基于动力学模型的诺如病毒感染性腹泻暴发疫情防控措施效果分析

  目的  采用动力学模型模拟不同干预措施在诺如病毒感染性腹泻暴发疫情处置中的防控效果，探讨最佳防控方式。  方法  根据选取2020年深圳市龙岗区报告的一起诺如病毒感染性腹泻暴发疫情资料，建立SEIAR模型，对诺如疫情隔离、停课及呕吐物处置效果进行分析。  结果  本起疫情在无干预情况下，基本再生数为9.63，持续4 d，人群感染率为97.38%。 采取隔离措施时，开始实施隔离的时间越迟，感染人数越多，持续时间变化不大；若疫情报告后次日下午才开始实施隔离，疫情规模接近无干预，隔离失效。 在报告后次日开始停课（实际开始停课时间），疫情规模与实际相同；若报告后次日下午才开始停课，疫情与无干预很接近，停课无效。 对呕吐物消毒效果评估，呕吐物未消毒的疫情与实际基本相同，随着呕吐物的消毒效果加强，感染人数下降，消毒效果达到90%以上时，基本无病例。  结论  发生诺如病毒感染性腹泻暴发疫情时，越早隔离、停课，规范处置呕吐物，效果越好。 本研究建立的SEIAR模型进行动力学分析可评估隔离、停课等防控措施的效果。     

一起GⅡ.4 ［P16］ 型诺如病毒感染暴发疫情调查

  目的   分析2021年山东省某小区一起诺如病毒感染暴发疫情流行因素,为制定有效的防控措施提供科学依据。  方法   采用现场流行病学方法调查、分析疾病的流行情况,采集水样本、典型病例的粪便或呕吐物、密切接触者的肛拭子标本进行胃肠炎病毒检测,对阳性样本进行基因分型。  结果   搜索到病例69例（9例为小区内幼儿园儿童,60例为社区居民）, 临床表现主要为呕吐（76.81%）,腹泻（69.57%）。 0～5岁儿童罹患率最高（21.18%）。 17份病例标本和2份密切接触者标本GⅡ组诺如病毒阳性,基因型均为GⅡ.4［P16］。  结论   本次事件是由GⅡ.4［P16］型诺如病毒引起的暴发疫情,是由患病儿童呕吐物造成环境污染,社区人员密切接触导致,及时识别和妥善处置是疫情防控的关键。     

2013－2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例GⅡ.P7-GⅡ.6型诺如病毒基因特征分析

  目的  分析2013 — 2019年浙江省湖州市急性胃肠炎病例诺如病毒基因特征,为疾病监测和防控提供参考。  方法  采用荧光定量反转录聚合酶链式反应（RT-PCR）方法对2013年12月、2014年4、12月、2019年3月发生的4起学校/托幼机构急性胃肠炎患者送检粪便标本进行诺如病毒核酸检测。 采用RT-PCR法对核酸阳性标本的多聚酶和衣壳蛋白部分区域进行扩增,并对扩增产物进行序列测定。 利用在线分型工具和系统进化分析对病原序列进行基因特征分析。  结果  共计28份标本中分别有5、4、2、5份为GⅡ型诺如病毒核酸阳性,阳性率为57.1%（16/28）。 4次疫情各有1份标本测序成功;在线分型和系统进化分支分析显示,4起疫情的病原均为GⅡ.P7-GⅡ.6重组型诺如病毒,但进化分支不同,其中2013年疫情标本检出GⅡ.P7-GⅡ.6c型;2014年2起疫情均为GⅡ.P7-GⅡ.6b型,2019年疫情中检出的GⅡ.P7-GⅡ.6a型。  结论  GⅡ.P7-GⅡ.6型重组型诺如病毒是引起湖州市2013 — 2019年4起急性胃肠炎暴发疫情的病原体,每年毒株存在一定基因进化分支的差异。 鉴于该病毒在全球范围内具有持续和广泛的流行能力,应进一步加强对该型别重组型诺如病毒的监测。     

2019年浙江省学校诺如病毒胃肠炎暴发疫情分析

  目的  了解浙江省学校诺如病毒感染暴发疫情的流行特征,提出当前防控特点。  方法  收集2019年1月1日至12月31日浙江省学校发生的诺如病毒胃肠炎暴发疫情资料,采用描述性流行病学方法。  结果  2019年报告173起学校诺如疫情,涉及170所学校,累计3172例病例,波及161711人,总罹患率为1.96%。 诺如病毒疫情主要发生在小学（53.18%）和托幼机构（27.16%）,病例的年龄集中在7～12岁（47.95%）。 疫情在春季和秋冬季均有发生,传播途径主要为人传人（94.80%）,食源性传播和水源性传播引起的疫情较少。 临床症状以腹泻、呕吐为主,基因型以GⅡ型为主（121起,69.94%）。  结论  浙江省学校诺如病毒胃肠炎暴发疫情主要发生在小学和幼儿园,传播途径多为人传人,学校应重视病例的排泄物/呕吐物及环境消毒处理。     

一起幼儿园诺如病毒暴发疫情调查及分子流行病学特征分析

  目的   调查2021年西安市一起幼儿园诺如病毒暴发疫情的流行特征和暴发原因,并对病原体进行分子鉴定分型。  方法   根据诺如病毒疑似病例定义主动搜索病例,同时开展现场卫生学调查;采用描述性流行病学方法描述病例的临床症状和三间分布特征,结合队列研究方法分析疫情暴发原因;采集典型病例肛拭子样本进行诺如病毒核酸检测和基因测序分型。  结果   该起暴发疫情共持续3 d,累计报告病例31例,病例均为幼儿,罹患率为14.16%（31/219）,其中4岁病例占比最大（93.55%,29/31）,小（4）班罹患率最高（40.00%,12/30）;病例临床症状主要为呕吐（100%）、腹泻（12.90%）和腹痛（6.45%）,无重症和死亡病例。 流行曲线提示疫情为一次性暴露后同源感染引起。 队列研究显示近距离暴露呕吐物幼儿发病风险是远距离暴露幼儿的3.98倍（相对危险度 = 3.98,95% 置信区间: 2.159～7.334）。 病例样本诺如病毒阳性检出率为61.54%（8/13）,经基因测序和鉴定分型确定渉疫毒株为GⅡ.3[P12]基因型诺如病毒。  结论   该起疫情暴发原因是托幼儿童暴露于首发病例呕吐物形成的气溶胶,感染毒株为GⅡ.3[P12]基因型诺如病毒。 建议托幼机构加强教职工诺如病毒疫情防控知识培训,尤其是对病例呕吐物和排泄物的应急处置,防止类似疫情再次发生。     

2018－2020年上海市5岁以下住院儿童病毒性腹泻病原学特征分析

  目的  对2018 — 2020年上海市5岁以下感染性肠胃炎住院患儿进行主要病毒病原学检测,了解目标人群中病毒的分子流行病学迁移变化特征,为病毒性腹泻的防控和疫苗研发及应用提供数据支撑。   方法  采集上海市某儿科医院5岁以下腹泻住院患儿的粪便标本,并收集相关流行病学资料。 采用ELISA、荧光PCR以及巢式PCR方法对轮状病毒、杯状病毒（包括诺如病毒和札如病毒）、星状病毒和肠道腺病毒进行检测和分子分型。   结果  共采集粪便标本805份（男性543份,女性262份）,病毒检出率为47.33%,检出率最高的病毒为杯状病毒（31.18%）,其次为A组轮状病毒（17.64%）;杯状病毒中诺如病毒GⅡ型的占比最高（95.62%）。 轮状病毒以G9P［8］为主要流行型别（占比90.85%）。 诺如病毒GⅡ型以GⅡ.4［P31］和GⅡ.3［P12］为主要流行株（占比分别为32.08% 和19.58%）;但2020年以来,新兴亚型GⅡ.4［P16］和GⅡ.2［P16］检出率明显高于2018和2019年（χ2=17.337,P＜0.001; χ2=11.044,P=0.001）。 此外本地首次从1名4月龄患儿粪便中发现1株乐儿德轮状病毒疫苗株。   结论  杯状病毒检出率高于轮状病毒的趋势加剧,使杯状病毒（主要是诺如病毒）疫苗的研发和上市需求愈发迫切。研究首次揭示了住院儿童中诺如病毒GⅡ型的主要流行和新兴亚型,为多效价的诺如疫苗研发提供了参考依据。轮状病毒G9型别近年检出率升高,需要对轮状病毒型别变化保持警戒、追踪和深究。     

2014-2019年成都地区诺如病毒聚集性疫情时空分布特征分析

  目的  应用地理信息系统（GIS）对成都地区诺如病毒聚集性疫情进行时空分布特征分析,为诺如病毒疫情防控提供依据。  方法  以成都地区2014 — 2019年聚集性疫情病例资料建立数据库,利用GIS软件与成都地区矢量地图关联,应用集中度法与圆形分布法分析疫情时间聚集性,Moran’s Ⅰ 法分析空间自相关。  结果  成都地区诺如病毒聚集性疫情M值为0.3927872,具有一定时间聚集性,冬季高于其他季节,夏季最低;不同型别的平均发病日与发病高峰期不同,时间集中于11月至次年3月。 空间分布呈现中心城区高于郊区特点,不同季节“热点”与“冷点”区域不同。  结论  成都地区诺如病毒聚集性疫情时空聚集性显著,应关注重点区域开展防控。     

2014－2018年江苏省无锡市感染性腹泻病原监测结果分析

目的了解江苏省无锡市感染性腹泻的病原谱及流行特征。方法于2014 — 2018年采集无锡市哨点医院门诊感染性腹泻病例粪便标本,采用分离培养法检测沙门菌、志贺菌、致泻性大肠埃希菌和副溶血弧菌,采用real-time PCR法进行诺如病毒、轮状病毒、札如病毒、星状病毒和肠道腺病毒的核酸检测。结果3?408 例腹泻病例中,共检出阳性样本946份（混合感染66份）,总检测阳性率为27.76%。 其中细菌感染529份,阳性率为15.52%,病毒感染460份,阳性率为13.50%,混合感染66份。 细菌性病原体中,致泻性大肠埃希菌分离率最高（6.60%）,其次为沙门菌（5.11%）、副溶血弧菌（4.05%）、志贺菌（0.32%）,主要流行于夏季。 病毒性病原体中,诺如病毒（8.92%）和轮状病毒（3.29%）检测阳性率较高,主要流行于冬春季。 不同年龄组人群病原体阳性率不同,轮状病毒感染高发于0 ~ 4岁年龄组。结论2014 — 2018年无锡市感染性腹泻的主要病原体是致泻性大肠埃希菌、沙门菌、副溶血弧菌、诺如病毒和轮状病毒,夏季以细菌性腹泻为主,冬春季以病毒性腹泻为主,在不同季节应针对5岁以下婴幼儿和老年人等重点人群采取不同防控措施。     

2010－2020年云南省其他感染性腹泻疫情变化趋势及流行病学特征分析

  目的   了解云南省其他感染性腹泻的流行病学特征,为制定高效防治策略、措施提供科学依据。  方法   采用描述性和分析性研究、圆形分布法、空间自相关和局部空间自相关等方法,对2010—2020年云南省其他感染性腹泻疫情资料进行统计分析。  结果   2010—2020年云南省共报告其他感染性腹泻254 279例,年均发病率为3.65/万,发病率及发病例数总体呈逐年上升趋势（β=0.16,P<0.01）。 云南省其他感染性腹泻的发病呈明显单峰分布,每年的11月至次年4月为发病高峰时段。 年均发病率排在前3位的为昆明市（11.40/万）、西双版纳（10.49/万）、玉溪市（9.93/万）,共报告121 553例,占全省病例数的47.81%,发病空间聚集范围逐渐形成以昆明市为中心的趋势。 男女性别比为1.29∶1, 0～5岁年龄组发病数最高,共189 623例（75.00%）;发病最多的人群为散居儿童,共210 481例（73.19%）。  结论   2010—2020云南省其他感染性腹泻发病呈逐年上升趋势,针对高发地区,应加大健康教育与健康促进力度,对重点人群开展全生命周期智能预警与预测干预行动,构建环境卫生治理体系,加强环境卫生治理和三级预防能力。     

2016-2019年我国诺如病毒暴发疫情的分子流行病学特征分析

  目的  了解中国诺如病毒监测网络（CaliciNet China）的发展及2016 — 2019年中国诺如病毒分子流行特征。  方法   收集2016年10月至2019年9月诺如病毒暴发流行病学和病例临床信息及标本,应用荧光反转录聚合酶链式反应（real-time, RT-PCR）进行诺如病毒检测,阳性样本通过RT-PCR扩增、测序,将数据录入CaliciNet China数据库并进行基因分型。  结果  2016年10月至2019年9月,共报告诺如病毒疫情1 153起,对其中776起疫情（67.3%）的阳性样本进行了基因分型。 94.9%的暴发疫情与人–人传播有关,发生在托幼机构或学校（94.4%）,每年11月至次年3月为诺如病毒暴发的流行高峰（65.0%）。 57.6%的诺如病毒暴发由GⅡ.2［P16］引起。  结论  GⅡ.2［P16］是 2016年10月至2019年9月引起我国诺如病毒暴发的主要基因型,主要发生在托幼机构或或学校,CaliciNet China正在进行的监测提供了有关毒株基因分型和暴发特征的信息。     

甘肃省一起幼儿札如病毒GⅠ.2型感染聚集性疫情调查分析

目的 通过对2021年6月甘肃省兰州市某幼儿园发生一起以呕吐、腹泻为主症的聚集性疫情,确定引起本次疫情的病原体。方法 采集发病幼儿肛拭子、食堂、教室等环境标本共44份（17份患儿肛拭子标本和27份环境标本）,运用聚合酶链式反应检测轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒及札如病毒核酸,肛拭子进行致泻菌分离培养。结果 44份标本未分离到致泻性大肠埃希菌、沙门菌、志贺菌、小肠结肠炎耶尔森菌等致病菌,轮状病毒、诺如病毒、星状病毒及肠道腺病毒核酸检测均为阴性,札如病毒核酸检测到患儿肛拭子阳性11份,其余标本均为阴性。选取其中2份强阳性标本进行全基因组测序,为札如病毒GⅠ.2型,基本局部比对搜索工具（BLAST）结果与2016年深圳市发现的札如病毒全序列相似度在98.96%～98.98%。结论 此次聚集性疫情由札如病毒GⅠ.2型引起,是甘肃首次发现札如病毒引起的暴发疫情,提示应加强病毒性腹泻的监测和防控。     

2021年北京市一起小学诺如病毒感染引起的急性胃肠炎暴发疫情调查

  目的   调查2021年北京市某小学一起诺如病毒感染引起的急性胃肠炎暴发疫情,分析可能的危险因素,提出有针对性的防控建议及措施,探讨疫情处置经验。  方法  采用现场流行病学方法开展调查,用描述性流行病学方法描述病例的临床症状和三间分布,通过病例对照研究分析疫情暴发的原因,采集病例及相关人员肛拭子和环境标本进行肠道病毒和肠道致病菌检测。  结果   共搜索到156例疑似病例,均为学生,罹患率为24.5%（156/638）。 病例临床表现以呕吐为主（98.1%）,无重症和死亡病例;流行曲线提示为点源暴露模式;病例分布具有明显的空间聚集性,不同教学楼、不同楼层、不同班级间罹患率差异均有统计学意义（P<0.001）;男性罹患率为33.1%（95/352）,女性罹患率为26.2%（61/286）,男女性罹患率差异无统计学意义（χ2=2.736, P=0.098）。 病例对照研究结果显示近距离接触患者呕吐物（≤1 m）为本起疫情发生的危险因素（OR=12.14,95%CI: 2.76～53.39）。 57件肛拭子标本和3件环境涂抹标本检出GⅡ组诺如病毒。  结论   本次事件是由GⅡ组诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发疫情,近距离暴露患病儿童呕吐物是主要的危险因素。 未及时处理呕吐物和疫情迟报为本次疫情规模较大的重要原因,建议学校及时规范处置呕吐物。 同时建议学校加强监测,发现疫情及时上报和处置,防止疫情蔓延。     

一起产志贺毒素大肠埃希菌O146∶H10引起的食物中毒的溯源分析

  目的  对2019年广西壮族自治区桂林市发生的一起校内食物中毒进行病原检测及溯源分析。  方法  对该起食物中毒事件开展流行病学调查,采集腹泻患者粪便、餐厨工作人员肛拭子、留样食品、厨房环境及餐厨用具涂抹样本,按常规方法进行病原分离和鉴定,对分离的病原菌进行毒力基因检测及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型分析。  结果  本次食物中毒事件共造成87人出现腹泻或其他症状。从1例腹泻患者粪便及1位餐厨工作人员肛拭子标本中分离到产志贺毒素大肠埃希菌,血清型均为O146∶H10,志贺毒素基因均为stx_1c亚型,且2株分离株具有相同的PFGE带型。  结论  这起食物中毒是由产志贺毒素大肠埃希菌O146∶H10引起,为国内首次报道由非O157产志贺毒素大肠埃希菌引起的食物中毒事件。     

广西壮族自治区梧州市某学校一起GⅡ型诺如病毒感染聚集性疫情的暴发调查

目的 调查2021年广西壮族自治区(广西)梧州市某学校一起诺如病毒感染引起的急性胃肠炎暴发疫情,分析可能危险因素,探讨疫情处置经验,提出有针对性的防控建议。方法 采用现场流行病学方法开展调查,用描述性流行病学方法描述病例的临床症状和三间分布特征,通过病例对照研究分析疫情暴发的原因,采集典型病例肛拭子、自备井水、储水池、市政末梢水、物表、留样食物等样本进行诺如病毒核酸和常见致病菌检测。结果 共搜索到病例142例,罹患率为5.55%(142/2 559);病例临床症状主要为呕吐(83.10%)、腹痛(83.10%)、发热(67.61%)、恶心(63.38%)、腹泻(50.70%);不同宿舍楼学生的罹患率差异有统计学意义(χ²=36.978,P<0.001)。病例对照研究结果显示自备水漱口[比值比(OR)=3.78、95%置信区间(95%CI):1.736～8.234)]和接触过病例(OR=2.97,95%CI:1.465～5.312)是主要危险因素,自备水漱口的频率与罹患率呈剂量反应关系(χ²=14.935,P=0.002)。8份病例肛拭子...     

2021年青海省一起职业暴露引起的新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学调查

目的 分析2021年10月17日至11月2日青海省西宁市一起职业暴露引起的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）聚集性疫情,探讨职业人群在COVID-19防护中存在的问题。方法 按照《新型冠状病毒肺炎防控方案（第八版）》的要求,开展流行病学调查及现场处置工作,采集病例、密切接触者和次密切接触者咽拭子标本,用反转录–聚合酶链式反应法进行核酸检测,使用高通量测序技术对部分确诊病例咽拭子样本进行基因测序。结果 本次疫情涉及病例11例,其中3例为家庭聚集性,8例为医护人员,女性9例;男性2例。共传3代,平均潜伏期为3.18 d,发病地点主要集中在办公室区域,共同使用电话、电脑等办公用品是本次疫情的高危行为,病例首发症状以咳嗽为主（10例,90.97%）。现场流调人员脱防护服时不规范以及防水靴套设计不科学,成为本次职业暴露的最主要风险点。本次疫情中新型冠状病毒基因序列属于VOC/Delta变异株。结论 本起疫情主要为职业暴露,建议流行病学现场防护服穿脱时指定专人监督和评估,建议改良防水靴套脚踝处设计,进入过现场的工作人员应减少与其他工作人员接触。     

2013-2020年北京市海淀区成年人致泻大肠埃希菌流行特征和分型研究

目的 掌握北京市海淀区成年人致泻大肠埃希菌(DEC)流行特征和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型特点.方法 对2013-2020年在3家哨点医院就诊的1961例成年人腹泻患者粪便或肛拭子标本进行DEC检测,对其中66株DEC菌株进行PFGE分型试验.结果 成年人DEC检出率为9.54％(187/1961),产肠毒素大肠埃希...     

2018-2019年江苏省病毒性腹泻病原谱构成及流行特征分析

目的 了解2018—2019年江苏省病毒性腹泻的病原谱和流行特征,以更好地为病毒性腹泻的科学防控和临床治疗提供数据支撑。方法 收集2018年11月至2019年10月江苏省哨点医院肠道门诊所有腹泻病例的新鲜粪便标本进行病毒核酸检测,使用χ²检验对标本阳性率结果进行统计分析。结果 共收集2 486例腹泻病例,其中633份样本病毒核酸检测阳性,检出率为25.46%。所有阳性样本中,诺如病毒和轮状病毒的占比分别为32.07%和25.43%,合计占比超过50%。感染性腹泻高发年龄为3～5岁(29.04%),高发季节为夏季(28.59%)和秋季(27.18%),外来人群的病毒检出率(45.76%)高于本地人群(23.33%)(χ²=56.618,P<0.001)。结论 建议将0～5岁学龄前儿童作为病毒性腹泻防控的重点人群,同时加强夏秋季节的病毒性腹泻防控工作,并扩大针对外来流动人口的健康宣教力度。     

基于个体行为的传染病模型研究与分析

  目的  为了充分考虑种群中个体差异和人员流动对传染病发展的影响,构建一种基于个体行为的传染病模型来揭示传染病传播的动力学特征,对疫情防控措施的有效性进行评价。  方法  以个体为基本研究对象建立仿真模型,为个体属性赋予不同数值以体现个体间的差异性,将影响传染病传播的因素以参数形式引入模型,通过改变个体的属性值来反映传染病流行期间个体的状态变化。  结果  通过对相关参数的设置,模型仿真结果与疫情发展趋势高度吻合,并以武汉地区新型冠状病毒肺炎疫情的基本再生数为指标,验证了模型的有效性。 在此基础上,进一步讨论了个体社交活跃度对疫情发展的影响,模拟了不同防控措施下疫情的发展趋势。  结论  该模型参数灵活,适用于传染病在多种情况下的趋势分析,能对防控措施的有效性进行科学评价,为疫情防控提供科学指导。