中国北方汉族人群HBV携带者和慢性乙肝患者TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性分析

目的探讨在中国北方汉族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性（SNPs）及其单倍型是否与HBV感染结局相关联。方法以212例无症状HBV携带者和207例慢性乙肝患者为研究对象,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）和序列特异性引物-PCR（SSP-PCR）方法对TNF-α基因启动子区5个位点,进行基因分型,用EPI和EH等软件分析各位点等位基因、基因型、单倍型频率及其组间差异。结果TNF-α基因-238GG基因型和-863CC基因型是HBV感染后个体发生乙型肝炎慢性化的易感因素（P=0．05,P〈0．01）。5个位点组成的单倍型GGCCT在慢性肝炎组的频率显著低于无症状携带组（P〈0．05）,单倍型GGCAT和GGTAT在慢性肝炎组的频率显著高于无症状携带组（P〈0．05）。结论TNF-α基因启动子区多态性可能是影响HBV感染结局的重要宿主遗传因素之一。     

TGF-β1基因启动子-800G/A、-509C/T多态性与食管癌的研究

目的研究转化生长因子β1(TGF-β1)基因启动子多态性各等位基因及基因型在食管癌患者中的分布频率,初步分析其基因型及血清水平与食管癌的相关性.方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,检测118例食管癌患者和130例正常对照组TGF-β1的基因多态性,包括TGF-β1基因启动子-800G/A、-509C/T位点,同时采用ELISA检测血清TGF-β1水平.结果食管癌患者血清TGF-β1水平显著高于对照组(P＜0.01),TGF-β1基因-800G/A位点多态性在食管癌组和正常人群中的分布差异无显著性(P＞0.05),而TGF-β1基因-509C/T多态性各等位基因及基因型频率在两组人群中的分布差异存在显著性(P＜0.05);等位基因频率的相对风险分析发现,T等位基因携带者患食管癌的风险是C等位基因的1.624倍(OR=1.624,95%CI1.134～2.324),携带T等位基因的食管癌患者血清TGF-β1水平显著高于不携带者(50.97±8.91μg/LVS44.23±8.54μg/L,P＜0.01).结论TGF-β1基因-509C/T多态性与食管癌的发病具有相关性,其中T等位基因可能是食管癌发病的遗传易感基因;携带T等位基因的个体可能通过促进TGF-β1的高度表达进而增加了食管癌的发病风险.     

中国汉族人群TNF-α基因启动子区的多态性研究

目的：研究中国汉族人群TNF-α基因启动子区的基因多态性。方法：采用PCR-SBT（PCR Sequencing Based Typing）方法进行TNF-α基因启动子区的多态检测。结果：采用PCR-SBT方法可以成功获得TNF-α基因启动子区的多态性结果并能够发现新的多态性位点；本次研究发现中国汉族人群TNF-α基因启动子区的多态性位点有：-1031、-863、-857、-572、-308、-238、-204和-163，其中-572和-204的多态性位点为首次报道；我国汉族人群该区域的核酸差异性为（11.00±0.46）×10-4，低于非洲人群；与Malawi人群相比，我国汉族人群-1031C、-308A、-238A出现频率较低，而-857T的频率却较高；与Gambian人群相比，-863A和-857T出现频率较高，-308A出现频率较低；我国汉族人群TNF-α基因启动子区的-1031C、-863A、-857T与-572C、-308A、-238、-204C、-163C有相关性。结论：采用PCR-SBT方法可以成功对TNF-α基因启动子区的基因多态性进行研究，我国汉族人群TNF-α基因启动子区的基因多态性可能存在独特的特点。     

TNF-α-238G/A基因多态性与原发性肝癌的关系

目的 探讨肿瘤坏死因子-α（TNF-α）基因启动子-238G/A多态性与原发性肝癌（PHC）的相关关系.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法（PCR-RFLP）检测100例PHC患者和150例健康对照者TNF-α基因启动子-238G/A多态性.结果 TNF-α-238基因型GG、GA频率在PHC组和对照组分别为95.3%和4.7%,88%和12%;等位基因G、A频率在PHC组和对照组分别为97.7%和4.7%,94%和6%.两组差异均有显著性（P＜0.05）,携带GA基因型个体患PHC的风险约是GG基因型的2.786倍（OR=2.786,95%CI=1.057～7.343）.结论 TNF-α-238G/A基因多态性与PHC的发病有相关性,A等位基因可能是PHC的遗传易感基因.     

TNFα-308G/A和-850C/T基因多态性与葡萄膜炎相关性的初步探讨

目的探讨肿瘤坏死因子(TNF)α-308G/A和-850C/T基因多态性与葡萄膜炎的关系。方法收集2005-2010年在番禺区人民医院、番禺区石碁人民医院、广州市红十字会医院和广州医学院第二附属医院眼科就诊的葡萄膜炎患者51例,119名对照组均为广州医学院第二附属医院体检者,运用多聚酶链反应技术检测51例葡萄膜炎及119例正常人TN-Fα-850C/T基因多态性。结果葡萄膜炎组TNFα-308G/G、G/A、A/A表型频率分别为0.7647、0.1765、0.0588,对照组分别为0.7899、0.1681、0.0420;葡萄膜炎组TNFα-308G、TNFα-308A基因频率分别为0.8739、0.1261,对照组分别为0.8529、0.1471,葡萄膜炎组TNFα-850 C/C、T/C、T/T表型频率分别为0.7059、0.2745、0.0196,对照组分别为0.7899、0.1932、0.0168;葡萄膜炎组TNFα-850 C、TNFα-850 T基因频率分别为0.8431、0.1569,对照组分别为0.8866、0.1134;TNFα-850C/T各种基因型频率在葡萄膜炎组与正常对照组之间差异无统计学意义(P>0.05)。结论TNFα-308G/A和-850C/T基因多态性与葡萄膜炎无明显相关。     

PAI-1基因启动子区4G/5G单核苷酸多态性与乳腺癌的相关性研究

目的研究纤溶酶原激活剂抑制物-1(plasminogen activator inhibitor-1,PAI-1)基因启动子区单核苷酸插入/缺失(4G/5G)多态性在温州地区的分布特点及其与乳腺癌之间的关系.方法病例组:53例乳腺癌患者.对照组:在温州汉族人群中随机选取146例女性为对照.应用聚合酶链式反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显带技术对上述人群进行PAI-1基因启动子区4G/5G多态性分析.结果 (1)正常女性与正常男性比较4G/4G、4G/5G、5G/5G基因型中,女性5G/5G基因型高于男性(χ2=6.626 P=0.01).(2)疾病和对照组的基因型和基因频率均无显著性差异(P>0.05).结论 (1)PAI-1基因启动子区4G/5G单核苷酸多态性随种族和地区的不同而存在差异.(2)PAI-1基因启动子区单核苷酸插入/缺失(4G/5G)遗传多态性与乳腺癌的发生发展可能没有直接相关性.     

贵州三个主要民族人群TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性分析

目的：了解贵州汉族、苗族、布依族人群肿瘤坏死因子α（Tumour necrosis factor alpha,TNF-α）基因启动子区的基因多态性。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）和序列特异性引物-聚合酶链反应（SSP-PCR）方法,对贵州汉族、苗族、布依族人群中TNF-α基因启动子区已知的5个多态性位点进行基因分型检测,并用统计学方法分析各位点基因型、等位基因频率和单倍型及其组间差异。结果：贵州汉族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238（G,96%;A,4.0%）、-308（G,92%;A,8%）、-857（C,65.0%;T,35.0%）、-863（C,80.0%;A,20.0%）、-1031（T,48.0%;C,52.0%）,其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC和GG-GG-TT-CC-TC为主,分别占32.0%和28.0%;苗族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238（G,85.0%;A,15.0%）、-308（G,94.0%;A,6.0%）、-857（C,74.0%;T,26.0%）、-863（C,96.0%;A,4.0%）、-1031（T,50.0%;C,50.0%）,其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC和GG-GG-TT-CC-TC为主,分别占50.0%和24.0%;布依族人群中TNF-α基因启动子区5个位点的等位基因频率分别为-238（G,86.0%;A,14.0%）、-308（G,92.0%;A,8.0%）、-857（C,89.0%;T,11.0%）、-863（C,84.0%;A,16.0%）、-1031（T,50.0%;C,50.0%）,其单倍型以GG-GG-CC-CC-TC占54.0%,AA-GG-CC-CC-TC和GG-GG-CC-AA-TC各占12%。结论：贵州汉族、苗族、布依族人群中TNF-α基因启动子区单核苷酸多态性具有独特的特征,这为TNF-α基因多态性与疾病的相关性研究提供了基础资料。     

载脂蛋白(a)启动子-418A/G位点和-384C/T位点单核苷酸多态性的研究

目的:研究载脂蛋白(a)启动子区-418位点和-384位点的单核苷酸多态性(SNP),比较种族间单核苷酸的基因型频率分布差异,探讨它们对血脂的影响及同冠状动脉疾病(CHD)的相关性。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的分析方法,检测了中国湖北汉族人群无血缘关系的156名健康者及56例CHD患者和65例无血缘关系的非洲贝宁黑种人的Apo(a)启动子-418位点、-384位点单核苷酸的基因型,并对作为酶切底物的PCR产物进行了T-载体法克隆测序。同时,测定血清脂蛋白(a)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、ApoAI及ApoB浓度。结果:(1)在对照组中Apo(a)启动子区-418位点只存在等位基因A,未见等位基因G,只有AA基因型,-384位点只存在等位基因C,未见等位基因T,仅有CC基因型;CHD组中,-418位点仅检出1例突变型(GG型),-384位点只有CC型,未发现突变基因T。(2)贝宁黑种人组中,-418位点检出两例突变型(GG型),其他均为AA基因型;-384位点只存在等位基因C,也未发现突变基因T,只有CC基因型。(3)测序结果表明对照人群中Apo(a)基因启动子区(-541--341)序列与GenBank所公布的序列是一致的,并且-418位点碱基为A,-384位点碱基为C。结论:汉族人群中Apo(a)基因启动子区-418位点和-384位点碱基突变率较低,不构成单核苷酸多态性(SNP),与脂质水平及CHD未显示相关性;贝宁黑种人-418位点具有多态性;在种族间的SNP可能存在着较大的差异。     

胆固醇7α-羟化酶基因-204A/C多态性与内源性高甘油三酯血症关联的研究

目的探讨成都地区内源性高甘油三酯血症（hypertriglyceridemia，HTG）患者胆固醇7α-羟化酶（cholesterol 7α-hydroxylase，CYP7A1）基因一204A／C多态性与血脂及载脂蛋白的关系。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测212名正常对照者和132例内源性HTG患者CYP7A1-204A／C基因多态性。酶法测定血清甘油三酯（triglyceride，TG）、总胆固醇（total cholesterol，TC）及高密度脂蛋白胆固醇（high density lipoprotein cholesterol，HDL-C），用本校载脂蛋白研究室研制的RID试剂盒测定血清apoAI、A1I、B100、CH、C111及E。结果CYP7A1—204A／C多态位点等位基因A、C频率在HTG组和正常对照组分别为0．602、0．398和0．601、0．399。等位基因频率和基因型频率分布均符合Hardv—Weinberg平衡定律。CYP7A1—204A／C多态性基因型频率，等位基因A、c频率在HTG组和正常对照组间比较差异无统计学意义（P〉0．05）。HTG组CC、AC基因型患者血清TG和apoCⅢ水平较从基因型患者显著增高（P〈0．05）。血清HDL-C水平在正常对照组中CC、AC基因型者较AA基因型者显著降低（P〈0．05），正常对照组中男性CC、AC基因型者血清TG水平较从基因型者显著增高（P〈0．05）。结论CYP7A1基因-204A／C多态性与HTG无关联，但HTG患者CYP7A1基因-204A／C多态性与血清TG和apoCⅢ水平密切相关。CYP7A1基因-204A／C多态性在正常对照组中与血清HDL-C水平密切相关，在正常男性人群中与血清TG水平增高密切相关。     

湖北地区汉族健康人群白细胞介素-1α基因启动子-889C/T位点多态性的研究

目的 :了解湖北地区汉族健康人群白细胞介素 1α基因 (IL 1A )启动子 -889位点的单核苷酸多态性 (SNP) ,比较其在不同种族间的分布特点。方法 :采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)分析的方法 ,检测 184名健康者IL 1A启动子 -889位点的SNP ,分析其基因型和等位基因频率。结果 :CC、CT、TT三种基因型 ,以C等位基因发生频率最高 ( 92 .4% ) ,T等位基因次之 ( 7.6% ) ;与挪威人群比较 ,其基因型和等位基因频率均存在极显著性差异 (P <0 .0 0 1) ,而与日本人群相比也有显著差异 (P <0 .0 5)。结论 :IL 1A启动子 -889位点存在SNP ,其在不同种族间的分布存在明显的差异 ,这种差异有可能是导致一些疾病在不同种族间的发病率和临床表现显著不同的因素之一     

云南省傣族、汉族人群乙型肝炎病毒感染与IL-6-572C/G和IFNAR1-168G/C的关联性研究

目的:探讨云南省西双版纳地区傣族和汉族人群IL-6-572C/G和I型干扰素受体1(interferon alpha receptor 1,IFNAR1)-168G/C位点单核苷酸多态性与乙型肝炎病毒(HBV)感染后疾病转归的关联性。方法:采集西双版纳州傣族、汉族人群血液样本共600份,其中每个民族包括健康对照组100名、HBV感染患者200名(含100名自限性恢复患者和100名慢性乙肝患者),运用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)和DNA测序技术对IL-6-572C/G和IFNAR1-168G/C位点进行基因分型。结果:傣族人群中,-572C/G位点基因型多态性与HBV感染后转归的关联性并无统计学显著性。C、G等位基因型在HBV感染组、正常对照组之间和慢性乙肝组、自限恢复组之间差异无统计学显著性。但是在G显性模式(GG+CG/CC)下,GG+CG基因型为HBV感染者发展成为慢性乙型肝炎患者的保护因素(P0.05)。汉族人群中,-572C/G位点基因型和等位基因分布频率在各组比较中无统计学显著性,并且在G显性模式和G隐性模式比较中也无统计学显著性。在上述4种比较中,IFNAR1-168G/C位点在汉族和傣族样本中的差异均无统计学显著性。结论:IL-6-572C/G位点GG+CG基因型可能是傣族人群中HBV感染者发展成为慢性乙型肝炎的保护因素,而IFNAR1-168G/C多态性与HBV感染后转归在傣、汉两族中并无显著性关联。     

早老素-1基因启动子区-48C/T位点多态性与LOAD的遗传相关性

目的研究早老素-1基因启动子区-48C/T位点的多态性与迟发性AD(LOAD)的相关性.方法用常规方法从人外周血白细胞中抽提基因组DNA,PCR扩增出包含-48C/T多态性位点的基因片段,利用PCR-RFLP技术对-48C/T多态性位点进行基因分型,χ2检验分析-48C/T多态性位点基因型分布和等位基因频率.结果以33例AD病例和32例对照样品的外周血白细胞基因组DNA为模板,PCR扩增出了长度为344bp的包含-48C/T多态性位点的基因片段.基因分型结果表明,33例散发型AD的C和T等位基因频率分别为47%和53%,C/T和T/T基因型频率分别为94%和6%.而32例正常对照的C和T等位基因频率分别为48%和52%,C/T和T/T基因型频率分别为97%和3%.χ2检验结果显示,病例-对照样品间C和T等位基因频率及C/C、C/T和T/T基因型的分布均无显著性差异(χ2值分别为0.443和0.318,P>0.05).结论在我们研究的群体中,早老素-1基因启动子区-48C/T位点的多态性与LOAD无显著的遗传相关性.     

干扰素诱导抗病毒蛋白的基因多态性与抗病毒疗效的关系

人们对干扰素的研究是从发现病毒间的干扰现象开始的。对干扰素分类、受体、信号转导及抗病毒活性表达作用机理的了解,为临床应用干扰素抗病毒治疗开辟了广阔的前景。近年国内外有关人体基因多态性与药物疗效关系的研究成果不断涌现,现将其中有关干扰素诱导抗病毒蛋白的基因多态性与抗病毒疗效的关系做一综述。     

LncRNA-GAS5基因rs2235095G/A和rs2067079C/T单核苷酸多态性在广西人群中的分布

目的:研究广西人群lncRNA-GAS5基因rs2235095G/A和rs2067079C/T单核苷酸多态性(SNPs)的分布特征,并比较其在不同地区人群中的分布差异。方法 :采用SNPscan技术对289例广西人群rs2235095G/A和rs2067079C/T位点进行基因分型检测,并分析其基因型和等位基因频率与国际千人基因组计划数据库公布的欧洲(CEU)、日本(JPT)、尼日利亚(YRI)和中国南方汉族人群(CHS)的分布差异。结果 :rs2235095G/A位点存在GG、AG和AA3种基因型,分布频率分别为37.0%、47.4%和15.6%;rs2067079C/T位点存在CC、CT和TT3种基因型,分布频率分别为63.0%、31.5%和5.5%。2个位点的基因型和等位基因频率在广西人群不同性别间比较差异均无统计学意义。rs2235095G/A基因型和等位基因频率与国际千人基因组计划数据库公布的CEU、JPT和YRI人群比较差异均有统计学意义;rs2067079C/T基因型和等位基因频率与YRI人群比较差异均有统计学意义。结论 :广西人群lncRNA-GAS5基因rs2235095G/A和rs2067079C/T位点存在基因多态性,且其在不同人群间存在不同程度的差异。     

PAI-1启动子区4G/5G基因多态性与脑血管病相关性研究

目的初步探讨人类纤溶酶原激活物抑制物-1（plasminogenactivatorinhibitor,PAI-1）启动子区基因多态性与脑血管病的关系及其在脑血管病发病过程中的作用。方法通过多聚酶链反应（polymerasechainreaction,PCR）技术和发色底物法(ELISA),测定96例脑血管病病人,其中脑梗死（cerebralinfarction,CI）组65例,脑出血（cerebralhemorrhage,CH）组31例和60例对照组的白细胞PAI-1启动子区4G/5G多态性位点的基因型及血浆PAI-1活性。结果CI组血浆PAI-1活性明显高于其它二组,各组中均以纯合子4G/4G基因型患者的PAI-1血浆活性水平为最高,5G/5G基因型最低,杂合子4G/5G基因型居中;4G纯合子基因型与其它二型之间比较差异均有显著意义,4G/5G与5G/5G基因型之间比较差异无显著意义。CI组4G/4G纯合子型基因型与对照组（Controls）比较有显著性差异（P<0.05）,CI组基因型与CH组及CH组与对照组基因型比较均无统计学意义（P>0.05）。女性CI4G纯合子基因型患者血浆PAI-1活性与同型男性患者比较有显著性差异。结论纯合子4G/4G基因型可能是CI发病的危险因素之一,4G纯合子个体可能具有较高的CI发病倾向,尤其可能与女性CI发病相关。     

干扰素诱导抗病毒蛋白的基因多态性与抗病毒疗效的关系

人们对干扰素的研究是从发现病毒间的干扰现象开始的。对干扰素分类、受体、信号转导及抗病毒活性表达作用机理的了解,为临床应用干扰素抗病毒治疗开辟了广阔的前景。近年国内外有关人体基因多态性与药物疗效关系的研究成果不断涌现,现将其中有关干扰素诱导抗病毒蛋白的基因多态性与抗病毒疗效的关系做一综述。     

丙型肝炎病毒1b型NS5 A区基因结构变异与α干扰？…

目的 观察丙型肝炎患者丙型肝炎病毒（ＨＣＶ）１ｂ型基因组部分ＮＳ５ Ａ区核苷酸,氨基酸的变异情况并探讨其与α干扰素疗效的相关性。方法 患者干扰素治疗前,中,后留血标本,用聚合酶链反应（ＰＣＲ）扩增ＨＣＶ病毒ＮＳ５ Ａ区部分基因片段并用直接测序法测序。与ＨＣＶ－Ｊ株及ＨＣＶ－河北株（ＨＣＶ－ＨＢ）比较核苷酸及氨基酸序列的同源性,根据α干扰素疗效分析ＨＣＶ１ｂ是否存在干扰素敏感决定区。     

广西壮族与汉族IL-6基因启动子-634C/G多态性的研究

目的研究白细胞介素-6(IL-6)基因启动子-634C/G多态性在中国广西壮、汉两民族中的分布.方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测185名壮族人和198名汉族人的白细胞介素-6基因启动子-634C/G多态性,比较两组白细胞介素-6基因型和等位基因的分布频率.结果在壮族人中CC、CG和GG基因型分别为69.7%、28.7%和1.6%;在汉族人中CC、CG和GG基因型分别为68.2%、29.3%和2.5%.两组白细胞介素-6基因型的分布频率差异无显著性(P＞(0.05).结论壮族与汉族白细胞介素-6基因-634C/G多态性分布频率差异无显著性.     

子宫内膜异位症与肿瘤坏死因子TNFα-308G/A和TNFβG252A基因多态性的关系

目的探讨肿瘤坏死因子TNFα-308G/A和TNFβG252A基因多态性与子宫内膜异位症的关系。方法运用多聚酶链反应技术检测100例子宫内膜异位症及100例正常人肿瘤坏死因子TNFα-308G/A和TNFβG252A基因多态性。结果TNFα-308G/A和TNFβG252A各种基因型频率在患者组与正常对照组之间的差异无统计学意义(P0.05)。结论肿瘤坏死因子TNFα-308G/A和TNFβG252A基因多态性与子宫内膜异位症无明显相关。     

TNF-α基因启动子区多态性与SARS发生关系的连锁不平衡研究

目的：研究TNF-α启动子区基因多态性连锁不平衡与严重急性呼吸道综合征（Sever acute respiratory syndrome,SARS）发生关系。方法：采用病例对照研究设计,检测75例SARS康复人员和95例健康人员的TNF-α基因启动子区多态性,分析TNF-α基因启动子区多态性位点的连锁作用与SARS-Cov易感性关系;在SARS康复病人中采用病例-病例对照研究设计,研究TNF-α基因多态性位点的连锁作用与SARS临床症状的关系。采用PCR-SBT（PCR Sequencing Based