基于紫外光谱-惩罚岭型线性判别对STR基因座分型研究

目的:结合紫外光谱(UV-s)和惩罚岭型线性判别(PRLDA)模式识别方法建立短串联重复序列(STR)的基因分型方法。方法:以D16S539基因座的9-9,12-13两种基因型为研究对象,研究包含该多态性位点的DNA片段的聚合酶链反应(PCR)扩增条件和紫外检测条件,建立标准化扩增条件和检测条件,以此获得基因分型的标准物及其标准UV-s。以标准光谱为识别变量,建立了9-9与12-13基因型的PRLDA判别模型。结果:所建立的PRLDA模型有较大的类间距和较小的类内距,表明模型具有良好的稳健性,且预测样本均分布在校正样本集的范围之内,对预测样本也表现出了极强的判别能力。结论:该方法不需任何检测前处理,而只需一步PCR扩增和UV-s检测即可实现STR的基因分型,具有简单、快速、低成本等优点。     

太子参代谢组学研究进展

本文综述了太子参代谢组学分析技术、太子参代谢组学与其鉴别和质量控制的关系、太子参抗逆性与物质代谢相关性以及太子参代谢途径与品质形成的关系,为全面了解代谢组学在太子参中的应用奠定基础。     

基于脂类代谢组学研究对乙酰氨基酚对小鼠药物性肝损伤的早期毒性

目的:基于脂类代谢组学研究对乙酰氨基酚(APAP)对小鼠的早期肝损伤毒性,为寻找潜在生物标志物提供参考。方法:将20只小鼠随机分为正常组和APAP肝损伤组,每组10只。APAP肝损伤组小鼠腹腔注射APAP 300 mg/kg建立急性肝损伤模型,正常组小鼠腹腔注射等体积生理盐水。1 h后取血并分离血浆,采用超高效液相色谱串联三重四级杆飞行时间质谱(UPLC-Triple-TOF-MS)法检测小鼠血浆代谢产物进行代谢组学分析,采用主成分分析(PCA)、偏最小二乘法分析(PLS-DA)以及正交偏二乘法分析(OPLS-DA)区分组间代谢轮廓的整体差异,并根据HMDB、Metlin、LIPID MAPS数据库对脂类代谢物进行筛选和鉴定,同时检测小鼠血浆中APAP水平变化。认定OPLS-DA分析中变量权重值(VIP)大于1且P<0.05的脂类代谢物为差异代谢物,并将脂类差异代谢物与血浆中APAP水平进行相关性分析。结果:PCA、PLS-DA以及OPLS-DA结果显示,正常组和APAP肝损伤组样品点位于图形不同的区域,具有良好的区分度。APAP肝损伤组与正常组比较,血浆中5个脂肪酰类代谢产物水平出现显著的升高或降低,8个甘油磷脂类代谢产物水平均显著降低,1个鞘脂类代谢产物水平显著上升;9-硫杂硬脂酸、十四烷二酸、9-过氧化氢-10,12-十八碳二烯酸、三-肉豆蔻酰基肉碱(脂肪酰类)和Scyphostatin A(鞘脂类)水平与血浆中APAP水平显著相关。结论:APAP染毒1 h后血浆脂类代谢组学显示异常,共发现14个相关脂类差异代谢物,其中5个与血浆中APAP水平显著相关。     

基于代谢组学研究对乙酰氨基酚片对中国健康成人胆汁酸谱的影响

目的:研究健康成人多次口服对乙酰氨基酚片后胆汁酸代谢的变化。方法:招募10名健康受试者,收集受试者口服对乙酰氨基酚前后的血清标本,分为给药前组(PD),第5次给药后组(FD)及第8次给药后组(ED),采用高效液相串联质谱(LC-MS/MS)的方法,定量检测血清胆汁酸谱,并结合代谢组学的主成分分析(PCA),正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA),研究多次口服对乙酰氨基酚后健康成人胆汁酸代谢谱的变化,检测各组肝功能生化指标,观察在给药前后肝功能生化指标的变化。结果:在给药前和给药后人血清的胆汁酸谱发生了变化,牛磺鹅去氧胆酸(TCDCA),甘氨胆酸(GCA),甘氨鹅脱氧胆酸(GCDCA),牛磺熊去氧胆酸(TUDCA)的浓度与给药前的基线相比显著升高(P<0.05),肝功能生化指标无明显的变化。采用代谢组学的方法筛选出的差异代谢物GCA,GCDCA为口服对乙酰氨基酚后胆汁酸改变最敏感的指标。结论:GCA和GCDCA或可作为对乙酰氨基酚致早期肝损伤的潜在生物标志物。     

基于代谢组学研究二苯乙烯苷在对乙酰氨基酚诱导小鼠肝损伤中的保护作用

目的:通过非靶向代谢组学等研究方法探讨二苯乙烯苷(tetrahydroxy stilbene glucoside,TSG)对乙酰氨基酚(acetaminophen,APAP)造成急性肝损伤的保护作用。方法:采用随机分组方式将SPF级C57BL/6小鼠分为APAP模型组和TSG干预组,每组15只。灌胃给予小鼠TSG连续7 d后,一次性腹腔注射APAP进行造模,6 h后取肝脏组织。结果:H&E染色、MDA和SOD检测表明单次APAP注射会造成肝脏损伤,TSG干预会降低肝脏受损程度。代谢产物检测结果显示,与APAP模型组相比,TSG组的ABC转运体、胆碱代谢、中心碳代谢、半乳糖、丙氨酸类氨基酸代谢等变化显著。结论:TSG通过改善脂质过氧化和能量代谢紊乱等过程抵御APAP导致的急性肝损伤。     

利用代谢组学技术研究HDP的肝毒性机制

目的 研究HDP对大鼠肝毒性的可能机制。     

基于代谢组学的中医证型物质基础研究进展

中医证型是中国传统医学辨证论治的产物,关于中医证型的标准化研究是中医现代化的标志,相关的物质基础研究是其重要组成部分。代谢组学是继基因组学、转录组学、蛋白质组学后逐渐兴起的学科。以"航拍角度"探测生物体在不同生理病理条件下的下游代谢物质,可准确反映出生物体实时代谢状态,与中医的整体性、动态性、即时性更为贴近。基于代谢组学的中医证型标准化研究拥有广阔的发展前景。     

异烟肼肝毒性的代谢组学特征研究*

目的:研究大鼠灌胃异烟肼后其尿液的代谢表型改变及其与组织病理学和血浆生化指标变化的相关性,探讨代谢组学在药物毒理学研究中的应用。方法:Wistar大鼠连续灌胃0,25,50,100,200和400 mg.kg-1异烟肼14 d后收集尿样,测定1H-NMR谱,并进行血浆生化指标测定和肝脏组织病理学检查。结果:常规毒理学评价方法发现大鼠在中、高剂量表现明显的肝毒性;给药组尿样1H-NMR谱2-氨基己二酸、葡萄糖和牛磺酸明显增加,2-酮戊二酸和柠檬酸明显降低。各剂量组的代谢产物谱变化与肝脏病理和血浆生化改变相一致,并且其敏感性优于常规毒理学检测指标。结论:大鼠尿液1H-NMR代谢产物谱与异烟肼毒性作用强度密切相关,异烟肼引起的肝毒性与线粒体功能受损及三羧酸循环中能量代谢异常有关,还与葡萄糖代谢紊乱有关。代谢组学分析在毒理学研究中有着广泛的应用前景。     

高血压病肝阳上亢证患者血清样品的核磁共振谱代谢组学研究

目的采用1HNMR结合主成分分析（PCA）方法研究高血压病肝阳上亢证患者和健康志愿者的血液成分谱差异,寻找可能的生物标记物,揭示高血压病肝阳上亢的证候本质。方法根据临床高血压病肝阳上亢证的诊断标准,选择典型病例,以1HNMR分析高血压病肝阳上亢证患者和健康志愿者的血液成分,使用PCA方法进行模式识别,寻找标记物并做出相关代谢途径的可能解释。结果PCA方法处理高血压病肝阳上亢证患者和健康志愿者的血清1HNMR谱数据显示,两组1HNMR谱数据可以在得分图实现分类,与健康志愿者作比较,患者机体相关代谢发生显著变化,体内部分氨基酸代谢和葡萄糖代谢明显异于健康志愿者。结论1HNMR结合PCA模式识别的代谢组学方法具有研究复杂条件下机体病理生理变化的优势,为理解高血压病肝阳上亢证的证侯本质和诊断该类病证提供了科学依据。     

制何首乌不同提取物的肝毒性血浆代谢组学研究

目的 基于代谢组学技术,分析比较制何首乌醇提物、水提物的血浆代谢表型差异,并结合肝功能生化指标和病理切片,探究两种提取物致大鼠肝毒性血浆中的潜在生物标志物并比较其差异.方法 30只SD大鼠,雌雄各半,随机分为制何首乌醇提组、水提组和空白对照组,每组10只.两给药组均按生药40 g·(kg·d)-1灌胃给药,空白对照组灌...     

BP神经网络在判别分析中的应用

为探讨 BP神经网络在判别分析中的应用 ,设计合适的 BP神经网络参数 ,利用 BP神经网络建立了判别模型。结果显示 ,BP神经网络在回代和前瞻性考核中都取得较好的结果     

基于电子鼻技术区分不同产地的牡丹皮药材

目的 应用电子鼻技术区分不同产地的牡丹皮药材。方法 通过单因素及正交试验法确定牡丹皮药材电子鼻测定的最佳试验条件。应用Loading分析法对传感器区分样品的能力进行分析,应用主成分分析法、线性判别分析法来区分不同产地的牡丹皮药材。结果 电子鼻技术测定牡丹皮药材的最佳试验条件为称样量3.0 g,空气流速300 mL·min^-1,样品室温放置时间为10 min;研究结果表明,其区分度均>0.980;7号传感器W1W对第一主成分贡献率最大,2号传感器W5S对第二主成分贡献率最大。通过对牡丹皮药材进行气味识别,电子鼻技术对亳州、铜陵、重庆3个主产区的牡丹皮药材有一定的区分能力,亳州产区不同产地之间区分度不明显。结论 利用牡丹皮药材特殊的气味并运用电子鼻对不同产地的牡丹皮药材进行区分,效果显著,为快速、简便的鉴别不同产地的牡丹皮药材提供新思路。     

基于非参数交叉证实判别分析法建立社区脑膜炎诊断模型

目的:建立适用于社区中脑膜炎与其他中枢神经系统疾病的鉴别诊断模型。方法:采用不等带宽核密度估计的非参数判别分析,对中国典型病例大全近四年内符合纳入标准的161例脑膜炎和161例非脑膜炎患者完整的病例资料进行分析。结果:经交叉证实法得到脑膜炎组的判别正确率为83.95%,对照组为71.25%,总的判断正确率87.64%。同时对资料进行logistic回归和人工神经网络模型进行分析,并进行与人工神经网络和logistic回归所建立的模型进行比较。结论:非参数判别分析建立的脑膜炎诊断模型是理想模型。     

昆明地区高血压影响因素的主成份分析

分析影响血压的重要因素，为有效地预防高血压及其临床治疗都有重要意义。本文利用主成份分析法，将影响血压的多个因素化简为几个主要综合因子的作用，来分析各种因素对血压的影响，其中年龄、就业状况、吸烟、饮烟、饮酒、体重指数、腹臀比值均为高血压危险因素，并得到患病组与正常组各主成份的量化比较。     

基于分子参数的血脑屏障通透性预测模型

目的建立血脑屏障通透性的定量预测模型,并确定药物通过血脑屏障的主要影响因素。方法选择190个化合物作为数据集,采用主成分分析和多元线性回归分析相结合的方法,使用10个分子结构参数建立数学模型。结果与结论所得模型统计结果良好(R2:0.642,SEE:0.496),应用于检验集时结果也比较令人满意(R2:0.642,SEP:0.495),模型表现出一定的可靠性和预测性。同时确定了对血脑屏障通透性影响较大的分子参数,这些参数及所建模型有助于指导进一步的新药筛选和开发。     

逐步判别分析在妊高征预测性诊断中的应用

目的:寻找一种准确、有效、简单易行的预测性诊断妊高征的方法。方法:用1:1配比的病例对照研究方法,收集妊高征发生的可能影响因素,采用逐步判别分析法进行分析。结果:对13个自变量通过逐步判别分析,筛选出5个有统计学意义的变量构建判别模型,用此模型对180个观察对象作回顾性评价,其灵敏度为94.4%,特异度为91.1%,阳性预测值为91.4%,阴性预测值为94.3%,误判率为7.2%;还用此模型对40个观察对象作前瞻性评价,其灵敏度为95.0%,特异度为90.0%,阳性预测值为90.5%,阴性预测值为94.7%,误判率为7.5%。结论:逐步判别分析方法可望成为一种准确、有效、简单易行的预测性诊断妊高征的工具。     

基于PCA及PLS-DA算法分析决明子炒制前后化学成分的变化

目的：分析决明子炒制前后化学成分的变化规律,筛选影响决明子炒制前后主要差异的物质基础。方法：采用HPLC-PDAD技术建立决明子及炒决明子的化学指纹图谱,利用《中药色谱指纹图谱相似度评价系统》进行Mark峰匹配,以SIMCA-P 11.0统计软件进行主成分分析（principal component analysis,PCA）及偏最小二乘判别分析（partial least-squares discriminant analysis,PLS-DA）,建立决明子及炒决明子PCA模型和PLC-DA模型,获取得分图和载荷图及Variable Importance （VIP）值,筛选并分析影响决明子炒制前后主要差异的物质基础。结果：构建了决明子及炒决明子的PCA （R₂X=0.844,Q₂=0.667）和PLC-DA （R₂Y=0.944,Q₂=0.861）模型,筛选出VIP值大于1的7个色谱峰。与决明子相比,炒决明子的色谱峰的峰面积均增大,且有显著性差异（P<0.01）,其中保留时间为54.189 min,VIP值为1.395 6的色谱峰为大黄素。结论：决明子炒制前后化学成分的含量发生改变。保留时间为58.252,62.825 min的成分（待分离鉴定）和大黄素为影响决明子炒制前后差异的主要物质基础。     

Acute liver acetaminophen toxicity in rabbits and the use of antidotes: a metabonomic approach in serum

The metabonomic approach has been widely used in toxicology to investigate mechanisms of toxicity. In the present study alterations in the metabolic profiles, monitored by ¹H‐NMR spectroscopy, on serum samples in acetaminophen (APAP)‐induced liver injury in rabbits were examined. Furthermore, the effect of the established antidote N‐acetylcysteine (NAC) and the proposed antidotes silybinin (SIL), cimetidine (CIM) and SIL/CIM was also investigated. A single dose of APAP (2 g kg^?1 b.w., i.g.) was administered to rabbits and APAP combined with the antidotes SIL, CIM and NAC. Animals were sacrificed at 24 h post‐APAP treatment. Healthy untreated animals served as controls. ¹H‐NMR spectra of serum samples were acquired and underwent principal component analysis (PCA). Acute liver injury was verified by histopathological examination and the alterations of serum biochemical enzymes AST and ALT. ¹H‐NMR spectroscopy revealed variations in the serum metabolic profile of APAP‐intoxicated rabbits compared with controls. Co‐administration of APAP with NAC, CIM and SIL + CIM seems to ameliorate the metabolic profile of animals compared with simply APAP‐treated ones. In this study, the model of APAPinduced liver injury was successfully described using the ¹H‐NMR based metabonomic approach in serum. Furthermore, the use of antidotes that reduced the toxic insult was also recorded using this technique. The combination of NMR spectroscopy and PCA is a rapid methodology, capable of detecting alterations in the metabolic profile, and produces adequate models that could be used for the characterization of unknown samples, both experimental and clinical, reinforcing its future use in clinical settings.Copyright © 2009 John Wiley & Sons, Ltd.     

基于指纹图谱结合化学计量学的独活寄生丸的质量评价研究

目的 建立独活寄生丸的指纹图谱,并采用化学计量学进行评价。方法 采用HPLC法建立独活寄生丸的指纹图谱和相似度评价,以聚类分析、主成分分析、正交偏最小二乘判别分析法分析数据。结果 建立了独活寄生丸HPLC特征指纹图谱,共确定32个共有峰,指认6个成分龙胆苦苷、川芎嗪、芝麻脂素、蛇床子素、细辛脂素、二氢欧山芹醇当归酸酯。15批独活寄生丸与对照图谱的相似度均大于0.900。15批独活寄生丸样品可分为2类,S1、S4、S6聚为一类,其余样品为另一类。9个主成分因子可作为独活寄生丸的评价指标。对模型分类贡献较大的3个变量,分别为共有峰4、17、2。结论该方法可用于独活寄生丸的质量评价,为独活寄生丸的质量标准研究提供依据。