陕西省HIV-Ⅰ流行毒株亚型分析

目的了解陕西省近年来发现的人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者所携带毒株的基因序列特征、亚型种类和毒株来源以及在各高危人群中的分布,推断其传播来源和流行趋势,为本省艾滋病防治工作提供技术资料。方法对HIV感染者进行流行病学相关因素调查,无菌采集HIV感染者抗凝全血,提取前病毒DNA,应用套式聚合酶链式反应（nested-PCR）扩增其膜蛋白基因env,对其C2～V3区及邻区的核苷酸序列进行测定,用GCG软件（Wisconsin公司）进行亚型分析。结果35份样本PCR扩增阳性并得到相应序列。经基因离散率计算和系统树分析,共发现4种HIV-1基因亚型和重组毒株,即HIV-1 B’、C、CRF01-AE和CRF-BC重组型。其中泰国B’亚型为主要流行株,占82.35%（28/34）,主要来源于既往采供血者及其配偶;其次是CRF-BC重组型,占11.77%（4/34）,主要来源于吸毒人群：CRF01-AE和C亚型各1份,分别占2.94%,均来自劳务输出的归国人员。该组样本B’亚型内的基因离散率为5.2%（n=23）;而CRF-BC亚型内的基因离散率为0.9%（n=3）,彼此间显示出较近的传播关系。结论陕西省HIV-1流行株以泰国B’亚型为主,发生在与既往有偿采供血相关的地区和人群,已有6～7年的流行史;首次在当地吸毒人群中发现HIV-1 CRF-BC重组型,并且显示近期高度流行的趋势。加强对既往有偿献血人群和吸毒人群的行为干预,控制HIV病毒在家庭内和吸毒人群中的传播,将是今后本省艾滋病防治工作重点之一。     

九江市HIV-流行毒株基因序列测定和亚型分析

目的：了解九江市HIV-1流行毒株的亚型分布情况。方法：对采集的6份九江市HIV-1感染者的血浆样品进行RT—PCR扩增，获得GAG基因的核酸片断进行核苷酸序列分析。结果：在6份样品中发现B’亚型HIV-1毒株四株，B亚型和A／E重组亚型HIV-1毒株各一株。结论：HIV-1流行毒株亚型在九江市分布情况复杂，防控形势严峻。     

陕西省HIV-Ⅰ流行毒株亚型分析

目的 了解陕西省近年来发现的人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者所携带毒株的基因序列特征、亚型种类和毒株来源以及在各高危人群中的分布,推断其传播来源和流行趋势,为本省艾滋病防治工作提供技术资料.方法 对HIV感染者进行流行病学相关因素调查,无菌采集HIV感染者抗凝全血,提取前病毒DNA,应用套式聚合酶链式反应(nested-PCR)扩增其膜蛋白基因env,对其C2～V3区及邻区的核苷酸序列进行测定,用GCG软件(Wisconsin 公司)进行亚型分析.结果 35份样本PCR扩增阳性并得到相应序列.经基因离散率计算和系统树分析,共发现4种HIV-1基因亚型和重组毒株,即HIV-1 B'、C、CRF01-AE和CRF-BC重组型.其中泰国B'亚型为主要流行株,占82.35%(28/34),主要来源于既往采供血者及其配偶;其次是CRF-BC重组型,占11.77%(4/34),主要来源于吸毒人群:CRF01-AE和C亚型各1份,分别占2.94%,均来自劳务输出的归国人员.该组样本B'亚型内的基因离散率为5.2%(n=23);而CRF-BC亚型内的基因离散率为0.9%(n=3),彼此间显示出较近的传播关系.结论 陕西省HIV-1流行株以泰国B'亚型为主,发生在与既往有偿采供血相关的地区和人群,已有6～7年的流行史;首次在当地吸毒人群中发现HIV-1 CRF-BC重组型,并且显示近期高度流行的趋势.加强对既往有偿献血人群和吸毒人群的行为干预,控制HIV病毒在家庭内和吸毒人群中的传播,将是今后本省艾滋病防治工作重点之一.     

湖北省HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析

１９９６年８月下旬采集２０份湖北省ＨＩＶ１感染者外周血，分离单个核细胞（ＰＢＭＣｓ）提取核酸使用ＰＣＲ进行扩增获得ＨＩＶ１膜蛋白（ｅｎｖ）基因的核酸片段，并对其Ｃ２Ｖ３及邻区３５０～４５０个核苷酸序列进行了测定和分析。研究结果表明，这２０份样品均为Ｂ亚型的ＨＩＶ１毒株序列，彼此间的基因离散率为１．９％。与国际ＡＥ亚型参考序列及部分地区Ｂ亚型代表株序列相比较，湖北的２０个毒株与流行与我国云南德宏、四川和河南等地的Ｂ亚型毒株序列十分接近，均属于泰国Ｂ亚型；它们的基因离散率在１．９％～３．２％的范围内。根据以上数据及其它资料提示，ＨＩＶ１在湖北的流行时间不长，该流行区毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型ＨＩＶ１毒株密切相关。     

不同途径感染人群HIV-1亚型分布

目的 了解河北省石家庄市不同感染人群人类免疫缺陷病毒I型(HIV-1)亚型及分布特点。方法 从石家庄市报告的148例HIV-1抗体阳性者抗凝全血中提取前病毒DNA,用套式聚合酶链反应(nested-PCR)扩增病毒膜蛋白(ENV)基因的C2-V3区并进行序列测定,与国际标准参考序列比较确定亚型。结果 148例样品分属8个亚型,45例为欧美B,37例为CRF07-BC,35例为泰国B(B'),25例为CRF01-AE,C和CRF02-AG各2例,CRF03-AB和CRF11-CPX各1例。结论 既往供受血人员和注射吸毒人群感染的HIV-1亚型相对单一,性传播亚型分布较广。     

山东省HIV-1流行株多基因区亚型分析

目的 了解流行于山东省境内HIV-1毒株的亚型,尤其是流行重组型毒株的种类及变异情况,分析其来源并推测其流行趋势。方法采集93份HIV-1感染者的外周静脉防凝血,提取前病毒DNA进行体外扩增,获得包膜蛋白（env）、核心蛋白（gag）、tat区基因的核酸片段,并对各基因区核苷酸进行测定和分析。结果发现在所有目标人群中共存在B、B,、C3种亚型以及CRF07-BC、CRF08-BC、CRF01-AG和CRF01-AE4种重组毒株,其中B’亚型数量最大71株（占77．2％）,CRF01-AE9株（占9．8％）,CRF07-BC、CRFOB-BC各3株（均占3．3oA）,B、C和CRF02-AG各2株（占2．2％）。3个基因区env区变异最大,gag和tat相对保守。3种优势亚型中,A／E变异最大,B’次之,B’／C最保守。结论山东省HIV-1流行毒株亚型众多。各优势毒株发生了不同程度的变异,在山东省有流行加快的趋势,应加强防控。     

北京入境人员中HIV-1感染毒株的序列特征和亚型分析

[目的]了解北京入境人员中HIV-1型感染毒株的分子流行病学特征。[方法]采集12份确认为HIV-1型感染者的全血，分离单核细胞(PNMC)，提取前病毒DNA，通过套式PCR扩增得到12份样品的结果，并对其env C2-V3区进行序列测定和分析。[结果]得到的样品分别属于HIV-1型的A、B、C亚型和重组AE型流行株。[结论]北京口岸入境人员中HIV-1型毒株的感染情况比较复杂。提示应加强对入境人员的HIV-1的检测，防止其它亚型的HIV-1型毒株传人我国。     

输血后感染的HIV-1流行株分子流行病学调查

目的了解河北省沙河市受血感染者及其夫妻传播者中HIV-1亚型特点和来源。方法采集HIV-1感染者的全血样品,分离外周血单核细胞（PBMC）,提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应（nested-PCR）,扩增HIV-1的env基因的C2～V3区,并进行序列测定和亚型分析。结果对7例HIV-1感染者的血标本进行nested-PCR扩增,得到6份HIV-1 env C2～V3基因片段,经序列测定分析,6份样品均为B′亚型。组内基因离散率6.22%±1.38%,基因序列与云南瑞丽株RL42（泰国B亚型）相近。受血者Heb0224及其配偶Heb0223与云南瑞丽株RL42 env的基因离散率分别为3.93%和7.71%。结论在河北省沙河市受血感染者及其夫妻传播者中流行的为HIV-1 B′亚型。     

输血后感染的HIV-1流行株分子流行病学调查

目的了解河北省沙河市受血感染者及其夫妻传播者中HIV-1亚型特点和来源。方法采集HIV-1感染者的全血样品,分离外周血单核细胞(PBMC),提取前病毒DNA,使用套式聚合酶链反应(nested-PCR),扩增HIV-1的env基因的C2～V3区,并进行序列测定和亚型分析。结果对7例HIV-1感染者的血标本进行nested-PCR扩增,得到6份HIV-1 env C2～V3基因片段,经序列测定分析,6份样品均为B′亚型。组内基因离散率6.22%±1.38%,基因序列与云南瑞丽株RL42(泰国B亚型)相近。受血者Heb0224及其配偶Heb0223与云南瑞丽株RL42 env的基因离散率分别为3.93%和7.71%。结论在河北省沙河市受血感染者及其夫妻传播者中流行的为HIV-1 B′亚型。     

同性和异性传播感染人群的HIV-1亚型分布和特征分析

目的了解河北省男男同性传播和异性传播人群HIV-1亚型分布和特征。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,逆转录后采用套式PCR扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,确定基因型并进行系统进化树分析。结果同性传播的52例HIV-1感染者中,发现了3种HIV-1亚型和重组型,以CRF01-AE为主,占65.4%(34/52),其次为B亚型占30.8%(16/52);异性传播的60例HIV-1感染者中,存在6种亚型和重组型,以B亚型为主占43.3%(26/60),其次是CRF01-AE占30.0%(18/60),CRF07-BC占15%(9/60);两类人群的亚型分布差异有统计学意义(P<0.001)。异性感染人群的各亚型组内基因距离均大于同性感染人群。结论在河北省同性传播人群和异性传播人群中HIV-1亚型分布不均衡。     

HIV-1基因亚型研究进展

HIV的典型遗传特征之一是高度的遗传多样性,这一特征为艾滋病患者的抗病毒治疗和HIV疫苗的研制带来了困难,然而也为研究人群中病毒的传播和进化提供了有利条件.根据HIV基因序列和氨基酸序列的特征,HIV-1可分为多种亚型.对HIV-1基因亚型的分析,可敏感地提示HIV的流行信息,及早发现新的HIV亚型毒株的传播,预测HI流行趋势,为艾滋病诊断试剂的更新换代、HIV疫苗的研制提供依据,还可用于估计疾病进展及抗病毒药物治疗的敏感性与耐药性,在预防和控制艾滋病方面发挥重要作用.     

河南省艾滋病毒I型膜蛋白基因序列特征和亚型研究

目的　了解在河南省流行的人类免疫缺陷病毒(HIV)毒株的流行情况及亚型特征。方法　用套式聚合酶反应(nested -PCR)对28份河南省内的HIV-1感染者外周血单个核细胞(PBMc)中的膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区350 -450个核苷序列进行测定和分析。结果　28份样品间的基因离散率为5.72%,与流行于云南的(泰国B)毒株基因离散率 为5.80%,与其它国际亚型,欧美B、A、C、D、F、G、H、J、O亚型基因离散率均在18.05%以上。系统树分析显示,28份毒株与 泰国B亚型聚在一起而远离其它国际亚型。其毒株V3环四肽序列泰国B亚型基因型GPGQ8例占28.57%,欧美B亚型基 因型GPGR13例占46.43%.结论　河南省流行的HIV株属B′亚型,其毒株来自与泰国接壤的云南,在河南流行的时间约在 6～10年,其V3环顶端四肽序列特征以GPGR为主。     

不同亚型的人类免疫缺陷病毒Ⅰ型毒株混合感染分析

目的：了解我国人类免疫缺陷病毒（HIV）感染中是否存在不同HIV－1亚型混合感染,分析其传染来源,方法：应用巢式－PCR方法对3例HIV－1感染外周血单个核细胞的HIV－1膜蛋白基因进行扩增。并对C2－V3及其邻区360个核苷酸序列进行测定和分析,计算基因离散率和系统进行化树。结果：3例感染体内有B和C或B′和E2种不同HIV－1亚型毒株序列,各亚型毒株与相应的Bcon、Ccon、Econ国际亚型毒株序列间的基因离散率分别为5．07％－7．26％、3．23％、5．38％－5．99％;同一个体内不同亚型毒株序列间的基因离散率分别为23．52％、20．69％、28．44％;根据gp120V3环顶端四肽序列特征,发现有卖淫和静脉吸毒史妓女体内的sz46-1具有典型的欧美B亚型GPGR序列,sz8-2为GPGH,其他毒株均为泰国B（B′）和E亚型所特有的CPGQ序列;进一步系统树分析显示,sz12、sz46-1与Bcon丛集一起,sz1-1和sz8-2,sz46-2分别与Econ、Ccon丛集。结论同一个体可以同时感染不同亚型HIV－1毒株,多种高危行为可能是导致混合感染的主要原因。     

广东省艾滋病患者HIV-1基因亚型分析

目的 了解目前广东省HIV/AIDS患者HIV-1基因型的流行状况.方法 用套式PCR对222例HIV/AIDS患者外周血单核细胞(PBMC)中HIV前病毒DNA膜蛋白env基因C2-V4区及其邻近区域片段进行扩增,并对片段进行序列测定,与国际HIV-1标准毒株序列进行比较,依据同源性确定基因型.结果 222例患者中,...     

合肥市HIV-1感染者基因亚型和耐药性突变调查与研究

目的 了解合肥地区艾滋病病毒Ⅰ型(human immundeficiency virus 1,HIV -1)基因亚型及耐药性HIV-1的流行情况,为制定防治措施提供科学依据.方法 应用巢式RT-PCR扩增HIV-1 POL区聚合酶基因,经DNA测序后进行进化系统树分析和重组分析,以确定HIV-1基因亚型和重组体,并与国际耐药数据库比对,辨别耐药性突变位点,结合流行病学资料进行分析.结果 收集93例合肥地区HIV-1感染者,经RT-PCR扩增并获得有效基因亚型序列77例,基因分型以CRF01 _AE重组亚型为主,有46例(59.7％);其次是CRF07_BC亚型23例(29.9％)、B亚型6例(7.8％)和CRF08_BC亚型2例(2.6％).耐药分析结果表明,在65例未治疗人群中,发现1例(1.5％)蛋白酶抑制剂(PIs)主要耐药基因突变,2例(3.1％)反转录酶抑制剂( RTIs)耐药基因突变.抗病毒治疗组出现耐药突变位点6例(50.0％)高于非治疗组3例(4.6％)(x2=20.21,P＜0.001).结论 本研究分析了合肥地区HIV-1基因亚型和耐药突变的流行情况,初步了解合肥地区的HIV-1遗传变异多样性并建立耐药检测体系,对合肥地区的艾滋病预防和控制工作有一定指导意义.     

山东省HIV-1C亚型毒株的分子流行病学研究

目的 了解HIV—1C亚型毒株在山东省不同人群中的流行传播情况，分析其传染来源和传播规律。方法 采集7份HIV—1感染的外周静脉防凝血，提取前病毒DNA进行体外扩增，获得包膜蛋白(env)基因的核酸片段，并对其C2—V3及邻区的核苷酸进行测定和分析。结果 7份血样均为HIV—1C亚型感染，系统树和基因距离分析发现，其中5株靠近07—BC重组毒株，2株靠近08—BC重组毒株。结论 山东省C亚型有重组株存在的可能，且人群分布广，传播途径多样，具有广泛传播的潜在危险。     

不同HIV-1亚型毒株混合感染的分子流行病学分析

应用巢式-PCR方法对3例HIV-1感染者外周血单个核细胞中的HIV-1膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区360个核苷酸序列进行测定和分析,计算基因离散率和系统进化树.结果,3例感染者体内有B和C或B'和E两种不同HIV-1亚型毒株序列,各亚型毒株与相应的Bcon、Ccon、Econ国际亚型毒株序的基因离散率分别为5.07～7.26%、3.23%、5.38～5.99%;同一个体内不同亚型毒株序列间的基因离散率分别为23.52%、20.69%、28.44%;根据gp120 V3环顶端四肽序列特征,发现有卖淫和静脉吸毒史妓女体内的sz46-1具有典型的欧美B亚型GPGR序列,sz8-2为GPGH,其它毒株均为泰国B(B')和E亚型所特有的GPGQ序列;进一步系统树分析显示,sz1-2、sz8-1、sz46-1与Bcon丛集一起,sz1-1、sz8-2和sz46-1分别与Econ、Ccon丛集.结论同一个体可以同时感染不同亚型HIV-1毒株,多种高危行为可能是导致混合感染的主要原因.     

福建省HIV-1 新近感染者流行毒株基因亚型及其流行特征分析

目的 了解福建省HIV-1 新近感染者流行毒株的亚型分布和流行特征。方法 随机抽取福建省2011－2012 年使用BED捕获酶免疫试验检出的104 例新近感染者血样标本,采用反转录巢式PCR扩增,gag、pol 和env 基因片段,并测定和分析核酸序列。结果 目标人群中存在B亚型和01_AE、07_BC、08_BC、55_01B 四种流行重组型,其中以01_AE 和07_BC 流行重组型为主,分别占45.68%和35.80%。基因亚型的流行特征分析显示,亚型分布中01_AE 所占比例下降,07_BC 所占比例上升;性传播是主要感染途径,其中同性传播比例明显上升。结论 福建省HIV-1 流行毒株亚型分布众多,随着时间推移,亚型构成和传播途径已发生改变,应加强对HIV-1感染的分子流行病学趋势动态监测。     

山东省HIV-1B亚型毒株分子流行病学研究

目的　了解人类免疫缺陷病毒 1型 (HIV -1B)亚型毒株在山东省的流行分布情况和传播规律。方法　采集 17份HIV -1感染者的外周静脉防凝血 ,提取前病毒DNA进行体外扩增 ,获得包膜蛋白 (env)基因的核酸片段 ,并对其C2 -V3及邻区的核苷酸进行测定和分析。结果　系统树和基因离散率分析发现这 17份血样均为HIV -1B亚型感染 ,且感染毒株距离泰国B亚型代表株RL42最近 ,离散率为 9 16± 3 3 4 ,17毒株之间的离散率为 11 69±4 19。氨基酸序列分析发现 ,V3环顶端 4肽基序呈多态性 ,有 6种形式。结论　HIV -1B亚型在山东省地理分布广 ,并涉及 3类人群两种传播途径 ,且毒株出现较大变异 ,具有广泛传播的潜在危险