大鼠小脑部分表达序列标签的鉴定

目的:为了获取大鼠小脑特异表达的cDNA序列,筛选新的EST基因片段,以便进一步获取有意义的cDNA全基因。方法:以大鼠大脑、脑干mRNA逆转录cDNA作为driver(驱动)cDNA,大鼠小脑mRNA逆转录cDNA作为tester(测试)cDNA,经消减杂交法,消除与大脑及脑干相同的cDNA,并富集低丰度基因,从而获得大鼠小脑特异表达基因片段,以及低表达基因片段,克隆制备成大鼠小脑特异表达cDNA文库。结果:共挑选出32个阳性克隆质粒,测序得到34个不同基因片段的序列。最后用反Northern杂交去除假阳性,筛选出8个有意义的差异表达cDNA基因片段。同时,将测序结果与Genbank进行同源性比较,发现13个新的EST序列,并申请获得基因序列号(AW288461-AW288474)。结论:抑制消减杂交法是一种筛选特异表达基因的有效方法。本结果可为研究脑功能的分子机制提供有益的资料。     

小鼠生发泡完整卵母细胞一个特异基因的克隆及其在胚胎的表达

目的：克隆和筛选小鼠生发泡完整卵母细胞(Gv卵)特异基因，并检测其一在胚胎中的表达。方法：应用抑制性消减杂交技术(SSH)，建立Gv卵特异的cDNA文库。通过斑点杂交法进一步筛选并对阳性克隆进行序列测定和同源性分析；采用RT-PC方法观察其一在着床前胚胎的表达。结果：克隆发现18个基因和8个EST序列在GV卵中特异表达。RT-PCR显示该阳性克隆的基因在GV卵、MII卵、1-细胞胚胎和2-细胞胚胎有表达，其短片段是预期要扩增者，从MII卵开始表达下降；长片段在Gv卵、MII卵、1．细胞胚胎和2-细胞胚胎表达未见明显变化。长、短片段两端序列一致。结论：该基因是GV卵特异cDNA文库中的一个基因，且是母源性基因，提示该基因在卵母细胞成熟和合子基因激活中起一定作用。     

肝癌组织差异表达基因cDNA序列的筛选与鉴定

目的：筛选并鉴定肝癌组织特异表达基因。方法：通过菌落原位杂交技术筛选用抑制消减杂交法构建肝癌与癌旁肝组织差异表达基因消减cDNA文库，用PCR方法进一步筛选出有插入片段的阳性克隆，将阳性克隆进行DNA测序和同源性比较分析，用Northern印迹方法对新的cDNA序列进行初步鉴定。结果：从消减文库中随机挑取的100个白色克隆中筛选出13个阳性克隆，DNA测序获得11个不同的cDNA序列；同源性比较分析表明，6个cDNA片段与在基因高度同源，5个cDNA片段为新的序列。其长度大于300bp的3个新序列，Norther印迹证实它都来源于肝癌组织。结论：用抑制消减杂交方法构建的肝癌差异表达基因消减cDNA文库富含肝癌特异表达基因，经验证的3个新的cDNA序列可能为肝癌特异的基因序列。     

大鼠不同发育阶段β-防御素-2基因在肺组织的表达研究

目的：探讨大鼠β-防御素-2基因在肺组织表达的发育调控。方法：根据Genbank大鼠β-防御素-2的cDNA序列,设计一对特异引物。采用RT-PCR技术在大鼠不同发育阶段的肺组织总RNA中,扩增其特异cDNA片段,并进行DNA序列测定。借助Genbank中BLASI、程序,将从该cDNA序列推导的氨基酸序列与人的hBD-2和大鼠的rBD-1做相似性分析。     

小鼠GV卵中母源基因的克隆和其中一个基因在植入前胚表达的研究

目的 克隆和筛选小鼠生发泡完整卵母细胞(GV卵)中母源基因，并检测其中一个基因在植入前不同发育阶段胚中的表达，初步了解该基因在卵母细胞发育成熟及早期胚发育中的作用。方法 应用抑制性消减杂交技术(SSH)，以生发泡完整的卵母细胞为检测子(tester)，8-细胞胚为驱赶子(driver)，建立GV卵中母源基因的cDNA文库。通过斑点杂交法进一步筛选GV卵中母源基因的cDNA文库，对阳性克隆进行序列测定和同源性分析；并采用RT-PCR方法观察其中1个阳性克隆的基因在着床前胚的表达。结果 克隆得到18个基因的cDNA序列和8个同源EST序列在GV卵中特异表达，包括PeroxiredoxinⅡ基因。RT-PCR显示PeroxiredoxinⅡ基因呈阶段性差异表达，在GV卵、MⅡ卵、1-胞胚和2-细胞胚有表达，但从MⅡ卵开始表达下降。而在4-细胞胚、8-细胞胚、桑椹胚和囊胚中不表达。结论 PeroxiredoxinⅡ基因是GV卵中母源基因cDNA文库中的一个基因，提示该基因在卵母细胞发育成熟和合子基因激活中起一定作用。     

通过差减文库筛选文昌鱼神经胚中特异表达的基因

目的:构建文昌鱼12 h神经胚与6 h原肠胚的差减cDNA文库,以期从中挑选出在神经、肌肉、体轴发育过程中特异表达的基因,以便对文昌鱼早期胚胎的发育调控机制进行进一步研究。方法:分别从文昌鱼12 h胚胎和6 h胚胎提取总RNA,反转录成cDNA,以文昌鱼12 h胚胎的cDNA作为tester,并以6 h胚胎的cDNA作为driver,经过两轮杂交和抑制性PCR扩增,产物与T载体连接,经蓝白斑筛选,提取质粒DNA,EcoR I酶切鉴定插入片段,由此构建文昌鱼早期两个不同发育时期的差减cDNA文库。结果:对200个文库克隆进行了测序,筛选到一些可能在文昌鱼12 h神经胚中特异表达的基因。结论:成功构建了文昌鱼12 h/6 h胚胎差减cDNA文库,所获得的12 h神经胚中特异表达的基因,为进一步对文昌鱼早期发育调控机制进行研究提供了材料。     

人类胚胎干细胞特异表达新基因HPESCRG1的克隆和特性分析

目的克隆一个人类胚胎干细胞特异表达的新基因并对其特性进行分析。方法从一个在人类胚胎干细胞(embryonicstem,ES)中特异表达的表达序列标签CF948547出发,应用生物信息学方法和分子生物学技术克隆一个新基因,采用逆转录-聚合酶链反应分析新基因的表达谱,并应用增强型绿色荧光蛋白真核表达系统分析新基因的亚细胞定位。结果成功克隆了一个新基因HPESCRG1,GenBank登录号为AY283672。该基因cDNA长1395bp,包含9个外显子和8个内含子,开放阅读框为250～1146bp,定位在3q13.13,预测编码297个氨基酸,预计分子量为33784,等电点为9.35。其编码蛋白有一个SAP功能域,该蛋白定位在细胞核内。该基因仅在人类ES细胞中表达,而在其分化细胞不表达,在人胚胎成纤维细胞、人间充质干细胞、成人和流产胚胎的多种正常组织中不表达。结论HPESCRG1基因是一个人类ES细胞中表达特异性新基因,很可能与人类ES细胞的自我更新和维持其未分化状态密切相关。     

异源内含子能增强小鼠体内转入基因的表达

转基因研究中最令人迷惑的现象是;有些cDNA基因组转染培养细胞后常能充分表达,但在转基因小鼠体内却不能起作用。这表明在小鼠体内,内含子对于转入基因的表达可能有特殊的重要性。在先前的研究中,作者以小鼠金属巯基蛋白(metallothionein,mMT-I)基因的启动子连接大鼠生长激素(rGH) 基因,构成基因组mMT-rGH;并以基因表达率和每细胞表达的mRNA分子数为指标,研究了内含子对转入基因表达的作用。     

人细胞角蛋白8(CK8)基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达

目的:克隆人细胞角蛋白8(CK8)基因cDNA并在大肠杆菌中表达CK8蛋白产物。方法:运用DNA重组技术,设计CK8基因特异引物,采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术从人肝细胞癌7721细胞中扩增CK8编码区cDNA,将其插入克隆载体pMD18-T simple vector中,获得重组质粒pMD18-CK8,转化感受态大肠杆菌DH5α。继而采用PCR技术从重组质粒pMD18-CK8中扩增出约1500bp目的片段,再次级克隆到原核表达质粒pET-28a(+)载体中,获得pET-28a-CK8重组原核表达质粒;经酶切、PCR及测序鉴定后转化入BL21(DE3)菌株,在IPTG诱导下进行融合蛋白的表达。采用SDS-PAGE电泳及Western blot检测CK8蛋白表达水平。结果:成功建立了人CK8基因cDNA重组体的无性繁殖系。②在原核细胞中成功地表达出人CK8蛋白,该蛋白具有很好的免疫原性。结论:运用原核细胞基因工程技术成功构建和表达了人细胞角蛋白8(CK8)基因,为进一步研究CK8的基因型及探讨该基因编码的CK8蛋白的性质和生物学活性创造条件。     

TRAIL胞外段基因克隆及其表达与纯化

目的克隆TNF相关的诱导凋亡配体胞膜外段基因(the extracellular region of the human TRAIL cDNA,TPAILex),构建表达载体并在大肠杆菌DH5α中高效表达有生物学活性的TRAIL蛋白胞膜外段.方法抗CD3McAb刺激正常人外周血淋巴细胞,用RT-PCR、巢式-PCR方法从活化的淋巴细胞中获得人TRAIL基因及其胞膜外段cDNA,并克隆到pGEM-T Easy载体中,DNA测序鉴定.将TRAIL的胞膜外段基因插入表达载体pGEX-2T,构建重组表达质粒pGEX/TRAILex,用IPTG诱导表达TRAIL蛋白的胞膜外段,GST-Agarose 4B层析柱纯化GST-TRAILex融合蛋白,Westem-blot鉴定纯化产物.结果抗CD3 McAb能诱导正常人外周血单个核细胞TRAIL的高表达,成功地克隆了TRAIL胞膜外段基因,构建了重组表达载体pGEX/TRAILex,IPTG诱导后得到高效表达的TRAIL蛋白胞膜外段,经12%SDS-PAGE分析,可观察到一分子量和理论值相符(约54kD)的诱导表达带.Kodak软件分析表面GST-TRAIL胞膜外段融合蛋白的表达量占菌体蛋白总量的28%,进一步分析证实TRAIL蛋白的胞膜外段主要以可溶性的形式表达,用GST-Agarose4B层析柱纯化超声破菌后的上清,每升细菌培养液可得到9.8 mg纯度的95%以上的GST-Tex.Western-blot结果证实54KD的表达带可与鼠抗TRAIL McAb起特异性反应.结论成功地克隆了人TRAIL基因,并应用基因工程技术在大肠杆菌中高效表达人TRAIL蛋白的胞膜外段,为进一步研究TRAIL的功能及其在肿瘤生物治疗中的应用奠定了基础.     

人源抗癌胚抗原单克隆抗体的获得与鉴定

目的：获得抗癌胚抗原（CEA）的单克隆抗体（mAb）。方法：采用特殊的5轮筛选法（逐轮降低抗原包被量，严格洗脱条件），以固相化的人源CEA抗原淘筛本室构建的人源特异性噬菌体抗体库。获得有特异结合活性的CEA噬菌体抗体，酶切鉴定插入的抗体基因。切去噬菌粒上衣壳蛋白gⅢ基因，构建表达载体，在大肠杆菌中可溶性表达抗CEA抗体Fab段，ELISA、Western blot检测抗体免疫学活性，测序分析抗体基因。结果：筛选出4株与CEA抗原特异结合而与BSA、HBsAg无交叉结合反应的噬菌体抗体。切去gⅢ基因，在大肠杆菌中表达可溶性抗体Fab段，表达量在细菌培养液上清和细菌裂解液中无统计学意义。可溶性抗体与人CEA抗原有特异结合活性，与BSA、HBsAg无交叉结合反应。Western blot显示在略大于相对分子质量（Mr）45000处有一明显条带，与Mr48000的Fab大小一致。DNA测序分析表明Fab段VH属于IgGVH3基因家族，VL属于VK1基因家族。结论：抗CEA噬菌体抗体库的构建和人源抗CEAmAb的制备，为CEA阳性表达肿瘤的靶向治疗奠定基础。     

从卵巢癌cDNA表达文库筛选肿瘤抗原基因的研究

目的：利用肿瘤患者自体血清筛选患者肿瘤cDNA表达文库（SEREX）,寻找肿瘤特异性抗原是肿瘤免疫学研究的新策略,由此方法所获B细胞抗原肽可为进一步寻找T细胞抗原肽,开展肿瘤免疫治疗和诊断提供线索。方法采用SEREX方法,筛选中国人卵巢癌cDNA表达文库,对获得的阳性克隆片段测序鉴定和进行BLAST同源性比较。采用RT－PCR,分析政党组织和肿瘤组织及肿瘤细胞株中6个新的EST片段的表达。结果,所获基因片段大多数为已知抗原基因（20／27）。根据其来源又可归类为结构基因。线粒体基因和调控基因。另外,获6个未知的EST片段。RT－PCR的结果表明,4个EST（EST87888、1750、1754和3533）片 肿瘤和正常组织中均有表达,2个EST在正常组织中未见表达,而在肿瘤组织中有表达,可能是与肿瘤相关或特异的EST片段。结论SEREX方法不失为一种有效筛选卵巢癌肿瘤抗原的新方法。所获肿瘤抗原候选基因,可进一步进行结构和功能的研究。     

NADH-细胞色素b5还原酶在视网膜色素变性rds小鼠中的差异表达

目的:寻找遗传性视网膜色素变性动物模型rds小鼠发病时差异表达的基因。方法:采用差异显示技术比较25drds小鼠和正常对照小鼠的视网膜mRNA。对差异表达的基因片段进行克隆、测序和同源性比较。用基因特异引物RT-PCR观察其在不同日龄两种小鼠中的表达情况。结果:rds小鼠与同龄正常对照小鼠相比,视网膜存在相当明显的基因表达差异。其中一个差异片段克隆的序列与大鼠NADH-细胞色素b5还原酶(b5R)的cDNA序列有91%的同源性,可以认为是小鼠b5R的cDNA片段。基因特异引物RT-PCR证实12d、25d和37drds小鼠视网膜中b5RmRNA水平高于同龄正常对照小鼠。结论:可能由于某种氧化因素使b5R表达增高,大量消耗NADH并生成NAD⁺,促进视网膜细胞凋亡。     

人ICOSIg的真核表达及其对MLR反应的影响

目的构建人ICOSIg基因的真核表达载体,表达并鉴定ICOSIg蛋白,初步研究其对MLR中细胞增殖以及对IL-10分泌的影响。方法从活化的人T细胞cDNA文库中以PCR方法扩增ICOS胞外区cDNA编码基因,并和人IgG1Fc基因一起装入真核表达载体pcDNAB中,采用脂质体转染COS-7细胞,G418筛选,用ELISA检测其表达情况,经蛋白A亲和纯化,用SDS-PAGE和Western blotting进行鉴定。进一步通过^3H-TdR掺入法和夹心ELSIA法探讨其对双向MLR反应中细胞增殖以及对IL-10分泌的影响。结果酶切和测序证实构建的ICOS膜外区和人IgG1Fc段基因序列正确、阅读框完整;ELISA、SDS-PAGE、Western blot验证ICOSIg的正确表达;功能实验提示ICOSIg能抑制MLR中的细胞增殖和IL-10的分泌。结论成功构建并表达了ICOSIg,而获得的ICOSIg能抑制MLR。     

一种鉴别差异表达基因的新方法——cDNA示差分析技术

cDNA示差分析技术是继mRNA差显示技术之后又一种鉴别差异表达基因的方法。该技术利用双链DNA模板在PCR时呈指数扩增,而单链DNA模板为线性扩增的原理,先用常见的限制性内切酶将实验组与对照组消化成平均长度为256bp的cDNA片段。再用PCR技术使两组的cDNA片段富集,随后进行3次差减杂交去除共有基因,最后扩增实验组中的特异表达的基因。本文概述了该技术的原理、基本方法及其应用前景。     

人BLyS基因真核细胞表达载体的构建和鉴定

目的构建人BLyS基因真核细胞表达载体.方法采用RT-PCR方法,从激活的人外周血淋巴细胞的总cDNA中扩增得到876bp的人BLyS cDNA片段,再用XhoⅠ和EcoRⅠ双酶切后定向克隆到真核细胞表达载体pcDNA3中,用限制性内切酶酶切分析和DNA序列分析鉴定重组质粒.结果人BLyS cDNA已经正确克隆到真核细胞表达载体pcDNA3中.结论本实验结果为研制抗人BLyS单克隆抗体来研究BLyS与B淋巴细胞功能的关系以及进一步探索自身免疫性疾病的治疗新途径奠定了基础.     

DNA重组技术在医学上的应用Hamilton O.Smith

近十年来,DNA重组技术已发展到可以将人的基因切下来,连接到质粒或病毒上去并使其在细菌中表达。因此现在才有可能用细菌生产大量的人的基因产物,如胰岛素、血液凝集因子,干扰素及其它有用的人的基因产物。 利用DNA重组及无性繁殖的技术分离人的基因,一般有三种方法:(1)构建基因库,用筛选的方法从成千上万的克隆中分离所需的基因。(2)构建CDNA库,将细胞中分离得到的mRNA逆转录成CDNA。     

先兆子痫胎盘的基因表达谱研究

目的： 利用cDNA芯片分析先兆子痫胎盘中基因表达的变化情况,寻找新的先兆子痫相关基因。方法: 建立含12 000个与代谢、凋亡、细胞黏附、信号转导、转录因子等有关基因的cDNA表达谱芯片,将先兆子痫及正常胎盘mRNA与cDNA芯片进行杂交,得到先兆子痫的基因表达谱;对部分差异表达基因进行Northern验证。结果: 在4例先兆子痫胎盘组织中发现均有差异表达的基因44个,其中表达上调有30个,表达下调有14个,Northern杂交鉴定的结果与芯片结果相符合。结论: 重度妊娠高血压疾病的基因表达谱存在明显差异,差异的基因可能涉及信号转导、细胞代谢、炎性细胞因子等方面,这些基因可能与妊娠高血压病的发病相关。     

人PSCA基因真核载体的构建与表达

目的 克隆人PSCA(prosaae stem cell antigen)分子的cDNA,构建PSCA基因的真核表达载体,并在体外进行表达和鉴定.方法 从PSCA阳性细胞系LNCaP中提取总RNA,逆转录为cDNA.根据编码人PSCA的基因序列设计引物,以cDNA为模板,采用PCR技术扩增PSCA基因,将该基因插入到pcDNA3.1(+)真核载体,构建pcDNA3.1(+)-PSCA表达质粒.经限制性酶切鉴定和DNA序列测定结果证实后,将重组质粒pcDNA3.1(+)-PSCA转染Hela细胞,检测其体外瞬时表达.结果 测序证实得到人PSCA基因序列,序列分析显示没有发生无义突变.RT-PCR和免疫细胞化学分析结果分别表明转染细胞有目的 基因和分子的表达.结论成功克隆人PSCA基因,并在真核细胞中获得表达,为进一步构建基于PSCA的肿瘤疫苗奠定了基础.     

hIL－16cDNA的克隆、测序及在E.coli中的表达与纯化研究

在国内首次从人的外周血单个核细胞（PBMC）中克隆了人白细胞介素－16(hIL－16)cDNA,并应用一种新型的大肠杆菌表达系统─硫氧还蛋白表达系统,成功地表达了重组hIL－16。hIL－16cDNA的扩增从人PBMC中提取总RNA,poly(T)8－12反转录cDNA,以半巢式PCR扩增出特异的DNA片段。hIL－16cDNA的克隆、测序与表达利用