一起诺如病毒引起的急性胃肠炎RT-PCR检测

目的对急性胃肠炎疫情标本进行疑似诺如病毒核酸RT-PCR检测,以确诊其致病原。方法从34例病人粪便中提取RNA,用引物JV13i、JV12y进行诺如病毒核酸RT-PCR扩增,再对其扩增产物进行琼脂糖凝胶检测;同时采用ELISA法检测粪便中的诺如病毒抗原,并用基因序列分析进行检测结果验证。结果34份标本中有26份诺如病毒核酸RT-PCR检测阳性,阳性率为76.5%,经基因序列分析,也证实为诺如病毒;而ELISA只检测到9份标本为阳性,阳性率为26.5%。结论RT-PCR和ELISA的阳性结果均证实该起疫情为诺如病毒感染所致。RT-PCR法比ELISA法灵敏度高,特异性强,且成本较低,但是操作较为繁琐。     

北京市某些医院内腹泻暴发与诺如病毒的相关性研究

目的确定2006年11-12月北京市某些医院内发生的住院患者腹泻爆发性流行的病原及其分子生物学特点。方法首先检测腹泻标本中轮状病毒抗原并用聚丙烯酰胺凝胶电泳进行轮状病毒核酸检测,然后用逆转录-聚合酶链反应进行诺如病毒核酸检测,对检测阳性标本进行诺如病毒VP1全基因的扩增;并对其中一例进行全基因克隆、测序和分析。另外对来自不同医院的2份阳性标本中的VP1的5′端部分序列进行测序分析。结果30份腹泻患者粪便标本中共有17份检测为诺如病毒阳性,总阳性率为56.7%,每一家医院送检标本的阳性率都在42.9%以上。对其中一份标本的诺如病毒VP1全基因序列测定和分析显示为GⅡ-4型诺如病毒。另2份标本中的部分序列测定显示与全基因序列高度保守,只有1个核苷酸的差异,因此也提示为GⅡ-4型诺如病毒。结论诺如病毒是北京地区医院内腹泻暴发的重要病原,此次暴发极可能是由GⅡ-4型诺如病毒引起。     

黄山市2018年两起暴发疫情诺如病毒分子分型与基因特征分析

目的了解黄山市暴发疫情诺如病毒分子分型与基因特征。方法收集黄山市2018年两起暴发疫情中具有胃肠炎症状患者的肛拭子标本37份,采用实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)对采集的标本进行诺如病毒核酸检测,检出的阳性标本,采用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增病毒衣壳区和聚合酶区,并对PCR产物进行基因测序及分子分型鉴定,测序结果使用Mega 6.0软件构建进化树进行遗传进化分析。结果 37份标本中,16份标本诺如病毒核酸阳性,其中11份测序成功,BLAST比对结果显示11条序列均为诺如病毒GII.P16-GII.2基因型。两起疫情中检出的诺如病毒序列与福建泉州、江苏泰州、南京和安徽宿州的毒株序列同源性较高。结论 GII.P16-GII.2基因型诺如病毒是引起黄山市黟县两起急性胃肠炎暴发疫情的主要病原体。     

医院内诺如病毒感染的三种病原学检测方法应用比较

目的找到一种简便易行的检测感染性腹泻粪便标本中诺如病毒的方法。方法用两种酶免疫吸附试剂盒检测北京地区婴幼儿腹泻和综合医院内成人感染性腹泻粪便标本中的诺如病毒,并用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)作对照,评价这两种试剂盒。用两种试剂盒分别检测69份儿科病房标本和来自3家综合医院15份成人医院内感染性腹泻的粪便标本中诺如病毒;其中5份儿科病房和15份成人病房的粪便标本还同时进行了RT-PCR检测。结果84份粪便标本中,试剂盒甲的诺如病毒检出率为20.2%(17/84),试剂盒乙的诺如病毒检出率为36.9%(31/84);两种试剂盒的符合率为73.8%(62/84),但试剂盒乙的检出率显著高于试剂盒甲(P<0.01)。在应用了RT-PCR检测的20份标本中,阳性率为55.0%(11/20)。试剂盒甲与RT-PCR检测结果相比,检出率明显低于RT-PCR(P<0.05),试剂盒乙与RT-PCR检测结果相比,检出率差异无统计学意义(P>0.05)。3家综合医院的成人标本中,每家医院都有2份或2份以上送检标本诺如病毒检测阳性,结合临床诊断可判定为诺如病毒医院内感染暴发。结论酶免疫吸附方法检测诺如病毒感染简便易行、利于推广,试剂盒乙可以替代RT-PCR方法应用于临床。3家综合医院都存在诺如病毒医院内感染的暴发。     

某巡逻船聚集性诺如病毒疫情的病原基因特征分析

【目的】对浙江省岱山县2022年2月一起罕见的重组型诺如病毒暴发疫情进行病原学鉴定及基因分子特征分析。【方法】采用荧光定量聚合酶链反应（PCR）法对送检的8份肛拭样本进行诺如病毒病原学鉴定,用普通逆转录PCR(RT-PCR)对阳性样本基因扩增,用MEGA7.0及Simplot软件对扩增序列进行基因特征分析。【结果】送检的8份标本鉴定结果均为诺如病毒GⅠ型,基因特征分析为重组诺如病毒GⅠ.6[P11]亚型,重组位点位于ORF1-ORF2连接处。同源性最高（98.75%）的是2018年登录的GⅠ.6[P11]毒株序列（登录号：MT357995）。【结论】经病原学鉴定与基因特征分析,本次暴发疫情是由罕见重组型诺如病毒GⅠ.6[P11]亚型引起。     

GⅠ.P11-GⅠ.6型诺如病毒分子特征分析

目的 分析引起北京市丰台区某小学1起胃肠炎疫情的诺如病毒分型特征，为诺如病毒防控提供参考依据。方法 2021年10月在北京市丰台区某小学发生1起胃肠炎疫情，留取粪便标本做便常规检测和便隐血检测，并在便标本中提取核酸，使用荧光定量PCR技术进行诺如病毒核酸检测，采用一步法逆转录PCR扩增特异性核酸片段分析诺如病毒亚型。结果 共14例胃肠炎病例，14份粪便标本便常规结果正常，7份便隐血结果阳性，阳性率为50.0%。13份标本检测出诺如病毒阳性，基因型别为GⅠ.P11-GⅠ.6。结论 本次疫情检测出的诺如病毒型别引起的胃肠炎便隐血阳性率较高，超过其他文献报道的比率，并发现其在氨基酸水平上聚合酶区和VP1区都发生了关键位点的变异。需持续进行疫情监测和防控工作，以减少该类疫情的发生。     

天津市婴幼儿病毒性腹泻诺如病毒检测

目的研究天津市秋冬季婴幼儿腹泻患儿中诺如病毒感染的流行情况及其基因型别。方法 2008年10-12月收集天津市儿童医院住院部310例疑似病毒性腹泻的婴幼儿粪便标本,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测粪便中诺如病毒核酸,并将部分阳性株的PCR产物进行测序,采用序列分析软件分析测序结果 ,推断其毒株型别。结果 310份腹泻标本中,诺如病毒RT-PCR阳性37份(GII型37份,GI型0例),检出率为11.94%;23份PCR产物送往测序,经Genebank Blast及系统进化树分析,所有诺如病毒均为诺如病毒基因组Ⅱ型,其中GII-4/2006b占95.65%(22/23),GII-3占4.35%(1/23);感染诺如病毒的患儿多为1岁以下,且11月份检出率最高。结论诺如病毒是天津市秋冬季婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体,2008年诺如病毒以GII-4/2006b型毒株流行为主。     

2011年-2013年珠海市诺如病毒胃肠炎暴发的病毒分子流行病学分析

目的研究珠海市诺如病毒胃肠炎暴发的分子流行病学特征及流行株基因型的演化情况。方法收集珠海市2011年-2013年28起胃肠炎暴发疫情患者肛拭子标本619份,采用荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)定性检测诺如病毒RNA,按要求选取部分诺如病毒RNA阳性标本扩增诺如病毒衣壳蛋白,进行测序及同源性分析。结果其中17起疫情由诺如病毒感染引发,检测阳性率为19.55%(121/619);选取诺如病毒RNA阳性标本57份进行测序分型,成功分型的标本为47份,全部为No V GⅡ,14株为GⅡ.4型(其中5株为GⅡ.4 2006b,另外9株为GⅡ.4/Sydney_2012);12株属于GⅡ.3型;3株属于GⅡ.5型;18株属于GⅡ.6型。结论珠海市诺如病毒引起的食物中毒流行株属于GⅡ组,但基因亚型存在多样性,并且在短时间内造成多处暴发疫情,提示该状况将是今后防控监测的重点。     

上海口岸首例邮轮大规模诺如病毒感染爆发的实验室快速诊断

〔目的〕总结上海出入境检验检疫局快速确认口岸首例邮轮大规模诺如病毒感染疫情的成功经验,完善口岸公共卫生突发事件应急处置体系的建设。〔方法〕在上海口岸,对发生疫情的邮轮通过检疫查验和流行病学调查明确疫情性质后,通过实验室有针对性的系统检测,对邮轮上发生的群体性急性胃肠炎进行快速诊断,从而实施有效的预防控制措施。〔结果〕通过实验室多种方法检测,确认引发急性胃肠炎的病原体为诺如病毒。〔结论〕对口岸首例邮轮大规模诺如病毒感染疫情的快速准确诊断将为口岸公共卫生突发事件应急体系的建设提供宝贵经验。     

一起养老院急性胃肠炎疫情的病原学分析

目的明确一起养老院感染性腹泻疫情的病原体及其基因型别。方法通过流行病学调查,查明罹患率。对发病老人和部分工作人员进行肛拭子采样,采用细菌培养检测常规肠道致病菌,应用胶体金法检测轮状病毒,采用实时荧光定量RT-PCR进行诺如病毒核酸检测,应用常规RT-PCR扩增部分NoV阳性株衣壳蛋白的N/S区,PCR产物纯化回收、测序,利用Clustal X、MEGA4.1软件分析其基因序列。结果 21份病例及工作人员肛拭子样本,肠道致病菌和轮状病毒均为阴性,19份样本诺如病毒核酸阳性,毒株排除重组株的可能,测序样本均属GⅡ.4型诺如病毒,其与Hu/NSW696T/2006/AUS（EF684915）的同源性高达99%。结论经诺如病毒核酸序列分析,该疫情是一起由GⅡ.4-2006b型诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发。     

一起酒店诺如病毒引起感染性腹泻的流行病学调查

目的分析一起酒店聚餐引发的感染性腹泻暴发的原因及疫情的流行病学特征,为今后预防和控制此类事件的发生提供科学依据。方法以现场流行病学调查为依托,采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术开展诺如病毒核酸检测。结果该起感染性腹泻事件发病人数82人,罹患率为0.82%。采集腹泻患者粪便样本24份,RT-PCR核酸检测阳性7份;酒店剩余食物及环境相关样本21份均为阴性。结论经过现场流行病学调查及实验室检测结果,该事件为一起诺如病毒感染引起的腹泻暴发。     

Waterborne outbreak of gastroenteritis in a religious summer camp in Norway, 2002

In July 2002 an outbreak of acute gastroenteritis occurred in a camp facility in western Norway during a 10-day seminar, with around 300 guests staying overnight and several day-time visitors. Environmental and epidemiological investigations were conducted to identify and eliminate the source of the outbreak, prevent further transmission and describe the impact of the outbreak. Of 205 respondents, 134 reported illness (attack rate, 65%). Multivariate analysis showed drinking water and taking showers at the camp-site to be significant risk factors. Secondary person-to-person spread among visitors or outside of the camp was found. Norovirus was identified in 8 out of the 10 stool samples analysed. Indicators of faecal contamination were found in samples from the private untreated water supply, but norovirus could not be identified. This outbreak investigation illustrates the importance of norovirus as a cause of waterborne illness and the additional exacerbation through person-to-person transmission in closed settings. Since aerosol transmission through showering contributed to the spread, intensified hygienic procedures such as isolation of cases and boiling of water may not be sufficient to terminate outbreaks with norovirus.     

Outbreaks of gastroenteritis associated with noroviruses on cruise ships--United States, 2002

During January 1-December 2, 2002, CDC's Vessel Sanitation Program (VSP), which conducts surveillance for acute gastroenteritis (AGE) on cruise ships with foreign itineraries sailing into U.S. ports received reports of 21 outbreaks of AGE on 17 cruise ships. Of the 21 outbreaks, nine were confirmed by laboratory analysis of stool specimens from affected persons to be associated with noroviruses, three were attributable to bacterial agents, and nine were of unknown etiology. Seven outbreaks were reported in 2001, and of these, four were confirmed to be associated with norovirus (CDC, unpublished data, 2002). This report describes five of the norovirus outbreaks that occurred during July 1-December 2, 2002, on cruise ships.     

北京市东城区一起GⅠ型诺如病毒感染暴发疫情的调查报告

目的 通过对某小学（以下称F小学）一起GⅠ型诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情进行调查和分析,为有效控制学校内发生的急性胃肠炎暴发疫情提供科学依据和经验借鉴。方法 采用现场流行病学调查方法,对F小学的急性胃肠炎暴发疫情中病例进行个案调查,采集病例和餐饮人员样本和环境样本,采用实时荧光PCR方法检测肠道病毒核酸。结果 2018年10月19 - 22日,F小学共报告急性胃肠炎病例145例,罹患率为21.77%。采集呕吐物及粪便标本29份,采集环境涂抹标本10份, 经检测9份粪便标本和2份涂抹标本为GⅠ型诺如病毒病毒核酸阳性。结论 此次疫情为一起由GⅠ型诺如病毒引起的小学生急性胃肠炎暴发疫情,餐饮人员隐性感染可能与本次疫情有关。     

1起疑似食源性诺如病毒感染暴发疫情的流行病学调查

摘要:目的 调查1起小学内出现多名急性胃肠炎病例的感染事件,提出预防控制措施。方法 按照病例定义开展病例搜索,采用描述性流行病学方法和病例对照研究方法进行分析;样本采用RT-PCR方法进行肠道病毒核酸检测。结果 武进区某小学2015年3月2日-11日,出现149例以呕吐症状为主的学生,罹患率为9.0%,3月2日出现发病高峰,病例发病急、班级分布广。现场采集患者肛拭子或呕吐物、对照及食堂工作人员肛拭子、食物和环境样本等共42份,其中2名患者肛拭子、2名患者呕吐物及1名食堂工作人员肛拭子检测出诺如病毒GII型。结论 这是1起由诺如病毒GII型引起的急性胃肠炎暴发疫情,暴发原因可能是由带毒食堂工作人员污染部分食物所致,以食源性传播为主。     

2005-2010年国际邮轮急性胃肠炎疾病暴发的流行病学分析

目的了解2005—2010年期间国际邮轮暴发急性胃肠炎疾病流行的状况与特征,探讨大型船舶暴发胃肠道传染病流行的规律和特点及应对措施。方法收集美国CDC国家环境卫生中心船舶卫生项目(VSP)及文献报道的邮轮急性胃肠炎疾病暴发等疫情报告资料,进行流行病学统计与分析。结果收集2005—2010年期间的暴发疫情中明确病原体的有100起,其中病毒性胃肠炎疾病94起(76.4%),细菌性及其他6起(4.9%);病原体未知及未获得样本有23起(18.7%)。诺如病毒、肠产毒性大肠杆菌、志贺氏菌和沙门菌在邮轮急性胃肠道疾病疫情病原体中占主要地位。每年的10月至次年5月为邮轮急性胃肠道疾病疫情发病高峰,其中诺如病毒引发的发病高峰季节是10月至次年3月。邮轮乘客胃肠炎发病率呈逐年上升趋势。结论邮轮发生胃肠道传染性疾病的频率及乘客发病率呈缓慢波动上升趋势,控制由诺如病毒引起的邮轮急性胃肠炎疾病暴发疫情对胃肠道疾病暴发相关性发病率的降低至关重要。     

Efficacy of an intramuscular bivalent norovirus GI.1/GII.4 virus-like particle vaccine candidate in healthy US adults

BackgroundWe performed this first-in-human efficacy trial of Takeda’s bivalent norovirus vaccine candidate (TAK-214) against moderate or severe acute gastroenteritis (AGE) in healthy adults.MethodsThis double-blind, randomized, placebo-controlled phase 2b trial was conducted over two winter seasons in 18–49 year-old US Navy recruits. Participants were randomized (1:1) to receive intramuscular injections of saline placebo (N = 2,357) or TAK-214 [15 μg GI.1 and 50 μg GII.4c VLPs, 0.5 mg Al(OH)₃] (N = 2,355), and monitored for 45 days post-vaccination for AGE. Norovirus genotypes were identified by RT-PCR and sequencing of stool/vomitus samples. Sera from AGE cases were used to assess immune responses as genotype-specific histo-blood group antigen (HBGA)-blocking antibodies.FindingsWith low rates of homotypic norovirus AGE detected the statistical analysis was proactively modified to account for AGE due to any norovirus genotype. Of the 48 norovirus AGE cases of “any severity”, 29 in placebo and 19 in vaccinees, causative genotypes were GI.1 (n = 1), G1.7a (n = 1), GII.2 (n = 39) and GII.4 (n = 7). Applying predefined definitions of moderate or severe AGE gave 26 vs. 10 cases due to any norovirus genotype in placebo vs. vaccine groups, a vaccine efficacy (VE) of 61.8% (95.01% CI, 20.8 to 81.6; p = 0.0097). Five vs. one moderate or severe cases due to vaccine GI.1/GII.4 homotypic genotypes in placebo vs. vaccine arms gave a primary endpoint vaccine efficacy of 80.0% (99.99% CI, −1318.1 to 99.7; p = 0.142). Levels of GI.1 and GII.4 HBGA-blocking antibodies were increased in vaccinees and in some placebo AGE cases infected with GII.2, indicating cross-reactivity in the immune responses to different genotypes.InterpretationDespite limited cases of homotypic norovirus AGE meaning the primary endpoint was not fully evaluable, we showed TAK-214 provided statistically significant efficacy against “any moderate/severe norovirus AGE” principally caused by the heterotypic GII.2 genotype, demonstrating induction of cross-genotype protection.