单细胞转录组测序技术及其在肿瘤研究中的应用

单细胞转录组测序是指对单个细胞的全部RNA进行逆转录、扩增和测序,再进行生物信息学分析的技术。自2009年Tang等基于高通量测序平台开始单细胞转录组测序之后,该技术发展突飞猛进。由于该技术能在单细胞水平诠释细胞的异质性,因此已广泛应用于生命科学各领域尤其是肿瘤等疾病研究。本文将主要综述单细胞转录组测序技术流程和技术发展,及其在肿瘤异质性、肿瘤转移、肿瘤微环境、肿瘤药物等研究中的应用进展。     

单细胞转录组测序技术及其在肿瘤研究中的应用进展

单细胞转录组测序是指对单个细胞的全部RNA进行逆转录、扩增和测序后再进行生物信息学分析的技术,近年来发展迅猛。该技术能在单细胞水平诠释细胞的异质性,已广泛应用于生命科学各领域尤其是肿瘤等疾病的研究。本文主要介绍单细胞转录组测序技术的流程和技术发展,同时分析总结其在肿瘤异质性、肿瘤转移、肿瘤微环境和抗肿瘤药物研发等方面的应用进展。     

单细胞表观遗传测序技术最新进展

单细胞测序技术是目前解码组织、器官、细胞、分子异质性的重要热门工具,其主要基于二代测序技术,根据其检测对象可分为单细胞基因组学测序技术、单细胞表观组学测序技术、单细胞转录组学测序技术,以及可同时解析多个组学的单细胞多组学测序技术.表观遗传学是连接基因组学和细胞表型的重要调控环节,其可通过染色质的可及性、DNA和组蛋白的...     

单细胞转录组测序在肺部疾病中的应用进展

单细胞转录组测序又称单细胞RNA测序,是通过分离单个细胞获得它们的转录本,并将转录本映射到单个细胞的测序库,进而分析评估细胞特性的一项高通量测序技术。近年来单细胞转录组测序技术已广泛应用于肺部疾病的研究,以深入了解疾病状态下肺组织细胞的生物学特征。本文对单细胞转录组测序技术的基本原理及其在肺部疾病研究中的应用进展进行综述,为各种常见肺部疾病状态下肺组织的细胞异质性、亚群鉴定及基因表达调控机制等相关研究的开展提供参考。     

单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用

肿瘤是具有高度复杂性的整体,理解肿瘤免疫微环境的组成和功能是指导有效肿瘤免疫治疗的前提。单细胞RNA测序可以在单细胞分辨率水平上检测细胞的转录水平,描述其功能状态,加深对肿瘤免疫微环境中各细胞类群组成和功能的理解。本文总结了近年来单细胞RNA测序技术在肿瘤免疫微环境研究中的应用。     

单细胞测序技术在肿瘤医学研究中的作用?

正答:肿瘤是一种基因疾病,其发病机制包括单核苷酸突变、拷贝数变异、插入/缺失等。肿瘤研究的关键是理解基因的改变在肿瘤发生、发展过程中发挥的作用。随着肿瘤标志物的不断发现及免疫技术的发展,单细胞测序技术的发展为探寻肿瘤发生中基因的改变提供了有力的工具。通过肿瘤标志运用流式细胞术分选单个肿瘤细胞,并通过细胞测序获得大量信息,在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通     

单细胞转录组测序联合空间转录组测序在纤维化疾病研究中的应用进展

单细胞转录组测序联合空间转录组测序可解析组织内每一个细胞的转录组表达谱和空间位置信息,有助于探究细胞的基因表达水平和组织的三维重建,解读细胞异质性,理解细胞间的联系和相互作用,对于深入探讨疾病发生和发展的细胞与分子机制具有重要意义。纤维化疾病累及全身多个器官,病程极为复杂,缺乏有效的抗纤维化治疗方法,因此仍需加强对此类疾病的全面认识。近年来,单细胞转录组测序联合空间转录组测序已应用于纤维化疾病的病理生理机制研究中,取得了较多进展。本文简要介绍单细胞转录组测序联合空间转录组测序技术,并对其在纤维化疾病研究中的应用进展作一综述。     

单细胞测序在儿科疾病中的应用进展

单细胞测序是一项新兴的测序技术,指在单个细胞水平上对细胞基因组和转录组等组学进行测序。相比传统的测序方法,单细胞测序在揭示生物异质性方面具有独特优势,有利于更深层次地揭示疾病发生、发展的机制。同时,单细胞测序在发现稀有细胞群体、展现细胞起源和分布状态、检测生物标志物中也发挥重要作用,其研究成果涉及了免疫治疗、靶向用药、胚胎发育等众多领域,该技术正逐渐成为由基础研究向临床转化的桥梁。本文就单细胞测序的主要流程及该技术在儿童肠道疾病、免疫性疾病、肿瘤等领域的应用进展作一综述,探讨该技术在儿童群体中的未来发展方向,以期更好地应用于后续儿科疾病的诊治。     

单细胞转录组测序联合空间转录组测序在纤维化疾病研究中的进展

蓬勃发展的单细胞转录组测序联合空间转录组测序,可以解析组织内每一个细胞的转录组表达谱和空间位置信息,这有助于探究细胞的基因表达水平和组织的三维重建,解读细胞异质性,理解细胞间的联系和相互作用,深入探讨疾病的发生发展机制。近年来,该综合技术已应用于纤维化疾病的病理生理机制研究中,并且取得了较多的进展。本文将简要介绍单细胞转录组技术和空间转录组技术,并对两者联合在纤维化疾病中的研究进展作一综述。     

单细胞RNA测序在干细胞生物学中的应用研究进展

细胞间的变异或异质性是干细胞群的基本和内在特征。传统的组学分析是在混合细胞群体上进行,导致这些差异被掩盖。近年来,单细胞基因组、表观基因组、转录组测序等技术发展迅速,为全面解析细胞异质性和识别不同表型细胞类型提供了强有利工具。这些方法应用于不同类型的干细胞,包括多能干细胞和组织特异性干细胞,在干细胞领域取得了令人兴奋的新发现。本文综述了单细胞组学测序技术的最新进展,并对单细胞组学测序的方法和应用进行了展望。     

应用单细胞测序技术进行中医体质研究探讨

旨在阐述单细胞测序技术的优势，促进单细胞测序技术在中医体质研究中的应用。通过介绍单细胞测序技术概况及其在医药领域的应用，论述单细胞测序在中医体质学研究中的可应用方向。运用单细胞测序方法进行“体质可分”“体病相关”“体质可调”中医体质关键科学问题和“禀赋遗传”等中医体质基本原理的研究，拓展中医体质研究思路和方法，为探索中医体质理论的现代研究提供了新的支撑。加快传统中医药与现代生命科学技术的结合，有利于中医体质研究的发展进程。     

美、英及我国政府对单细胞测序研究及应用领域的基金资助

目的：从政府基金资助的角度探讨了我国在单细胞测序相关领域的主要布局与发展以及与发达国家的差距,为相关决策部门提供参考。方法：从美、英及我国政府资助平台获取信息,分析单细胞测序相关领域的基金资助与研究方向。结果：目前在单细胞测序相关领域,美英政府分别资助5.4亿美元和4 000万英镑用于生物医学和技术开发,我国政府累计投入约1亿元,主要用于微生物、肿瘤和生殖医学等领域,重点是技术研发。结论：我国对单细胞测序相关领域的基金资助起步晚于美英,需要充分利用现有资源推动单细胞测序技术的进步与应用。     

单细胞转录组测序技术及其在免疫学研究中的应用

免疫系统具有复杂性、多变性以及可塑性。目前免疫系统的组成和动态变化的研究过程只局限在其群体效应,无法体现免疫系统的异质性。近年来,单细胞技术的出现革新了对免疫学问题的认识。单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)技术是目前应用最广泛的单细胞技术,它能够在单细胞和单分子的水平进行免疫学分析,揭示生理或病理条件下的免疫反应过程。因此,本文对单细胞RNA测序技术的一般流程、发展及其在免疫学方面的应用进展进行综述,并展望了单细胞RNA测序技术在免疫学方面的发展前景。     

单细胞转录组测序在黑色素瘤中的研究进展

黑色素瘤是成人第五大常见的恶性肿瘤,亚洲人与其他有色人种的黑色素瘤存在明显差异,其发生发展机制复杂,具有高度侵袭性、转移性和致死性,预后差。因此,加强该病基础研究尤为重要。单细胞转录组测序作为近年来快速发展的新技术,以其特有的优势,如探索细胞亚群的异质性、鉴定稀有细胞、使用算法揭示不同组织细胞的分化轨迹等,极大地推动了包括黑色素瘤在内的肿瘤学研究发展。本文将就目前黑色素瘤单细胞转录组测序研究中,在肿瘤异质性、肿瘤微环境和细胞互作、免疫逃逸与治疗抵抗方面的研究进展做一综述。     

单细胞测序在肿瘤基因检测中的研究进展

肿瘤是全球第二大死亡原因,但其发生、发展和转移的分子机制尚不明确,肿瘤的诊断、检测和治疗手段仍不完善。传统的高通量检测方法是对大量的混合细胞进行遗传信息的研究,把大量混合细胞的遗传信息进行平均化,这样不仅无法观察到各种类型的细胞之间的区别,还会掩盖一些重要且数量稀少的细胞的独特特征。单细胞测序技术为探究肿瘤在单细胞层面的变化提供了新的手段,同时为发现新的生物标志物和药物靶点,促进癌症诊断、监测和治疗提供了新途径。     

DNA甲基化与结直肠癌发生发展的关系

表观遗传调控在肿瘤的形成、发展、转移中起着重要作用,为研究肿瘤的发生机制及预防、诊断和治疗提供了重要线索。DNA甲基化是表观遗传学中研究比较成熟的一种修饰形式,是肿瘤发生、发展的分子机制之一。在此详细论述了DNA甲基化在结直肠癌与肿瘤基因/抑癌基因间的关系,目的为治疗结直肠癌提供新的思路。