RNA干扰抑制大鼠肝星状细胞CTGF表达的实验研究

目的构建针对结缔组织生长因子(connective tissue growth factor,CTGF)的RNA干扰重组质粒及其对照质粒,将其转染到体外培养的大鼠肝星状细胞(Hepatic Stellate Cells,HSC)中,进一步应用Real-time PCR方法检测CTGFmRNA的表达,观察RNA干扰对大鼠肝星状细胞CTGF表达的抑制作用,为临床基因治疗提供依据。方法①利用pGCsi载体构建介导CTGF短发夹RNA(shRNA)表达的质粒重组体,并通过基因测序分析进行鉴定。②将构建成功的4组重组质粒转染大鼠肝星状细胞株(HSC-T6),另设空白对照组,48 h后,共聚焦显微镜检测绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)表达,分析转染效果。③检测CTGFmRNA表达水平,筛选出有效抑制CTGF表达的序列。④应用SPSS 17.0软件对数据进行方差分析。结果成功构建了能表达CTGFshRNA的三组重组体pGCsi-CTGFshRNA。pGCsi-CTGFshRNA成功转染到肝星状细胞中。与空白对照组相比,pGCsi-CTGFshRNA1组及pGCsi-CTGFshRNA2组细胞CTGFmRNA不同程度下降,pGCsi-CTGFshRNA3组细胞及非特异性shRNA组mRNA表达水平无明显变化。结论本实验成功构建了pGCsi重组质粒。重组质粒成功转染到大鼠肝星状细胞中。筛选出两条有效抑制CTGF基因表达的序列,pGCsi重组质粒能高效抑制大鼠肝星状细胞中CTGF的表达。     

靶向大鼠CTGF的shRNA表达载体的构建和作用分析

目的:构建并筛选靶向大鼠结缔组织生长因子(CTGF)的shRNA表达载体.方法:根据大鼠CTGF mRNA序列设计并构建4个靶向大鼠CTGF基因的shRNA干扰质粒;然后以脂质体转染试剂将目的质粒转染至大鼠心肌成纤维细胞,流式细胞技术分选出成功转染的阳性细胞.通过RT-PCR和Western Blot技术对成功构建的4个shRNA干扰质粒进行有效性筛选,分析其CTGF mRNA及蛋白表达水平.结果:酶切证实转录shRNA的目的基因片段已成功克隆入载体,经测序证明与设计的相同;在转染成纤维细胞48 h后,与空白对照组比较,有3组细胞CTGF mRNA及蛋白表达水平明显降低;而转染非特异阴性质粒对照组CTGF mRNA及蛋白表达水平无明显变化.结论:成功构建并筛选出靶向大鼠CTGF的shRNA真核表达质粒重组体,为进一步进行体内外心肌纤维化的RNA干扰研究奠定了基础.     

siRNA对HSC结缔组织生长因子的抑制作用

目的研究化学合成的小分子干扰RNA ( siRNA) 对鼠肝星状细胞 (HSC)结缔组织生长因子(CTGF)基因表达的抑制作用.方法针对大鼠CTGF mRNA 483、885和946位点化学合成3对21核苷酸(nt) siRNA, 分别以50、100、200 nmol/L浓度转染HSC T6, 以空白及转染非特异siRNA作为对照, 应用RT-PCR检测CTGF mRNA表达, 筛选出抑制效率最高的siRNA及其浓度; 再转染HSC T6, 抽提孵育24、48、72 h细胞总RNA及蛋白质, 应用RT-PCR和Western blot检测CTGF mRNA及蛋白质表达.结果与对照相比, 转染siRNA的HSC T6细胞CTGF mRNA表达水平明显降低, siRNA抑制效率在50 ～ 200 nmol/L范围呈浓度依赖性增高, 以483 siRNA 200 nmol/L最显著, 转染非特异siRNA的HSC T6细胞CTGF mRNA表达水平无明显变化; 转染483 siRNA的HSC T6细胞24 48、72 h CTGF mRNA分别下调 (91±2) %、(65±3) % (P均<0.01)和 (10±7) % (P=0.0634), 蛋白分别下调 (86±5)%、(94±4)%和 (42±9)% (P均<0.01).结论化学合成483 siRNA能高效抑制HSC的CTGF基因表达, 有效阻抑时间达72 h, 提示化学合成siRNA具有预防和治疗肝纤维化的潜力.     

Bcl-2shRNA表达载体的构建及其对HL-60细胞生长的抑制作用

目的构建Bcl-2短发夹样RNA（short hairpin RNA，shRNA）序列的表达载体并研究其对HL-60细胞生长的抑制作用。方法化学合成2段编码短发夹RNA序列针对Bcl-2基因66个碱基的寡核苷酸，克隆到Pgenesil-1载体的u6启动子的下游，重组构建RNAi质粒，同时设立阴性对照；然后经酶切电泳和DNA测序鉴定。采用脂质体介导的转染方法将重组的RNAi质粒转入HL-60细胞后，采用RT-PCR检测Bcl-2mRNA表达水平；采用MTT法测定细胞增殖情况。结果重组构建的两个Bcl-2 shRNA1、shRNA2载体经双酶切电泳分析及插入基因片段序列分析，结果表明66个碱基成功插入到预期位点，并且序列完全一致。转染Bcl-2 shRNA1、shRNA2载体分别入HL-60细胞24h，其Bcl-2 mRNA表达水平均降低，但转染Bcl-2 shRNA1引起的Bcl-2 mRNA表达下降更为明显，分别与转染阴性shKNA及未转染组比较，有显著性差异（P〈0.05）。MTT测定显示转染Bcl-2 shRNA1、shRNA2载体入HL-60细胞在72、96h细胞生长明显受到抑制，分别与转染阴性shRNA、单纯脂质体组及未转染组比较，差异有显著性（P〈0.05）。结论成功地构建了两个Bcl-2 shRNA1、shRNA2表达载体，且Bcl-2 shRNA可序列特异性地抑制HL-60细胞的生长。     

短发卡样RNA抑制c-myc癌基因在乳腺癌细胞中的过度表达

目的构建人cmyc癌基因特异性短发卡样RNA(shRNA)真核表达载体,抑制靶基因cmyc在乳腺癌细胞中的过度表达。方法设计有小发夹结构的三条寡核苷酸序列,克隆至空载体pEGFPC1/U6中构建重组体并体外转染乳腺癌细胞株MCF7,48h后分别用RTPCR和Westernblot方法检测胞内cmyc癌基因mRNA水平和蛋白水平。结果①成功构建shRNA真核表达载体;②shRNA表达载体转染MCF7细胞48h后,pEGFPC1/U62能明显下调胞内cmycmRNA水平和蛋白水平(P<0.01)。结论构建的shRNA真核表达载体能显著抑制cmyc癌基因在MCF7细胞中的过表达。     

携带DNMT1-shRNA真核表达载体的构建及其对DNMT1表达的影响

目的构建携带针对DNA甲基转移酶1（DNMT1）mRNA的shRNA真核表达载体,检测重组质粒对DNMT1的沉默效应。方法以DNMT1mRNA序列为靶基因设计shRNA和阴性对照序列（HK）,应用基因重组技术将其克隆到真核表达载体7P-Gensil-1中,构建真核表达载体P-DNMT1-shRNA、P-HK。将重组质粒转染到大肠杆菌DH5口中,经筛选后对提取质粒测序鉴定。用构建的重组质粒转染T24细胞,进行RT-PCR和western blot检测,观察DNMT1mRNA和蛋白的变化。结果重组质粒经Sac Ⅰ酶切得到大小两个基因片段,与设计相同,经测序显示插入完全正确;DNMT1mRNA在24h、48h和72h的抑制率为28．44％、52．48％、70．91％;其蛋白在24h、48h和72h的抑制率为24．27％、57．79％、69．74％。结论成功构建了P-DNMT1-shRNA真核表达载体并能有效沉默T24细胞中DNMT1H水NA和蛋白的表达。     

shRNA沉默基因DNMT1的表达对膀胱癌T24细胞增殖与凋亡的影响

目的 体外研究shRNA(short hairpin RNA)沉默基因DNMTl的表达对膀胱癌T24细胞增殖和凋亡的影响,初步探讨DNMT1在膀胱肿瘤形成过程中的作用机制.方法 实验分为空白对照组(给予脂质体)、HK组(含无效干扰序列的质粒)及pshRNA-DNMT1组;常规培养膀胱癌T24细胞株,用脂质体Lipofeetamine 2000将构建成功的重组质粒pshRNA-DNMT1转染进入T24细胞,然后进行RT-PCR、Western blot检测各组DNMT1 mRNA及蛋白质水平变化;进行MTT,Annexin V-FITC/PI双染法流式细胞术检测各组T24细胞增殖和凋亡情况.结果 重组质粒pshR-NA-DNMT1成功转染进入膀胱癌T24细胞;经RT-PCR检测pshRNA-DNMT1组DNMT1 mRNA表达减少,24、48、72h的抑制率分别是28.44%、52.48%、70.91%;转染pshRNA-DNMT1后,T24细胞中DNMT1蛋白24、48和72 h的抑制率分别为24.27%、57.79%、69.74%;在MTT检测中,pshRNA-DNMT1组的细胞增殖抑制率在24、48、72 h分别为(4.34±0.76)%,(9.87±1.54)%和(13.78±1.93)%,与空白对照组比较各时间点差异均有极显著性意义(均P<0.01);转染24、48和72 h后,pshRNA-DNMT1组细胞凋亡率分别为(3.87±0.81)%、(8.69±1.23)%和(11.46±1.24)%,与空白对照组比较差异均有极显著性意义(均P<0.01).结论 重组质粒pshRNA-DNMT1能有效降低膀胱癌细胞中DNMT1基因mRNA及蛋白的表达,并在一定程度上抑制T24细胞的增殖和促进凋亡.     

ZNF217肿瘤基因shRNA表达载体的构建及鉴定

目的 构建针对ZNF217肿瘤基因的shRNA表达载体,以用于后续的RNAi研究.方法 依据设计shRNA的原则,针对人ZNF217的mRNA序列,设计并合成编码的shRNA的两条寡核苷酸序列,经退火成互补双链,再克隆至PGenesil-1质粒,构建重组体PGenesil-ZNF217,进行测序鉴定,然后转染重组体至HO-8910细胞中.转染24 h后流式细胞仪检测转染率.结果 酶切及测序证实质粒PGenesil-ZNF217构建成功,转染24 h的HO-8910细胞发出绿色荧光.结论 成功构建的针对人ZNF217基因shRNA表达质粒PGenesil-ZNF217转染进人卵巢癌细胞株HO-8910细胞,为后续研究以及卵巢癌的基因治疗奠定了基础.     

靶向leptin基因的siRNA对大鼠肝星状细胞生物学特性的影响

目的 构建具有特异性瘦素（leptin）基因小于扰RNA（small interfering RNA，siRNA）功能的表达质粒，研究靶向leptin基因的siRNA对大鼠肝星状细胞（hepatic stellate cell，HSC）中leptin表达及HSC生物学特性的影响。方法 以leptin为目的基因，以产生siRNA质粒载体psiRNA-hHlneo为表达模板，细胞内转录合成4对特异的siRNA和1对对照siRNA。构建能在真核细胞中表达的重组质粒leptinsi RNA，用酶切方法和测序法对重组体进行鉴定。应用脂质体介导重组质粒转染HSC。RT-PCR、Western blot和免疫细胞化学法检测HSC的leptin表达情况，用MTT法检测细胞增殖，用流式细胞仪分析细胞凋亡。结果 酶切和序列测定表明，成功构建了leptinsiRNA表达质粒；外源重组质粒siRNA3和siRNA4能够抑制leptinm RNA和蛋白表达（均P〈0．01）；HSC增殖活性显著降低（P〈0．05），凋亡增加（P〈0．01）。与未转染组相比，consiRNA、siRNA1和siRNA2转染组没有显著改变（均P〉0．05）。结论 构建的leptinsi RNA表达载体可减少leptin的表达，抑制HSC增殖并诱导其凋亡。为肝纤维化基因治疗提供了新的靶点。     

Livinα基因特异性shRNA在乳腺癌细胞MCF7中的表达鉴定

目的：研究凋亡抑制因子α（ Livinα）特异的短发夹状 RNA（ shRNA）在MCF7乳腺癌细胞中对外源 Livinα基因表达的抑制作用。方法构建4组EGFP－Livinα融合表达的重组质粒,其中两组分别含shRNA 1、shRNA2对应的不同序列的cDNA干扰片断,分别电转染入MCF7乳腺癌细胞中,48h 后用荧光显微镜观察各实验组细胞中EGFP的表达,流式细胞仪检测转染后各组细胞的平均荧光强度。应用逆转录－聚合酶链反应（ RT－PCR）检测各组细胞中Livin α在RNA水平和蛋白水平的表达。结果酶切及测序证实质粒构建成功;荧光显微镜观察结果显示载体成功转染入MCF7乳腺癌细胞;干扰片段shRNA2可有效抑制目的基因mRNA的表达。结论成功构建的含目的基因有效干扰片断的质粒可抑制目的基因在MCF7乳腺癌细胞中的表达。     

靶向表皮生长因子受体shRNA表达载体的构建和鉴定

目的构建靶向表皮生长因子受体（EGFR）的短发卡状RNA（shRNA）质粒表达载体并进行鉴定。方法①根据人类EGFR的mRNA序列,设计4条干扰片段,以PGPU6/GFP/Neo质粒为载体,构建shRNA重组体,转化入DH5a大肠杆菌,提取质粒,进行酶切和测序鉴定;②采用脂质体Lipofectamin 2000分别转染人皮肤鳞状细胞癌细胞株Colo-16细胞,用G418筛选阳性克隆。结果①经酶切及测序鉴定,成功构建了针对EGFR的4个重组干扰质粒;②成功转染Colo-16细胞,经筛选后得到稳定表达的细胞克隆。结论利用RNAi技术原理成功构建针对EGFR的shRNA重组质粒,并转染入Colo-16细胞。     

干扰HSP70-2的shRNA表达载体的构建及筛选

目的:利用pGenesil-1质粒构建针对热休克蛋白HSP70-2的短发夹RNA(shRNA)表达载体。方法:设计针对HSP70-2表达shRNA结构的互补DNA序列,经退火成双链,分别克隆至带有U6启动子的质粒载体pGenesil-1中,构建重组质粒,转化大肠杆菌DH5α菌株,扩增,提取质粒,酶切鉴定后测序分析。利用质粒转染大鼠精原细胞,用RT-PCR和Western blotting法检测转染后HSP70-2 mRNA和蛋白表达变化。结果:成功构建靶向HSP70-2的3个shRNA重组质粒载体pGenesil-1-HSP70-21、pGenesil-1-HSP70-22和pGenesil-1-HSP70-23。酶切鉴定和测序分析重组质粒,shRNA编码序列与设计的片段完全一致,经酶切凝胶电泳证实载体构建成功。质粒筛选实验提示pGenesil-1-HSP70-23质粒对精原细胞HSP70-2基因的抑制作用最强,而pGenesil-1-HSP70-21的抑制作用最弱。结论:成功构建表达靶向HSP70-2的shRNA重组质粒载体。     

干扰转酮醇酶的短发卡RNA表达载体的构建与筛选

目的筛选出干扰小鼠转酮醇酶(TK)的短发卡RNA(shRNA)表达载体。方法针对TK基因序列设计4条TK干扰序列:hMGFP-shRNA1、hMGFP-shRNA2、hMGFP-shRNA3、hMGFP-shRNA4,PstⅠ酶切鉴定其序列。然后利用质粒转染小鼠肝癌细胞株Hepa1-6,用逆转录-聚合酶链式反应和酶活性方法检测转染TKshRNA后Hepa1-6细胞内TK mRNA和蛋白表达变化。结果经酶切凝胶电泳证实shRNA载体构建正确,质粒筛选实验表明hMGFP-shRNA1质粒对TK基因的抑制作用最强。结论成功构建表达靶向TK的shRNA重组质粒载体。     

CTGF shRNA对肝星状细胞细胞因子及细胞外基质表达的影响

目的：研究结缔组织生长因子(CTGF)短发夹RNA(short hairpin RNA,shRNA)对肝星状细胞（HSC-T6）中TGF-β1、CTGF、Ⅰ型胶原、Ⅲ型胶原基因表达及细胞外基质分泌的影响。方法：将已构建并筛选有效含绿色荧光蛋白（EGFP）的CTGFshRNA质粒以转染试剂Metafectene转染HSC-T6,另设空质粒组、只加Metafectene组及空白对照组,24h及48h后,用RT-PCR法检测各组细胞中TGF-β1、CTGF、Ⅰ型胶原、Ⅲ型胶原mRNA的表达;放免法分析细胞上清液中Ⅲ型前胶原、Ⅳ型胶原、透明质酸和层粘连蛋白的含量;流式细胞仪分析转染效率。结果：CTGFshRNA质粒在肝星状细胞的转染效率24h、48h分别为(60±5)％、(42±3)％;与空白对照组相比,空质粒组、脂质体组对基因表达及细胞外基质的分泌均无影响,而CTGFshRNA能明显抑制CTGF、Ⅰ型胶原、Ⅲ型胶原mRNA的表达,降低上清液中Ⅲ型前胶原、Ⅳ型胶原、透明质酸和层粘连蛋白的含量（P<0.01或P<0.05）,而对TGF-β1的基因表达则无影响。结论：CTGFshRNA可明显抑制肝星状细胞CTGF、Ⅰ型胶原、Ⅲ型胶原基因表达及细胞外基质的分泌。     

S100A16基因shRNA真核表达质粒的构建及其干扰效果的初步鉴定

目的:构建S100A16基因RNA干扰(RNAi)的真核表达质粒,转染3T3-L1小鼠前体脂肪细胞,初步鉴定其干扰效果.方法:以小鼠S100A16基因为靶基因,以PLKO.1-sP6-GFP质粒为载体,根据GenBank数据库提供的S100A16基因核苷酸序列,选择设计2条siRNA干扰序列,构建针对S100A16基因...     

RNA干扰Twist基因真核表达载体的构建与筛选

目的： 构建编码Twist mRNA 的短发卡样RNA （shRNA ）质粒表达载体,并筛选出基因沉默效果最明显的shRNA 质粒表达载体。方法： 以Twist mRNA 编码区中第777位和第845位序列作为RNA干扰靶点,分别构建2个shRNA 质粒表达载体和1个阴性对照质粒表达载体,构建后通过PCR 酶切电泳和质粒测序进行鉴定。经鉴定后分别转染稳定表达Twist基因的膀胱癌T24细胞,RT-PCR 和Western blotting 分别从mRNA 和蛋白质水平检测抑制效果。结果： 构建的质粒表达载体PCR鉴定均可扩增出400 bp的目的条带,插入片段测序结果与合成的shRNA 结果一致。靶向Twist基因的shRNA 对膀胱癌T24细胞中Twist基因mRNA 抑制率为90%,蛋白质抑制率为86%,两种干扰质粒中shRNA1干扰效果最明显。结论： 成功构建了靶向Twist 基因的shRNA 质粒表达载体,其中抑制效果最为明显的shRNA 质粒表达载体为pGenesil-shRNA1 质粒。     

CTGF特异性siRNA慢病毒表达载体的构建及鉴定

目的:构建CTGF特异性siRNA慢病毒表达载体并观察其介导的RNA干扰(RNA interference,RNAi)对人肝癌细胞CTGF(connective tissue growth factor,CTGF)表达的影响?方法:针对已经筛选确定的人CTGF基因RNAi有效靶序列,合成靶序列的Oligo DNA,退火形成双链DNA,与Plk0.1-GFP-SP6载体连接产生shRNA 慢病毒载体,经PCR筛选阳性克隆进行DNA测序鉴定?用脂质体转染法将质粒共转染293T 细胞,将包装产生的慢病毒颗粒感染HepG2细胞,Real-time PCR?Western-blot检测CTGF mRNA和蛋白的表达?结果:PCR与DNA测序证实合成的含CTGF shRNA慢病毒载体寡核苷酸链插入正确?经RNA干扰后的靶细胞CTGF mRNA以及蛋白表达水平明显降低?结论:成功构建人CTGF基因RNA干扰慢病毒载体,体外感染HepG2细胞可有效降低CTGF mRNA和蛋白的表达,为以CTGF基因为靶点的肝癌基因治疗研究奠定了基础?     

靶向hVEGF165基因shRNA质粒表达载体的构建及筛选

目的 构建编码hVEGF165 mRNA的shRNA质粒表达载体,并筛选出基因沉默效果最明显的shRNA质粒表达载体.方法 以hVEGF165 mRNA编码区中第5和第7外显子序列作为RNA干扰靶点,分别构建3个shRNA质粒表达载体和1个阴性对照质粒表达载体并通过PCR进行鉴定.经鉴定后分别转染稳定表达hVEGF165基因的BHK细胞,实时荧光定量PCR和Western blotting分别从mRNA和蛋白质水平检测抑制效果.结果 构建的质粒表达载体PCR鉴定均可扩增出预期条带,构建成功.靶向hVEGF165基因的shRNA对所转染稳定表达hVEGF165基因的BHK细胞中hVEGF165基因mRNA和蛋白质表达均有抑制作用,其中shRNA2最为明显.结论 成功构建了靶向hVEGF165基因的shRNA质粒表达载体,其中抑制效果最为明显的shRNA质粒表达载体为pDC316-EGFP-U6-shRNA2质粒.     

细胞周期相关因子CDCA3基因shRNA表达载体的构建及鉴定

目的设计能转录短发夹状RNA(short hairpin RNAs,shRNA)的DNA序列,构建能有效下调CDCA3蛋白表达的shRNA真核表达载体,研究其对CDCA3表达的影响,以便进一步研究CDCA3的功能。方法根据文献获得CDCA3的siRNA靶序列,依据RNA干扰机制和shRNA靶序列的设计原则,以CDCA3基因为靶基因,合成一对编码shRNA的两条DNA序列,经退火后合成DNA双链,再克隆至shRNA表达载体pSIREN-DNRDsRed质粒中,连接产物转化E.coilJM109感受态细胞,然后挑取克隆提质粒,进行酶切鉴定和DNA序列测定。将构建成功的载体通过脂质体介导转染导入人胚肾HEK293细胞,采用Western blot法和Realtime RT-PCR,检测特异性shRNA对CDCA3蛋白在mRNA及蛋白表达水平的抑制效果。结果成功构建靶向CDCA3蛋白的特异shRNA的真核表达载体;转染HEK293细胞后,可显著下调CDCA3在细胞内的mRNA水平及蛋白表达水平。结论 CDCA3蛋白的特异shRNA的真核表达载体能显著下调HEK293细胞内的CDCA3蛋白表达。成功构建CDCA3 shRNA表达载体,为进一步研究CDCA3基因的功能提供了实验基础。