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1.
北京市新型冠状病毒Omicron变异株的传播力研究   总被引:3,自引:3,他引:0       下载免费PDF全文
目的 评估新型冠状病毒Omicron变异株在北京市现有防控措施下的传播力,为做好疫情防控工作提供参考依据。方法 收集北京市2022年3月7-25日报告的78例具有明确传播链的Omicron变异株感染者信息,分别采用Gamma和Weibull分布拟合潜伏期和序列间隔时间,使用马尔科夫链蒙特卡罗算法估计实时再生数(Rt)。结果 Omicron变异株感染者潜伏期MQ1,Q3)为4.0(3.0,6.0)d,序列间隔时间3.0(2.0,5.0)d,序列间隔时间在未完成和已完成全程疫苗接种感染者中MQ1,Q3)分别为2.0(1.0,4.0)d和4.0(2.0,6.0)d(Z=-2.12,P=0.034),儿童和成年人感染者分别为2.0(1.5,3.0)d和4.0(2.0,6.0)d(Z=-2.02,P=0.044),差异均有统计学意义。本轮疫情Rt初始值为4.98(95%CI: 2.22~9.04)。结论 与既往Delta变异株相比,北京市Omicron变异株的传播力较强,应持续做好常态化疫情防控和新型冠状病毒疫苗接种工作,关注儿童易感人群。  相似文献   

2.
目的 本研究旨在估计广州市2起由新型冠状病毒(新冠病毒)奥密克戎变异株(BA.2)引起的本地疫情的潜伏期、序列间隔和基本再生数(R0)等流行病学参数,探索不同场所聚集性对R0的影响,为奥密克戎变异株疫情防控提供科学依据。方法 收集2022年4-5月广州市2起新冠病毒奥密克戎变异株本地疫情病例数据,使用Weibull、Gamma和lognormal分布对奥密克戎变异株本地疫情的潜伏期、序列间隔分布进行估计,采用指数增长法和极大似然法估计R0结果 两起疫情中位潜伏期为2.94(95%CI:2.52~3.38)d;中位序列间隔为3.32(95%CI:2.89~3.81)d。小型场所聚集性疫情R0为4.40(95%CI:3.95~4.85),机场聚集性疫情R0为11.35(95%CI:11.02~11.67)。结论 广州市2起由新冠病毒奥密克戎变异株引起的本地疫情潜伏期较德尔塔变异株明显缩短。场所聚集程度越高,R0越大,传播速度越快,易呈现暴发疫情,应及时调整防控策略。  相似文献   

3.
目的 分析北京市海淀区一起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学特征及传播链。方法 采用描述性流行病学方法分析疫情流行病学特征,应用现场调查和大数据技术分析传播链。结果 2022年4月27日至5月13日, 海淀区发生一起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情,全基因组测序系Omicron变异株(BA.2.2进化分支);涉及感染者38例,确诊病例34例,无症状感染者4例;临床分型以轻型(88.2%)为主,无重型、危重型和死亡病例;早期临床症状以咽部不适(50.0%)、咳嗽(29.4%)为主;17 d内传播7代,涉及3起社区聚集、2起单位聚集和8个家庭内传播;暴露方式以同住(47.6%)、同时空暴露(31.6%)为主;代间距MQ1,Q3)为3(1,6)d;总续发率为1.5%(37/2 482),其中家庭续发率为36.7%(18/49)。结论 本起Omicron变异株疫情临床症状轻,家庭、社区聚集性明显,疫情传播速度较快,同时空暴露感染风险较高,需利用信息化技术全面摸排密切接触者,以快制快,有效阻断疫情传播。  相似文献   

4.
目的 分析新型冠状病毒(新冠病毒)再感染的流行病学特征及其影响因素,为科学防控新冠病毒感染疫情提供依据。方法 在中国疾病预防控制信息系统的传染病监测系统获取2020年1月1日至2022年11月30日宁波市新冠病毒既往感染者的资料,对其再感染状况进行问卷调查,采用多因素logistic回归分析性别、年龄、距初次感染时间间隔、新冠病毒疫苗接种剂次及基础疾病史对新冠病毒再感染的影响。结果 共调查897例既往感染者,其中115例再感染者,再感染率为12.82%。再感染者两次感染间隔时间MQ1Q3)为1 052(504,1 056)d。单因素分析显示,年龄、新冠病毒疫苗接种剂次、初次感染变异株类型、距初次感染时间间隔、初次感染严重程度与再感染率有关(均P<0.05)。多因素logistic回归分析显示,30~岁组再感染发生风险高于≥60岁组(OR=2.10,95%CI:1.11~3.97) 距初次感染<6个月组无再感染发生,≥12个月组再感染发生风险高于6~个月组(OR=6.68,95%CI:3.46~12.90);初次感染严重程度为普通型和轻型者再感染发生风险高于无症状感染者(OR=2.64,95%CI:1.18~5.88;OR=2.79,95%CI:1.27~6.11)。结论 距初次感染时间间隔是再感染风险的重要影响因素,6个月内出现再感染的概率较低。  相似文献   

5.
目的 分析新型冠状病毒(新冠病毒)B.1.617.2(Delta)变异株引起的广州市荔湾区本土疫情流行特征,为Delta变异株疫情防控工作提供参考依据。方法 资料来源于中国疾病预防控制信息系统传染病报告信息管理系统和广州市荔湾区CDC,收集2021年5月21日至6月18日广州市荔湾区新冠病毒感染者(确诊病例和无症状感染者)相关信息。采用频数(构成比)、直方图、百分比堆积面积图等对本次Delta变异株疫情的流行病学特征进行描述,并应用潜伏期、动态再生系数(Rt)估计进行分析。结果 截至6月18日广州市荔湾区累计报告新冠病毒感染者127例,年龄范围2~85岁,<18、18~59和≥60岁年龄组分别占18.9%(24/127)、43.3%(55/127)和37.8%(48/127)。男女性别比为1:1.35(54:73);职业以离退休人员32.3%(41/127)、家务及待业18.1%(23/127)和学生16.5%(21/127)为主;主要集中在荔湾区的白鹤洞街道(70.1%,89/127)与中南街道(23.6%,30/127);Delta变异株的中位潜伏期6(范围:1~15)d;临床分型以普通型(64.6%,82/127)为主;基本再生系数(R0)=5.1,Rt先上升后下降,最高达7.3;传播方式以密闭空间为主,具有明显的家庭聚集性,主要传播场所为家庭(26.8%,34/127)、餐馆(29.1%,37/127)、小区(3.9%,5/127)和市场(3.1%,4/127)。密切接触者筛查(66.1%)和社区排查(33.1%)是发现感染者的主要途径。结论 本次疫情新冠病毒Delta变异株的传染性较强,广州市荔湾区本土疫情具有明显的家庭聚集性,新冠病毒感染者以18~59和≥60岁年龄组为主。  相似文献   

6.
目的 分析比较宁波市Delta和Omicron变异株引发本土聚集性疫情续发感染者的流行特征,为进一步优化调整新冠肺炎疫情的防控措施提供参考依据。方法 以2021年12月1日—2022年5月31日宁波市37起本土新冠肺炎疫情中判定为密切接触者(密接)中的171例续发感染者为研究对象,对两种变异株的感染者流行特征进行描述性分析,以与关联病例有明确暴露时间的续发感染者计算潜伏期。结果 确诊病例占80.70%(138/171),无症状感染者占19.30%(33/171)。Delta和Omicron变异株感染者分别占64.33%(110/171)和35.67%(61/171),Omicron变异株的无症状感染者比例高于Delta变异株(54.1%vs. 0,P <0.01)。与关联病例有明确暴露时间的22例确诊病例(Delta变异株15例,Omicron变异株7例)平均潜伏期为(3.45±0.44)d,Delta和Omicron变异株感染者的最长潜伏期分别为8和6 d,平均潜伏期分别为(3.60±0.58)和(3.14±0.63)d,差异无统计学意义(P> 0.05)。Omicron...  相似文献   

7.
目的 分析并比较北京市新发地市场疫情中新型冠状病毒肺炎(COVID-19)确诊病例与无症状感染者的流行病学特征。方法 收集并整理传染病报告信息管理系统中北京市新发地市场疫情中COVID-19感染者数据和流行病学调查报告资料,应用SPSS 19.0软件分析并比较确诊病例和无症状感染者的流行病学特征。结果 2020年6月11日至7月10日北京市共诊断新型冠状病毒感染者368例,其中确诊病例335例(91.03%),无症状感染者33例(8.97%)。病例分布于11个区,其中丰台区病例数占总病例数的68.48%(252/368)。发病曲线呈现暴发流行模式,发病高峰为6月13日。全部感染者年龄MQR)为43(31~51)岁,无症状感染者的年龄MQR)为32(29~49)岁,低于确诊病例的年龄MQR)[43(31~52)岁],差异有统计学意义(Z=2.416,P=0.016)。感染者男女性别比为1.26:1。从事餐饮及商业服务和公共场所服务的人员最多,占64.13%(236/368)。73.91%(272/368)的感染者有新发地市场直接暴露史。通过核酸筛查发现全部感染者的54.08%(199/368)。确诊病例中轻型和普通型病例占99.10%(332/335),无死亡病例。结论 北京市新发地市场疫情呈暴发流行模式,COVID-19病例以餐饮和服务业人员为主。无症状感染者的年龄低于确诊病例。  相似文献   

8.
目的 分析我国河北省、浙江省、陕西省和湖南省(4省份)≥55岁中老年人帕金森病前驱期(pPD)患病概率,探讨总体认知功能及不同认知域功能与pPD患病概率的关联性。方法 利用神经系统疾病专病社区队列研究2020年调查数据,选择未患阿尔茨海默病和帕金森病的有完整人口统计学、疾病史、认知功能评估和帕金森病风险因素数据的≥55岁中老年人4 634人。采用蒙特利尔认知测验中文版量表评估认知功能,按照国际帕金森病及运动障碍协会诊断标准评估pPD患病概率并判定pPD,采用多因素线性回归模型分析认知功能与pPD患病概率的关联性。结果 研究对象总体认知功能评分、记忆、执行力、视空间、语言、注意力和定向指数评分的MQ1Q3)分别为25(20,30)、13(11,15)、10(7,12)、6(4,7)、5(4,6)、15(12,18)和6(6,6)分,pPD患病概率MQ1Q3)为0.42%(0.80%,1.73%),可能或极可能患pPD者比例为0.4%。总体认知功能评分四等分组pPD患病概率分布差异有统计学意义(P<0.001),可能或极可能pPD患者比例差异有统计学意义且呈下降趋势(P=0.001)。调整混杂因素后,多因素线性回归分析结果显示,总体认知功能评分Q2Q3Q4组pPD患病概率较Q1组分别降低23.4%、31.2%和20.1%,相应的β值(95%CI)分别为0.766(0.702~0.836)、0.688(0.631~0.751)和0.799(0.730~0.875),且趋势有统计学意义(P<0.001)。较高的执行力、视空间、语言、注意力和定向指数评分与较低的pPD患病概率有关,差异有统计学意义(均P<0.001)。结论 总体认知功能及执行力、视空间、语言、注意力和定向功能减退可能增加中老年人pPD患病概率,提示早期认知功能干预对预防pPD有重要意义。  相似文献   

9.
目的 了解MSM人群的HIV感染者(MSM感染者)人群病毒载量(PVL)数据分布特征,拟合分布函数,探讨评价PVL的合适参数。方法 病毒载量(VL)检测限设定为≤ 50拷贝/ml。描述PVL的一般分布特征,结合Box-Cox转换和正态性检验,根据PVL数据转换后的分布特征,拟合稳定分布函数,并进行拟合优度检验。结果 PVL原始数据为偏态分布,变异系数(CV)为622.24%,经Box-Cox转换,转换参数(λ)最优值=-0.11,为多峰分布;VL原始值>检测限的PVL经Box-Cox数据转换,λ最优值=0,为对数转换,偏态厚尾特征,不满足正态分布,拟合稳定分布函数(α=1.70,β=-1.00,γ=0.78,δ=4.03),呈稳定分布。结论 PVL原始值存在截尾、非正态分布的特征,变异度较大;当VL原始值≤检测限的截尾数据占总体比例较大时,不宜用检测限的1/2代替;VL原始值>检测限的PVL对数值为稳定分布,适合用MIQR来描述集中趋势和离散趋势。  相似文献   

10.
目的 了解膳食对社区管理2型糖尿病(T2DM)患者血糖控制的影响,为实施针对糖尿病患者的防治策略和措施提供依据。方法 于2015年在常熟市和武汉市随机抽取8个社区,对进行社区管理的T2DM患者进行问卷调查、身体测量和血糖检测。研究采用因子分析获得膳食模式。并分别以FPG、餐后2 h血糖控制是否达标为因变量,进行非条件多因素logistic回归分析影响因素。结果 最终共纳入1 818名T2DM患者,患者FPG控制率为57.59%(95%CI:55.30%~59.86%),餐后2 h血糖控制率为24.90%(95%CI:22.93%~26.91%);因子分析得到5种膳食模式:动物性食物模式、水果-水产-薯类模式、蔬菜-谷物模式、蛋-奶-豆模式和油盐模式。非条件多因素logistic回归分析显示,调整其他因素后,FPG达标概率降低与动物性食物模式(OR=0.71,95%CI:0.52~0.98)、水果-水产-薯类模式(OR=0.71,95%CI0.51~0.97)相关,餐后2 h血糖达标概率降低与水果-水产-薯类模式(OR=0.60,95%CI:0.40~0.90)相关,FPG和餐后2 h血糖达标概率增加均与蔬菜-谷物模式(OR=1.41,95%CI:1.03~1.94;OR=1.68,95%CI:1.13~2.51)、蛋-奶-豆模式(OR=1.75,95%CI:1.25~2.46;OR=1.56,95%CI:1.00~2.42)有关。与蛋-奶-豆模式Q4组相比,膳食模式组合(水果-水产-薯类模式Q4组、蔬菜-谷物模式Q2组、蛋-奶-豆模式Q3组)FPG控制达标可能性更高(OR=6.79,95%CI:1.15~40.23,P=0.035);与蔬菜-谷物模式Q4组相比,膳食模式组合(水果-水产-薯类模式Q4组、蔬菜-谷物模式Q3组、蛋-奶-豆模式Q2组、油盐模式Q2组)餐后2 h血糖控制达标可能性更高(OR=12.78,95%CI:1.26~130.05,P=0.031)。结论 搭配得当的膳食模式及膳食模式组合更有利于武汉市和常熟市社区管理T2DM患者的FPG和餐后2 h血糖控制,应加强患者营养教育,提高患者食物搭配能力。  相似文献   

11.
目的对北京市3起可能通过跨境物流途径导致的新型冠状病毒(新冠病毒)Omicron变异株聚集性疫情进行调查, 分析其感染来源和传播链。方法应用流行病学调查和大数据技术核查病例的活动轨迹, 对活动轨迹涉及的风险点位进行密切接触者追踪、人员和环境采样, 应用实时荧光定量PCR进行核酸检测, 对核酸阳性标本进行基因测序分析。结果 2022年1-4月北京市3起Omicron变异株聚集性疫情病毒基因序列分别为Omicron变异株BA.1、BA.1.1、BA.2分支, 疫情分别持续8、12、8 d, 报告6、42、32例新冠病毒感染者。1起感染来源可能为国际邮件, 2起可能为进口衣物, 进口物品从境外启运至首发病例接触感染的时间间隔为3~4 d。潜伏期M(Q1, Q3)为3(2, 4)d, 代间距M(Q1, Q3)为3(2, 4)d。结论此次疫情提示常温进口货品通过物流途径输入Omicron变异株疫情的风险, 且Omicron变异株传播速度更快, 应加快流行病学调查处置。  相似文献   

12.
目的研究新型冠状病毒(新冠病毒)感染疫情的Omicron变异株BA.5.1.3亚型的潜伏期。方法基于315例新冠病毒感染者流行病学调查数据, 根据区间删失数据的特点, 采用log-normal和Gamma两种分布估计潜伏期, 利用离散时间马尔科夫链蒙特卡罗算法对分布函数的参数进行贝叶斯估计。结果 315例感染者年龄(42.01±16.54)岁, 男性占30.16%。其中156例报告了症状出现时间, 年龄(41.65±16.32)岁, log-normal和Gamma分布估计发病潜伏期M(Q1, Q3)分别为2.53(1.86, 3.44)d及2.64(1.91, 3.52)d;估计感染潜伏期M(Q1, Q3)分别为2.45(1.76, 3.40)d及2.57(1.81, 3.52)d。结论基于log-normal和Gamma分布进行贝叶斯估计的潜伏期接近, 潜伏期最佳分布均为Gamma分布, 感染潜伏期与发病潜伏期M相差较小, Omicron变异株BA.5.1.3亚型比以往的Omicron变异株的潜伏期M更短。  相似文献   

13.
目的分析深圳市一起广东省外输入的新型冠状病毒(新冠病毒)Omicron BF.7变异株所致暴发疫情的流行病学特征, 梳理和分析其传播链条和传播特征。方法采用现场流行病学方法对病例进行调查, 整理新冠病毒感染者活动轨迹、分析代际关系等, 对新冠病毒核酸阳性标本进行基因测序分析。结果 2022年10月8-23日, 深圳市共报告196例新冠病毒感染者, 均存在流行病学关联。男、女性分别为100和96例, 年龄M(Q1, Q3)为33(25, 46)岁。本起疫情由在广东省外旅游返回深圳市的新冠病毒感染者(首发病例)引起, 4条传播链分别为首发病例现住址相关感染8例、7日晚社会面活动相关感染65例、8日写字楼工作场所相关感染累计48例、在工作场所附近的写字楼相关感染74例。本起疫情潜伏期M(Q1, Q3)为1.44(1.11, 2.17)d。室内暴露的潜伏期短于室外暴露的潜伏期, M(Q1, Q3)分别为1.38(1.06, 1.84)和1.95(1.22, 2.99)d, 差异有统计学意义(Waldχ2=10.27, P=0.001)。随着代际的增加, 基因位点突变个数及突变比例增加。在同一传...  相似文献   

14.
《Vaccine》2022,40(50):7195-7200
Background aimThe Omicron COVID-19 variants BA.1* and BA.2* evade immune system leading to increased transmissibility and breakthrough infections. We aim to test the hypothesis that immunity achieved post COVID-19 infection combined with vaccination (hybrid immunity), is more effective against Omicron infection than vaccination alone in a health-care setting.MethodsData on regular pre-emptive PCR testing from all Health-Care Workers (HCWs) at Laiko University Hospital from 29th December 2020, date on which the national COVID-19 immunization program began in Greece, until 24th May 2022, were retrospectively collected and recorded. The infection rate was calculated after December 21st, 2021, when Omicron was the predominant circulating variant in Greece, as the total number of infections (positive PCR COVID-19 test regardless of symptoms) divided by the total person-months at risk.ResultsOf 1,305 vaccinated HCWs who were included in the analysis [median age of 47 (IQR: 36, 56) years, 66.7 % women], 13 % and 87 % had received 2 or 3 vaccine doses (full and booster vaccination), respectively. A COVID-19 infection had occurred in 135 of 1,305 of participants prior to Omicron predominance. Of those 135 HCWs with hybrid immunity only 13 (9.6 %) were re-infected. Of the 154 and 1,016 HCWs with full and booster vaccination-induced immunity, respectively, 71 (46.1 %, infection rate 13.4/100 person-months) and 448 (44.1 %, infection rate 12.2/100 person-months) were infected during the follow up period. No association between gender or age and COVID-19 infection was found and none of the participants had a severe infection or died.ConclusionsHybrid immunity confers higher protection by almost 5-fold compared to full or booster vaccination for COVID-19 infection with the Omicron variant among HCWs who are at high risk of exposure. This may inform public health policies on how to achieve optimal immunity in terms of the timing and mode of vaccination.  相似文献   

15.
We analyzed 324,734 SARS-CoV-2 variant screening tests from France enriched with 16,973 whole-genome sequences sampled during September 1, 2021–February 28, 2022. Results showed the estimated growth advantage of the Omicron variant over the Delta variant to be 105% (95% CI 96%–114%) and that of the BA.2 lineage over the BA.1 lineage to be 49% (95% CI 44%–52%). Quantitative PCR cycle threshold values were consistent with an increased ability of Omicron to generate breakthrough infections. Epidemiologic modeling shows that, in spite of its decreased virulence, the Omicron variant can generate important critical COVID-19 activity in hospitals in France. The magnitude of the BA.2 wave in hospitals depends on the level of relaxing of control measures but remains lower than that of BA.1 in median scenarios.  相似文献   

16.
《Vaccine》2023,41(38):5587-5591
BackgroundThere is limited data directly comparing the effectiveness of different COVID-19 vaccines.MethodsWe compared rates of SARS-CoV-2 Omicron BA.1/2 infection during March to May 2022 in Australian adults who had received one of four COVID-19 vaccines in the last 14–63 days as either a primary course or a booster dose using Cox proportional hazards models adjusting for age and other characteristics.ResultsAs a primary course, over 2318 person-years and 1033 infections, compared to recipients of BNT162b2 mRNA vaccine, adjusted hazard ratios for SARS-CoV-2 infection were 1.03 (95%CI 0.82–1.30), 1.19 (0.95–1.49), 1.70 (1.46–1.97) for respectively mRNA-1273, ChAdOx-1 nCov-19 and NVX-CoV2373. For the booster dose, over 154,984 person-years and 93,580 infections the respective adjusted hazard ratios compared to BNT162b2 mRNA vaccine were 1.02 (95%CI 1.00–1.04), 1.20 (1.10–1.32), 1.39 (1.20–1.60).ConclusionsOur findings suggest relatively higher effectiveness of ancestral strain mRNA vaccines against SARS-CoV-2 Omicron infection than viral vector and protein subunit vaccines and provide clinical confirmation of immunological data on differences in COVID-19 vaccine performance.  相似文献   

17.
ObjectivesTo identify factors that contribute to protection from infection with the Omicron variant of SARS-CoV-2 in older adults in nursing and retirement homes.DesignLongitudinal cohort study with retrospective analysis of infection risk.Setting and Participants997 residents of nursing and retirement homes from Ontario, Canada, in the COVID in LTC study.MethodsResidents with 3 messenger RNA (mRNA) dose vaccinations were included in the study. SARS-CoV-2 infection was determined by positive nasopharyngeal polymerase chain reaction test and/or circulating antinucleocapsid IgG antibodies. Cumulative probability of Omicron infection after recent COVID-19 was assessed by log-rank test of Kaplan-Meier curves. Cox regression was used to assess risk of Omicron infection by age, sex, mRNA vaccine combination, whether individuals received a fourth dose, as well as recent COVID-19.ResultsIn total, 171 residents (17.2%) had a presumed Omicron variant SARS-CoV-2 infection between December 15, 2021 (local start of the first Omicron wave) and May 3, 2022. Risk of Omicron infection was not different by age [hazard ratio (95% confidence interval) 1.01 (0.99‒1.02)], or in women compared with men [0.97 (0.70‒1.34)], but infection risk decreased 47% with 3 vaccine doses of mRNA-1273 (Moderna) compared with BNT162b2 (Pfizer) [0.53 (0.31-0.90)], 81% with any fourth mRNA vaccine dose [0.19 (0.12‒0.30)], and 48% with SARS-CoV-2 infection in the 3 months prior to beginning of the Omicron wave [0.52, (0.27‒0.99)].Conclusions and ImplicationsVaccine type (ie, mRNA-1273/Spikevax vs BNT162b2/Cominarty), any fourth vaccine dose, and hybrid immunity from recent COVID-19, were protective against infection with the Omicron variant. These data emphasize the importance of vaccine type, and number of vaccine doses, in maintenance of protective immunity and reduction of risk of Omicron variant breakthrough infection. These findings promote continued public health efforts to support vaccination programs and monitor vaccine immunogenicity in older adults.  相似文献   

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