SLC22A12基因rs893006和SLC2A9基因rs11942223位点与高尿酸血症关联性研究

目的 探讨rs893006和rs11942223位点与高尿酸血症的关系,为高尿酸血症的群体遗传学研究以及防治提供依据。方法 在某体检机构确定364例高尿酸血症患者为病例组,按性别、民族、年龄进行1:1匹配,选择364例健康个体为对照组,采用Sequenom Mass ARRAY iPLEX GOLD技术检测两组中单核苷酸多态性,通过多因子降维法（multifactor dimensionality reduction,MDR）分析基因位点和体质指数（body mass index,BMI）的交互作用。结果 病例组的肌酐、总胆固醇、甘油三酯、收缩压和BMI较对照组高,差异均有统计学意义（均有P<0.05）。在男性中,rs893006位点基因型频率和等位基因频率在两组中的差异均有统计学意义（χ₁2=6.372,P=0.041;χ₂2=4.935,P=0.026）;在男性不同遗传模型中,rs893006位点的G等位基因为保护因素,携带GG+GT基因型发生高尿酸血症的风险是TT基因型的0.405倍。采用MDR分析表明:BMI和rs893006及rs11942223位点之间可能存在较弱的协同作用,rs893006和rs11942223位点可能存在明显的拮抗作用,携带高危基因型群体发生高尿酸血症的风险是低危基因型群体的1.99倍（χ2=12.499,P<0.001）。结论 rs893006位点基因的多态性与男性高尿酸血症的发病有关联,位点rs893006和rs11942223与BMI之间存在交互作用。     

Sp110基因5'-UTR rs11679983 SNP与肺结核易感相关性研究

[目的]探讨Sp110基因5'-UTR rs11679983位点单核苷酸多态性对重庆籍汉族人群肺结核易感性的影响.[方法]采用病例一对照研究,选择100名初治涂阳肺结核患者和106名非结核病对照,运用ASA-PCR技术检测研究对象的基因型,比较Sp110基因5'-UTR rs11679983位点基因型频率及等位基因频率分布. [结果]Sp110基因5'-UTR rs11679983位点A/A、A/G、G/G基因型频率在病例组分别为21.00%、56.00%、23.00%;对照组分别为41.51%、54.72%、3.77%;两组间基因型分布差异有统计学意义(X2=18.11,P<0.001).Logistic回归分析显示rs11679983A/G与肺结核相关(OR=2.84,95%CI:1.76～4.59,P<0.001). [结论]Sp110基因rs11679983位点基因多态与肺结核易感性相关.     

SP110基因rs11679983A/G多态性与中国南方汉族肺结核易感性研究

目的探讨SP110基因rs11679983位点单核苷酸多态性与中国南方汉族人群肺结核的关联性,为临床治疗提供参考依据。方法纳入2013年1月-2014年12月医院118例肺结核患者为病例组,同期选取118名健康志愿者为对照组,运用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测基因型,数据采用SPSS 22.0软件进行统计分析。结果 SP110基因rs11679983 AA、AG、GG基因型在病例组和对照组的分布频率分别为0、90.7%、9.3%和0.8%、40.7%、58.5%;A、G等位基因在病例组和对照组的分布频率分别为45.3%、54.7%和21.2%、78.8%;肺结核患者中AG基因型和A等位基因频率高于健康对照人群。结论 SP110基因rs11679983位点单核苷酸多态性与中国南方汉族人群肺结核相关,AG基因型和A等位基因可能增加肺结核的易感性。     

IL-2（rs6822844）和IL-2Ra（rs2104286）单核苷酸多态性与原因不明复发性流产的相关性研究

目的：探讨白细胞介素2基因（IL-2）及其受体α（IL-2Rα）单核苷酸多态性（SNPs）与原因不明复发性流产（URSA）的相关性。方法：采用病例对照研究,应用实时荧光定量聚合酶链反应（qRT-PCR）技术,对中国浙江地区145例URSA患者及220例健康对照IL-2（rs6822844）G/T及IL-2Rα（rs2104286）A/G进行分析。结果：URSA组IL-2Rα（rs2104286）AA基因型及A等位基因频率均高于对照组,差异均有统计学意义（P＜0.05）。A等位基因携带者URSA患病风险是G等位基因携带者的2倍（OR=2.06,95%CI：1.34～3.16,P=0.001）,AA基因型较AG+GG基因型URSA患病风险增加约1倍（OR=2.27,95%CI：1.40～3.68,P=0.001）。URSA组及对照组IL-2（rs6822844）GG基因型频率均为100%,差异无统计学意义（P＞0.05）。结论：IL-2Rα（rs2104286）A等位基因可能是浙江地区URSA的遗传易感基因,IL-2（rs6822844）基因多态性与浙江地区URSA无相关性。     

质膜Ca2+-ATP酶异构体2基因多态性与噪声性听力损失易感性的关系

目的探讨质膜Ca2+-ATP酶异构体2(PMCA2)基因多态性与噪声性听力损失的关系.方法采用横断面流行病学研究方法,对194名噪声暴露作业工人进行调查和听力测试,按听力学评价的结果将其分为听力损失组和听力正常组;用多聚酶链反应-限制性片断长度多态性(PCR-RFLP)方法和等位基因特异扩增法(ASA)检测其PMCA2基因上rs2289274和rs6790640两个单核苷酸位点的多态性.结果在93名噪声性听力损失的工人中,rs2289274位点AA、AG和GG基因型的频率分别为16.1%、40.9%和43.0%,等位基因A和G的频率为36.6%和63.4%;在101名听力正常的工人中,其基因型频率分别为15.8%(AA)、32.7%(AG)和51.5%(GG),等位基因频率为32.2%(A)和67.8%(G).rs6790640位点在噪声性听力损失组CC、CT和TT基因型的频率分别为0、 82.8%和17.2%,等位基因C和T的频率为41.4%和58.6%;在听力正常组的基因型频率分别为1.0%(CC)、 76.2%(CT)和22.8%(TT); 等位基因频率为39.1%(C)和60.9%(T).两位点的基因型分布及其等位基因频率在噪声性听力损失组与听力正常组之间差异均无显著性(P＞0.05).采用多元Logistic回归对两组间年龄、性别、吸烟状况、爆震史和累积噪声暴露量等因素进行校正后,未发现两位点中任一基因型的噪声性听力损失的危险度有显著性升高(P＞0.05).结论 PMCA2基因rs2289274和rs6790640两个单核苷酸位点的多态性可能不是噪声性听力损失的遗传易感性因素.     

乌鲁木齐地区维吾尔族ORMDL3基因单核苷酸多态位点与哮喘易感性的研究

目的通过对乌鲁木齐地区维吾尔族哮喘患者和正常人群中血清类黏蛋白1样蛋白3(ORMDL3)基因单核苷酸多态(SNP)位点rs7216389、rs12603332基因型的检测,探讨rs7216389、rs12603332位点与哮喘患者易感性的关系。方法利用SNaPshot技术检测100例哮喘患者和93例对照组ORMDL3基因多态位点rs7216389、rs12603332基因分型及等位基因分布频率,并分析2组等位基因构成比。结果 rs7216389位点和rs12603332位点2组基因型分布频率差异均有统计学意义(X~2=7.029,P<0.05;X~2=11.367,P<0.05)。rs7216389位点2组A、G等位基因频率分别为61.5%、38.5%和74.2%、25.8%;rs12603332 2组G、A等位基因频率分别为58.5%、41.5%和74.7%、25.3%,差异也均有统计学意义(P<0.05)。结论 ORMDL3基因rs12603332位点和rs7216389位点多态性与新疆地区维吾尔族人群哮喘易感性相关,rs12603332位点的GG型和rs7216389位点的AA型可能是哮喘病的易感基因型。     

强直性脊柱炎易感性与IL-1F10基因多态性关系

目的探讨强直性脊柱炎易感性与白细胞介素-1F10(IL-1F10)基因中rs6743376和rs6761276位点基因多态性的关系。方法收集2007-2008年安徽医科大学附属第一医院门诊确诊的强直性脊柱炎患者161例和同期正常健康献血人群对照178人,采用基于高温连接酶的连接酶检测反应(LDR)方法检测其IL-1F10 rs6743376和rs6761276位点的单核苷酸多态性,分析比较其等位基因频率及基因型频率在2组中的分布。结果病例组和对照组的rs6743376位点A等位基因频率分别为74.2%,71.6%;C等位基因频率分别为25.8%,28.4%;2组的rs6761276位点C等位基因频率分别为21.1%,18.0%;T等位基因频率分别为78.9%,82.0%;2个位点等位基因在2组人群中的分布差异均无统计学意义(均P0.05);基因型频率在2组间的分布差异也无统计学意义。结论安徽籍汉族人群强直性脊柱炎易感性与IL-1F10基因rs6743376和rs6761276位点单核苷酸多态性无关。     

Ace基因多态性与维医异常黑胆质相关性

目的分析血管紧张素转换酶Ace基因多态性与异常黑胆质的关联。方法按照《维吾尔医诊断学》标准诊断喀什地区维吾尔族居民异常黑胆质组515例,诊断正常体液类型308例作为正常体液组,采用高分辨率溶解曲线-聚合酶链反应(HRM-PCR)方法对Ace基因进行基因分型,分析Ace基因8个位点多态性,比较两组基因型和等位基因的分布频率。结果异常黑胆质组和正常体液组Ace基因rs4293位点主要基因型为AG,主要等位基因是A;rs4344位点主要基因型为AG,主要等位基因为A;rs4303位点主要基因型为GG,少数等位基因是T;rs4461142位点主要基因型为CT,主要等位基因是C;rs8075924位点主要基因型为CC,少数等位基因是T;rs4316818位点主要基因型为CT,主要等位基因为T;rs12451328主要基因型为CC,少数等位基因为A;rs4353主要基因型为AG,主要等位基因分别是G、A。异常黑胆质人群Ace基因rs4353位点GG基因型频率(χ2=9.14,P=0.01)及等位基因G频率(χ2=8.16,P=0.01),rs8075924位点等位基因C基因频率(χ2=6.11,P=0.04)均高于正常体液人群,异常黑蛋质组高于正常体液组,差异有统计学意义。两组单倍型比较,rs4461142和rs4353位点A C单倍型分布频率异常黑胆质人群明显高于正常体液人群(χ2=10.33,P=0.001)。结论 Ace基因rs4353位点多态性,rs4461142和rs4353位点A G单倍与异常黑胆质有关联。     

2型糖尿病家系人群两种基因多态性分布

目的检测中国常州汉族2型糖尿病家系人群中PEA 15基因与KCNJ 10基因中2个单核苷酸位点多态性分布情况,探讨该遗传标记与2型糖尿病的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对该地区55个2型糖尿病高发家系265名成员的PEA 15基因（rs8175359）及KCNJ 10基因（rs2486253）2个单核苷酸多态性位点（SNPs）进行分析。结果在2型糖尿家系人群中,rs8175359位点基因型频率为：病例组中GG、GA分别为98.6%,1.4%;在未患病亲属组中为GG 99.2%,GA 0.8%,未发现AA纯合子。rs2486253位点基因型频率为：病例组中GG、GT分别为92.9%,7.1%;在未患病亲属组中为GG 91.1%,GT 8.9%。2组间基因型频率、等位基因频率的差异均无统计学意义。按性别等因素分层分析显示,rs2486253位点基因型频率构成比差异均无统计学意义。结论该两位点是否可作为2型糖尿的相关遗传标记需进一步在大样本人群研究中重复验证。     

蛋白激酶Cβ基因rs16972959多态性与类风湿关节炎的相关性研究

目的 类风湿关节炎（rheumatoid arthritis,RA）是一种受环境和遗传因素共同影响其易感性的自身免疫性疾病。研究显示蛋白激酶C β（protein kinase C β,PKCβ）基因与若干自身免疫病相关。本文分析在汉族人群中PKCβ的rs16972959是否与类风湿性关节炎具有相关性。方法 本研究采用病例对照研究并收集508例RA患者和503例健康对照。采用TaqMan探针基因分型技术检测病例组和对照组PKCβ 基因位点rs16972959的基因型。应用SPSS 16.0进行统计分析。结果 RA病例组和对照组PKCβ基因（rs16972959）等位基因频率分布差异无统计学意义（OR=0.928,95% CI:0.761~1.131,P=0.460）,基因型分布差异无统计学意义（GG vs AA:OR=1.054,95% CI:0.632~1.759,P=0.839;GA vs AA:OR=0.963,95% CI:0.570~1.627,P=0.888）。研究发现rs16972959等位基因频率与抗环瓜氨酸肽抗体（anti-cyclic citrullinated peptide,ACCP）有关（P=0.041）。此外,rs16972959基因型与类风湿因子（rheumatoid factor,RF）有关（P=0.042）。但是,本研究没有发现rs16972959与抗角蛋白抗体有关。结论 以上研究表明PKCβ 基因位点rs16972959与汉族人群RA遗传易感性无关。Rs16972959与部分实验室指标存在关联。     

新疆哈萨克族儿童基因rs9930506多态性与超重、肥胖的关联

目的 研究新疆哈萨克族学龄儿童体脂量和肥胖症相关基因(FTO)rs9930506与超重、肥胖的关系.方法 2009年5-6月采用整群抽样法在新疆伊犁哈萨克族自治州选取118名超重、肥胖儿童作为研究对象,对照组为141名体重正常的儿童.应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术分析2组儿童rs9930506位点多态性,同时使用自动生化仪酶法检测血糖、血脂,放射免疫法检测胰岛素浓度.结果 rs9930506在超重、肥胖组和对照组中基因型频率分别为:AA型0.458、0.582;AG型0.492、0.397;GG型0.050、0.021.两组AA、AG和GG基因型频率分布差异无统计学意义(x2=4.795,P=0.091),但GG+AG基因型频率在超重、肥胖组(0.542)高于对照组(0.418),差异有统计学意义(x2=3.957,P=0.047);A等位基因频率在超重、肥胖组和对照组分别是0.703、0.780,差异有统计学意义(x2=3.986,P=0.046).超重、肥胖组中GG;+AG基因型人群及AA基因型者的空腹血糖水平分别是(4.93±0.52)、(4.69±0.56)mol/L(t=2.430,P=0.017),臀围分别是(79.70±11.73)、(75.28±11.52)cm(t=2.053,P=0.042),体质指数(BMI)分别是(21.61±2.72)、(19.92±1.98)kg/m2(t=3.891,P=0.000),GG+AG基因型人群空腹血糖水平(t=2.430,P=0.017)、臀围(t=2.053,P=0.042)、BMI(t=3.891,P=0.000)均高于AA基因型者.结论 FTO基因rs9930506多态性和新疆哈萨克族学龄儿童超重、肥胖相关,与空腹血糖水平、臀围、BMI差异具有相关性.     

磷酸二酯酶4D基因rs918592位点多态性与急性冠脉综合征的关系

目的 探讨磷酸二酯酶(phosphodiesterase 4D,PDE4D)基因rs918592位点多态性与急性冠脉综合征的关系。 方法 运用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性方法(PCR-RFLP)检测50例急性冠脉综合征患者(ACS 组)及100例同期经冠脉造影排除冠心病诊断的患者作为对照组(NC 组)血液中PDE4D基因rs918592位点多态性,比较两组间的PDE4D基因rs918592位点多态性差异。 结果 150个样本中AA、AG、GG基因型频率分别为22.67%、56.66%、20.67%,符合Hardy·Weinberg定律(χ²=2.686,P=0.101)。ACS与NC两组的GG基因型(18% vs. 25%)、AA+AG基因型(82% vs. 75%)分布以及G(57% vs. 55%)、A(43% vs. 45%)等位基因频率差异无统计学意义(P<0.05)。 结论 PDE4D基因rs918592位点多态性与急性冠脉综合征无关。     

尼古丁乙酰胆碱受体基因多态性与焦炉工DNA损伤的关联性

目的 探讨尼古丁乙酰胆碱受体的CHRNA3-CHRNB4-CHRNA5基因簇多态性与焦炉工DNA损伤的联系.方法 选择中国北方某焦化厂的309名工人作为研究对象,按照血浆中苯并(a)芘二氢二醇环氧化物(BPDE)-白蛋白加合物水平,将研究对象分为高暴露组(154人)和低暴露组(155人),使用健康体检调查表收集个人健康信息,采用碱性单细胞凝胶电泳技术评价淋巴细胞DNA损伤,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术检测基因多态性,使用Phase v2.1.1软件计算单体型对.结果 高浓度多环芳烃暴露组工人外周血淋巴细胞彗星尾矩(OTM)值为1.23±1.05,低暴露组OTM值为0.80±1.07,两组比较,差异有统计学意义(P＜0.01).在高暴露组中,CHRNA3 -CHRNB4-CHRNA5基因簇的rs667282 CC基因型携带者外周血淋巴细胞的OTM值(1.64±0.17)明显高于CT和CT+TT基因型携带者(0.95±0.13和1.09±0.11),差异有统计学意义(P＜0.01);rs12910984 GG基因型携带者外周血淋巴细胞的OTM值(1.60±0.17)明显高于AG和AG+AA基因型携带者(0.92±0.13和1.07±0.10),差异有统计学意义(P＜0.01).单体型对的分析结果显示,在高暴露组中,人群中分布最广的TA/CG单体型对携带者OTM值最低(0.89±0.13),TA/TA和CG/CG单体型对携带者OTM值分别为1.35±0.17和1.64±0.17,TA/TA和CG/CG单体型对携带者的OTM值明显高于TA/CG单体型对携带者,差异有统计学意义(P＜0.05).在低暴露组中,没有发现该基因簇多态性与DNA损伤之间的关联.结论 CHRNA3-CHRNB4-CHRNA5基因簇多态性与焦炉工DNA损伤程度有关联.暴露于高浓度多环芳烃时,携带rs667282位点CC基因型的个体DNA损伤程度较其他基因型携带者高;携带rs12910984位点GG基因型的个体DNA损伤程度较其他基因型携带者高.为进一步阐明CHRNA3-CHRNB4-CHRNA5基因簇在肺癌发生中的作用提供了新的证据.     

CD46 rs1970530遗传变异影响肺腺癌易感性和预后

目的 探讨CD46 rs1970530变异与肺腺癌易感性和预后的关系。方法 该病例对照研究包括400例肺腺癌患者和600例正常对照。使用χ2检验比较病例组和对照组中性别、年龄和吸烟状况之间的分布差异。使用PCR -限制性片段长度多态性分析对CD46 rs1970530遗传变异进行基因分型。使用非条件logistic回归分析CD46 rs1970530变异与肺腺癌易感性的关系。使用Kaplan - Meier生存曲线、Log - Rank检验和Cox多因素回归模型评估CD46 rs1970530变异各基因型患者间的预后差异。通过UALCAN数据库分析CD46基因在肺腺癌组织及其癌旁正常组织中的表达差异,使用Kaplan - Meier Plotter数据库分析CD46表达对肺腺癌患者总体生存时间的影响。结果 CD46基因在肺腺癌组织中的表达显著高于正常组织,且CD46高表达肺腺癌患者的总体生存时间显著高于CD46低表达患者。与CD46 rs1970530 AA基因型携带者相比,至少携带一个G等位基因的肺腺癌患者的发病风险显著增加（OR = 1.52,95%CI:1.10～2.09）。不同性别和年龄的中位生存时间不存在统计学差异（P＞0.05）。在肺腺癌患者中,不吸烟者的中位生存时间（48个月）显著高于吸烟者（19个月）（P = 0.001）。携带CD46 rs1970530 GG基因型的肺腺癌患者的中位生存时间（10个月）显著低于AA基因型（35个月）和AG基因型患者（56个月）（P = 0.002）。多因素COX回归分析显示,CD46 rs1970530GG基因型是肺腺癌患者预后的高危因素（HR = 5.15,95%CI:1.81～14.66）。结论 CD46 rs1970530变异可以增加肺腺癌的发病风险,并提示预后不良。     

Regulome - SNP: shc1 rs11264233与延边地区原发性肝癌风险性的研究

目的 探讨shc1 rs11264233与延边地区肝癌风险性的关系。方法 选取延边地区599名肝癌患者和599名健康对照组人群为研究对象。采用PCR - RFLP方法检测基因型及等位基因分布频率。二元logistic 回归模型分析shc1 rs11264233位点多态性与肝癌遗传易感性的关系。结果 shc1 rs11264233位点存在G和A两种等位基因,GG、GA和AA基因型。shc1 rs11264233位点基因型符合哈迪-温伯格遗传平衡规律。共显性模型中与携带GG基因型的个体相比携带AA基因型的个体更容易患PHC（调整OR = 1.512,95% CI:1.087～2.102,P = 0.014）,隐性模型中AA基因型PHC组风险度显著高于GG和GA组合型中（调整 OR = 1.461,95% CI:1.101～1.940,P = 0.009)。结论 shc1 rs11264233位点单核苷酸多态性与延边地区肝癌风险有明显相关性。     

多囊卵巢综合征患者H19基因多态性与复发性流产的相关性

目的探讨H19基因多态性与多囊卵巢综合征(PCOS)患者复发性流产(RSA)遗传易感性的相关性。方法选择PCOS患者115例和75例对照组为研究对象。PCOS的诊断标准参照鹿特丹工作组修正的标准。在115例PCOS患者中,55例为已生育无流产史的PCOS患者,60例为PCOS伴复发性流产(RSA)患者。提取研究对象基因组DNA,采用高通量测序法进行基因组测序。分析长链非编码RNA (lnc RNA) H19基因结合区单核苷酸多态性(SNPs)与PCOS伴发RSA的相关性。结果PCOS+RSA组、PCOS对照组和正常对照组中H19基因的rs7103849位点存在AA、AG、GG 3种基因型和A、G两种等位基因,PCOS+RSA组3种基因型和A/G两种等位基因频率分别为26.3%、57.9%、15.8%、55.3%及44.7%;PCOS对照组3种基因型和A/G两种等位基因频率分别为66.7%、26.7%、6.7%、80.0%及20.0%;正常对照组3种基因型和A,G两种等位基因频率分别为24.0%、60.0%、16.0%、54.0%及46.0%,3组在3种基因型的频率分布上差异无统计学意义(P>0.05);而两种等位基因频率分布上差异有统计学意义(P=0.047)。结论 lnc RNA H19基因rs7103849位点SNP多态性可能与RSA的发生相关。