外周血B淋巴细胞半套式PCR法扩增人抗体基因

目的用半套式PCR法,以一组人抗体重链和轻链引物直接从人外周血淋巴细胞中扩增人全套抗体基因片段.方法从不同人群外周血淋巴细胞中提取总RNA,经反转录后,以免疫球蛋白信号肽序列引物和家族特异性免疫球蛋白可变区基因引物,进行半套式PCR扩增人全套抗体基因片段.结果采用不同的引物进行重链、轻链Kappa和Lambda链的半套式PCR扩增,均能获得相应大小的PCR产物,其结果扩增率达到100%.结论在建立抗体基因文库时,半套式PCR法能进一步丰富扩增的抗体基因的多样性,可弥补由于转化效率不高而降低抗体库多样性的不足.     

从人外周血B淋巴细胞中应用PCR扩增人抗体基因

本文用常规ＰＣＲ法和半套式ＰＣＲ法，以一组人抗体重链和轻链引物，直接从人外周血淋巴细胞中扩增出抗体重链Ｆｄ基因和轻链基因。一些常规ＰＣＲ法不能直接扩增的人抗体基因，用半套式ＰＣＲ法扩增却得到了阳性结果。扩增的抗体基因的分子量与国内外同类报道一致。本文结果提示，在建立抗体基因文库时，半套式ＰＣＲ法能进一步丰富扩增的抗体基因的多样性     

前列腺癌患者抗体库构建中抗体基因的扩增

目的：探讨如何扩增出种类更多、产量更丰的免疫球蛋白基因，从而增加抗体库的多样性，为抗体库的构建及筛选奠定基础。方法：分离前列腺癌患者外周血淋巴细胞，提取其总RNA，逆转录为cDNA，通过改变PCR反应条件扩增出全部κ、λ轻链及大部分重链Fd段；改变PCR反应条件扩增未成功的重链片段改用半套式PCR进行扩增。结果：不仅所有引物都扩增出产物，而且其产量也较高。结论：这表明改变PCR反应条件与半套式PCR联合应用可扩增出种类更多、产量更丰的免疫球蛋白基因，从而增加抗体库的多样性，为抗体库的构建及筛选奠定基础。     

抗D二聚体的人源性噬菌体抗体库的构建

目的：应用噬菌体展示技术构建人源性抗D二聚体噬菌体抗体抗体组合文库。 方法： 从不同人群外周血淋巴细胞中提取总RNA，经反转录后，以免疫球蛋白信号肽序列引物和家族特异性免疫球蛋白可变区基因引物,进行半套式PCR扩增人全套抗体基因片段，并克隆于pComb3H载体，电转化大肠杆菌XL1-Blu，在辅助噬菌体的超感染下，构建噬菌体抗体组合文库。 结果： 采用不同的引物进行重链、轻链Kappa和Lambda链的半套式PCR扩增，均能获得相应大小的PCR产物，其结果扩增率达到100％。经4次电转化构建了库容为2.8×108的抗体库,轻、重链基因的重组率为46％，经辅助噬菌体的超感染，得到噬菌体滴度为4.1×1017PFU /L的人源性噬菌体抗体库。 结论： 成功构建了含抗D二聚体的人源性噬菌体抗体库，为进一步筛选抗D二聚体的Fab噬菌体抗体奠定了基础。     

人源噬菌体Fab抗体库构建过程中引物的优化和初步鉴定

目的 优化设计一套引物，扩增全套人抗体Fd片段和L链基因，改善扩增效率，益于人源噬菌体抗体库的构建。方法 根据V-BASE数据库提供的人抗体可变区胚系基因，在其家族分类基础上，根据FR1区5’端保守序列重新分组，设计特异性的5’端扩增引物。同时对设计引物的匹配情况进行分析，并应用PCR扩增和测序反应对其扩增效果进行鉴定。结果 Fd链5’端扩增引物有5条，κ轻链有6条5’端扩增引物，而λ轻链5’和3’扩增引物有10条。分析表明，人抗体可变区胚系基因与5’引物有较好的匹配率，数目较少，匹配率较高。PCR结果显示，全部的重链及轻链引物对均能高效扩增出特异性较高的目的片段。测序结果表明PCR扩增产物具有较好的亚类和可变区家族分布。结论 优化了一套扩增全套人抗体Fd片段和L基因的引物，为人源噬菌体抗体库的构建奠定了良好的基础。     

天然人源IgG Fab噬菌体抗体库的构建及多样性分析

目的:构建天然人源IgGFab噬菌体抗体库并分析来源于健康人外周血B淋巴细胞的抗体基因可变区的多样性及优势选择。方法:以DNA重组技术从300名健康志愿者的外周血淋巴细胞中扩增出全套人抗体轻链及重链Fd基因,分别插入噬菌体载体pFabICN相应位置,构建天然人源免疫球蛋白G基因文库;进一步从抗体库中随机挑选克隆,获得重轻链基因进行核苷酸序列测定并利用IgBLAST数据库分析抗体基因可变区的同源家族。结果:从4×108库容的天然人源IgGFab噬菌体抗体库中随机挑选克隆,对其中32个轻链及重链Fd基因插入正确的克隆进行核苷酸序列测定和氨基酸序列的推算,获得29条彼此完全不同的Fd重链基因及轻链基因。以IgBLAST数据库比对分析显示29条重链基因的V区分别属于VH3(72.4%),VH1(10.3%),VH4(6.9%),VH5(6.9%)和VH7(3.4%)基因家族。29条轻链基因分别属于Vκ1(44.8%),Vκ2(15.4%),Vκ3(11.5%),Vκ4(23.1%)基因家族和Vλ1(11.5%)基因家族。结论:以300份健康人外周血淋巴细胞的抗体基因构建的天然人源IgGFab噬菌体抗体库基因多样性良好,重链VH3基因家族存在优势表达。     

人源性天然噬菌体展示文库的构建及鉴定

目的:构建人源性天然噬菌体展示文库并对文库进行鉴定。方法:从未经主动免疫健康志愿者的外周血淋巴细胞中提取总RNA,反转录合成cDNA,用直接PCR及半巢式PCR扩增人抗体重链(VH)及轻链(Vκ和Vλ)可变区基因。采用改进的重叠延伸PCR法将VH基因和VL(Vκ和Vλ)基因连接成人单链抗体(scFv)基因,并将scFv文库基因克隆到噬菌体载体pCANTAB-5E中,电转化E.coliTG1,构建单链抗体文库。结果:采用直接PCR和半巢式PCR扩增得到42条VH基因片段,16条Vκ基因片段,18条Vλ基因片段。混合的VH和VL等摩尔比连接后,产生的单链抗体文库基因大小为750bp左右;转化后构建了文库容量为1.35×108的单链抗体文库。BstNⅠ酶切分析文库中的单链抗体基因结果显示,酶切得到的scFv指纹图谱均不相同。结论:构建的抗体文库多样性好,可用于多种人源性单链抗体的筛选。     

多样性人源天然噬菌体抗体库的构建及初步应用

目的:构建多样性良好的人源天然噬菌体抗体库。方法:从正常人外周血中分离淋巴细胞,以RT-PCR和半巢式PCR扩增重链可变区VH基因和轻链可变区VL基因,以重叠延伸PCR将VH、VL组装成scFv基因,并将其克隆入噬菌粒载体pCANTAB-5E中。以pCANTAB-5E电转化大肠杆菌TG1,构建人源天然噬菌体抗体库,测序分析抗体基因的家族信息和多样性,并用多种抗原对其进行筛选。结果:获得了库容为2×108的人源天然噬菌体抗体库。分别用5种抗原对其进行筛选,均可获得特异性噬菌体抗体的富集。结论:成功地构建了一个多样性良好的人源天然噬菌体抗体库,可用于制备具有应用前景的人源抗体。     

重组人G－CSF免疫小鼠全套单链抗体噬菌体表面展示文库的构建

利用全套噬菌体抗体表面展示技术,绕过杂交瘤技术,从重组人G－CSF免疫的小鼠脾淋巴细胞中提取总RNA,反转录成cDNA后,用抗体可变区PCR混合引物进行全套抗体重、轻链可变区（VH和VL）基因的扩增。经重叠延伸反应,在体外随机装配成单链抗体（ScFv）。将其克隆至噬菌粒载体pCANTAB5E中,电转化含SupE的     

单克隆抗-D细胞株的建立及抗-D抗体Fab段的基因序列分析

目的:建立分泌抗-D抗体的人B淋巴细胞株,分析编码一株人单克隆抗-D抗体Fab段的基因序列。方法:以EB病毒(EBV)转化分泌抗-D抗体的人B淋巴细胞,建立分泌抗-D抗体的淋巴细胞株。设计扩增人lgM重链Fd段及κ轻链的引物,以聚合酶链反应进行扩增,对扩增产物进行分子克隆及测序。结果:分别用轻链引物和重链引物从一分泌lgM抗-D的单克隆细胞株扩增出一约650bp和700bp的特异带。序列分析表明,其核苷酸及其所推导的氨基酸(AA)序列符合人lgFab段的序列特征。结论:获得了抗-D抗体Fab段基因,为基因工程抗-D的研制及Rh新生儿溶血病的预防提供物质基础。     

Oligonucleotide primers for polymerase chain reaction amplification of human immunoglobulin variable genes and design of family-specific oligonucleotide probes

In recent work, the polymerase chain reaction (PCR) has been used to amplify rearranged mouse and human immunoglobulin heavy and kappa light chain variable (V) genes. Here we have optimized the design of the PCR primers for human V genes and used them to amplify cDNA from human peripheral blood lymphocytes. Cloning and sequencing revealed a diverse repertoire of V genes, and the presence of members of each human V gene family. After alignment of the sequences, we identified a region conserved within V gene families, but differing between families, and used this to design family-specific oligonucleotide probes.     

V-Region and Class Specific RT-PCR Amplification of Human Immunoglobulin Heavy and Light Chain Genes from B-Cell Lines

We have designed and tested primers that amplify complete human kappa and lambda light chain genes, and human Fd fragments from gamma, mu and alpha heavy chain genes. These primers were tested for efficiency and specificity on monoclonal sources of human immunoglobulin RNA, obtained from human B-cell lines of known immunoglobulin gene expression. Analysis of the sequences derived from these B-cells confirms the specificity of the PCR primers and the extent of somatic mutation seen in different B-cell malignancies supports existing concepts for differing aetiologies in the tumours concerned.     

人源抗人免疫缺陷病毒1型噬菌体抗体库的构建及筛选

目的构建人免疫缺陷病毒１型（ＨＩＶ－１）特异性噬菌体抗体库，制备人源抗ＨＩＶ－１ｇｐ１２０单克隆抗体。方法以半巢式聚合酶链反应（ＰＣＲ）从ＨＩＶ－１感染者外周血单个核淋巴细胞中扩增抗体重链Ｆｄ和轻链（ｋ）基因，与噬菌体载体ｐＣｏｍｂ３连接，构建噬菌体抗体Ｆａｂ组合文库。对抗体库进行３轮吸附－洗脱－扩增的亲和选择后，以ＥＬＩＳＡ法筛选抗ＨＩＶ－１ｇｐ１２０噬菌体抗体，并进行ＤＮＡ序列分析和Ｆａｂ的可溶性表达。结果半巢式ＰＣＲ有效地扩增出Ｆｄ和ｋ基因，以此构建成容量为１９５×１０７的噬菌体抗体库。３轮亲和选择使特异性抗体得到高度富集，抗ＨＩＶ－１ｇｐ１２０噬菌体抗体阳性克隆占３２％。对一阳性克隆抗体基因ＣＨ１和ＣＬ部分ＤＮＡ序列进行了测定，并在大肠杆菌表达出可溶性Ｆａｂ。结论抗ＨＩＶ－１特异性噬菌体抗体库的构建和人源抗ＨＩＶ－１ｇｐ１２０单克隆抗体的制备为今后筛选抗ＨＩＶ中和抗体奠定了基础，具有重要的应用价值。     

Cloning and sequencing of human lambda immunoglobulin genes by the polymerase chain reaction

Universal oligonucleotide primers, designed for amplifying and sequencing genes encoding the rearranged human lambda immunoglobulin variable region, were validated by amplification of the lambda light chain genes from four human heterohybridoma cell lines and in the generation of a cDNA library of human V lambda sequences from Epstein-Barr virus-transformed human peripheral blood lymphocytes. This technique allows rapid cloning and sequencing of human immunoglobulin genes, and has potential applications in the rescue of unstable human antibody-producing cell lines and in the production of human monoclonal antibodies.     

从兔外周血直接克隆B细胞κ轻链的可变区

目的 从兔外周血总RNA中直接扩增出B细胞κ轻链的可变区序列.方法 首先从IMGT/GENE-DB数据库中获取大耳白兔Ig胚系基因Vκ(IGKV)、Jκ(IGKJ)和Cκ(IGKC)的cDNA序列、设计引物,然后以非免疫兔外周血总RNA为模板进行RT-PCR扩增,回收产物并克隆到T载体,随机挑选单克隆测序,最终将序列提交到IMGT/V-QUEST,分析出每个克隆的Vκ-Jκ组合,并利用BioEdit的本地Blast程序比较出Cκ的基因型.结果 共设计出4对引物,其中引物对RK.C1[4-5-9]无产物,引物对RK.C1[1-2-7]、RK.C1[3-6-8]和RK.C2[1-2-3-4]有产物,分别回收、克隆到T载体后各挑取20个克隆,共获得51个克隆的插入子序列.没有任何2个克隆的插入子序列完全相同,每个克隆均包含完整的兔Vκ、Jκ及Cκ的5'端序列,其中Vκ-Jκ-IGKC1组合的克隆33个,Vκ-Jκ-IGKC2组合的克隆18个;68个Vκ胚系基因中有22个出现,其中频率最高的是IGKV1S10*01(12次),其次是IGKV1S36*01、IGKV1S37*01和IGKV1S4*01(各5次),其余均为3次以下;8个Jκ胚系基因中只有1个出现,为IGKJ1-2*01;2个Cκ基因的等位基因分别为IGKC1*01和IGKC2*03.33个Vκ-[IGKJ1-2*01]-[IGKC1*01]克隆中有17种不同的组合方式,其中频率最高的为[IGKV1S10*01]-[IGKJ1-2*01]-[IGKC1*01](7次).18个Vκ-[IGKJ1-2*01]-[IGKC2*03]克隆中有11种不同的组合方式,频率最高的为[IGKV1S10*01]-[IGKJ1-2*01]-[IGKC2*03](5次).Vκ-Jκ-Cκ组合方式相同的克隆,序列仍具有明显的差异.结论 利用自行设计的兼并引物,成功并特异地从兔外周血总RNA中直接扩增出了κ轻链的可变区,且产物具有良好的多样性,但所有Vκ-Jκ-Cκ组合中只出现了1种Jκ基因.     

人源抗丙型肝炎病毒噬菌体抗体库的构建、筛选及表达

用常规RT PCR法 ,直接从 5名丙型肝炎患者外周血混合淋巴细胞中扩增抗体重链Fd基因和κ轻链基因 ,构建噬菌体抗体Fab库。对抗体库进行 5轮吸附 洗脱 扩增的亲和选择后 ,以ELISA法鉴定抗HCV噬菌体抗体。 5轮亲和选择使特异性噬菌体抗体得到高度富集 ,抗HCV噬菌体抗体阳性克隆达 96 %。对一阳性克隆在大肠杆菌中表达 ,经ELISA及Westernblot分析鉴定 ,证实成功表达出人源可溶性Fab。对抗体基因VH和VκDNA序列进行测定 ,证实所获基因为抗体可变区基因。抗HCV噬菌体抗体库的构建和人源抗HCV单克隆抗体Fab段的制备 ,为HCV感染的诊断、治疗和发病机制的研究提供有效的分子工具。     

PCR-based clonality analysis of B-cell lymphomas in paraffin-embedded tissues: diagnostic value of immunoglobulin kappa and lambda light chain gene rearrangement investigation

Polymerase chain reaction (PCR)-based analysis, employed for detecting immunoglobulin heavy chain (IgH) gene rearrangements, has become a diagnostic tool widely used in the investigation of B-cell lymphomas, but the overall sensitivity of these methods does not exceed 80%, notably in germinal center (GC) and post-GC B-cell origin lymphomas. Many PCR strategies devised for detecting immunoglobulin light chain (IgL) gene rearrangements have been developed to enhance the clonality detection rates. However, the feasibility of these methods in routine clinical diagnosis using paraffin-embedded tissues has not yet been investigated sufficiently. We studied a large series of 108 cases of B-cell lymphomas, as well as 20 reactive lymphoid tissues using degenerate primers to amplify immunoglobulin kappa (Igkappa) and lambda (Iglambda) light chain genes. B-cell clonality was further investigated using semi-nested PCR for IgH gene rearrangements. B-cell clonality was detected in 74%, 56.5%, and 43.5% of cases using IgH, Igkappa, and Iglambda PCR, respectively. By combining these methods, the clonality detection rate increased to 93.5%. Only polyclonal patterns were noted in reactive lymphoid samples. We concluded that in addition to the established methods for IgH analysis, a PCR-based approach for IgL gene rearrangements analysis improves the clonality detection rate in over 90% of B-cell lymphoma cases using routine histological specimens with poor preservation of the genomic DNA.