TCN2基因与非综合征性唇腭裂的关系

目的研究叶酸代谢相关基因TCN2与中国人群中非综合征性唇腭裂的关系。方法通过聚合酶链反应-限制性片段长度多态性,在108例非综合征性唇腭裂患者和184名正常对照个体中,对TCN2基因2个单核苷酸多态性（SNP）（rs10418和rs1801198）进行检测。利用拟合优度卡方检验,分析基因型分布频率是否符合Hardy-Weinberg平衡定律;应用UNPHASED软件包分析单个单核苷酸多态性位点以及两个位点单倍型与非综合征性唇腭裂的相关性。结果 2个SNP位点基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡;等位基因分布和单倍型组合在非综合征性唇腭裂患者与对照组之间无显著性差异;rs10418 TT基因型能增加非综合征性唇腭裂患病风险。结论 TCN2基因rs10418 TT基因型是非综合征性唇腭裂的危险因素。     

宁夏回汉族人群中FOXE1基因多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究

目的:探讨宁夏回汉人群FOXE1基因rs3758249、rs10217225和rs4460498位点单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂发病的相关性。方法:收集宁夏地区回、汉族非综合征型唇腭裂患者207例,其中回族69例,汉族138例;正常对照组292例,其中,回族72例,汉族220例。采用PCR-RFLP方法检测FOXE1基因rs3758249、rs10217225和rs4460498多态位点的基因型,进行病例对照分析。结果:在回汉人群中,与正常对照组比较,单纯唇裂组和唇腭裂组rs3758249、rs10217225和rs4460498多态位点基因型和等位基因频率存在统计学差异(P0.05);而在单纯腭裂组差异无显著性(P0.05)。分别对汉族和回族人群内病例对照分析,发现唇裂并唇腭裂组rs3758249、rs10217225和rs4460498多态位点基因型在汉族和回族人群中的均存在差异性(P0.05)。病例组内进行回、汉族基因型比较,发现rs10217225多态性在宁夏地区回、汉患者中存在差异性(P0.05),而rs3758249、rs4460498差异没有显著性。结论:在宁夏回汉族人群中,FOXE1基因的rs3758249、rs10217225和rs4460498位点单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂存在相关性;回汉族人群间基因型没有统计学差异。     

MTR基因rs1805087位点多态性与非综合征性唇腭裂的关联性研究

目的:研究蛋氨酸合成酶(methionine synthase,MTR/MS)基因rs1805087位点单核苷酸多态性与山西人群非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的相关性。方法:采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对135个NSCL/P核心家庭、150例正常新生儿及其母亲的MTR基因rs1805087位点多态性进行检测;用人群关联研究、病例组核心家庭的传递不平衡检验(TDT)和单体型的相对危险度(HHRR)进行统计分析。结果:本研究中GG基因型较少,故将AG和GG基因型合并后与AA基因型比较。病例组子代及母亲和对照组之间,基因型分布和等位基因频率比较,差异均无统计学意义(P>0.05);唇裂组和唇腭裂组子代及母亲基因型分布和等位基因频率,与对照组差异均无统计学意义(P>0.05);病例组核心家庭分析,TDT检验χ2=0.083,P>0.05,HHRR分析χ2=0.112,P>0.05,说明携带有突变基因G并不能增加NSCL/P的发病风险。结论:本研究结果未显示MTR基因rs1805087位点多态性与山西人群非综合征性唇腭裂之间存在相关性。     

成纤维细胞生长因子3基因多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究

目的探讨成纤维细胞生长因子3（FGF3）基因rs4980700、rs4631909单核苷酸多态性（SNP）与非综合征型唇腭裂（NSOC）的相关性。方法收集186例非综合征型唇腭裂患者,患者父亲183例,母亲174例,核心家系172个;200例正常新生儿为对照组。采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测FGF3基因rs4980700与rs4631909多态位点基因型,并进行病例对照分析,传递不平衡检验（TDT）和以家系为基础的相关性分析（FBAT）。结果病例组rs4980700多态位点基因型和等位基因频率与对照组比较存在统计学差异（P<0.05）;病例组rs4631909多态位点基因型和等位基因频率与对照组比较存在统计学差异（P<0.05）,而在腭裂组则无统计学差异（P=0.49）。传递不平衡研究发现,FGF3基因rs4980700位点的G等位基因与rs4631909位点的C等位基因在本研究人群非综合征型唇腭裂患者中存在过传递（P<0.05）。FBAT分析rs4980700、rs4631909多态位点与本研究人群非综合征型 唇腭裂存在相关性（P<0.05）。结论FGF3基因rs4980700、rs4631909多态位点与非综合征型唇腭裂存在相关性。     

干扰素调节因子6基因多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究

目的探讨干扰素调节因子6（IRF6）基因rs642961和rs4844880位点单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂的相关性。方法收集宁夏地区非综合征型唇腭裂患者186例,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCRRFLP）方法检测IRF6基因多态位点rs642961和rs4844880基因型,进行病例对照分析、传递不平衡检验（TDT）。结果与正常对照组比较,唇裂组和唇腭裂组rs642961和rs4844880位点的AA基因型和A等位基因的频率存在统计学差异（P<0.05）,腭裂组均没有意义（P=0.15, P=0.967）;TDT研究发现IRF6基因rs642961位点的A等位基因和rs4844880位点的A等位基因在唇裂和唇腭裂患者中存在过传递（P<0.05）;2个位点在腭裂组均没有统计学意义（P=0.91,P=0.95）。结论IRF6基因多态性与非综合征型唇腭裂存在较强的相关性。     

MTR基因Rs1805087多态性与非综合征性唇腭裂的相关性研究

目的研究5-甲基四氢叶酸-高半胱氨酸甲基转移酶（5-methyltetrahydrofolate-homocysteine methyltransferase,MTR）SNPs位点Rs1805087多态性与非综合征性唇腭裂的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,检测174例非综合征性唇腭裂患者和169例正常对照组的MTR基因Rs1805087的多态性。结果 MTR基因Rs1805087位点基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;MTR基因Rs1805087位点基因型及等位基因的分布在NSCL/P组与对照组之间均无统计学意义（P〉0.05）。结论结果未显示MTR基因Rs1805087多态性与非综合征性唇腭裂的发生有关。     

TPM1基因相关多态性与中国北方汉族人群非综合征性唇腭裂的相关研究

目的：分析TPM1基因上游功能区3个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms, SNPs）位点与中国北方人群非综合征性唇腭裂（nonsynodromic orofacial clefts, NSOC）的关联。方法：通过对335个NSOC样本及572个健康对照样本外周血DNA的研究对目的位点行聚合酶链反应（polymerase chain reaction, PCR）扩增、DNA测序、基因分型。利用PubMed数据库（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed）采集相关多态性位点基本信息。使用SHEsis在线软件、SPSS 20.0软件对SNPs位点的等位基因频率、基因型及单体型进行分析研究。结果：TPM1相关rs1873147、rs7179658和rs4775599完全连锁,rs1873147在唇腭裂（cleft lip and palate, CLP）组与健康对照组之间的等位基因频率差异有统计学意义（P=0.035）。结论：TPM1相关rs7179658、rs1873147和rs477559与中国北方汉族人群NSOC可...     

小泛素化修饰基因-1多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究

目的探讨小泛素化修饰基因-1（SUMO-1）rs6709162、rs7599810和rs7580433位点单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂（NSOC）的相关性。方法收集宁夏地区NSOC患者208例、患者父亲189例、患者母亲176例、完整核心家系（患者及其父母）172个进行研究,并收集正常新生儿284例作为对照。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法检测SUMO-1基因多态位点rs6709162、rs7599810和rs7580433基因型,并进行病例对照分析、传递不平衡检验（TDT）和以家系为基础的相关性检验（FBAT）。结果病例对照研究发现：SUMO-1基因rs7599810位点的TT基因型频率在唇裂、腭裂组与对照组比较有统计学差异（P=0.01,P=0.01）。TDT分析结果：rs7599810位点的T等位基因在唇腭裂组中存在过传递（P=0.00）;rs6709162位点的C等位基因在腭裂和唇腭裂组中存在过传递（P=0.00,P=0.01）;rs7580433位点的G等位基因在唇裂组中存在过传递（P=0.05）。FBAT分析结果：rs7599810位点TT基因型和T等位基因的分布具有统计学意义（P=0.00,P=0.00）。结论SUMO-1基因多态性与NSOC存在相关性。     

非综合征性唇腭裂与同源异型盒基因1多态性的相关性研究

目的采用聚合酶链反应- 单链构象多态性（PCR- SSCP）方法研究同源异型盒基因（MSX）1外显子1的编码区，探讨非综合征性唇腭裂（NSCL/P）患者MSX1基因外显子1的编码区内是否存在基因突变。方法采用聚合酶链反应（PCR）和单链构象多态性（SSCP）方法，以45名健康人为对照组，45名NSCL/P患者作为研究对象，分析MSX1基因多态性。结果SSCP分析显示NSCL/P患者（45名）与对照组（45名）样本的电泳速率相同，提示无多态性存在。结论MSX1基因外显子1未发现多态性的存在，其与NSCL/P患者之间无明显相关性。     

中国西部汉族人群血小板源性生长因子C基因单核苷酸多态性与非综合征型唇腭裂相关性研究

目的探究中国西部汉族人群血小板源性生长因子C(PDGF-C)基因的靶向单核苷酸多态性(SNPs)位点rs4691383、rs7667857及其基因型以及环境暴露因素与非综合征型唇腭裂(NSCL/P)发生的相关性。方法收集268个NSCL/P病例—父母核心三人家系,采用聚合酶链反应—限制性酶切片段长度多态法和直接测序法对2个靶向SNPs位点(rs4691383、rs7667857)进行基因分型,使用哈温平衡检验、连锁不平衡检验、传递不平衡检验、单倍型关联分析等方法进行统计学分析。同时收集纳入对象所填写的唇腭裂流行病学研究问卷,对PDGF-C基因和环境暴露因素之间是否存在交互作用进行条件Logistic回归分析。结果 PDGF-C基因rs4691383位点的A等位基因和rs7667857位点的G等位基因在NSCL/P发生中存在过度传递(P<0.05)。孕妇吸烟/被动吸烟史、叶酸补充史、环境有害气体长期吸入史3个环境暴露因素与PDGF-C基因的SNPs位点基因型之间均不存在交互作用(P>0.05)。结论 PDGF-C基因rs4691383位点和rs7667857位点多态性与中国西...     

非综合征唇腭裂的候选基因位点

<正>唇腭裂的遗传模式主要有2种观点:多因素阈点模式和主要致病基因遗传模式。20世纪90年代以来,国内外一些学者开始从基因定位的角度做了大量的临床和实验研究,希望筛选出可能的唇腭裂易感基因并进行基因定位。虽然其结果仍有争议,但仍可以为人们深入认识唇腭裂的病因、调整研究思路和方向奠定重要基础。     

汉族人转化生长因子-α基因多态性与环境因素和非综合征性唇腭裂的关系

目的研究汉族人转化生长因子- α（TGF- α）基因多态性与环境因素和非综合征性唇腭裂（NSCL/P）的关系。方法通过问卷调查获得所有研究对象母亲孕早期感染史、孕期服药史及叶酸补充等资料。应用多聚酶链反应（PCR）结合限制性酶切方法，确定199例NSCL/P患者与203例正常人的基因型。将基因型与孕早期感染史、孕期服药史及叶酸补充因素进行分析。结果NSCL/P患者的C2等位基因频率比正常对照组明显增高，其差异有统计学意义（P<0.05）。孕早期感染、孕期服药及不补充叶酸的孕妇发生NSCL/P增多。C1C2基因型与孕早期感染、孕期服药和叶酸补充3个因素有交互作用。结论TGF- α基因的突变与汉族人NSCL/P的发生有相关性，孕早期感染史、孕期服药史及叶酸补充等环境因素与NSCL/P的发生有关。含有C2等位基因的个体对孕早期感染、孕期服药和叶酸缺乏3个危险因素更为敏感。     

非综合征性唇腭裂与视黄酸受体-α基因关系的研究

唇腭裂畸形是人类最常见的先天发育性缺陷之一,全世界的发病率为1/500～1/1000,近年来各国报道的唇腭裂发病数字仍有上升的趋势[1]。在我国,先天性唇腭裂的发生率约为1‰～2‰,属于发病率较高的国家。在所有唇腭裂中,约有50%～70%以非综合征形式存在,且有明显的家族集中性[2]。     

山西人群MTHFR基因rs1801133位点多态性与非综合征性唇腭裂的关联性研究

目的:研究亚甲基四氢叶酸还原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)基因rs1801133位点多态性与非综合征性唇腭裂(NSCL/P)的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,检测334例非综合征性唇腭裂患者和314例正常对照组的MTHFR基因rs1801133位点的多态性。结果:MTHFR基因rs1801133位点基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡;MTHFR基因rs1801133位点基因型及等位基因的分布在NSCL/P组与对照组之间均无统计学意义(P>0.05)。结论:MTHFR基因rs1801133位点多态性与山西人群非综合征性唇腭裂的发生无关。     

非综合征型唇腭裂易感基因的研究进展

<正>唇腭裂(cleft lip and palate,CLP)是常见的先天性发育畸形,全世界发病率为1/500～1/1 000。我国为唇腭裂高发国家,发病率高达1.82‰,总发生率占我国出生缺陷的14.01%。先天性唇腭裂常分为综合征型唇腭裂(syndromic cleft lip and/or cleft lip,SCL/P)和非综合征型唇腭裂(nonsyndromic cleft lip and/     

VAX1 gene associated non-syndromic cleft lip with or without palate in Western Han Chinese

ObjectiveNon-syndromic cleft lip with or without palate (NSCL/P) is one of the most common human birth defects, it results from multiple genetic and environmental risk factors. Recently, GWA studies identified associations between NSCL/P and two genetic risk loci, rs7078160 and rs4752028, at VAX1.DesignCurrently, we tried to investigate the roles of the two loci among 302 NSCL/P trios (129 non-syndromic cleft lip only (NSCLO) trios and 173 non-syndromic cleft lip and cleft palate (NSCLP) trios) from Western Han Chinese. The two SNPs were genotyped by SNPscan method; Hardy–Weinberg equilibrium test, allelic TDT and parent-of-origin effect were performed by PLINK software, and genotypic TDT and haplotype by FBAT software.ResultsAllelic TDT analysis revealed allele A at rs7078160 was over-transmitted among NSCL/P group (P = 0.0086, OR_transmission = 1.36, 95%CI: 1.08–1.72). Parent-of-origin effect analysis revealed a paternal special over-transmission of allele A at rs708260 in NSCL/P group (P = 0.0079). Haplotype AC of rs7078160-rs4752028 was significant over-transmitted in the NSCL/P group.ConclusionsOur study firstly confirmed that allele A at rs7078160 at VAX1 gene was a risk factor for NSCL/P in Western Han Chinese population.     

唇腭裂病因学研究的新进展

先天性唇腭裂是一种常见的多基因遗传病,是遗传因素和环境因素综合作用的结果,随着人类基因组计划的完成,先天性唇腭裂易感基因的研究已成热点,国外许多学者已进行了大量的研究,并取得了初步的成果。本文回顾近年来在唇腭裂病因学研究方面的进展,包括易感基因定位、相关信号分子流行病学及动物模型等方面的研究。     

Gene-gene interaction for nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate in Chilean case-parent trios

ObjectiveNonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) is a birth defect for which several genes susceptibility genes been proposed. Consequently, it has been suggested that many of these genes belong to common inter-related pathways during craniofacial development gene-gene interaction. We evaluated the presence of gene-gene interaction for single nucleotide polymorphisms within interferon regulatory factor 6 (IRF6), muscle segment homeobox 1 (MSX1), bone morphogenetic protein 4 (BMP4) and transforming growth factor 3 (TGFB3) genes in NSCL/P risk in Chilean case-parent trios.DesignFrom previous studies, we retrieved genotypes for 13 polymorphic variants within these four genes in 152 case-parent trios. Using the trio package (R) we evaluate the gene-gen interaction in genetic markers pairs applying a 1°-of-freedom test (1df) and a confirmatory 4°-of-freedom (4df) test for epistasis followed by both a permutation test and a Benjamini-Hochberg test for multiple comparisons adjustment.ResultsWe found evidence of gene-gene interaction for rs6446693 (MSX1) and rs2268625 (TGFB3) (4df p = 0.024; permutation p = 0.015, Benjamini-Hochberg p = 0.001).ConclusionsA significant gene-gene interaction was detected for rs6446693 (MSX1) and rs2268625 (TGFB3). This finding is concordant with research in animal models showing that MSX1 and TGFB3 are expressed in common molecular pathways acting in an epistatic manner during maxillofacial development.     

阜新市阜蒙县非综合征性唇腭裂的多因素分析

目的:研究阜蒙县近8年先天性非综合征性唇腭裂的发病因素,为唇腭裂的预防与治疗提供依据。方法:采用1∶4配对的方法,对32例唇腭裂患儿的母亲与128例非唇腭裂小儿的母亲进行了对照研究,调查范围包括母亲自身及环境中的危险因素和遗传因素两大方面。资料用条件Logistic回归方法进行单因素和多因素分析。结果:病例对照单因素分析显示与唇腭裂发病有显著性意义的因素共13种,最终进入多因素Logistic回归模型的变量有7种。结论:本研究发现家庭人均收入,母亲孕早期食用水果、呕吐反应、患风疹、接触农药、精神刺激以及家族史这7种因素是唇腭裂的主要影响因素。     

干扰素调节因子-6基因多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究

20世纪80年代后期以来,学者们陆续报道了10～20个与非综合征型唇腭裂有关的易感基因和位点,其中干扰素调节因子-6（IRF-6）基因是迄今发现的最有价值的与非综合征型唇腭裂发病相关的基因之一。本文就IRF-6基因的结构和功能、IRF-6基因的多态性及其与非综合征型唇腭裂的相关性研究作一综述。