论大肠杆菌调控系统的形成机理

对大肠杆菌调控基因进行同源搜索可以发现，调控基因是以族群形式存在的。同一族群的基因之间同源程度很高。依据基因之间同源值的大小，将同一言辞群的基因连接起来，就构成了调控基因族群族谱。在这个族谱中，基因之间有辈份的区别。相连接的两个基因之间是父子关系，子基因是父基因通过转座生成的。通过对转座段进行分析，发现这种转座与过去发现的转座形式是不同的。这种转座不是整个基因段的转座，而是父基因通过裁剪机制，剪去一部分序列，以亚基因片段转座，这种转座我们称为裁剪转座。这是一种新型的转座，和以前发现的转座和转座理论不同。同时，对转座片段两端序列进行分析，发现父基因转座片段两端存在一种象标尺一样的正向重复序列，本文称为转座标尺序列。它是裁剪转座段的标尺。同时在子基因中的两端，也就是转座点，也有一段标尺序列，它是决定转座点的标尺。它和裁剪标尺序列的关系是正向配对。这种配对和通常所见的DNA双链、RNA双链中的反向配对也是不同的。此外，从几个方面进行分析还发现，调控基因的裁剪转座是和调控有关的，这种转座实际上是一种调控转座。调控是引发转座的原因，是转座的动力。在此基础上，本文建立起了调控转座模型。根据调控基因族群表现出的特性，以及父子调控基因之间序列的相似性，作者推测大肠杆菌调控基因有基因互控关系，依据这种基因互控关系，建立起了大肠杆菌调控总模型。这就是调控基因调控功能基因转录子的转录，同时调控基因又按照调控基因群族谱互相调控。本文还根据对基因群族谱的分析，推测调控基因起源于运输蛋白基因。     

鱼类抗病基因的研究进展

鱼类虽是低等脊椎动物，但它仍具有较完善的免疫系统。从体系方面来讲，鱼类的免疫防御系统由免疫细胞和免疫分子两部分组成。从应答方面来讲，鱼类的免疫防御系统又划分为先天性免疫细胞及分子和适应性免疫细胞及分子。鱼类的非特异性免疫系统在鱼类自身抗病作用中，较特异性免疫系统发挥更大作用。本文从鱼类免疫系统的防御功能，分别综述了主要组织相客性复合体基因、免疫球蛋白基因，补体基因、干扰素基因，凝集素基因、白细胞介素基因，抗菌肽基因、p53基因、溶菌酶基因，转铁蛋白基因，鱼精蛋白基因以及金属硫蛋白基因等12种鱼类非特异性免疫因子和抗病因子厦其基固的分子生物学研究进展，并分析了上述因子及其基因的特点。     

鼻咽癌基因研究进展

肿瘤是一种严重危害人类健康的疾病，对于肿瘤癌基因和抑癌基因的研究具有重大意义，其中与鼻咽癌相关的癌基因以及候选瘤基因有LMP1基因、bcl—2基因、ras基因、c—erbB—基因、Tx基因、NAG23／FBXO30基因等，抑癌基因及候选抑瘤基因有p53、p16基因、p130／Rb2基因、nm23基因、NAG7基因、NAG11基因、NAG12基因、UBAP1基因、YH1基因、NGX6基因等，这些基因在鼻咽癌发生、发展过程中有着重要作用。     

神经干细胞分化前后基因表达变化的DNA微阵列分析

目的：了解神经干细胞分化前后的差异表达基因，为神经干细胞的分化调控提供基础研究资料。方法：利用细胞培养、DNA微阵列技术等，检测了神经干细胞分化前后的差异表达基因。结果：检测到了1000多个差异表达基因，其中明显上调的基因138个，明显下调的基因179个，基因种类很多如细胞周期相关基因、发育与分化相关基因、受体与通道相关基因、细胞骨架相关基因、生长因子相关基因、原癌基因和抑癌基因、转录和翻译调节基因、ESTs、代谢调节、蛋白运输相关基因等。结论：大量基因参与了神经干细胞的分化调控，其确切调控机制，还有待于进一步深入研究。     

一种快速检测CpG胞嘧啶甲基化的方法

脊椎动物基因5＇端的CpG岛甲基化状态能够调控基因的转录，几乎所有的看家基因和近一半的组织特异性表达基因的表达受CpG岛甲基化调控。在正常生理条件下，大部分CpG岛处于非甲基化状态。DNA修复基因、肿瘤抑制基因都是看家基因，在肿瘤组织中其CpG岛常常处于异常甲基化状态，导致基因转录失活。肿瘤抑制基因的异常甲基化成为继基因结构变异之外的又一种重要基因失活方式。     

缺血性脑卒中的遗传

人类的一些遗传性状或遗传病不是决定于一对主基因，其遗传基础是多对基因，这些基因对该遗传性状或遗传病形成的作用是微小的，称为微效基因。多对微效基因累加起来可以形成明显的表型效应，称为加性效应(additive effect)，这些基因也称为加性基因(additive gene)。多基因性状或遗传病的形成除受微效基因影响外也受环境因素的影响，所以这种遗传方式称多基因遗传(polygenic inheritance)或多因子遗传(multifactorial inheritance)。     

弓形虫依钙蛋白激酶Calpain-like的克隆及生物学特性

目的克隆弓形虫RH株Calpain（依钙蛋白酶）-like基因，分析免疫生物学功能，筛选预防弓形虫感染的疫苗候选分子。方法利用人类、鼠类和其它寄生虫的Calpain基因同源性比较的保守区域合成混合引物，以弓形虫的RNA为模板，应用RT-PCR扩增弓形虫Calpain-like基因片段，扩增的片段通过TA克隆插入克隆载体pET32A，筛选阳性克隆进行双酶切鉴定和DNA序列分析，用克隆的基因片段制备特异性基因探针，经Northern blot技术证实弓形虫Calpain-like基因mRNA。结果RT-PCR扩增了316bp弓形虫Calpain-like基因，其DNA序列与日本血吸虫Calpain基因同一区域的同源性为70％，与计算机推测的弓形虫Calpain-like基因的同源性为100％。Northern blot显示了弓形虫Calpain-like基因mRNA的大小约6300bp。结论弓形虫RH株基因组中存在Calpain-like基因，Calpain-like基因在弓形虫RH株中高度表达。     

用生物信息技术初步分析杂交水稻的抗病基因

目的：通过对水稻基因组序列信息的分析，全局地、宏观地了解各种植物抗病相关基因在水稻中的同源情况，发现水稻的抗病相关基因，方法：利用各种基因预测软件，以多种植物的数据库，特别是单子叶植物的数据和EST数据库为训练集，进行基因的预测，收集各个公用数据库中各种植物抗病相关基因的蛋白序列，包括抗病基因（R基因）和抗病基因信号传导途径相关基因，将它们与水稻基因组数据库比对，并进行保守区分析，结果与结论：发现水稻的抗病相关基因具有较为特殊的R基因类型和独特的信号传导与调控系统，这些特性与单子叶和双子叶植物的系统发生有关，为加快水稻抗病性研究，培育优良新品种的步伐提供强有力的帮助。     

气的实质与基因关系的研究

试从分子生物学基因重组与克隆技术，DNA多态性，基因的转录，表达与调控，细胞增殖与凋亡，基因疗法等角度，论述中医气学理论的科学性及先进性。认为：基因是气的生命表现形式，从基因角度研究中医气学理论，有助于气实质的研究。     

人类T细胞白血病病毒的tax基因研究进展

人类T细胞白血病病毒(HTLV)的tax基因长约1000bp，它的基因产物命名为p40tax蛋白。p40tax蛋白激活HTLV部分病毒基因组，而促进病毒复制。另外，p40tax也能激活其他细胞基因，激活大量基因的转录，包括几种细胞因子的产物的基因，例如IL-2、IL-2a受体、IL-6、IL-1S和肿瘤坏死因子^[1]。另外，p40tax能抑制肿瘤抑制基因^[1]。tax基因的能力是激活许多基因，并诱导肿瘤形成。因此，tax基因不是一种真正的病毒癌基因，在HTLV相关的白血病和淋巴瘤的发展中，tax基因扮演着一个重要角色。     

基因疗法的跨世纪策略

基因疗法是指将正常基因植入靶细胞代替遗传缺陷的基因，或关闭、抑制异常表达的基因，以达到预防和治疗疾病目的的一种临床治疗技术。探讨基因疗法的最初目的是为了治疗那些世代相传的遗传性疾病，随着研究的进展发现，基因疗法也可用于治疗某些后天获得性疾病。基因疗法...     

老年人睾丸组织退化的基因表达谱研究

目的：研究老年人睾丸组织基因表达谱变化，为研究老年人睾丸功能衰退机制奠定基础。方法：知情同意下获取正常青年人和老年人睾丸组织标本各3例，采用QIAGEN RNA提取试剂盒提取总RNA，分别等量混合后制备探针。利用ClonTech公司生产的包含8000个已知基因的人类cDNA基因芯片[Atlas Plastic Human 8K Microarray(cat．#7905—1)]筛选差异表达基因。按基因功能分类方法对老年睾丸组织中差异表达的基因进行归类分析。用RT—PCR、T—A克隆测序等方法选择目的基因，验证基因芯片结果。结果：筛选到差异表达基因117个(1．46％)，83个基因在老年睾丸组织中表达下调，34个基因表达上调。在表达下调的基因中，代谢相关基因16个(19．3％)，与基因和蛋白表达相关的基因18个(21．7％)，信号通路相关基因16个(19．3％)，细胞分化相关基因19个(22．9％)，细胞结构和运动相关基因6个(7．2％)，细胞或内环境稳态相关基因4个(4．8％)，未知功能基因4个(4．8％)。在表达上调的基因中，代谢相关基因3个(8．8％)，与基因和蛋白表达相关的基因10个(29．4％)，信号通路相关基因2个(5．9％)，细胞分化相关基因11个(32．4％)，细胞结构和运动相关基因8个(23．5％)。RT—PCR及T—A克隆测序进一步证实呼吸链相关的基因cox7a2在老年睾丸组织显著上调，atp50显著下调。结论：老年人的睾丸组织中基因表达谱发生了明显变化，老年人睾丸功能衰退与多种基因表达变化有关，其中呼吸链功能相关cox7a2、atp50基因的显著差异表达可作为重要目的基因，可能对进一步研究睾丸功能衰退的机制具有重要意义。     

酵母PHO81基因与酸性磷酸脂酶家族中其他基因的关系

为阐明酵母PHO81基因与酸性磷酸脂酶（APase)家族中其他基因的相互关系，用已构建的PHO2、PHO85、PHO5、PHO11及PHO81基因与半乳糖苷酶基因（LacZ)的重组质粒对野生型酵母菌和PHO2、PHO85、PHO81等调控基因突变株分别转化，以β-半乳糖苷酶的活力表示各基因的表达水平，分析这些调控基因对其它基因表达的影响，结果表明，PHO81基因对结构基因的表达起着正调控作用。调控基因PHO2、PHO85的表达不受PHO81基因的影响，而PHO81基因的表达却受前者的调控，在低磷条件下，PHO2基因的突变使PHO81表达水平下降7倍，PHO85的突变则使PHO81呈构成型高效表达。     

风湿病的基因疗法

风湿病的病因及发病机制颇复杂，治疗也有相当困难。基因疗法是在生物学技术基础上发展起来的一种新的疗法。本文从基因疗法的概念，有抗风湿作用的基因，抗风湿基因的转染方式，载体的选择和改进，如何获得持久的并可调节的基因表达，基因疗法的安全性，以及基因疗法在类风湿关节炎（RA）和其他各种风湿病治疗上的应用近况等各个方面进行综述，这一新疗法令人鼓舞，有着极好的开端和宽广的应用前景。     

肿瘤抑制基因p53的研究进展

随着肿瘤发病分子机制的逐步揭示和分子生物学技术的发展，肿瘤基因及其治疗已成为研究热点。现在人们知道，所有肿瘤的发生都是由于一些肿瘤相关基因的改变而产生，为了使癌变细胞能逃避机体免疫机制的控制，最终发展成肿瘤，通常需要积聚5—9次基因改变。这些基因的改变通常发生于细胞发育、细胞增殖、细胞分化、细胞存活、细胞休止以及遗传学修复有关的基因中。其中一些涉及细胞生长正调节的基因通常称之为癌基因，而涉及细胞负调节的基因则称之为抑癌基因。一旦癌基因与抑癌基因之间的平衡被打破，控制细胞增殖的癌基因持续或过高表达，同时抑癌基因不表达或失活，会导致各种人类肿瘤的形成和发展。常见的抗癌基因有p53，p21，p27，p16，FTEN，FHIT，BRCA1／BRCA2等。其中p53基因最受瞩目，这是因为在人类恶性肿瘤中至少有50％发生了p53基因的变化。现就将p53基因与肿瘤关系的研究进展综述如下。     

论“五劳”行为相关基因表达的分析

从OMIM检索与五劳，基因实（表达量过多），基因虚（表达不足）的相关基因，进而探讨五劳疾病与基因虚实，遗传性缺陷的相关情况，试图分析基因行为定势表达与疾病的关系，以供中医在疾病的预防，治疗，康复及养生保健等方面研究的参考。     

大鼠外周血淋巴细胞钟相关基因的筛选和鉴定

目的 探讨外周血淋巴细胞的钟相关基因。方法 采用mRNA差异显示技术比较不同时点基因的差异显示，筛选出大鼠外周血淋巴细胞的钟相关基因，并进一步用RNA干涉技术确定其为钟下游基因。结果 获得10条差异表达的eDNA片段，其中3种与已知基因过氧化氢酶、髓鞘蛋白脂蛋白和组蛋白乙酰化酶同源，4种与已知EST同源，另有3种为未知EST，它们均属Clock基因的下游基因。结论 外周血淋巴细胞中至少存在3种以上钟相关基因，其表达水平接受作为昼夜节律振荡器重要组分的Clock基因的调控。     

幽门螺杆菌耐药性与cagA、VacA基因相关分析

目的分析幽门螺杆菌的耐药性与cagA、VacA基因的关系。方法将上消化道疾病患者胃窦部组织接种后培养，并进行药敏试验，PCR聚合酶链反应技术测定幽门螺杆菌的cagA、VacA基因，同时测患者血清抗体。结果81株敏感菌株cagA基因检出率77．8％，VacA基因检出率95．1％，58株耐药菌株cagA基因检出率38．8％，％以基因检出率94．8％。结论％以基因与耐药性无关，耐药菌株中以不合cngA基因的HP菌株为主。     

FHIT基因与肿瘤研究进展

FHIT基因定位于人类染色体3p14．2区域，含有脆性位点FRA3B，该基因不仅在多种肿瘤中存在变异，其外显子在正常人群中也存在一定的多态性．FHIT基因在肿瘤中的改变主要是以缺失为主，包括外显子/或内含子的缺失，也有外源序列的插入。目前，人们普遍认为FHIT基因是一个抑癌基因，与多种肿瘤的发生和发展有关，本文就FHIT基因的发现，FHIT基因的结构与功能以及FHIT基因的变异与多种肿瘤的关系加以总结，以供参考。     

互信息关联模型在基因调控网络构建中的应用

【摘要】 目的 基因的表达受其它基因的影响较大，基因之间相互影响、相互制约的关系构成了复杂的基因表达调控网络。本研究基于基因表达的时空特性，寻求一种新的描述基因表达调控网络的方法。方法 根据信息熵确定属性权重，对各时间点进行加权聚类；根据互信息相关理论，确定相关系数，分析基因之间的调控关系。 结果 得到各基因之间的调控矩阵，进一步进行图像可视化。结论 利用信息熵理论得到信息熵相关系数后，可以根据两两基因之间信息熵相关系数的大小确定基因之间的调控关系，从而得到基因之间的生物学关系。该方法计算简便, 结果更为合理，可以从整体上了解生物细胞的生长过程，把握基因之间的相互关系，特别是对于发现基因的新功能有较好的效果，并为进一步的生物学实验提供了相关依据。