基于二代测序的HLA-Ⅱ类等位基因多态性研究及等位基因丢失防范策略

目的：研究二代测序技术（NGS）检测深圳地区随机健康无关汉族人群HLA-DRB1、DQB1、DQA1、DRB3、DRB4、DRB5、DPA1、DPB1等位基因多态性的精确性,探讨HLA-DRB1等位基因丢失的原因及室内关键质控体系建立策略。方法：采用Mi Seq DxTM NGS平台对1 012例样本完成HLA-II类等位基因分型。对质控体系软件提示的疑难样本和HLA-DRB1纯合子样本采用PCR-SSOP法或PCR-SBT法进行确认。结果：检出HLA-DRB1、DRB3、DRB4、DRB5、DQA1、DQB1、DPA1、DPB1等位基因分别有45、7、5、7、17、21、10、27种。常见等位基因（频率>10%）有HLA-DRB1*09:01(17.09%)、15:01(10.72%);DRB3*02:02(25.99%)、03:01(10.18%);DRB4*01:03(36.46%);DRB5*01:01(15.42%);DQA1*01:02(20.01%)、03:02(17.19%);DQB1*03:01(19.47%)、03:03(17.98%)、05:02(11.66...     

广西沿海地区Graves病与HLA-DQA1、DQBIDRB1*09等位基因的相关性研究

目的研究广西沿海地区Graves病（gravesdisease,GD）患者中HLADQA1、DQB1及DRB1＊09等位基因的分布情况及其关系。方法采用序列特异性引物PCR（PCR—SSP）方法检测162例广西沿海地区GD患者及90例健康者的HLA—DQA1、DQB1及DRB1＊09的基因型,计算和比较各组间等位基因频率。结果与健康对照组比较,HLADQA1＊0501、DQB1＊0303和HLA—DRB1＊0901在GD患者组的分布频率明显增高（P〈0．05）;GD女性患者组中的HLADQA1＊0301频率比健康对照组女性明显升高,差异有统计学意义（P〈0．05）。结论HLADQA1＊0501、HLA-DQB1＊0303及HLADRB1＊0901是广西沿海地区GD遗传易感基因;DQA1＊0301是广西沿海地区女性GD患者中的遗传易感基因。     

广东汉族HLA-A、C、B、DRB1和DQB1基因的高分辨多态性及连锁不平衡分析

目的研究广东汉族人群的人类白细胞抗原(HLA)-A、C、B、DRB1和DQB1基因的高分辨多态性和等位基因间的连锁不平衡关系。方法PCR-测序分型方法(sequence-based typing,SBT)对144名随机广东汉族造血干细胞捐献者的HLA-A、C、B、DRB1和DQB1基因进行序列分析,并采用PyPop软件计算等位基因频率、单体型频率和连锁不平衡参数。结果发现1个新等位基因HLA-Cw*0340;HLA-Ⅰ类基因中,A、C、B基因座分别检出27、24和54个等位基因,其中频率>0.05常见等位基因包括A*1101、A*2402、A*0207、A*0201、A*3303、A*0203、Cw*0102、Cw*0702、Cw*0304、Cw*0801、Cw*0302、B*4601、B*4001、B*1301、B*5801和B*1502;HLA-Ⅱ类基因中,总共观察到30个DRB1和15个DQB1等位基因,频率>0.05的常见等位基因见于DRB1*0901、DRB1*0301、DRB1*1501、DRB1*1202、DRB1*0803、DRB1*1101、DRB1*1602,DQB1*0303、DQB1*0301、DQB1*0502、DQB1*0601、DQB1*0201、DQB1*0302和DQB1*0501;除A-DQB1最常见单体型为A*1101-DQB1*0301外,其它所有两座位单倍型以及A-C-B、A-B-DRB1和A-C-B-DRB1-DQB1扩展单体型的最常见型均由A*0207、Cw*0102、B*4601、DRB1*0901和DQB1*0303组合而成。任意2个HLA基因间均具有强的连锁不平衡,而21.99%—31.63%的有价值连锁不平衡单倍型具有统计学意义(χ2>3.84,P<0.05),其中频率≥0.01的有156条。结论获得了广东汉族人群HLA-A、B、C、DRB1和DQB1基因的等位基因和单体型多态性及连锁不平衡分析数据,为HLA基因的相关研究和应用提供了更加详细的参考资料。     

儿童Graves病与HLA-DQA1基因的相关性分析

目的　试图建立一种经济简单的HLA DQA1基因分型方法 ,为将来研究HLA DQA1基因相关性疾病及临床诊断弥漫性毒性甲状腺肿 (Graves′disease,GD)提供一种新的途径及方法。方法　用一对聚合酶链反应 (PCR)引物扩增 85例甲亢儿童及 5 0例健康对照外周血细胞基因组DNA的HLA DQA1基因的第二外显子多态性片段后作SSCP分析 ,再经DNA测序证实。结果　发现不同的DQA1基因亚型 ,在中性聚丙烯酰胺凝胶电泳中有不同迁移带 ,两组间有明显差异 ,其中d(DQA1 0 1 0 2 )、f(DQA1 0 30 2 / 0 5 0 1 )两带型频率显著高于对照组 (P <0 .0 5 ) ,而b带型频率显著低于对照组 (P <0 .0 5 )。结论　d、f带型与Graves病的易感性相关 ,b带型与Graves病的保护性相关 ,SSCP方法可以区分HLA DQA1基因多态性 ,不需要放射性同位素 ,是一种简便快速经济的新方法。     

糖尿病防治若干研究进展

近些年来糖尿病的研究取得了可喜的进展,现就糖尿病在防治研究领域的若干成就进行讨论. 1糖尿病病因及发病机制研究 1.1 1型糖尿病目前认为1型糖尿病(DM1)的病因是在遗传易感基因的基础上在外界环境因素作用下,引发机体自身免疫功能紊乱,导致胰岛B细胞的损伤和破坏,最终使胰岛素分泌绝对不足.通过对人类白细胞抗原(HLA)研究,发现糖尿病患者部分家族成员具有高危险性基因标志,如:HLA DR3、DQA1-0531、DQB1-0201、HLA DR4-DQA1-0301、DQB1-0302带有高危险性基因标志的成员5年后有患糖尿病的风险.     

碘摄入量及易感HLA基因与广西沿海地区Graves病的相关性研究

目的 研究碘摄入量及HLA-DQA1、DQB1、DRB1*09等位基因在广西沿海地区Graves病(GD)患者中的状况,及其与GD关系.方法 采用序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)和过硫酸铵消化-砷铈催化分光光度测定方法检测162例广西沿海地区GD怠者(GD组)及90例正常人(对照组)的尿碘浓度和HLA-DQA1、DQB1、DRB1*09的基因型,计算和比较各组间尿碘浓度和等位基因频率.结果 GD组HLA-DQA1*0301、DQA1*0501、DQB1*0303和DRB1*0901基因频率明显高于对照组(40.0%、32.7%、35.8%、29.6%vs 26.7%、13.3%、16.7%、12.2%,P<0.05或<0.01);按性别分层后,HLA-DQA1*0301在GD女性组中频率较对照女性组明显升高(44.1%vs 26.5%,P<0.05);GD男性和女性组HLA-DQA1*0501、DQB1*0303、DQB1*0901基因频率明显高于对照男性和女性组(33.3%、39.2%、29.4%vs 12.2%、17.1%、9.8%,均P<0.05;32.4%、34.2%、29.7% vs14.3%、16.3%、14.3%,均P<0.05);GD组尿碘中位数较对照组明显升高(448.7 μg/Lvs 219.6 μg/L,P<0.05).结论 HLA-DQA1*0501、HLA-DQB1*0303及HLA-DRB1*0901是广西沿海地区GD患者遗传易感基因;DQA1*0301是广西沿海地区女性GD患者遗传易感基因;而高碘是该地区的易感环境因素.     

用PCR-指纹图和PCR-单链构象多态性对骨髓移植供、受体进行HLA-D区配型

为探讨HLA血清学分型与DNA配型结果的相关性,本文建立了HLA-DQA、DQB、DPB、DRB位点聚合酶链反应-指纹图(PCR-F)、聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)配型方法,并用PCR-F、PCR-SSCP对21对骨髓供、受者进行了基因配型。与血清学结果比较,其中10对血清学配型一致的供、受体,在DQA位点PCR-F、PCR-SSCP有8对相合,在DRB位点有7对相合。提示在配型中,应用PCR-F和PCR-SSCP可发现血清学不易检测出的基因亚型。     

云南地区肾移植受者HLA基因分布频率分析

目的 探讨云南地区肾移植受者人类白细胞抗原(HLA)-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因分布频率.方法 收集2017年6月至2020年11月该院1251例肾移植受者HLA基因检测结果,分析HLA-A、B、DRB1和DQB1位点等位基因分布频率.结果 HLA-A位点检出等位基因17种,其中A*11、A*02和A*24分布频率较高,分别为0.3145、0.2802和0.1930.HLA-B位点检出等位基因31种,其中B*15、B*40和B*46分布频率较高,分别为0.1926、0.1199和0.1199.HLA-DRB1位点检出等位基因14种,其中DRB1*12、DRB1*04、DRB1*09分布频率较高,分别为0.2178、0.1399和0.1171.HLA-DQB1位点检出等位基因7种,其中DQB10301、DQB1*05和DQB1*06分布频率较高,分别为0.2866、0.2010和0.1671.结论 云南地区肾移植受者HLA-A、B、DRB1和DQB1位点中,A*11、B*15、DRB1*12和DQB10301分别为分布频率最高的等位基因,符合南方汉族人群H LA基因多态性的分布特征.     

中医瘀血体质与HLA—Ⅱ类基因相关性研究

目的：研究中医瘀血体质与HLA—Ⅱ类基因（DPB1、DRB1、DQB1）多态性的关系。方法：采用PCR—SBT（sequence—basedtyping）分型方法对正常体质、瘀血体质人群样本进行DPB1、DRB1、DQB1基因分型。比较组间各等位基因表型频率（PD并计算相对危险度（RR）。结果：与正常质组比较，瘀血质组DRB1＊15011、DRB1＊04051、DQB1＊05021表型频率显著降低（P=0．04、0．01、0．05）；DRB1＊1405、DRB1＊14071、DQB1＊03032、表型频率显著升高（P=0．04、0．02、0．02）。结论：HLA基因与中医体质类型有一定关联，为中医体质的免疫遗传学研究提供依据。     

陕西地区HLA确认和罕见等位基因及单体型研究

目的本研究分析陕西地区1 276例临床血液病患者和供者HLA-A/B/C/DRB1/DQB1高分辨分型结果中确认等位基因(Well-Documented alleles)和罕见等位基因(Rare alleles)的检出情况并且总结确认等位基因相关单体型。方法应用PCR-SBT和PCR-SSOP 2种方法对临床血液病患者和供者HLA-A/B/C/DRB1/DQB1 5个位点进行高分辨检测和复核。结果 1 276例患者和供者中共检出48种确认等位基因并且分析总结出11种确认等位基因相关的单体型,检测出5个罕见等位基因HLA-A*11∶140、B*07∶248、C*08∶125、DQB1*06∶103和DQB1*06∶117,其中C*08∶125在同1个家族姐弟中被检出3次。结论在临床检测和分析的过程中,应该不断的记录和统计确认和罕见等位基因,保证中华骨髓库(China Marrow Donor Program,CMDP)HLA基因多态性的不断丰富,有助于中国CWD表的不断完善。对确认和罕见等位基因相关单体型总结和分析,为临床指导非亲缘造血干细胞移植供者的选择提供理论依据,保证携带确认和罕见等位基因的患者最大可能的找到匹配的供者。