网络药理学在中医药研究中的现状及思考

网络药理学已成为中医药药理基础与作用机制研究的热门工具,广泛应用于中药活性成分筛选、药物重定位、中药配伍机制探索及中医药多成分、多靶点、多通路的作用机制阐释等。回顾网络药理学的发展历程,整理现阶段网络药理学相关的中医药数据库、疾病数据库、功能注释数据库,对网络药理学在中医药现代化研究中的应用进行简要综述,并指出研究中面临的问题及挑战,进而展望中医药网络药理学研究的发展方向,以期为规范、合理使用网络药理学进行中医药研究提供指导,同时也为引领中医药原创研究的发展以及中药新药研发提供思路。     

基于网络药理学的盐酸小檗碱治疗抑郁症作用机制研究

目的 运用网络药理学方法探讨盐酸小檗碱治疗抑郁症的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台及PharmMapper网站预测盐酸小檗碱的作用靶点,并利用STRING数据库构建靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,获得盐酸小檗碱的潜在作用靶点.检索GeneCards数据库以获得抑郁症相关靶点,与盐酸小檗碱的潜在...     

基于网络药理学探讨生脉散治疗心律失常作用机制

目的:基于网络药理学探讨生脉散治疗心律失常的分子机制.方法:使用TCMSP和TCMID数据平台筛选生脉散的有效成分,TCMSP及STITCH数据库筛选药物作用靶点,通过TTD、DRUGBANK及DisGeNET数据库检索心律失常的疾病靶点.制作韦恩图获得相关交集,使用String数据库制作靶点间相互作用网络,并依据置信...     

基于网络药理学及分子对接方法分析佩兰治疗2型糖尿病作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接方法分析佩兰治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Drugbamk、UniProt数据库筛选出佩兰的活性成分及靶点;采用GeneCards、CTD及OMIM数据库获取T2DM相关基因,并与药物靶点相互映射,得到共同靶点;采用STRIN...     

基于网络药理学和实验验证探讨苦参治疗乙型病毒性肝炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术,探讨苦参治疗乙型病毒性肝炎的作用机制,为临床防治提供指导.方法 通过GeneCards、OMIM和TTD数据库获取乙型病毒性肝炎靶点,使用TCMSP、BATMAN-TCM、ETCM、HERB数据库及查阅相关文献获取苦参活性成分及靶点,并利用VENNY作图取两者的交集.用Cytosca...     

活血消异方治疗子宫内膜异位症网络药理学研究

采用网络药理学方法探析活血消异方治疗子宫内膜异位症(EMT)的相关靶点及作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)及Swiss Target Prediction网络数据库推测并获取活血消异方组方的药物活性成分及靶点.利用基因卡片(GeneCard)数据库筛选获取EMT的疾病相关靶点,绘制药物成分-药物靶...     

基于网络药理学研究葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的分子作用机制

目的:通过网络药理学方法探讨葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的具体分子机制.方法:通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库对葛根芩连汤主要成分及潜在作用靶点进行收集.从DisGeNET数据库中寻找与溃疡性结肠炎相关的疾病基因与潜在靶点进行映射,得出该方治疗溃疡性结肠炎的最终作用靶标.将最终靶标输入STRING数据库得出"蛋白-蛋白"相互作用关系,并用Cytoscape软件进行可视化.输入DAVID数据库进行GO、KEGG PATHWAY富集,得出其可能作用的分子机制并构建"成分-靶标-信号通路"网络图.结果:通过网络药理学预测后发现,葛根芩连汤中有127个有效成分可用于治疗溃疡性结肠炎,其中涉及155个靶基因及包括TNF、NF-kB、HIF-1等在内的22个信号通路.结论:从网络药理学角度初步揭示了其治疗溃疡性结肠炎的分子机制,为后续的研究提供了基础.     

基于网络药理学和分子对接探讨当归建中汤治疗痛经的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨当归建中汤治疗痛经的有效成分、潜在靶点及作用通路,阐述其作用机制.方法:通过TCMSP网站建立当归建中汤有效成分与靶点数据库,利用CTD、DisGeNET、Drugbank数据库筛选痛经相关的靶点,对药物靶点与疾病靶点取其交集,利用STRING数据库构建PPI蛋白作用关系,clus...     

网络药理学方法研究石菖蒲治疗神经退行性疾病的作用机制

目的 从系统水平研究石菖蒲治疗神经退行性疾病的有效成分和作用机制.方法 采用计算机网络药理学方法,从中药系统药理学数据库中筛选石菖蒲治疗神经退行性疾病的活性成分,并构建药物-靶标-疾病网络.结果 通过网络药理学方法筛选出石菖蒲活性成分20种,显示该中药化学成分和作用靶点与阿尔茨海默病、抑郁症和帕金森综合征等神经退行性疾病之间存在一定的联系.结论 通过网络药理学方法构建的石菖蒲网络可以将该中药化学成分的聚类、差异以及有效成分与相关靶标及疾病的复杂分子作用机制可视化.     

壮肾固精方治疗IgA肾病的网络药理学机制

[目的]基于网络药理学预测壮肾固精方治疗IgA肾病的作用机制,为后续相关实验研究提供理论基础.[方法]通过TCMSP数据库和TCMID数据库获得壮肾固精方的有效化学成分和作用靶点,通过OMIM数据库、GeneCards数据库及PharmGkb数据库获得IgA肾病的相关基因,取交集后得到壮肾固精方和IgA肾病的核心基因....     

基于“成分-靶点-通路”的余甘子网络药理学研究

目的：运用网络药理学方法,研究余甘子的有效成分和作用机制。方法：从中药系统药理学数据库和分析平台检索余甘子的生物活性成分、作用靶点和相关疾病,利用STRING数据库研究靶点间的相互作用关系,利用DAVID数据库分析GO和KEGG,利用Cytoscape及Hiplot软件建立“化合物-靶点”网络、蛋白质相互作用网络（PPI）、“化合物-靶点-疾病-通路”网络进行基因本体（GO）和KEGG富集分析。结果：筛选得到12个有效生物活性成分、59个靶点、107种疾病和113条通路,基因功能分析得到生物学过程（BP）相关通路479条、细胞成分（CC）相关通路44条、分子功能（MF）相关通路78条。结论：余甘子通过广泛作用于多条细胞代谢通路,调节细胞增殖、分化、凋亡的过程,发挥抗炎、抗癌活性作用。网络药理学研究有助于揭示余甘子多成分作用的协同机制。     

基于网络药理学探讨加味柴苓汤治疗高脂血症性胰腺炎作用机制

目的 基于网络药理学方法分析加味柴苓汤治疗高脂血症性胰腺炎的作用机制,为临床的合理使用、动物实验、新药研发提供依据.方法 通过中医药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform...     

基于网络药理学探讨知柏地黄汤治疗前列腺癌的作用机制

目的 基于网络药理学探讨知柏地黄汤治疗前列腺癌的作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和UniProt数据库获取知柏地黄汤有效成分及作用靶点,通过OMIM和CTD数据库筛选前列腺癌的相关靶点,将有效成分靶点与疾病靶点取交集,运用Cytoscape 3.7.1软件构建药物-有效成分-靶点-疾病网...     

参芪地黄汤治疗糖尿病肾病的网络药理学机制

目的 通过采用网络药理学方法,探讨参芪地黄汤治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制.方法 利用TCMSP数据库平台查找参芪地黄汤的有效化学成分及与化学成分相关的潜在靶点,并在UniProt数据库中对靶点的名称标准化.再利用Gene Cards数据库、OMIM数据库筛选出与DN相关的疾病靶点,并通过Cytoscape 3.7....     

基于网络药理学的芪参益气滴丸治疗心肌梗死机制研究

目的 采用网络药理学的方法 探究芪参益气滴丸治疗心肌梗死(MI)的药理作用机制.方法 使用中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)检索芪参益气滴丸中药复方中四味草药的所有活性化合物成分和作用靶点;通过OMIM、TTD、PharmGKB、DisGinNET及DrugBank数据库对MI的相关疾病靶点进行检索,并与药物...     

基于网络药理学探讨牛大力治疗抑郁症的活性成分及分子机制

目的:采用网络药理学方法研究牛大力治疗抑郁症的活性成分及作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)与文献资料检索筛选出牛大力活性成分;运用Swiss Target Prediction预测成分靶点,并从Gene Cards数据库中预测抑郁症相关靶点;同时,采用Cytoscape 3.2.1软件构建活...     

基于网络药理学和分子对接方法探析黄芪预防新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制

目的 运用网络药理学与分子对接的方法探讨黄芪预防新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在干预机制.方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及相关文献,筛选及预测黄芪的活性成分及潜在作用靶标,将草药靶标导入到STRING平台进行PPI网络构建,并通过Cytoscape软件将结果进行网络化展示,通过网络...     

基于网络药理学与分子对接技术的荆银合剂干预新型冠状病毒肺炎的作用机制研究

目的 应用网络药理学和分子对接的方法 ,探讨荆银合剂干预新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的分子靶点及可能机制.方法 ? 利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索荆银合剂的潜在入血活性成分和靶点.通过GeneCard数据库检索COVID-19相关靶点.利用STRING 10.5软件构建荆银合剂成分靶点与C...     

基于网络药理学探究祛瘀平肝化痰汤降压作用机制及实验验证

目的 运用网络药理学探讨祛瘀平肝化痰汤治疗高血压病的可能靶点及作用机制,并选取部分关键靶点及通路进行实验验证,为其临床应用及后续研究提供理论支持.方法 运用TCMSP、BATMAN、TCMIP网络药理学分析平台挖掘祛瘀平肝化痰汤的中药有效成分,运用SWISS、STITCH数据库整理其作用靶标;以OMIM、TTD、Gen...     

蒙药复方协日嘎-4的网络药理学研究

目的对蒙药复方协日嘎-4进行网络药理学研究,探索其治疗前列腺增生、前列腺癌等疾病的活性成分和作用靶点,运用计算机网络药理学技术对协日嘎-4所含化学成分的作用机制进行分析。方法通过中国知网,万方数据库等数据库筛选蒙药复方协日嘎-4所含化合物信息,通过Pubmed、Super Target、Drug Bank、TTD(Therapeutic Targets Database)等数据库收集蒙药协日嘎-4中化学成分对应的靶点,通过KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)、IPA(Ingenuity Pathway Analysis)等数据库收集相关信号通路,采用Cytoscape软件建立多成分-多靶点和多成分-多靶点-多疾病网络模型。结果药物与靶点之间存在的相关性为潜在靶点的探索提供了一条新途径。筛选结果显示蒙药复方协日嘎-4中有33种化合物与12种生物靶标存在网络交互作用,他们之间的相关性,揭示了网络药理学"多成分""多靶点"的特征。同时化合物与靶点连接最终共同作用于疾病即良性前列腺增生和前列腺癌,建立了蒙药复方协日嘎-4化学成分-靶点-疾病网络模型。通过数据库筛选得到两条主要信号通路,雄激素受体(AR)信号通路和Wnt/β-连环蛋白(Wnt/β-catenin)信号通路。结论本文建立了一条"疾病-靶点-药物"的蒙药复方网络药理学的研究模式,为蒙药的研究和发展提供了新的思路和方法。