m6ARNA甲基化在骨发育中的研究进展

骨的发育受转录因子、细胞因子、多种信号通路和表观遗传学的调控.近年来,如何在转录后水平调控骨髓间充质干细胞(BMSCs)分化为期望的细胞是一个很有前景的研究方向.因此,大量研究报道了 m6A甲基化在BMSCs分化中的作用.本文就m6A在骨发育过程中对成骨、成软骨、成脂及破骨分化等方面的作用进行分析,探讨其可能存在的分子...     

基于CiteSpace的m6A甲基化研究的文献可视化分析

目的 分析近年m6A甲基化研究的发展状况、研究热点与前沿趋势。方法 通过CNKI和Web of Science数据库检索2013—2021年m6A甲基化相关研究的文献,运用CiteSpace 5.8.R3软件对文献作者进行合作网络分析,对关键词进行共现、聚类和突现分析,绘制知识可视化图谱。结果 共获得中文文献438篇、英文文献897篇,年度发文量呈快速增长趋势,高水平期刊主要集中在英文文献上,高产机构有南京医科大学、浙江大学、中山大学等高校。m6A甲基化研究高产作者主要有Chuan He、谷仕艳等,但尚未形成稳定的核心团队。关键词分析显示,m6A甲基化研究内容主要集中在检测技术、调控机制及靶向药物、预后风险模型等方面。结论 m6A甲基化研究正处于高速发展时期,其测序技术、不同调控因子的分布状态与疾病发生发展之间的关联性等方向成为主要研究热点。未来,恶性肿瘤、肝细胞癌、胃癌、结直肠癌等疾病的m6A甲基化修饰相关性研究是主要方向。     

m6A相关长链非编码RNA在黑色素瘤患者预后中的作用研究

目的 探讨N6甲基腺苷(m6A)甲基化修饰相关的长链非编码RNA(lncRNA)在黑色素瘤预后中的作用以及可能的机制。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载黑色素瘤患者的测序和临床数据并进行整合,利用皮尔逊相关系数分析获得与m6A甲基化修饰酶相关的lncRNA,并基于这些lncRNA在肿瘤患者中的表达通过一致性聚类分析确定黑色素瘤患者的不同分子亚型,进一步分析患者亚型之间肿瘤微环境的差异分布,筛选存在预后价值的lncRNA并进行基因评分(gene score=∑PC1i+∑PC2i),进而分析高/低评分患者之间的差异表达基因与分子通路。结果 通过获取的468例黑色素瘤患者的基因测序结果和临床数据,筛选出453个与m6A甲基化修饰酶相关的lncRNA,并基于这些lncRNA在肿瘤患者中确定出两种分子亚型—cluster1与clueter2,其中cluster1的预后明显差于cluster2(P<0.001),而且亚型之间的肿瘤微环境存在明显差异,其中M2型巨噬细胞和滤泡辅助性T细胞在cluster1中表达明显高于cluster2(P<0.05),而静息性NK杀伤细胞、...     

m6A修饰酶METTL16在卵巢中的表达及其作用机理挖掘

目的 基于公共数据库挖掘m6A修饰酶METTL16在卵巢癌中的表达及其作用机制,为进一步研究METTL16在卵巢癌中作用及机理提供理论依据.方法 收集Oncomine数据库METTL16基因表达信息,分析其在卵巢癌中的表达.利用Kaplan-Meier数据库分析METTL16基因与卵巢癌患者生存的关系.通过STRING...     

膀胱癌m6A调节因子预后模型建立与分析

目的 分析m6A调节因子对膀胱癌（bladder cancer, BC）预后的影响,建立预后预测模型。方法 从癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas, TCGA）数据库获取397例BC组织的高通量测序数据和对应的临床病理特征数据。在26个m6A调节因子中,采用单因素Cox回归筛选预后相关的m6A调节因子,利用最小绝对值收敛和选择算子（least absolute shrinkage and selection operator, LASSO）Cox回归分析方法构建BC预后预测模型,比较高低风险组总生存期（overall survival, OS）、免疫检查点相关基因和靶向治疗相关基因表达的差异。通过基因集富集分析比较高低风险组中信号通路的富集情况,采用单样本基因富集分析（single sample gene set enrichment analysis,ssGSEA）和估计恶性肿瘤组织中基质和免疫细胞（estimation of stromal and immune cells in malignant tumors using expression data...     

DNA修复基因MGMT启动子区过甲基化与脑胶质瘤

目的 在许多肿瘤中发现启动子区过甲基化而导致O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)的转录失活,本研究拟从胶质瘤患者肿瘤组织和其对应血清中MGMT基因启动子过甲基化是否有一致性对MGMT基因启动子甲基化进行研究.方法 采用甲基化特异性PCR法(MSP)进行MGMT基因启动子区甲基化水平的检测.结果 27例胶质瘤组织中有14例(51.9%)MGMT甲基化扩增阳性,13例(48.1%)为MGMT去甲基化扩增阳性.相应的血清中有13例(48.1%)MGMT甲基化扩增阳性,14例(51.9%)MGMT去甲基化扩增阳性(P＜0.05).结论 胶质瘤患者肿瘤组织和其对应的血清中MGMT基因启动子甲基化状态具有显著相关性.测定血清中MGMT基因启动子区的甲基化状态能反应胶质瘤组织中MGMT基因启动子区甲基化状态.MSP是检测MGMT基因启动子区甲基化灵敏和可靠的方法,可以指导临床脑胶质瘤的个体化化疗方案的设计.     

N6-甲基腺苷甲基化在卵巢癌中的作用机制研究进展

目的 探讨N6-甲基腺苷（m6A）甲基化在卵巢癌中的作用机制。方法 检索相关文献,总结m6A甲基化调节蛋白在卵巢癌发生、发展和化学治疗（简称化疗）耐药中的作用及机制。结果 m6A甲基化调节蛋白m6A甲基转移酶、m6A去甲基转移酶和m6A结合蛋白在卵巢癌的发生、发展中参与调控卵巢癌的增殖、侵袭、凋亡等生物学过程,并与卵巢癌的化疗耐药及预后密切相关。结论 m6A甲基化相关研究可为改善卵巢癌化疗耐药性及指导新型靶向药物的研究提供参考。     

RNA甲基化在甲状腺癌中作用研究进展

甲状腺癌(THCA)是一种常见的头颈部恶性肿瘤,近年来发病率逐年上升。而THCA的危险因素不明确,相关研究表明这可能与人口特征因素、环境因素、遗传与表观遗传因素等有关,其中表观遗传因素是近年来THCA发病机制方面研究的热点。该文就表观遗传中的RNA甲基化因素进行综述,为进一步揭示THCA的发病机制、了解其预后及遗传性等,为THCA的精准和科学防控提供依据。     

综合分析m6A RNA甲基化调节因子与肺癌免疫浸润及预后的相关性

目的 初步探究N6甲基化腺苷(N6-methyl-adenosine,m6A)甲基化调节因子在肺癌肿瘤免疫微环境中的潜在作用及机制.方法 基于TCGA数据库,本研究利用生物信息学综合分析m6A RNA甲基化调节因子与肺癌免疫浸润及预后的相关性.结果 多个m6A RNA甲基化调节因子在肺鳞癌和肺腺癌中差异性表达.然而,A...     

脑胶质瘤中Hint1基因甲基化状态与表达的研究

目的探讨脑胶质瘤中Hint1基因启动子区的甲基化与表达情况。方法采用MSP和Western-blit法检测Hint1基因在脑胶质瘤和正常脑组织中甲基化状况及对应表达情况。实时荧光定量PCR的方法检测Hint1 mRNA的表达情况。结果经检测正常脑组织和胶质瘤Hint1基因启动子区域呈非甲基化状态,在83例胶质瘤患者脑组织中Hint1 mRNA的平均表达量为0.5190±0.0280,高于在30例正常脑组织中的平均表达量0.2236±0.0300。Hint1 mRNA的表达量与患者年龄、性别等临床特征无明显相关性而与患者的临床分期密切相关（P〈0.01）。结论脑胶质瘤中Hint1基因启动子区域呈非甲基化状态,其表达程度与患者的临床分期密切相关。     

LMX1A基因启动子在胃癌中的异常甲基化研究

目的研究LMX1A基因启动子在胃癌细胞中的甲基化状态。方法运用甲基化特异聚合酶链反应(MSP)法检测30例原发胃癌和癌旁组织中LMX1A基因的甲基化水平。甲基化修饰后亚硫酸盐测序聚合酶链反应(BSP)分析胃癌细胞MKN45细胞LMX1A基因启动子CpG岛甲基化状态。提取细胞RNA,通过实时定量聚合酶链反应(PCR)检测LMX1A基因mRNA在不同浓度的DNA甲基化酶抑制剂5′-杂氮-2′-脱氧胞嘧啶(5-aza-dC)处理MKN45细胞后,LMX1A基因mRNA的改变情况。结果原发性胃癌的甲基化异常检出率是33%(10/30)。LMX1A基因在MKN45细胞中存在高甲基化状态,MKN45细胞经5-aza-dC处理后LMX1A基因mRNA表达明显上调。结论 LMX1A基因在原发性胃癌中存在甲基化异常,说明LMX1A基因甲基化异常可能参与胃癌的发生。     

大鼠胶质瘤模型的C6胶质瘤细胞的增殖动力学研究

目的　在建立C6 Wistar胶质瘤大鼠模型的基础上 ,研究大鼠胶质瘤模型的C6胶质瘤细胞的增殖动力学。方法　应用流式细胞仪检测、PCNA免疫组化染色和核仁组织区银染三种方法 ,研究C6胶质瘤细胞的增殖动力学指标 ,并进行相关性分析。结果　 1、肿瘤细胞接种 2周后 ,肿瘤模型建立 ,HE染色见肿瘤细胞增殖活跃 ,各项增殖指标显示该肿瘤增殖活性较强。 2、AgNor面积、AgNOR计数与S期百分比和PCNA指数具有良好的相关性 ,AgNOR面积 (P <0 0 1)比AgNOR计数 (P <0 0 5 )相关性更强     

线粒体tRNA m5C甲基化修饰及与疾病的关联

<正>在真核细胞中,线粒体参与能量生产、细胞凋亡、钙稳态调节和先天免疫应答等关键生命活动^[1]。人类线粒体基因组包含37个基因,编码氧化磷酸化的13个亚基、2个核糖体RNA(rRNA)和22个转运RNA(tRNA)^[2]。RNA甲基化是RNA转录后修饰中主要的表观遗传修饰之一,主要包括5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine, m5C)、3-甲基胞嘧啶(3-methylcytosine, m3C)、     

CD44v6、Syndecan-1在人脑胶质瘤中的表达

目的通过研究黏附分子CD44v6、syndecan-1在胶质瘤中的表达,探讨其与胶质瘤浸润发展的关系。方法用免疫组织化学SP法,CD44v6选用石蜡切片,syndecan1采用冰冻切片进行分析研究。结果CD44v6在正常脑组织的阳性表达率50%(4/8),而在胶质瘤中基本不表达8.2%(5/61);syndecan1在胶质瘤中表达为22%(9/41),明显低于对照组阳性表达率75%(6/8)(P<0.05)。但两者的表达在胶质瘤Ⅰ～Ⅱ级组与Ⅲ～Ⅳ级组中相比均无统计学差异(P>0.05)。结论CD44v6的表达缺失可能是胶质瘤不发生颅外转移的原因之一,syndecan-1与胶质瘤的浸润发展有一定的相关性。     

DNA甲基化在肿瘤发生作用中的研究进展

表遗传学现象广泛地存在于各种生物中,表遗传现象形成的重要机制之一是DNA甲基化作用引起基因转录沉默。鉴于该重要机制,研究DNA甲基化水平的改变对肿瘤的发生、发展有重要的作用。经研究发现DNA甲基化改变可以引起细胞中C→T突变、抑癌基因的高甲基化、癌基因的低甲基化、错配修复基因异常以及诱导染色体不稳定导致肿瘤的发生。因此,通过探索肿瘤发生时DNA甲基化的变化特征,可为肿瘤治疗提供理论依据。     

信使 RNA N6-甲基腺嘌呤甲基化修饰在血管性痴呆中的作用机制研究进展

信使 RNA(mRNA)中的腺苷酸可发生甲基化转化为 N6-甲基腺嘌呤( N6-methyladenosine,m6A)进而调节 mRNA的功能和代谢,这是一种高度动态可逆的表观转录组修饰方式。血管性痴呆( vascular dementia,VD)是由多种脑血管原因(如动脉粥样硬化、淀粉样改变等)引起的一种神经退行性疾病,近年来,有研究发现 m6A与 VD的发病和进展密切相关, m6A甲基化在调节神经元氧化应激、炎症反应、脑血管内皮损伤、线粒体功能障碍和突触可塑性等方面具有较大影响。文章对近几年关于 m6A甲基化修饰在 VD中的潜在作用机制进行综述,以期为后续研究和靶向治疗 VD提供新的科学思路。     

RNA N6-腺苷酸甲基化修饰在慢性肝病中作用的研究进展

N⁶-腺苷酸甲基化(m⁶A)修饰是病毒和真核生物RNA最丰富、最重要的内部修饰,在基因的转录后调控中起关键作用。m⁶A修饰调控RNA生命过程的各个方面,包括加工、输运、翻译和降解。肝是病理生理过程中重要的代谢和消化器官。最近研究表明,m⁶A修饰对肝功能和肝病的发展具有显著的调节作用。本文主要综述m⁶A修饰在慢性肝病如病毒性肝炎、肝纤维化、非酒精性脂肪性肝病和肝癌等中的生物学和临床意义,为慢性肝病的治疗提供参考。     

EGLN家族在胶质瘤中的研究进展

人脯氨酰羟化酶(EGLN)是双加氧酶超家族成员,可直接感受氧分压的变化,是调节缺氧诱导因子(HIF)脯氨酸残基产生羟化降解反应的重要因素,通过影响缺氧诱导因子的转录活性、介导蛋白酶分解和调节亚基的多聚泛素化等发挥作用.近年来,EGLN调节通路和信号机制相关研究的不断深入,为多种疾病的发生、发展及治疗提供了潜在靶点和新的...     

脑胶质瘤中CLDN-7基因甲基化状态及蛋白表达的研究

目的探讨脑胶质瘤血浆中CLDN-7基因的甲基化状况及蛋白表达的关系。方法采用巢式PCR、亚硫酸氢盐测序PCR（BSP）及免疫组织化学技术方法,检测56例脑胶质瘤血清标本中CLDN-7基因启动子区CpG岛的甲基化状态,分析其甲基化程度、蛋白表达和临床资料之间的相关性。结果脑胶质瘤患者血清中CLDN-7基因启动子区甲基化率为35.3%（18/51）,按WHO病理分级,其中低级别（Ⅰ～Ⅱ级）组胶质瘤中基因启动子区甲基化率25.0%（9/36）低于高级别（Ⅲ～IV级）组甲基化率60.0%（9/15）,两者之间存在显著差别（P〈0.05）;甲基化蛋白表达阳性率为55.6%（10/18）,未甲基化的蛋白阳性表达率为84.8%（28/33）。结论 CLDN-7基因启动子区CpG岛中存在甲基化现象,与脑胶质瘤发生有关;基因的甲基化率与蛋白表达呈负相关关系。