L1CAM基因分子遗传学研究进展

Ｌ１ＣＡＭ基因分子遗传学研究进展胡冬贵黎青黄艳仪自从１９９１年人类Ｌ１ＣＡＭ基因（Ｌ１－ｌｉｋｅａｄｈｅｓｉｏｎｃｅｌｍｏｌｅｃｕｌｅｇｅｎｅ，Ｌ１ＣＡＭ基因）完整的ｃＤＮＡ被克隆鉴定以来［１］，在短短的５年之内，分子遗传学的研究已证实Ｌ１ＣＡＭ基因...     

一个Chediak-Higashi综合征家系CHS1/LYST基因新变异

目的对1个旁系血亲婚配的Chediak-Higashi综合征家系的CHS1/LYST基因进行变异检测,探讨LYST基因变异与临床表型的关系。方法收集临床资料及家系调查,分析2例患者的临床资料和实验室检查结果。提取患者外周血DNA及父母等16名亲属指甲的DNA,采用外显子组测序分析患者的致病基因,根据基因变异点对亲属相应位点做Sanger测序,确认携带者。结果该家系中2例患者临床均有皮肤部分白化及免疫缺陷,表现为反复严重感染、出血倾向且发生嗜血现象,骨髓细胞及血涂片检查均出现粗大的嗜酸性包涵体颗粒。LYST基因第34外显子存在c.8782C>T(p.Gln2928*)纯合无义变异,与其表型相关,且该变异为新变异点。确认6名表型正常的家系成员的LYST基因存在与先证者相同的杂合变异,另10名表型正常的家系成员则均未检测到该变异。结论基因变异分析结果丰富了Chediak-Higashi综合征致病基因的变异谱,为临床明确病因提供了重要依据,并为家系遗传咨询和产前诊断提供了参考依据。     

一个Alagille综合征家系的 JAG1基因新变异与临床表型分析

目的:对1个Alagille综合征家系进行 JAG1基因变异和临床表型分析,探讨基因型与表型的关系。 方法:对先证者进行靶向捕获二代测序,并在家系内进行Sanger测序验证。检出的候选致病基因与已知疾病数据库比对并进行致病性评估。分析表型变化特点及基因型与表型的关系。结果:先证者及其姐姐、母亲 ...     

一个圆头精子症家系DPY19L2基因的变异分析

目的对一圆头精子症家系的DPY19L2基因进行变异分析,明确其遗传学病因。方法应用全外显子组捕获测序及生物信息学技术对该家系基因组进行分析,Sanger测序及实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术对致病基因的变异进行验证。结果全外显子组测序分析、Sanger测序及qRT-PCR验证显示家系两患者及其母亲均存在DPY19L2基因c.384dup(p.Glu129*)杂合变异,两例患者及父亲存在覆盖DPY19L2基因全长约164.5 kb的大片段杂合缺失。结论两例圆头精子症患者DPY19L2基因c.384dup(p.Glu129*)变异及DPY19L2基因缺失是其致病原因,符合常染色体隐性遗传规律。     

五个成骨不全家系COL1A1基因的变异分析

目的分析5个成骨不全家系的COL1A1基因致病变异位点,为家系遗传咨询及产前诊断提供依据。方法应用高通量测序方法对5个成骨不全家系的先证者进行225个骨病相关基因进行检测分析,所检岀的可疑变异经PCR扩增后进行Sanger测序,对5个家系的先证者及其家庭成员和100名正常个体进行验证,确定致病性变异后,对1个家系中的高危胎儿进行产前诊断。结果5个家系的先证者分别携带COL1A1基因c.3226G>A(p.Glyl076Ser)杂合错义变异、c.579delT(p.Glyl94Valfs*71)移码变异、c・2911_2912insAG(p.Gly971Glufs*138)插入变异、c.3037G>A(p.Glyl013Arg)杂合错义变异,以及c.642+5G>A杂合剪接变异;家系1胎儿产前诊断结果提示胎儿未携带与先证者相同的变异,与超声检查结果一致。5个家系的父母均未携带相应的变异,均为新发变异。100名正常个体均未检出上述变异。其中COL1A1基因c.3037G>A(p.Glyl013Arg),c.29U_2912insAG(p.Gly971Glufs*138)变异为未报道的新变异。结论COL1A1基因变异是5个成骨不全家系的致病病因。本研究的结果丰富了COL1A1基因的变异谱,为家系遗传咨询和产前诊断提供了依据。     

一个线粒体DNA耗竭综合征家系临床及DGUOK基因分析

目的对一个线粒体DNA耗竭综合征家系进行遗传基因变异分析,探讨其分子发病机制。方法提取家系中患者及其父母外周血基因组DNA,采用高通量测序技术检测致病基因变异,并对变异进行Sanger测序验证。结果发现患者DGUOK基因存在c.505_508delTATC的纯合变异,父母都是该位点的杂合变异携带者。c.505_508delTATC为未见报道的新变异位点,造成169位氨基酸由酪氨酸(Y)变异为精氨酸(R),随后编码框改变,在199位翻译提前终止,理论上产生截短蛋白p.Y169Rfs31X。结论c.505_508delTATC为DGUOK基因致病性变异,扩展了DGUOK基因变异谱。     

一个 EYA1基因无义变异所致鳃-耳综合征家系的遗传学分析

目的:探讨1个疑似鳃-耳综合征家系的临床表型,寻找该家系的可能致病原因,为其临床诊断提供依据。方法:应用目标序列捕获技术对先证者进行耳聋基因的筛查,找到可疑致病变异,并用Sanger测序对家系成员进行验证。结果:遗传性耳聋基因筛查检测到先证者 EYA1 c．1627C>T(p.Gln543Ter)无义变异;...     

中国汉族两个马凡综合征家系FBN1基因的一个新突变

目的 对两个常染色体显性遗传的马凡综合征家系进行基因诊断,并探讨其临床特点。方法 完成家系调查和系谱分析,通过聚合酶链式反应和直接测序的方法对收集到的两个家系中的成员进行原纤维蛋白1(fibrillin 1,FBN1)基因的突变检测。结果 两个家系均呈常染色体显性遗传模式。对两个家系成员进行FBN1基因突变检测发现,在两个家系的患者中发现一个相同的突变位点,即FBN1第27号外显子3463位碱基由G变为A( 3463G＞A),导致原纤维蛋白1第1 155位氨基酸由天冬氨酸变为天冬酰胺(Asp 1155Asn),而两个家系的正常成员及选取的100名健康对照中均未发现该突变位点。结论 先证者均符合Ghent标准诊断为马凡综合征,基因诊断发现两家系中相同的突变位点3463G＞A为中国汉族马凡综合征患者中首次报道。     

两个Coffin-Siris综合征家系的 ARID1B基因变异分析

目的:通过对两个Coffin-Siris综合征家系先证者的临床表征及基因变异分析,揭示其可能的遗传发病机制,为家系的遗传咨询提供依据。方法:应用全外显子组测序技术对两例先证者进行致病原因筛查,结合临床表型确定可能致病的候选基因,用Sanger测序法对先证者及其家系成员进行变异验证。结果:WES检测结果显示家系1先证者 ...     

一个 PCDH15基因变异所致的Usher综合征家系的遗传学分析及产前诊断

目的:对1个Usher综合征家系的临床特征及基因变异进行分析,明确其遗传病因。方法:对家系中患儿进行全外显子测序,就发现的可疑致病变异用Sanger测序法对患儿及其父母进行检测,明确先证者病因后,进一步对家系中的胎儿进行产前诊断。结果:测序结果显示先证者 PCDH15基因(NM_033056)存在c.17_...     

一个遗传性癫痫伴热性惊厥附加症家系的临床表型及 SCN1A基因变异分析

目的:分析1个遗传性癫痫伴热性惊厥附加症(genetic epilepsy with febrile seizures plus,GEFS+)家系的临床表型及遗传特征进行分析。方法:收集先证者及其家系成员的临床资料并提取外周血DNA,对先证者采用高通量测序以确定潜在的变异位点,对其家系成员采用Sanger测序进行验证。...     

一个致死性先天性挛缩综合征7型家系的 CNTNAP1基因变异分析

目的确定1个3次妊娠均出现羊水过多、早产, 其中两例活产出生, 出生后表现为呼吸困难、四肢挛缩、早亡等的家系的病因。方法应用全外显子测序技术(whole exome sequencing, WES)对胎儿组织及父母外周血样进行检测。经生物信息学分析, 对疑似致病性位点进行Sanger测序验证。结果 WES检测到胎儿组织标本CNTNAP1基因存在c.3718C>T(p.Arg1240Ter)无义纯合变异, 父母双方均检测到该位点的杂合变异。该变异尚未见数据库收录, 依据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南, 该变异被判断为致病性(PVS1+PM2+PP4)。结论 CNTNAP1基因c.3718C>T(p.Arg1240Ter)变异可能是该致死性先天性挛缩综合征7型(lethal congenital contracture syndrome type 7, LCCS7)家系的发病原因。致病性变异的检出可以为其临床诊断提供依据, 有助于该家系的遗传咨询和产前诊断。     

An updated and upgraded L1CAM mutation database

The L1 syndrome is an X‐linked recessive disease caused by mutations in the L1CAM gene. To date more than 200 different mutations have been reported, scattered over the entire gene, about 35% being missense mutations. Although it is tempting to consider these missense mutations as being disease‐causing, one should be careful in drawing any firm conclusions, unless there is additional supporting information. This is in contrast to truncating mutations, which are always considered to be disease‐causing, unless they involve truncations close to the gene stop codon. In order to allow conclusions to be drawn on the disease‐causing nature of L1CAM (missense) mutations, we have updated and upgraded our LICAM mutation database with more pathogenicity data and clinical information collected from the literature or generated by our own research. As a result, the renewed database offers condensed scientific information, allowing conclusions to be drawn on the pathogenicity and severity of LICAM mutations based on multiple factors. The L1CAMMutation Database is at: www.l1cammutationdatabase.info . © 2009 Wiley‐Liss, Inc.     

一个轴前多指畸形家系的基因变异分析CSCD

目的对1个轴前多指畸形家系进行基因变异分析,明确其可能的致病原因。方法提取先证者及其父母外周血DNA,采用trio全外显子组测序法检测疾病相关基因,筛选出可疑致病基因,并在家系其他成员中进行Sanger测序验证。结果基因测序结果显示家系中6例患者的LMBR1基因均存在c.423+4909(IVS5)C>T杂合变异。表型正常家系成员未检测到该变异。根据美国医学遗传学与基因组学学会遗传变异分类标准与指南,LMBR1基因c.423+4909(IVS5)C>T变异被判断为致病性(PM1+PM2+PP1-S(PS)+PP4+PP5)。结论LMBR1基因第c.423+4909C>T变异可能为该家系患者的致病原因。     

一例 DIS3L2基因变异所致Perlman综合征患儿的临床表型及遗传学分析

目的:分析1例Perlman综合征患儿的临床表型及 DIS3L2基因变异,了解其可能的致病原因。 方法:抽取患儿及其父母外周血,对患儿进行全外显子测序分析,根据筛出致病基因变异对患儿及其父母进行Sanger测序验证。按照美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medi...     

一个眼-脑-肾综合征家系的 OCRL基因变异研究

目的:探讨一个眼-脑-肾综合征(Lowe综合征)家系基因型与表型的关系,为遗传咨询提供依据。方法:应用全外显子测序(whole exome sequencing, WES)结合Sanger技术对先证者及其家系成员进行基因变异分析,对患者临床表型与以往文献比较。结果:先证者为一名3岁5个月男性患儿,临床表现为先天性白内障...     

A novel mutation in LICAM gene in a Japanese patient with x-linked hydrocephalus

Summary L1CAM is a member of the immunoglobulin gene superfamily of neural adhesion molecule. Abnormality of the L1CAM gene is associated with X-linked recessive form of congenital hydrocephalus (HSAS; hydrocephalus due to congenital stenosis of aqueduct of Sylvius) and some allelic disorders. Four new patients with congenital hydrocephalus consistent with the X-linked type were described. One of them had a novel mutation in the L1CAM gene.