其中c.1290T>A无义突变可能是导致该家系临床表型的突变位点，这些发现丰富了OCA2的致病基因突变谱。     

Psoriasis vulgaris in Chinese individuals is associated with PSORS1C3 and CDSN genes

BACKGROUND: Besides the HLA-Cw*0602 allele, the psoriasis susceptibility 1 candidate 3 (PSORS1C3) and corneodesmosin (CDSN) genes are two probable psoriasis susceptibility genes in the PSORS1 locus. The -79C, -26C and +246A alleles of the PSORS1C3 gene, the CDSN*971T allele, CDSN*TTC (619T-1236T-1243C) and CDSN*5 (619T-1240G-1243C) are strongly associated with psoriasis in the caucasian population. Until now, no haplotype study of the PSORS1C3 and CDSN genes has been documented in Chinese patients with psoriasis vulgaris. OBJECTIVES: We aimed to determine whether genetic polymorphisms of the PSORS1C3 and CDSN genes were associated with an increased risk of psoriasis vulgaris in Chinese patients in Taiwan. METHODS: We investigated the PSORS1C3 and CDSN genes for disease association by direct sequencing in 178 patients with psoriasis vulgaris and 203 control subjects. Genotyping for HLA-Cw*0602, alpha-helix coiled-coil rod homologue (HCR) gene and single nucleotide polymorphism (SNP) n.9 was also carried out using a sequence-based typing method. RESULTS: The PSORS1C3*582A allele, an SNP in the 3'-untranslated region of the PSORS1C3 gene, was a major psoriasis vulgaris susceptibility allele in the Chinese population, and the association was much stronger in patients with early-onset psoriasis vulgaris (22.3% vs. 6.9%, odds ratio = 3.87, P(c) =0.0000072). The frequencies of CDSN*TTC and CDSN*971T were also significantly increased in patients with early-onset psoriasis vulgaris. Moreover, PSORS1C3*582A, SNP n.9*C, Cw*0602 and HCR*WWCC were in near complete linkage disequilibrium (LD) with each other; in contrast, the LD with the CDSN gene was not so strong. SNP n.9*C-Cw*0602-PSORS1C3*582A-HCR*WWCC was a major susceptibility haplotype in patients with early-onset psoriasis vulgaris (P < 10(-7)) and this risk haplotype also carried CDSN*TTC and CDSN*971T. CONCLUSIONS: The PSORS1C3 and CDSN genes are important psoriasis susceptibility genes in Chinese patients with psoriasis vulgaris.     

兰州地区汉族寻常性、脓疱性银屑病与HLA-DRB1*0701的相关性

目的探讨兰州地区汉族寻常性、脓疱性银屑病与HLA-DRB1*0701等位基因的相关性。方法采用聚合酶链反应-序列特异引物(PCR-SSP)法检测42例寻常性银屑病、28例脓疱性银屑病和50例健康对照者HLA-DRB1*0701等位基因频率,并相互比较。结果寻常性银屑病患者组及脓疱性银屑病患者组HLA-DRB1*0701等位基因频率分别(54.8%,46.4%)与正常对照组(22.0%)比较差异均有显著性(P<0.05)。结论HLA-DRB1*0701等位基因可能是兰州地区汉族寻常性、脓疱性银屑病的遗传标志。     

寻常型银屑病与HLA-C第73位密码子相关性的研究

目的 探讨寻常型银屑病与人类白细胞抗原（HLA）复合体C基因座位第73位氨基酸密码子的相关性。方法 采用聚合酶链反应－变性聚丙烯酰胺凝胶电泳－DNA银染、测序，检测了104例寻常型银屑病患者和110例健康对照者的HLA－C基因第73位氨基酸密码子。结果 寻常型银屑病患者编码HLA－C抗原第73位的丙氨酸序列、苏氨酸序列的频率与健康对照组差异有显著性， 在有、无家族史 的寻常型银屑病患者中差异亦有显著性。结论 HLA－C第73位密度子与建党型银屑病发病存在相关性；HLA－C的第73位丙氨酸序列可能是该病的易感因素，而第73位苏氨酸序列似科是该病的保护性因素。     

基于靶基因捕获测序法对海南省汉族寻常型银屑病与维生素D受体基因关系的研究

目的:探讨维生素D受体（VDR）基因多态性与寻常型银屑病的关系。方法:2018年3月至2020年2月在海南医学院第二附属医院皮肤性病科和体检中心分别收集101例海南籍汉族寻常型银屑病患者与79例海南籍健康对照。采用靶基因捕获测序法对VDR基因及其上、下游各2 kb进行全长测序,对于最小等位基因频率大于1%的单核苷酸多态...     

新疆维吾尔族HCR基因多态性与寻常性银屑病的相关性研究

目的 检测新疆维吾尔族寻常性银屑病(PsV)患者外周血DNA中HCR基因第16外显子的1911位点多态性,探讨其与银屑病发病的相关性。方法 从128例患者及健康对照组132例的抗凝血中提取DNA,用PCR-限制性片段长度多态性法及PCR产物直接测序法鉴定基因类型,对结果进行统计学分析处理。结果 HCR基因第16外显子的1911位点核苷酸存在G、A二态性,可表现为GG纯合、AA纯合、GA杂合三种基因型。基因型和等位基因频率经卡方检验两组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。其中Ⅰ型、Ⅱ型寻常性银屑病患者与对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05),男女寻常性银屑病患者与对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 HCR基因第16外显子1911位点的多态性与新疆维吾尔族非家系寻常性银屑病在基因型和等位基因频率方面未发现相关性。